Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II....

22
Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5

Transcript of Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II....

Page 1: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Bi 231: Ingénierie des Protéines

cours 5

Page 2: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Plan Général

• I. Introduction et rappels.• II. Purification des protéines.• III. Surexpression d'une protéine.• IV. Mutagenèse: techniques et applications. • V. L'insuline : exemple d'une stratégie.• VI. Analyse d'articles.

Page 3: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

V. L'insuline : exemple d'une stratégie.

• 51 –Introduction

• 52 –Historique : de Banting à Sanger

• 53 –Les stratégies utilisées.

Page 4: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

51 –Introduction : Rôles, fonctionnement, structure et enjeux

médicaux.

Insuline : • hormone sécrétée par le pancréas. • sécrétée dans le sang après

ingestion de sucres.• provoque absorption du sucre par

les cellules (médiée par des récepteurs spé).

Page 5: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Régulation de la glycémie chez les

mammifères :

Rôle + du glucagon relargage par le foie

Rôle – de l'insuline Absorption cellulaire du glucose notamment

par adipocytes

Page 6: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Diabète :déficience en insuline

• sans insuline problèmes majeurs d'assimilation du glucose au niveau cellulaire.

• Diabète de type I : déficit de production de l'insuline.

• Diabète de type II : problème de transduction du signal sur cellules réceptrices.

Page 7: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Diabète de type I

• Due à réaction auto-immune :

Ac ilôts de Langerhans

hyperglycémie

coma

mort

• 10% des diabétiques• Apparition favorisée

par infection par certains virus (EBV,...), traitement médicaux,

chirurgicaux.

Traitement : injection régulière d'insuline.

Page 8: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Diabète de type II• Due à mauvaise

alimentation + terrain génétique.

hyperglycémie chronique

problèmes cardiaques,

visuels,rénaux, neurologiques, ...

• 90% des diabétiques.•Chez sujets adultes,

agés• Apparition

multifactorielle :génétique, alimentaire,

autoimmune (Ac insuline-recepteur),...

Traitement : régime alimentaire, hygiène de vie +traitement médicamenteux.

Page 9: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Les différents types d'insuline disponibles : Analogues d'insuline :

action rapide action prolongée Biphasique

Onset: 10-20 minutesMaximum effect: 1-3 hoursDuration: 3-5 hours

Onset: 1 hourDuration: 24 hours

Onset: 10-20 minutesMaximum effect: 1-4 hoursDuration: up to 24 hours

Insuline humaine:action rapide action intermédiaire prémixée

Onset: within 30 minutesMaximum effect: 1-3 hoursDuration: 8 hours indication : 30 min after meal

Onset: within 1.5 hoursMaximum effect: 4-12 hoursDuration: 24 hours

Onset: within 30 minutesMaximum effect: 2-8 hoursDuration: 24 hours composition : 30% rapid, 70% isophane

http://www.novonordisk.com/diabetes/public/diabetestools/insulins/default.asphttp://www.novonordisk.com/diabetes/public/diabetestools/handsoninsulin/default.asp

Page 10: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Structure de l'insuline

• Formée de 2 chaînes, A et B

• synthétisée sous forme de proinsuline

Page 11: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Séquence de l'insuline Préproinsuline humaine

peptide B :31 aa peptide A : 20 aapeptide signal peptide C

FVNQHLCGSHLVEALYLVCGERGFFYTPKT D fSL

RREAEDLQVGQVELGGGPGAGSLQPLALEGSLQKRHL

GIVEQCCTSICSLYQLENYCN L

accumulation de proinsuline (FS diabète de type II)

Page 12: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Comparaison avec autres insulines animales

Page 13: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

V. L'insuline : exemple d'une stratégie.

• 51 –Introduction sur Insuline : Rôles, fonctionnement, structure, enjeux médicaux.

• 52 –Historique : de Banting à Sanger

• 53 –Les stratégies utilisées.

Page 14: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

52 –Historique : de Banting à Sanger.

• 1889 : Ablation du pancréas induit un diabète chez le chien.

• 1908 : Restauration de la glycémie par injection d'extrait de pancréas chez chien sans pancréas.

• 1921 : Extraction d'une hormone antidiabétique simultanément par 2 équipes : Bucarest (Paulesco)

Toronto (Banting & Macleod).• 1922 : premiers patients traités et sauvés à Toronto• 1923 : Banting & Macleod : prix Nobel de médecine• 1925-1970 : amélioration de la pureté et des formulations

(1ère insuline retard par ajout de Zn, protamine)

Page 15: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

52 –Historique : de Banting à Sanger.

• 1926 :cristallisation de l'insuline• 1958 : détermination de la structure chimique de

l'insuline (1ère protéine séquencée): prix Nobel de chimie pour Sanger.

• 1967 : Séquence de la proinsuline.• 1969 : Structure 3D de l'insuline.• 197n : "humanisation" de l'insuline porcine.• 1982 : production d'insuline recombinante.• 1983 Amélioration du procédé

Page 16: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

V. L'insuline : exemple d'une stratégie.

• 51 –Introduction sur Insuline : Rôles, fonctionnement, structure, enjeux médicaux.

• 52 –Historique : de Banting à Sanger

• 53 –Les stratégies utilisées.

Page 17: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

53 –Les stratégies de purifications utilisées.

• A partir de pancréas : extraction acide dans éthanol et précipitation / sels.

• Conversion d'insuline porcine.

• Surproduction d'insuline.

• Surproduction de proinsuline.

Page 18: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

A partir de pancréas

• Le pancréas est découpé en morceaux,• Suspendu dans ethanol à pH 2 (inactivation de

la trypsine),

• neutralisation / CaCO3,

• précipitation par sels (KCl, NaCl, SO4(NH4)2, ...),

• resuspension dans eau et précipitation par acidification

• + chromatographie : Gel filtration et/ou échangeuse d'ions

Page 19: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Conversion d'insuline porcine.

= remplacement AlaThr

• purification insuline (cf précédent),• conversion : insuline (porc) + Trypsine +

thréonine ester dans eau+solvant organique (diminue activité peptidase de trypsine et favorise la réaction inverse),

rendement <97 %• Purification par chromatographie(s)

Page 20: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Surproduction d'insuline.

• Production séparée des chaînes A et B chez E. coli. Les peptides étaient co-exprimés avec autre protéine (-gal, TrpE, ...).

• séparation /protéolyse

• 2A +1B sulfoné (cys-SO2) + mercaptoethanol, 24H

60 % rendemment.• purification / chromatographie

phase inverse

Page 21: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Surproduction de proinsuline.sur expression chez E. coli (1982)• insertion du cDNA de la préproinsuline dans une

vecteur bactérien.• surproduction avec protéine de fusion (idem).• coupure / protéase proinsuline• oxydation des cystéines• repliement de la protéine en présence de

réducteurs.• coupure par protéase spécifique• purification par chromatographie

Page 22: Bi 231: Ingénierie des Protéines cours 5. Plan Général I. Introduction et rappels. II. Purification des protéines. III. Surexpression d'une protéine.

Surproduction de proinsuline.

sur expression chez S. cerevisiae (1988)• insertion du cDNA de la préproinsuline dans une

vecteur de levure.• surproduction avec protéine de fusion (idem).• coupure / protéase proinsuline insuline• purification par chromatographies