amikul [Autosaved]

8/19/2019 amikul [Autosaved]

1/84


2/84

Asam Amino

• Asam Amino adalah molekul yang terdiri

dari gugus asam karboksilat dan gugus

amin.

• Asam Amino memainkan peran sentral,

sebagai building blocks dari protein dan

sebagai bentuk antara pada metabolisme.


3/84

RUMUS UMUM ASAM

AMINO

R = rantai samping


4/84


5/84

• rotein adalah polimer dari berbagai unit

monomer yang disebut asam amino, yang

mempunyai gugus !ungsi berbeda tersebut.

• "ebih dari #$$ asam amino yang ada di

alam, tetapi protein dengan berbagai

species, yang terdapat pada bakteri sampaimanusia, hanya terdiri dari %$ asam amino

utama.


6/84

• rotein dapat berinteraksi dengan protein

lainnya dan biomolekul untuk membentuk

struktur yang lebih komleks dan kuat dan!leksibel dalam !ungsi yang berbeda&beda.


7/84

Subdivisi Asam Amino

• Ada %$ asam amino utama yang membangun protein.

• Masing&masingnya mengandung gugus !ungsi yang unik

untuk kepentingan yang berbeda&beda.

• 'epentingan tersebut meliputi ( )esar, Ruang, Muatan

serta kapasitasnya untuk membentuk ikatan hidrogen, baik

secara hidro!ilik*hidro!obik , dan reakati!itas kimia.

•Asam Amino dapat bersi!at hidrofobik dan hidrofilik ,tergantung kepada si!at kimia dari gugus R nya.


8/84

ASAM AMINO

1. Merupakan "building Blocks" tubuh kita. Selain

membangun sel baru dan memperbaiki aringan

!ang rusak mereka uga membentuk antibodi

untuk mela#an serangan bakteri $ %irus.

&.Bagian dari sistim en'im $ hormonal.(.Membangun nukleoprotein )*NA $ RNA+

,.Memba#a oksigen keseluruh tubuh dan

berpartisipasi dalam akti-itas otot. rotein !ang

pecah pada proses pencernaan akanmenghasilkan && asam amino. *elapan

diantaran!a adalah esensial dan lainn!a non/

esensial.


9/84

Zwitterion :

• Asam amino akan bersi!at sebagai

+itterionik, bila gugus asam karboksilat

melepaskan proton, sedangkan gugus aminomenerima proton dalam keadaan serentak.


10/84

dimana asam karboksilatnya dalam

keadaan berair terionisasi dan gugus

basanya (gugus amino) terprotonkan.

0&N 2 2OO0 30(N 2 2OO/

H3N+ C C

H

H

O

O-

BENTUK MOLEKULBENTUK ION I!OL"#

(ION 45I667R)

#E"K$I !#OTOLI$I$ "$"M "MINO "L"M L"#UT"NN%"

"!"T ITULI$K"N $BB &


11/84

Optik Aktiv

• 'lasi!ikasi asam amino di bedakan dalam beberapakategori, berdasarkan si!at dari rantai sampingnya

- R , yakni bila atom karbon yang tetrahedral

berikatan dengan unsur atau molekul yang berbeda&

beda ( kiral ).

• 'emampuan molekul untuk berotasi memutar bidang

polarisasi cahaya ke kiri, " -levorotary atau ke

kanan, / -dextrorotary menyatakan si!at optiknya

dan 0uga stereokimianya.

• Semua asam amino pada polipeptida adalah dengan

kon!igurasi ".


12/84

"nggota yang paling seder'ana dari

asam amino adala' glisin. "tom

karbon enu'nya tidak tersubstitusi

dengan demikian dia tidak optis

aktiv.


13/84

Substituen pada atom karbon alfa :

- Gugus alkil rantailurus/berabang

atau aromatik.

- !lkil amina/amina aromatik - !lkil alko"ol/alko"ol aromatik.

- #iol $belerang%


14/84

Substituen pada atom karbon alfa

tersebut diberi singkatan & $rantai

samping%

&antai sampin ada 'an

bersifat

!sam( basa dan netral.


15/84

1M)A2IAN 2O"ON2AN ASAM

AMINO• )erdasarkan si!at kepolaran dari R(

R 3 NON O"AR

Asam amino R 3 O"AR


16/84

Klasifikasi Asam Amino

• Non-polar

• Aliphatic ( glycine, alanine, 4aline,

isoleucine, leucine

• Aromatic ( phenylalanine, tryptophan.

• yclic ( roline


17/84

• Polar

• Sulfur!ontainin" ( cysteine, methionine

• #ydroxyl!ontainin" ( serine, threonine

• Aromatic ( tyrosine

• Acidic Amide ( asparagine, glutamine


18/84

• Muatan asam amino -pada p5 !isiologi

• Asam ( aspartic acid, glutamic acid

• $asa ( histidine, lysine, arginine


19/84

%$ Asam Amino

6h i d


20/84

6he genetic code

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/en/d/d6/GeneticCode21-version-2.svg


21/84

8lisin9 asam amino yang paling seder'ana.

alam protein dengan *oded (*odon) &22U, 227, 22A dan 222.

$i+at & neorotransmiter antagonis.


22/84

Glisin adala" asam aminountuk biosintesa : asam

nukleat( asam empedu(

porfirin( kreatin posfat danasam - asam amino lain.


23/84

%hysiolo"ical function

• 6he principal !unction o! glycine is as a

precursor to proteins, such as its

periodically repeated role in the !ormationo! 7ollagen heli8 in con0unction ith

5ydro8yproline. It is also a building block

to numerous natural products.

http://en.wikipedia.org/wiki/Collagenhttp://en.wikipedia.org/wiki/Hydroxyprolinehttp://en.wikipedia.org/wiki/Hydroxyprolinehttp://en.wikipedia.org/wiki/Collagen


24/84

As a neurotransmitter

• 2lycine is an inhibitory neurotransmitter in

the central ner4ous system, especially in the

spinal cord, brainstem, and retina.

http://en.wikipedia.org/wiki/Neurotransmitterhttp://en.wikipedia.org/wiki/Central_nervous_systemhttp://en.wikipedia.org/wiki/Spinal_cordhttp://en.wikipedia.org/wiki/Spinal_cordhttp://en.wikipedia.org/wiki/Central_nervous_systemhttp://en.wikipedia.org/wiki/Neurotransmitter


25/84

&lisin men"alami de"radasi melalui ti"a alur

• 9. Alur pertama ( Umumnya ter0adi pada hean, yaknimeliputi katalisis oleh en+im

&lisin ' tetrahidrofolat ' A' * O+ ' #, ' ' N5- N10!.etilen tetrahidrofolat ' A# ' # '

• %. Alur kedua ( glisin didegradasi dalam dua tahap.6ahap I merubah glisin men0adi serin dengan en+imserin hidroksimetil trans!erase. 6ahap II, Serin dirubahmen0adi piru4at melalui serin dehidratase.

• :. Alur ketiga ( glisin dirubah men0adi glioksilat dengan bantuan /&asam amino oksidase. 2lioksilat kemudiandioksidasi oleh hepatik laktat dehidrogenase men0adioksalat dalam adanya NA/;


26/84

Alanin Asam amino yang banyak bergunadalam protein. isomer "&nya adalah satu dari %$

asam amino yang proteinogenik . 7odonnya adalah

27U, 277, 27A, dan 272.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/alanine.htmlhttp://en.wikipedia.org/wiki/Image:Alanin_-_Alanine.svghttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/alanine.html


27/84

!lanin adala" asam amino

non-esensial 'ang terlibatpada metabolisme triptofan

dan vitamin piridoksin.


28/84

)eranan alanin ukup penting

pada terapi ter"adap manusia(

sala" satun'a adala"kemampuann'a menurunkan

kadar kolesterol dan virus H*

b t Al i l i

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/balanine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/balanine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/balanine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/balanine.html


29/84

beta-Alanin , se*ara alami

terdapat sebagai beta pada asam

amino. /ormula: 0#1O+

H

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/balanine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/balanine.htmlhttp://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/pdbsum/1n2j/chetBAL.gifhttp://www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/pdbsum/1n2j/chetBAL.gifhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/balanine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/balanine.html


30/84

Arginin / asam amino yang berguna pada sisiakti+ dari en-im.

'acang&kacangan kaya akan asam amino arginin yang

penting untuk proses sintesis nitric o8ide -NO. NO dibutuhkan untuk mengalirkan darah ke seluruh organ tubuh.

http://duniafitnes.com/supplement/otot-makin-nge-pump-dengan-suplementasi-nitric-oxide.htmlhttp://duniafitnes.com/supplement/otot-makin-nge-pump-dengan-suplementasi-nitric-oxide.html


31/84

Asam aspartat intermedietpenting pada siklus asam sitrat.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/asparticacid.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/asparticacid.html


32/84

!sam aspartat adala" satu dari

dua asam amino $lainn'a

adala" asam lutamat% 'an

mempun'ai muatan ne atif

'akni dari u us karboksilat

pada rantai sampin .


33/84

!sam aspartat adala" asam

amino non-esensial( dia ikut

berperan dalam metabolisme

pembuatan asam amino laindan seara biokimia dalam

siklus asam sitrat.


34/84

Seara biokimia 'angdisintesa dari asam aspartat

adala" asparagin( arginin(

lisin( metionin( treonin(

isoleusin( dan beberapa

nukleotida.


35/84

Asparagin , turunan amide dari

asam aspartat.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/asparagine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/asparagine.html


36/84

Sistein , asam amino yang

mengandung tiol dan terlibatpada sisi akti+

dan menentukan strukturprotein tersier.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/cysteine.htmlhttp://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/bio/aminoacid/mol/asp.molhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/cysteine.html


37/84

Sistin , produk oksidasi darisistein yang mengikat protein

bersama sama.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/cystine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/cystine.html


38/84

Asam glutamat , asam

amino yang tidak bermuatanditemukan pada permukaan

protein.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/glutamicacid.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/glutamicacid.html


39/84

8lutamin satu , satunya asam

amino dengan dengan muda'melakukan perlintasan antara

dara' dan aringan otak.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/glutamine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/glutamine.html


40/84

0istidin , asam amino yangdapat merespon biosintesa

'istamin.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/histidine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/histidine.html


41/84

rolin , asam amino siklik

alipatik berguna pada sintesa

kolagen.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/proline.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/proline.html


42/84

0idroksiprolin asam aminopenting yang berguna dalam

struktur protein seperti

kolagen.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/hydroxyproline.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/hydroxyproline.html


43/84

Isoleusin , asam amino 'idropobikyang berguna selama konstruksi

protein dan en-im.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/isoleucine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/isoleucine.html


44/84

:isin , asam amino esensial

dengan muatan positi+ pada

rantai samping ali+atis.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/lysine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/lysine.html


45/84

Metionin , asam amino esensial

yang membantu meberikan inisial

sintesa protein.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/methionine.htmlhttp://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/bio/aminoacid/mol/met.molhttp://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/bio/aminoacid/mol/met.molhttp://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/bio/aminoacid/mol/met.molhttp://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/bio/aminoacid/mol/asn.molhttp://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/bio/aminoacid/mol/asn.molhttp://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/bio/aminoacid/mol/lys.molhttp://www.chemie.fu-berlin.de/chemistry/bio/aminoacid/mol/cys.molhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/methionine.html


46/84

; il l i i

http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/d/d1/Methionine_biochemical_paths.pnghttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/phenylalanine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/phenylalanine.html


47/84

;enilalanin , asam amino

aromatik yang terdapat pada

protein.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/phenylalanine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/phenylalanine.html


48/84

Serin , asam amino alko'olditemukan pada sisi akti+ dari

serin protease.

http://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/serine.htmlhttp://micro.magnet.fsu.edu/aminoacids/pages/serine.html


49/84


50/84

#aurin adala" sisa produk

dari metabolisme sistein.

#aurin terkon'u asi pada

asam kolat membentuk

taurokolat( 'aitu

aram empedu.

http://www.aw-bc.com/mathews/ch05/cys.htmhttp://www.aw-bc.com/mathews/ch18/cholicac.htmhttp://www.aw-bc.com/mathews/ch18/taurchol.htmhttp://www.aw-bc.com/mathews/ch18/bilesalt.htmhttp://www.aw-bc.com/mathews/ch18/bilesalt.htmhttp://www.aw-bc.com/mathews/ch18/taurchol.htmhttp://www.aw-bc.com/mathews/ch18/cholicac.htmhttp://www.aw-bc.com/mathews/ch05/cys.htm


51/84

/aram empedu terbentuk dari asam

empedu yang berikatan dengan kation

seperti asam amino. 0onto' gliko*'olatdan tauro*'olat. (garam empedu adala'

-at sema*am detergen yang dikeluarkan

dari kantong empedu (gallbladder) untukmembantu men*ernakan atau menyerap

lipid.


52/84


53/84

SUM)1R

• Makanan yang mengandung treonin

meliputi ( ke0u, unggas, ikan, daging dan

bi0i&bi0ian.


54/84

Metabolisme

• 2reonin dimetabolis dalam dua cara(

• %ertama ( /irubah men0adi piru4at melalui

treonin dehidrogenase. )entuk antara pada

pathay ini mengalami tiolisis dengan 7oAuntuk menghasilkan asetil&7oA dan glisin.


55/84

• Kedua ( ada manusia treonin dirubah

men0adi


56/84

6ripto-an , asam amino

aromatik berguna se1aktu

1aktu pada protein.


57/84

,eberapa fakta tentang -triptofan.

Singkatan : #rp.

ode satu "uruf : /(

0asa molekul : 123 daltons.ategori : "idropobik 4 aromatik.

pa

: tidak ada.

ros n , asam am no


58/84

ros n asam am no'idroksi+enil yang berguna

untuk membangunneurotransmiter dan 'ormon.


59/84


60/84

Asam gama/Aminobutirat

2 asam amino 'asil dekarboksilasi yang

membantu

kita keluar dari rasa dingin.


61/84

6aurin , asam amino yang mengandung

mer*aptan terlibat se*ara biokimia pada

asam empedu.

2aurin adalah sisa produk dari metabolisme sistein. 2aurin

terkonyu"asi pada asam kolat membentuk taurokolat,yaitu "aram empedu.


62/84

Ornitin = salah satu anggota dari

asam amino pada siklus urea.


63/84

2 Sitrulin , suatu asam amino yang

bekera untuk meng'ilangkan ra*un

danmengeliminasi amonia yang tidak

diinginkan.


64/84

2 arnitin asam amino yang tidak

umum yang memba1a asam lemak

kedalam mitokondria.


65/84


66/84


67/84

/NA t d 9 b b d d i /NA t d %


68/84

/NA strand 9 berbeda dari /NA strand %

pada lokasi pasangan basa tunggalnya-7*6

polimor!isme.


69/84

Aturan dari International Union o! ure and

Applied 7hemistry -IUA7 (

A 3 adenine> 7 3 cytosine> 2 3 guanine> 6 3thymine> R 3 2 A -purine> ? 3 6 7

-pyrimidine> ' 3 2 6 -keto> M 3 A 7

-amino> S 3 2 7 -strong bonds> @ 3 A 6

-eak bonds> ) 3 2 6 7 -all but A> / 3 2

A 6 -all but 7> 5 3 A 7 6 -all but 2> 3 2

7 A -all but 6> N 3 A 2 7 6 -any


70/84

• 6he table shos the BC codons and the

amino acid !or each. 6he direction o!

the mRNA is #D to :D. +ndbase5A&6st


71/84

• UUU -he*E henylalanineUU7 -he*Ehenylalanine

• U7U -Ser*S SerineU77 -Ser*SSerine

• UAU -6yr*? 6yrosineUA7 -6yr*?6yrosine

• U2U -7ys*7 7ysteineU27 -7ys*77ysteine


72/84

• UUA -"eu*" "eucine

• U7A -Ser*S Serine

• UAA Ochre -Stop

• U2A Opal -Stop


73/84

• UU2 -"eu*" "eucine

• U72 -Ser*S Serine

• UA2 Amber -Stop

• U22 -6rp*@ 6ryptophan


74/84

• 7UU -"eu*" "eucine7U7 -"eu*" "eucine

• 77U -ro* roline777 -ro*roline

• 7AU -5is*5 5istidine7A7 -5is*55istidine

• 72U -Arg*R Arginine727 -Arg*RArginine

7UA -" *" " i


75/84

• 7UA -"eu*" "eucine7U2 -"eu*" "eucine

• 77A -ro* roline772 -ro*roline

• 7AA -2ln*F 2lutamine

• 7A2 -2ln*F2lutamine

• 72A -Arg*R Arginine722 -Arg*RArginine


76/84

• AUU -Ile*I IsoleucineAU7 -Ile*IIsoleucine

• A7U -6hr*6 6hreonineA77 -6hr*66hreonine

• AAU -Asn*N Asparagine

AA7 -Asn*NAsparagine• A2U -Ser*S SerineA27 -Ser*S Serine


77/84

• AUA -Ile*I Isoleucine

• A7A -6hr*6 6hreonine

• AAA -"ys*' "ysine• A2A -Arg*R Arginine


78/84

• AU2 -Met*M Methionine, Start G9HA72 -6hr*6 6hreonine

• AA2 -"ys*' "ysine• A22 -Arg*R Arginine


79/84

• 2UU -al* aline2U7 -al* aline

• 27U -Ala*A Alanine277 -Ala*A Alanine

• 2AU -Asp*/ Aspartic acid2A7 -Asp*/ Aspartic acid

• 22U -2ly*2 2lycine227 -2ly*2 2lycine


80/84

• 2UA -al* aline2U2 -al* aline

• 27A -Ala*AAlanine272 -Ala*A Alanine

• 2AA -2lu*1 2lutamic acid2A2 -2lu*1 2lutamic acid

• 22A -2ly*2 2lycine222 -2ly*2 2lycine


81/84


82/84


83/84


84/84

amikul [Autosaved]

Documents

Transcript of amikul [Autosaved]