Fête de la Science : Les maladies métaboliques chroniques en Tunisie: une épidémie ?
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Recherche et formation
Les maladies métaboliques chroniques en
Tunisie: une épidémie?
Institut de nutrition de Tunis
Dr Rym KEFI
Maître assistante universitaire (PhD, HDR)
Laboratoire de Génomique Biomédicale et Oncogénétique
Institut Pasteur de Tunis
Mr Hamza DALLALIEtudiant en thèse
Recherche et formation
1
2
Nos projets 3
2
PLAN
Syndrome métabolique
Diabète : caractéristiques, prévalences…
MODY4
Recherche et formation
Transition épidémiologique
Contexte actuel
Des maladies infectieuses
Des maladies non transmissibles
(diabète, hypertension artérielle, dyslipidémie,
maladies cardiovasculaires et cancers)
Recherche et formation
Une hyperglycémie chronique:
un défaut de la sécrétion de l’insuline
ou de son action sur ses cellules cibles
ou bien de la combinaison de ces deux anomalies
Recherche et formation
Diabète
Diabète MODY
Diabète gestationnel
Diabète
mitochondrial
2-5%
Diabète de type
2
90-95%
Diabète de
type 1
5-10%
Les types du diabète
Recherche et formation
Selon les critères de l’OMS et l’IDF:
Glycémie à jeun ≥ 1,26 g/l (7 mmol/l)
Glycémie post-prandiale ≥ 2 g/l (11,1 mmol/l)).
Recherche et formation
Dans le monde, plus de 5,1 millions de décès par an sont dus au
diabète!
soit 14 000 morts par jour
1 mort toutes les 7 secondes !
Fédération internationale de diabète, 2015
Recherche et formation
2.3
9
12.2
15
0
2
4
6
8
10
12
14
16
Prévalence (%)
Evolution de la prévalence du Diabète en Tunisie
1977 2007 2016 2017OMS et institut de nutrition
Recherche et formation
• Composante
environnementale
• Composante génétique
Incidence nettement plus élevée chez
les individus ayant des antécédents
familiaux
14
Maladie multifactorielle
Syndrome métabolique
Recherche et formation16
Continent PaysPrévalence totale
(%)Auteurs (Année)
Afrique du Nord
Tunisie 30.0 (Belfki et al., 2013)
Algérie 5.8(Thanopoulou et al.,
2006)
Maroc 12,8 (van Vliet et al., 2009)
Amérique
Venezuela 26.6 (Florez et al., 2005)
Mexique 26.6(Aguilar-Salinas et al.,
2004)
Etats unis 23.7 (Ford et al., 2002)
Asie
Iran 23.7 (Sharifi et al., 2009)
Turquie 32.8 (Onat et al., 2002)
Inde 18.3 (Deepa et al., 2007)
Inde 31.6 (Gupta et al., 2004)
Singapour 13.2 (Heng et al., 2006)
Japon 13 (Ishizaka et al., 2005)
Chine 7.3 (Lao et al., 2012)
Europe
Croatie 34 (Kolcic et al., 2006)
Espagne 26.5 (Lorenzo et al., 2003)
Pays bas 25.5 (Dekker et al., 2005)
Grèce 24.5 (Athyros et al., 2005)
Portugal 27.5 (Fiuza et al., 2008)
Italie 22.2 (Miccoli et al., 2005)
Prévalence
Recherche et formation
New Partnership for Africa’s Development (NEPAD)
North Africa Biosciences Network (NABNet)
http://www.nrc.sci.eg/nepad/default.html
TUNISIA
MAURITANIA
ALGERIA
MOROCCO
“lnvestigation multidisciplinaire des facteurs génétiques
à risque pour le diabète de type II et ses complications
en Afrique du Nord »
Collaboration régionale
2008-2011
Recherche et formation
Identification: MEDIGENE – FP7-279171-1
Titre: « les facteurs génétiques et environnementaux du
syndrome métabolique et ses complications chez les
populations méditerranéennes»
Durée: 4 ans et demi (Janvier 2012-2015; prolongation
Juillet 2016)
18
Recherche et formation
Approche: étude d’association
Le variant génétique est-il plus fréquent chez les sujets malades
que chez les témoins?
Recherche et formation
Les variants du gène KCNJ11 (ATP-sensitive potassium) et
IGF2BP2 (Insulin Like Growth Factor 2 mRNA Binding Protein 2)
augmente le risque de DT2 en Tunisie et en Mauritanie
Facteur de 2 à 3,6 le risque de DT2
Résultats (DT2)
Le variant rs7756992 du gène CDKAL1 (CDK5 Regulatory Subunit
Associated Protein 1 Like) possède un rôle protecteur contre la
néphropathie diabétique (OR = 0.44, 95% CI = 0.27–0.73, P = 0.001)
Recherche et formation
24
L’haplotype GCA (rs1421085 A>G -rs 8057044 T>C -
rs9939609 T>A ) du gène FTO, est associé avec un risque élevé
de développer un Smet (OR = 3,81; 95% CI = 0,987-9,86; p = 0,
015)
L’haplotype GCA est associé à des valeurs élevées de GAJ, PAS,
TG.
Différence entre les hommes et les femmes
Association des variants du gène FTO (Fat mass and obesity
associated) avec Smet.
Le genotype TA du rs9939609 augmente d’un facteur de 1,5
(OR = 1,54; 95% CI =1,11 – 2,14; p = 0.009)
Résultats (Smet)
Recherche et formation
MODY: c’est quoi?
• Une forme atypique de diabète survenant dés l’enfance ou l’adolescence
Diabète de type adulte chez le jeune= Maturity Onset Diabetesof the Young.
• Une forme monogénique du diabète de type 2.
• Une prévalence estimée à 2% des cas diabétiques type 2.
La prévalence exacte de MODY est
sous-estimée
Présence de signes cliniques communs à ceux
des deux types majeurs du diabète
Recherche et formation
MODY: Hétérogénéité clinique et
génétiqueType Gène atteint Fréquence
relative
Age au diagnostic Traitement Complications
du diabète
MODY 1 HNF4A 5% Jeunes adultes Régime, sulfonylurées,
insuline
Fréquents
MODY 2 GCK 20-50% Enfants Régime, activité physique Rares
MODY 3 HNF1A 20-50% Enfants Régime, sulfonylurées,
insuline
Fréquents
MODY 4 PDX1 <1% Nouveaux nés,
enfants
Antidiabétiques oraux,
insuline
?
MODY 5 HNF1B 5% Jeunes adultes Antidiabétiques oraux,
insuline
Rénales
MODY 6 NEUROD1 très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 7 KLF11 très rare Jeunes adultes ? DT2
MODY 8 CEL très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 9 PAX4 très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 10 INS très rare Jeunes adultes Antidiabétiques oraux,
insuline
?
MODY 11 BLK très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 12 ABCC8 très rare Jeunes adultes , sulfonylurées ?
MODY 13 KCNJ11 très rare Jeunes adultes ? ?
MODY 14 APPL1 très rare Jeunes adultes ? ?
MODY X ? ? ? ? ?
Recherche et formation
Existence d'une hyperglycémie
permanente
< 25 ans
Forte hérédité familiale
Mode autosomique dominant
Une indépendance à l’insuline, au
moins durant les premières années de
la maladie.
Pas d'acidocétose
Absence d'autoanticorps
pancréatiques
Le diagnostic du Diabète MODY
Recherche et formation
http://www.diabetesgenes.org/content/mody-
probability-calculator
Centre for Molecular Genetics at the University of Exeter Medical
School and Royal Devon and Exeter Hospital, Exeter, UK
Le calculateur prédictif de la probabilité de MODY
(Shields et al, 2011)
Recherche et formation
12 jeunes tunisiens
atteints du diabète
familial non auto-
immun
La recherche des
mutations dans 6
gènes de MODY
Identification de la
mutation causale chez
uniquement un patient
au niveau du gène
HNF4A
Recherche et formation
Projet:
Etude épidémiologique et génétique des formes
atypiques du diabète en Tunisie : le MODY
Coordinateur principal: Dr Rym KEFI
Une étude pluridisciplinaire impliquant plusieurs partenaires:
L’institut de nutrition de Tunis
Le laboratoire de biochimie à l’IPT
Le laboratoire d’immunologie clinique à l’IPT
Collaborateurs étrangers pour l’application du NGS à des
patients tunisiens cliniquement suspectés MODY.
Implication de référents en statistique et en bioinformatique.
Recherche et formation
Objectif du projet
Améliorer le diagnostic du diabète de type MODY en Tunisie
Le diagnostic clinique Le diagnostic moléculaire.
Mise en place d’un calculateur prédictif
Recherche et formation
collecte des données
cliniques, généalogiques
Investigation moléculaire par séquençage à Haut Débit
Intégration et analyse des données
Identification des mutations causales et validation du calculateur prédictif
Détermination
de la sous classe de MODY
Patient
Prescription
du traitement
adéquat
Recherche et formation
Identification de biomarqueurs pour le diabète de
type 2 à travers des investigations pluridisciplinaires
Nouveau projet
Etude génétique
Etude du stress oxydant
Etude de la flore intestinale
Janvier 2018
Coordinatrice : Dr Rym KEFI