Aspects génétiques de la FPI et des autres PID...

35
Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiques Dr Raphael Borie Service de Pneumologie A Hôpital Bichat Journée du DES de pneumologie 7 octobre 2016

Transcript of Aspects génétiques de la FPI et des autres PID...

Page 1: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Aspects génétiques de la FPI et

des autres PID idiopathiques

Dr Raphael Borie

Service de Pneumologie A

Hôpital Bichat

Journée du DES de pneumologie 7 octobre 2016

Page 2: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Introduction

• Homme de 72 ans

• Suivi pour une FPI

• Pas de maladie systémique clinique ou

biologique

• Pas d’exposition pneumotoxique hors tabac

• Deux frères et une sœur atteints de fibrose tous

décédés

Page 3: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Formes familiales de fibrose

• La présence de plusieurs cas de fibroses

dans une même famille est elle un

hasard?

• Faut-il

– Faire une enquête génétique?

– Laquelle et ou?

– Jusqu’à quel âge?

Page 4: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Pneumopathie Interstitielle

Familiale

• Définition: au moins 2 membres d’une

même famille présentant une pneumopathie

interstitielle idiopathique

– Quel que soit le phénotypeSteele, AJRCCM, 2005

• Proposition: au moins 2 membres d’une

même famille présentant une pneumopathie

interstitielle idiopathique

– Quel que soit le phénotype

– Y compris les formes secondaires

Page 5: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Augmentation du risque de PID chez

les apparentés

• Prévalence de la FPI de 5 à 50/100.000

• ~10% des patients atteints de PID ont un apparenté atteint de PID– 8% dans la cohorte incidente française COFI (250

patients)

– 17,5% d’une cohorte de PHS ont un apparenté atteint d’une PID

• Un antécédent familial de FPI – x6 le risque de FPI

– x4 le risque de décès par fibrose

Nunes, WASOG, 2013; Garcia-Sancho, 2011, Res Med; Okamoto, Respiration,

2013; Scholand, Lung, 2013

Page 6: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Physiopathologie de la FPI

Lésions répétées:

Tabac,

RGO…

-Génétique

-Temps

Cellules épithéliales

Cellules mésenchymateuses

Cellules circulantes

Médiateurs

Pro-fibrosants

Facteurs

pro-apototiques

Page 7: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

TRÈS RARE COMMUN

0.001 0.005 0.05

Fréquence de l’allèle

Puissance de l’effet

ELEVÉ

FAIBLE

1.1

1.5

50.0

3.0

MUTATIONS

POLYMORPHISMES

Maladie mendélienne ou

facteur de risque génétique

Manolio, Nature, 2009

Page 8: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Ces polymorphismes pourraient

aider au diagnostic ou modifier

la réponse thérapeutique

Oldham, AJRCCM,2015

Survie sous NAC en fonction du polymorphisme de TOLLIP

Page 9: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

53ax2 x3

Transmission autosomique

dominante dans 80% des casI

II

III

IV

Transmission verticale:

Transmission autosomique

dominante

Patients de plus en plus jeunes au

cours des générations

Phénomène d’anticipation

73a

33a

Page 10: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

TRÈS RARE COMMUN

0.001 0.005 0.05

Fréquence de l’allèle

Puissance de l’effet

ELEVÉ

FAIBLE

1.1

1.5

50.0

3.0

Gènes:

télomères

surfactant

Gènes

MUC5B

TERT

Génétique et FPI

Mendélien et polymorphismes

Page 11: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

De très nombreux gènes impliqués

TERT 15%

Inconnu 60%

TERC 5%

STING 1%SFTPA1 1%

SFTPC 1%

SFTPA2 1%

RTEL1 8%

PARN 4%

ABCA3 1%

TINF2 1%

DKC1 1%

COPA 1%

Page 12: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

…mais des gènes qui font sens

TERT 15%

Inconnu 60%

TERC 5%

STING 1%SFTPA1 1%

SFTPC 1%

SFTPA2 1%

RTEL1 8%

PARN 4%

ABCA3 1%

TINF2 1%

DKC1 1%

COPA 1%

Telomere 25-30%

Inconnu 60%

Autres syndromes

3-5%

Surfactant

3-5%

Age

Genes

Temps

Infection

Pollution

TabacEnvironnement

Particules

FIBROSE

Page 13: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Proportion des différentes mutations en

fonction de l’âge

0

10

20

30

40

50

60

70

80

90

100

0 10 20 30 40 50 60 70 80

Ages en années

%

Δ Développement:

surfactant

Δ Vieillissement:

télomérases

Page 14: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

OU

OU

Télomérases

Armanios, Mut Res, 2012

Page 15: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

18,2% de patients mutés

FIBROSES

FAMILIALES

N=153

Prévalence des mutations TERT/TERC

Page 16: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

N= 103

Variants 8%

N=7

Variants 2%

N=31

Variants 32%

N=7

Variants 85%

N=10

Variants 10%

N=52

Variants 21%

N=12

Variants 8%

SIGNES PERSONNELS

EXTRA-PULMONAIRES

N=119

SIGNES FAMILIAUX

EXTRA-PULMONAIRES

N=40

FIBROSES

FAMILIALES

N=153

Borie, ERJ,2016

Page 17: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Pro

babili

ty o

f m

uta

tion

Age at diagnosis

Probabilité de mutation TERT/TERC en fonction de l’âge

Page 18: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

NFS au diagnostic des patients

mutés TERT/TERC

19

0

100000

200000

300000

400000

500000

600000

Patientsmutés

Patients nonmutés

/mm3

Plaquettes VGM

60

70

80

90

100

110

120

130

fl

Patients

mutés

Patients non

mutés

Page 19: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Diaz de Leon, PLoS One 2010, Borie, ERJ, 2016, Newton, ERJ, 2016

Aspect du scanner

PIC typique PIC possible Atypique/PPFE

50-74% 15-25% 15-25%

Page 20: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Diagnostic pulmonaire

FPI49%

Inclassable

28%

PINS7%

Protéinose

alvéolaire3%PHS

9%

PR-PID2%

Toxique2%

PID secondaires 13%

Borie, ERJ, 2016

Diagnosis 77

FPI 35 (45,5)

PINS 3 (2,6)

DIP 1 (1,3)

PPFE 8 (10,4)

Inclassable 15 (19,5)

PHS 9 (11,7)

Connectivite-PID 2 (2,6)

IPAF 5 (6,5)

Newton, ERJ, 2016

Page 21: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

• 40% des patients avec une mutation de TERT

développent une fibrose

– Age moyen 57 ans

• 0 avant 40 ans

• >60% après 60 ans

– 60% d’homme

• Age moyen des hommes 54 ans

• Age moyen des femmes 63 ans

– Exposition à des toxiques environnementaux

• 96 % avec fibrose vs 65% des patients sans fibrose

(p=0,005)

Pénétrance

Cronkhite, AJRCCM, 2008; Diaz de Leon, PLoS One 2010

Page 22: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Evolution

• Médiane de survie 3 ans

• Quelle que soit l’histologie ou le gène muté

• Décroissance de la CV≈300 mL/an

Diaz de Leon, PLoS One 2010; Newton, ERJ, 2016

Page 23: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Quel traitement

Pirfenidone, probablement pas?

> 10% FVC decline n, (%)Before After

11 (36.7%) 11 (36.7%)

Before initiation After initiation-250

-200

-150

-100

-50

0

NS

Varia

tio

n F

VC

per m

on

th

Annual FVC Rate Decline (mL), Mean

± SD375.9 ± 103.6 426.9 ± 98.91

Justet, ERS, 2016

Page 24: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

N Engl J Med 2016;375:1095-1096.

Changes in Pulmonary Forced Vital Capacity (FVC) in Patients Treated with Danazol.Danazol, à confirmer?

Page 25: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Transplantation pulmonaire?

Attention aux plaquettes!

• Risque de toxicité hématologique++– Adaptation thérapeutique des immunosuppresseurs

• Survie médiane <1 an dans la série française (9 patients)– Amélioration depuis modifications thérapeutiques et meilleure

sélection

Silhan, ERJ, 2014; Borie, JHLT, 2015, Turkman, JHLT, 2015

Après 01/01/2014

Avant 01/01/2014

P=0,2

Page 26: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Autres gènes du complexe

télomérase: RTEL1Auteurs Cogan Kannengiesser Stuart

Fréquence 9/188 4/35 puis 9/70 5/99

N 47 21 19

Age moyen 64,8 55 [29-80] 65,3

Anticipation ? Peut-être Oui

FPI 67% 66% >50%

« Atypies » ? 3 sarcoïdose

1 PR

1 hépatite auto-

immune

1 Sjogren

1 patient:

thrombopénie et

macrocytose

Cogan, AJRCCM, 2015; Kannengiesser, ERJ, 2015; Stuart, Nat genet, 2015

Page 27: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Les même risques pour tous les

gènes?

en preparation

Pla

quettes G

/L

RTEL1 TERC TERT60

70

80

90

100

110

120

p=0.007P=0.01

VG

M fL

ns P=0.02

RTEL1 TERC TERT0

100

200

300

400

500

Plaquettes VGM

Au diagnostic de la PID

Page 28: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

LE SURFACTANT

Page 29: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

0

1

2

3

4

5

6

7

8

Naissance <1 2-9 10-19 20-29 30-39 40-49 50-59 60-69

SFTPA1

SFTPA2

SFTPC

ABCA3

Mutations du Surfactant

Base de données de Trousseau

Age de début de la

PID

Nombre de patients

mutés

Avec la courtoisie du Dr Nadia Nathan, Hôpital Trousseau, Paris

Page 30: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Gènes non associés au complexe téloméraseSurtout des scanners≠PIC

Page 31: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Traitement

• Amélioration des cas pédiatriques au stade verre dépoli– Traitements utilisés:

• Corticoides

• Macrolides (azithromycine)

• Hydroxycholoroquine

• Renutrition

• Prévention des infections– Aggravation par le VRS possible

• Transplantation pulmonaire sans cas de récidive décrit

Thouvenin, Arch Dis Child, 2010, Amin, J Pediatr, 2002

Page 32: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Function Gene Transmission Age of onset of pulmonary Associated signs

Telomerase

TERT-TERC AD Adults, average 55 years Short telomere syndrome

Combined pulmonary fibrosis

and emphysema

TINF2 AD Children, rare adults<50 years Short telomere syndrome

DKC1 X Children, rare adults<50 years Short telomere syndrome

Helicase RTEL1 AD Adults 35-60 years Short telomere syndrome

RNA regulation

PARN AD Adults 47-81 years Pulmonary granulomatosis

Short telomere syndrome

NAF1 AD Adults 45-60 years Short telomere syndrome

Surfactant

SFTPA1-SFTPA2 AD From newborn to 72 years Lung cancer

SFTPB AR Newborn

SFTPC AD Children, rare adults<50 years Combined pulmonary fibrosis

and emphysema

ABCA3 AR Children, rare adults<50 years Combined pulmonary fibrosis

and emphysema

NKX-2.1 (TITF1) AD Children, rare adults<50 years Chorea, hypothyroidism

Tumor

suppressor

NF-1 AD Adults Type 1 neurofibromatosis

LysosomeHPS-1 to 8/AP-

3B1

AR Adults Hermansky Pudlak syndrome

Stimulation of

interferon

synthesis

TMEM173 AD Children, rare adults<50 years Recurrent fever

Alopecia, skin rash

Antinuclear antibodies

Vasculitis

Endoplasmic

reticulum stress

COPA AD Children, rare adults<25 years Arthritis, Antinuclear antibodies

and ANCA

Unknown FAM111B AD 7-30 years Myopathy, poikiloderma

MithochondriaNDUFAF6 AR 19-50 years Acadian variant of Fanconi

Syndrome

Zinc finger

transcription

factors

GATA2 AD 4-76 years Alveolar proteinosis

Myeloid disease

MonoMAC syndrome

Page 33: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Conclusion: diagnostic

• Il existe des polymorphisme à risque de PID– Intérêt diagnostic?

– Intérêt thérapeutique?

• Il existe des maladies monogéniques responsable de PID

INDICATIONS DE DIAGNOSTIC GENETIQUE:

Formes familiales de PID

Suspicion de téloméropathies (foie, poumon, peau, hémato)

PID idiopathique <50 ans

Page 34: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Conclusion prise en charge

• Formes familiales de PID

• Suspicion de syndrome des télomères courts

(foie, poumon, peau, hémato)

– Séquençage de TERT si négatifs NGS « telomeres »

• Attention à l’utilisation de cytotoxiques

(médicamenteux)

• PID idiopathique <50 ans

– Mutation du surfactant

• Traitement corticoides/macrolides/ plaquenil?

Page 35: Aspects génétiques de la FPI et des autres PID idiopathiquesdes-pneumo.org/wp-content/uploads/2018/04/rb_fibroses_genetiques_des... · Newton, ERJ, 2016 • 40% des patients avec

Génétique:

MUC5B

TERT,

Surfactant

Causes:

Idiopathique,

PR,

Asbestose,…

Pattern

Scanner

histologique

Diagnostic et

traitement