Evolution de la résistance bactérienne aux antibiotiques ... · CNR : les attentes Les demandes...
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1
A. Savey, E. Caillat-Vallet CClin Sud-Est, Lyon
Evolution de la résistance
bactérienne aux antibiotiques
(SARM & EBLSE)
Principaux résultats
de la surveillance BMR
Tendances et Actualités
Sud-Est
Sud-Est
4 octobre 2016
Plan
• Résultats et tendances
– BMR Sud-Est 2015
– BMR-RAISIN 2010-2015
– EARS 2014
• Alertes & signalement (eSIN)– EPC
– alerte gène mcr-1
• PROPIAS
• Recommandations & outils
2
Méthodologie
• période : avril – juin 2015
• cible– SARM S. aureus méticilline-R– EBLSE entérobactéries productrices de BLSE
• tout patient admis en hospitalisation complète ou de semaine
• prélèvements à visée diagnostique
• dédoublonnage (même espèce, même ATBg)
– 1 bactérie / patient / période
• Changement méthodologique 2016 – infections à Clostridium difficile (module optionnel)
Evolution de la participation BMR Sud-Est
436 établissements soit 81 430 lits ���� 72 % lits SAE soit 88 % lits CS2015
+3,1%
Web BMR
3
Participation régionale
Région Etab Couverture
n % Etab % lits SAE
AUV-Rh-Alpes 173 48,5 74,2
Auv 38 56 ,7 76,5
RhA 135 46,6 73,6
Corse 8 33,3 59,8
Languedoc-R. 74 44,3 56,5
PACA 170 55,4 78,1
Réunion/Mayotte 7 25,0 59,0
Total Sud-Est 432 48,9 71,7
2015
max
+ 4 hors Sud-Est
Répartition des établissements selon leur type
n étab.
n = 436 2015
Public = 36% des établissements = 60% des lits enquêtés
1 ES sur 2 < 100 lits
4
Description des BMR
Cibles n souches %
SARM 1 313 24.0
BLSE 4 153 76.0
Total 5 466 100,0
2015Top 3 - BLSEE. coli 55,8 %
K. pneumoniae 24,8 %
E. cloacae 10,0 %
Cas acquis : 40%
Délai médian d'apparition des cas acquis à SARM et EBLSE : 12 jours
Evolution des EBLSE
pour les principales espèces
Incidence / 10 000 JH
0,2 0,2 0,20,5 0,5 0,6
0,9
1,61,9
2,32,6
3,23,5 3,6
3,9
1,9 1,8 1,7 1,91,6
22,3
2,93,4
3,8
4,6
5,56 6,2
7
0
1
2
3
4
5
6
7
8ENT AER
ENT CLO
ESC COL
KLE PNE
TOT ENB
total
E. coli
K. pne
E. cloaE. aerog
5
Marqueurs complémentaires
CiblesAntibiotique
sEffectifs
n? S I R
% % % %
SARM vancomycine 1 313 2,1 100,0 0,0 0,0
EBLSE
imipénème
4 153 14,8 99,0 0,4 0,6
E. coli 2 319 15,7 99,8 0,1 0,1
K. pneumoniae 1 032 13,1 98,7 0,4 0,9
E. cloacae 414 11,1 98,9 0,3 0,8
EBLSE
ertapénème
4 153 4,9 96,7 1,0 2,2
E. coli 2 319 3,8 99,6 0,0 0,4
K. pneumoniae 1 032 5,8 97,0 0,8 2,2
E. cloacae 414 7,2 82,3 6,0 11,7
2015
SARM � 0,0 % de Vanco I/REBLSE � 1,0% de imipénème I/R et 3,2% ertapénème I/R.
Evolution de l'incidence des BMR
CSéj SSR
0
0,5
1
1,5
2
2,5
3
3,5
4
20
00
20
01
20
02
20
03
20
04
20
05
20
06
20
07
20
08
20
09
20
10
20
11
20
12
20
13
20
14
20
15
SARM rea
EBLSE réa
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
20
00
20
01
20
02
20
03
20
04
20
05
20
06
20
07
20
08
20
09
20
10
20
11
20
12
20
13
20
14
20
15
SARM ssr
EBLSE ssr
0
0,05
0,1
0,15
0,2
0,25
0,3
0,35
0,4
0,45
0,5
20
00
20
01
20
02
20
03
20
04
20
05
20
06
20
07
20
08
20
09
20
10
20
11
20
12
20
13
20
14
20
15
SARM sld
EBLSE sld
*
*
* 2009
Séparation SSR SLD
REA SLD
6
Evolution de l'incidence des BMR
selon la catégorie d'établissement
A : majorité de court séj. B : minorité de court séj.
SARM
EBLSE
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
0,9
1
2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015
A.SARM
B.SARM
0
0,1
0,2
0,3
0,4
0,5
0,6
0,7
0,8
2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015
A.EBLSE
B.EBLSE
Distribution des ES selon l'incidence
SARMEBLSE
A - ES comprenant une majorité de lits de court séjour (CHU, HOP, MCO, MIL, CLC)
B- ES avec une majorité de lits de moyen et long séjour (DIV, MEP, PSY, ESR, ELD)
2015
A B A B
* extrême > P75+3 IIQ éloigné > P75+1,5 IIQ maximum hors outliers
P75 médiane P25 minimum
Outliers : 8 A et 9 B Outliers : 11 A et 4 B
7
Module optionnel EHPAD
Evolution à 5 ansAnnée 2010 2011 2012 2013 2014 2015Etablissements (EHPAD) n 81 92 109 113 110 110Lits n 9 384 17 642 13 851 14 991 15 282 15 949Journées d'hébergement n 795 149 943 448 1 206 992 1 299 617 1 339 273 1 405 357 SARM observées n 81 80 72 81 67 58BLSE observées n 49 61 77 99 139 143% résistance dans l'espèce
(SARM)% 58,7 63,5 23,8 44,8 42,9 40,6
Incidence SARM /10 000 JH 1,02 0,85 0,60 0,62 0,50 0,41
Incidence EBLSE /10 000 JH 0,62 0,65 0,64 0,76 1,04 1,02
BMR - Raisin 2015 (tendances)
8
SARM / BMR-Raisin 2015
978 ES avec court séjour
1426 ES (toutes catégories)
EBLSE / BMR-Raisin 2015
978 ES avec court séjour
1426 ES (toutes catégories)
9
BMR-RAISIN 2010-2014 (poster ECCMID)
Réa
Cséj
Ts séj
SSR-LD
Bactériémie à SARM : - 20%Bactériémie à EBLSE : + 63%
E. Coli = 58% K.pneumoniae = 24%
Cohorte de 614 établissements
SARM EBLSE
EARS 2014 - SARM2003 29%
17.4%
10
SARMEARS 2011-2014
• Hausse : 2 pays !– dont le Danemark
• Baisse : 8 pays– France : 20,1 � 17,4
• Variations– min. 0.9% Netherlands– max. 56.0 Roumanie
• reste une priorité– 7 pays > 25%– EU/EAA : 18,6 �17,4%
(baisse)(= moyenne européenne pondérée selon pop.)
EARS 2014 – E. coli C3G-R
9.9%
2003
< 1%
E. Coli
Carb-R<0,1%
11
E. coli C3G-REARS 2011-2014
• Hausse : 12 pays• France : 8,2 � 9,9
• Baisse : 1 ! • Danemark
• Variations– min. 3,3% Islande – max 40,4% Bulgarie
• EU/EAA – Gradient Sud (pays > 25%)
– hausse de 9.6% à 12.0%(= moyenne européenne pondérée selon pop.)
• % BLSE parmi E. coli C3G-R
• France : 78.5% BLSE+
% E. coli carb-R– max. Grèce 1,2%– France < 0.1 %– EU/EAA 0.1%
EARS 2014 – K. pneumoniae C3G-R
29.6%
20054 %
K. pne
Carb-R0,5 %
12
K. Pne C3G-REARS 2011-2014
• Hausse : 11 pays• France : 25,3 � 29,6
• Baisse : 5 pays • Danemark
• Variations– min. 0,0% Islande – max 74,8% Bulgarie
• EU/EAA – Gradient Sud (pays > 25%)
– hausse de 23.6% à 28.0%(= moyenne européenne pondérée selon pop.)
• % BLSE parmi K. pne C3G-R
• France : 71.6% BLSE+
% K. pne carb-R– max. Grèce 62,3 %– France 0,5 %– EU/EAA 7,3 %
SIGNALEMENT & ALERTES
EPC
MCR-1
13
Signalements SE, 2015 (539)
CClin Sud-Est / Période du 1er janvier au 31 décembre 2015
0
100
200
300
400
500
600
AUV COR LR PACA REU RHA Sud-Est
EPC
ICD
ABRI
ERG
E-C3GR
SARM
Autre
75%18%
37%
50%
39%
36%
42%
53%25%
37% 21%43%
45%
34%
64,6%
EPC : Quid en France ?
Données : 4 Septembre 2015
3417 patients446 décès (non nécessairement imputable à une infection)
Mortalité: 13%Colonisation/ Infection = 80/20Infections: Urinaires (47%)
Bactériémies (20%)Pneumopathies (14%)
Cas secondaires dans 12% des épisodes
Nombre d’épisodes d’EPC, 2012 – 2015, par
département
Taille des épisodes les plus importants (N = 7)
Bilan au 4 septembre 2015 (N= 1 866 épisodes)
L’analyse par taille présente uniquement les épisodes les
plus importants (≥ 15 cas) avec une évolution récente
(nouveaux cas < 6 mois)
2 026 épisodes au total au 4 septembre 2015 soit 3 417 cas
2009: 10, 2010: 28, 2011: 113, 2012: 233, 2013: 402, 2014: 656, 2015: 583
14
EPC – mécanisme de résistance
2026 épisodes
Klebsiella > E. coli > E. cloacae59% 34% 12 %
Episodes impliquant des EPC
en France – (conclusion)
• Nombre d’épisodes impliquant des EPC encore limité en France
• Augmentation significative du nombre d’épisodes signalés ces 3 dernières années (EPC = 38% des signaux)
• 7 épisodes de taille conséquente évolutifs sur les 6 derniers mois
• Entérobactéries = toujours K. pneumoniae puis E. coli
• Carbapénèmase la plus fréquente : OXA-48
• Episodes en lien avec un pays étranger (nb pays listés �)
• Episodes sans lien avec un pays étranger � : 2010 : 32% � 2015 : 46%
• Circulation autochtone EPC OXA-48 en France mais pas une endémie !
• Situation des EPC au niveau international – poursuivre les dépistages des patients ayant été hospitalisés dans un pays étranger
– renforcer la vigilance devant tout isolement au laboratoire d’une entérobactérie suspecte d’être productrice de carbapénémase
15
Envoi de la souche (note 19p)http://www.cnr-resistance-antibiotiques.fr/ressources/pages/Note_technique_v5_mai16.pdf
+ Formulaire de demande téléchargeable sur le site internet du CNRhttp://www.cnr-resistance-antibiotiques.fr/ressources/pages/Formulaire_de_demande_v3_2016.pdf
Données surlignées en jaune : critiques pour la prise en charge de la souche
CNR : les attentes
Les demandes d'analyses (caractérisation des enzymes et comparaisons génotypiques) portant sur plus de 5 souches par épisode doivent faire l'objet d'un accord préalable avec l'ANSP.
PROPIAS 2015 – Axe 2
16
Propias 2015
Objectifs chiffrés
eSIN
Bilan LIN
Bilan LIN
Objectifs quantifiés - SE 2015 :
- cas 2nd /cas BHRe : 21%
- 20% d’épisodes avec cas 2nd
(33/164 épisodes )
32
GÈNE MCR1 DE RÉSISTANCE PLASMIDIQUEÀ LA COLISTINEDEPUIS QUAND EXACTEMENT?
TITRE DE LA PRÉSENTATION
CHEZ L’ANIMAL :
1980’s en Chine et 2005 en Europe
CHEZ L’HOMME : 2008
chez shigella sonnei au vietnam
LIU 2011-2014 :
En CHINE
Remerciements à Anne Carbonne - ANSP
17
33
EXTENSION MCR1 _ ECDC JUIN 2016
TITRE DE LA PRÉSENTATION
Remerciements à Anne Carbonne - ANSP
Mécanisme de résistance émergent
(mcr1) : historique de l’alerte
� Chine : Emergence chez l’homme en 2015
� USA : Diffusion media du premier cas clinique … MMWREscherichia coli Harboring mcr-1 and blaCTX-M on a Novel IncF Plasmid: First report of mcr-1 in the USA / P Mc Gann et al AAC May 2016
� France 2015 : Contact InVS-CNR : recherche rétrospective de cas depuis mi 2015� 1ère fiche alerte ANSP : 8 juillet 2016� 25-28 juil. CNR : 2 premières souches d’entérobactéries mcr-1 (souches N Calédonie 2014)
� 29 aout, publication* de 2 souches isolées à Marseille et Angers (rétrospectives)
� 2e fiche alerte ANSP : 8 aout 2016
� Message MARS : 2 sept 2016 : information et recommandations CNR� 7-12 sept 2016 : 3 cas signalés en France métropolitaine dont 1 EPC
• 1 cas de Grenoble K. pneumoniae BLSE + mcr-1
• 1 cas de Clermont-Ferrand, E. coli BLSE + mcr-1
• 1 cas de Clamart , E. coli NDM-1 + mcr-1
Rolain JM et al. Plasmid-mediated mcr-1 gene in colistin-resistant clinical isolates of K. pneumoniae in France et Laos. Antimicrob Agents Chemother 29/08/2016
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Résistance acquise à la colistine
chez les EPC en France
Message d’alerte rapide sanitaire
n° 12 du 2 sept 2016Mécanisme non détecté par techniques de routine
Résistance plasmidique hautement transférable
Risque d’impasse thérapeutique si EPC
A venir …
• Evolution de l’outil eSIN 2017 : onglet BHRe
– ne pas emboliser la fonction « alerte »
– meilleur suivi épidémiologique : • cas index, mécanisme de Rce, lien étranger, lien CNR …
• mesures : admission, prévention, dépistage, transfert, suivi réadm. (recapture)
• Recommandations HCSP (mcr-1) � octobre 2016– liste BHRe / recommandations identification labo
• Réactualisation des précautions standard (SF2H) � juin 2017
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Autres outils
et toujours les programmes d'actionStopRisk (PS)StopRisk + (PCH)Hygiène des mainsZéro bijou
+ charte ville en 2017
Conclusion
• BUA et BMR = axe prioritaire n° 2 du PROPIAS 2015– à l'origine de nombreux indicateurs– BHRe signalement +++
• Tendances– Baisse des SARM
� poursuite des efforts (PS/PCH, SHA +++)
– Hausse des BLSE (++ en court séjour) �gestion des excréta ++ et BUA ++� lutte contre l'installation des EPC
• Les bactéries iront toujours plus vite que nous ! �Rce mcr1 à la colistine