Osirix : logiciel libre d’imagerie médicale

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Communication breve

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Osirix : logiciel libre d’imagerie medicale

Osirix: Free and open-source software for medical imagery

F. Jalbert*, J.R. Paoli

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Disponible en ligne sur

Recu le :16 mai 2007Accepte le :31 juillet 2007

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Service de chirurgie maxillofaciale, CHU de Toulouse-Purpan, place du Dr-Baylac,

31059 Toulouse cedex 9, France�

www.sciencedirect.com

SummaryOsirix is a tool for diagnostic imagery, teaching and research tasks,

which presents many possible applications in maxillofacial and oral

surgery. It is a free and open-source software developed on Mac OS

X (AppleW) by Dr Antoine Rosset and Dr Osman Ratib, in

the department of radiology and medical computing of Geneva

(Switzerland).

� 2008 Elsevier Masson SAS. All rights reserved.

Keywords: Osirix, Software, Maxillofacial surgery, Three-dimen-sional imagery

ResumeOsirix est un outil d’imagerie diagnostique, d’enseignement et de

recherche, qui presente de nombreuses applications possibles dans

le champ de la chirurgie maxillofaciale et de la stomatologie. Il

s’agit d’un logiciel libre (gratuit et open-source) fonctionnant sur

Mac et developpe par le Dr Antoine Rosset et le Dr Otman Ratib du

departement de radiologie et d’informatique medicale des hopitaux

universitaires de Geneve (Suisse).

� 2008 Elsevier Masson SAS. Tous droits reserves.

Mots cles : Osirix, Logiciel, Chirurgie maxillofaciale, Imagerietridimensionnelle

L es progres realises ces dernieres decennies dans ledomaine de l’imagerie medicale, (du scanner, plusparticulierement en ce qui nous concerne), permettent

aujourd’hui d’obtenir des images d’une tres grande preci-sion. Les logiciels de traitement de ces donnees furentlongtemps reserves aux seuls radiologues et necessitaientdes equipements informatiques particulierement puissants.L’apparition de logiciels grand public et l’augmentation descapacites des ordinateurs personnels permettent depuis peude nous approprier facilement la manipulation de ces don-nees de l’imagerie.Depuis 2004, des radiologues genevois, le Dr Antoine Rosset etle Dr Osman Ratib, developpent Osirix [1], un logiciel libre etgratuit de traitement des images radiologiques, fonctionnantsur plateforme Mac OS X (AppleW) et base sur des technologiesopen-source (Cocoa, VTK, ITK, OpenGL. . .) [2–5]. Ce logicielregulierement mis a jour est devenu de plus en plus perfor-mant et est actuellement utilise dans de nombreux centres derecherche ou hopitaux dans le monde.

* Auteur correspondant.e-mail : [email protected]

0035-1768/$ - see front matter � 2008 Elsevier Masson SAS. Tous droits reserves.10.1016/j.stomax.2007.07.007 Rev Stomatol Chir Maxillofac 2008;109:53-55

Apres importation des donnees scanographiques du patientau format Dicom, le logiciel offre de nombreuses possibilitesde traitement de l’image :� reconstructions 3D volumiques, 3D surfaciques, multi-planaires, en projection d’intensite maximale ;� generation de coupes dans tous les plans de l’espace entemps reel, reconstruction 2D curviligne (denta scanner) ;� fusion d’images multimodalites (TDM-IRM-PET) ;� segmentation d’objet 3D ;� mesures bidimensionnelles (angle, distance, surface) ettridimensionnelles (volume) ;� possibilite d’exporter des images et des animations 3D (demaniere a illustrer un enseignement ou un cours) ;� systeme d’archivage et de communication (Pacs) : c’est-a-dire possibilite de se connecter sur le reseau d’imagerie d’unservice de radiologie ;� realisation d’endoscopies virtuelles.Loin de se substituer au radiologue, c’est un moyen simplepour le chirurgien maxillofacial de mieux apprehender l’ana-lyse de l’imagerie tridimensionnelle, notamment osseuse.L’interet de la manipulation en temps reel de ces reconstruc-tions 3D est bien une meilleure representation spatiale dusquelette ce qui va permettre, dans les cas complexes, une

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F. Jalbert, J.R. Paoli Rev Stomatol Chir Maxillofac 2008;109:53-55

Figure 1. a, b et c : reconstruction 3D volumique et fusion PET-CT.

meilleure apprehension de fractures, de dysmorphoses, delocalisation spatiale d’une lesion, etc.Mais les avantages de ce logiciel ne se bornent pas a cetaspect tridimensionnel. On peut notamment realiser desreconstructions curvilignes type denta scanner passant pre-cisement aux racines des dents voulues (les avantages enchirurgie implantaire et preimplantaire sont evidents).L’exportation de donnees au format STL permet une creationaisee des fichiers necessaires a la realisation de stereolitho-graphies. Les outils de segmentation 2D et 3D s’averent

Figure 3. a, b et c : aide au diagnostic et planning preoperatoire des malforma

Figure 2. a et b : denta scan coupe mince.

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particulierement utiles pour l’etude de regions precises.Une importante quantite de fonctionnalites est ainsi dispo-nible et ne necessite qu’un court apprentissage pour unemaıtrise correcte (fig. 1 a 3).Dans notre pratique courante, nous utilisons desormaisregulierement Osirix comme aide au planning prechirurgicaldes cas complexes (orthognathique, malformatif, traumato-logie, implantologie) pour l’ etude des parties molles (recons-truction en rendu de volume), pour la creation d’illustrationsou d’animation a des fins pedagogiques ou de discussion,

tions complexes.

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mais egalement a des fins de recherche clinique (mesure etcalcul de volume, fusion d’image PET-SCAN en cancerologie,etc.).Enfin, d’autres logiciels de 3D a usage specifique de la CMFsont commercialises, mais restent pour l’heure encore chers.Leur utilisation est orientee principalement vers la simulationet vers le planning 3D orthognathique ou implantaire, maispermet peu de manipulations d’images, notamment en recon-struction ou en rendu de volume. Ces outils nous semblent dece fait complementaires. Par ailleurs, d’autres logiciels libresd’imagerie medicale sont developpes, mais aucun ne nousapparaıt aussi complet que Osirix et son large panel defonctionnalites. Il presente certes l’inconvenient de n’etredeveloppe que sur Mac, mais c’est un logiciel gratuit, puissantet d’acces facile. A l’heure ou les techniques de navigationchirurgicale et de plannification 3D se developpent dans notre

specialite, la familiarisation avec ce type de technologie logi-cielle nous semble particulierement interessante.

References

1. http//www.osirix-viewer.com.2. Katakura Y. High function PACS utilizing Osirix, an open-source

software. No Shinkei Geka 2006;34(2):208–14.3. Rosset A, Spadola L, Pysher L, Ratib O. Informatics in radiology

(infoRAD): navigating the fifth dimension: innovative interfacefor multidimensional multimodality image navigation. Radio-graphics 2006;26(1):299–308.

4. Rosset A, Spadola L, Ratib O. Osirix: an open-source software fornavigating in multidimensional DICOM images. J Digit Imaging2004;17(3):205–16.

5. Rosset C, Rosset A, Ratib O. General consumer communicationtools for improved image management and communication inmedicine. J Digit Imaging 2005;18(4):270–9.

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