Phenotypes de Resistance
-
Upload
jean-paul-nguessan -
Category
Documents
-
view
137 -
download
0
Transcript of Phenotypes de Resistance
Mercredi 30 Novembre 2005
LES ENTEROBACTERIES : PHENOTYPES DE RESISTANCE ACQUISE AUX B-LACTAMINES
Pr. mrite A. PHILIPPON Facult de Mdecine Paris Descartes
ENTEROBACTERIES LA RESISTANCE NATURELLE
Entrobactries: Phnotypes de rsistance naturelle-LACTAMINE AMOXICILLINE + A. CLAVULANIQUE TICARCILLINE + A.CLAVULANIQUE PIPERACILLINE + TAZOCILLINE CEFALOTINE CEFAMANDOLE CEFUROXIME CEFOXITINE CEFTAZIDIME CEFOTAXIME CEFTRIAXONE CEFEPIME IMIPENEME MEROPENEME* synergie
G1 S S S S S S S S S S S S S S S S
G2 r S* r S* S S S S S S S S S S S S
G3 I/R I/R S S/I S S I/R S/I I/R S/I/R** S S S S S** S
G4 R R r S* S S R S S/I I S S S S S S
G5 R S R S S S I/R* I/R* I/R* S S S S S S S
** induction ou antagonisme
PHENOTYPES DE RESISTANCE NATURELLE
1/ Impermabilit 2/ Pnicillinase de bas niveau (Pase) 2/ Cphalosporinase inductible/- (Case) 3/ Cphalosporinase + Pnicillinase 4/ BLA PASECASE
Groupes 1, 2, 3, 4, 5 Groupe 2 Groupe 3 Groupe 4 Groupe 5
EntrobactriesPhnotypes de rsistance naturelle Banque
www.microbes-edu.org
EUCAST Expert rules in antimicrobial susceptibility testing, version 1, April 2008Table 1: Intrinsic resistance (R) in Enterobacteriaceae Enterobacteriaceae are also intrinsically resistant to penicillin G, glycopeptides, fusidic acid, macrolides (with some exceptions 1), lincosamides, streptogramins, rifampicin, daptomycin and linezolid.
1 Azithromycin is effective in vivo for the treatment of typhoid fever and erythromycin may be used to treat travellers diarrhoea.
Table 1: Intrinsic resistance (R) in Enterobacteriaceae
E. coli, Shigella, Salmonella
2, All Providencia spp. produce a chromosomal AAC(2)-Ia enzyme.
Providencia spp. should be considered resistant to allaminoglycosides except amikacin and streptomycin. Some isolates express the enzyme poorly and can appear susceptible to netilmicin
in vitro, but should be reported as resistant as mutation can result inoverproduction of this enzyme.
3, All Serratia marcescens produce a chromosomal AAC(6)-Ic enzyme that may affect moderate the activity of all aminoglycosides except streptomycin and gentamicin.
RESISTANCE1/ La rsistance naturelle existe chez toutes les souches dune espce bactrienne. Ainsi toutes les souches de E. coli sont rsistantes la pnicilline G) (dfinit le spectre dactivit dun antibiotique)
2/ La rsistance acquise existe chez certaines souches dans une espce normalement sensible lantibiotique Exemple: E. coli rsistant lampicilline
ENTEROBACTERIES LA RESISTANCE ACQUISE
RESISTANCE ACQUISE ?
Donc CQ interne
E. coli : autres expressions phnotypiques Exemples des -lactaminesAmoxicilline Ticarcilline Cfalotine Amoxicilline + AC Phnotypes A B C D E F I S I S R R S S R R R I R R R S R S S R R S R R
A B C D E F Phnotype impermabilit Phnotype Pase Phnotype Pase haut niveau Phnotype BLSE mais.... Phnotype Pase TRI/IRT Phnotype Cphalosporinase
E. coli : autres expressions phnotypiques
Antibiogramme par diffusion: Gold standard mais rserv des experts
E. coli sauvage
E. coli + rsistance acquisehttp://www.microbe-edu.org/
Phnotype impermabilit/efflux
. Pliotrope plusieurs AB dont bla (MOX) FQ TMP FOS . Dtection difficile CMI 2-8 fois . Peu frquent K. pneumoniae, E. coli . Mcanismes porines, efflux . Association possible = rsistance limipnme (cf plus loin)
R. acquise: autres phnotypes varisA B C D E F G H Phnotype Pase Phnotype Pase de bas niveau (BN) Phnotype Pase haut niveau Phnotype BLSE Phnotype Pase TRI/IRT Phnotype Cphalosporinase HP Phnotype Cphalosporinase BLSE Phnotype Carbapnmase
PASE 1965 . plasmidique (Tra+) . Pni R C1G S/I . dtection ++ . la: TEM, SHV, OXA . interprtation . frquence E. coli 50% P. mirabilis 30% K. pneumoniae 20-40%
PASE BN 1985
Mauvaise ID E. hermannii Bla chromosomique Groupe 2 R : pnicillines
PASE HN . plasmidique (Tra+) . Pni R C1G R MA I/R AMC R . dtection + . la: TEM, SHV, OXA . frquence E. coli < 10 %
PASE 1965
B-lactamase spectre largi ou tendu (BLSE) 1985 . plasmidique (Tra+) . Pni R C1G C2G C3G . dtection ++ . la mutes: TEM, SHV . frquence E. coli < 10% K. pneumoniae < 10% Salmonella < 10% . petites pidmiesE. coli
Rsistance aux C3G ? Dtection
BLSE IN AFRICA - TUNIS 1984BEN REDJEB S., BEN YAGHLANE H., BOUJNAH A., PHILIPPON A., LABIA R. 1988 - Synergy between clavulanic acid and newer -lactams on 9 clinical isolates of Klebsiella pneumoniae, Escherichia coli and Salmonella typhimurium resistant to third generation cephalosporins. J. Antimicrob. Chemother., 21: 263-266.
- GABON 1986 1 Brl avec KP - SENEGAL 1987 RICHARD C, PHILIPPON A., M'BOUP S., VIEU J.F. 1989 - Epidmiologie des -
infections pdiatriques Klebsiella dans deux hpitaux de Dakar: Production de lactamases spectre largi (1987-1988). Md. Mal. Inf. 19: 753-759. - MADAGASCAR 1989 1 fivre typhode (S. typhi SHV-2 +)
Expressions variables
AMX
TIC
PIP
FEP
AMX
TIC
PIP
FEP
CF
AMC
CAZ
PTZ
CF
AMC
CAZ
PTZ
FOX
CXM
TCC
AZT
FOX
CXM
TCC
AZT
MEC
MOX
CTX
IPM
MEC
MOX
CTX
IPM
E. coli
BLSE: Tests complmentaires
AMX
TIC
PIP
FEP
OxodCF AMC CAZ PTZ
CTXFOX CXM TCC AZT
CTX
CAZMEC MOX CTX IPM
CAZ ATM
E. coli
ATM
TEM: Exemples dvolution molculaire1/ Hpital: Rsistance aux C3G Bla spectre largi
104 BLSE Km 69 TRI/IRT TEM-1/2 Km 237
164 238
244
2/ Ville: Rsistance aux inhibiteurs de bla TEM rsistant aux inhibiteurs (TRI) Inhibitor resistant TEM (IRT)
PASE mute (IRT) 1990. plasmidique (Tra+) . Pni R , AMC R . dtection + . la: TEM ++ SHV . interprtation . frquence E. coli < 15 % K. pneumoniae < 10 %
E. coli
Nouvelles BLSE 1995. Emergence mondiale . R Bla dont C3G . Divers types . Prfrence gographique . Dtection idem . Identification gnomique
PER-1 P. mirabilis Cfotaximase = CTX-M
Nouvelles BLSE
SFO-1
PER-1
VEB-1
CAZ
CAZ
CAZ ATM
TCC
ATM
TCC
ATM
TCC
CTX
CTX
CTX
K. pneumoniae
CTX-M-14
CTX-M-19
Pro-167-SerBLSE ID squencage
PHYLOGNSE DES NOUVELLES BLSE
SFO-1 CTX-M
Groupe 5 S. fonticola Kluyvera spp.
Evolution de la distribution relative des EB BLSE entre 1995-2003
RESISTANCE AUX C3G INCIDENCE ACTUELLE EN EUROPE (EARSS) E. coli
2002
2006
C3G R: NOUVEAU PHENOTYPE: LEQUEL ?
AVANT
APRES
CASE hyperproduite 1985. Espces Groupe 3 (E. cloacae, E. aerogenes..) . R C3G + inhibiteurs Bla . S C4G S MEC IPM S . Dtection ++ . Frquence V . AmpD : mutation
E. cloacae
PHENOTYPE CASE BLSE CASE
PHENOTYPE CASE BLSE
E. cloacae HP: C4G R (cfpime, cefpirome) 18 b dltes
E. aerogenes AER-1 HP: mutation ponctuelle L-293-P S. marcescens HP: 12 b dltesBarnaud G. FEMS Microb. Lett 2001, Barnaud G. AAC 2003; Mammeri AAC 2004
Bla hyperproduite 1985. 1 Espce: K. oxytoca . R C3G + inhibiteurs Bla . Dtection + . Frquence V < 10% . Promoteur : mutation
S aux autres AB
AVANT
APRES
Mutation dans le promoteur
CASE plasmidique 1990. Espces Groupe 1/2/3 (K. pneumoniae, Salmonella...) . R C3G + inhibiteurs Bla . S C4G S MEC IPM S . Dtection ++ . Frquence V . Acquisition de gnes mobiles codant des cases (chr)
K. pneumoniae
K. pneumoniae - rsistance aux C3G: Phnotypes ?A B C D
Cphalosporinases plasmidiques
= mmes facteurs de risque que BLSE
Quels progniteurs ?
ACT-1 GN7471 E.asburiae MIR-1 E.hormaechi E.cancerogenus E.cloacae E.intermedius P99 E.minipressuralis E.ammigenus EAR2 C.murliniae EAR1 C.braaki I113 E.aerogens C.youngae C.freundii E.coli CMY4 LAT3 E.fergusonii LAT4 CMY2CMY5 CMY6 LAT1 CMY7
groupe CMY-2 (C.freundii) DHA-1 (M. morganii) groupe FOX-1 (A. caviae) ACT-1 (E. asburiae) ACC-1 (H. alvei)
E.rhapontici
FOX-5 FOX-6 A.caviae FOX-3 FOX-1 FOX-2 FOX-4 CepS Aeromonas AER-14 CMY-8 CMY-9 CMY-1
DHA-2 DHA-1 M.morganii
S.algae
MOX-2 MOX-1
Environnement ?
P.aeruginosa A.baumannii O.anthropi P.stuartii0.1
S.marcescens
H.alvei
ACC-1
dendrogramme (squences acides amins) de bla AmpC
Impermabilit + CASE ?
pCASE + IMPERMEABILITE
Spectre dinactivationBLSE + Cphamycines + inhibiteur de bla
CASE impermabilit 1990 Nouvelles bla . Carbapnmases 1998Dernire tape !
K. pneumoniae
CARBAPENEMASES (CLASSE A) 1982
CARBAPENEMASES 1996
Expressions phnotypiques (mg/L)
PIP, pipracilline; PTZ, +tazobactam; CTX, cfotaxime; FEP, cfpime; ATM, aztronam; IMP, imipnme; MER, mropnme.
Carbapnmases de classe B Zn++, inhibes par les chlateurs (EDTA)
IPM R : Dtection en pratique
1/ Synergie de 2 log2
2/ Faux positifs
OXA: EXPRESSIONS PHNOTYPIQUES (CMI, mg/L)
Rsistance acquise: stabilit des bta-lactamines selon le type d'enzyme
B-Lactamases: spectres dinactivation
PASE, pnicillinase; BLSE: -lactamase spectre largi/tendu; IRT/TRI, TEM rsistant aux PASE, BLSE: -lactamase IRT/TRI, inhibiteurs; CASE HP, cphalosporinase hyperproduite; pCASE,!cphalosporinase hyperproduite; HP, hyperproduite; pCASE, hyperproduite; BLSE CASE, cphalosporinase spectre largi ; carbapnmases (VIM, IMP........) CASE, + , inactivation; - , stabilit
CONCLUSIONSRsistance bactrienne en constante volution : 350 BLA Problme de sant publique. Sous Surveillance Standardisation Europenne Rsistance naturelle variable des entrobactries : 5 groupes Rsistance acquise principalement par -lactamases En fonction de lintroduction des molcules - Pnicillines: Pnicillinases TEM, OXA....... (1965) - C3G: CASE HP - BLSE - pCASE............... - AUG, TCC, PTZ: IRT/TRI - IMP: CASE+ impermabilit, KPC, OXA, IMP, VIM....... Usage raisonn des antibiotiques (divers niveaux) Dtection ou surveillance de la rsistance (BMR) : systmes experts Isolement des malades en milieu hospitalier....................... La rsistance des bactries est inductable cause de leur extraordinaire potentiel gntique
www.microbes-edu.org
http://www.ibacterionet.org/