ANALYSE CLONALE SOMATIQUE Pour quoi faire? - analyse de mutations récessives létales. -...

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ANALYSE CLONALE SOMATIQUE

Pour quoi faire?- analyse de mutations récessives létales.- génération de tissus mosaïque.- test d’autonomie cellulaire.

Conditions:- induire des crossing-over dans des cellules en mitose.- pouvoir marquer le clone.

Définition d’un clone: groupe de cellules de même génotype (issu d’un même fondateur), au sein d’un individu de génotype différent. (par ex.: -/- au sein de +/-)

+

m

+

+m

m

+

m

+

m

Génotype:+ / m

+

+

m

m

+

+m

m

+

+m

m

+

m

+

m

+

m

+

+

PhénotypeRecombinaison mitotique

Analyse clonale somatique : SYSTEME FRT-FLP

flp

SitesFRT

Recombinaison site spécifique

+

+

m

m

+

+m

m

m

+flp

Génotype:+ / m ; HS-FLP / +

+

+

m

m

+

+m

m m

+flp

Marquage des clones

UB-GFP

Choc thermique

Génotype:+ , UB-GFP , FRT / m , + , FRT ; HS-FLP / +

+

+

m

m

+

+m

m m

+flp

myc-tag

Choc thermique

Génotype:+ , FRT / m , mycTag , FRT ; HS-FLP / +

+

+

m

m

+

+m

m m

+flp

Marquage des clones : négatif (GFP)

UB-GFP

Choc thermique

Génotype:+ , UB-GFP , FRT / m , + , FRT ; HS-FLP / +

ProliférationClones jumeaux(« twin-spot »)

Prolifération, croissanceClones jumeaux(« twin-spot »)

Twin-spots

HS-FLP ; FRT rasc40b mycTag / FRT , +, + ; en-GAL4, UAS-P35

+

+m

m

m

+flp

Marquage des clones : positif (GFP) Système MARCM

UAS-GFP

PromoteurUbiquitaire

GAL4

Génotype:+ , UB-GAL80 , FRT / m , + , UAS-GFP , FRT ; UB-GAL4 , HS-FLP / +

GAL80

répresseur

Promoteur HS

répresseur

m

m UAS-GFP

maternelzygotique

Activation du génome zygotique

m

m + z

z

1 2 3

L ’ovocyte se développe dans un cyste

Fs

m

Fs

Fs

PhénotypeCLONES GERMINAUX : technique « FLP-DFS »

Fs

Fsm

m

flp

Génotype:Fs , + , FRT / + , m , FRT ; HS-FLP / +

+

+

+

+

Fs

m

+

+

Fs

m

+

+

Fs

Fsm

m

flp

+

+

+

+

Fs +

m+

Fs +

m+

PromoteurHSP 70

p-actine

FRT FRT

yellow GAL4

FRT

p-actine GAL4

UASGFP

UASgène X

ELEMENTS TRANSPOSABLES : P

TRANSFORMATION : LIGNEES TRANSGENIQUES

transposase

LacZGAL4UASGène X......

rosywhiteG418

+transposase

APPLICATIONS ET TYPES D'ELEMENTS P

- vecteurs d'expression(gène X; lacZ; GAL4; GFP; FRT; Flipase;...)

- pièges("enhancer-trap"; "gene-trap" ; "protein-trap")

- rapporteur(UAS;)

- mutagène

Vecteur d'expression

gène X; lacZ....

promoteur

ENHANCER-TRAP

LacZ

Promoteur minimal

ENHANCER

"PROTEIN-TRAP"

GFP

SDSA

UAS (5X)

Gène X

GAL4

GAL4

"GENE-TRAP"DEREGULATION

phénotype

GAL4 tissu-spécifique

WT en-GAL4

sans effet Régulateurpositif

Régulateurnégatif

TRACAGE DES CELLULES

Cycle rétroviral

Nicolas, J.F. et al. Development. 1996. 122:2933-46Eloy-Trinquet, S. et al Curr Top Dev Biol. 2000. 47:33-80

P7

GENES RAPORTEURS