Didier Fontenille, Christophe Paupy...Vecteurs et environnement pour support de l’émergence...

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Vecteurs et environnement pour support de l’émergence virale Didier Fontenille, Christophe Paupy Institut de Recherche pour le Développement (IRD) UR016 – vectopôle, Montpellier, France www.mpl.ird.fr/ur016

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Vecteurs et environnement pour support de l’émergence viraleDidier Fontenille, Christophe Paupy

Institut de Recherche pour le Développement (IRD)UR016 – vectopôle, Montpellier, Francewww.mpl.ird.fr/ur016

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Qu’est ce qu’un arbovirus ?Qu’est ce qu’un vecteur d’arbovirus ?La spécificité Vecteur – Hôte – VirusLe rôle de l’environnement : la capacité vectorielle

3 exemplesChikungunya et Aedes albopictusWest Nile et Culex sp.Encéphalite à Tique et Ixodes sp.

Quelles leçons tirer de ces émergences ?

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Qu’est ce qu’un arbovirus• Définition :

– Arthropod Borne virus : Virus transmis biologiquement par des arthropodes.

– L’usage a réservé l’exclusivité du terme aux virus pathogènes pour les vertébrés

• Importance des arbovirus– Plus de 600 arbovirus actuellement recensés et leur

nombre ne cesse de croître.– Plus de 100 sont pathogènes pour l’homme,

essentiellement en milieu tropical– Une quarantaine est à l’origine de maladies animales

identifiées

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Manifestations pathologiques des arbovirus chez l’homme

• Infection inapparente• Syndromes de type « dengue like »

– syndromes fébriles aigus accompagnés de douleurs avec, parfois, éruptions et adénopathies

• Syndromes neurologiques– méningites, méningo-encéphalomyélites

• Syndromes hémorragiques– fièvres hémorragiques, avec ou sans état de choc

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QuQu’’estest cece ququ’’unun vecteurvecteur dd’’arbovirusarbovirus ??

ARTHROPODES

INSECTES

ARACHNIDES

DIPTERES

BRACHYCERES

NEMATOCERES

SIPHONAPTERESANOPLOURES

HETEROPTERES

Chrysops

Tabanus

Phlébotomes

Simulies

Culicoïdes

Culicidae

Toxorhynchitinae

Anophelinae

Culicinae

autres

TIQUES

Ixodidae

Argasidae

TBE

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Culicidae

Toxorhynchitinae

Anophelinae

Culicinae

Anopheles

Chagasia

Bironela

OchlerotatusMimomyiaMansonia

Uranotaenia

CulexEtc…

KertesziaCelliaNyssorhynchusAnopheles

Anopheles

Chagasia

Bironela

MimomyiaMansonia

Uranotaenia

CulexEtc…

StegomyiaDiceromyiaAedimorphusNeomelaniconion

CulexLutziaNeoculexEumelanomyia

Aedes

Toxorhynchites

Près de 3300 espèces de moustiques décrites35 genres

QuQu’’estest cece ququ’’unun vecteurvecteur dd’’arbovirusarbovirus ??

CHIK

WN

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TRANSMISSION⇓

RENCONTRE ET COMPTABILITE(Euzet et Combes)

DIMENSION DIMENSION DIMENSIONECOLOGIQUE ETHOLOGIQUE CELLULAIRE

(cohabiter) (se rencontrer) (se reconnaître)Vivre au même endroit être en contact

CAPACITE vectorielle COMPETENCE vectorielle

préférence trophique Barrière physique (membrane péritrophique)longévité récepteurs , immunité

Pour le vecteur la transmission se passe à 3 niveaux

BASES GENETIQUES

LA VECTION N’EST PAS LA REGLE, C’EST PLUTOT L’EXCEPTION

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Homme

Vecteur

Population adaptée

Génotype adapté

Population susceptible

EMERGENCE

Virus

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Virus dans les glandessalivaires

Repas 2 pris sur un hôte virémique

Durée de développement extrinsèque de 11 jours (fonction de virus, vecteur, et température)

Repas 6 et suivants infectants

ARBOVIROSES AMOUSTIQUES

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Capacité vectorielle des populations

ma : taux d ’agressivité (Nombre de piqûres / 24h)a : Nombre de repas pris sur homme / 24h par un moustiquep : taux quotidien de survie d ’une population de moustiquesn : durée du cycle extrinsèque du virusb : “compétence vectorielle” (proportion de piqûres réellement infectantes) r : taux de négativation de l’hôte

(1/r = durée de la période infectieuse pour les moustiques)

R0 = TAUX DE REPRODUCTION DE BASENombre de nouveaux cas attendus à partir d’un cas

Fct GENETIQUESCompétence vectorielleCAPACITE VECTORIELLE

ma . a .pn

R0 :-ln. p

x b x1r

HOMME

ARBOVIROSES AMOUSTIQUES

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CAPACITE VECTORIELLE

ma . a .pn

CV :-ln. p

ma : taux d ’agressivité (Nb piqûres / 24h)a : Nb repas pris sur homme / 24h par un moustiquep : taux quotidien de survie d ’une populationn : durée du cycle extrinsèque du virus

TOUTES CES VARIABLES DEPENDENT DE L’ENVIRONNEMENT ET DU CLIMAT :

ma (densité) : température, pluies (gîtes), venta : présence des hommes vs animauxp : température, hygrométrien : température

ARBOVIROSES AMOUSTIQUES

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3 exemples :

Chikungunya et Aedes albopictus

West Nile et Culex sp.

Encéphalite à Tique et Ixodes sp.

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Chikungunya et Aedes albopictus

M. Dukhan

Aedes aegypti

Aedes albopictus

JP Hervy

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LE VIRUS CHIKUNGUNYA EN AFRIQUE DE L ’OUEST

Aedes furcifer , Ae. luteocephalus, Ae. metallicus, Ae. africanus

= VECTEURS SAUVAGES

oeufs oeufs

Saison sècheSaison sèche

Saison des pluies

Transm. Verticale Transm. Verticale

Vecteurs Sauvages

Saison des pluies

Homme

ZONE FORESTIEREVILLAGES

Aedes aegypti + Aedes furcifer, Ae. luteocephalus

= VECTEURS DOMESTIQUES

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Aedes albopictus

Photos Michel Dukhan

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Distribution Distribution actuelleactuelle connueconnue dd’’AedesAedes albopictus albopictus par payspar pays

Avant 1980Avant 1980Expansion 1981Expansion 1981--20052005

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Sholte & Schaffner 2007Distribution d’Aedes albopictus en janvier 2007

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Aedes albopictusPhotos P Delaunay Nice

Aedes albopictus à Nicephoto P. Delaunay

Aedes albopictus à Nicephoto P. Delaunay

Aedes albopictus à Nicephoto P. Delaunay

Aedes albopictus à Nicephoto P. Delaunay

Aedes albopictus à Nicephoto P. Delaunay

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Photos EID Ch. Jeannin

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EID Ch. Jeannin Carte H. Barré

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Préférence trophique d’Ae. albopictusde la Réunion

Delatte at al. unpublished results

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Activité nycthémérale Aedes albopictus

0

10

20

30

40

50

60

8h15

8h45

9h15

9h45

10h1

510

h45

11h1

511

h45

12h1

512

h45

13h1

513

h45

14h1

514

h45

15h1

515

h45

16h1

516

h45

17h1

517

h45

18h1

518

h45

19h1

519

h45

20h1

520

h45

21h1

521

h45

22h1

522

h45

23h1

523

h45

00h4

501

h45

02h4

503

h45

4h45

5h15

5h45

6h15

6h45

7h15

7h45

Heure

Abo

ndan

ce T

otal

e (M

ale+

Fem

elle

)

ExtérieurIntérieur

Delatte at al. unpublished results

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Adultes F0

Repas de sang

Oeufs

Adultes F1

Larves et Nymphes du terrain

Compétence vectorielle

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Schuffenecker et al. (2006)

Polymorphisme du virus Chikungunya

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Susceptibilité d’Ae. albopictus de la Réunion and Mayotte pour le virus Chikungunya

Vazeille et al. 2007. plos One

0

20

40

60

80

100

STAND1

STBEN1

STDEN1

STPAU1

STPAU2

STPIE

1STP

IE2

STPIE

3MAYOT1MAYOT2MAYOT3

Infe

ctio

n R

ate

(%)

CHIK 05.115

CHIK 06.21

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Sélection de la mutation CHIKV A226V concomitante de l’extension d’Aedes albopictus

De Lamballerie et al. 2008 J. Virol.

: mutation A226V

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From De la Fuente Layos, L. 2006. Air transport in Europe in 2005. Statistics in focus, Transport. Eurostat publications KS-SF-07-008-EN-N

Augmentation du trafic de 8% par an

Importation de virus : 900 cas de Chikungunya reportés entre avril 2005 et janvier 2007 en France métropolitaine (Source InVS)

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West Nile et Culex sp.

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Les cycles du virus

Les cycles « classiques » sauvages

Plus de 30 espècesCulex

Culex univittatus, Cx. antennatus,Cx. poicilipes, Cx modestus (Camargue)

Mais aussi :AedesMimomyiaMansoniaAedeomyiaAnophelesCoquillettidiaTique : Amblyomma

Cx. poicilipes Cx. pipiens

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Les cycles du virus

Les cycles urbains

Culex

Cx. pipiens

Cx. pipiens aux USA (depuis 1999 , > 3000 cas par an) et en Europe (Bucarest 1996, Volvograd 1999)

Bucarest New York

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POURQUOI CETTE EMERGENCE RECENTE DE WEST NILE ?

Trois hypothèses non exclusives

Brault et al. 2007 Nat Genet

(1) Génotypes viraux :

sélection de génotypes viraux plus virulents pour les oiseaux et l’homme

Une mutation (NS3-T249P) sur le gène de l’hélicasepourrait expliquer la virulence des souches nord américaines pour les corneilles

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(2) Génotype du vecteur et comportement trophique de Culex pipiens s.l.

Des variations de comportements entre ornithophilie et mammophilie, supporté par un polymorphisme génétique, pourraient expliquer le passage du virus des oiseaux à l’homme et aux chevaux.

Des populations génétiquement différenciées de Cx. pipiens(Cx. p. pipiens et Cx. p. molestus) ont des comportements différents.

Le comportement trophique peut varier aux cours de la saison en fonction de la disponibilitédes oiseaux

Fonseca et al. 2004. Science, Kilpatrick et al. 2006. PLoS Biol.

Populations sténogames, autogènes, non diapausantes, anthropophiles= Cx molestus

Populations eurigames, anautogènes, diapausantes, ornithophiles

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(3) Environnement

Roumanie 1996 : les cas humains sont survenus dans les immeubles insalubres et très peuplés dont les sous sols inondés favorisaient la prolifération de Cx. pipiens

New Haven, USA : distribution des vecteurs potentiels en fonction de NDVI, urbanisation, stress hydrique, distance à l’eau

Highest vegetationvalue

Moderate vegetationvalue

Urban

Culex salinarius

Cx. pipiensCx. restuansBrown et al. 2008. VBZD

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Encéphalite à Tique et Ixodes

L’encéphalite à tique (TBE) est une anthropo-zoonosedue à un flavivirus transmis par des tiques, essentiellement Ixodes ricinus et I. persulcatus, via les rongeurs, surtout les mulots (Apodemus)

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Encéphalite à Tique et Ixodes

Sumilo et al., 2007. PLoS ONE

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Sumilo et al., 2007. PLoS ONE

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Transition socio-économique dans

les républiques Baltes

Déclin de l’agriculture

Régénération des arbustes

Augmentation de la densité de rongeurs

Conscience écologiqueBaisse de la pollution ?

Changement climatique global

Modification de période d’agressivité des tiques: co-feeding

Augmentation de densité de rongeurs

Augmentation des tiques

Augmentation des tiques infectées

Augmentation de l’incidence de TBE

Augmentation du chômage = cueillette

Augmentation des loisirs

Augmentation des Hommes en forêt

?Vaccin ?

D’après Randolph et al., 2007

Développement et survie des tiques

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Quelles leçons de ces émergences ?

L’émergence : un mécanisme multifactoriel (écologie, climat, économie, comportements) et évolutif

Le pire n’est pas toujours sûr (WN), mais le probable est certain à moyen terme (Dengue, Chikungunya)

Détection précoce : suivi de l’extension d’Ae. albopictus

La prévention est essentielle : répulsifs, lutte anti-vectorielle, comportement adapté

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Homme

Vecteur

Population adaptée

Population susceptible

EMERGENCE

Génotype adapté

Virus

EnvironnementCo-adaptationCo-évolution