Staphylococcus aureus sensible à la méticilline et résistant à d’autres antibiotiques :

Étude COLBVH 2009

XVème Journée de Microbiologie Clinique

Le staphylocoque dans tous ses états

18 juin 2010

Coordonateurs : Pierre-Yves Donnio et Alain Le Coustumier

Contexte – Observation initiale – Étude COLBVH 2004

• Période 2000-2002 :

– SASM avec phénotype de R inhabituel

– Phénotype idem SARM majoritaire :

• Kana Tobra MLSb constitutif FQ (KTELF)

– 5 CH : Cahors, Lannion, Rennes, St Brieuc, Vannes

– Perte d’ADN sur la bande de 200Kb portant mecA

• Étude COLBVH SASM-R 2004 :

– Recueil SASM avec 2 R : aminosides / MLS / FQ

– 62 CH ; 250 souches caractérisées / phénotype + génotype

– 92% des SASM-R dérivaient de SARM

– SASM-R épidémiques dans certains CH

SARM SASM SASM

• Clones hospitaliers :

- ST8 70%

- ST5 15%

• Type SCCmec IV ou IVA

• Principaux phénotypes de R :

- KTELF

- KTF

- F

- KTEF

- ELF

Protocole- Objectifs :

- Évaluer- l’incidence des SASM-R dans les CH- le lien avec la consommation antibiotique

- Données :

• Données microbiologiques :

– N de patients avec S. aureus– N de patients avec SARM– N de patients avec SASM-R :

• R FQ avec co-résistance(s) ou non• ou R aminoside + R macrolides/lincosamides

– N isolats par phénotype de R

• Données démographiques :

– N de JH et N entrées

• Consommation antibiotique en DDJ (Dose Définie Journalière) pour 1000 JH par classes

42 CH et 4 CHU

Résultats (1) : % et phénotypes

EF2,1

ELF4,8

KTELF25,0

KTEF5,7

KTF25,1

KTLF3,5

KTEL1,5

KE0,5

F15,6

Autres16,2

EF6,1

ELF28,1

KTELF3,4KTEF

0,8KTF3,9KTLF

0,9KTEL1,6

KE5,5

F36,4

Autres13,3

• 4545 SARM (26%) :

• % des phénotypes :

• KTF : 25,1

• KTELF : 25

• F : 15,6

• 766 SASM-R (4,4%) :

• % des phénotypes :

• F : 36,4

• ELF : 28,1

7343 patients avec S. aureus

Résultats (2) : Incidences SARM

Extrêmes = 0,18 à 1,69

Moyenne = 0,49

Médiane = 0,45

0,0000,0500,1000,1500,2000,2500,3000,3500,4000,4500,5000,5500,6000,6500,7000,7500,8000,8500,9000,9501,0001,0501,1001,1501,2001,2501,3001,3501,4001,4501,5001,5501,6001,6501,7001,7501,800

0 1 2

N S

AR

M / 1

000 J

H

2007

CCLIN

Incidence

N/1000 JH

Est 0,46

Ouest 0,30

Paris-Nord 0,53

Sud-Est 0,41

Sud-Ouest 0,59

Moyenne 0,46

Résultats (3) : Incidence SASM-R

0

0,01

0,02

0,03

0,04

0,05

0,06

0,07

0,08

0,09

0,1

0,11

0,12

0,13

0,14

0,15

0,16

0,17

0,18

0,19

0,2

0,21

0,22

0,23

0,24

0,25

0 1 2

N S

AS

M-R

/

10

00

JH

Extrêmes = 0,036 à 0,238

Moyenne = 0,08

Médiane = 0,06

Incidence relative : P = (NSASM-R / NSARM) x100

• distribution de P en faveur de l’émergence verticale par excisions indépendantes

Moyenne = 17,6

Excision

de

SCCmec

Dissémination

SARM

SASM

« SARM

repenti »

Patient

Émergence verticale. Émergence

horizontale.

NSASM-R = 0,17 NSARM - 0,38

Coefficient Corrélation R = 0,88

Coefficient Détermination R² = 0,77

P < 0,0001

Corrélation entre SASM-R et SARM dans les 46 centres

Correspondance globale des phénotypes

SARM SASM

EF 93 47

ELF 219 215

ELFKT 1132 26

EFKT 257 6

FKT 1136 30

LFKT 158 7

ELKT 69 12

EK 21 42

F 708 279

Autres 733 102

Hypothèse : si les SASM-R dérivent de SARM alors pour chaque phénotype

il doit y avoir corrélation entre les nombres de souches des 2 catégories

R2 = 0,0144

0

50

100

150

200

250

300

350

400

0 200 400 600 800 1000 1200 1400

N de SARM par phénotypes

N d

e S

AS

M-R

par

ph

én

oty

pes

excision complète

SCCmec type IVA

excision partielle, perte de pUB110 et dcs résiduel

LJ RJ

HVR pUB110dcs orfX

LJ RJ

dcs orfX

LJ RJ

orfX

ccrAB4 IS272 mecA

mecR1

HVR pUB110dcs orfX

LJ RJ

PBP2a ANT4’4’’

SASM KTELF

SASM ELF

SASM ELF

SARM KTELF

Profil de résistanceExcision de SCCmec chez SARM

kana-tobra R, genta S, MLSb constitutif, FQ R

excision partielle, pUB110 et dcs résiduels

SARM SASM-R

ELF + KTELF 1351 241

EF + KTEF 350 53

F + KTF 1844 309

Autres 1000 163

N total 4545 766

Corrélation SARM et SASM-R sur l’ensemble des CH en tenant compte des correspondances avant et après excision

Phénotype SASM-R

Excision totale Excision partielle

KTELF ELF KTELF

ELF ELF ELF

KTEF EF KTEF

EF EF EF

KTF F KTF

F F F

Ph

én

oty

pe

SA

RM

NSASM-R = 0,17 N SARM - 6,78

Coefficient Corrélation R = 0,997

Coefficient Détermination R² = 0,994

P = 0,003

N SARM

N S

AS

M-R

0

50

100

150

200

250

300

350

0 250 500 750 1000 1250 1500 1750 2000

Y = 0,127 X + 0,97

Coefficient Corrélation R = 0,62

Coefficient Détermination R² = 0,39

P < 0,0001

0

5

10

15

20

25

0 20 40 60 80 100 120 140 160

N S

AS

M-R

seu

lem

en

t au

x F

Q

N SARM KTF + F

Les SASM résistant seulement aux fluoroquinolonesdériveraient -ils de SARM ?

• Corrélation moindre que pour l’ensemble des phénotypes SASM-R

• Mais statistiquement significative

• Attention ! Excisions de SCCmec ou effets conjoints de la pression antibiotique ?

• Arguments moléculaires à réunir : matière à future étude du Collège

Classe antibiotique

COLBVH

2007

RAISIN 2007

(CH et CHU)

b-lactamines dont 290 310

Pénicillines 260 265

Céphalosporines 40 45

Fluoroquinolones 63 62

Macrolides 14 26

Aminosides 11 ?

• Chiffres de consommation antibiotique pour 42 CH et 4 CHU : DDJ / 1000 JH

• Moyennes comparables à celles rapportées par le RAISIN pour la même période

Consommation antibiotique : le panel de CH est-il représentatif ?

Antibiotiques Catégorie(s)S. aureus

R R² p

TousSARMSARM + SASM-R

0,5250,560

0,2760,314

0,00060,0002

β-lactamines SARMSARM + SASM-R

0,4920,533

0,2420,284

0,00150,0005

Pénicillines SARMSARM + SASM-R

0,3930,452

0,1540,204

0,01340,0039

Céphalo. 3ème G SARMSARM + SASM-R

0,6420,631

0,4120,398

< 0,0001< 0,0001

FluoroquinolonesSARMSARM + SASM-R

0,4560,478

0,2080,228

0,00350,0021

• Corrélations avec catégories agrégées SARM et SASM-R comparées à SARM seuls :

Corrélation incidences et consommation antibiotique

Conclusion

• Relation étroite entre SASM-R et SARM niveaux local et national :

• En moyenne NSASM-R 0,17 NSARM

• SASM avec 2 mécanismes de R : émergence à partir des SARM par excision de SCCmec

• Nécessité d’une étude des caractéristiques moléculaire des SASM résistant aux seules

fluoroquinolones pour déterminer s’ils dérivent de SARM.

• Pression de sélection antibiotique : favorise l’émergence des SASM-R mais pas

toujours dans le même sens que pour les SARM (céphalos 3G)

• Les SASM-R font partie intégrante du paysage staphylococcique des hôpitaux.

Remerciements

• Aux membre du COLBVH, biologistes des 42 CH ayant participé à l’étude

• Aux collègues des CHU de Bordeaux, Brest et HEGP

• Aux pharmaciens ou hygiénistes des 46 CH pour les données de consommation antibiotique

• À Anne-Valérie Apéry pour la mise en forme et l’analyse des données

• À Alain Le Coustumier pour son enthousiasme inaltérable