STEREOCHIMIE DES MOLECULES. Stéréoisomérie de conformation Les conformations dune molécule sont...

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STEREOCHIMIE DES MOLECULES 6 5 1 4 2 3 7 8 CH 3 18 9 10 11 12 13 14 15 15' 14' 13' CH 3 20' 12' 11' 10' 9' CH 3 19' 8' 7' C H 3 17 CH 3 16 CH 3 19 CH 3 20 1' 6' 2' 3' 5' 4' C H 3 18' C H 3 16' CH 3 17'

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STEREOCHIMIE DES

MOLECULES

65

1

4

2

3

7

8

CH318

9

10

11

12

13

14

15

15'

14'

13'

CH320'

12'

11'

10'

9'

CH319'

8'

7'

CH317

CH316

CH319

CH320

1'6'

2'

3'5'

4'CH318'

CH316'

CH317'

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Stéréoisomérie de conformation

• Les conformations d’une molécule sont les différents arrangements de ses atomes qui peuvent être obtenus sans rupture de liaisons.

• On les obtient par rotation autour d’une liaison simple carbone-carbone.

• L’ADN, macromolécule support de l’hérédité, existe sous différentes conformations.

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Stéréoisomérie de conformation

Pour une molécule donnée, la conformation la plus stable est celle d’énergie minimale : Les groupes ou atomes portés par les atomes de carbone de la liaison autour de laquelle se fait la rotation sont alors le plus éloignés possible :

Cas du butane :

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Définition adaptée du site Wikipédia

La chiralité (du grec ch[e]ir : main) est une importante propriété d’asymétrie dans

diverses branches de la science.

Un objet ou un système est appelé chiral s’il constitue l’image dans un miroir plan

d’un autre objet ou système avec lequel il ne se confond pas.

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Les objets suivants sont-ils chiraux ou achiraux ?

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Une boule de cristal

ACHIRAL

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Une règle graduée

CHIRAL

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Des briques de construction

ACHIRAL

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Le soulier de Cendrillon…

CHIRAL

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Un avion sans nom de compagnie sur la carlingue

ACHIRAL

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A la cuisine…

CHIRAL

ACHIRAL

CHIRAL

CHIRAL

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Le réfrigérateur est non superposable à son image dans un miroir plan OBJET CHIRAL

Miroir plan

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Il en est de même pour cette horloge…

Miroir plan

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Stéréoisomères de configuration : les énantiomères

• On appelle stéréoisomères des molécules qui ont la même formule semi-développée mais des arrangements d’atomes différents dans l’’espace.

• Deux énantiomères sont des molécules images l’une de l’autre dans un miroir plan, mais non superposables, même après rotation autour de liaison simple.

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Enantiomères et propriétés physiques

Les propriétés physiques des composés chiraux sont identiques à l'exception de la capacité qu'ils ont de faire tourner le plan de polarisation d'une lumière incidente polarisée. Un des énantiomères fait tourner ce plan de polarisation dans le sens de rotation des aiguilles d'une montre, l'autre dans le sens inverse.

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Mélange racémique

C’est un mélange équimolaire d’un couple d’énantiomères

Il est donc optiquement inactif

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Miroir plan

Ces deux molécules sont l’image l’une de l’autre dans un miroir plan. Elles ne sont pas

en revanche superposables.

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Les liaisons et les atomes sont dans

le plan de la « feuille ».

COOHH

CH 3

O H

C COOHH

CH 3

O H

C COOHH

CH 3

O H

C

Les liaisons et les atomes arrivés

sont en arrière du plan de la « feuille ».

Les liaisons et les atomes arrivés

sont en avant du plan de la « feuille ».

Représentation de Cram

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COOHH

CH 3

O H

C

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Définition : Un atome de carbone est dit asymétrique s’il est lié à quatre atomes ou groupes d’atomes strictement différents. Un carbone asymétrique est repéré par un astérisque. Une molécule possédant un atome de carbone asymétrique est chirale.

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Acide tartrique et Pasteur

**

Présence de 2 carbones asymétriquesPossibilité de chiralité

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Un exemple d’un acide aminé : la leucine

fonction amine

fonction acidecarboxylique

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Un cas particulier : la glycine

• Comme le radical R de la glycine correspond à un hydrogène, le C situé en n’est pas un carbone asymétrique. La glycine n’existe pas sous la forme de deux énantiomères.

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Les deux énantiomères de l’alanine

Miroir plan

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Formation d’un dipeptide

• La liaison entre deux acides aminés se nomme liaison peptidique.

• Chimiquement parlant, il s’agit d’une fonction amide qui se forme lors de la

réaction entre la fonction acide carboxylique de l’AA1 et la fonction amine

de l’AA2.

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Enantiomères et propriétés biologiques

Deux énantiomères ont des propriétés physiques et chimiques identiques tant que le réactif ou le phénomène mise en jeu et non chiral.La plupart des processus du vivant mettent en jeu des phénomènes chiraux : un récepteur biologique ne reconnaitra qu’une forme énantiomère d’une molécule chirale et pas l’autre : deux énantiomères ont des propriétés biologiques différentes.

http://www.ac-creteil.fr/biotechnologies/doc_biochemistry-chirality.htm

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Forme énantiopure

Les deux énantiomères sont séparés et on isole

l’un d’entre eux afin d’obtenir une forme

énantiopure

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Application industrielle de la chiralité dans le domaine chimique

Les deux formes énantiomères de la « tristement célèbre » thalidomide

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Quelques propriétés biologiquesdes formes énantiomères

• Morphine : propriété analgésique

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• Ibuprofène : propriété anti-inflammatoire

Seul l’énantiomère du bas possède une activité pharmacologique

*

*

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Limonène : Propriétés odorantes

Selon que l’on considère l ’énantiomère S ou R, le limonène a soit une odeur de

citron soit une odeur d’orange.

Les récepteurs olfactifs de l’être humain sont donc sensibles comme d’autres capteurs à la chiralité des molécules.

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Pour la culture générale…

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Stéréoisomères : les diastéréoisomères

On appelle diastéréoisomères des molécules de même formule semi-développées, non superposables et qui ne sont pas images l’une de l’autre dans un miroir :

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Stéréoisomères : les diastéréoisomères

Pour qu’une diastéréoisomérie Z/E existe, il est nécessaire que la molécule possède une double liaison et que chaque atome engagé dans cette double liaison soit lié à deux groupes d’atomes différents :

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Stéréoisomères de configuration : les diastéréoisomères

Lorsqu’une molécule présente deux atomes de carbone asymétriques, il existe le plus souvent quatre stéréoisomères dont certains sont diastéréoisomères entre eux :

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Les différentes configurations de la vitamine C

Relation de diastéréoisomérieRelation d’énantiomérie

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Propriétés des diastéréoisomères

• Certaines propriétés physiques et chimiques des diastéréoisomères peuvent être différentes (température de changement d’état, solubilité, pH...) Ils sont donc facilement séparables.

Voir TP

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Deux molécules A et B de même formule brute correspondent-elles à une même

formule plane ?

A et B sont des isomères de constitution.

NON

NON

OUIA et B sont des stéréoisomères.

Peut-on passer de A à B par des rotations autour de

liaisons simples ?

A et B sont des stéréoisomères de conformation.

OUI

A et B sont des stéréoisomères de configuration.

Pour passer d’une molécule à l’autre, il faut casser des liaisons

NON

A et B sont-ils images l’un de l’autre dans un miroir ?OUI

A et B sont des énantiomères.

A et B sont des diastéréoisomères.

NON

NON

OUI

NON

NON

OUI

OUI

NON

NON

NON

OUI

OUI

NON

NON