Travaux en coursTravaux en cours

lité h è d d é i- vers une qualité homogène des données suisses

Pascal TschudinYves Gonseth

Daniel BurckhardtDaniel Burckhardt

Les noms scientifiques brutes indexés par GBIF org se cumulentLes noms scientifiques brutes indexés par GBIF.org se cumulent

Source: David Remsen GBIF orgSource: David Remsen, GBIF.org

Vers une qualité homogène des données suissesVers une qualité homogène des données suisses

• Intégralité de l’information mise à disposition• Homogénéité des données lors de leur publication • Conformité par rapport aux standards de la communauté

internationaleinternationale

… tout en respectant la diversité linguistique et conceptuelle des p g q pdonnées sources.

Test de l’intégralité des donnéesTest de l intégralité des données

Comment valider les noms scientifiques qui ont passé le test de

l’intégralité de l’entrée?l intégralité de l entrée?

IF.o

rgvi

d R

emse

n, G

BS

ourc

e: D

av

Recherche d’une autre approcheRecherche d une autre approche

• Ne pas valider, mais signaler des incohérences potentiellesainsi qu’une possible multiplication des éléments appartenant au même concept nominal.

• Demander une confirmation des noms suspects au responsableDemander une confirmation des noms suspects au responsable scientifique…

Origine de la multiplication d'éléments appartenant au même concept nominal

Année de publication incohérente Anomotaenia microphallos (Krabbe, 1861)Anomotaenia microphallos (Krabbe, 1869)

Lapsus calamiLapsus calamiProteocephalus pentastoma (Klapotcz, 1906)Proteocephalus pentastoma (Klaptocz, 1906)

Orthographie hétérogène du nom d'auteurAmoebotaenia cuneata (von Linstow, 1872)

Amoebotaenia cuneata (v. Linstow, 1872)P llid h t i i i (C b id 1913)Palliduphantes insignis (Cambridge, 1913)

Palliduphantes insignis (O.P. Cambridge, 1913)

Origine de la multiplication d'éléments appartenant au même concept nominal

Accord de genre problématiqueCrassicutis intermedius (Szidat, 1954)

Crassicutis intermedium (Szidat, 1954)

Utili ti hété è dUtilisation hétérogène du sous-genreNeodiplostomum (Conodiplostomum) acutum (Dubois, 1937)

Neodiplostomum acutum (Dubois, 1937)

Variabilité dans la mise en parenthèses de l'auteur du taxonDiorchis acuminata (Clerc, 1902)

Diorchis acuminata Clerc 1902Diorchis acuminata Clerc, 1902

Origine de la multiplication d'éléments appartenant

Synonymes au niveau du genre

au même concept nominal

Synonymes au niveau du genre

Proteocephalus catzeflisi de Chambrier, Vaucher & Renaud, 1992Ophiotaenia catzeflisi (de Chambrier, Vaucher & Renaud, 1992)Ophiotaenia catzeflisi (de Chambrier, Vaucher & Renaud, 1992)

Anax ephippiger (Burmeister, 1839)Hemianax ephippiger (Burmeister, 1839)

HomonymesInermicapsifer hyracis (Dubois, 1908)

Inermicapsifer hyracis (Beddard, 1912)Inermicapsifer hyracis (Beddard, 1912)

Test de la cohérence interne des noms scientifiquesTest de la cohérence interne des noms scientifiques

Stratégie• Considération des terminaisons afin de permettre une analyse non

faussée par un accord problématique au genre attribué• Dénombrement d'éléments isolés et recombinés du nom scientifique• Attribution d’un code permettant le dénombrement de combinaisons

(noms scientifiques complets) similaires, probablement appartenant au même concept nominal et tenant compte des erreurs les plus fréquentes :- année de publication erronéeannée de publication erronée - orthographie du nom d’auteur problématique (double consonants, noms étrangers, terminaisons)

- orthographie du nom d’espèce erronée (double consonants, inversion de lettres, d-t, c-k etc.)

• Identification et regroupement de concept nominaux potentiellement identiques sur la base des épithètes, du nom d'auteur, de l'année de publication et la systématique supérieure

N? V? erreur?

NV

N = Nouveau concept nominalV = Variante du précédentV Variante du précédentS = Synonyme du préc.B = Basionyme0 = Entrée erronée à supprimer

• Pour la biodiversité suisse, fédérer les variantes et harmoniser la synonymie afin de normaliser les noms scientifiques publiés, condition pour

• Assurer une correspondance et mise à jour avec les nomenclateursAssurer une correspondance et mise à jour avec les nomenclateurs externes européens (FaEu, E+M, ERMS)

Recherche d'occurrences pour Hemianax ephippiger (Burmeister, 1839)

@N

00/1

8134

2763

9ph

otos

/218

3349

4@fli

ckr.c

om/p

Recherche d'occurrences pour Anax ephippiger (Burmeister, 1839)

@N

00/1

8134

2763

9ph

otos

/218

3349

4@fli

ckr.c

om/p

Recherche d'occurrences pour Hemianax ephippiger (Burmeister, 1839)

A visiterA visiter...

http://www.gbif.chhttp://www.gbif.orghttp://www.catalogueoflife.orghtt //http://www.eu-nomen.eu

Entrées Noms scientifiques

GBIF.ch: nächste Schritte und Ausblickusb c

AusgangslageAusgangslage

• Viele kleine bis mittlere Institutionen• 6 nationale Datenbanken• Ein zentraler Datenknoten

D i G bi t B t ik P lä t l i d Z l i• Drei Gebiete: Botanik, Paläontologie und Zoologie• Anzahl Belege 40 Mio.• Ziel Erfassung sämtlicher BelegeZiel Erfassung sämtlicher Belege

Aktuelle SituationAktuelle Situation

• CHF 80.000 pro Jahr für Projekte• Priorisierung: Bsp. Taxa: Ameisen; Region: Alpen• Projekte mit Synergien zwischen Institutionen

Fi i hli li h D t f• Finanzierung ausschliesslich von Datenerfassung• Definition von Minimalstandard der zu erfassenden Sammlungen• 10 Projekte abgeschlossen10 Projekte abgeschlossen• 400.000 Einträge online verfügbar• Gesamtaufwand bis 2011: CHF 1,84 Mio.,

für Projekte CHF 600.000

Wieviel Geld brauchen wir?Wieviel Geld brauchen wir?

• Erfassung von 250.000 Datensätze kostete CHF 320.000• Kosten für 40 Mio. Objekte CHF 51,2 Mio.• Weitere Kosten für Sammlungsrevisionen für Erreichung von

MinimalstandardMinimalstandard• Kosten für Datenaufarbeitung

ProjektProjekt

• Erarbeitung eines Gesuchs• Suchen von potentiellen Geldgebern/Sponsoren Stiftungen,

Industrie, Nationalfonds

Wieviel Geld wozu?Wieviel Geld wozu?

• Sammlungsrevisionen, Datenerfassung und Datenaufarbeitung• CHF 5 Mio. für 10 Jahre, d.h. CHF 500.000 pro Jahr (jetzt CHF

80.000 pro Jahr)

PersonellesPersonelles

• Erstellen eines Entwurfs des Gesuchs und Dossier-Koordination DB und PT

• Redaktionelle Unterstützung durch wissenschaftliche Kommission GBIF chGBIF.ch

• Eventuelle Zusatzinformationen durch Konservatorinnen und Konservatoren

• Prüfung des Gesuchs durch wissenschaftliche Kommission GBIF.ch

ZeitplanZeitplan

• August: Erstellen des Entwurfs• September/Oktober: Prüfung des Gesuchs durch wissenschaftliche

Kommission GBIF.ch• Ab September: Aufbau von Kontakten zu Geldgebern• Ab September: Aufbau von Kontakten zu Geldgebern• Dezember: Unterlagen sind bereit• Frühjahr 2010: Eingabenj g

Gesuchseingaben 2010Gesuchseingaben 2010

• GBIF.ch Portal ist aufgeschaltet und funktionell• Infrastruktur ist bereit• Virtuelles Schweizer Naturmuseum

G t ht GBIF I t ti l• Gutachten von GBIF International• Jahr der Biodiversität

DankDank

• Wissenschaftliche Kommission GBIF.ch• Bundesamt für Umwelt BAFU• Allen Konservatorinnen und Konservatoren, welche bereitwillig die

Aufbauarbeit des Schweizer Knotens mit Daten und InformationenAufbauarbeit des Schweizer Knotens mit Daten und Informationen unterstützt haben