Diversité du VIH Surveillance dans le cadre de la DO
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Diversité du VIHSurveillance dans le cadre de la DO
F BarinInserm ERI 19 - CNR VIH
CHU Bretonneau - Université F Rabelais
Tours
Diversité du VIHDiversité du VIHDiversité du VIHDiversité du VIH
HIV-1HIV-1 HIV-2HIV-2
HIV-1HIV-1OO
HIV-1HIV-1MM
HIV-1HIV-1NN
AA
CC
virusvirusmosaïquesmosaïques
BB
DDEE
GG
HH
IIJJ
FF
AABB
CCDD EE
CRF01-AECRF01-AE > 30 CRFs> 30 CRFs
CRF04-cpxCRF04-cpx
KK
FF
HHGG
Diversité du VIHDiversité du VIHDiversité du VIHDiversité du VIH
HIV-1HIV-1
HIV-1HIV-1OO
HIV-1HIV-1MM
HIV-1HIV-1NN
AA
CC
virusvirusmosaïquesmosaïques
BB
DDEE
GG
HH
IIJJ
FF
CRF01-AECRF01-AE > 30 CRFs> 30 CRFs
CRF04-cpxCRF04-cpx
KK
Distribution géographique
Résultats(mars 2003 – décembre 2005)
11 190 nouveaux diagnostics
18 HIV-1/2(0.2%)
131 HIV-2(1.4%)
10 874 HIV-1
10 892
543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O
2 HIV-1M/O(0.2%)
3 428 non-B**(45.9%)
414 NT(M)4 039 B*(54.1%)
* dont 2 co-infections HIV-2** dont 16 co-infections HIV-2
2 457 nondisponibles
167 inconnus
HIV-2 F M Total
MSM Heterosex. Transfusion Unknown
65 1
27
3 42 0 11
3 107
1 38
93 56 149
• France (n=15)• Portugal (n=2)
• Côte d’Ivoire (n=54)• Mali (n=17)• Senegal (n=9)• Guinea (n=7)• Guinea-Bissau, Ghana, Mauritania (n=3)• Cape-verde (n=2)• Burkina, Gambia, (n=1)
• Cameroon (n=1)• Congo (n=1)
• Madagascar (n=1)
• Algérie, Peru, Colombie (n=1)• Unknown (n=26)
F M Total
MSM Heterosex. Transfusion Unknown
65 1
27
3 42 0 11
3 107
1 38
93 56 149
HIV-2
• France (n=15)• Portugal (n=2)
• Côte d’Ivoire (n=54)• Mali (n=17)• Senegal (n=9)• Guinea (n=7)• Guinea-Bissau, Ghana, Mauritania (n=3)• Cape-verde (n=2)• Burkina, Gambia, (n=1)
• Cameroon (n=1)• Congo (n=1)
• Madagascar (n=1)
• Algérie, Peru, Colombie (n=1)• Unknown (n=26)
F M Total
Heterosex. Unknown
7 -
2 2
9 2
7 4 11
HIV-1 group O
• France (n=2)
• Cameroon (n=8)• Chad (n=1)
Résultats(mars 2003 – décembre 2005)
11 190 nouveaux diagnostics
18 HIV-1/2(0.2%)
131 HIV-2(1.4%)
10 874 HIV-1
10 892
543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O
2 HIV-1M/O(0.2%)
3 428 non-B**(45.9%)
414 NT(M)4 039 B*(54.1%)
* dont 2 co-infections HIV-2** dont 16 co-infections HIV-2
2 457 nondisponibles
167 inconnus
Résultats: B vs non-B(mars 2003 - décembre 2005)
Non-B p
N % (IC 95 %)
Sexe
Hommes 1 406 32.8 (31.4 - 34.2) < 0.0001
Femmes 2 006 63.5 (61.9 - 65.2)
Mode de contamination
Rapports homosexuels 197 12.0 (10.4 - 13.6) < 0.0001
Rapports hétérosexuels 2 489 58.4 (56.9 - 59.9)
Injection de drogues 27 15.8 (10.3 - 21.3)
Autres/Inconnu 699 50.8 (48.1 - 53.4)
3 412 / 7 449(45.8%)
Résultats: B vs non-B(mars 2003 - décembre 2005)
Non-B p
N % (IC 95 %)
Nationalité
France 666 21.4 (20.0 - 22.9) < 0.0001
Europe (hors France) 45 30.4 (23.0 - 37.8)
Afrique subsaharienne 2 096 78.6 (77.0 - 80.1)
Afrique du Nord 57 37.5 (29.8 - 45.2)
Autres/Inconnu 548 39.9 (37.3 - 42.5)
B vs non-B / infections récentes (mars 2003 - décembre 2005)
Homo-bisexuels
B Non-B NT
Nationalité
France (795) 369 63 363
Europe (hors France) (26) 11 1 14
Afrique sub-saharienne (7) 3 4 -
Afrique du Nord (4) 2 - 2
Autres/Inconnu (118) 45 9 64
Total (950) 430 77 443
(46.6%)
• 77/507 (15.2 %)• 63/432 (14.6 %)
B vs non-B / infections récentes (mars 2003 - décembre 2005)
Rapports hétérosexuels
B Non-B NT
Nationalité
France (422) 158 96 264
Europe (hors France) (8) 4 3 1
Afrique subsaharienne (229) 42 127 60
Afrique du Nord (21) 7 5 9
Autres/Inconnu (133) 55 41 37
Total (813) 266 272 275
(33.8%)
• 272/538 (50.6%)• F: 96/254 (37.8%) non-B• Af S-S: 42/169 (24.9%) B
Résultats(mars 2003 – décembre 2005)
11 190 nouveaux diagnostics
18 HIV-1/2(0.2%)
131 HIV-2(1.4%)
10 874 HIV-1
10 892
543 NT 7 881 HIV-1M 9 HIV-1O
2 HIV-1M/O(0.2%)
3 428 non-B**(45.9%)
414 NT(M)4 039 B*(54.1%)
* dont 2 co-infections HIV-2** dont 16 co-infections HIV-2
2 457 nondisponibles
167 inconnus
NT: infections récentes pour la plupart
Génotypage sur DSS
RNA extractionRT-PCR (env)JC Plantier et al., AIDS 2005
- 460 bp
SéquençageAnalyse phylogénétique
302 échantillons sélectionnées: 100 M 168 NT Plupart récents. M et NT consécutifs (< 20 janvier 2005) 22 B 12 NB
Résultats: génotypage
Génotypage
B Non-B Non-amplifiés
Sérotypage
B (22) 12 1 9
Non-B (12) - 6 6
M (100) 38 9 53
Non-typables (168) 75 28 65
Total (302) 125 44 133
• CRF02_AG: 20• A: 7• G: 4• CRF01_AE: 2• D: 2• F: 2• Autres: 7
Résultats: génotypage(facteurs de risques)
Hommes FemmesB Non-B NT Total B Non-B NT Total
Homo-Bis. 80 13* 47 140 - - - -
UDI - - - - 2 - 1 3
Hétérosex. 20 5 23 48 17 17 46 80
Inconnu 6 4 12 22 - 5 4 9
Total 106 22 82 210 19 22 51 92
* Dont 9 français nés en France