Bras courts des acrocentriques : attention aux pièges ! XXIVe colloque ATC 10 septembre 2014 Pierre...
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Bras courts des acrocentriques : attention aux pièges !
XXIVe colloque ATC
10 septembre 2014 Pierre Serra
Laboratoire de Cytogénétique Constitutionnelle de Lyon
Structure des bras courts des acrocentriques
_« Satellite », ADN satellite type I_« Tige » = NOR : organisateurs nucléolaires (plusieurs copies par chromosome), ARNr_Bras court proximal, ADN satellite β et type III
_Centromère : ADN a-satellite
p13
p12
p11.2
p11.1q11.1
q11.2
q12
Bras long
Séquences communes à tous les acrocentriques Taille des bras courts des acrocentriques comparable à
celle d’un 18p de la même métaphase (Verma et al. 1977)
Polymorphismes de taille des acrocentriques
Variations de taille Fréquemment observées Potentiellement importantes Le plus souvent non pathologiques Non signalées sur le compte-rendu
Polymorphismes de taille des acrocentriques
Ils sont dûs : À des gains de nombre de copies au sein du
bras court allongé À des réarrangements avec d’autres bras
courts des acrocentriques (crossing over inégal lors de la méiose) voire avec Yq12 Translocations Insertions
Doivent leur bénignité À la grande pauvreté en gènes de ces régions Au caractère redondant dans le génome de ces
régions au caractère non dose-dépendant des régions
concernées par ces remaniements
La taille normale d’un acrocentrique ne garantit pas l’absence d’anomalie
Risque de confondre des dérivés de translocations pathologiques avec ces polymorphismes
Polymorphismes de taille des acrocentriques
Quatre cas d’anomalies des bras courts
1)Cas de diagnostic pré-natal
Patiente de 18 ans 1e grossesse Risque séquentiel intégré au 2e trimestre : 1/10 000 Échographie fœtale : agénésie du corps calleux
Cas 1
Caryotype fœtal à 21 SA
Bandes G
Bandes R
Bandes R
Bandes R
Cas 1
ACPADuplication en 20q13.2q13.33 de 8,3 Mb
Courbe rouge : Patient en Cy5 – Témoin 1 en Cy3Courbe verte : Témoin 2 en Cy5 – Patient en Cy3
Cas 1
Sondes20pter Vert20qter Rouge
46,XY,der(14)t(14;20)(p11q13)
Trisomie 20qter par dérivé 14 d’une t(14;20) responsable d’une trisomie 20qter pure.
FISH
Chr 20 normaux
Dérivé
Cas 1
Caryotype fœtal à 21 SA
Bandes G
Bandes R
Bandes R
Bandes R
Cas 1
2)Cas d’une fille de 7 ans
Difficultés d’apprentissage avec troubles de l’attention Dilatation aortique Retard de croissance FISH 7q11.23 normale (sd Williams-Beuren)
Cas 2
Caryotype
Bandes G
Bandes G
Bandes R
Bandes R
Bandes R
Cas 2
ACPADuplication en 22q13.31q13.33 de 5.5 Mb
Courbe rouge : Patient en Cy5 – Témoin 1 en Cy3Courbe verte : Témoin 2 en Cy5 – Patient en Cy3
Cas 2
FISH
SondesN25 22q11.2SHANK3 22q13.3Acro p-arm (NOR)
46,XX,der(22)(qter->q13.31::p11.2->qter).ish der(22)(NOR-,SHANK3+,N25+,SHANK3+)
Signal vert sur le bras court du 22Absence de signal orange (acrop-arm) sur ce même 22
dérivé
Chr 22 normal
Cas 2
Caryotype
Bandes G
Bandes G
Bandes R
Bandes R
Bandes R
Cas 2
3)Cas d’un garçon de 4 mois
Dysmorphie faciale modérée Hypotonie Malformations des organes génitaux externes
Cas 3
Caryotype
Bandes G
Bandes G
Bandes R
Bandes R
Bandes R
Cas 3
ACPADuplication en 3p26.3-p24.3 de 21,3Mb
Courbe rouge : Patient en Cy5 – Témoin 1 en Cy3Courbe verte : Témoin 2 en Cy5 – Patient en Cy3
Cas 3
FISH
Sondes3pterAcro p arm (NOR)13qter
Chr. 3 normal
Chr. 3 normal
Dérivé du chromosome 13 avec translocation distale par rapport aux NOR
46,XY,t(3;13)(p24.3;p13)
Chr 13 normal
Cas 3
Interprétation des sondes acrop-arm
Chez ce patient : Confusion en FISH d’un chromosome 15 avec un
chromosome 13 due à des NOR volumineux sur un chromosome 15
Risque d’erreur d’identification du dérivé (ici un chromosome 13)
Par ailleurs, perte des NOR possible sur un chromosome
Nécessité d’associer des sondes spécifiques de chromosome pour certifier la nature du dérivé
Cas 3
Caryotype
Bandes G
Bandes G
Bandes R
Bandes R
Bandes R
Cas 3
4) Cas d’un garçon de 3 mois
Retour veineux pulmonaire anormal Dysmorphie faciale Imperforation anale Chez sa mère : cardiopathie et colobome
Suspicion de cat-eye syndrome
Cas 4
Caryotype
Bandes G
Bandes R
Bandes R
Bandes R
Cas 4
ACPATriplication en 22q11.1q11.21 de 2,5Mb
Courbe rouge : Patient en Cy5 – Témoin 1 en Cy3Courbe verte : Témoin 2 en Cy5 – Patient en Cy3
Cas 4
FISH
Sondes 22qter22q11.1
46,XY,trp(22)(q11.1;q11.21)Triplication homogène du segment proximal du chromosome 22
dérivé
Chr 22 normal
Cas 4
FISH
A
CTD-3144O3 (22q11)Cen 14/22 (Kreatech)NORs
A
CTD-3144O3 (22q11)Cen 14/22 (Kreatech)NORs
CC
B
der 22
chr 22
B
der 22
chr 22
46,XY,trp(22)(q11.1;q11.21)
Diapo Sarra Dimassi
Cas 4
caryotype
Bandes G
Bandes R
Bandes R
Bandes R
Cas 4
Conclusions
Nombreux polymorphismes de taille des bras courts des acrocentriques
Remaniements pathologiques bien plus rares Remaniements pathologiques semblant plus
faciles à détecter en bandes R ? Techniques ordinaires (Giemsa) et/ou
rechercher des associations Nécessitent une expérience Pas toujours suffisants
Conclusions
Intérêt de l’ACPA : identifier l’origine du matériel supplémentaire
Intérêt de la FISH : reconnaître le dérivé et donc le mécanisme (impossible avec l’ACPA seule, ou la qPCR)
Intérêt en FISH des sondes des NOR Mais nécessité d’y associer des sondes spécifiques
pour reconnaître le dérivé étudié (perte des NOR possible)
Remerciements
Techniciennes/ingénieures Eudelyne Alix, Christelle Angei, Emmanuelle
Banquart, Chantal Beche, Christine Bel, Anne Fautrelle, Hélène Guilbert, Catherine Hempel, Brigitte Jelassi, Sylvie Josue, Audrey Labalme, Chantal Lavert, Jessica Michel, Isabelle Morin, Caroline Perbet, Christine Valex
Secrétaires : Laurence Caine, Michelle Martin
Médecins : Dr Rafat, Pr Sanlaville, Dr Schluth-Bolard, Dr Till