Master 1 : Mention Toxicologie - Ecotoxicologie

Programme d’enseignement

SEMESTRE UE ECTS/UE

S3

8UEobligatoires Toxicologiegénéraleetréglementaire(ToxGenR) 3ECTS

Pharmacologiemoléculaire(PharmacoL) 3ECTSPhysiologieetPathologieshumaines(PhysioPatH) 6ECTS

Toxicologiemécanistique(MecaTox) 6ECTSToxicologieanalytique(AnaTox) 3ECTS

Biostatistiques(Biostat) 3ECTSTransportetmétabolismedesxénobiotiques(TeMeX) 3ECTS

Anglais 3ECTS

S4

2UEobligatoires Stage 15ECTS

Stresscellulaires(CellStress) 3ECTS4UEauchoix 3ECTS/UE

Xénobiotiquesenvironnementauxetécotoxicologie(X2E) Biologiestructurale(BS)

Biologieintégrativeettoxicologie(Bix) BioinformatiquestructuraleenToxicologie(BiosoX)

Toxicologieprédictive(ToxPred) HistologieetanatomiepathologiqueenToxicologie(AnaPaX)

Approchesméthodologiquesentoxicologieanalytiqueetcellulaire(AMTAC) UELibre

Dernièremiseàjour:26/03/19

Semestre 1

UE Obligatoires UE ToxGenR : Toxicologie générale et réglementaire (Robert Barouki, Jean-Marie Dupret - 3 ECTS) • Historiquedelatoxicologie,approcheépistémologique,mécanismesgénérauxd’actiondes

xénobiotioques• Baseschimiquesdelatoxicité• Classificationspharmacotoxicologiquesdesatomes• Eco-toxicologie,toxicologiedesmédicaments• Basesbiologiquesdel’adaptationauxtoxiquesetnotionsdestress.toxicologieetSHS,perceptiondu

risqueUE PharmacoL : Pharmacologie moléculaire (Catherine Marchand-Leroux - 3 ECTS) • Terminologie;récepteursetvoiesdesignalisation;synapseetciblespharmacologiques• Pharmacométrieliaisonetréponse• Nouvellesvoiesdesignalisationetmédicamentspotentiels• Systèmessympathiqueetparasympathique:catécholamine• Systèmessympathiqueetparasympathique:acétylcholine

UE PhysioPatH : Physiologie et Pathologies humaines (Jean-Pascal De Bandt, Bruno Megarbane - 6 ECTS)

• Systèmesphysiologiques/organes:cardiovasculaire,respiratoire,excréteur,digestif&régulationdumétabolismedesglucides,génital,musculo-squelettique,nerveux,systèmeimmunitaire

• Mécanismesdetoxicité• récepteur/réactivitéchimique/stressoxydant• toxiquesfonctionnels/lésionnels• relationeffet/dose,effet/concentration,expositionaigue/répétée• toxicitéd’organes• mécanismesinflammatoires• interactionstoxiques;dualitépharmacocinétique/pharmacodynamique;induction/inhibition

enzymatique• maladiechroniqueinduiteparuneexpositionunique

• Apportdel’analysetoxicologiqueUE MecaTox: Toxicologie mécanistique (Karine Andréau - 6 ECTS) • Signalisationcellulaireentoxicologie,régulationdel’expressiondesgènes(transcription,traduction,

modificationspost-traductionnelles)ettechniquesd’étude(PCRquantitative)• Récepteursnucléaires(oestrogènes)etmodulationpharmacologique• Régulationdelachromatineetmodulationsépigénétiques• Cyclecellulaireetmécanismederéparationdel’ADN• Grandesvoiesdesignalisation(Signalinsuline,AMPc,Ca2+,NRF2,NFκB,MAPK)• Lesdifférentstypesdemortcellulaire(nécrose,apoptose,autophagie,anoïkis,entose)• Plasticitécellulaire,invasion,transitionépithélio-mésenchymateuseetcancer• Placentaetxénobiotiques• Intégritéscientifique• TDs:Méthodologiedel’analysededonnéesentoxicologie

UE AnaTox : Toxicologie analytique (Julien Dairou, Olivier Laprévote - 3 ECTS) • L’échantillon:Matricesbiologiquesetenvironnementales/problèmesassociés• Principesdesprincipalesméthodesd’extractiondel’échantillon• Méthodesséparatives(chromatographies)appropriéesàlaToxicologieanalytique• Méthodesenzymatiques,immunochimiques,spectroscopiquesetspectrométriques• Stratégiesanalytiquesentoxicologiehumaineetenvironnementale• Introductionàlamétabolomique:xénométabolomeettoxicométabolomique.UE Biostat : Biostatistiques (Emmanuel Curis, Déborah Hirt - 3 ECTS) • CetteUEapourobjectifdefournirauxétudiantsunsocled'outilsstatistiquescommunsàtoutesles

orientationsduMaster. • Cesoutilsserépartissentendeuxgrandescatégories:

• Décrireetreprésenterlesrésultatsd'uneétude(statistiquesdescriptives) • Etablirlelienentrecesrésultatsdanslecasdedeuxgrandeursétudiées(khi-deux,Student,analyse

devariance,corrélation,régressionlinéaire). • Lesenseignementss'accompagnentd'uneinitiationaulogicielR.

UE TeMeX : Transport et métabolisme des xénobiotiques (Salvatore Cisternino - 3 ECTS) • lesprincipalesenzymesdumétabolismedesxénobiotiques(exemplesdesCYPs) • Lesprincipauxtransporteursdesxénobiotiques • Variationsgénétiquesetenvironnementalesdumétabolismeettransportdesxénobiotiques • Modèlesinvitrod’explorationdumétabolismeetdutransportdesxénobiotiques • Modèlesinvivod’explorationdumétabolismeetdutransportdesxénobiotiques • Modèlesphysiologiquesd’extrapolationinvitro-invivoentransportetmétabolisme • Implicationsdesvariationsdumétabolismeetdutransport • Clinique(pharmaco-toxico-cinétiqueetpharmacodynamie),développementdesmédicaments)

• TD:Métabolismeettransportdesxénobiotiques(logicieletanalysearticle),Pharmacocinétique

(logicielet/ouanalysed’article) UE : Anglais (Philippe Cholet - 3 ECTS) • L’objectifducoursd’anglaisestd’arriveràlamaîtrisedel’anglais,maîtriserequisepourl’obtentiondu

Master.• Lesétudiantsserontrépartisengroupesdeniveaux.Unenseignementdehautniveauestdisponible

pourlesétudiantsmaîtrisantdéjàlalangue.• Pourlesétudiantsn’ayantjamaissuivid’anglais,unenseignement«grandscommençants»sera

proposé.

Semestre 2 UE Obligatoires

UE Stage (Karine Andréau, Etienne Blanc - 15 ECTS) • 2moisdansunlaboratoirederechercheavecmémoireécritetsoutenanceorale• Périoded'expérimentationenlaboratoire:avril-juin,dépôtmémoire:débutjuin;soutenancefinjuin

UE CellStress : Stress cellulaires (Etienne Blanc, Julien Dairou - 3 ECTS) • Stressoxydant:réactivitédel’oxygèneetdesespècesoxydantes,modificationcovalenteet

inactivationfonctionnelle,signalisation• Stresshypoxique• Stressduréticulumendoplasmique,stressconformationnel• Stressmécanique

UE Optionnelles UE X2E : Xénobiotiques environnementaux et écotoxicologie (Armelle Baeza-Squiban, Karine Andréau - 3 ECTS) • Xénobiotiquesetimpactsenvironnementaux:lesgrandesfamillesdepolluants• Devenirdesxénobiotiquesdansl’environnement• Evaluationdel’écotoxicitéetbiosurveillancedel’étatdesantédesécosystèmes.• Xénobiotiquesetmortscellulaires:mécanismesd'adaptationetdeprotection• Ecotoxicitéetsolspollués• Xénobiotiquesetreproduction• Xénobiotiquesetgénotoxicité.• Etudesdecas:Impactsenvironnementauxdescyanobactéries,écologieurbainedesabeilles• TD:lemercure,sondevenirdansl’environnementetsonécotoxicité

• Analysebibliographique.

UE BS : Biologie structurale (Pierre Nioche, Luc Ponchon - 3 ECTS) • Initiationetcompréhensiondesdeuxtechniquesdebiologiestructuraleexistantes:larésonnance

magnétiquenucléaire(RMN)etlacristallographiedesrayonsX(RX).• EnRMN,notionsdespinetdecouplage,traitementdusignal,acquisitiondesdonnéesà1,2et3D,

modélisationetexemplespratiques• EnRX,notionsdecristallisationdeprotéines,acquisitionettraitementdesdonnées.

UE Bix : Biologie intégrative et toxicologie (Karine Audouze, 3 ECTS) • Delabiologiedessystèmesàlatoxicologiesystémique• Lesdifférentesméthodesomiques(génomique,transcriptomique,protéomique,métabolomique)• Bioinformatiquefonctionnelle:commentrelierlesxénobiotiquesauxvoiesdesignalisationàl’aidede

bio-statistiques?• Lesréseauxbiologiques:commentrelierlesxénobiotiquesauxmaladies?• IntroductionaulogicielCytoscape(visualisationdedonnées,créationdemodèlecomputationnelde

toxicologiesystémique)

UE BiosoX : Bioinformatique structurale en Toxicologie (Delphine Flatters, Gautier Moroy - 3 ECTS) • Analysedeséquences,basesdedonnéesenbiologie• Initiationàlamodélisationdestructuresdemacromolécules,modélisationmétabolique• Initiationàl'utilisationdeR…

UE ToxPred : Toxicologie prédictive (Xavier Coumoul - 3 ECTS) • Latoxicologieàl’épreuvedel’Europe:dispositionsréglementairesetjuridiques(protocoleREACH….).• Modèlesanimaux(modèlesclassiques,souristransgéniques….).• Modèlescellulaires(lignéescellulaires,pucesàcellules….).• Modélisationettoxicologieinsilico

UE AnaPaX : Histologie et anatomie pathologique en toxicologie (Pierre-Alexandre Just - 3 ECTS) • Processuspathologique:pathologiecirculatoire,modèlesexpérimentaux,angiogenèse,fibrose,

inflammationetréactionimmunitairetissulaires,tumeurs,modèlesmurins.• Techniquesmorphologiques(IHC,HIS,microscopieélectronique..).• Démonstrationspratiques.

UE AMTAC : Approches méthodologiques en toxicologie analytique et cellulaire (Armelle Baeza-Squiban, Karine Andréau, Julien Dairou - 3 ECTS) • Deuxtravauxpratiques:

• ToxicologieCellulaire:évaluerlatoxicitécellulaireduperoxyded'hydrogène• ExtractiondepesticidesetanalysesparHPLCetGC

• Uneétudedecas:demandedefinancementtypeANSESsurlesnaoparticulesdeTiO2UE Libre à choix dans tous parcours selon compatibilité des emplois du temps et accord des responsables.