Dossier Pedagogique Spe Physiopath Cellul Moleculaire

ULP - Mention Vie et Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire

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Université Louis Pasteur

Mention : Vie et Santé

Spécialité :

Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire Plan 1

Porteurs du projet et Objectifs, Compétences à acquérir, 2 Insertion des étudiants 3 M2, Débouchés, Admissions de Droit 5 Pré-requis, validation M1, admissions M2 6 Effectifs prévisibles 7 Liste des Laboratoires 8 Modalités, innovations pédagogiques 10 Partenariats - passerelles 12 Dispositif d’évaluation 13 Semestre 1 14 Semestre 2 38 Semestre 3 43 Semestre 4 53 Evaluation de la charge d’enseignement 55 Annexe 1 - Liste des enseignants-chercheurs et chercheurs participant aux enseignements magistraux et pratiques 56 Annexe 2 - Programmes des Enseignements modulaires 83 Annexe 3 - Réponse à l’évaluation de la CEPPE de Février 2005 92 Annexe 4 – Plaquette d’information sur la spécialité PCM 93


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MASTER DE SCIENCES MENTION Vie et Santé…………………………. SPECIALITE : Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire Recherche : OUI Professionnelle : NON Porteurs de la spécialité : Nom et Prénom : Bahram Seiamak Qualité : PU-PH Section CNU : 47 03 et/ou section comité national CNRS : ou Commission spécialisée INSERM : 2 Unité de recherche : Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, INSERM-CRES, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. Tél. : 33 3 90 24 39 92 Fax : 33 3 90 24 40 16 E-mail : [email protected]

Nom et Prénom : Prévost Gilles Qualité : MCU-PH, HDR Section CNU : 45 01 et/ou section comité national CNRS : ou Commission spécialisée INSERM : Unité de recherche : UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Fax : 03 88 25 11 13 Tél. : 33 3 90 24 37 57 E-mail : [email protected] Objectifs : Des équipes de recherche pour une grande part dans la Fédération de Recherche de la Faculté de Médecine de Strasbourg participent à la mise en évidence de l’histoire naturelle des maladies dans son échelle cellulaire et moléculaire, au développement du diagnostic et à la conceptualisation de nouvelles thérapeutiques. Elles développent souvent plusieurs axes complémentaires dans leurs thèmes de recherche. Pour aboutir aux connaissances et développer des applications, les investigations sont souvent multidisciplinaires et mettent en oeuvre différentes approches analytiques ou constructives. Ces équipes de recherche obtiennent donc un bénéfice réel lorsqu’elles peuvent rassembler des chercheurs interdisciplinaires aux compétences multiples tout en restant des collaborateurs privilégiés du secteur clinique. Ce sont ces intrications disciplinaires que souhaite développer la spécialité de Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire, afin de constituer un point de nucléation pour une formation scientifique à visée médicale et pour les différents services cliniques qui devront pérenniser les carrières hospitalo-universitaires, hospitalières et scientifiques. Elle propose une formation solide dans des domaines disciplinaires importants en lien avec de nombreuses préoccupations de la Santé Humaine. Cette formation vise également à des échanges plus nombreux entre les laboratoires concernés et escompte que les étudiants auront au travers de leur formation pluridisciplinaire, une vision précise et dynamique des possibilités de recherche et des technologies présentes et accessibles dans cette Fédération. La spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire est également soutenue par plusieurs équipes de l’ULP et d’Universités étrangères. Compétences à acquérir et débouchés (insertion professionnelle) :

Compétences à acquérir La spécialité de Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire propose aux étudiants

médecins, pharmaciens, dentistes (MPD dans le texte) et scientifiques un enseignement modulaire et disciplinaire à la carte, soit de 2 modules pour les médecins, pharmaciens et dentistes, et de 3 modules pour les scientifiques au choix parmi 5 proposés : Biologie et Médecine de la Reproduction, Cancérologie, Génétique Humaine, Immunologie, Microbiologie Médicale. Les parcours internes comprennent des modules disciplinaires complétés des Travaux Dirigés et Pratiques en laboratoire et des conférences. Par ailleurs, ils s’appuient sur des enseignements au choix de type fondamental (Stratégie de recherche en biologie cellulaire, transcription-réplication, biologie du développement). Les différents enseignements sont répartis sur les trois premiers semestres et créent des liens transversaux avec d’autres spécialités comme la Biologie Cellulaire Intégrée et la Biologie Moléculaire et Structurale. Il ne peut, cependant s’agir de parcours en Y vis à vis des spécialités citées avec lesquelles un réel effort de partage d’enseignement est envisagé, tant l’ensemble des bases obligatoires ainsi que les finalités sont différentes. Cette spécialité est appelée à former des étudiants pouvant s’inscrire en doctorat à l’Ecole Doctorale des Sciences de la Vie et de la Santé de Strasbourg : http://www-ed-sdvs.u-strasbg.fr/site/reglement.html


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Insertion des étudiants - M1. Les enseignements modulaires à la carte se déclinent

par environ 50 heures de cours . magistraux et 40 heures de TP-TD par module. Les cours magistraux des modules sont non seulement orientés vers des connaissances disciplinaires, mais intègrent aussi des connaissances fondamentales et les technologies utilisées pour mettre en évidence certains des phénomènes décrits. Les formations pratiques sont réalisées dans les laboratoires s’affichant sur des thèmes techniques prédéfinis. Ces formations pratiques ont déjà eu cours pour les MSBM ; elles permettent aux étudiants d’appliquer individuellement des techniques actuelles en utilisant parfois des appareillages rarement mis en place dans les salles de travaux pratiques (purification automatisée de protéines, cytométrie en flux, amplification en temps réel, laboratoire P3, cultures cellulaires,...) et de se familiariser avec les nécessaires contraintes de manipulation. D’autre part, dans ces formations et dès M1, les étudiants sont amenés à être en contact avec différentes équipes de recherche. Cela constitue une mise en situation concrète dans le monde de la recherche et une ouverture professionnelle. Pour soutenir les enseignements fondamentaux, disciplinaires et pratiques, des travaux dirigés sensibilisent les étudiant aux technologies de la biologie moléculaire et la manipulation de banques de données et de logiciels spécialisés. Des travaux de communication sont également demandés.

Cas des étudiants MPD Les étudiants médecins, pharmaciens et dentistes (MPD) devront valider au moins 30 crédits de

la spécialité pour la première année du Master (M1), soit 2 modules à la carte sur les cinq proposés, de deux « Travail d’Etudes et de Recherche » et de 6 crédits de Langues. Les 30 autres crédits seront acquis après la validation de la sixième année (DCEM-4) des formations en Médecine ou Odontologie (DCEO3) et de la cinquième année de la formation en Pharmacie. Les crédits de langues seront néanmoins validables en Master ou en Médecine – Pharmacie – Odontologie.

La liste des groupes de deux modules à la carte pour la validation de M1 par les étudiants MPD est la suivante :

Immunologie et Microbiologie Médicale ou Cancérologie et Génétique humaine ou Cancérologie et Immunologie ou Génétique humaine et Biologie et Médecine de la Reproduction ou Génétique humaine et Immunologie ou Cancérologie et Microbiologie Médicale ou Biologie et Médecine de la Reproduction et Cancérologie Les étudiants MPD pourront valider au moins un module au cours d’une année

universitaire, mais pourront utiliser deux semestres pour valider les cours magistraux et le stage pratique en laboratoire d’un module. Les 30 crédits d’enseignements (CE) pourront donc être validés en trois années au moins à partir du DCEM 1 pour les médecins ou équivalent pour les dentistes, et à partir de la troisième année de la formation en Pharmacie. Les enseignements spécifiques des formations médicale, pharmaceutique et odontologique donneront équivalence à 30 crédits (15 par semestre de M1) auxquels pourra s’ajouter un maximum de 6 crédits de langues, à l’issue des trois années de spécialisation de second cycle.

Exemple de deux types de validations de M1, pour des étudiants médecins : I) Année 1 (DCEM 2) Année 2 (DCEM 3) Année 3 (DCEM 4) Semestre 1 CM Module 1 6 CE

Semestre 2 TP Module 1 3 CE Langues 3 CE

S1 TER I, Langues3 + 3 CE

S2 TER II ou IIII 3 CE

S1 CM Module 2 6 CE

S2 TP Module 2 3 CE

II) Année 1 (DCEM 2) Année 2 (DCEM 3) Année 3 (DCEM 4) Semestre 1 CM.Module 1 - 6 CE TP Module1 3 CE

S2 TER II ou IIII 3 CE

S1 Langues 3 CE

S2 CM Module 2 6 CE TP Module2 3 CE

S1 TER I, 3 CE

S2 Langues 3 CE


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Afin que l’ensemble des étudiants puissent trouver une souplesse de choix horaires des

enseignements modulaires ou puissent valider les CM de 4 des modules à la carte, il nous parait opportun d’inscrire les CM des mêmes modules en option (6 crédits de CM seront alors concernés). Pour les étudiants MPD, les cours magistraux nécessiteront quatre heures de temps présentiel hebdomadaire aux premier (1 module) et/ou second semestres. Les TER nécessiteront deux heures de disponibilité hebdomadaire sur deux semestres d’une quelconque année où ils suivront cette formation. Ces cours seront dispensés soit à partir de 16h00 deux fois par semaine, soit sur une après-midi. Une rotation horaire bisannuelle des modules enseignés chaque semestre sera mise en place par semestre, afin d’assurer leur accès à tous les étudiants. Les modules de Biologie et Médecine de la Reproduction et de Microbiologie Médicale seront enseignés simultanément, car ils ont peu d’intérêts scientifique en commun. Les autres modules seront enseignés chacun à des horaires différents pour permettre leur accès aux étudiants scientifiques. Les mêmes modules sont affichés en option, afin que les étudiants puissent validés plus de trois modules ou bien qu’après le jeu de compensations (option --> module), ils puissent valider des options lors du (second) semestre où elles sont ouvertes. Par ailleurs, pour l’année M1, les crédits de langue (6 crédits maximum) seront validés s’ils ont été suivis, tout ou partie, au cours des formations en Médecine, Pharmacie, Odontologie ou bien durant le cursus Master. Enfin, les stages pratiques (TP, TD-TP) validés dans les enseignements de Master (6 crédits) pourront être valorisés au titre des stages d’initiation en laboratoire de DCEM-3, voire des stages de Biologie de la filière Internat de la formation pharmaceutique. Les titulaires d'unité d'enseignement/ou de modules obtenus durant le Master pourront bénéficier de la dispense d'un enseignement complémentaire (afférent au DCEM1 pour Médecine) ou d'un enseignement optionnel (pour les DCEM2, DCEM3 ou DCEM4) selon les dispositions prises par les conseils d'UFR.

Cas des étudiants scientifiques Les étudiants scientifiques devront valider un parcours de 60 crédits, et choisir trois

modules sur les cinq au cours de l’année M1. Sept parcours à la carte seront proposés pour l’année M1 aux étudiants scientifiques : Génétique humaine et Biologie et Médecine de la Reproduction et Cancérologie ou Génétique humaine et Cancérologie et Immunologie ou Cancérologie et Immunologie et Microbiologie Médicale ou Génétique humaine et Microbiologie Médicale et Immunologie ou Immunologie et Génétique humaine et Biologie et Médecine de la Reproduction ou Immunologie et Cancérologie et Biologie et Médecine de la Reproduction ou Génétique humaine et Cancérologie et Microbiologie Médicale

Les enseignements sont prévus selon le schéma général suivant :

M 1 – semestre 1 semestre 2 CM Module 1 6 CE TP Module1 3 CE Ens. Fond. I 3 CE Histo TD/TP 3 CE TER I 3 CE Option 6 CE Ens. Libre 3 CE Langues 3 CE Total = 30 CE

CM Module 2 6 CE TP Module 2 3 CE CM Module 3 6 CE TP Module 3 3 CE TER II 3 CE TER III 3 CE Ens. Libre 3 CE Langues 3 CE Total = 30 CE

NB : Pour les enseignements fondamentaux partagés avec les spécialités de Biologie Cellulaire Intégrée et de Biologie Moléculaire et Structurale lors du premier semestre de M1, les étudiants scientifiques devront suivre les cours à des horaires correspondant à leur disponibilité. M2. Le contenu d’enseignement au cours de l’année M2 sera le même pour l’ensemble des étudiants. Il comportera un module d’Instrumentation en Imagerie moléculaire de la cellule (3 CE) et un suivant axé les méthodes d’investigation des fonctions cellulaires en imagerie (Histologie fonctionnelle, 3 crédits), deux séries de conférences portant sur des Questions d’actualité en Biologie Cellulaire (3 CE) et en Physiopathologie (9 CE). Les 12 autres crédits d’enseignement à valider au 3ème semestre seront partagés entre divers enseignements concernant la sécurité en laboratoire, la qualité, la propriété intellectuelle, les profils de carrière et la gestion des projets scientifiques, mais aussi la préparation du stage du semestre 4. Le stage du 4ème semestre est consacré à la recherche dans une équipe d’accueil et à la préparation d’un rapport de stage. La préparation d’un séminaire par l’étudiant pourra lui être demandé.


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Débouchés

Les débouchés concernent les carrières de chercheurs à part entière et aussi celles d’enseignants-chercheurs universitaires et hospitalo-universitaires, et de praticiens hospitaliers, qui doivent également passer des concours sur dossier pour accéder aux postes. Les carrières dans les départements Recherche et Développement du secteur industriel sont aussi des débouchés à ce type de formation dès M2 ou à l’issue d’un Doctorat. La possibilité d’une spécialisation polyvalente pour les étudiants parait constituer un atout important pour une insertion future dans le monde professionnel.

Un Cancéropôle a été mis en place à Strasbourg à partir de l’été 2003, et il sera pérennisé par

l’Institut National du Cancer durant l’année 2004. . De plus un projet ambitieux est sur le point de naître sur le campus médical Strasbourgeois. Il s’agit de l’IRBS (Institut de Recherche Biomédical de Strasbourg) qui fédérera à terme (2007) sur un même emplacement géographique (Campus Médecine : Faculté de Médecine et Nouvel Hôpital Civil de Strasbourg) la majorité de la recherche biomédicale Strasbourgeoise. Ceci est clairement acté dans le Plan Quadriennal 2005-2008 et dans les CPER (Contrat Plan Etat-Région) actuel et futur. L’IRBS sera centré sur les thèmatiques suivantes : l’infection, l’immunologie et la génétique humaine, les maladies inflammatoires, cancer et neurosciences. Une fraction importante des laboratoires constitutifs de l’IRBS supportera la présente spécialité.

Il s’agit d’une formation à la recherche tant fondamentale qu’appliquée, ayant une double visée diagnostique et thérapeutique dans de nombreux domaines de la Santé. Elle pourrait être attractive sur le Grand Est français, d’ores et déjà deux universités européennes acceptent d’être partenaires.

Enfin, avec la formation M1, les étudiants pourront acquérir des bases solides en biologie

cellulaire – biochimie, en microbiologie, et quelques éléments de physiologie. Ainsi, cette spécialité peut aussi constituer un tremplin intéressant vers la préparation aux concours CAPET – Agrégation des Professeurs de Biotechnologies. Admission de droit à l’inscription aux 60 premiers crédits de master pour les étudiants titulaires des diplômes suivants obtenus à l’ULP* : Plusieurs catégories d’étudiants pourront s’inscrire en M1 dans cette spécialité de Master :

les étudiants en Sciences de la Vie pourront s’inscrire après avoir validé une : Licence de Biochimie ou Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire et Physiologie à l’Université Louis Pasteur (ancien système)

Licence de Biologie Cellulaire et Physiologie ou une Licence de Biochimie et Biologie Moléculaire. (LMD – ULP) ou Licence jugée équivalente dans une autre université par la Commission Pédagogique*.

Les étudiants en Médecine pourront s’inscrire après avoir totalement validé leur année de PCEM2 et pourront valider cette année M1 sur trois années, soit jusqu’au DCEM4 inclus. Les étudiants en Odontologie pourront s’inscrire après avoir totalement validé leur première année de spécialisation vers la formation en Chirurgie Dentaire (PCEO2) et pourront valider cette année M1 sur trois années.

Les étudiants en Pharmacie pourront s’inscrire après avoir validé leur seconde année d’étude en Pharmacie et pourront valider cette année M1 sur deux ou trois années.* * Pour les autres étudiants, l’admission se fera sur examen du dossier par la commission pédagogique Pré-requis (connaissances et compétences) recommandées pour l’admission en master. Précisez les pré-requis pour chaque année de master :

La spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire requiert des connaissances sérieuses en Biologie. La Biologie Moléculaire et la Biologie Cellulaire représentent des éléments fondamentaux de cette filière. Des notions de biochimie, physiologie et un intérêt en pathologie sont également importants. En fonction d’une expérience préalable et/ou d’affinités


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particulières, les étudiants pourront choisir des orientations disciplinaires proposées dans la spécialité.

Les étudiants scientifiques des autres universités peuvent s’inscrire directement en M1 à la

condition d’avoir validé un ensemble d’enseignement jugé équivalent à 80% des enseignements spécifiques de l’une des licences citées plus haut. Dans ce cas, nous ne demanderons pas la validation d’enseignement complémentaire. Le cas échéant, une mise à niveau représentant au plus 20% d’une année L3 de licence pourra être demandée. Cette évaluation sera jugée par la Commission Pédagogique de la spécialité.

Pour les étudiants changeant d’université au cours de leurs études médicales, pharmaceutiques ou d’odontologie, la Commission Pédagogique réalisera une évaluation au cas par cas pour déterminer le niveau d’enseignement équivalent à cette formation et déterminera les acquis pour chaque étudiant en fonction.

Les enseignements cliniques et biologiques acquis dans les disciplines MPD

procureront un bagage disciplinaire et une équivalence de trente crédits pour la première année de Master. Dans tous les cas, l’année M1 ne sera validée pour ces étudiants qu’à l’issue de la validation des parcours MPD obligatoires, soit les 6èmes années des études médicales ou de chirurgie dentaire ou la 5ème année des études pharmaceutiques.

Validation de M1 et Admission en M2

L’admission de droit en M2 ne pourra être effective qu’après avoir validé : Une maîtrise de : - Biochimie mention biochimie moléculaire et cellulaire option biologie du développement - Biochimie mention biochimie moléculaire et cellulaire option biologie moléculaire générale - Biologie Cellulaire et Physiologie mention physiologie option physiologie générale et pharmacologie ou option Biologie des Micro-Organismes de l’Université Louis Pasteur pour l’ancien système ou - les enseignements obligatoires et optionnels de la spécialité Physiopathologie Cellulaire et

Moléculaire ou un parcours cohérent de 30 CE (2 x 15) pour les étudiants MPD (30 autres CE d’équivalence sont attribués en ayant valider le second cycle universitaire) ou 60 crédits pour les étudiants scientifiques, et enfin avoir satisfait aux examens correspondants à l’année M1. Pour les médecins, dentistes et pharmaciens, la possibilité de s’inscrire en M2 sera envisageable sans nouvelle évaluation pendant au moins cinq années à compter de la validation de M1 (il est rappelé que l’Internat est de quatre années ; une année supplémentaire pour l’accès à M2 est accordée pour les cas d’échec au concours à l’Internat [second DCEM-4] ou de difficulté d’insertion dans un laboratoire). Il est rappelé qu’ils devront également déposer la demande d’une année « recherche » ; cette dernière est insérable durant l’Internat. Certains laboratoires financent parfois ce type d’année M2.

ou Spécialité ULP – M1 Biologie Cellulaire Intégrée – accès intégral si parcours

Immunologie et autre module(s) de Physiopathologie en M1 ou La Commission Pédagogique de la spécialité sera en charge d’examiner les éventuelles

demandes externes ou spécifiques d’inscription en M2 en fonction des parcours préalablement réalisés. Les étudiants médecins, dentistes ou pharmaciens pourront valider une année M1 s’ils sont titulaires d’une MSBM depuis moins de quatre ans et dont le contenu corresponde suffisamment au contenu pédagogique du M1 considéré. Les certificats uniques de MSBM préalablement obtenus pourront trouver une équivalence en crédits d’enseignement qui devra être évaluée au cas par cas (1 certificat = 9 CE).

Des passerelles seront également possibles pour l’inscription en M2 à partir de M1 de plusieurs

spécialités vers celle de Physiopathologie avec ou sans complément d’enseignement nécessaire comme pour la Biologie Cellulaire Intégrée(voir plus loin).


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Effectifs prévisibles

Pour l’année M1, le recrutement de la spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire s’appuiera sur plusieurs formations de Maîtrise de Sciences Biologiques et Médicales (7 au total) représentant 100 à 110 inscrits chaque année (médecins, dentistes, pharmaciens, vétérinaires, et une proportion significative d’étudiants étrangers)(ex : 35 inscrits en 2003, 37 en 2004 pour la seule MSBM Physiopathologie des maladies transmissibles). En outre, cette spécialité est conçue pour pouvoir accueillir des étudiants scientifiques attirés par la recherche dans le secteur médical.

Pour l’année M2, la spécialité repose surtout sur la branche Physiopathologie et Défenses

Immunitaires [Coordinateurs : Prs T. Martin (Immunopathologie) , H. Monteil (Bactériologie)] du DEA de Biologie Moléculaire et Cellulaire de Strasbourg, soit dans cette option du DEA 18 inscrits en 2002, 20 inscrits en 2003, 22 en 2004 dont 60% environ sont issus des formations scientifiques. Outre les équipes initialement agréées dans cette option de DEA, de nouvelles équipes viennent renforcer le potentiel de formation et de recherche. Un certain nombre d’étudiants locaux qui évoluent dans différents services cliniques, ne trouveront plus le même accès à des formations disciplinaires nationales et s’inscriront probablement dans cette spécialité qui doit être une alternative de formation (ex : dermatologie, parasitologie, médecine interne, ...).

Les effectifs prévisibles, compte-tenu de l’impact attractif des disciplines concernées

peuvent être compris entre vingt et trente-cinq étudiants pour cette spécialité. L’accès à cette spécialité est conçu aussi bien pour les étudiants médecins, pharmaciens et

dentistes à qui il est impératif de préserver un accès et un attrait pour les carrières hospitalo-universitaires tout en respectant les formations professionnelles aux carrières MPD. La spécialité sera également ouverte aux étudiants des formations scientifiques qui valideront un enseignement plus important.

Les carrières hospitalo-universitaires seront subordonnées par l’obtention par les candidats des diplômes de Master, de Doctorats et d’Habilitation à Diriger des Recherches, avant de pouvoir concourir aux concours de recrutement organisés par les différents Conseils Nationaux Universitaires des disciplines médicales, pharmaceutiques et odontologiques. Un nombre important de postes hospitalo-universitaires sera mis au renouvellement dans les quelques années futures.


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Liste des laboratoires et institutions d’accueil et nombre de places de stage. Indiquer le nombre d’HDR au sein de chaque laboratoire d’accueil.

● 24 Unités de recherche, 51 équipes de recherche, 100 HDR UPR 9021 . « Immunologie et Chimie Thérapeutiques» , équipe

« Immunopeptides, autoimmunité et immunomodulation » Directeur : Dr S. Muller, (DR1 CNRS, SDV 22). Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 rue Descartes F-67084 Strasbourg cedex . 22. Tel. 03 88 41 70, Fax. 03 88 61 06 80.

Email : [email protected] 1 équipe, 2 HDR UPR 9022 . Réponse Immunitaire et Développement chez les Insectes. Directeur:

Jules A. HOFFMANN (DR1 CNRS SDV 28) - Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 rue Descartes F-67084 Strasbourg cedex . 22. (33) 03.88.41.70.77 Sec : (33) 03.88.41.70.37. Fax 3 88 60 69 22. Email : [email protected] . Site web : http://www-ibmc.u-strasbg.fr .

2 équipes, 2 HDR. Laboratoire de Biologie et Physiologie Intégrée (CNRS/GDRE-ITI), Directeur :

Dr N. Kieffer (DR2 CNRS SDV 24). Faculté des Sciences, de la Technologie et de la Communication, Université du Luxembourg, Avenue de la Faïencerie, 162A, L-1511 Luxembourg, Grand-Duché de Luxembourg. Tel: (352) 466644-440 Fax : (352) 466644-442.,

Email: [email protected] 1 équipe, 1 HDR Laboratoire de Biologie Moléculaire, d’Analyse et de Modélisation Génétique,

Directeur : Dr E. Friederich (DR2 CNRS SDV 24), Centre de Recherche Public-Santé (http://www.crp-sante.lu) 42, rue du Laboratoire. L-1011 Luxembourg. Tel : + 352 26 48 02 05, Fax. : 00 352 26 48 00 85. Email : [email protected]

2 équipes, 3 HDR Laboratoire d'Immunogénétique et d'Allergologie. Directeur : Dr. F. Hentges, Centre

de Recherche Public-Santé/Centre Hospitalier du Luxembourg, 12, rue Barblé L-1210 Luxembourg. Tel: (352 ) 4411 2219. Fax: (352) 441255. Email: [email protected] (MD. CHL, CRP-Santé.).

1 équipe, 3 HDR

* L’Université du Luxembourg est actuellement en cours de formation et ne dispose pas pour le moment et dans un futur proche de formation à la recherche dans le domaine de la Biologie. Les laboratoires faisaient déjà partie du DEA de Biologie Moléculaire et Cellulaire de Strasbourg.

INSERM U375 CSS 1 (Heidelberg) , « Virologie Appliquée à l'Oncologie »

Directeur: J. Rommelaere, (DR1, INSERM CSS 01), Abteilung F0100, INSERM U375, Postfach 101949, 69009 Heidelberg, Germany/ Allemagne. Tel : 49 6221 42 49 62. Fax: 00 49 6221 42 49 62. Email: [email protected] 3 équipes, 4 HDR

UPR 9003, ESBS, « Cancérogenèse et Mutagenèse Moléculaire et Structurale »

Directeur : Dr R.P. Fuchs, puis G. De Murcia (DR2, CNRS SDV 21). Ecole Supérieure de Biotechnologie de Strasbourg. Boulevard Sébastien Brant, 67400 Illkirch. Tel : 03 90 24 47 07, Fax. 03 90 24 46 86. Email : [email protected]

3 équipes, 6 HDR INSERM-UMR 682 Ontogenèse et pathologie du système digestif : rôle du

micro-environnement cellulaire et moléculaire Directeur : M. Kédinger (DR1 INSERM CSS 5) - 3, Avenue Molière – 67200 Strasbourg. Tél. 33 (0)3 88 27 77 27. Fax 33 (0)3 88 26 35 38. Email : [email protected]

4 équipes, 9 HDR


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UPRES EA-3430, « Altérations Géniques des Cancers et Réponse

Thérapeutique » Directeur : Pr J.P. Bergerat (CNU section 47 02) - Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie. Tél. 03 88 11 90 61, Fax. 03 88 11 90 97. Email: [email protected]

1 équipe, 4 HDR + 1 DE INSERM U311, « Biologie et pharmacologie de l’hémostase et de la

Thrombose » Dr Christian Gachet (DR2, INSERM CSS 4). Etablissement Français du sang – Alsace. 10, rue Spielmann, F-67065 Strasbourg. Tél. : 03 88 21 25 25 Fax : 03 88 21 25 21. Email : [email protected] Site web : http://www.efs-alsace.fr 3 équipes, 4 HDR

INSERM U725, « Biologie des Cellules Dendritiques humaines» Directeur : Daniel

Hanau (DR2 INSERM CSS 2), Etablissement Français du Sang-Alsace, 10, rue Spielmann-67065 Strasbourg Cedex. Tel : 03 88 21 25 25. Fax : 03 88 21 25 21 .

Email: [email protected] , http://www.efs-alsace.fr 1 équipe, 2 HDR INSERM U737 – UPRES EA-3431 « Tolérance B lymphocytaire et

autoimmunité » Directeur : Pr Thierry Martin ( INSERM CSS 2, UPRES EA-3431), Service Médecine Interne A, 1, place de l’Hôpital, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 39 82,

Fax : 03 90 24 40 16. Email : [email protected]. 1 équipe, 3 HDR UPRES EA-3431 Centre de Recherche d'Immunologie et d'Hématologie «

Laboratoire d’Immunogénétique Moléculaire Humaine » Directeur : Pr Siamak Bahram (UPRES EA-3431) Faculté de Médecine, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. Tel 03 90 24 39 92, Fax : 03 90 24 40 16,

E-mail : [email protected] , http://immuno.u-strasbg.fr 1 équipe, 3 HDR UPRES EA-3771. “Inflammation et environnement dans l’asthme”. Directeur : Dr Nelly Frossard (DR2 INSERM CSS 2). Faculté de Pharmacie 74, route du

Rhin, BP 24, F-67401 Illkirch Cedex. Tél. 03 90 24 41 50. Fax : 03 90 24 43 09. Email: [email protected] 1 équipe, 1 HDR INSERM-CNRS/ULP, INSERM U596 (CSS8, CT1, CT2)/CNRS - UMR 7104 (SDV

25, 28). Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), 1 rue Laurent Fries BP 10142 67404 Illkirch CEDEX . Directeur : Pr J.L. Mandel (CNRS SDV ) Tel: 03 88 65 32 00, Fax : 03 88 65 32 01, Email: [email protected] – Départements : Biologie du Développement, Pathologie Moléculaire, Génétique et Physiologie du signal nucléaire, Transcription, Biologie Structurale et Génomique.

4 Départements de recherche, 18 équipes, 19 HDR Demande de Création d’EA Génétique Clinique,

Directrice : Pr H. Dollfus. (CNU section 47 04). Fédération de Génétique de la Faculté de Médecine, 4, rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg - Hôpitaux Universitaires de Strasbourg. Tel : 03 88 12 81 53 – 03 90 24 33 41. Fax : 03 90 24 33 31. Email : [email protected] ; [email protected] 4 équipes, 4 HDR

UPRES EA-3428. Primates : variabilité et évolution des prosimiens à l'homme.

Directeur : Pr B. Ludes (CNU section 54 05). Service de Biologie et Médecine du développement et de la reproduction 11, rue Humann, 67085 STRASBOURG. Tel : 03 90 24 31 86, Fax : 03 90 24 31 87. Email : [email protected] )

1 équipe, 1 HDR


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INSERM U405 - Psychopathologie et pharmacologie de la cognition. Directeur : Pr

J.M.Danion. Faculté de Médecine - Bâtiment 4 - 11, rue Humann - 67085 Strasbourg Cedex. Tel : 03 88 11 60 37, Email : [email protected] . Equipe Anomalies anatomiques et fonctionnelles du développement cérébral associées à une dysconnexion précoce. Responsables : Dr A. Nehlig, Pr N. Boehm (CNU section 42 02), Tel : 03 90 24 32 15, Fax : 03 90 24 32 11 Email : [email protected]

1 équipe, 1 HDR. Lien : http://neurochem.u-strasbg.fr INSERM U-692 - Laboratoire de Signalisations Moléculaires et

Neurodégénérescence. Directeur de l'Unité : Loeffler JP, DR-INSERM, CS8-Inserm. Faculté de Médecine (Université Louis Pasteur), , Bâtiment 3 - 8ème étage. 11, rue Humann - 67000 Strasbourg. Tél : 03.90.24.30.86 - Fax : 03.90.24.30.65. Email : [email protected] , 5 HDR ; Lien : http://neurochem.u-strasbg.fr

INSERM U.143, (équipe 3 - Jean-Marie Freyssinet (DR1 INSERM, CSS 4, HDR (Docteur d’Etat

ès Sciences ; [email protected] . Faculté de Médecine,ULP, 4 rue Kirchleger, 67085 Strasbourg. Tél. : 03 90 24 39 85/86/87/88/89

ERT interne à l’Unité INSERM U 595,11 rue Humann 67085 STRASBOURG

Cedex,Tel 03 90 24 38 68,Fax 03 90 24 39 00,courriel htenenxcite.com. Applications biomédicales des films multicouches de polyélectrolytes. Dir : Pr H. Tenenbaum

Ex UMR 544, UPRES EA-3770. « Pathogénie des infections virales

persistantes » Directeur : Pr F. Stoll-Keller (CNU section 45 01). Institut de Virologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg., Tel : 03 90 24 37 16, Fax : 03 90 24 37 23. Email : [email protected] . 2 équipes, 6 HDR

UPRES EA Physiotpathologie cellulaire et moléculaire des infections

parasitaires et fongiques, Directeur Pr E. Candolfi (CNU section 45 02). Faculté de Pharmacie – 74, route du Rhin – 67401 Illkirch CEDEX. Téléphone : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 93. Email : [email protected]

1 équipe, 3 HDR UPRES EA-3432, Laboratoire de Physiopathologie et d'Antibiologie des

Infections Nosocomiales et Emergentes. Directeur : Pr H. Monteil (CNU section 45 01). Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 75. Fax : 03 88 25 11 13.

Email : [email protected] ) 2 équipes, 9 HDR + 8 Enseignants-chercheurs avec HDR de différents services des Hôpitaux Universitaires de Strasbourg, qui sont associés par d’étroites collaborations scientifiques à l’IGBMC, à l’EA-3428, EA-3431, CRES et à l’EMI0222 ou la demande d’EA de Mme le Pr H. Dollfus. Les renseignements sur les différentes équipes sont accessibles sur sites web de l’Université Louis Pasteur et de la Faculté de Médecine de Strasbourg : http://www-ulp.u-strasbg.fr/ http://www-ulpmed.u-strasbg.fr/portail/ Modalités de contrôle des connaissances Les règles générales des modalités de contrôle des connaissances sont définies au niveau de l’université et s’appliquent à tous les diplômes (cf lettre de présentation de la Mention Vie et Santé). Ces règles générales fixent les modalités de capitalisation, compensation, conservation de notes d’une année à l’autre et report de notes entre les 2 sessions d’examen.


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Elles définissent les aménagements d’études accordés aux étudiants selon leurs situations particulières. Innovations pédagogiques Culture d’ouverture, culture actualisée et spécialisée. Pour permettre une meilleure adéquation des préoccupations de recherche dans les laboratoires avec l’enseignement en Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire, la programmation s’est délibérément orientée vers une formation à la recherche proche des problématiques médico-cliniques, car une partie de l’enseignement fondamental sera inclus dans les enseignements disciplinaires/modulaires. Des enseignements transversaux permettront de rappeler des notions technologiques s’appuyant sur des bases fondamentales. En effet, pour expliquer et décrire des processus physiopathologiques qu’ils soient d’ordre génétique, transcriptionnel ou en interaction avec des éléments environnementaux, il est indispensable de les resituer dans le contexte des mécanismes fondamentaux. Les cours magistraux feront l’objet d’un accès en ligne Intranet réservée aux inscrits de chaque module. Les contenus détailleront les points essentiels des savoirs dispensés et fourniront les références bibliographiques d’aide à l’assimilation du cours. A l’issue des analyses bibliographiques réalisées par les étudiants, des résumés seront également mis à la disposition des étudiants. A chaque conférence des questions d’actualité en Biologie Cellulaire ou en Physiopathologie, les listes d’articles pouvant servir de première référence seront également mises à disposition. Ces prestations n’excluent pas de remettre des polycopiés de cours ou leurs équivalents. Formations pratiques sur les terrains de recherche : les formations pratiques en salle commune de TP seront réduites à environ 20 heures en M1 et 50 heures en M2 ; alors que les formations pratiques dans les laboratoires d’accueil atteindront 120 heures pour les scientifiques et 80 heures pour les étudiants médecins, dentistes, pharmaciens en M1. Les intérêts sont multiples : pouvoir appréhender les techniques comme elles sont utilisées dans le monde professionnel, côtoyer au plus prêt et démystifier le monde de la recherche, vivre plusieurs expériences dans les laboratoires ; afin de renforcer l’ouverture d’esprit et effectuer un choix éclairé d’orientation vers la recherche. La formation pratique en M2 intitulée « Imagerie moléculaire et cellulaire » sera effectuée en groupe , mais va dans le sens de l’approfondissement du savoir et de la spécialisation. Recherche d’enseignements complémentaires cohérents avec les préoccupations disciplinaires de la Physiopathologie et approfondissement de certaines formations initiales : les crédits d’enseignement optionnel et libres seront l’occasion donnée aux étudiants d’affiner leur formation en allant acquérir des savoirs supplémentaires et cohérents à leur formation générale. Qu’il s’agisse éventuellement d’enseignements fondamentaux ou appliqués, ils pourront se tourner dans la mesure du possible vers d’autres spécialités, de bio-statistique, bio-informatique, pharmacologie, biomorphologie, biologie des micro-organismes, biologie structurale ; ces disciplines sont considérées cohérentes et complémentaires de la formation en physiopathologie. Entraînements à la communication scientifique : les Travaux d’Etude et de Recherche en M1 constitueront une première sensibilisation à la communication scientifique. L’effort de communication sera d’abord réalisé par groupes, puis de manière individuelle. Les stages pratiques en laboratoire, les conférences dédiées à la Biologie Cellulaire et la Physiopathologie seront l’occasion de différentes formes de communication et d’échanges scientifiques en groupe ou individuellement. L’initiation tuteurée à la recherche scientifique en M2 avec l’analyse d’articles ou d’affiches seront de nouvelles occasions données aux étudiants pour s’approprier des méthodes de réflexion, d’analyse et de communication scientifique. Ces différents enseignements leur demanderont une bonne organisation de travail et une prise de distance avec les sujets abordés. En outre, elles leur demanderont de produire un effort personnel de recherche d’informations, d’analyse critique, afin restituer un message synthétique et compréhensible par la communauté. Un certain nombre des thèmes au choix, des éléments bibliographiques, ainsi que les documents produits par les étudiants seront mis en ligne avec accès restreint aux inscrits. Avec les enseignements libres, les unités d’enseignements d’Ouverture Professionnelle et d’Accompagnement, les étudiants découvriront un ensemble de dispositifs mis en regard destinés à la meilleure intégration des savoirs et des applications disciplinaires. Il faut enfin souligner l’adhésion et l’enthousiasme d’une communauté diverse d’enseignants-chercheurs et de chercheurs prêts à s’investir dans cette formation.


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Formation Continue OUI X NON Poids de l’enseignement en situation présentielle et non présentielle et évolution au cours du cursus M1 : 1er semestre S1 : présentiel 38% - non présentiel 62 % 2nd semestre S2 : présentiel 39 % - non présentiel 61% M2 : 3ème semestre S3 : présentiel 42 % - non présentiel 58% 4ème semestre S4 : stage en laboratoire à temps plein Partenariats

- Composantes de l’Université Louis Pasteur – Strasbourg I : Faculté de médecine > M. Bertrand Ludes 4 rue Kirschleger - 67085 Strasbourg Cedex Tél. 03 90 24 35 20 - Fax 03 90 24 34 67 – Scolarité Tél. 03 90 24 35 10 - Fax 03 90 24 35 18 E-mail : [email protected] - Site web : http://www-ulpmed.u-strasbg.fr Faculté de pharmacie > M. Claude Hasselmann 74 route du Rhin BP 24 - 67401 Illkirch Cedex Tél. 03 90 24 41 10 - Fax 03 90 24 41 00 – Scolarité Tél. 03 90 24 42 84 E-mail : [email protected] - Site web : http://www-fac-pharma.u-strasbg.fr Faculté des sciences de la vie > M. Serge Potier 28 rue Goethe - 67083 Strasbourg Cedex Tél. 03 90 24 20 01 - Fax 03 90 24 20 02 – Scolarité Tél. 03 90 24 18 72 E-mail : [email protected] - Autres établissements partenaires de l’Enseignement Supérieur : Projet de Convention simple avec le Deutsches Krebsforschungszentrum (DKFZ) de

l’Université d’Heidelberg (Allemagne). Postfach 101949, 69009 Heidelberg, Germany/ Allemagne. Fax: 00 49 6221 42 49 62.

Projet de Convention simple avec l’Université du Luxembourg – secteur Sciences de la Santé à établir sur document agréé par l’ULP. Massimo Malvetti - Université du Luxembourg , Faculté des Sciences, de la Technologie et de la Communication Campus Kirchberg. L-1359 Luxembourg Téléphone: (+352) 420101-314. Télécopie: (+352) 420101-209. email : [email protected]

Passerelles prévues avec d’autres diplômes après les 30 ou 60 premiers crédits de Master selon l’avis de la Commission Pédagogique de la Spécialité PCM

- Accès en 2nd semestre de M1ère année de Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire Premiers semestres M1 validés de Biologie Cellulaire Intégrée, et de

Pharmacologie, Biologie Moléculaire et Structurale, Biologie des micro-organismes, sous réserve de la validation d’un module disciplinaire de Physiopathologie

- Accès à l’inscription en M2nde année de Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire

- Biologie Cellulaire Intégrée – accès intégral si parcours Immunologie et autre module(s) de Physiopathologie en M1

- Biologie Moléculaire et Structurale – accès en M2 selon appréciation de la Commission

Pédagogique (complémentation d’un module (cours) de Physiopathologie en S3*) - Biologie des Microorganismes - accès en M2 selon appréciation de la Commission

Pédagogique (complémentation d’un module (cours) de Physiopathologie en S3*)


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- Pharmacologie – accès en M2 selon appréciation de la Commission Pédagogique (complémentation d’un module (cours) de Physiopathologie en S3*)

* Pourvu que l’un au moins des cinq modules de Physiopathologie et « Stratégie d’étude en Biologie Cellulaire » ait été préalablement validé en M1.

- Accès vers d’autres spécialités avec la validation de M1 Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire : - Biologie Cellulaire Intégrée Dispositif d’évaluation des enseignements (UE obligatoires) Modules disciplinaires à la carte (Biol. Med. Reprod., Can., Gén., Immunol., Microbiol.) :

Examens écrits (coeff 2)+ rapports de stages pratiques (coeff 1)

Stratégies de recherche en Biologie Cellulaire : contrôle continu (coeff 0,25) + contrôle terminal (0,75) Histologie Appliquée : Contrôle continu (0,5) contrôle terminal (0,5). Enseignements optionnels

- Voir dans les spécialités correspondantes (en général coeff 2) -

Nouvelles technologies en Biologie Moléculaire (coeff 0,5) et Exploitation bibliographique individuelle : Résumé + présentation orale courte (coeff 0,5) Exploitation bibliographique en groupe : note de synthèse + présentation orale (coeff 1) Analyse de données expérimentales : exercices, contrôle continu (coeff 0,5) et Analyse et exploitation de données à partir de logiciels et de banques de données : exercices, contrôle continu (coeff 0,5) Instrumentation en Imagerie moléculaire de la cellule (coeff 1) Histologie fonctionnelle : contrôle terminal (coeff 1) Actualités en Biologie cellulaire : notes de synthèse, contrôle continu (coeff 1) Actualités en Physiopathologie : contrôle terminal (coeff 3) UE Ouverture professionnelle – Accompagnement : QCM / QROC (contrôle terminal) (coeff 1) Initiation tuteurée à la recherche : note bibliographique et projet scientifique, contrôle continu (coeff 2)


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DESCRIPTION DES ENSEIGNEMENTS : SEMESTRE 1 : 30 CREDITS

Liste de UE Coeff UE ECTS UE

UE obligatoires Stratégies de recherche sur la cellule 1 3 Histologie appliquée 1 3 Acquisition et analyse de résultats, banque de données, logiciels (Travail d’Etudes et de Recherche I)* 1 3 Langues* 1 3 UE obligatoire à choix 1 des 2 modules de Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire * (Cancérologie, Génétique Humaine) 3 9 Options - nombre d'UE à choisir parmi la liste ci-dessous : 2 6

Transcription et traduction de l’information génétique (TTI)) 2 6 Biologie du développement animal (BDA) ou 2 6 Physiologie et Physiopathologie (PEP de la Mention Sciences du Médicament) ou 2 6 Génétique et génomique des micro-organismes (GGM) ou 2 6 Pathogenèse virale et lutte anti-virale (PVL) ou 2 6 Virus en recherche fondamentale et appliquée (VFA) 2 6 CM des modules Génétique Humaine ou Cancérologie 2 6 Enseignement libre 1 3 * les lignes mentionnées d’une * indiquent les enseignements devant obligatoirement être validés par les étudiants en sciences médicales, pharmaceutiques et en odontologiques * les UE libres doivent totaliser 9 crédits sur l’ensemble du master. L’étudiant fait valider le choix des UE libres par l’équipe pédagogique. NB : la plupart sinon toutes les options choisies sont des UE obligatoires pour d’autres spécialités

Equipe pédagogique du semestre :

(enseignants –chercheurs, enseignants, chercheurs EPST)* (Indiquer les noms, prénoms, qualité, section CNU, unité de recherche, tél, fax, mail)

● Biologie et Médecine de la Reproduction (Coordinateurs : Pr M. Mark, Dr S. Warter)

Ontogenèse des gonades et du tractus génital : Pr. M. Mark (PU/PH, Médecine et Biologie du

Développement et de la Reproduction, section CNU 54 05). Implantation et placentation. Dr. S. Warter (MCU-PH, Médecine et Biologie du Développement et

de la Reproduction, section CNU 54 05). Contrôle hormonal de la reproduction et régulations auto et paracrines intra-gonadiques. Pr. N.

Boehm (PU/PH, Histologie, Embryologie et Cytogénétique, section CNU 42 02). Techniques en biologie de la reproduction. Dr. S Viville (MCU-PH avec HDR Médecine et Biologie

du Développement et de la Reproduction, section CNU 5405). Gamétogenèse, fécondation, et pathologies de la fertilité. Pr. Y Rumpler (PU/PH, Médecine et

Biologie du Développement et de la Reproduction, section CNU 54 05). Stages pratiques M1 : Dr. N. Ghyselinck (CR1 avec HDR, CNRS-SDV 28) Stages M2 : Pr. M. Mark, Dr. S. Warter, Dr. N. Ghyselinck


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Nelly Boehm (CNU section 4202, PU-PH, HDR, INSERM U405 (Psychopathologie et pharmacologie de la cognition. Directeur : J.M.Danion), Faculté de Médecine - Bâtiment 4 - 11, rue Humann - 67085 Strasbourg Cedex. Tel : 03 90 24 32 12, Fax : 03 90 24 32 11 Email : [email protected].

SAMAMA B., PLAS-ROSER S., SCHAEFFER C., CHATEAU D., FABRE M., BOEHM N. (2002) HPV DNA detection by in situ hybridization with catalyzed signal amplification on thin-layer cervical smears. Journal of Histochemistry and Cytochemistry, 50, 1417-1420.

AUW-HAEDRICH C., BOEHM N., WEISSENBERGER C. (2001) Signet ring carcinoma of the eccrine sweat gland in the eyelid, treated by radiotherapy alone. British Journal of Ophthalmology, 85, 112-113.

STOLL C., ALEMBIK Y., TCHOMAKOV D., MESSER J., HEID E., BOEHM N., CALVAS P., HOVNANIAN A. (2001) Severe hypernatremic dehydration in an infant with Netherton syndrome. Genetic Counseling, 12, 237-243.

Norbert B. Ghyselinck (CR1 CNRS commission 28, HDR, IGBMC UMR 7104, Département de génétique physiologique et de signalisation nucléaire. 1, rue Laurent Fries - BP 10142, F-67404 Illkirch CEDEX – Tel : 03 88 65 32 13, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

METZGER, D., INDRA, A., LI, M., CHAPELLIER, B., CALLÉJA, C., GHYSELINCK, N.B., CHAMBON, P. (2003) Targeted conditional somatic mutagenesis in the mouse: temporally-controlled knock-out of retinoid receptors in epidermal keratinocytes. Methods in Enzymology, 2003, 364, in press.

SCHNUTGEN, F., DOERFLINGER, N., CALLEJA, C., WENDLING, O., CHAMBON, P., GHYSELINCK, N.B. (2003) A directional strategy for monitoring Cre-mediated recombination at the cellular level in the mouse. Nature Biotechnology, 21, 562-565.

CHAPELLIER, B., MARK, M., MESSADDEQ, N., CALLÉJA, C., WAROT, X., BROCARD, J., GÉRARD, C., LI, M., METZGER, D., CHAMBON, P., GHYSELINCK, N.B. (2002) Physiological and retinoid-induced proliferations of basal keratinocytes are differently controlled. EMBO Journal, 21, 3402-3413.

Manuel Mark (CNU section 54 05, PU-PH, HDR, IGBMC UMR 7104, Département de génétique physiologique et de signalisation nucléaire 1, rue Laurent Fries BP 10142 67404 Illkirch CEDEX - Tel: 03 88 65 56 36. Fax: 03 88 65 32 01) Email : [email protected]

WEBER P., CAMMAS F., GERARD C., METZGER D., CHAMBON P., LOSSON R., MARK M. (2002) Germ cell expression of the transcriptional corepressor TIF1β gene is required for the maintenance of spermatogenesis in the mouse. Development, 129, 2329-2337.

DUPONT S., KRUST A., GANSMULLER A., DIERICH A., CHAMBON P., MARK M. (2000) Effect of single and compound knockouts of estrogen receptors � (ER�) and � (ER�) on mouse reproductive phenotypes. Development, 127, 4277-4291.

MARK, M., YOSHIDA-KOMIYA, H., GEHIN, M., LIAO, L., TSAI, M.J., O’MALLEY, B.W., CHAMBON, P., XU, J. (2004) Partially redundant functions of SRC-1 and TIF2 in postnatal survival and male reproduction. Proc Natl Acad Sci U S A., 101, 4453-4458.

Yves Rumpler (CNU section 5405, PU-PH, HDR. Biologie et médecine du développement et de la reproduction 11,rue Humann, 67085 STRASBOURG. EA-3428, Primates : variabilité et évolution des prosimiens à l'homme. Directeur : Pr Y. Rumpler, Tel : 03 90 24 31 86, Fax : 03 90 24 31 87. Email : [email protected] )

VEZULI A, RUMPLER Y. (2000) Lemur chromosomal study with simultaneous R-banding and chromosome painting. Chromosoma, 109, 214-218.

RUMPLER Y, PROSPER, HAUWY M, RABARIVOLA C, RAKOTOARISOA G, DUTRILLAUX B. (2002) Chromosomal evolution of the Hapalemur griseus subspecies (Malagasy Prosimian), including a new subspecies (H. g. ranomafanensis). Chromosome Research, 10, 145-153.

RUMPLER Y. (2002) Chromosomal and molecular primatology. In: Soligo C, Anzenberger G, Martin RD (eds). Primatology and Anthropology: Into the Third Millenium. Wiley, New York. Evolutionary Anthropology, 11S, 145-149.

Stéphane Viville (CNU section 54 05, MCU-PH, HDR, IGBMC UMR 7104 Département de génétique physiologique et de signalisation nucléaire 1, rue Laurent Fries, BP 10142, F-67404 Illkirch CEDEX, Tel : 03 88 62 82 00, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

MARTIANOV I., VIVILLE S., DAVIDSON I. (2002) RNA Polymerase II Transcription in Murine Cells Lacking the TATA Binding Protein. Science, 298, 1036-1039.


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MOUTOU C., GARDES N., VIVILLE S. (2002) Multiplex PCR combining deltaF508 mutation and intragenic microsatellites of the CFTR gene for pre-implantation genetic diagnosis (PGD) of cystic fibrosis. European Journal of Human Genetics, 10, 231-238.

MOUTOU C., RONGIÈRES C., BETTAHAR-LEBUGLE K., GARDES N., PHILIPPE C., VIVILLE S. (2003) Preimplantation genetic diagnosis for achondroplasia: genetics and gynaecological limits and difficulties. Human Reproduction, 18, 509-514.

Isabelle KOSCINSKI-CHARAU AHU. Laboratoire de Biologie de la Reproduction, CMCO. [email protected]. fax: 03 88 62 84 45. ● Cancérologie (Coordinateur : Pr J-P Bergerat)

Biologie moléculaire de la cellule : Dr J.M. Egly, DR1 INSERM Mécanismes de la Cancérogénèse : Pr J.P. Bergerat (Cancérologie, CNU section 4702) Biologie de la progression tumorale : Dr M.C. Rio, DR1 INSERM Recherche en Thérapeutique Anticancéreuse : Pr P. Dufour (Cancérologie, CNU section 47 02) Travaux pratiques M1 : Dr J.E. Kurtz (MCU-PH, HDR en cours, Cancérologie, CNU section 4702) Stages M2 : Pr J.P. Bergerat (Cancérologie, CNU section 4702), Dr M. Kedinger (DR1 INSERM U381 CSS 2)

Jean-Pierre Bergerat (PU-PH, HDR, Institut de Recherche contre les Cancers de l’Appareil

Digestif (IRCAD) 1, Place de l’Hôpital BP 426. 67091 Strasbourg Cedex. UPRES EA- 3430, « Altérations Génétiques des Cancers et Réponse Thérapeutique - Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie » Directeur : Pr J.P. Bergerat Tél. 03 88 11 90 61, Fax. 03 88 11 90 97. Email: [email protected]) CERALINE J, ERDMANN E, ERBS P, DESLANDRES-CRUCHANT M, JACQMIN D, DUCLOS B,

KLEIN-SOYER C, DUFOUR P, BERGERAT JP. (2003) A yeast-based functional assay for the detection of the mutant androgen receptor in prostate cancer. European Journal of Endocrinology, 148: 99-110.

CERALINE J, DEPLANQUE G, NOEL F, NATARAJAN-AME S, BERGERAT JP, KLEIN-SOYER C. (2003) Sensitivity to cisplatin treatment of human K1 thyroid carcinoma cell lines with altered p53 function. Cancer Chemotherapy and Pharmacology, 51, 91-95.

MAH-BECHEREL MC, CERALINE J, DEPLANQUE G, CHENARD MP, BERGERAT JP, CAZENAVE JP, KLEIN-SOYER C. (2002) Anti-angiogenic effects of the thienopyridine SR 25989 in vitro and in vivo in a murine pulmonary metastasis model. British Journal of Cancer, 86, 803-810.

Patrick Dufour (PU-PH, HDR, UPRES EA-3430, « Altérations Génétiques des Cancers et Réponse Thérapeutique - Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie » Directeur : Pr J.P. Bergerat Institut de Recherche contre les Cancers de l’Appareil Digestif (IRCAD) 1, Place de l’Hôpital BP 426. 67091 Strasbourg Cedex, Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97 Email : [email protected] )

FISCHER B, COELHO D, DUFOUR P, BERGERAT JP, DENIS JM, GUEULETTE J, BISCHOFF P. (2003) Caspase 8-mediated cleavage of the pro-apoptotic BCL-2 family member BID in p53-dependent apoptosis. Biochemistry & Biophysical Research Communications, 306, 516-522.

KURTZ JE, NEGRIER S, HUSSEINI F, LIMACHER JM, BOREL C, WAGNER JP, PREVOT G, BERGERAT JP, DUFOUR P. (2003) A phase II study of docetaxel-irinotecan combination in advanced pancreatic cancer. Hepatogastroenterology, 50, 567-570.

COELHO D, FISCHER B, HOLL V, DUFOUR P, DENIS JM, GUOULETTE J, BERGERAT JP, BISCHOFF P. (2002) Induction of apoptosis by high linear energy transfer radiation: role of p531. Canadian Journal of Physiology and Pharmacology, 80, 644-649.

Jean Marc Egly (DR1 INSERM CT1, HDR, IGBMC UMR 7104, Département Transcription 1, rue Laurent Fries BP 10142 67404 CEDEX – Illkirch. Tel : 03 88 65 34 47, Fax : 03 88 65 32 01 E-mail : [email protected] )

RIEDL T, HANAOKA F, EGLY JM. (2003) The comings and goings of nucleotide excision repair factors on damaged DNA. EMBO Journal, 22, 5293-5303.

FRIT P, KWON K, COIN F, AURIOL J, DUBAELE S, SALLES B, EGLY JM. (2002) Transcriptional activators stimulate DNA repair. Molecular Cell, 10, 1391-1401.

EGLY JM. (2001) TFIIH: from transcription to clinic; The 14th Datta Lecture. FEBS Letters, 2001, 498: 124-128.

Michèle Kedinger DR1 INSERM, HDR, Inserm U381 CSS 5 - Ontogenèse et pathologie du système

digestif : rôle du microenvironnement cellulaire et moléculaire - 3, Avenue Molière – 67200 Strasbourg. Directeur : M. Kédinger, Tél. 33 (0)3 88 27 77 27. Fax 33 (0)3 88 26 35 38.


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Email : [email protected] . DOMON-DELL C, SCHNEIDER A, MOUCADEL V, GUERIN E, GUENOT D, AGUILLON S,

DULUC I, MARTIN E, IOVANNA J, LAUNAY JF, DUCLOS B, CHENARD MP, MEYER C, OUDET P, KEDINGER M, GAUB MP, FREUND JN.(2003) Cdx1 homeobox gene during human colon cancer progression. Oncogene, 22, 5969-5977.

BONHOMME C, DULUC I, MARTIN E, CHAWENGSAKSOPHAK K, CHENARD MP, KEDINGER M, BECK F, FREUND JN, DOMON-DELL C. (2003) The Cdx2 homeobox gene has a tumour suppressor function in the distal colon in addition to a homeotic role during gut development. Gut, 52, 1465-1471.

VANIER MT, DECK P, STUTZMANN J, GENDRY P, ARNOLD C, DIRRIG-GROSCH S, KEDINGER M, LAUNAY JF. (2003) Expression and distribution of distinct variants of E-MAP-115 during proliferation and differentiation of human intestinal epithelial cells. Cell Motility and Cytoskeleton, 55, 221-231.

Jean-Emmanuel Kurtz (MCU PH, inscrit en HDR, UPRES EA-3430, « Altérations Génétiques des Cancers et Réponse Thérapeutique - Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie » Directeur : Pr J.P. Bergerat. Institut de Recherche contre les Cancers de l’Appareil Digestif (IRCAD) 1, Place de l’Hôpital BP 426. 67091 Strasbourg Cedex.

Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97. Email : [email protected] ) KURTZ JE, NEGRIER S, HUSSEINI F, LIMACHER JM, BOREL C, WAGNER JP, PREVOT G,

BERGERAT JP, DUFOUR P. (2003) A phase II study of docetaxel-irinotecan combination in advanced pancreatic cancer. Hepatogastroenterology, 50, 567-570.

KURTZ JE, DUFOUR P. (2002) Strategies for improving quality of life in older patients with metastatic breast cancer. Drugs Aging, 19, 605-622.

KURTZ JE, EXINGER F, ERBS P, JUND R. (2002) The URH1 uridine ribohydrolase of Saccharomyces cerevisiae. Current Genetics, 41, 132-141.

Marie Christine Rio (DR1 INSERM CSS 6, HDR, IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie Moléculaire 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 88 65 32 24, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

ANDARAWEWA KL, BOULAY A, MASSON R, MATHELIN C, STOLL I, TOMASETTO C, CHENARD MP, GINTZ M, BELLOCQ JP, RIO MC. (2003) Dual stromelysin-3 function during natural mouse mammary tumor virus-ras tumor progression. Cancer Research, 63, 5844-5849.

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● Génétique Humaine (Coordinatrice : Pr H. Dollfus, section CNU 47 04)

Génétique humaine : introduction générale: Pr JL Mandel (Génétique humaine, CNU section 47-04)

Pathologies chromosomiques, épigénétique: Dr E Flori (Génétique humaine , MCU-PH, HDR en cours CNU section 47 -04)

Pathologies du développement: Dr F Perrin-Schmitt (Biochimie et Biologie Moléculaire, MCU-PH, CNU section 44- 01)

Pathologies héréditaires du système nerveux et sensoriel: Pr M Koenig ( Génétique Humaine option moléculaire, section CNU 47-04)

Métabolisme : Pr H. Dollfus, section CNU 47 04 Stages pratiques et stages M2 : Dr D. Devys et Pr H. Dollfus, section CNU 47 04

Didier Devys (MCU-PH, HDR, CNU section 47 04, IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie

Moléculaire, 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email: [email protected] )

MERIENNE K, HELMLINGER D, PERKIN GR, DEVYS D, TROTTIER Y (2003). Polyglutamine expansion induces a protein-damaging stress connecting heat shock protein 70 to the JNK pathway. Journal of Biological Chemistry, 278, 16957-16967.

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18

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Hélène Dollfus (PU-PH, HDR, Fédération de Génétique de la Faculté de Médecine, 4, rue

Kirschleger, F-67000 Strasbourg - Hôpitaux Universitaires de Strasbourg. Tel : 03 88 12 81 53 – 03 90 24 33 41. Mails : [email protected] ; [email protected])

DOLLFUS H., BISWAS P., KUMARAMANICKAVEL G., STOETZELL C., QUILLET R., BISWAS J., LAJEUNIE E., RENIER D., PERRIN-SCHMITT F. (2002) Saethre-Chotzen syndrome : Notable intrafamilial variability in a large family with Q28X TWIST mutation. American Journal of Medical Genetics, 109, 218-225.

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Elisabeth Flori (MCU-PH, HDR en cours, CNU section 47 04. Fédération de Génétique de la Faculté

de Médecine, 4, rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. Email : [email protected] )

SCHLUTH C, DORAY B, GIRARD-LEMAIRE F., KOHLER M., LANGER B., GASSER B., LINDNER V., FLORI E. (2002) Prenatal sonographic diagnosis of the 49,XXXXY syndrome. Prenatal Diagnosis, 22, 1177-1180.

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Michel Koenig (PU-PH, HDR, CNU section 47 04, IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie

Moléculaire 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

H. PUCCIO, D. SIMON, M. COSSÉE, P. CRIQUI-FILIPE, F. TIZIANO, J. MELKI, C. HINDELANG, R. MATYAS, P. RUSTIN, M. KOENIG. (2001) Mouse models for Friedreich ataxia exhibit cardiomyopathy, sensory nerve defect and Fe-S enzyme deficiency followed by intramitochondrial iron deposits. Nature Genetics, 27, 181-186.

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Jean-Louis. Mandel (PU-PH, HDR, CNU section 47 04, IGBMC UMR 7104, Département de

Pathologie Moléculaire 1, rue Laurent Fries BP 10142 67404 Illkirch CEDEX . Tel: 03 88 65 34 12, Fax : 03 88 65 32 01. Email: [email protected] )

A. BUJ-BELLO, V. LAUGEL, N. MESSADDEQ, H. ZAHREDDINE, J. LAPORTE, J.F. PELLISSIER, J.L. MANDEL. (2002) The lipid phosphatase myotubularin is essential for skeletal muscle maintenance but not for myogenesis in mice. Proceedings of the National Academy of Sciences (USA), 99, 15060-15065.

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Fabienne Perrin-Schmitt (MCU-PH, HDR, IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie

Moléculaire, 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 90 24 33 36, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected]


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● Immunologie (Coordinateur : Pr S. Bahram) S. Bahram PU-PH, INSERM CSS 2 CRES « Laboratoire d’Immunogénétique Moléculaire Humaine »

Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. CNU section 47 03

Tel 33 3 90 24 39 92, Fax : 33 3 90 24 40 16, Email : [email protected] BAHRAM, S., GILFILLAN, S., KÜHN, L. C., MORET, R., SCHULZE, J. B., LEBEAU, A.,

SCHÜMANN, K. (1999) Experimental hemochromatosis due to MHC class I HFE deficiency : Immune status and iron metabolism. Proceedings of the. National Academy of Sciences (USA), 96, 13312-13317.

*AGUADO, B., BAHRAM, S., BECK, S., CAMPBELL, R. D., FORBES, S. A., GERAGHTY, D., GUILLAUDEUX, T., HOOD, L., HORTON, R., INOKO, H., JANER, M., JASONI, C., MADAN, A., MILNE, S., NEVILLE, M., OKA, A., QIN, S., RIBAS-DESPUIG, G., ROGERS, J., ROWEN, L., SHIINA, T, SPIES, T., TAMIYA, G., TASHIRO, H., TROWSDALE, J., VU, Q., WILLIAMS, L. & YAMAZAKI, M. (as the MHC sequencing consortium). (1999) Complete sequence and gene map of a human Major Histocompatibility Complex (MHC). Nature, 401, 921-923.

*auteurs dans l’ordre alphabétique. RADOSAVLJEVIC, M., CUILLERIER, B., WILSON, M., CLÉMENT, O., WICKER, S., GILFILLAN,

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Jean-Marie Freyssinet DR1 INSERM CSS 2, HDR, Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. Tel : 03 90 24 3985, Fax : 03 90 24 40 16. Email: [email protected]

GIDON-JEANGIRARD, C., HUGEL; B., HOLL, V., TOTI F, LAPLANCHE JL, MEYER D, FREYSSINET J. M. (1999) Annexin V delays apoptosis while exerting an external constraint preventing the release of CD4+ and PrPc+ membrane particles in a human T lymphocyte model. Journal of Immunology, 162, 5712-8.

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Daniel Hanau (DR, EFS, HDR – INSERM E 0345 CSS 2, « Biologie des Cellules Dendritiques Humaines», Etablissement Français du Sang-Alsace, Directeur : Daniel Hanau 10,

rue Spielmann-67065 Strasbourg Cedex. Tel : 03 88 21 25 25, Fax : 03 88 21 25 21 Email: [email protected])

SALAMERO, J., BAUSINGER, H., MOMMAAS, A. M., LIPSKER, D., PROAMER, F., CAZENAVE, J.-P., GOUD, B., DE LA SALLE, H., HANAU, D. (2001) CD1a molecules traffic through the early recycling endosomal pathway in human Langerhans cells. Journal of Investigative Dermatology, 116, 401-408.

MCDERMOTT, R., ZIYLAN, U., SPEHNER, D., BAUSINGER, H., LIPSKER, D., MOMMAAS, M., CAZENAVE, J.-P., RAPOSO, G., GOUD, B., DE LA SALLE, H., SALAMERO, J., HANAU, D. (2002) Birbeck granules are subdomains of the endosomal recycling compartment in human epidermal Langerhans cells, which form where Langerin accumulates. Molecular Biology of the Cell, 13, 317-335.

BAUSINGER, H., LIPSKER, D., ZIYLAN, U., MANIE, S., BRIAND, J.-P., CAZENAVE, J.-P., MULLER, S., HAEUW, J.-F., RAVANAT, C., DE LA SALLE, H., HANAU D. (2002) Endotoxin


20

free heat shock protein 70 fails to induce APC activation. European Journal of Immunology, 32, 3708-3713.

Anne-Sophie Korganow (MCU-PH, HDR CNU section 47 03, EMI INSERM 0022 CSS 2

« Laboratoire d’Immunopathologie ». Directeur : Thierry MARTIN . Service Médecine Interne A, Tel : 03 90 24 39 82, Fax : 03 90 24 39 78. Email : [email protected]

H. SCHISTER, T. MARTIN, L. MARCELLIN, J.C. GARAUD, J.L. PASQUALI, A.S. KORGANOW. (2002) Expansion of marginal zone B cells is not sufficient for the development of renal disease in NZBxNZW F1 mice. Lupus, 11, 277-286.

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Mirjana Radosavljevic (MCU-PH CNU section 47 03, HDR en 2004, CRES « Laboratoire

d’Immunogénétique Moléculaire Humaine » Directeur Pr S. Bahram. Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. Tel : 03 90 24 39 95, Fax : 33 3 90 24 40 16. Email : [email protected] )

RADOSAVLJEVIC, M., CUILLERIER, B., WILSON, M., CLÉMENT, O., WICKER, S., GILFILLAN, S., BECK, S., TROWSDALE, J., BAHRAM, S. (2002) A cluster of ten novel MHC class I-related genes on human chromosome 6q24.2-25.3. Genomics, 79, 114-123.

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Jean Sibilia (PU-PH, HDR, CNU section 5001, UPRES EA-3432, Laboratoire de Physiopathologie et

d'Antibiologie des Infections Nosocomiales et Emergentes. Directeur : Pr H. Monteil. Service de Rhumatologie de l’Hôpital de Hautepierre Avenue Molière - BP 49 67098 STRASBOURG CEDEX. Tel : 03 88 12 79 54. Email : [email protected] )

J. SIBILIA, F.X. LIMBACH. (2002) Reactive arthritis or chronic infectious arthritis? Annals of the Rheumatic Diseases, 61, 580-587.

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● Microbiologie Médicale - Coordinateurs : Pr F. Stoll-Keller, Dr G . Prévost Epidémiologie des maladies infectieuses : Dr Valérie Letscher-Bru (Parasitologie, CNU section

4502) Interactions moléculaires et cellulaires Hôte-Pathogène : Pr Ermanno Candolfi (Parasitologie,

CNU section 4502), Pr Yves Piémont (Bactériologie, CNU section 4501) Physiopathologie des maladies infectieuses : Dr Gilles Prévost (Bactériologie, CNU section 4501),

Pr Françoise Stoll-Keller (Virologie, CNU section 4501) Stages pratiques M1 : Dr Catherine Schuster (Virologie, INSERM, CS 1) Préparation et stages M2 : Dr Gilles Prévost (Bactériologie, CNU section 4501), Pr Françoise

Stoll-Keller (Virologie, CNU section 4501) Ermanno Candolfi (PU-PH, HDR, CNU section 4502, INSERM U 392, Immunopathologie des

infections opportunistes, Directeur : Dr J.P. Klein. Institut de Parasitologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 79. Email : [email protected] )

O. VILLARD, D. FILISETTI, F. ROCH-DERIES, J. GARWEG, J. FLAMENT, E. CANDOLFI. (2003) The diagnostic value of ELISA, Immunoblotting and PCR for toxoplasmic chorioretinitis. Journal of Clinical Microbiology, 41, 3537-3541.


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Valérie Letscher-Bru (MCU-PH, CNU section 4502, INSERM U 392, « Immunopathologie des

infections opportunistes » Directeur : Dr J.P. Klein. Institut de Parasitologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 79. Email : [email protected] )

V. LETSCHER-BRU, M.H. MEYER, A.C. GALOISY, J. WALLER, E. CANDOLFI. (2002) Prospective evaluation of the new chromogenic medium Candida ID, in comparison with Candiselect, for isolation of molds and isolation and presumptive identification of yeast species. Journal of Clinical Microbiology, 40, 1508-1510.

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Yves Piémont (PU-PH, HDR, CNU section 4501, EA-3432, Laboratoire de Physiopathologie et

d'Antibiologie des Infections Nosocomiales et Emergentes. Directeur : Pr H. Monteil. Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13. Email : [email protected] )

H.J. BOULOUIS, F. BARRAT, D. BERMOND, F. BERNEX, D. LE THIBAULT, R. HELLER, J.-J. FONTAINE, Y. PIEMONT, B. CHOMEL. (2001) Kinetics of Bartonella birtlesii infection in experimentally infected miceand pathogenic effect on their reproductive functions. Infection & Immunity, 69, 5313-5317.

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Gilles Prévost (MCU-PH, HDR, CNU section 4501, EA-3432, Laboratoire de Physiopathologie et

d'Antibiologie des Infections Nosocomiales et Emergentes. Directeur : Pr H. Monteil. Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13. Email : [email protected] )

V ; GUILLET, P. ROBLIN, S. WERNER, M. CORAIOLA, G MENESTRINA, H. MONTEIL, G. PREVOST, L. MOUREY. (2004) Crystal structure of leucotoxin S component. Journal of Biological Chemistry, 279, 41028-41037.

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Françoise Stoll-Keller (PU-PH, HDR, CNU section 4501, INSERM exU544, UPRES EA-3770.

Pathogénie des infections virales persisitantes, Directeur : Pr F. Stoll-Keller. Demande d’EA en cours. Institut de Virologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 16, Fax : 03 90 24 37 10. Email : [email protected] )

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Catherine Schuster (CR1 INSERM commission n°1, HDR, INSERM exU544, UPRES EA-3770.


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● Enseignements partagés obligatoires avec la Spécialité Biologie Moléculaire et Structurale

Transcription et traduction : Pr Philippe CARBON, PR, Section CNU 64, Unité de Recherche : UPR 9002 CNRS , IBMC, 15 rue

Descartes F-67084 Strasbourg cedex. Tél. : 03 88 41 70 64. Fax : 03 88 60 22 18. Email : [email protected]

MYSLINSKI, E., AME, J. C., KROL, A., CARBON, P. (2001). An unusually compact external promoter for RNA polymerase III transcription of the human H1RNA gene. Nucleic Acids Res. 29, 2502-2509.

SCHAUB, M., KROL, A., CARBON, P. (1999) Flexible zinc finger requirement for binding of the transcriptional activator Staf to U6 snRNA and tRNASec promoters. J. Biol. Chem. 274, 24241-24249.

SCHAUB, M., MYSLINSKI, E., KROL, A., CARBON P. (1999) Maximization of tRNASec and U6 snRNA transcriptional activation achieved by flexible utilization of a Staf zinc finger. J. Biol. Chem. 274, 25042-25050.

Enseignements partagés avec la Spécialité Biologie Cellulaire Intégrée

● Stratégie d’étude de la cellule : Pr Anne-Catherine Schmitt , PR section CNU 65 (Institut de Biologie Moléculaire des Plantes

(IBMP), CNRS-UPR2357 - Université Louis Pasteur, 12 rue du General Zimmer, F-67084 -Cedex, Strasbourg, France. Tél : 03 88 41 71 57 , Fax : 03 88 41 71 57.

Email : [email protected] ) SCHMIT, A.C., CANADAY, J., HERZOG, E., CAMPAGNE, S., SELTZER, V., EVRARD, J.L.,

LAMBERT, A.M. (2003). Molecular mechanims of microtubule nucleation in synchronized tobacco BY-2 cells. In "Tobacco BY-2 cell line as a model plant cell and its application to biotechnology" T. Nagata, S Hasezawa, D. Inzé eds., Springer Verlag, Berlin, Heidelberg, New-York, Tokyo, sous presse.

ERHARDT, M., STOPPIN-MELLET, V., CAMPAGNE, S., CANADAY, J., MUTTERER, J., FABIAN, T., SAUTER, M., MULLER, T., LAMBERT, A.M., SCHMIT, A.C. (2002) The plant Spc98p homologue colocalizes with �tubulin at microtubule nucleation sites and is required for microtubule nucleation. J. Cell Sci. 115, 2423-31.

SCHMIT, A.C. (2002) Acentrosomal microtubule nucleation in higher plants. Int. Rev. Cytol. 220, 257-89.

● Biologie du Développement : Pr Jean Luc Imler (CNU 65, CNRS UPR9022, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 rue

René Descartes, 67000 Strasbourg, France. Tel.: + 33 388 41 70 36 Fax : 03 88 41 70 36 Email : JL.Imler@ibmc)

WEBER, A. N., TAUSZIG-DELAMASURE, S., HOFFMANN, J.A., LELIEVRE, E., GASCAN, H., MORSE, M.A., IMLER, J.L., GAY, N.J. (2003) Binding of the Drosophila cytokine Spätzle to Toll is direct and establishes signaling. Nature Immunol. 4, 794-800.


23

TAUSZIG, S., BILAK, H., CAPOVILLA, M., HOFFMANN, J.A., IMLER, J.L. (2002) Drosophila MyD88 is required for the response to fungal and Gram-positive bacterial infections. Nature Immunol. 3, 91-97.

TZOU, P., OHRESSER, S., FERRANDON, D., CAPOVILLA, M., REICHHART, J.M., LEMAITRE, B., HOFFMANN, J.A., IMLER, J.L. (2000) Tissue-specific inducible expression of antimicrobial peptide genes in Drosophila surface epithelia. Immunity 13, 737-748.

● Relations avec les autres spécialités Pr Jean Luc Imler (UPR , CNU section 65), voir ci-dessus

Pr Dominique Wachsmann (Immunologie, CNU section 41). Faculté de Pharmacie, 74, Route du Rhin. F-67401 ILLKIRCH CEDEX. INSERM U 392, Immunopathologie des infections opportunistes, Directeur : Dr J.P. Klein Tel: 03 90 24 41 52, Fax : 03 90 24 43 08. Email : [email protected] L. NEFF, M. ZEISEL, J. SIBILIA, M. SCHOLLER-GUINARD, J.P. KLEIN, D. WACHSMANN.

(2001) NF-KB and the MAP kinases/AP-1 pathways are both involved in IL-6 and IL-8 expression in fibroblast-like synoviocytes stimulated by protein I/II, a modulin from oral streptococci. Cellular Microbiology, 3, 703-712.

L. NEFF, M. ZEISEL, V. DRUET, K. TAKEDA, J.P. KLEIN, J. SIBILIA, D. WACHSMANN. (2003) ERK1/2 and JNKs depenndent synthesis of IL-6 and IL-8 by fibroblast-like synoviocytes stimulated with protein I/II, a modulin from oral streptococci, requires FAK. Journal of Biological Chemistry, 278, 27721-27728.

M. ZEISEL, L. NEFF, J. RANDLE, J.P. KLEIN, J. SIBILIA, D. WACHSMANN. (2003) Impaired release of IL-18 from fibroblast-like synoviocytes activated with protein I/II, a PAMP from oral streptococci, is due to defective translation of IL-18. Cellular Microbiology, 2003, 6, 593-598.

*Les noms des différents membres de la Commission pédagogique sont également surlignés en Annexe I Autres intervenants dans le semestre : (Indiquer les noms, prénoms, qualité, domaine d’expertise, tél, fax, mail) L’ensemble des cours magistraux dans chaque UE a été attribué à plusieurs Collègues en fonction de leur domaine d’excellence et de leurs affinité pour les différents thèmes. D’autre part, le fait des mises en situation de recherche des étudiants au travers des stages pratiques en laboratoire pour chacun des modules à la carte de physiopathologie vont amener un grand nombre de collègues à intervenir dans la formation pédagogique. L’ensemble des intervenants potentiels est cité en annexe 1 de même que trois de leurs publications récentes les plus significatives. Dans cette liste, les membres de la Commission Pédagogique de la spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire sont mis en évidence par un surlignage.


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Fiche U.E. INTITULE de l’UE

Module Microbiologie Médicale (MIM) Niveau requis pour l’inscription : licence Biologie Cellulaire et Physiologie ou de Biochimie et Biologie Moléculaire, DCEM1, 3èmes années de Dentaire et de Pharmacie. Enseignement en M1, 2nd semestre S2

RESPONSABLES : Nom, prénom : Prévost Gilles Stoll-Keller Françoise Discipline : Bactériologie CNU section 4501 Virologie CNU section 4501 Adresse ; Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, Institut de Virologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg Tel : 03 90 24 37 57. 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 16, Fax : 03 88 25 11 13. Email : [email protected] Fax : 03 90 24 37 23. Email : [email protected]

CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :

Matières enseignées CM CI TD TPTravail perso

étudiant

Coeff internes CT* CC*

Epidémiologie des maladies infectieuses 9 Interactions moléculaires et cellulaires Hôte-Pathogène 23 Physiopathologie des maladies infectieuses 19 Total : 53 100 2 Ecrit Stage pratique M1 en laboratoire : 24 places au total 40 40 1 Rapport

Dans chacune des trois unités de cours, les enseignants de Bactériologie, Parasitologie et Virologie et d’autres de la Faculté de Pharmacie donneront des cours sur 2 ou 3 thématiques correspondant à ces unités de cours. Les thèmes sont choisis pour développer des sujets caractéristiques et permettant de recouvrir les différents modes d’évolution ou d’invasion ou de virulence des micro-organismes (ex : Un modèle de bactérie toxinogène : Corynebacterium diphtheriae, un modèle de bactérie invasive : Listeria monocytogenes, un modèle bactérien de pathogénie mixte : Staphylococcus aureus. Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle terminal CT* = 66% ; contrôle continu CC* = 33 %

COMPETENCES A ACQUERIR : Connaître les réservoirs d’agents infectieux et leur mode de transmission, leur évolution génétique. Connaître les mécanismes cellulaires et moléculaires essentiels à la virulence et à la diversion de la réponse immune. Au travers de modèles indépendants, découvrir de manière plus approfondie la physiopathologie de certaines infections et envisager les problèmes thérapeutiques. Durant les cours magistraux, des références seront développées quant aux processus cellulaires et moléculaires et fondamentaux impliqués et aux technologies mises en place pour la découvertes des mécanismes et la lutte anti-infectieuse. Des stages pratiques seront proposés en laboratoire de recherche. Ces stages permettront une authentique mise en situation des étudiants permettant d’appréhender l’équipement et la stratégie de recherche.

TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM : 53 h présentielles TP : 40 h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 230 h Crédits ECTS : 9 (Attention il s’agit d’un module à la carte : les étudiants scientifiques devront valider 3 des 5 modules proposés, les étudiants MPD devront n’en valider que 2. Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs :

-/- MUTUALISATION : UE obligatoire à la carte pour le master : Mention Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et

Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters : OUI NON

Peut constituer une UE libre : OUI NON


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Moléculaire Spécialités Biologie Cellulaire Intégrée, Biologie des Micro-organismes

A l’exclusion des TP en laboratoire


Module Biologie et Médecine de la Reproduction (BMR) Niveau requis pour l’inscription : licence Biologie Cellulaire et Physiologie ou de Biochimie et Biologie Moléculaire, DCEM1, 3èmes années de Dentaire et de Pharmacie. Enseignement en M1, 2nd semestre S2

RESPONSABLE : Nom, prénom : Mark Manuel Warter Stephanie Discipline : BDR CNU section 5405 BDR CNU section 5405 Adresse ;IGBMC, 1, rue Laurent Fries, Institut d’Embryologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg,

F-67404 Illkirch. Tel : 03 88 65 56 36. 11 rue Humann , F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 31 84 , Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] Fax 03 90 24 31 87. Email :[email protected] CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :

Matières enseignées CM CI TD TP Travail perso

étudiant

Coeff matière CT* CC*

Ontogenèse des gonades et du tractus génital. 8 Ecrit Implantation et placentation 6 Techniques en biologie de la reproduction. 12 Gamétogenèse, fécondation, et pathologies de la fertilité 14 Contrôle hormonal de la reproduction 15 Total 55 100 2 Stage pratique M1 en laboratoire : 23 places au total 40 40 1 X Dans chacun des 5 cycles de cours, les enseignants de Biologie et Médecine du Développement et de la Reproduction, Biologie Moléculaire et Cellulaire, Histologie et sciences cliniques (Endocrinologie, Gynécologie, Pédiatrie) apporteront aux étudiants les connaissances les plus actuelles dans leurs domaines d‘expertise. Le programme, qui s’appuie notamment (1) sur des travaux de recherches menés a l’IGBMC sur les fonctions des récepteurs hormonaux dans des modèles de souris mutées et (2) sur l’expérience du terrain des biologistes du service hospitalier, couvre l’ensemble des problématiques actuelles en biologie de la reproduction, des voies de signalisation moléculaires à la physiopathologie. Part du contrôle continu et du contrôle terminal :


COMPETENCES A ACQUERIR : Connaître les cascades moléculaires impliquées dans la différenciation sexuelle, les mécanismes cellulaires et moléculaires mis en œuvre dans l’implantation, les échanges fœto-maternels, le contrôle hormonal et paracrine de la gamétogenèse et la reconnaissance inter-gamétique Au travers de modèles indépendants, découvrir de manière plus approfondie la physiopathologie des troubles de la fertilité et de la différenciation sexuelle. Durant les cours magistraux, des références seront développées quant aux processus cellulaires et moléculaires fondamentaux impliqués et aux technologies. Des stages pratiques seront proposés en laboratoire de recherche, 23 places sont disponibles. Ces stages permettront une authentique mise en situation des étudiants. TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM : 55 h présentielles TP : 40 h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 235 h Crédits ECTS : 9 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs :

MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et




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Moléculaire


Module de CANCEROLOGIE (CAN) Niveau requis pour l’inscription : licence Biologie Cellulaire et Physiologie ou de Biochimie et Biologie Moléculaire, DCEM1, 3èmes années de Dentaire et de Pharmacie. Enseignement en M1, 1er semestre S1 ou S3

RESPONSABLE : Nom, prénom :Pr Jean-Pierre Bergerat Discipline : Cancérologie Adresse : Département d’Hématologie et d’Oncologie, Hôpital de Hautepierre, 1 Av Molière 67098 Strasbourg Institut de Recherche contre les Cancers de l’Appareil Digestif (IRCAD), 1, Place de l’Hôpital BP 426. 67091 Strasbourg Cedex. UPRES EA-3430, « Altérations Génétiques des Cancers et Réponse Thérapeutique - Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie » Tél. 03 88 11 90 61 Fax. 03 88 11 90 97. Email: [email protected]) CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :

Matières enseignées CM CI TD TP Travail perso étudiant


Biologie moléculaire de la cellule 14h Mécanismes de la cancérogenèse 13h Biologie de la progression tumorale 15h Recherche en thérapeutique anti-cancéreuse 12h Total 54h 100 2 Ecrit Stage pratique : 16 places au total 40 36 1 Rapport Part du contrôle continu et du contrôle terminal :


COMPETENCES A ACQUERIR : Connaître les bases de la physiologie de la cellule et ses principales composantes gouvernant la prolifération cellulaire et son contrôle. Connaître les facteurs et les mécanismes de dérégulation de la croissance cellulaire, la nature et le rôle des gènes impliqués dans l’apparition du phénotype cancéreux. Connaître les mécanismes moléculaires de la progression tumorale et leurs conséquences. Comprendre la relation entre ces différents éléments et les développements récents de la recherche anticancéreuse.

TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM 54h présentielles TP 40h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 230h Crédits ECTS : 9 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Mention Biologie et Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire




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Module Immunologie (IMM) Niveau requis pour inscription : Sciences : licence biologie cellulaire et physiologie ou biochimie et biologie moléculaire, Médecine : PCEM2/DCEM1, Dentaire ou pharmacie : 3ème année. Enseignement dispensé en M1 - second semestre S2.

RESPONSABLE : Nom, prénom : BAHRAM, Seiamak (PU-PH) et RADOSAVLJEVIC, Mirjana (MCU-PH). Discipline : Immunologie CNU4703 Adresse : Laboratoire d'Immunogénétique Moléculaire Humaine, INSERM-CReS, Centre de Recherche d'Immunologie et d'Hématologie, 4 rue Kirschleger, 67085 Strasbourg Cedex, France. Téléphone 0388.140.269 ; Fax :0390.244.016 Emails :[email protected]; [email protected]




Bases cellulaires et moléculaires de l’immunité 20 Ecrit Physiopathologie du système immunitaire 20 Ecrit Méthodes d’exploration du système immunitaire 10 Oral 100 2 Stage pratique M1S2 : 25 places 50 20 20 40 1 X Part du contrôle continu et du contrôle terminal :


COMPETENCES A ACQUERIR : Connaître les bases cellulaires et moléculaires du système immunitaire et par voie de conséquence savoir disséquer la réponse immune normale et pathologique chez l’homme. Cela comprendra en particulier la compréhension des mécanismes intimes des déficits immunitaires innés et acquis chez l’homme, l’appréciation du rôle du système immunitaire dans la défense anti-tumorale, dans la réponse anti-infectieuse, dans les réactions allergiques et les processus auto-immuns. Enfin, l’étudiant maîtrisera les bases immunologiques du rejet et acceptation du greffon et possèdera des notions quant à la thérapeutique à visée immunologique. En un mot, l’esprit de l’enseignement repose fortement sur l’acquisition d’une connaissance/démarche translationnelle allant « de la paillasse à la clinique ». TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM : 50 h présentielles TD : 20 h présentielles TP : 20 h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 230 h Crédits ECTS : 9 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Biologie – Santé Spécialités Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire et Biologie Cellulaire Intégrée


Peut constituer une UE libre : OUI NON A l’exclusion des TP en laboratoire


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Module Génétique Humaine (GHU) Niveau requis pour l’inscription : licence Biologie Cellulaire et Physiologie ou de Biochimie et Biologie Moléculaire, DCEM1, 3èmes années de Dentaire et de Pharmacie. Enseignement en M1, 1er semestre S1

RESPONSABLE : Nom, prénom : Dollfus Hélène Discipline : CNU 4704 Génétique option clinique Adresse : Service de génétique médicale Hôpital de Hautepierre, Avenue Molière 67098 Strasbourg. Tel : 03 88 12 81 53 – 03 90 24 33 41. Emails : [email protected] ; [email protected]



étudiant


Génétique humaine (introduction générale, banque de données, diagnostic moléculaire, aspects éthiques) 11h Cytogénétique moléculaire et épigénétique 14h Pathologies héréditaires (développement, système nervuex central, métabolisme) 25h TOTAL 50h 100 2 Ecrit Stage pratique Génétique Humaine M1: 20 places au total 40h 1 Rapport Part du contrôle continu et du contrôle terminal :


COMPETENCES A ACQUERIR : Connaître les approches cliniques, cytogénétiques et moléculaires concernant l'étude physiopathogénique des principaux groupes de pathologies étudiées en génétique humaine: 1° pathologies liées au développement 2° pathologies du système nerveux central etsensoriel 3° pathologies chromosomiques 4° pathologies du métabolisme. Les principales banques de données utilisables en génétique humaine seront présentées. Les stratégies d'études moléculaires et cytogénétiques de ces affections seront détaillées ainsi que les principaux mécanismes mutationnels et épigénétiques. Les applications de ces données au diagnostic prénatal, pré-implantatoire et aux abords thérapeutiques seront abordés. Les aspects légaux et éthiques concernant l'étude des maladies génétiques seront aussi traités. TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM : 50 h présentielles TP/TD : 40 h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 230 h Crédits ECTS : 9 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire


Peut constituer une UE libre : OUI NON A l’exclusion des TP en laboratoire


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Fiche U.E.

INTITULE de l’UE

STRATEGIE DE RECHERCHE SUR LA CELLULE (SRC)

RESPONSABLE : Nom, prénom : SCHMIT, Anne -Catherine Discipline : Biologie Cellulaire Adresse : UPR2357 du CNRS, IBMP ; Tél : 03 88 41 71 57 E-mail : [email protected] SEMESTRE (M1, M2, M3, M4) EFFECTIF PREVU M1, M3 >80

CONTENU DES ENSEIGNEMENTS : Cours magistraux : Illustration des grandes stratégies d’investigation employées dans l’étude de la signalisation cellulaire, du trafic intracellulaire, de la polarité cellulaire, du cycle cellulaire et des transports nucléo-cytoplasmiques. Ceci comprend la caractérisation spatio-temporelle dynamique des acteurs du processus étudié et les approches fonctionnelles de leur activité, par toutes les méthodes intégrées d’investigation (biochimie, génétique, biologie moléculaire et cellulaire in vitro et in vivo) TP/TD : En s’appuyant sur 5 modèles d’études (levures, cellules végétales, drosophiles, cellules nerveuses et fibroblastes) illustration de différentes approches expérimentales utilisées dans la caractérisation (1) de mécanismes biologiques tels le chimiotactisme, la cicatrisasion, la polarité développementale et (2) des voies de contrôle de l’activité cellulaire (checkpoints G1/S/G2 et M) Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle continu (1/4) ; contrôle terminal (3/4)

COMPETENCES A ACQUERIR :

Objectifs cognitifs : • Acquérir une démarche scientifique nécessaire à l’exploration d’une problématique de biologie intégrée Objectifs techniques :

• Savoir pratiquer des techniques de biologie cellulaire, moléculaire, biochimie et d’imagerie Objectifs méthodologiques :

Savoir réaliser une synthèse et proposer des approches expérimentales en réponse à une problématique scientifique

UE NECESSAIRE(S) POUR L'ADMISSION

TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM : 15 h présentielles TD : 10 h présentielles TP : 10 h présentielles Autre : (spécifier, exposés, visites, ...) heures présentielles

Charge horaire totale pour l’étudiant : 75 Crédits ECTS : 3

Enseignements assurés par des intervenants extérieurs : MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Biol Cell Intégrée Biol Mol Struct Physio-pathologie cell et Mol Imagerie Biologique

Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters : OUI: Sciences du végétal Chimie du vivant

Peut constituer une UE libre : Non


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Fiche U.E. INTITULE DE L’U.E. Histologie appliquée (HIA)°

RESPONSABLE :

Nom, prénom : Boehm Nelly Discipline : Histologie et Cytologie CNU : 42-02 Adresse : Institut d’Histologie Faculté de Médecine, 11 rue Humann, 67085 Strasbourg Cedex INSERM U666 Tel 03 90 24 32 15 Fax 03 90 24 32 11 E-mail : [email protected]

SEMESTRE (M1, M2, M3, M4) EFFECTIF PREVU

M1

30-40 CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :


étudiant


Interprétation de lames et de photos de cellules et tissus normaux de mammifères 10 30 + +

* CT : contrôle terminal, CC contrôle continu Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle continu 50% contrôle terminal 50%.

COMPETENCES A ACQUERIR :

Avoir une connaissance approfondie de l’organisation normale des cellules et des tissus fondamentaux de mammifères et particulièrement des modèles animaux les plus couramment utilisés ; savoir les reconnaître et les décrire au microscope (optique et électronique) ; connaître les variations moléculaires, fonctionnelles et morphologiques des cellules ; connaître les techniques plus particulièrement adaptées aux différents tissus et phénotypes cellulaires ; cet enseignement sous forme de TD/TP utilisera essentiellement l’analyse de lames au microscope et l’étude de photos de microscopie électronique sur la base d’un CD d’illustrations histologiques.

UE NECESSAIRE(S) POUR L’ADMISSION /

TYPE D’ENSEIGNEMENT :

TP/TD : 40h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 75 h

ECTS : 3

Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : /

MUTUALISATION :

UE obligatoire pour le master : Vie et santé Spécialité : Physiopathologie cellulaire et moléculaire

Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters : OUI

Peut constituer une UE libre : OUI selon le nombre de places disponibles


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Acquisition et analyse de résultats, banques de données, logiciels (ABL) Travail d’Etudes et de Recherche I

Niveau requis pour l’inscription : licence Biologie Cellulaire et Physiologie ou de Biochimie et Biologie Moléculaire, DCEM1, 3èmes années de Dentaire et de Pharmacie. Enseignement en M1, 1er semestre

RESPONSABLE : Nom, prénom : Prévost Gilles Discipline : Bactériologie CNU section 4501 Adresse ; Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg Tel : 03 90 24 37 57 Fax : 03 88 25 11 13.. Email : [email protected] …et P. Riegel,


Matières enseignées TD Temps de travail Coeff interne CC* Acquisition, mise en forme, analyse de résultats 15 h 22 h 0,5 Exercices Banque de données et logiciels 18 h 18 h 0,5 Exercices Total 33 h 42 h 1

Exploitation de données numériques, d’évaluations de cytométrie en flux, mises en forme des courbes moyennes, signification des variations dans les séries de données (Sigma Plot, etc...) Edition, analyse de séquences nucléotidiques, alignements et comparaisons de séquences, analyses philogénétiques,Séquences peptidiques, analyses, modifications exploitations de structures tridimensionnelles (Expasy, Artemis, EMBL-EBI, WebLab Viewer). Ces enseignements bénéficieront de l’accès à une salle informatique de la Faculté de Médecine (Forum) équipée de 35 postes en réseau. Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle continu = 100 %

COMPETENCES A ACQUERIR : Par des exemples précis pouvant être issus de l’expérience des laboratoires ou de publications, il s’agit d’une sensibilisation à différentes approches mises en oeuvre pour l’acquisition de données, leur mise en forme, leur présentation et leur signification. Par ailleurs, les étudiants auront l’opportunité d’appréhender la pratique de plusieurs logiciels d’analyse accessibles en ligne (analyse et comparaison de séquences, analyse génétique d’allèles, prévisions de mutations et analyses fonctionnelles, analyse de données numériques). Les exemples développés pourront intéresser chacune des cinq disciplines modulaires. TYPE D’ENSEIGNEMENT : TD : 33 h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 75 Heures Crédits ECTS : 3 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Mention Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire

Peut constituer une UE optionnelle pour d’autres masters : NON

Peut constituer une UE libre : NON


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Fiches des UE Optionnelles

de la Spécialité

Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire


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INTITULÉ de l'Unité d'Enseignement Fiche U.E. INTITULE de l’UE

TRANSCRIPTION ET TRADUCTION DE L’INFORMATION GENETIQUE (TTI)

RESPONSABLE : Nom, Prénom : CARBON Philippe Discipline : Biochimie, Biologie Moléculaire Adresse : UPR 9002 du CNRS, IBMC 15, Rue René Descartes 67084 STRASBOURG Cédex Tél. : 03 88 41 70 64, Fax : 03 88 60 22 18, E-mail : [email protected] CONTENU DES ENSEIGNEMENTS : La transcription de l’information génétique chez les procaryotes. L’ARN polymérase eubactérienne. L’initiation, l’élongation, la terminaison et l’antiterminaison de la transcription. Le contrôle de l’expression des gènes : les opérons lactose, tryptophane et l’atténuation. Les stratégies de régulation de l’expression des gènes chez le phage lambda. La transcription de l’information génétique chez les eucaryotes. Chromosome, chromatine et nucléosome. Les ARN polymérases. Les éléments promoteurs et les éléments de contrôle des gènes. Les facteurs généraux de la transcription. Les activateurs, les coactivateurs, les répresseurs et les corépresseurs de la transcription. La structure chromatinienne des régions transcrites. Le remodelage de la chromatine. Acétylation de la chromatine et activation des gènes. Le code des histones. Méthylation de l’ADN et répression de l’expression des gènes. Les régions de contrôle des locus, de liaison à la matrice et les éléments frontières. La traduction de l’information génétique chez les procaryotes et les eucaryotes. Les étapes de la traduction de l’information génétique, la régulation et les mécanismes d’inhibition (antibiotiques, toxines, …) de la traduction. Biosynthèse, maturation et transport des ARN impliqués dans la traduction (ARN messagers, de transfert, ribosomiques, régulateurs,…). Les ARN apparentés à ces ARN (ARN génomique de rétrovirus, pseudo-ARNt….) ou impliqués dans d’autres fonctions (gene silencing, dégradation,….). Etude de la relation structure–fonction de ces ARN. Dysfonctionnements des processus post-transcriptionnels à l’origine de diverses pathologies. Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle terminal 100% COMPETENCES A ACQUERIR : Les étudiants devront acquérir une bonne maîtrise dans la connaissance des mécanismes qui gouvernent l’expression des gènes chez les procaryotes et les eucaryotes et qui la régulent. Seront également acquises des connaissances nécessaires à la compréhension de la structure, de la dynamique, de la fonction des biomolécules (acides nucléiques, protéines) et des mécanismes de reconnaissance entre les macromolécules et leurs ligands. Des connaissances préalables d’ingénierie des biomolécules, de biochimie métabolique, d’enzymologie et d’exploitation de la structure tridimensionnelle des biomolécules seront des atouts indispensables à la compréhension de ce programme. TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM : 56 h présentielles TD : h présentielles TP : h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 168 h Crédits ECTS : 6 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs :

MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Biologie Moléculaire et Structurale Sciences du Végétal Biologie Cellulaire Intégrée Biochimie Structurale Génomique Structurale et Informatique


Peut constituer une UE libre : OUI


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INTITULÉ de l'Unité d'Enseignement Biologie du développement animal (BDA) Origine de l'UE : reconduction d'une ancienne UE (Biologie du Développement animal NEBDA-41) RESPONSABLE Nom, Prénom : Jean-Marc Reichhart Discipline : Biologie Adresse si en dehors de la Faculté Sciences de la Vie Autres Enseignants : Vincent Leclerc, Julien Royet, Michel Labouesse, Christine et Bernard Thisse SEMESTRE (M1, M2, M3, M4) EFFECTIF PREVU M1 30

PROGRAMME (contenu) Patrons du développement embryonnaire : segmentation, gastrulation, mise en place des organes pour différmodèles. Le contrôle du cycle cellulaire. Les oncogènes. L’apoptose. La différenciation cellulaire : équivalencgénome, expression génique différentielle et niveaux de contrôle. La détermination cellulaire : détermincytoplasmiques (la lignée germinale & la mise en place des axes chez la drosophile). Les interactions cellulproches (inductions chez le Xénope et poisson zèbre) et à distance (le développement post-embryonnaire etcontrôle). COMPETENCES A ACQUERIR Connaissances des différents types de développement embryonnaire, c’est une unité de défloration intellectuelle vis à vis des principes de base de la morphogenèse. Formation à l’analyse critique et à l’évaluation de données scientifiques. Manipulation des instruments d’observation les plus courants. Connaissance des principaux modèles et voies de signalisation. UE NECESSAIRE(S) POUR L’ADMISSION (seulement pour les UE de M2 et M3) néant TYPE d'ENSEIGNEMENT CM : 39 h présentielles TD : 12 h présentielles TP : 24 h présentielles Autre : (spécifier, exposés, visites, ...) heures présentielles

Heures étudiants : 75 Crédits ECTS : 6

MUTUALISATION UE obligatoire pour Master : Biologie cellulaire Intégrative

Peut constituer une UE optionnelle pour d'autres

Master Oui

Peut constituer une UE libre Oui


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INTITULÉ de l'Unité d'Enseignement Physiologie et Physiopathologie Origine de l'UE : nouvelle, reconduction d'une ancienne UE (RMM de l’IUP2) RESPONSABLE Nom, Prénom :PIQUARD François Discipline : MCU-PH- physiologie Médecine Adresse si en dehors de la Faculté Sciences de la Vie : Faculté de Médecine Autres Enseignants : OUDART Hugues : MCU- fac des sciences de la Vie VAN OVERLOOP Bruno : MCU, Faculté de pharmacie SEMESTRE (M1, M2, M3, M4) EFFECTIF PREVU M1 40 PROGRAMME (contenu) Fonctions endocrines et paracrines cardiaques et vasculaires Fonctions endocrines cardiaques: les peptides natriurétiques,Implication dans la régulation hydrosodée,Mécanismes de la perte d'efficacité de l'ANP au cours de l'insuffisance cardiaque,Résistance à l'insuline dans les pathologies cardio-respiratoires. La vasomotricité dépendante du NO ou de l'endothéline: implications dans la régulation de la pression artérielle et de l'hypertension artérielle pulmonaire.Les adaptations cardio-respiratoires et pulmonaires à l'effort. Les facteurs cardio-respiratoires limitants à l'exercice musculaire.Le réentrainement à l'effort: un modèle de physiologie intégrée. Régulations énergétiques et physiopathologie de l’obésité Réserves énergétiques / composition corporelle. Physiologie du tissu adipeux.Contrôle de la prise alimentaire .Régulation de la balance énergétique / obésité. Physiologie et Physiopathologie de la reproduction Le système reproducteur mâle, Le système reproducteur femelle : cycle menstruel ; la fonction ovarienne et son contrôle ; les troubles de la fonction ovarienne. La puberté et la ménopause : les pubertés précoces et les retards pubertaires la ménopause. Grossesse : les modifications physiologiques de la grossesse ; la placentation : échanges et endocrinologie ; la lactation. Les premières étapes du développement embryonnaire Enseignements dirigés : Procréations médicales assistées ; Ménopause : prise en charge et évolution ;Grossesse et médicaments COMPETENCES A ACQUERIR A l’issue de cet enseignement, l’étudiant devra savoir faire le lien entre la physiologie cellulaire et la pathologie dans une problématique de physiologie intégrée. UE NECESSAIRE(S) POUR L’ADMISSION (seulement pour les UE de M2 et M3) TYPE d'ENSEIGNEMENT CM : 39 h présentielles TD : 21 h présentielles TP : h présentielles Autre : (spécifier, exposés, visites, ...) heures présentielles


MUTUALISATION UE obligatoire pour Master : .Pharmacologie (R+P)

Peut constituer une UE optionnelle pour d'autres Master Oui Non

Peut constituer une UE libre Oui Non


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INTITULÉ de l'Unité d'Enseignement PATHOGENESE VIRALE ET LUTTE ANTI-VIRALE (PVL) Nouvelle UE Code : PVL RESPONSABLE Nom, Prénom : Mario KELLER Discipline : Virologie Adresse si en dehors de la Faculté Sciences de la Vie Autres Enseignants : Salah BOUZOUBAA, David GILMER, Françoise STOLL-KELLER et Evelyne SCHVOERER SEMESTRE (M1, M2, M3, M4) EFFECTIF PREVU M3 30 étudiants PROGRAMME (contenu) - Grands syndromes viraux - Transmission des virus des animaux et de l’homme - Infections virales à syndrome respiratoire - Infections virales digestives - Infections virales du système nerveux central - Les hépatites virales - Oncogenèse virale - Syndrome d’immunodéficience - Fièvres hémorragiques - Infections du fœtus et maladies virales des enfants - Maladies à prions - Système interféron - Chimiothérapie (analogues nucléosidiques et non nucléosidiques, inhibiteurs d’enzymes, ribozyme et RNAi) - Vaccination : historique, vaccins atténués, inactivés, sous-unitaires et ADN et, stratégies vaccinales et santé publique - Thérapie cellulaire COMPETENCES A ACQUERIR - Capacité à distinguer les maladies virales d’origines différentes - Dépistage et diagnostic (méthodologies) des maladies virales - Faire un bilan de l’efficacité des traitements anti-viraux en fonction de données médicales - Analyse d’articles scientifiques - Rédaction de rapport UE NECESSAIRE(S) POUR L’ADMISSION (seulement pour les UE de M2 et M3) Virologie moléculaire TYPE d'ENSEIGNEMENT CM : 45 h présentielles TD : 10 h présentielles TP : h présentielles Autre : (spécifier, exposés, visites, ...) heures présentielles


MUTUALISATION UE obligatoire pour Master : Micro-organismes option virologie


Master Oui

Peut constituer une UE libre Oui si validation de l’UE « Virus et pathogenèse » de Licence


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INTITULÉ de l'Unité d'Enseignement VIRUS EN RECHERCHE FONDAMENTALE ET APPPLIQUEE (VFA) Nouvelle UE Code : VFA RESPONSABLE Nom, Prénom : Successeur de Gérard JONARD Discipline : Virologie Adresse si en dehors de la Faculté Sciences de la Vie Autres Enseignants : Salah BOUZOUBAA, David GILMER et MC recruté cette année SEMESTRE (M1, M2, M3, M4) EFFECTIF PREVU M3 30 étudiants PROGRAMME (contenu) - Apport des virus dans la connaissance des mécanismes biologiques fondamentaux - Vecteurs viraux pour thérapie génique - Vecteurs viraux pour obtention de vaccins - Virus en biotechnologie : enzymes virales, vecteurs de clonages, vecteurs d’expression, phage dispay…. - Etudes des gènes par la technique du « Virus induced gene silencing » (VIGS) - Autres applications : lysotypie, phagothérapie, cartographie, marqueurs d’évolution…. COMPETENCES A ACQUERIR - Monter un projet de recherche - Interprétation et synthèse de résultats - Analyse d’articles - Etude critique des outils moléculaires mis sur le marché pour la recherche appliquée et fondamentale - Rédaction d’un rapport et présentation orale UE NECESSAIRE(S) POUR L’ADMISSION (seulement pour les UE de M2 et M3) Virologie moléculaire et/ou phytovirus et défense anti-virale TYPE d'ENSEIGNEMENT CM : 24 h présentielles TD : 15 h présentielles TP : 20 h présentielles Autre : (spécifier, exposés, visites, ...) heures présentielles

Heures étudiants : 160 h Crédits ECTS : 6

MUTUALISATION UE obligatoire pour Master : Micro-organismes option virologie


Master Oui

Peut constituer une UE libre Oui si validation UE « Virus et Pathogenèse » de Licence


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SEMESTRE 2 : 30 CREDITS Liste des UE Coeff UE ECTS UE

UE obligatoires Technologies de la Biologie Moléculaire et Cellulaire, et résumé d’article individuel (Travail d’Etudes et de Recherche II*) 1 3 Compte-rendu bibliographique en groupe sur l’une des thématiques scientifiques proposées (Travail d’Etudes et de Recherche III*) 1 3 Langues 1 3 UE obligatoires à choix - nombre d'UE à choisir parmi la liste ci-dessous : 2 des 3 modules à la carte de Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire * (Biologie et Médecine de la Reproduction, ou Immunologie ou Microbiologie Infectieuse) 3 + 3 18 Option si 1 second module à choix a été acquis au M1-S1 et compensé au M1-S2 CM des modules Biologie et Médecine de la Reproduction, ou Immunologie ou Microbiologie Infectieuse 2 6 Enseignement libre (par ex : génétique moléculaire des microorganismes, modèles animaux des pathologies humaines, pharmacologie expérimentale,...) 1 3 * Les étudiants en sciences médicales, pharmaceutiques et en odontologiques n’auront à valider qu’un module (9 ECTS) et un Travail d’Etudes et de Recherche (3 ECTS) parmi les trois proposés (S1 + S2)

* les UE libres doivent totaliser 9 crédits sur l’ensemble du master. L’étudiant fait valider le choix des UE libres par l’équipe pédagogique. Equipe pédagogiques du semestre : (enseignants –chercheurs, enseignants, chercheurs EPST)* (Indiquer les noms, prénoms, qualité, section CNU, unité de recherche, tél, fax, mail) ● Biologie et Médecine de la Reproduction (Coordinateurs : Pr M. Mark, Dr S. Warter)

Ontogenèse des gonades et du tractus génital : Pr. M. Mark (PU/PH, Médecine et Biologie du

Développement et de la Reproduction, section CNU 54 05). Implantation et placentation. Dr. S. Warter (MCU-PH, Médecine et Biologie du Développement et

de la Reproduction, section CNU 54 05). Contrôle hormonal de la reproduction et régulations auto et paracrines intra-gonadiques. Pr. N.

Boehm (PU/PH, Histologie, Embryologie et Cytogénétique, section CNU 42 02). Techniques en biologie de la reproduction. Dr. S Viville (MCU-PH avec HDR Médecine et Biologie

du Développement et de la Reproduction, section CNU 5405). Gamétogenèse, fécondation, et pathologies de la fertilité. Pr. Y Rumpler (PU/PH, Médecine et

Biologie du Développement et de la Reproduction, section CNU 54 05). Stages pratiques M1 : Dr. N. Ghyselinck (CR1 avec HDR, CNRS-SDV 28) Stages M2 : Pr. M. Mark, Dr. S. Warter, Dr. N. Ghyselinck

Nelly Boehm Tel : 03 90 24 32 12, Fax : 03 90 24 32 11 Email : [email protected]. Norbert B. Ghyselinck Tel : 03 88 65 32 13, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] ) Manuel Mark Tel: 03 88 65 56 36. Fax: 03 88 65 32 01) Email : [email protected] Yves Rumpler Tel : 03 90 24 31 86, Fax : 03 90 24 31 87. Email : [email protected] ) Stéphane Viville Tel : 03 88 62 82 00, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] ) Isabelle KOSCINSKI-CHARAU AHU. Laboratoire de Biologie de la Reproduction, CMCO.

[email protected]. fax: 03 88 62 84 45.


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● Cancérologie (Coordinateur : Pr J-P Bergerat)

Biologie moléculaire de la cellule : Dr J.M. Egly, DR1 INSERM Mécanismes de la Cancérogénèse : Pr J.P. Bergerat (Cancérologie, CNU section 4702) Biologie de la progression tumorale : Dr M.C. Rio, DR1 INSERM Recherche en Thérapeutique Anticancéreuse : Pr P. Dufour (Cancérologie, CNU section 47 02) Travaux pratiques M1 : Dr J.E. Kurtz (MCU-PH, HDR en cours, Cancérologie, CNU section 4702) Stages M2 : Pr J.P. Bergerat (Cancérologie, CNU section 4702), Dr M. Kedinger (DR1 INSERM U381 CSS 2)

Jean-Pierre Bergerat Tél. 03 88 11 90 61, Fax. 03 88 11 90 97.

Email: [email protected])

Patrick Dufour Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97 Email : [email protected] ) Jean Marc Egly Tel : 03 88 65 34 47, Fax : 03 88 65 32 01 E-mail : [email protected] ) Michèle Kedinger Tél. 33 (0)3 88 27 77 27. Fax 33 (0)3 88 26 35 38.

Email : [email protected] . Jean-Emmanuel Kurtz

Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97. Email : [email protected] ) Marie Christine Rio Tel : 03 88 65 32 24, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

● Génétique Humaine (Coordinatrice : Pr H. Dollfus, section CNU 47 04) Génétique humaine : introduction générale: Pr JL Mandel (Génétique humaine, CNU section 47-

04) Pathologies chromosomiques, épigénétique: Dr E Flori (Génétique humaine , MCU-PH, HDR en

cours CNU section 47 -04) Pathologies du développement: Dr F Perrin-Schmitt (Biochimie et Biologie Moléculaire, MCU-PH,

CNU section 44- 01) Pathologies héréditaires du système nerveux et sensoriel: Pr M Koenig ( Génétique Humaine option

moléculaire, section CNU 47-04) Métabolisme : Pr H. Dollfus, section CNU 47 04 Stages pratiques et stages M2 : Dr D. Devys et Pr H. Dollfus, section CNU 47 04

Didier Devys Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email: [email protected] )

Hélène Dollfus Tel : 03 88 12 81 53 – 03 90 24 33 41. Mails : [email protected] ;

[email protected])

Elisabeth Flori Email : [email protected] )

Michel Koenig Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] ) Jean-Louis. Mandel Tel: 03 88 65 34 12, Fax : 03 88 65 32 01. Email: [email protected] ) Fabienne Perrin-Schmitt Tel : 03 90 24 33 36, Fax : 03 88 65 32 01.

Email : [email protected]

● Immunologie (Coordinateur : Pr S. Bahram) Immunologie fondamentale : Pr S. Bahram (PU-PH CNU section 47 03), Dr M. Radosavljevic

(MCU-PH, HDR en cours CNU section 47 03) Immunologie Médicale : Dr D. Hanau, (DR EFS - INSERM CSS 2), Pr J. Sibilia (PU-PH, CNU

section 5001) Technologies : Dr A.-S. Korganow, (MCU-PH, CNU section 47 03), Dr M. Radosavljevic (MCU-

PH, HDR en cours CNU section 47 03) Stages pratiques et stages M2 : Dr J.-M Freyssinet, (DR1 INSERM CSS 2), Pr S. Bahram (PU-PH

CNU section 47 03) S. Bahram Tel 33 3 90 24 39 92, Fax : 33 3 90 24 40 16, Email : [email protected]


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Jean-Marie Freyssinet DR1 INSERM CSS 2, HDR, Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. Tel : 03 90 24 3985, Fax : 03 90 24 40 16. Email: [email protected] Daniel Hanau Tel : 03 88 21 25 25, Fax : 03 88 21 25 21. Email: [email protected]) Anne-Sophie Korganow Tel : 03 90 24 39 82, Fax : 03 90 24 39 78.

Email : [email protected] Mirjana Radosavljevic Tel : 03 90 24 39 95, Fax : 33 3 90 24 40 16.

Email : [email protected] ) Jean Sibilia Tel : 03 88 12 79 54. Email : [email protected] )

● Microbiologie Médicale - Coordinateurs : Pr F. Stoll-Keller, Dr G . Prévost

Epidémiologie des maladies infectieuses : Dr Valérie Letscher-Bru (Parasitologie, CNU section 4502)

Interactions moléculaires et cellulaires Hôte-Pathogène : Pr Ermanno Candolfi (Parasitologie, CNU section 4502), Pr Yves Piémont (Bactériologie, CNU section 4501)

Physiopathologie des maladies infectieuses : Dr Gilles Prévost (Bactériologie, CNU section 4501), Pr Françoise Stoll-Keller (Virologie, CNU section 4501)

Stages pratiques M1 : Dr Catherine Schuster (Virologie, INSERM, CS 1) Préparation et stages M2 : Dr Gilles Prévost (Bactériologie, CNU section 4501), Pr Françoise

Stoll-Keller (Virologie, CNU section 4501) Ermanno Candolfi Tel : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 79.

Email : [email protected] ) Valérie Letscher-Bru Tel : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 79.

Email : [email protected] ) Yves Piémont Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13.

Email : [email protected] ) Gilles Prévost Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13.

Email : [email protected] ) Françoise Stoll-Keller Tel : 03 90 24 37 16, Fax : 03 90 24 37 10.

Email : [email protected] ) Catherine Schuster Tel : 03 90 24 37 16, Fax : 03 90 24 37 10.

Email : [email protected] ) ● Relations avec les autres spécialités

Pr Dominique Wachsmann Tel: 03 90 24 41 52, Fax : 03 90 24 43 08. Email : [email protected]

En annexe les responsables d’UE sont signalés par un surlignage et la liste des 3 publications les plus récentes y figure Autres intervenants dans le semestre : (Indiquer les noms, prénoms, qualité, domaine d’expertise, tél, fax, mail) Coordonnées complètes des Responsables d’Enseignement : voir pages 14-23 Les fiches UE des 5 modules à la carte sont rassemblées plus haut (voir semestre 1, page 14).


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Technologies de la Biologie Moléculaire et Cellulaire, et démarche scientifique (TBR) Travail d’Etudes et de Recherche II

Niveau requis pour l’inscription : licence Biologie Cellulaire et Physiologie ou de Biochimie et Biologie Moléculaire, DCEM1, 3èmes années de Dentaire et de Pharmacie. Enseignement en M1, 2nd semestre

RESPONSABLE : Nom, prénom : Piémont Yves (suppléé de B. Jaulhac, même adresse) Discipline : Institut de Bactériologie de la faculté de Médecine Adresse : 3 rue Koeberlé F-67000 Strasbourg Tel : 03 90 24 37 76 Fax : 03 88 25 11 13 Email : [email protected] ; [email protected] Avec la ressource de l’ensemble des enseignants-chercheurs de la spécialité; CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :



Principes des Technologies actuelles 20 30 0,5 QROC/ QCM Démarche scientifique – analyse d’articles

15

15

0,5

Résumé/ réponses

Total 35 45 1 Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle continu = 50 % ; contrôle terminal = 50 %

COMPETENCES A ACQUERIR : Des cours-conférences réparties sur les cinq disciplines seront consacrés à une présentation des principes et de l’apport de nouvelles technologies en biologie moléculaire ou cellulaire. Ces présentations pourront comprendre une analyse comparative des types de résultats pouvant être obtenus par des technologies voisines. La seconde partie de l’enseignement comportera une analyse d’articles représentatifs de chaque discipline, chaque étudiant devra produire un titre et un résumé (1 page, 10 min) et répondre à quelques questions posées (5 min) par un enseignant-chercheur. L’enseignant développera lui-même l’article au cours d’une brève conférence (20 min). La liste des articles et des résumés sera ensuite disponible sur Intranet. TYPE D’ENSEIGNEMENT : CI : 35 h présentielles Autre : (exposés en présence d’enseignants-chercheurs) soient 12-15 h présentielles d’exposés Charge horaire totale pour l’étudiant : 80 h Crédits ECTS : 3 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Mention Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire




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Recherche en groupe sur une thématique scientifique proposée (RTS) Travail d’Etudes et de Recherche II

Niveau requis pour l’inscription : licence Biologie Cellulaire et Physiologie ou de Biochimie et Biologie Moléculaire, DCEM1, 3èmes années de Dentaire et de Pharmacie. Enseignement en M1, 2nd semestre

RESPONSABLE : Nom, prénom : Didier Devys (MCU-PH, HDR), Michel Koenig (PU-PH, HDR) Discipline : Génétique humaine, CNU section 47 04 Adresse ; IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie Moléculaire, 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email: [email protected] , [email protected])



étudiant


Compte rendu écrit bibliographique et résumé oral 20 50 0,5 + 0,5 CR + oral Part du contrôle continu et du contrôle terminal :


COMPETENCES A ACQUERIR : Les étudiants par groupe de 3 se verront proposer des dossiers bibliographiques limités à 4-6 publications portant sur un thème de recherche correspondant à l’une des cinq disciplines. Chacun des dossiers sera proposé par un enseignant-chercheur qui devra guider l’étudiant sur sa demande pour accéder à des compléments d’informations complémentaires. En aucun cas, il ne s’agira de se substituer à l’étudiant dans la préparation du compte-rendu. Cet enseignement sera effectué avant l’analyse bibliographique individuelle du TER II. Le groupe d’étudiants rendra une note de synthèse écrite (5 pages) sous une forme pré-déterminée et résumera cette bibliographie oralement (30 min) lors de séances consacrées à chaque discipline. Les compte-rendus pourront ensuite être accessibles sur Intranet avec accès réservé. TYPE D’ENSEIGNEMENT : CI : Par groupe de 3 étudiants, 5 h de préparation en présence d’un enseignant-chercheur + 50 heures de préparation personnelle + 15 heures (5 X 3) de présentation synthétique des compte-rendus bibliographiques en présence de trois enseignants / chercheurs de la discipline concernée par la thématique et d’une sélection d’au moins 4 autres enseignants-chercheurs. Charge horaire totale pour l’étudiant : 70 h Crédits ECTS : 3 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs :

MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Mention Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire




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SEMESTRE 3 : 30 CREDITS Liste de UE Coeff UE ECTS UE

UE obligatoires Instrumentation en Imagerie moléculaire de la cellule 1 3 Histologie fonctionnelle 1 3 Questions d'actualité en biologie cellulaire 1 3 Questions d'actualité en Physiopathologie (Thématiques des 5 cinq modules) 3 9 Ouverture Professionnelle - UE Accompagnement * (Sécurité en laboratoire, qualité, propriété intellectuelle, projet scientifique et gestion de projet, CV-Lettres, profils de carrière, recherche du stage S4)

1 Présence obligatoire

3

Initiation tuteurée à la recherche et la communication scientifique, insertion en équipe (rapport et projet scientifique) 2 6 Enseignement libre 1 3 *Une partie des enseignements dispensés seront communs à d’autres spécialités de la Mention Biologie et Santé. Une partie du temps de cette UE pourra s’effectuer sous la forme d’une présence dans les laboratoires d’accueil. *les UE libres doivent totaliser 9 crédits sur l’ensemble du master. L’étudiant fait valider le choix des UE libres par l’équipe pédagogique. Equipe pédagogique du semestre : (enseignants –chercheurs, enseignants, chercheurs EPST)* (Indiquer les noms, prénoms, qualité, section CNU, unité de recherche, tél, fax, mail) ● Biologie et Médecine de la Reproduction (Coordinateurs : Pr M. Mark, Dr S. Warter) Nelly Boehm (CNU section 4202, PU-PH, HDR, INSERM U405 (Psychopathologie et pharmacologie de la cognition. Directeur : J.M.Danion), Faculté de Médecine – Bâtiment 4 – 11, rue Humann – 67085 Strasbourg Cedex. Tel : 03 90 24 32 12, Fax : 03 90 24 32 11 Email : [email protected]. Norbert B. Ghyselinck (CR1 CNRS commission 28, HDR, IGBMC UMR 7104, Département de génétique physiologique et de signalisation nucléaire. 1, rue Laurent Fries BP 10142 67404 Illkirch CEDEX –Tel : 03 88 65 32 13, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] ) Manuel Mark (CNU section 5405, PU-PH, HDR, IGBMC UMR 7104, Département de génétique physiologique et de signalisation nucléaire 1, rue Laurent Fries BP 10142 67404 Illkirch CEDEX - Tel : 03 88 65 56 36. Fax : 03 88 65 32 01) Email : [email protected] Yves Rumpler (CNU section 5405, PU-PH, HDR. Biologie et médecine du développement et de la reproduction 11,rue Humann, 67085 STRASBOURG. EA-3428, Primates : variabilité et évolution des prosimiens à l’homme. Directeur : Pr Y. Rumpler, Tel : 03 90 24 31 86, Fax : 03 90 24 31 87. Email : [email protected] ) Stéphane Viville (CNU section 5405, MCU-PH, HDR, IGBMC UMR 7104 Département de génétique physiologique et de signalisation nucléaire 1, rue Laurent Fries, BP 10142, 67404 Illkirch CEDEX , Tel : 03 88 62 82 00, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] ) Isabelle KOSCINSKI-CHARAU AHU. Laboratoire de Biologie de la Reproduction, CMCO.

[email protected]. fax: 03 88 62 84 45. ● Cancérologie (Coordinateur : Pr J-P Bergerat) Jean-Pierre Bergerat (PU-PH, HDR, Institut de Recherche contre les Cancers de l’Appareil

Digestif (IRCAD) 1, Place de l’Hôpital BP 426. 67091 Strasbourg Cedex. UPRES EA- 3430, « Altérations Génétiques des Cancers et Réponse Thérapeutique – Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie » Directeur : Pr J.P. Bergerat


44

Tél. 03 88 11 90 61, Fax. 03 88 11 90 97. Email : [email protected])

Patrick Dufour (PU-PH, HDR, UPRES EA-3430, « Altérations Génétiques des Cancers et Réponse Thérapeutique – Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie » Directeur : Pr J.P. Bergerat Institut de Recherche contre les Cancers de l’Appareil Digestif (IRCAD) 1, Place de l’Hôpital BP 426. 67091 Strasbourg Cedex, Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97 Email : [email protected] ) Jean Marc Egly (DR1 INSERM CT1, HDR, IGBMC UMR 7104, Département Transcription 1, rue Laurent Fries BP 10142 67404 CEDEX – Illkirch. Tel : 03 88 65 34 47, Fax : 03 88 65 32 01 E-mail : [email protected] ) Michèle Kedinger DR1 INSERM, HDR, Inserm U381 CSS 5 – Ontogenèse et pathologie du système

digestif : rôle du microenvironnement cellulaire et moléculaire – 3, Avenue Molière – 67200 Strasbourg. Directeur : M. Kédinger, Tél. 33 (0)3 88 27 77 27. Fax 33 (0)3 88 26 35 38. Email : [email protected] .

Jean-Emmanuel Kurtz (MCU PH, inscrit en HDR, UPRES EA-3430, « Altérations Génétiques des Cancers et Réponse Thérapeutique – Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie » Directeur : Pr J.P. Bergerat. Institut de Recherche contre les Cancers de l’Appareil Digestif (IRCAD) 1, Place de l’Hôpital BP 426. 67091 Strasbourg Cedex.

Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97. Email : [email protected] ) Marie Christine Rio (DR1 INSERM CSS 6, HDR, IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie Moléculaire 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 88 65 32 24, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

● Génétique Humaine (Coordinatrice : Pr H. Dollfus, section CNU 47 04) Didier Devys (MCU-PH, HDR, CNU section 47 04, IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie

Moléculaire, 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

Hélène Dollfus (PU-PH, HDR, Fédération de Génétique de la Faculté de Médecine, 4, rue

Kirschleger, F-67000 Strasbourg - Hôpitaux Universitaires de Strasbourg. Tel : 03 88 12 81 53 – 03 90 24 33 41. Mails : [email protected] ; [email protected])

Elisabeth Flori (MCU-PH, HDR en cours, CNU section 47 04. Fédération de Génétique de la Faculté

de Médecine, 4, rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. Email : [email protected] )

Michel Koenig (PU-PH, HDR, CNU section 47 04, IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie

Moléculaire 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

Jean-Louis. Mandel (PU-PH, HDR, CNU section 47 04, IGBMC UMR 7104, Département de

Pathologie Moléculaire 1, rue Laurent Fries BP 10142 67404 Illkirch CEDEX . Tel : 03 88 65 34 12, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

Fabienne Perrin-Schmitt (MCU-PH, HDR, IGBMC UMR 7104, Département de Pathologie

Moléculaire, 1, rue Laurent Fries BP 10142 F-67404 Illkirch CEDEX. Tel : 03 90 24 33 36, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected]

● Immunologie (Coordinateur : Pr S. Bahram) S. Bahram PU-PH, INSERM CSS 2 CRES « Laboratoire d’Immunogénétique Moléculaire Humaine »

Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. CNU section 47 03

Tel 33 3 90 24 39 92, Fax : 33 3 90 24 40 16, Email : [email protected] Jean-Marie Freyssinet DR1 INSERM CSS 2, HDR, Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. Tel : 03 90 24 3985, Fax : 03 90 24 40 16. Email : [email protected] Daniel Hanau (DR, EFS, HDR – INSERM E 0345 CSS 2, « Biologie des Cellules


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Dendritiques Humaines», Etablissement Français du Sang-Alsace, Directeur : Daniel Hanau 10, rue Spielmann-67065 Strasbourg Cedex. Tel : 03 88 21 25 25, Fax : 03 88 21 25 21 Email : [email protected])

Anne-Sophie Korganow (MCU-PH, HDR CNU section 47 03, EMI INSERM 0022 CSS 2

« Laboratoire d’Immunopathologie ». Directeur : Thierry MARTIN . Service Médecine Interne A, Tel : 03 90 24 39 82, Fax : 03 90 24 39 78. Email : [email protected]

Mirjana Radosavljevic (MCU-PH CNU section 47 03, HDR en 2004, CRES « Laboratoire

d’Immunogénétique Moléculaire Humaine » Directeur Pr S. Bahram. Centre de Recherches d’Hématologie et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, 4 rue Kirschleger, F-67085 Strasbourg cedex. Tel : 03 90 24 39 95, Fax : 33 3 90 24 40 16. Email : [email protected] )

Jean Sibilia (PU-PH, HDR, CNU section 5001, UPRES EA-3432, Laboratoire de Physiopathologie et

d’Antibiologie des Infections Nosocomiales et Emergentes. Directeur : Pr H. Monteil. Service de Rhumatologie de l’Hôpital de Hautepierre Avenue Molière – BP 49 67098 STRASBOURG CEDEX. Tel : 03 88 12 79 54. Email : [email protected] )

● Microbiologie Médicale – Coordinateurs : Pr F. Stoll-Keller, Dr G . Prévost Ermanno Candolfi (PU-PH, HDR, CNU section 4502, INSERM U 392, Immunopathologie des

infections opportunistes, Directeur : Dr J.P. Klein. Institut de Parasitologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 79. Email : [email protected] )

Valérie Letscher-Bru (MCU-PH, CNU section 4502, INSERM U 392, « Immunopathologie des

infections opportunistes » Directeur : Dr J.P. Klein. Institut de Parasitologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 79. Email : [email protected] )

Yves Piémont (PU-PH, HDR, CNU section 4501, EA-3432, Laboratoire de Physiopathologie et

d’Antibiologie des Infections Nosocomiales et Emergentes. Directeur : Pr H. Monteil. Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13. Email : [email protected] )

Gilles Prévost (MCU-PH, HDR, CNU section 4501, EA-3432, Laboratoire de Physiopathologie et

d’Antibiologie des Infections Nosocomiales et Emergentes. Directeur : Pr H. Monteil. Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg. Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13. Email : [email protected] )

Françoise Stoll-Keller (PU-PH, HDR, CNU section 4501, INSERM exU544, UPRES EA-3770.


Catherine Schuster (CR1 INSERM commission n°1, HDR, INSERM exU544, UPRES EA-3770.


Enseignements partagés avec la Spécialité Biologie Cellulaire Intégrée

Dr Corinne Schmitt-Keichinger, Maître de Conférence, 65ème section, Institut de Biologie Moléculaire des Plantes, tel 03 88 41 72 00 ; fax 03 88 61 44 42, Mail : [email protected] RITZENTHALER C, LAPORTE C, GAIRE F, DUNOYER P, SCHMITT C, DUVAL S, PIEQUET A,

LOUDES AM, ROHFRITSCH O, STUSSI-GARAUD C, PFEIFFER P. (2002). Grapevine fanleaf virus replication occurs on endoplasmic reticulum-derived membranes. Journal of Virology, 76:8808-8019 SCHMITT C, SANCHEZ C, LAMPRECHT A, RENARD D, LEHR C, DE KRUIF CG, HARDY J. (2001). Study of beta-lactoglobulin/acacia gum complex coacervation by diffusing-wave


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spectroscopy and confocal scanning laser microscopy. Colloids Surfaces B Biointerfaces, 20:267-280.

Pr Jean Luc Imler (CNU 65, CNRS UPR9022, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 rue

René Descartes, 67000 Strasbourg, France. Tel. : + 33 388 41 70 36 Fax : 03 88 41 70 36 Email : JL.Imler@ibmc) ● Relations avec les autres spécialités Pr Jean Luc Imler (UPR , CNU section 65), voir ci-dessus

Pr Dominique Wachsmann (Immunologie, CNU section 41). Faculté de Pharmacie, 74, Route du Rhin. F-67401 ILLKIRCH CEDEX. INSERM U 392, Immunopathologie des infections opportunistes, Directeur : Dr J.P. Klein Tel : 03 90 24 41 52, Fax : 03 90 24 43 08.

Email : [email protected] * 3 publications parmi les plus récentes pour les responsables d’UE sont visibles sur la liste en annexe Autres intervenants dans le semestre : (Indiquer les noms, prénoms, qualité, domaine d’expertise, tél, fax, mail) Pour un tiers au moins des conférences données au cours des questions d’actualités en Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire, il est envisagé et souhaité de pouvoir inviter des conférenciers extérieurs, afin de profiter d’une ouverture scientifique et de l’excellence de spécialistes. Les thèmes choisis pourront varier d’année en année et il parait aléatoire de pouvoir donner des noms d’intervenants à l’heure actuelle. L’annexe 2 du projet présente néanmoins quelques projections sur ce thème.


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Fiche U.E. Master Imagerie Biologique, semestre 3

INTITULE DE L’U.E. :

Instrumentation en Imagerie moléculaire de la cellule (IIM)

RESPONSABLE : Nom, prénom : Corinne Schmitt-Keichinger, Maître de Conférence Discipline : Biologie cellulaire des plantes (section 65 CNU) Adresse : Institut de Biologie Moléculaire des Plantes Strasbourg Email : [email protected]

PROGRAMME :



La microscopie photonique en lumière blanche 6 2 6 1.2 * * La microscopie photonique en épifluorescence 6 2 6 1.2 * La microscopie confocale et biphotonique 6 2 1.2 * * CT : contrôle terminal, CC contrôle continu COMPETENCES A ACQUERIR : Les étudiants devront être capables de connaître les caractéristiques, performances et limites d’utilisation des microscopes photoniques et de leurs accessoires (objectifs, filtres, caméras…). Ils devront également être capables d’en assurer la maintenance et d’orienter les utilisateurs vers le meilleur choix. TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM : 18 h présentielles TD : 6 h présentielles TP : 18 h présentielles Autre : (spécifier, exposés, visites …) 4h travail perso étudiant (visite de laboratoires disposant de microscopes confocaux et biphotoniques) Charge horaire totale pour l’étudiant : 82h Crédits ECTS : 3 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Imagerie biologique




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Fiche U.E. INTITULE DE L’U.E. Histologie fonctionnelle (HIF)

RESPONSABLE :

Nom, prénom : Boehm Nelly Discipline : Histologie et Cytologie CNU : 42-02 Adresse ; Institut d’Histologie Faculté de Médecine, 11 rue Humann, 67085 Strasbourg Cedex INSERM U666 Tel 03 90 24 32 15 Fax 03 90 24 32 11 E-mail : [email protected]

SEMESTRE (M1, M2, M3, M4) EFFECTIF PREVU

M3

30-40 CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :


étudiant


Homéostasie cellulaire et tissulaire : organisation fonctionnelle normale et pathologique de tissus épithéliaux ; application aux pathologies humaines

8

Défense de l’organisme et réaction aux biomatériaux 6 Interactions neurones-glie : application aux potentialités de régénération 4

Matrice extra-cellulaire : organisation fonctionnelle normale et pathologique ; exemples d’application à la pathologie humaine

8

*

* CT : contrôle terminal Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

contrôle terminal

COMPETENCES A ACQUERIR : Connaissance approfondie des relations structure-fonction nécessaires pour mettre en oeuvre des techniques de visualisation cellulaire et tissulaire et pour l’étude de processus biologiques normaux et pathologiques ; l’enseignement, sous forme de cours et de séminaires, abordera des exemples permettant d’illustrer l’éventail des techniques utilisables (de la microscopie optique à la microscopie en champ proche, visualisation moléculaire in situ invivo et in vitro, reconstructions tridimensionnelles, etc...) appliquées à l’étude de la fonction normale et pathologiquedes tissus fondamentaux . UE NECESSAIRE(S) POUR L’ADMISSION une connaissance acquise ou en cours d’acquisition de l’organisation cellulaire et tissulaire (histologie appliquée ou équivalent) est souhaitable

TYPE D’ENSEIGNEMENT :

CM : 26 h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 64 h

ECTS : 3

Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : /

MUTUALISATION :

UE obligatoire pour le master : Vie et santé Spécialité Physiopathologie cellulaire et moléculaire




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Fiche U.E.

INTITULE de l’UE Questions d’actualité en Biologie Cellulaire (QAC)

Niveau requis : M1 en Biologie Cellulaire Intégrée ou en Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire RESPONSABLE : Nom, Prénom : Jean-Luc IMLER Discipline : Biologie Cellulaire Adresse : Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 rue René Descartes, 67000 Strasbourg, France.

Tel.: + 33 388 41 70 36 Fax : 03 88 41 70 36 Email : JL.Imler@ibmc) Autres Enseignants : Anne-Catherine Schmit ; Jan DeMey ; Elisabeth George-Labouesse ; Marie-Christine Rio ; Patricia Simon-Assmann ; Angela Giangrande; Johan Auwerx ; Filippo Rijli; Daniel Metzger ; Philippe Kastner ; Susan Chan CONTENU DES ENSEIGNEMENTS : Cette UE est constitutée de conférences de 2-3h par des chercheurs strasbourgeois travaillant sur différents aspects de la biologie cellulaire, ou sur des techniques de pointe. Son contenu sera amené à évoluer pour s’adapter à l’actualité. Il inclus des conférences sur le cytosquelette (A-C Schmit et J. DeMey), l’adhésion cellulaire et la matrice extracellulaire (E. George-Labouesse, M-C Rio, P. Simon-Assmann), les récepteurs et la transduction de signal (J.L. Imler) , la physiologie cellulaire (J. Auwerx), la biologie du développement (S. Chan ; A. Giangrande ; M. Labouesse) ; ainsi que sur les techniques d’inactivation ciblée des gènes (D. Metzger) et d’analyse globale du transcriptome (P. Kastner). Rédaction d’une note de synthèse sur un aspect d’actualité en biologie cellulaire. Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle continu = 100%

COMPETENCES A ACQUERIR : -Connaissance des grands modèles de biologie cellulaire : plantes, modèles génétiques (levure, nématode, drosophile), système nerveux, système immunitaire. -Expertise des techniques et méthodes de la biologie cellulaire -Analyse critique de données scientifiques -Rédaction d’une note de synthèse TYPE D’ENSEIGNEMENT : CM : 30 h présentielles Heures étudiants : 90h Crédits ECTS : 3 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Mention Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire et Biologie Cellulaire Intégrée




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Fiche U.E.

INTITULE de l’UE Questions d'actualité en Physiopathologie (Thématiques des 5 cinq modules - QAP)

Niveau requis : M1 en Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire ou en Biologie Cellulaire Intégrée RESPONSABLE : Nom, prénom : BAHRAM, Seiamak Discipline : Immunologie, CNU4703 Adresse : Laboratoire d'Immunogénétique Moléculaire Humaine, INSERM-CReS, Centre de Recherche d'Immunologie et d'Hématologie, 4 rue Kirschleger, 67085 Strasbourg Cedex, France. Téléphone 0388.140.269 ; Télécopie 0390.244.016 Email : [email protected] ; assisté des membres de la Commission Pédagogique et des Directeurs d’Unités CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :


étudiant


15 conférences sur les thèmes de la physiopathologie 45 120 2 + 1 Oral Ecrit Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle terminal = 100 %

COMPETENCES A ACQUERIR : Trois conférences pour chaque discipline modulaire seront présentées pour l’ensemble des étudiants. Ces conférences aborderont les développements actuels dans les disciplines concernées. Elles nécessiteront une analyse bibliographique de la part des étudiants puisqu’ils se verront proposés par le chercheur invitant et en accord avec le conférencier une liste limitée (2-3) d’articles et devront produire un compte-rendu en 1-2 pages de chaque conférence dans un délai court de 3-4 jours. Ces compte-rendus seront notés et un examen oral portant sur une analyse d’un article / année et quelques questions complèteront cet examen. Les articles choisis pour l’oral seront tirés au sort.

TYPE D’ENSEIGNEMENT : CI : 30h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 150 h Crédits ECTS : 9 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : Pour un tiers au moins des conférences données au cours des questions d’actualités en Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire, il est envisagé et souhaité de pouvoir inviter des conférenciers extérieurs, afin de profiter d’une ouverture scientifique et de l’excellence de spécialistes. Les thèmes choisis pourront varier d’année en année et il parait aléatoire de pouvoir donner des noms d’intervenants à l’heure actuelle. MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Mention Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire




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Fiche U.E.

INTITULE de l’UE Ouverture Professionnelle - Unité d’Accompagnement (OPR)

Niveau requis : M1 en Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire RESPONSABLES : Nom, prénom : BAHRAM, Seiamak Discipline : Immunologie, CNU4703 Adresse : INSERM-CReS, Centre de Recherche d'Immunologie et d'Hématologie, 4 rue Kirschleger, 67085 Strasbourg Cedex, France. Téléphone 0388.140.269 ; Télécopie 0390.244.016 Email : [email protected] Et les autres Responsables de spécialités de la Mention Biologie et Santé

Nom, prénom : PREVOST Gilles Discipline : Bactériologie CNU section 4501 Adresse ; Institut de Bactériologie de la Faculté de Médecine de Strasbourg, 3 rue Koeberlé, F-67000 Strasbourg Tel : 03 90 24 37 57 Fax : 03 88 25 11 13.. Email : [email protected]



étudiant


Conférences Interactives sur l’insertion professionnelle 30 30 1 QROC Recherche d’un laboratoire pour le stage S4 40 20 -/- Durant ce cycle, les informations seront données concernant la sécurité (chimique, culture cellulaire, bactériologique, radioactivité, incendie) et la qualité en matière de recherche (gestion des produits, élimination des déchets, traçabilité des manipulations). Les aspects de propriété intellectuelle devraient être abordés. La visite d’une entreprise de biotechnologies pourrait également être programmée. Préparation de CV, structures administratives et présentation des profils de carrière dans les différentes grandes institutions, entretiens et recherche d’un laboratoire d’accueil pour le stage S4. La notion des appels d’offre à financement émis par les grands organismes ou les fondations sera abordée. La gestion de projets sera aussi traitée. La validation de cette unité s’effectuera sur la présence. Part du contrôle continu et du contrôle terminal :


COMPETENCES A ACQUERIR : Connaître les principes de fonctionnement internes et externes vis à vis des institutions des laboratoires. Connaître les responsabilités qu’impliquent la carrière de chercheur. Connaître les grands aspects de fonctionnement des institutions et les possibilités de carrière.

TYPE D’ENSEIGNEMENT : CI : 30 h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 120 heures Crédits ECTS : 6 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : Enseignements communs à plusieurs spécialités de la Mention Biologie et Santé MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Mention Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire


Peut constituer une UE libre : NON


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Fiche U.E.

INTITULE de l’UE Initiation tuteurée à la recherche et à la communication scientifique (ITR)

Niveau requis : M1 en Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire RESPONSABLE : Nom, prénom : Kurtz, Jean-Emmanuel Discipline : Cancérologie Adresse : UPRES EA-3430, « Altérations Génétiques des Cancers et Réponse Thérapeutique - Laboratoire de Cancérologie Expérimentale et de Radiobiologie » Directeur : Pr J.P. Bergerat. Institut de Recherche contre les Cancers de l’Appareil Digestif (IRCAD) 1, Place de l’Hôpital BP 426. 67091 Strasbourg Cedex. Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97. Email : [email protected] ... assisté de la Commission Pédagogique CONTENU DES ENSEIGNEMENTS :


étudiant


Rapport et projet scientifique (séminaire) 40 30 2 Oral Part du contrôle continu et du contrôle terminal :

Contrôle terminal = 100 %

COMPETENCES A ACQUERIR : Après avoir ciblé la possibilité d’un stage S4 dans un groupe de recherche, les étudiants devront composer un rapport et un projet scientifiques courts sur la thématique sur laquelle ils souhaitent travailler. Lors d’une présentation très concise (10 min), où ils pourront s’appuyer sur le commentaire d’une affiche ou d’un support de projection, ils exposeront cette thématique et les grandes orientations du projet scientifique qui leur sera confié durant le quatrième semestre du Master.

TYPE D’ENSEIGNEMENT : TP : 40 h présentielles Charge horaire totale pour l’étudiant : 30 heures Crédits ECTS : 3 Les enseignements assurés par des intervenants extérieurs : -/- MUTUALISATION : UE obligatoire pour le master : Mention Biologie – Santé Spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire




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SEMESTRE 4 : STAGE : 30 CREDITS CARACTERISTIQUES DU STAGE : Le stage en laboratoire est effectué dans une équipe d’une Unité de Recherche contractualisée à un EPST ou à l’Université (Université Louis Pasteur ou Université partenaire en convention simple). Ce stage débute officiellement au début du quatrième semestre de Master (soit janvier de l’année universitaire) et peut avoir été anticipé d’une courte période au troisième semestre. Il s’agit d’une occupation à plein temps où l’étudiant est intéressé à un sujet de recherche particulier et où il apprend les techniques mises en place et intervient dans la poursuite des objectifs de recherche. Durant le stage, l’étudiant doit avoir accès à tous les éléments scientifiques, techniques et bibliographiques lui permettant d’étayer sérieusement sa formation. Il est préférable que durant son stage, l’étudiant soit au minimum suivi par un enseignant-chercheur habilité à diriger des recherches. Un séminaire de travail ou bibliographique peut lui être demandé durant son stage. Le stage est sanctionné par la remise d’un rapport et la présentation orale du travail effectué à la fin de l’année universitaire. Les étudiants à la recherche d’une allocation de recherche doivent avoir valider leur année M2 de manière synchrone à la publication des postes d’allocataires de recherche par les différents organismes nationaux. Les rapports seront jugés sur leur forme et la cohérence scientifique de leur contenu, et une iconographie appropriée. Les qualités didactiques et la maîtrise scientifique des étudiants seront évaluées, de même que les compétences technologiques en rapport avec le sujet développé. Equipe pédagogique du semestre : (enseignants –chercheurs, enseignants, chercheurs EPST)* (Indiquer les noms, prénoms, qualité, section CNU, unité de recherche, tél, fax, mail) ● Biologie et Médecine de la Reproduction (Coordinateurs : Pr M. Mark, Dr S. Warter)

Nelly Boehm Tel : 03 90 24 32 12, Fax : 03 90 24 32 11 Email : [email protected].

Norbert B. Ghyselinck Tel : 03 88 65 32 13, Fax : 03 88 65 32 01.

Email : [email protected] ) Manuel Mark Tel: 03 88 65 56 36. Fax: 03 88 65 32 01) Email : [email protected] Yves Rumpler Tel : 03 90 24 31 86, Fax : 03 90 24 31 87. Email : [email protected] ) Stéphane Viville Tel : 03 88 62 82 00, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] ) Isabelle KOSCINSKI-CHARAU AHU. Laboratoire de Biologie de la Reproduction, CMCO.

[email protected]. fax: 03 88 62 84 45.

● Cancérologie (Coordinateur : Pr J-P Bergerat) Jean-Pierre Bergerat Tél. 03 88 11 90 61, Fax. 03 88 11 90 97. Email: [email protected]) Patrick Dufour Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97 Email : [email protected] ) Jean Marc Egly Tel : 03 88 65 34 47, Fax : 03 88 65 32 01 E-mail : [email protected] ) Michèle Kedinger Tél. 33 (0)3 88 27 77 27. Fax 33 (0)3 88 26 35 38. Email : [email protected] . Jean-Emmanuel Kurtz Tel : 03 88 11 63 64, Fax. 03 88 11 90 97. Email : [email protected] ) Marie Christine Rio Tel : 03 88 65 32 24, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] )

● Génétique Humaine (Coordinatrice : Pr H. Dollfus, section CNU 47 04)

Didier Devys Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email: [email protected] )


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Hélène Dollfus Tel : 03 88 12 81 53 – 03 90 24 33 41. Mails : [email protected] ; [email protected])

Elisabeth Flori Email : [email protected] )

Michel Koenig Tel : 03 88 65 32 44, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected] ) Jean-Louis. Mandel Tel: 03 88 65 34 12, Fax : 03 88 65 32 01. Email: [email protected]

strasbg.fr ) Fabienne Perrin-Schmitt Tel : 03 90 24 33 36, Fax : 03 88 65 32 01. Email : [email protected]

● Immunologie (Coordinateur : Pr S. Bahram) S. Bahram Tel 33 3 90 24 39 92, Fax : 33 3 90 24 40 16, Email : [email protected] Jean-Marie Freyssinet Tel : 03 90 24 3985, Fax : 03 90 24 40 16. Email: jean-

[email protected] Daniel Hanau Tel : 03 88 21 25 25, Fax : 03 88 21 25 21. Email: [email protected]) Anne-Sophie Korganow Tel : 03 90 24 39 82, Fax : 03 90 24 39 78. Email : [email protected] Mirjana Radosavljevic Tel : 03 90 24 39 95, Fax : 33 3 90 24 40 16. Email : [email protected] ) Jean Sibilia Tel : 03 88 12 79 54. Email : [email protected] )

● Microbiologie Médicale - Coordinateurs : Pr F. Stoll-Keller, Dr G . Prévost

Ermanno Candolfi Tel : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 79. Email : [email protected] )

Valérie Letscher-Bru Tel : 03 90 24 36 79, Fax : 03 90 24 36 79.

Email : [email protected] ) Yves Piémont Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13.

Email : [email protected] ) Gilles Prévost Tel : 03 90 24 37 76. Fax : 03 88 25 11 13.

Email : [email protected] ) Françoise Stoll-Keller Tel : 03 90 24 37 16, Fax : 03 90 24 37 10.

Email : [email protected] ) Catherine Schuster Tel : 03 90 24 37 16, Fax : 03 90 24 37 10.

Email : [email protected] )

Coordonnées complètes des Responsables d’Enseignement : voir pages 14-23 ● Relations avec les autres spécialités

Pr Dominique Wachsmann Tel: 03 90 24 41 52, Fax : 03 90 24 43 08. Email : [email protected]

Pr Jean Luc Imler (CNU 65, CNRS UPR9022, Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 rue René Descartes, 67000 Strasbourg, France. Tel.: + 33 388 41 70 36 Fax : 03 88 41 70 36

Email : JL.Imler@ibmc)

… et les enseignants-chercheurs désignés pour le Jury d’évaluation des rapports de stage, soit un représentant de chaque unité de recherche.

Autres intervenants dans le semestre dans l’encadrement du stage : (Indiquer les noms, prénoms, qualité, domaine d’expertise, tél, fax, mail) Voir en Annexe I, les noms des chercheurs titulaires d’une HDR


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Fiche interne à l’ULP Evaluation de la charge d’enseignement de la formation PCM:

CM CI TD TP Semestres UE* Effectif étudiant attendu Durée Groupe Durée Groupe Durée Groupe Durée Groupe

S1/S2 BMR (9 ects) 15-20 53 1 40 Indiv-labS1: 9 ects ; S2: 18 ects CAN (9 ects) 15-20 55 1 40 Indiv-lab MPD: 2/5 modules IMM (9 ects) 15-20 50 1 40 Indiv-lab SCI: 3/5 modules GHU (9 ects) 15-20 50 1 40 Indiv-lab (rotation modules) MIM (9 ects) 15-20 53 1 40 Indiv-lab S1 SRC (3 ects) >80 15 1 10 ? 10 ? ABL (3 ects) 25-30 33 1 HIA (3ects) 25-30 10 30 options TTI (6 ects) 2-5 56 1 des autres spec. --> BDA (6 ects) 2-5 39 1 12 1 24 ? PEP (6ects) 2-5 39 1 21 1 PVL (6 ects) 2-5 45 1 10 1 VFA (6 ects) 2-5 24 1 15 1 20 ? +5 modules PCM CM S2 TBR (3 ects) 25-30 35 1 RTS (3 ects) 25-30 20 8 - 10 S3 HIF (3 ects) 25-30, ? 26 1 IIM (3 ects) 25-30, ? 18 1 6 1 18 ? QAC (3 ects) 25-30 30 1 QAP (9 ects) 25-30 45 1 OPR (3 ects) 25-30 15 1 20 Labos. ITR (6 ects) 25-30 75 Labos. S4 Stage 3 ects Labos 27 ects Labos TOTAUX heures E.HTD * N’indiquer que les UE obligatoires et obligatoires à choix (ne pas faire figurer les UE libres) Durée : nombre total d’heures assurées Groupe : nombre de groupe Evaluation des besoins et des financements nécessaires à la mise en place : (équipement, fonds documentaires, logiciels …) Logiciel d’acquisition et de transformation de données numériques disponible en réseau Divers fonds documentaires (CD roms) Invitations de 5-8 conférenciers extérieurs Travaux pratiques M1 (équipement en salle de TP pour les spécialités partenaires, aide symbolique pour les TP en labos ?)


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Annexe I

Liste des enseignants-chercheurs et chercheurs participant aux enseignements magistraux et pratiques : 33 PU/PU-PH, 35 MCU/MCU-PH, 23 Directeurs de Recherche, 17 Chargés de recherche, 85 HDR et 5 chercheurs permanents Luxembourgeois UPR 9021 . « Immunologie et Chimie Thérapeutiques» Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 rue Descartes F-67085 Strasbourg cedex . Tel. 03 88 41 70 22. Directeur : Dr S. Muller, Email : [email protected] Sylviane Muller (DR1 CNRS, SDV 22, HDR)

MONNEAUX, F., MULLER, S. (2002) Epitope spreading in systemic lupus erythematosus: identification of triggering peptide sequences. Arthritis Rheumatism, 46, 1430-1438.

MONNEAUX, F., LOZANO, J. M., PATARROYO, M. E., BRIAND, J.-P., MULLER, S. (2003) T cell recognition and therapeutic effect of a phosphorylated synthetic peptide of the 70K snRNP protein administered in MRL/lpr mice. European Journal of Immunology, 33, 287-296.

THÉBAULT-BAUMONT, K., DUBOIS-LAFORGUE, D., KRIEF, P, BRIAND, J.-P., HALBOUT, P., VALLON-GEOFFROY, K., MORIN, J., LALOUX, V., LEHUEN, A., CAREL, J.-C., JAMI, J., MULLER, S., BOITARD, C. (2003) Acceleration of type I diabetes mellitus in proinsulin 2-deficient non-obese diabetic mice. Journal of clinical Investigation, 111, 851-857.

Sylvie Fournel (MCU, section CNU 65, HDR)

FOURNEL S., AGUERRE-GIRR M., HUC X., LENFANT F., ALAM A., TOUBERT A., BENSUSSAN A., LE BOUTEILLER P. (2000) Soluble HLA-G1 triggers CD95/CD95 ligand-mediated apoptosis in activated CD8+ cells by interacting with CD8. Journal of Immunology, 164, 6100-6104.

FOURNEL S., MULLER S. (2002) Peptides as DNA mimics: cross-reactivity and mimicry in systemic autoimmune diseases. Cellular and Molecular Life Sciences 59, 1280-1284

FOURNEL, S., NEICHEL, S., DALI, H., FARCI, S., MAILLERE, B., BRIAND, J.-P., MULLER, S. (2003) CD4+ T cells from (NZBxNZW)F1 lupus mice and normal mice immunized against apoptotic nucleosomes recognize similar Th cell epitopes in the C-terminus of histone H3. Journal of Immunology, 171, 636-644.

UPR 9022 . Réponse Immunitaire et Développement chez les Insectes. Directeur: Jules

A. HOFFMANN (DR1 CNRS SDV 28) - Institut de Biologie Moléculaire et Cellulaire, 15 rue Descartes F-67085 Strasbourg cedex . 22. (33) 03.88.41.70.77 Sec : (33) 03.88.41.70.37. Fax 3 88 60 69 22. Email : [email protected] . Site web : http://www-ibmc.u-strasbg.fr .

Elena Levashina (CNRS CR1, SDV 28, HDR) BLANDIN, S., SHIAO, S.H., MOITA, L.F., JANSE, C.J., WATERS, A.P., KAFATOS, F.C., LEVASHINA,

E.A. (2004) Complement-like protein TEP1 is a determinant of vectorial capacity in the malaria vector Anopheles gambiae. Cell 2004, 116, 661-670.

BLANDIN, S., MOITA, L.F., KOCHER, T., WILM, M., KAFATOS, F.C., LEVASHINA, E.A. (2002) Reverse genetics in the mosquito Anopheles gambiae: targeted disruption of the Defensin gene. EMBO Rep., 3, 852-856.

LEVASHINA, E.A., MOITA, L.F., BLANDIN, S., VRIEND, G., LAGUEUX, M., KAFATOS, F.C. (2001) Conserved role of a complement-like protein in phagocytosis revealed by dsRNA knockout in cultured cells of the mosquito, Anopheles gambiae. Cell, 104, 709-718.

Jean-Luc Imler (Pr, CNU 65, HDR)

SABATIER, L., JOUANGUY, E., DOSTERT, C., ZACHARY, D., DIMARCQ, J.L., BULET, P., IMLER, J.L. (2003) Pherokine-2 and -3: two Drosophila molecules related to pheromone/odor-binding proteins induced by viral and bacterial infections. European Journal Biochemistry, 270, 3398-3407.

WEBER, A.N., TAUSZIG-DELAMASURE, S., HOFFMANN, J.A., LELIEVRE, E., GASCAN, H., RAY, K.P., MORSE, M.A., IMLER, J.L., GAY, N.J. (2003) Binding of the Drosophila cytokine Spatzle to Toll is direct and establishes signaling. Nature Immunology, 4,794-800.

TAUSZIG-DELAMASURE S., BILAK H., CAPOVILLA M., HOFFMANN J.A., IMLER J.L. (2002) Drosophila MyD88 is required for the response to fungal and Gram-positive bacterial infections. Nature Immunology, 3, 91-97.


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Laboratoire de Biologie et Physiologie Intégrée (CNRS/GDRE-ITI), Faculté des Sciences, de la Technologie et de la Communication, Université du Luxembourg. Centre de Recherche Public, Avenue de la Faïencerie, 162A, L-1511 Luxembourg, Grand-Duché de Luxembourg. Tel: (352) 466644-440 Fax: (352) 466644-442. Directeur : Dr N. Kieffer , Email: [email protected] N. Kieffer (DR2 CNRS SDV 24 / CRP, HDR)

MELCHIOR C, KREIS S, JANJI B, KIEFFER N. (2002) Promoter characterization and genomic organization of the gene encoding integrin-linked kinase 1. Biochimica Biophysica Acta, 1575, 117-122.

S. PLANCON, M.C. MOREL-KOPP, E. SCHAFFNER-RECKINGER, P. CHEN, N. KIEFFER. (2001) Green fluorescent protein (GFP) tagged to the cytoplasmic tail of �IIb or �3 allows the expression of a fully functional integrin αIIbβ3: Effect of αIIbβ3GFP on �IIb�3 ligand binding. Biochemical Journal, 357, 529-536

P. CHEN, C. MELCHIOR, N.H.C. BRONS, N. SCHLEGEL, J. CAEN, N. KIEFFER. (2001) Probing conformational changes in the I-like domain and the cysteine-rich repeat of human �3 integrins following disulfide bond disruption by cysteine mutations. Journal of Biological Chemistry, 276, 38628-38635.

Laboratoire de Biologie Moléculaire, d’Analyse Génique et de Modélisation 42, rue du Laboratoire. L-1011 Luxembourg. Tel : + 352 26 48 02 05, Directeur : Dr E. Friederich, Email : [email protected] E. Friederich (DR2 CNRS SDV 24 / CRP / HDR)

FRADELIZI J, NOIREAUX V, PLASTINO J, MENICHI B, LOUVARD D, SYKES C, GOLSTEYN RM, FRIEDERICH E. (2001) ActA and human zyxin harbour Arp2/3-independent actin-polymerization activity. Nature Cell Biology, 3, 699-707.

NIX DA, FRADELIZI J, BOCKHOLT S, MENICHI B, LOUVARD D, FRIEDERICH E, BECKERLE MC. (2001) Targeting of zyxin to sites of actin membrane interaction and to the nucleus. Journal of Biological Chemistry, 276, 34759-3467.

PETIT MM, FRADELIZI J, GOLSTEYN RM, AYOUBI TA, MENICHI B, LOUVARD D, VAN DE VEN WJ, FRIEDERICH E. (2000) LPP, an actin cytoskeleton protein related to zyxin, harbors a nuclear export signal and transcriptional activation capacity. Molecular Biolology of the Cell, 11:117-129.

Bassam JANJI (PhD, chercheur core staff CRP-Santé)

BILLOTTET, C., JANJI, B., THIERY, J:P., J. JOUANNEAU. (2002). Rapid tumor development and potent vascularization are independent events in carcinoma producing FGF-1 or FGF-2. Oncogene, 21, 8128-8139.

DEUGNIER, M. A., FARALDO, M. M., JANJI, B., THIERY, J.P., M.A. GLUKHOVA. (2002). EGF controls the in vivo developmental potential of a mammary epithelial cell line possessing progenitor properties. Journal of Cell Biology, 159, 453-63.

JANJI, B., MELCHIOR, C., VALLAR, L., N., KIEFFER (2000). Cloning of an isoform of integrin-linked kinase (ILK) that is upregulated in HT-144 melanoma cells following TGF-beta1 stimulation. Oncogene, 19, 3069-3077.

Laurent VALLAR (PhD, chercheur core-staff CRP-Santé, assistant professeur, Université du Luxembourg).

LAPLANTINE, E., MAURER, P., VALLAR, L., EBLE, J., PAULSSON, M., BRUCKNER, P., KIEFFER, N., M., AUMAILLEY (2002). The integrin beta1 subunit cytoplasmic tail forms oligomers: a potential role in beta1 integrin clustering. Biology of the Cell, 94, 375-387.

VALLAR, L., REGNAULT, V., LATGER-CANNARD, V., T. LECOMPTE (2001). Beta2-glycoprotein I binding to platelet microparticle membrane specifically reduces immunoreactivity of glycoproteins IIb/IIIa. Thrombosis & Haemostasis, 85, 314-319.

KASPER, G., BROWN, A., EBERL, M., VALLAR, L., KIEFFER, N., BERRY, C., GRIDWOOD, K., EGGLETON, P., QUINNELL, R., D.I. PRITCHARD (2001). A calreticulin-like molecule from the human hookworm Necator americanus interacts with C1q and the cytoplasmic signalling domains of some integrins. Parasite Immunology, 23, 141-152.

Laboratoire d'Immunogénétique et d'Allergologie. Centre de Recherche Public-

Santé/Centre Hospitalier du Luxembourg, 12, rue Barblé L-1210 Luxembourg. Tel: (352 ) 4411 2219. Fax: (352) 441255. Directeur : Dr. F. Hentges, Email: [email protected] (MD. CHL, CRP-Santé).

François Hentges (PhD, chercheur core-staff CRP-Santé). Email: : [email protected] Hilger Christiane (PhD, chercheur core-staff CRP-Santé). Email: [email protected]


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HILGER, C, THILL L, GRIGIONI F, LEHNERS C, FALAGIANI P, ROMANO C, STEVENS W, HENTGES F. (2004) IgE antibodies of fish allergic patients cross-react with frog parvalbumin. Allergy, 59, 653-660.

HILGER C, GRIGIONI F, THILL L, MERTENS L, HENTGES F (2002). Severe IgE-mediated anaphylaxis following consumption of fried frog legs. Definition of a-parvalbumin as the allergen in cause. Allergy, 57, 1053-1058.

HILGER C, GRIGIONI F, DE BEAUFORT C, MICHEL G, FREILINGER J, HENTGES F. (2001). Differential binding of IgG and IgA antibodies to antigenic determinants of bovine serum albumin. Clinical & Experimental Immunology, 123, 387-396.

Zimmer Jacques (MD, PhD, core staff CRP-Santé, HDR en cours à l'ULP). Email : [email protected]

DOUCEY M.A., SCARPELLINO L., ZIMMER J., GUILLAUME P., LUESCHER I.F., BRON C., HELD W. (2004). Cell-autonomous adaptation of natural killer cell inhibition to self-MHC class I. Nature Immunology, in press.

HELD W., COUDERT J.C., ZIMMER J. (2003). The NK cell receptor repertoire : formation, adaptation and exploitation. Current Opinion in Immunology, 15, 233-237.

ZIMMER J., IOANNIDIS V., HELD W. (2001). H-2D ligand expression by Ly-49A+ natural killer (NK) cells precludes ligand uptake from environmental cells : implications for NK cell function. The Journal of Experimental Medicine, 194, 1531-1539.

ERT interne à l’Unité INSERM U 595,11 rue Humann 67085 STRASBOURG Cedex,Tel 03 90 24 38 68,Fax 03 90 24 39 00,courriel htenenxcite.com. Applications biomédicales des films multicouches de polyélectrolytes. Dir : Pr H. Tenenbaum

Nabil Chakfe PU/PH,CNU 5104 email [email protected] BEN ABDESSALEM S, DURAND B, AKESBI S, CHAKFE N. Blood flow in textile polyester vascular

prosthesis: Experimental and numerical study. Text Res J 2001 ; 71 : 178-183.

CHAKFE N, RIEPE G, DIEVAL F, WANG L, BEAUFIGEAU M, URBAN E, LE MAGNEN JF, DURAND B, IMIG H, KRETZ JG. Longitudinal ruptures of polyester knitted vascular prostheses. J Vasc Surg 2001; 33: 1015-1021.

CHAKFE N, DIEVAL F, THAVEAU F, TAGHAVI I, LE MAGNEN JF, HASSANI O, RIEPE G, LAROCHE G, DURAND B, KRETZ JG. Aneurysm of expanded polyetrafluoroethylene vascular graft. An ultrastructural analysis. Eur J Vasc Endovasc Surg 2003 ; 25 : 360-366.

Christian Debry PU/PH,CNU 5502 email [email protected]

VAUTIER D, HEMMERLÉ J, VODOUHE C., KOENIG G, LUDOVIC R., PICART C, VOEGEL JC, DEBRY C, CHLUBA J, OGIER J. 3-D surface charges modulate protrusive and contractile contacts of chondrosarcoma cells. Cell Motil Cytoskel,2003 ; 56 :147-158.

DEBRY C, SCHULTZ P., VAUTIER D. Biomaterials in laryngotracheal surgery : a solvable problem in the near future? J Laryngol Otol 2003 ;117:113-17.

SCHULTZ P, VAUTIER D, CHLUBA J, MARCELLIN L, DEBRY C. Survival analysis in rats implanted with porous titanium tracheal prosthesis. Experimental study of a new porous tracheal prosthesis made of Ti40. Ann Thorac Surg 2002;73:1747-51.

Youssef Haikel PU/PH,CNU 5802 email [email protected]

SCHWINTE P., BALL V., SZALONTAI B., HAÏKEL Y., VOEGEL J-C., SCHAAF P. Secondery structure of proteins adsorbed or embeddedin in polyelectrolyte mutilayers. Biomacromolecules: 3: 1135, 2002.

TRYOEN-TOTH P., VAUTIER D., HAIKEL Y., VOEGEL JC., SCAAF P., CHLUBA J., OGIER J. Viability, adhesion, and bone phenotype od osteoblast-like cells on polyelectrolytes and embedded into multilayer architectures films. J Biomat Mat Res, 60(4):657-667, 2002.

ENGEL-DEUTSCH M., PINI A., YAMASHITA Y., SHIBATA Y., HAIKEL Y., SCHOLLER M., KLEIN JP. Insertional inactivation of pac and rmlB genes reduces the release of TNF-α, IL-6 and IL-8 induced by S.mutans in monocytic, dental pulp and periodontal ligament cells. Infection and Immunity ,71: 5169-5177,2003.

Jean-Georges Kretz PU/PH,CNU 5104 email [email protected]


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CARDON A, CHAKFE N, THAVEAU F, GAGNON E, HARTUNG O, AILLET S, KERDILES Y, KRETZ JG, DOILLON CJ. Sealing of polyester prostheses with autologous fibrin glue and bone marrow. Ann Vasc Surg 2000 ; 14 : 543-552.

CHAKFE N, RIEPE G, DIEVAL F, WANG L, BEAUFIGEAU M, URBAN E, LE MAGNEN JF, DURAND B, IMIG H, KRETZ JG. Longitudinal ruptures of polyester knitted vascular prostheses. J Vasc Surg 2001; 33: 1015-1021..

RINCKENBACH S, CHAKFE N, BEAUFIGEAU M, HASSANI O, BACHELIER P, JAECK D, KRETZ JG. Surgical treatment of a Budd-Chiari syndrome secondary to hepatic inferior vena cava agenesia. J Cardiovasc Surg 2002 ; 43 : 665-669.

Henri Tenenbaum PU/PH,CNU 5701 email [email protected]

M.DAHAN, B.NAWROCKI, R.ELKAIM, M.SOELL, A.L.BOLCATO-BELLEMIN, P.BIREMBAUT et H.TENENBAUM. Expression of matrix metalloproteinases in healthy and diseased human gingiva. J. Clin Periodontol. 28 : 128-136. 2001.

M.SOELL, R.ELKAIM et H.TENENBAUM. Cathepsin C, matrix metalloproteinases and their tissue inhibitors in periodontitis affected patients. J. Dent. Res. 81 : 174-178. 2002.

H. TENENBAUM, J.F.SCHAAF et F.J.G. CUISINIER. Histological analysis of the Ankylos peri-implant soft tissues in a dog model. Implant Dent. 12 : 259-265. 2003

Jean-Claude Voegel DR1 Inserm,CNU 5703 email [email protected]

JESSEL N., ATALAR F., LAVALLE PH., MUTTERER J., DECHER G., SCHAAF P., VOEGEL J.C., OGIER J., Advanced Mat., 2003, 15, 692-95.

PICART C., MUTTERER J., RICHERT L., LUO Y., PRESTWICH G.D., SCHAAF P., VOEGEL J.C., LAVALLE PH., Proc. Natl. Acad. Sci. (USA), 2002, 99, 12531-35.

BOULMEDAIS F., BALL V., SCHWINTE P., FRISCH B., SCHAAF P., VOEGEL J.C., Langmuir 2003, 19, 440-45.

Jean-Luc Davideau MCU/PH,CNU 5701 email [email protected]

LEZOT F, DAVIDEAU JL, THOMAS B, SHARPE P, FOREST N, BERDAL A. Epithelial Dlx-2 homeogene expression and cementogenesis. J Histochem Cytochem. 2000 Feb;48(2):277-84.

DAVIDEAU JL, LEZOT F, KATO S, BAILLEUL-FORESTIER I, BERDAL A. Dental alveolar bone defects related to Vitamin D and calcium status. J Steroid Biochem Mol Biol. 2004 May;89-90(1-5):615-8.

LEZOT F, COUDERT A, PETIT S, VI-FANE B, HOTTON D, DAVIDEAU JL, KATO S, DESCROIX V, PIBOUIN L, BERDAL A. Does Vitamin D play a role on Msx1 homeoprotein expression involving an endogenous antisense mRNA? J Steroid Biochem Mol Biol. 2004 May;89-90(1-5):413-7.

INSERM U375 CSS 1 (Heidelberg) , « Virologie Appliquée à l'Oncologie » Abteilung F0100, INSERM U375 - Deutsches Krebsforschungszentrum, Postfach 101949, 69009 Heidelberg, Germany/ Allemagne. Fax: 00 49 6221 42 49 62. Directeur: J. Rommelaere, DR1 INSERM, Email: [email protected] Marc Aprahamian (DR2, INSERM CSS 5, HDR)

HAJRI, A., WACK, S., LEHN P., VIGNERON, J.P., LEHN J.P., MARESCAUX, J., APRAHAMIAN, M. (2004) Combined suicide gene therapy for pancreatic peritoneal carcinomatosis using BGTC liposomes. Cancer Gene Therapy, 11, 16-27.

WACK, S., HAJRI, A., HEISEL, F., SOWINSKA, M., BERGER, C., WHELAN, M., MARESCAUX, J., APRAHAMIAN, M. (2003) Feasibility, sensitivity, and reliability of laser-induced fluorescence imaging of green fluorescent protein-expressing tumors in vivo. Molecular Therapy, 7, 765-773.

HAJRI, A., WACK, S., MEYER, C., SMITH, M.K., LEBERQUIER, C., KEDINGER, M., APRAHAMIAN, M. (2002) In vitro and in vivo efficacy of photofrin and pheophorbide a, a bacteriochlorin, in photodynamic therapy of colonic cancer cells. Photochemistry Photobiology, 75, 140-148.

Jan Cornelis (CR1, DKFZ)

MOEHLER, M., ZEIDLER, M., SCHEDE, J., ROMMELAERE, J., GALLE, P.R., CORNELIS, J.J., HEIKE, M. (2003) Oncolytic parvovirus H1 induces release of heat-shock protein HSP72 in susceptible human tumor cells but may not affect primary immune cells. Cancer Gene Therapy, 10, 477-480.

OLIJSLAGERS, S., DEGE, A.Y., DINSART, C., VOORHOEVE, M., ROMMELAERE, J., NOTEBORN, M.H.M., CORNELIS, J.J. (2001) Potentiation of a recombinant oncolytic parvovirus by expression of apoptin. Cancer Gene Therapy, 8, 958-965.


60

MOEHLER, M., BLECHACZ, B., WEISKOPF, N., ZEIDLER, M., STREMMEL, W., ROMMELAERE, J., GALLE, P.R., CORNELIS, J.J. (2001) Effective infection, apoptotic killing and gene transfer of human hepatoma cells but not primary hepatocytes by parvovirus H-1 and derived vectors. Cancer Gene Therapy, 8, 158-167.

Célina Cziepluch (CR1, INSERM CSS 1)

BODENDORF, U., CZIEPLUCH, C., JAUNIAUX, J.-C., ROMMELAERE, J., SALOMÉ, N. (1999) Nuclear export factor CRM1 interacts with the non-structural protein NS2 from parvovirus minute virus of mice. Journal of Virology, 73, 7769-7779.

CZIEPLUCH, C., LAMPEL, S., GREWENIG, A., GRUND, C., LICHTER, P., ROMMELAERE, J. (2000) H-1 parvovirus associated replication (H1PAR)bodies: a distinct virus-induced nuclear structure. Journal of Virology, 74, 4807-4815.

BASHIR, T., ROMMELAERE, J., CZIEPLUCH, C. (2001) In vivo accumulation of cyclin A and cellular replication factors in autonomous parvovirus MVM-associated replication bodies. Journal of Virology, 75, 4394-4398.

Laurent Deleu (CR2, CNRS SDV )

DELEU, L., DAEFFLER, L., FAISST, S., ROMMELAERE, J. (2002) Action oncolytique des parvovirus de rongeurs. Virologie, 6, 29-40.

DELEU, L., PUJOL, A., NÜESCH, J.P.F., ROMMELAERE, J. (2001) Inhibition of transcription-regulating properties of non structural protein 1 (NS1) of parvovirus minute virus of mice by a dominant negative form of NS1. Journal of General Virology, 82, 1929-1934.

DELEU, L., SHELLARD, S., ALEVIZOPOULOS, K., AMATI, B., LAND, H. (2001) Recruitment of TRRAP required for oncogenic transformation by E1A. Oncogene, 13, 8270-8275.

Christina Dinsart (CR1 DKFZ)

WRZESINSKI, C., TESFAY, L., SALOMÉ, N., JAUNIAUX, J.C., ROMMELAERE, J., CORNELIS, J., DINSART, C. (2003) Chimeric and pseudotyped parvoviruses minimize the contamination of recombinant stocks with replication-competent viruses and identify a DNA sequence that restricts parvovirus H-1 in mouse cells. Journal of Virology, 77, 3851-3858.

BROWN, C.S., DISUMMA, F., ROMMELAERE, J., DEGE, A.Y., CORNELIS, J.J., DINSART, C., SPAAN, W.J.M. (2002). Production of recombinant H-1 parvovirus stocks devoid of replication-competent viruses. Human Gene Therapy, 13, 2135-2145.

WETZEL, K., MENTEN, P., OPDENAKKER, G., VAN DAMME, J., GRÖNE, H.J., GIESE, N., VECCHI, A., SOZZANI, S., CORNELIS, J.J., ROMMELAERE, J., DINSART, C. (2001) Transduction of human MCP-3 by a parvoviral vector induces leukocyte infiltration and reduces growth of human cervical carcinoma cell xenografts. The Journal of Gene Medicine, 3, 326-337.

Amor Hajri (CR1, IRCAD)

HAJRI, A., WACK, S., LEHN P., VIGNERON, J.P., LEHN J.P., MARESCAUX, J., APRAHAMIAN, M. (2004) Combined suicide gene therapy for pancreatic peritoneal carcinomatosis using BGTC liposomes. Cancer Gene Therapy, 11, 16-27.

WACK, S., HAJRI, A., HEISEL, F., SOWINSKA, M., BERGER, C., WHELAN, M., MARESCAUX, J., APRAHAMIAN, M. (2003) Feasibility, sensitivity, and reliability of laser-induced fluorescence imaging of green fluorescent protein-expressing tumors in vivo. Molecular Therapy, 7, 765-773.

HAJRI, A., WACK, S., MEYER, C., SMITH, M.K., LEBERQUIER, C., KEDINGER, M., APRAHAMIAN, M. (2002) In vitro and in vivo efficacy of photofrin and pheophorbide a, a bacteriochlorin, in photodynamic therapy of colonic cancer cells. Photochemistry Photobiology, 75, 140-148.

Jean-Claude Jauniaux (CR1 DKFZ)

LEFEBVRE, L., VANDERPLASSCHEN, A., CIMINALE, V., HEREMANS, H., DANGOISSE, O., JAUNIAUX, JC., TOUSSAINT, JF., ZELNIK, V., BURNY, A., KETTMANN, R., WILLEMS, L. (2002) Oncoviral bovine leukemia virus G4 and human T-cell leukemia virus type 1 p13 (II) accessory proteins interact with farnesyl pyrophosphate synthetase. Journal of Virology, 76, 1400-1414.

MARCHINI, A., ACCARDI, R., MALANCHI, I., SCHYR, E., OXELMARK, E., DE PINTO, V., JAUNIAUX, J.C., MAUNDRELL, K., TOMMASINO, M. (2002) Schizosaccharomyces pombe Pmf1p is structurally and functionally related to Mmf1p of Saccharomyces cerevisiae.Yeast, 19, 703-711.

POIREY, R., DESPONS, L., LEH, V., LAFUENTE, MJ., POTIER, S., SOUCIET, J.L., JAUNIAUX, J.C. (2002) Functional analysis of the Saccharomyces cerevisiae DUP240 multigenic family reveals membrane-associated proteins that are not essential for cell viability. Microbiology, 148, 2111-2123.

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-ULP, INSERM U596/UMR 7104. 1, rue Laurent Fries - BP 10142 67404 Illkirch CEDEX . Tel: 03 88 65 32 00. Fax 03 88 65 32 03. Email: [email protected] Départements de Biologie du Développement, Pathologie Moléculaire, Génétique et Physiologie du signal nucléaire, Transcription, Biologie Structurale et Génomique.

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Dino Moras (DRCE CNRS SDV 20/21, HDR, Laboratoire de biologie et de génomique structurales, IGBMC).

Email : [email protected]) STEHLIN-GAON C, WILLMANN D, ZEYER D, SANGLIER S, VAN DORSSELAER A, RENAUD JP,

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Pierre Oudet (PU-PH, HDR, CNU section 44 03, Laboratoire de Biochimie et de Biologie Moléculaire, Hôpital

de Hautepierre, Hopitaux Universitaires de Strasbourg, Avenue Molière, 67000, Strasbourg, France. Tel : 03 88 12 75 35 . Email : [email protected] )

ENTZ-WERLE N, SCHNEIDER A, KALIFA C, VOEGELI AC, TABONE MD, MAREC-BERARD P, MARCELLIN L, PACQUEMENT H, TERRIER P, BOUTARD P, MEYER N, GAUB MP, LUTZ P, BABIN A, OUDET P. (2003) Genetic alterations in primary osteosarcoma from 54 children and adolescents by targeted allelotyping. British Journal of Cancer, 88, 1925-1931.

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Marie Christine Rio (DR1 INSERM CSS 6, HDR, Email : [email protected])

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Danièle Spehner (IR 1 INSERM CSS 1, Email: [email protected] )

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Demande de Création d’EA Génétique clinique, Fédération de Génétique de la Faculté de Médecine, 4, rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg - Hôpitaux Universitaires de Strasbourg. Directeur : Pr Hélène Dollfus. Tel : 03 88 12 81 53 – 03 90 24 33 41. Mails :

[email protected] ; [email protected]) Valérie Biancalana (IR, [email protected])

ROBERTSON S.P., TWIGG S.R., SUTHERLAND-SMITH A.J., BIANCALANA V., GORLIN R.J., HORN D., KENWRICK S.J., KIM C.A., MORAVA E., NEWBURY-ECOB R., ORSTAVIK K.H., QUARRELL O.W., SCHWARTZ C.E., SHEARS D.J., SURI M., KENDRICK-JONES J., WILKIE A.O.; OPD-SPECTRUM DISORDERS CLINICAL COLLABORATIVE GROUP. (2003) Localized mutations in the gene encoding the cytoskeletal protein filamin A cause diverse malformations in humans. Nature Genetics, 33, 487-491.

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NOLIN S.L., BROWN W.T., GLICKSMAN A., HOUCK G.E. JR, GARGANO A.D., SULLIVAN A., BIANCALANA V., BRONDUM-NIELSEN K., HJALGRIM H., HOLINSKI-FEDER E., KOOY F., LONGSHORE J., MACPHERSON J., MANDEL J.L., MATTHIJS G., ROUSSEAU F., STEINBACH P., VAISANEN M.L., VON KOSKULL H., SHERMAN S.L. (2003) Expansion of the fragile X CGG repeat in females with premutation or intermediate alleles. American Journal of Human Genetics, 72,454-464.

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Hélène Dollfus (PU-PH, HDR CNU section 47 04,

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Email : [email protected] ) DORAY B., BECMEUR F, GIRARD-LEMAIRE F., SCHLUTH C., FLORI E. (2002) Esophageal and

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Elisabeth Flori (MCU-PH, HDR en cours CNU section 47 04,

Email : [email protected]) SCHLUTH C, DORAY B, GIRARD-LEMAIRE F., KOHLER M., LANGER B., GASSER B., LINDNER V.,

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Fabienne Perrin-Schmitt (MCU-PH,HDR CNU section 47 04,

Email: [email protected] ) YOSHIBA N., YOSHIBA K., STOETZEL C., PERRIN-SCHMITT F., CAM Y., RUCH J.V., LESOT H. (2003)

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UPRES EA-3428. Espèce humaine et Primates : variabilité et évolution Directeur : Pr B. LUDES, Institut de Médecine Légale, 11 rue Humann, 67085 STRASBOURG. Tel : 03 90 24 33 48 ; Email : [email protected]

Bertrand Ludes (PU-PH1, HDR)

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Jean-Marie LE MINOR (MCU-PH, HDR) Matthieu SCHMITTBUHL (MCU-PH, HDR)

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Yves Rumpler (PU-PH1)


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Services et chercheurs associés aux équipes de génétique : Institut d’Anatomie Pathologique, Institut d’Histologie, Services d’Urologie, de Gynécologie-Obstétrique, CECOS des H.U.S. Joseph Abecassis (Chercheur Centre Paul Strauss/IGBMC, HDR,

Email : [email protected] ) ZHENG H, WASYLYK C, AYADI A, ABECASSIS J, SCHALKEN JA, ROGATSCH H, WERNERT N,

MAIRA SM, MULTON MC, WASYLYK B. (2003) The transcription factor Net regulates the angiogenic switch. Genes and Development, 17, 2283-2297.

REDON R, HUSSENET T, BOUR G, CAULEE K, JOST B, MULLER D, ABECASSIS J, DU MANOIR S. (2002) Amplicon mapping and transcriptional analysis pinpoint cyclin L as a candidate oncogene in head and neck cancer. Cancer Resarch, 62, 6211-6217.

PIK3CA but not p63 gene as a likely target of 3q26-qter gains. REDON R, MULLER D, CAULEE K, WANHERDRICK K, ABECASSIS J., DU MANOIR S. (2001) A simple specific pattern of chromosomal aberrations at early stages of head and neck squamous cell carcinomas. Cancer Research, 61, 4122-4129.

Laboratoire d’Anatomie Pathologique, Ave Molière, F-67200 Strasbourg Jean-Pierre Bellocq (PU-PH, HDR, CNU section 42 03, Email : [email protected] )

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BELLOCQ JP, PENEAULT-LLORCA F. (2003) Extemporaneous histologic examination in infraclinical mammary lesion. Bulletin du Cancer, 90, 299-300.

BOULAY A, MASSON R, CHENARD MP, EL FAHIME M, CASSARD L, BELLOCQ JP, SAUTES-FRIDMAN C, BASSET P, RIO MC. (2001) High cancer cell death in syngeneic tumors developed in host mice deficient for the stromelysin-3 matrix metalloproteinase. Cancer Research, 61, 2189-2193.

INSERM U405 - Psychopathologie et pharmacologie de la cognition. Directeur : Pr

J.M.Danion. Faculté de Médecine - Bâtiment 4 - 11, rue Humann - 67085 Strasbourg Cedex. Tel : 03 88 11 60 37, Email : [email protected]

Nelly Boehm (PU-PH, HDR, CNU 42-02) Tel : 03 90 24 32 15 ; fax : 03 90 24 32 12 ; Email : [email protected]


AUW-HAEDRICH C., BOEHM N., WEISSENBERGER C. (2001) Signet ring carcinoma of the eccrine sweat gland in the eyelid, treated by radiotherapy alone. British Journal of Ophthalmology, 85, 112-113.

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Brigitte Samama (MCU-PH, CNU section 42 02, Email : [email protected] )

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Service de Neurologie des H.U.S. Christine Tranchant (Service de Neurologie, PU-PH, HDR CNU section 49 01,

Email : [email protected] ) TRANCHANT C., FLEURY M., MOREIRA M., KOENIG M., WARTER J.M.. (2003) Phenotypic variability

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GIRAUD M., BEAURAIN G., YAMAMOTO A.M, EYMARD B., TRANCHANT C., GAJDOS P., GARCHON H.J.. (2001) Linkage of HLA to myasthenia gravis and genetic heterogeneity depending on anti-titin antibodies. Neurology, 57, 1555-1561.

Service d’Urologie des H.U.S. Didier Jacqmin (PU-PH, HDR, CNU section 52 04,

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J. CÉRALINE, E. ERDMANN, P. ERBS, M. DESLANDRES-CRUCHANT, D. JACQMIN, B. DUCLOS, C. KLEIN-SOYER, P. DUFOUR, J.P. BERGERAT. (2003) Experimental study : A yeast-based functional assay for the detection of the mutant androgen receptor in prostate cancer. European Journal of Endocrinology, 148, 99-110.

Services de Gynécologie et d’obstétrique Karine Bettahar-Lebugle (PH, service de gynécologie du CMCO)

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Benoit Jaulhac (MCU-PH, HDR, CNU section 45 01, en 2004, Email : [email protected])

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Yves Piémont (PU-PH, HDR, CNU section 45 01, Email: [email protected] )

H.J. BOULOUIS, F. BARRAT, D. BERMOND, F. BERNEX, D. LE THIBAULT, R. HELLER, J.-J. FONTAINE, Y. PIEMONT, B. CHOMEL. (2001) Kinetics of Bartonella birtlesii infection in experimentally infected miceand pathogenic effect on their reproductive functions. Infection & Immunity, 69, 5313-5317.

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Gilles Prévost (MCU-PH, CNU section 4501, HDR, Email: [email protected] )

S. BRONNER, H. MONTEIL, G. PREVOST. (2003) Regulations of virulence determinants in Staphylococcus aureus: complexity and application. FEMS Microbiology Reviews, 28, 183-200.

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Philippe Riegel (MCU-PH, CNU section 45 01, Email : [email protected] )

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Jean Michel Scheftel (MCU-PH, CNU section 45 01, HDR, Email: [email protected] )

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Jean Sibilia (PU-PH, CNU section 50 01, HDR, Email : [email protected] )

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Dominique Wachsmann (PU, HDR, CNU section 41, Email: [email protected] ), rejoint l’EA-3432 en 2005


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INSERM U311, « Biologie et pharmacologie de l’hémostase et de la Thrombose » Directeur : Christian Gachet (DR INSERM CSS 2). Etablissement Français du sang – Alsace. 10, rue Spielmann, F-67065 Strasbourg. Tél. : 03 88 21 25 25 Fax : 03 88 21 25 21 www.efs-alsace.fr Jean-Pierre Cazenave (PU-PH ; MD, PhD)

VAN RHENEN (D.J.), GULLIKSSON (H.), CAZENAVE (J.-P.), PAMPHILON (D.), LJUNGMAN (P.), KLÜTER (H.), VERMEIJ (H.), KAPPER-KLUNNE (C.), DE GREEF (G.E.), LAFORET (M.), LIOURE (B.), DAVIS (K.), MARBLIE (S.), MAYAUDON (V.), FLAMENT (J.), CONLAN (M.), LIN (L.), METZEL (P.), BUCHHOLZ (D.), CORASH (L.). Transfusion of pooled buffy coat platelet components prepared with photochemical pathogen inactivation treatment : the euroSPRITE Trial. Blood, 2003, 101, 2426-2433.

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in patients with ischemic cardiovascular diseases. Journal of Thrombosis and Haemostasis, 2005, 3, 85-92.

WOLFF (V.), ALEIL (B.), GIROUD (M.), LORENZINI (J.-L.), WIESEL (M.-L.), CAZENAVE (J.-P.), LANZA (F.). Soluble platelet glycoprotein V is a marker of thrombosis in patients with ischemic stroke. Stroke, 2005, 36, 17-19.

François Lanza (Dr en Pharmacie, PhD)

PERRAULT (C.), MANGIN (P.), SANTER (M.), BAAS (M.-J.), MOOG (S.), CRANMER (S.L.), PIKOVSKI (I.), WILLIAMSON (D.), JACKSON (S.P.), CAZENAVE (J.-P.), LANZA (F.). Role of the intracellular domain of GPIb in controlling the adhesive properties of the platelet GPIb/V/IX complex. Blood, 2003, 101, 3477-3484.

STRASSEL (C.), PASQUET (J.-M.), ALESSI (M.-C.), JUHAN-VAGUE (I.), CHAMBORT (H.), COMBRIÉ (R.), NURDEN (P.), BAAS (M.-J.), DE LA SALLE (C.), CAZENAVE (J.-P.), LANZA (F.), NURDEN (A.T.). A novel missense mutation shows that GPIb� has a dual role in controlling the processing and stability of the platelet GPIb-IX adhesion receptor. Biochemistry, 2003, 42, 4452-4462.

MANGIN (P.), DAVID (T.), LAVAUD (V.), CRANMER (S.L.), PIKOVSKI (I.), JACKSON (S.P.), BERNDT (M.C.), CAZENAVE (J.-P.), GACHET (C.), LANZA (F.). Identification of a novel 14-3-3ζ binding site within the cytoplasmic tail of platelet glycoprotein Ib�. Blood, 2004, 104, 420-427.

Dr Christian Gachet (DR INSERM, MD, PhD)

HECHLER (B.), LENAIN (N.), MARCHESE (P.), VIAL (C.), HEIM (V.), FREUND (M.), CAZENAVE (J.-P.), CATTANEO (M.), RUGGERI (Z.), EVANS (R.), GACHET (C.). A role of the fast ATP-gated P2X1 cation channel in the thrombosis of small arteries in vivo. Journal of Experimental Medicine, 2003, 198, 661-667.

KAUFFENSTEIN (G.), HECHLER (B.), CAZENAVE (J.-P.), GACHET (C.). Adenine triphosphate nucleotides are antagonists at the P2Y12 receptor. Journal of Thrombosis and Haemostasis, 2004, 2, 1980-1988.

MANGIN (P.), OHLMANN (P.), ECKLY (A.), CAZENAVE (J.-P.), LANZA (F.), GACHET (C.). The P2Y1 receptor plays an essential role in the platelet shape change induced by collagen when TXA2 formation is prevented. Journal of Thrombosis and Haemostasis, 2004, 2, 969-977.

BAURAND (A.), ECKLY (A.), HECHLER (B.), KAUFFENSTEIN (G.), GALZI (J.-L.), CAZENAVE (J.-P.), LÉON (C.), GACHET (C.). Differential regulation and relocalization of the platrelet P2Y receptors


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following activation : a way to avoid loss of hemostatic properties ? Molecular Pharmacology, 2005, 67, 721-733.

Catherine Léon (Habilitation en 2005)

LEON (C.), ALEX (M.), KLOCKE (A.), MORGENSTERN (E.), MOOSBAUER (C.), ECKLY (A.), SPANNAGL (M.), GACHET (C.), ENGELMANN (B.). Platelet ADP receptors contribute to the initiation of intravascular coagulation. Blood, 2004, 103, 594-600

LÉON (C.), FREUND (M.), LATCHOUMANIN (O.), FARRET (A.), PETIT (P.), CAZENAVE (J.-P.), GACHET (C.). The P2Y1 receptor is involved in the maintenance of glucose homeostasis and insulin secretion in mice. Purinergic Signalling, 2005, in press.

LÉON (C.), RAVANAT (C.), FREUND (M.), CAZENAVE (J.-P.), GACHET (C.). Differential involvement of the P2Y1 and P2Y12 receptors in platelet procoagulant activity. Arteriosclerosis, Thrombosis and Vascular Biology, 2003, 23, 1941-1947.

INSERM U-692 - Laboratoire de Signalisations Moléculaires et Neurodégénérescence. Directeur de l'Unité : Loeffler JP, DR-INSERM, CS8-Inserm. Faculté de Médecine (Université Louis Pasteur), , Bâtiment 3 - 8ème étage. 11, rue Humann - 67000 Strasbourg. Tél : 03.90.24.30.86 - Fax : 03.90.24.30.65. Email : [email protected] Jean-Philippe Loeffler J.P. (DR INSERM CSS8)

BOUTILLIER AL, TRINH E, LOEFFLER JP . Selective E2F-dependent gene transcription is controlled by histone deacetylase activity during neuronal apoptosis. J Neurochem, (2003), 84(4): 814-28

DUPUIS L, DI SCALA F, RENÉ F, DE TAPIA M, OUDART H, PRADAT PF, MEININGER V, LOEFFLER JP. Upregulation of mitochondrial Uncoupling protein 3 reveals an early muscular metabolic defect in Amyotrophic Lateral Sclerosis. FASEB J, (2003), 17(14):2091-3.

DUPUIS L, OUDART H, RENE F, GONZALEZ DE AGUILAR JL, LOEFFLER JP. Evidence for defective energy homeostasis in amyotrophic lateral sclerosis: benefit of a high-energy diet in a transgenic mouse model. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004; 101, 11159-64.

Larmet Y., MCU-HDR (CNU n°69)

HECK N, GARWOOD J, LOEFFLER JP, LARMET Y, FAISSNER A. Differential upregulation of extracellular matrix molecules associated with the appearance of granule cell dispersion and mossy fiber sprouting during epileptogenesis in a murine model of temporal lobe epilepsy. Neuroscience. 2004;129, 309-24.

PANTELEEVA I, ROUAUX C, LARMET Y, BOUTILLIER S, LOEFFLER JP, BOUTILLIER AL. HDAC-3 Participates in the Repression of e2f-Dependent Gene Transcription in Primary Differentiated Neurons. Ann N Y Acad Sci. 2004;1030, 656-60.

REIBEL S, BENMAAMAR R, LE BT, LARMET Y, KALRA SP, MARESCAUX C, DEPAULIS A. Neuropeptide Y delays hippocampal kindling in the rat. Hippocampus. 2003;13, 557-60.

René F., MCU-HDR (CNU n°69)

JOKIC N, DI SCALA F, DUPUIS L, RENE F, MULLER A, DE AGUILAR JL, LOEFFLER JP.Early activation of antioxidant mechanisms in muscle of mutant Cu/Zn-superoxide dismutase-linked amyotrophic lateral sclerosis mice. Ann N Y Acad Sci. 2003, 1010, 552-6.

GONZALEZ DE AGUILAR JL, RENE F, DUPUIS L, LOEFFLER JP. Neuroendocrinology of neurodegenerative diseases. Insights from transgenic mouse models. Neuroendocrinology. 2003, 78, 244-52.

DUPUIS L, OUDART H, RENE F, GONZALEZ DE AGUILAR JL, LOEFFLER JP. Evidence for defective energy homeostasis in amyotrophic lateral sclerosis: benefit of a high-energy diet in a transgenic mouse model. Proc Natl Acad Sci U S A. 2004; 101, 11159-64.

Boutillier AL, CR1-CNRS, HDR (CNRS n°24)

ROUAUX C, LOEFFLER JP, BOUTILLIER AL. Targeting CREB-binding protein (CBP) loss of function as a therapeutic strategy in neurological disorders. Biochem Pharmacol. 2004, 68, 1157-64.

PANTELEEVA I, ROUAUX C, LARMET Y, BOUTILLIER S, LOEFFLER JP, BOUTILLIER AL. HDAC-3 Participates in the Repression of e2f-Dependent Gene Transcription in Primary Differentiated Neurons. Ann N Y Acad Sci. 2004;1030, 656-60.

BOUTILLIER AL, TRINH E, LOEFFLER JP . Selective E2F-dependent gene transcription is controlled by histone deacetylase activity during neuronal apoptosis. J Neurochem, (2003), 84(4): 814-28.

Muller A., PU-PH, ULP-HUS

JOKIC N, DI SCALA F, DUPUIS L, RENE F, MULLER A, DE AGUILAR JL, LOEFFLER JP. Early activation of antioxidant mechanisms in muscle of mutant Cu/Zn-superoxide dismutase-linked amyotrophic lateral sclerosis mice. Ann N Y Acad Sci. 2003, 1010, 552-6.


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DUPUIS L, MULLER A, MEININGER V, LOEFFLER JP. Molecular mechanisms of amyotrophic lateral sclerosis: recent contributions from studies in animal models. Rev Neurol (Paris). 2004, 160, 35-43.

Gaiddon C., CR1-CNRS (CNRS n°24), Dupuis L., CR2-INSERM (CSS8 INSERM), De Tapia M., MCU (CNU n°64), Lannes B., MCU-PH


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Annexe 2

Programmes des Enseignements modulaires Biologie et médecine de la Reproduction - Coordinateurs Stéphanie Warter - Manuel Mark (55h) Ontogenèse des gonades et du tractus génital (8 heures). Pr. M. Mark (PU/PH, Médecine et Biologie du Développement et de la Reproduction, section CNU 5405)

Ontogenèse des cellules germinales primordiales. Différenciation et fonctions des cellules de Sertoli embryonnaires. Cascades moléculaires impliquées dans la différenciation des caractères sexuels primaires Différenciations sexuelles pathologiques, états intersexués. Génération de modèles animaux en Biologie de la Reproduction : culture de cellules souches embryonnaires, transgenèse et knock-out.

Implantation et placentation (6 heures). Dr. S. Warter (MCU-PH, Médecine et Biologie du Développement et de la Reproduction, section CNU 5405)

Ontogenèse du placenta. Mécanismes cellulaires et moléculaires de l’implantation. Implantation et tolérance immunitaire. Vascularisation placentaire et échanges foeto-maternels.

Contrôle hormonal de la reproduction et régulations auto et paracrines intra-gonadiques (15 heures). Pr. N. Boehm (PU/PH, Histologie, Embryologie et Cytogénétique, section CNU 4202)

Fonctions des cellules de Sertoli ; barrière hémato-testiculaire. Folliculogenèse et hormones stéroïdes. Récepteurs de l’oestradiol, de la progestérone et de l’acide rétinoïque. Stratégies d’identification des gènes cibles des récepteurs nucléaires. Régulation hormonale de l’axe neuro-hypothalamo-hypophyso-ovarien. Action des stéroïdes sexuels sur les organes cibles Déterminisme hormonal de la puberté et de la ménopause.

Techniques en biologie de la reproduction (12 heures). Dr. S Viville (MCU-PH avec HDR Médecine et Biologie du Développement et de la Reproduction, section CNU 5405)

Analyse du sperme et tests fonctionnels. Insémination artificielle, FIV et ICSI : aspects techniques et médicaux. Congélation gamétique et embryonnaire : aspects biologiques et médicaux. Diagnostic préimplantatoire. Induction de l’ovulation.

Gamétogenèse, fécondation, et pathologies de la fertilité (14 heures). Pr. Y Rumpler (PU/PH, Médecine et Biologie du Développement et de la Reproduction, section CNU 5405).

Maturation des spermatozoïdes et des ovocytes. Mécanismes moléculaires de la reconnaissance inter-gamétique. Causes chromosomiques et génétiques des infertilités. Effets de l’environnement sur la fertilité. . Perturbations du tractus génital féminin et fertilité. Stratégies d’exploration de la fertilité. Aspects éthiques, juridiques et psychologiques de l’assistance médicale à la procréation.

Cancérologie - Coordinateur : Jean-Pierre Bergerat (54h) Biologie moléculaire de la cellule 14h

Structure et organisation du génome, Régulation de la transcription, Physiologie des récepteurs nucléaires, Structure et maturation de l’ADN Notions sur la réparation de l’ADN : lésions, senseurs, transducteurs et effecteurs Membrane cellulaire et transports transmembranaires. Trafic intracellulaire. Cytosquelette, phagocytose et mobilité, Adhésions et interactions cellulaires Transduction des signaux mitogènes et antiprolifératifs, Régulation du cycle cellulaire Méthodes d’étude de la prolifération cellulaire normale et pathologique Cellules souches et cellules proliférantes.Régulation de la différenciation cellulaire Mécanismes de l’apoptose


87

Mécanismes de la Cancérogénèse 13h Caractéristiques des cellules cancéreuses, histoire naturelle de la transformation cancéreuse, anomalies génétiques et sélections clonales ; oncogènes et gènes suppresseurs de tumeur Mécanismes génétiques et épigénétiques des anomalies de l’expression ou de l’activité des gènes impliqués dans la carcinogenèse. Différentes causes d’altérations génétiques Implication des mécanismes de réarrangement des gènes d’immunoglobulines et des récepteurs T dans la physiopathologie des lymphopathies malignes Cancérogène virale. Rôle des mutations et du polymorphisme des gènes modifiant la susceptibilité génétique aux cancers. Rôle des facteurs environnementaux, hormones et cancérogénèse Gènes impliqués dans le maintien de l’intégrité du génome Gènes impliqués dans la régulation de la prolifération cellulaire Gènes impliqués dans la différenciation cellulaire et la sénescence Syndromes de prédispositions héréditaires au cancer

Biologie de la progression tumorale 15h Instabilité génétique et instabilité chromosomique Etapes de la transformation cancéreuse in vitro- modèles expérimentaux Les étapes de la progression tumorale in vivo : des lésions pré-cancéreuses à la métastase Antigènes tumoraux et immunosurveillance Biologie de l’invasion, Biologie de la métastase Biologie de l’angiogénèse tumorale, Techniques d’analyse, Cytogénétique tumorale Implications du phénotypage moléculaire dans le dépistage, le pronostic et le traitement des cancers. Biologie moléculaire des cancers colo-rectaux Biologie moléculaire des leucoses myéloïdes Biologie moléculaire des sarcomes

Recherche en Thérapeutique Anticancéreuse 12h Chimiothérapie et agents cytotoxiques Techniques d’études in vitro de la réponse cellulaire aux agressions génotoxiques Techniques d’études chez l’animal, mécanismes de résistance Hormonothérapie : interaction avec les autres voies de signalisation cellulaire et nouvelles orientations Radiothérapie, effets biologiques des radiations ionisantes : optimisation des effets thérapeutiques, ciblage et potentialisation Effets biologiques et développement des rayonnements particulaires Développement thérapeutique : thérapie génique, thérapie cellulaire Vaccination antitumorales, ciblage moléculaire et nouveaux traitements anticancéreux

Génétique Humaine – Coordinatrice : Hélène Dollfus (50h) Génétique humaine : introduction générale 11h

Introduction générale Présentation générale de la génétique (clinique – cytogénétique et moléculaire). Les grandes étapes (historique de la découverte de l’ADN à nos jours…), - Les modes de transmission classiques vers le multifactoriel,recherches de gènes de prédisposition aux

maladies factorielles, les grands types de pathologies disséquées par la génétique Le diagnostic moléculaire de maladies monogéniques. Techniques du diagnostic des maladies monogéniques (dont diagnostic prénatal) Différents types de mutation Indications et intérêts du diagnostic moléculaire Stratégies de diagnostic moléculaire Les banques de données Situations classiques de conseil génétique et dilemmes éthiques liés au diagnostic

d’une maladie génétique. Pathologies chromosomiques, épigénétique 14h

Techniques chromosomiques . Cytogénétique conventionnelle : caryotype normal - cytogénétique moléculaire . Exploration des points de cassures des translocations . CGH + puces à ADN Anomalies chromosomiques : variété et structure Syndromes chromosomiques classiques et microdélétionnels Empreinte génomique


88

Pathologies du développement 8h Dysmorphologie et anomalies du développement- présentation générale Gènes du développement et cascades moléculaires (facteurs de transcription et récepteurs /ligands)

liées à des syndromes identifiés Syndromes classiques de dysmorphologies liés aux bases moléculaires

Pathologies héréditaires du système nerveux et sensoriel 12h Pathologies héréditaires neuromusculaires Pathologies sensorielles Dystrophies héréditaires de la rétine Surdités héréditaires

Métabolisme 5h Aspects moléculaires et génétiques de l’obésité. Pathologies métaboliques de l’enfant

Immunologie – Coordinateur : Siamak Bahram (50h) Immunologie fondamentale 20h Immunité innée. Complexe Majeur d’Histocompatibilité.

Immunorécepteurs. Tolérance immunitaire. Complément. Les intégrines et adressines. Les cytokines et leurs récepteurs.

Cellules NK et leurs récepteurs. Cellules dendritiques. Apoptose. Immunologie Médicale 20h Auto-immunité. Allergies/Asthme. Immunité anti-infectieuse. Immunité anti-tumorale. Déficits immunitaires. Greffes de cellules souches hématopoïétiques. Allogreffes et Xénogreffes d'organes. Traitements immunomodulateurs. Technologies 10h Transgénèse et recombinaison homologue. Bioinformatique, Génomique en Immunologie. Microbiologie Médicale – Coordinateurs : Gilles Prévost – Françoise Stoll-Keller (51h)

Epidémiologie des maladies infectieuses 9h

Mode de transmission des infections bactériennes à partir de l’environnement Infections bactériennes émergentes et ré-émergentes transmises par les arthropodes Epidémiologie et sélection des résistances bactériennes Mécanismes de transmission des virus Génétique et évolution des virus Les modalités du parasitisme et la dynamique des relations hôte-parasite Epidémiologie des infections à apicomplexa à transmission vectorielle ou directe Epidémiologie des infections fongiques opportunistes et nosocomiales

Interactions moléculaires et cellulaires Hôte-Pathogène 23h Stratégies invasives des bactéries Toxines bactériennes, superantigènes et endotoxines Virulence des bactéries à tropisme intestinal Actions des bactéries sur la signalisation cellulaire Régulation de l’expression des facteurs de virulence de Pseudomonas aeruginosa Mécanismes d’échappement des bactéries aux défenses de l’hôte Résistance aux anti-bactériens : aspects phénétiques et génétiques Effets des virus sur la biologie de la cellule Mécanismes d’adaptation des virus à leur hôte Résistance aux antiviraux Mécanismes moléculaires d'échappement des parasites extracellulaires aux défenses de l’hôte Mécanismes moléculaires d'échappement des parasites intracellulaires. Relation virulence, pathogénicité et souches parasitaires Interaction PAMPS (pathogen associated molecular patterns)-PRRs (pattern recognition receptors) : PRR solubles (opsonines), cellulaires (internalisation et/ou activation)

Physiopathologie des maladies infectieuses 19h Un modèle de bactérie toxinogène : Corynebacterium diphtheriae Un modèle de bactérie invasive : Listeria monocytogenes Un modèle bactérien de pathogénie mixte : Staphylococcus aureus Deux modèles de bactéries à développement intracellulaire obligatoire : Brucella et Coxiella burnetii


89

Réponse immunopathogène virale Modèles animaux Modèle d’infection virale chronique : l’hépatite C Modèle d’infection virale persistante : l’infection par le VIH : aspects moléculaires Modèle d’infection virale persistante : l’infection par le VIH : aspects physiopathologiques Modèle d’infection à prions Physiopathologie de l'infection à Plasmodium : un modèle d'infection vectorielle persistente Physiopathologie de l'infection à Toxoplasma : un modèle d'infection opportuniste Physiopathologies des candidoses invasives : un modèle d'infection nosocomiale

Terrains de stages pratiques M1

Cancérologie TD

Lieu du stage Responsable du stage

Contact Objectifs du stage Nb max d’étudiants par stage / Nb stage par an

Durée du stage

1 Ecole supérieure de biotechnologie de STG (ESBS)

bd S. Brandt 67400 Illkirch

Pr P. OUDET

secrétariat 03 88 12 75 35 Fax : 03 88 12 75 39• • E-mail [email protected]

- cultures cellulaires, études de la prolifération

- transfection d’un gène dans des cellules eucaryotes

- techniques d’étude de l’expression génique

4 / 1

5 jours x

7 h

2 Laboratoire de cancérologie

expérimentale et de

radiobiologie (LCER) EA3430- IRCAD

Hôpital Civil

Pr JP BERGERAT

• secrétariat 03 88 12 76 82 • E-mail [email protected]

- cultures cellulaires, méthodes d’étude de la prolifération cellulaire

- techniques d’étude de l’apoptose, des effets cytocinétiques et cytoxiques des agressions génotoxiques in vitro

- clonage et transfection d’un gène dans des cellules eucaryotes

2 / 1

5 jours x

7 h

3 Laboratoire de biologie

tumorale Centre Paul

Strauss

Dr J

ABECASSIS

• secrétariat 03 88 25 24 44 • E-mail : [email protected]

- Quantification de l’expression génique par PCR en temps réel

- Diagnostic moléculaire des prédispositions géniques au cancer, séquençage

- Immunohistologie

2 / 1

2 x 5

demies journées

4 U392S... Dr Francis RAUL

• secrétariat 03 88 11 90 23 • E-mail :

- Cultures cellulaires, étude de la prolifération

-

2 / 1

5 jours x

7 h

5 Laboratoire d’Hématologie

• secrétariat 03 88 12

- Etude du profil d’expression génique

2

5 jours


90

expérimentale Institut

d’Hématologie Hôpital Civil

Pr P LESSARD

• E-mail : [email protected]

par hybridation sur membrane ; acquisition d’image et analyse des résultats

- Amplification par PCR en temps réel

- Techniques d’études cytogénétiques des hémopathies et des tumeurs malignes

/ 1

x 7 h

6 Laboratoire INSERM-ULP

381 Dans l’enceinte de l’hôpital de Hautepierre

67200 Strasbourg

Dr Michèle KEDINGER


- Cultures cellulaires

- Techniques d’études de l’expression génique

- Techniques de transfert de gènes dans les cellules eucaryotes

- Xénogreffes tumorales chez la souris nude

2 / 1

5 jours

x 7 h

7 Laboratoire de l’Institut de

Biologie Moléculaire et

Cellulaire (IGBMC)

Dr Marie-Christine

RIO


- cultures cellulaires - techniques d’étude de l’expression génique

- transfert de gènes dans les cellules eucaryotes

- techniques d’étude de la croissance tumorale, de l’invasion et de la métastase chez l’animal

2 / 1

5 jours

x 7 h

8 Laboratoire de l’Institut de

Biologie Moléculaire et

Cellulaire (IGBMC)

Dr

Bohdan WASYLYK


- technique de criblage différentiel d’expression génique par hybridation soustractive

- transfection génique dans celles eucaryotes et étude du pouvoir transformant du cycle cellulaire et de l’apoptose

2 / 1

5 jours

x 7 h

Génétique humaine

Lieu du Stage Responsable du

laboratoire Contact (secrétariat) et E.mail

Objectifs et possibilités du stage (présentation aux étudiants)

Nombre d’étudiants maximum au cours d’une même période stage

Préférence pour stage d’une semaine ou de 15 J

Laboratoire de Diagnostic Génétique –Faculté de Médecine 9ème étage Batiment 3

Pr JL MANDEL [email protected]

Techniques de biologie moléculaire appliquées au diagnostic.

2 maximum 1S ou 15J De préférence pas pendant juillet-août


91

Laboratoire de cytogénétique – Hôpital de Hautepierre – 3ème étage

Docteur E. FLORI

: 03.88.12.73.38 ou 03.88.12.73.39 Fax : 03.88.12.73.37 E-mail : [email protected]

* cultures cellulaires* techniques chromosomiques : conventionnelles avec classement de caryotypes et cytogénétique moléculaire

2 - 1 semaine à temps plein (dates à convenir au cas par cas)

Laboratoire du LGME Faculté de Médecine

Dr F. PERRIN-SCHMITT

: 03 90 24 33 36 [email protected]

Recherche de mutations dans des pathologies humaines-modèles Animaux

? 1 semaine à plein temps

IGBMC

Pr M KOENIG Dr S. Du Manoir Dr P. Dolle

: 03 88 65 33 99 Fax : 03 88 65 32 46 [email protected]



études de liaisons génétiques par génotypage, recherche de mutations par séquençage direct de produits PCR Utilisation des puces à ADN pour l’analyse des pertes et gains chromosomiques Analyse de l'expression de genes dans des modeles animaux de pathologies du developpement

2 fois 1 étudiant 1 2

stages de 15 jours à mi-temps 15 x ½ journée hors été 1 semaine plein temps

Microbiologie Médicale – formations pratiques affichées (40 heures) Lieu de stage, équipe

Responsable équipe

Contact e-mail Objectifs du stage Nb d’étudiants maximum

Préférences : 5 J ou 10 1/2J périodes exclues

UPRES EA-3432

G . Prévost D. Colin Y. Piémont B. Jaulhac F. Jehl

[email protected] didier.colin@medecine ... [email protected] [email protected] franç[email protected]

Purification de protéines Typages moléculaires Cytométrie en flux 1. Infections expérimentales par Bartonella et Borrelia burgdorferi 2. Techniques d’étude de l’expression in vivo de gènes de Bartonella et Borrelia burgdorferi Bactéricidie dynamique des antibiotiques

1 1 2 1 1 2

Au cas par cas ‘’ une seule période cas par cas cas par cas


92

J.M. Scheftel

[email protected]

Expression de facteurs de virulence de Bordetella pertussis

2

5 jours

Etablisse- ment Français du Sang - Alsace INSERM E 0345

R. Drillien D. Spehner

[email protected] [email protected]

Culture et infection de cellules dendritiques humaines par le virus de la vaccine Localisation d’antigènes par la microscopie électronique

1 1

Cas par cas Cas par cas

INSERM U 392

E. Candolfi

[email protected]

1. Etablissement de

modèles expérimentaux murins d'infections parasitaires

2. Technique de quantification tissulaire parasitaire par cytométrie en flux

3. Techniques d'évaluation quantitative de l'expression de cytokines par RT-PCR quantitative et par immunoenzymologie

2

5 jours

Institut de Virologie INSERM U544

A.N. Aubertin/ C. Moog JL Gendrault JP Gut MP Schmitt F Stoll-Keller

[email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected]

Labo P3: multiplication virale (souches VIH) sur cultures de cellules Culture de cellules infectées par un virus cytopathogène et leur observation en microscopie électronique ELISA pour la recherche de l’avidité antivirale Amplification génique : extraction d’acide nucléique, PCR, électrophorèse, analyse PCR en temps réel. Application à la Virologie

1 2 2 2 2

5 jours

Biologie et Médecine de la Reproduction

Lieu de stage, équipe

Responsable équipe

Contact e-mail Objectifs du stage Nb d’étudiants maximum

Préférences : 5 J ou 10 1/2J périodes exclues

UPRES EA-3428

Yves Rumpler

[email protected]

hybridation in situ sur chromosomes

2

cas par cas


93

IGBMC, UMR 7104 – INSERM 596

S.Viville J. Auwerx N. Ghyselinck et M. Mark D. Metzger R. Losson

[email protected] [email protected] [email protected] [email protected] [email protected]

initiation à la culture cellulaire PCR quantitative Hybridation in situ sur embryons entiers Mise en evidence de l'invalidation d'un gene cible par mutagenèse somatique conditionnelle chez la souris RT-PCR quantitative, protéomique, Application à la recherche de gènes cibles

2 2 2 2 2

cas par cas cas par cas cas par cas cas par cas cas par cas

Conférences « Questions d’actualité en Physiopathologie Une série de sujets de conférences a déjà été envisagée par des enseignants-chercheurs de certains des modules. Les sujets de ces conférences évolueront bien sûr d’année en année : Microbiologie médicale

*Difficultés de mise au point des vaccins anti-parasitaires. N. Boulanger. *Les vaccins à ADN dans les infections à apicomplexa. D. Filisetti. *Stratégies vaccinales. (E. Candolfi ??? et quelqu’un de virologie comme A.M. Aubertin ou R. Drillen ou C.

Moog). *Stratégie vaccinale contre les infections virales persistantes. C. Moog. Les modèles animaux de l’infection congénitale à Toxoplasma gondii. E. Candolfi. Mécanismes moléculaires des interactions entre les cellules de l’immunité maternelle et les trophoblastes

fœtaux, modèles in vitro et in vivo. A. Pfaff. Les mécanismes moléculaires de résistances des agents fongiques aux anti-fongiques, exemple des Candida.

V. Letscher-Bru. Modulation de la réponse innée et adaptative par les arthropodes-vecteurs. N. Boulanger. *Modèles animaux expérimentaux en pathologie infectieuse. Y. Piémont, G. Prévost (aspects

règlementaires), F. Jehl Approches physiopathologiques de l’étude des Borrélioses. B. Jaulhac. Pharmacodynamie des antibiotiques. F. Jehl. *Approches biologiques et moléculaires pour l’étude des toxines formant des pores. G. Prévost/D. Colin. Toxi-infections alimentaires : aspects moléculaires et cellulaires. C. Harf-Monteil. Infections virales émergentes. E. Schvoerer. Développement de molécules antivirales. M.P. Schmitt. Nouvelles stratégies antivirales basées sur le contrôle d l’expression des gènes viraux.

C. Schuster. Echappement du virus au système immunitaire. J.P. Martin. Physiopathologie des infections à Papillomavirus. F. Stoll-Keller.

Cancérologie • Biologie moléculaire des sarcomes des tissus mous. A Aurias Institut Curie, Paris


94

• Thérapie cellulaire et génique des mélanomes. MF. AVRIL Institut Gustave Roussy, Paris • Biologie de la cellule dendritique. D Hanau ETS, Strasbourg • Histoire naturelle et traitement des cancers de la prostate. B Wasykyk IGBMC, Strasbourg • Cancers du sein. JP Bellocq/C Mathelin Hôpitaux Universitaires Strasbourg • Métaloprotéases et cancers. MC Rio IGBMC, Strasbourg • Biologie moléculaire des lymphomes. L Mauvieux Laboratoire d’Hématologie Expérimentale • Cytogénétique des leucoses aiguës lymphoïdes M Lessard Laboratoire d’Hématologie Expérimentale • Techniques d’étude de la maladie résiduelle en cancérologie. P Oudet ESBS-HUS • Inhibiteurs de Tyrosine Kinases en thérapeutique anti-cancéreuse. P Dufour HUS • Biologie des cancers des VADS. J Abecassis Centre Paul Strauss Immunologie 1. Génétique des déficits immunitaires. 2. Recherche translationnelle en immunologie: de la paillasse à la clinique et vice versa. 3. Immunogénomique. Génétique humaine 1. Récepteurs nucléaires et capteurs métaboliques. Auwerx Johan (IGBMC, Illkirch) 2. Pathologies du métabolisme mitochondrial Arnold Munnich ou Pascale De Lonlay (Hôpital Necker Enfants Malades, Paris) 3. Pathologies génétiques constitutionnelles osseuses. Dr Valérie Cormier-Daire (Hôpital Necker Enfants Malades) 4. Pathologies de réparation de l'ADN. Alain Sarasin (IGR,Villejuif) ou JF Egly (IGBMC) 5. Vieillissement et progeria. Nicolas Levy (AHP Marseille).


95

Annexe 3

Réponse à l’évaluation de la CEPPE de Février 2005 et modifications apportées au dossier

Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire (ULP) L’évaluation a relevé un manque de cohérence pour deux des options proposées : Pharmacologie

expérimentale et Histologie fonctionnelle. Si la première de ces deux options a été supprimée, nous avons concernant la seconde, à répondre aux contraintes de collègues responsables des UE obligatoires qui ont :

- réduit de 6 à 3 crédits l’UE Stratégies d’étude de la cellule (SRC) - restreint l’UE Imagerie Moléculaire et Cellulaire 6 crédits à 3 crédits d’une UE maintenant intitulée

Instrumentation en imagerie moléculaire de la cellule 3 crédits et ouverte aux autres étudiants créant ainsi un déficit pour le versant de notre formation à la biologie cellulaire et tissulaire. C’est dans

ce contexte que nous proposons d’intégrer deux UE obligatoires de 3 crédits, l’une au S1 constituera une familiarisation des étudiants avec la pathologie tissulaire et cellulaire ; l’autre sera enseignée en S3 et sera plus axée sur les méthodes de caractérisation des pathologies tissulaires et cellulaires que peuvent offrir les différentes instrumentations en imagerie cellulaire.

Autres modifications apportées : Conscients du fait que nous demanderons aux étudiants de choisir un enseignement à la carte de 3

disciplines parmi 5 (Biologie et médecine de la reproduction, cancérologie, génétique humaine, immunologie ou microbiologie médicale), il nous parait impossible d’exclure des étudiants qui seraient intéressés par une 4ème discipline. C’est pourquoi nous proposons d’ouvrir les Cours Magistraux de ces disciplines au titre des options, et pour permettre un droit au remords des étudiants séduits par l’une de ces disciplines – options, nous installerons un système de compensation de crédits au second semestre qui s’accompagnera pour ces étudiants de devoir valider d’autres crédits d’options, mais aussi de pouvoir valider les stages en laboratoire correspondant.

Ainsi, le choix dit à la carte pourra entièrement être respecté. D’autre part, nous avons décidé de réduire les crédits d’Ouverture Professionnelle à 3 crédits et de les

faire « glisser » vers ceux de l’lnitiation tuteurée à la recherche, l’amenant ainsi à 6 crédits, et permettant aux étudiants de réellement bâtir un projet scientifique. Enfin, des stages en laboratoires seront acceptés au titre des 3 crédits d’enseignement libre de S3.

Enfin, la réflexion sur l’intégration des étudiants médecins, pharmaciens et dentistes est maintenant

formalisée au travers d’une plaquette d’information ci-jointe en Annexe 4.


96

Annexe 4 Plaquette d’information Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire

Responsables : Pr S. Bahram Dr G. Prévost Centre de Recherches d’Hématologie UPRES EA-3432, Institut de Bactériologie

et d’Immunologie de la Faculté de Médecine, de la Faculté de Médecine, 3 rue Koeberlé, 4 rue Kirschleger, F-67000 Strasbourg. F-67085 Strasbourg cedex Tel : 03 90 24 37 57 Tél. : 33 3 90 24 39 92 Fax : 03 88 25 11 13 Fax : 03 90 24 40 16 E-mail : [email protected] E-mail : [email protected]

Préambule Cette formation à la recherche médicale repose sur un enseignement à la carte de trois parmi cinq disciplines : Biologie et Médecine de la Reproduction, Cancérologie, Génétique Humaine, Immunologie, Microbiologie Médicale. Elle est complétée par des enseignements d’initiation à la recherche : Identification des altérations cellulaires, technologies actuelles, communication, projet scientifique ; et des enseignements par la recherche : TP en laboratoires, conférences sur thèmes, information sur les carrières. ♫ Première information : 9ème Forum Formation Emploi Entreprise en Science de la Vie du 15-17 Mars 2005.

Comment m’engager dans le Master ? Je suis étudiant des Sciences de la Vie, je peux m’inscrire en 1ère année si je suis titulaire de : Licence de Biochimie ou Licence de Biologie, mention Biologie cellulaire et Physiologie à l’Université Louis Pasteur ou Licence équivalente dans une autre université. Pour les étudiants venant d’une autre université, la commission pédagogique de la spécialité examinera leur dossier. Je suis étudiant en Médecine, je peux m’inscrire en 1ère année si je suis titulaire de : PCEM2 Je suis étudiant en Pharmacie, je peux m’inscrire en 1ère année si je suis titulaire de : Seconde année d’études en Pharmacie Je suis étudiant en Odontologie, je peux m’inscrire en 1ère année si je suis titulaire de : PCEO2

Effectif envisagé : 20 – 35 étudiants en M1 et en M2


97

Combien de crédits (ects) d’enseignement devrais-je valider pour obtenir ma 1ère année (M1) ?

1ère année M1 Semestre S1, nombre d’ects Semestre S2, nombre d’ects Scientifiques 30 30 Médecins, Pharmaciens, Dentistes

9 + 3 + 3 = 15* + 15** 9 + 3 + 3 = 15* + 15**

* parmi lesquels 3 ou 6 ects Langues pourront être obtenus en équivalence s’ils sont validés au cours des études

médicales + 3 ects qui pourront être validés pour les études médicales au titre stage en laboratoire (ex : DCEM3 pour les médecins faisant partie du stage radiologie, laboratoire, psychiatrie)

** 15 ects par semestre seront obtenus en équivalence des études médicales, pharmaceutiques ou odontologiques

avec la validation du DCEM4, de la 5ème année d’études pharmaceutiques, de la troisième année du second cycle (DCEO3) des dentistes.

Cette inscription constituera :

- mon inscription principale si je suis scientifique - une inscription secondaire si je suis médecin, pharmacien, dentiste Je retire les dossiers d’inscription et m’inscrit à la Faculté de Médecine de Strasbourg Je suis titulaire d’une MSBM, en conserverai-je le bénéfice ? Oui, les certificats de MSBM acquis ouvriront une équivalence de 9 crédits sur 5 années au moins à compter de leur obtention. Deux certificats de MSBM peuvent procurer une équivalence de M1, si l’on additionne les équivalences de langues et de stage en laboratoire. Attention ! les certificats doivent suffisamment coïncider avec les disciplines traitées dans les Masters. Les certificats de MSBM étaient valorisés au titre des enseignements optionnels dans les études médicales, pharmaceutiques et odontologiques, et maintenant ? Les titulaires d'unité d'enseignement/ou de modules obtenus durant le master pourront bénéficier de la dispense d'un enseignement complémentaire (afférent au DCEM1 pour Médecine) ou d'un enseignement optionnel (pour les DCEM2, DCEM3 ou DCEM4) selon les dispositions prises par les conseils d'UFR. Pourrai-je valider M1 sur plusieurs années ? Oui, du DCEM1 au DCEM4 pour les médecins, de la troisième à la cinquième année pour les pharmaciens, de DCEO1 à DCEO3 pour les dentistes Je suis étudiant des Sciences de la Vie, je peux m’inscrire en 2nde année si je suis titulaire d’une maîtrise de : - Biochimie mention biochimie moléculaire et cellulaire option biologie du développement - Biochimie mention biochimie moléculaire et cellulaire option biologie moléculaire générale - Biologie Cellulaire et Physiologie mention physiologie option physiologie générale et pharmacologie ou option Biologie des Micro-Organismes de l’Université Louis Pasteur ou une maîtrise acquise dans une autre Université jugée équivalente ou une année M1 acquise dans une autre Université jugée équivalente ... par la Commission Pédagogique de la spécialité qui examinera les dossiers NB : Le cas des étudiants en cours de validation d’un DEA (2 ans) sera examiné par la commission pédagogique, afin qu’une solution soit trouvée.

→ L’accès à la seconde année de Master M2 pour les étudiants Médecins, Pharmaciens et Dentistes est envisageable après les validations de DCEM-4 et M1 et lors des années « Recherche » durant leur Internat, ou lors d’un second DCEM-4.


98

Programme de la spécialité Physiopathologie Cellulaire et Moléculaire - PCM M1 –semestre 1 (MS1) – modules obligatoires et modules obligatoires à choix en gras – 30 ou 15 ects Unités d’enseignement Scientifiques Médecins, Pharmaciens, Dentistes Modules disciplinaires (6 + 3 ects) Cancérologie (CAN) ou Génétique humaine (GHU)

9 ects 9ects

Acquisition et analyse de résultats, banques (ABL) 3 3 Stratégies de recherche sur la cellule (SRC) 3 -

Histologie appliquée (HIA) 3 - Options : 6 ects à valider en MS1 ou MS2 parmi Mécanismes de transcription de l’information génétique (TIG) Mécanismes post-transcriptionnels de l’expression gen. (MTT) Biologie du développement animal (BDA) – 6 ects Physiologie et physiopathologie (RMM) – 6 ects Pathogénèse virale et lutte anti-virale (PVL) – 6 ects Virus en recherche fondamentale et appliquée (VFA) – 6 ects Cancérologie (CAN)* – 6 ects Immunologie (IMM)* – 6 ects

6 ects en MS1 ou en MS2

-

Langues 3 3 Enseignement libre 3 - M1 –semestre 2 (MS2) – 30 ou 15 ects Unités d’enseignement Scientifiques Médecins, Pharmaciens, Dentistes Modules disciplinaires (6 + 3 ects) Biologie et Médecine de la Reproduction (BMR) ou Immunologie (IMM) ou Microbiologie Médicale (MIM)

9 + 9 ects 9ects

Technologies de la Biologie Moléculaire et Cell. (TBR) **

3 3 ou **

Compte-rendu bibliographique** 3 3** Options : 6 ects à valider en MS1 ou MS2 parmi : Interaction hôtes-microorganismes (IHM) .Immunologie (IMM)* Biologie et Médecine de la Reproduction (BMR)* Microbiologie Médicale (MIM)*

3 + 3 ects en MS1 ou en MS2 ..si 6 ects de module validés en MS1 !

-

Langues 3 3 Enseignement libre 3 - * Pour assurer un accès maximal aux options quand elles seraient enseignées au 2nd semestre et pour permettre aux étudiants de valider jusqu’à 4 modules « PCM » stricto sensu de leur choix, les modules disciplinaires (cours magistraux) sont également affichés dans les options. Les étudiants de la spécialité PCM pourront seuls valider des stages de TP en labo durant les enseignements libres et ensuite valider par compensation des crédits de modules (6) au titre des options au cours du 2nd semestre. ** ces deux Unités d’Enseignement sont au choix pour les étudiants Médecins, Pharmaciens, Dentistes.


99

M2 – semestre 1 (M2-S3) – 30 ects Unités d’enseignement Scientifiques Médecins, Pharmaciens, Dentistes Instrumentation en Imagerie moléculaire de la cellule(IMC) (3 ects)

3 ects 3 ects

Histologie fonctionnelle (HIF – 3 ects) 3 3 Questions d’actualité en Biologie Cellulaire (3 ects) 3 3 Questions d’actualité en Physiopathologie (9 Ects) 3 conférences dans chacune des 5 disciplines

9 9

Ouverture Professionnelle (6 ects) Sécurité, qualité, traçabilité en laboratoire Propriété intellectuelle Carrières de la Recherche, projet scientifique CV, choisir un laboratoire d’accueil

3 3

Initiation tuteurée à la recherche Préparation d’un sujet de stage – projet scientifique

6 6

Enseignement libre 3 3 M2 –semestre 2 (M2-S4) – 30 ects Unité d’enseignement Scientifiques Médecins, Pharmaciens, Dentistes

Stage en laboratoire 30 30 Liste des Unités soutenant cette formation IBMC : UPR 9021 (S. Muller), UPR 9022 (J.L. Imler),

ESBS : UPR9003 (G. De Murcia),

DKFZ : INSERM U375 (Heidelberg – J. Rommelaere),

UNIVERSITE DU LUXEMBOURG : Biologie et Physiologie Intégrée (Luxembourg, CNRS/GDRE-ITI – N. Kieffer),

Biologie Moléculaire analyse génique et modélisation (Luxembourg, E. Friederich), Immunogénétique et Allergologie

(Luxembourg, F. Hentges)

CAMPUS MEDECINE STRASBOURG : U381 (UMR – M Kedinger), U666 (- N. Boehm), U596/UMR7104 (IGBMC –

J.L. Mandel), E0222 (T. Martin), E0345 (D. Hanau), CRES Immunologie Moléculaire Humaine (S. Bahram), EA

3428 ( Y. Rumpler, B. Ludes), EA-3430 (J.P. Bergerat), E-3432 (H. Monteil – Y. Piémont), EA-3770 (F. Stoll-Keller),

EA-3771 (N. Frossard), EA H. Candolfi, EA H. Dollfus,

Noms des membres de la Commission Pédagogique Prs Bahram, Bergerat, Boehm, Candolfi, Dollfus, Dufour, Imler, Koenig, Ludes, Mandel,

Mark, Piémont, Sibilia, Stoll-Keller, Viville, Wachsmann Drs Devys, Egly, Flory, Freyssinet, Ghyselinck, Hanau, Kedinger, Korganow, Kurtz,

Letscher-Bru, Perrin-Schmitt, Radosavljevic, Rio, Schuster, Warter

Dossier Pedagogique Spe Physiopath Cellul Moleculaire

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