Fête de la Science : Les maladies métaboliques chroniques en Tunisie: une épidémie ?

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Recherche et formation Les maladies métaboliques chroniques en Tunisie: une épidémie? Institut de nutrition de Tunis Dr Rym KEFI Maître assistante universitaire (PhD, HDR) Laboratoire de Génomique Biomédicale et Oncogénétique Institut Pasteur de Tunis Mr Hamza DALLALI Etudiant en thèse

Transcript of Fête de la Science : Les maladies métaboliques chroniques en Tunisie: une épidémie ?

Recherche et formation

Les maladies métaboliques chroniques en

Tunisie: une épidémie?

Institut de nutrition de Tunis

Dr Rym KEFI

Maître assistante universitaire (PhD, HDR)

Laboratoire de Génomique Biomédicale et Oncogénétique

Institut Pasteur de Tunis

Mr Hamza DALLALIEtudiant en thèse

Recherche et formation

1

2

Nos projets 3

2

PLAN

Syndrome métabolique

Diabète : caractéristiques, prévalences…

MODY4

Recherche et formation

Transition épidémiologique

Contexte actuel

Des maladies infectieuses

Des maladies non transmissibles

(diabète, hypertension artérielle, dyslipidémie,

maladies cardiovasculaires et cancers)

Recherche et formation

Une hyperglycémie chronique:

un défaut de la sécrétion de l’insuline

ou de son action sur ses cellules cibles

ou bien de la combinaison de ces deux anomalies

Recherche et formation

Diabète

Diabète MODY

Diabète gestationnel

Diabète

mitochondrial

2-5%

Diabète de type

2

90-95%

Diabète de

type 1

5-10%

Les types du diabète

Recherche et formation

Selon les critères de l’OMS et l’IDF:

Glycémie à jeun ≥ 1,26 g/l (7 mmol/l)

Glycémie post-prandiale ≥ 2 g/l (11,1 mmol/l)).

Recherche et formation

Facteurs environnementaux Facteurs génétiques

Maladie multifactorielle

Recherche et formation

Recherche et formation

(Fédération internationale de diabète, 2015)

Recherche et formation

Dans le monde, plus de 5,1 millions de décès par an sont dus au

diabète!

soit 14 000 morts par jour

1 mort toutes les 7 secondes !

Fédération internationale de diabète, 2015

Recherche et formation

2.3

9

12.2

15

0

2

4

6

8

10

12

14

16

Prévalence (%)

Evolution de la prévalence du Diabète en Tunisie

1977 2007 2016 2017OMS et institut de nutrition

Recherche et formation

Recherche et formation

obésité abdominale

Syndrome métabolique

Dyslipidémie13

Recherche et formation

• Composante

environnementale

• Composante génétique

Incidence nettement plus élevée chez

les individus ayant des antécédents

familiaux

14

Maladie multifactorielle

Syndrome métabolique

Recherche et formation15

du syndrome métabolique

Recherche et formation16

Continent PaysPrévalence totale

(%)Auteurs (Année)

Afrique du Nord

Tunisie 30.0 (Belfki et al., 2013)

Algérie 5.8(Thanopoulou et al.,

2006)

Maroc 12,8 (van Vliet et al., 2009)

Amérique

Venezuela 26.6 (Florez et al., 2005)

Mexique 26.6(Aguilar-Salinas et al.,

2004)

Etats unis 23.7 (Ford et al., 2002)

Asie

Iran 23.7 (Sharifi et al., 2009)

Turquie 32.8 (Onat et al., 2002)

Inde 18.3 (Deepa et al., 2007)

Inde 31.6 (Gupta et al., 2004)

Singapour 13.2 (Heng et al., 2006)

Japon 13 (Ishizaka et al., 2005)

Chine 7.3 (Lao et al., 2012)

Europe

Croatie 34 (Kolcic et al., 2006)

Espagne 26.5 (Lorenzo et al., 2003)

Pays bas 25.5 (Dekker et al., 2005)

Grèce 24.5 (Athyros et al., 2005)

Portugal 27.5 (Fiuza et al., 2008)

Italie 22.2 (Miccoli et al., 2005)

Prévalence

Recherche et formation

New Partnership for Africa’s Development (NEPAD)

North Africa Biosciences Network (NABNet)

http://www.nrc.sci.eg/nepad/default.html

TUNISIA

MAURITANIA

ALGERIA

MOROCCO

“lnvestigation multidisciplinaire des facteurs génétiques

à risque pour le diabète de type II et ses complications

en Afrique du Nord »

Collaboration régionale

2008-2011

Recherche et formation

Identification: MEDIGENE – FP7-279171-1

Titre: « les facteurs génétiques et environnementaux du

syndrome métabolique et ses complications chez les

populations méditerranéennes»

Durée: 4 ans et demi (Janvier 2012-2015; prolongation

Juillet 2016)

18

Recherche et formation

21 Partenaires en Europe, Afrique du Nord et en Asie

Finland

19

Recherche et formation20

Plus de 150 gènes

candidats

Recherche et formation

Approche: étude d’association

Le variant génétique est-il plus fréquent chez les sujets malades

que chez les témoins?

Recherche et formation

Les variants du gène KCNJ11 (ATP-sensitive potassium) et

IGF2BP2 (Insulin Like Growth Factor 2 mRNA Binding Protein 2)

augmente le risque de DT2 en Tunisie et en Mauritanie

Facteur de 2 à 3,6 le risque de DT2

Résultats (DT2)

Le variant rs7756992 du gène CDKAL1 (CDK5 Regulatory Subunit

Associated Protein 1 Like) possède un rôle protecteur contre la

néphropathie diabétique (OR = 0.44, 95% CI = 0.27–0.73, P = 0.001)

Recherche et formation

Valorisation 9 articles

Recherche et formation

24

L’haplotype GCA (rs1421085 A>G -rs 8057044 T>C -

rs9939609 T>A ) du gène FTO, est associé avec un risque élevé

de développer un Smet (OR = 3,81; 95% CI = 0,987-9,86; p = 0,

015)

L’haplotype GCA est associé à des valeurs élevées de GAJ, PAS,

TG.

Différence entre les hommes et les femmes

Association des variants du gène FTO (Fat mass and obesity

associated) avec Smet.

Le genotype TA du rs9939609 augmente d’un facteur de 1,5

(OR = 1,54; 95% CI =1,11 – 2,14; p = 0.009)

Résultats (Smet)

Recherche et formation

Valorisation 4 articles

IF: 1.97IF: 3

IF: 1.27

2 communications orales

Recherche et formation

Recherche et formation

MODY: c’est quoi?

• Une forme atypique de diabète survenant dés l’enfance ou l’adolescence

Diabète de type adulte chez le jeune= Maturity Onset Diabetesof the Young.

• Une forme monogénique du diabète de type 2.

• Une prévalence estimée à 2% des cas diabétiques type 2.

La prévalence exacte de MODY est

sous-estimée

Présence de signes cliniques communs à ceux

des deux types majeurs du diabète

Recherche et formation

MODY: Hétérogénéité clinique et

génétiqueType Gène atteint Fréquence

relative

Age au diagnostic Traitement Complications

du diabète

MODY 1 HNF4A 5% Jeunes adultes Régime, sulfonylurées,

insuline

Fréquents

MODY 2 GCK 20-50% Enfants Régime, activité physique Rares

MODY 3 HNF1A 20-50% Enfants Régime, sulfonylurées,

insuline

Fréquents

MODY 4 PDX1 <1% Nouveaux nés,

enfants

Antidiabétiques oraux,

insuline

?

MODY 5 HNF1B 5% Jeunes adultes Antidiabétiques oraux,

insuline

Rénales

MODY 6 NEUROD1 très rare Jeunes adultes ? ?

MODY 7 KLF11 très rare Jeunes adultes ? DT2

MODY 8 CEL très rare Jeunes adultes ? ?

MODY 9 PAX4 très rare Jeunes adultes ? ?

MODY 10 INS très rare Jeunes adultes Antidiabétiques oraux,

insuline

?

MODY 11 BLK très rare Jeunes adultes ? ?

MODY 12 ABCC8 très rare Jeunes adultes , sulfonylurées ?

MODY 13 KCNJ11 très rare Jeunes adultes ? ?

MODY 14 APPL1 très rare Jeunes adultes ? ?

MODY X ? ? ? ? ?

Recherche et formation

Existence d'une hyperglycémie

permanente

< 25 ans

Forte hérédité familiale

Mode autosomique dominant

Une indépendance à l’insuline, au

moins durant les premières années de

la maladie.

Pas d'acidocétose

Absence d'autoanticorps

pancréatiques

Le diagnostic du Diabète MODY

Recherche et formation

http://www.diabetesgenes.org/content/mody-

probability-calculator

Centre for Molecular Genetics at the University of Exeter Medical

School and Royal Devon and Exeter Hospital, Exeter, UK

Le calculateur prédictif de la probabilité de MODY

(Shields et al, 2011)

Recherche et formation

12 jeunes tunisiens

atteints du diabète

familial non auto-

immun

La recherche des

mutations dans 6

gènes de MODY

Identification de la

mutation causale chez

uniquement un patient

au niveau du gène

HNF4A

Recherche et formation

Projet:

Etude épidémiologique et génétique des formes

atypiques du diabète en Tunisie : le MODY

Coordinateur principal: Dr Rym KEFI

Une étude pluridisciplinaire impliquant plusieurs partenaires:

L’institut de nutrition de Tunis

Le laboratoire de biochimie à l’IPT

Le laboratoire d’immunologie clinique à l’IPT

Collaborateurs étrangers pour l’application du NGS à des

patients tunisiens cliniquement suspectés MODY.

Implication de référents en statistique et en bioinformatique.

Recherche et formation

Objectif du projet

Améliorer le diagnostic du diabète de type MODY en Tunisie

Le diagnostic clinique Le diagnostic moléculaire.

Mise en place d’un calculateur prédictif

Recherche et formation

collecte des données

cliniques, généalogiques

Investigation moléculaire par séquençage à Haut Débit

Intégration et analyse des données

Identification des mutations causales et validation du calculateur prédictif

Détermination

de la sous classe de MODY

Patient

Prescription

du traitement

adéquat

Recherche et formation

Identification de biomarqueurs pour le diabète de

type 2 à travers des investigations pluridisciplinaires

Nouveau projet

Etude génétique

Etude du stress oxydant

Etude de la flore intestinale

Janvier 2018

Coordinatrice : Dr Rym KEFI

Recherche et formation

[email protected]

[email protected]

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