Epidémiologie moléculaire

Post on 29-Jun-2015

422 views 1 download

description

Epidémiologie moléculaire - Présentation de la 4e édition du Cours international « Atelier Paludisme » - Valérie ANDRIANTSOANIRINA - Etudiant/Chercheur - Institut Pasteur de Madagascar - landyvalerie@yahoo.fr

Transcript of Epidémiologie moléculaire

EPIDEMIOLOGIE MOLECULAIRE DU

PALUDISME

Ex : suivi de la chloroquino-resistance

Valérie ANDRIANTSOANIRINA Atelier Paludisme -IPM-

EVALUATION

par les FACILITATEURS

PLANPLAN

• avant la biologie moléculaire• avec la biologie moléculaire• exemple: suivi de la résistance à la chloroquine

(pfcrt)• avantages et limites • conclusion

Définition : étude de la répartition et des déterminants des évènements de santé dans les populations

Définition du sujet : Surveillance par méthode moléculaire des phénomènes épidémiologiques dont principalement l’apparition des résistances aux médicaments

INTRODUCTIONINTRODUCTION

Avantages : pas d’extrapolation sur autres espèces et expériences en labo

Inconvénients : • contraintes éthiques imposées par expérimentation humaine• Protocole lourd

– temps– argent

• Comparaison inter études (standardisation)

In vivo : essai direct sur l’hommeIn vitro : culture cellulaire

Epidémiologie avant la biologie Epidémiologie avant la biologie moléculairemoléculaire

����

suivi de la chloroquinosuivi de la chloroquino--resistance resistance dans le mondedans le monde

����������

����� �

OMSOMS

Définition : mettre en relation les données recueillies avec la recherche des causes d’une

maladie sur le plan moléculaire

« Mutant = résistant »suivi d’une résistance� suivi mutation associée à une résistance.

Epidémiologie avec la biologie moléculaire

Suivi de résistance à la CQ (Pfcrt T76)

Marqueur moléculaire Pfcrt 76 : substitution de la : substitution de la Lysine K à la position 76 (K76) en thréonine T Lysine K à la position 76 (K76) en thréonine T (Chromosome 7) (Chromosome 7)

�� PrPréésents chez les isolats rsents chez les isolats réésistants et non chez sistants et non chez les sensiblesles sensibles

DjimdDjimdéé et al., 2001 : association entre le et al., 2001 : association entre le PfcrtPfcrt T76 T76 et det dééveloppement de rveloppement de réésistance sistance àà la CQ pendant le la CQ pendant le traitement.traitement.

(Djimdé et al., 2001)

Djimdé et al., 2001Djimdé et al., 2001

��SSéélection pour la T76 in vivolection pour la T76 in vivo

��AprAprèès traitement seuls les mutants rs traitement seuls les mutants réésistentsistent

Pourquoi ce choix ?Pourquoi ce choix ?

• déterminant essentiel de la résistance à la chloroquine Djimdé, 2001; Fidock et al., 2001

• Djimdé et al., 2001 : association entre le Pfcrt T76 et développement de résistance à la CQ pendant le traitement.

• outil de surveillance à la résistance à la chloroquine

CI 5

0 d

e la CQ

CI 5

0 d

e la CQ

������������ ��

����

�����

����

���

�� �������

���

������� �

� �

�������

������

� !

�� �!

"� "!

#� #!

!� !!

$� $!

%� %!

&� &!

'� '!

�� '!

��� �'!

��� �!!

%�� %'!

%�� %!!

&�� &'!

&�� &!!

'�� '!!

'�� '!!

��� �'!

��� �!!

$�� $'!

$�� $!!

#�� #'!

���� (

�)��* ���

�%��%�

Exemple 2: Madagascar

• Mutation pfcrt K76T par PCR/RFLP : grande première à Madagascar.

• 3,3% : 6/183 sur isolats de Plasmodium falciparumétudiés

• Génotypage du pfcrt est un outil utile pour la surveillance de la résistance à la CQ

Randrianarivelojosia et al., 2006Randrianarivelojosia et al., 2006

Intérêts et limites

• Intérêts :+ , �-������ �������������� ������� ������(�������

+ . ������ �������� ����(��������� �������������)

+ /����������� ��������� ��(�(�� ������( � ����

Limites:Limites:00 *����

0 12�������(���������)�������� �����3����(�

Djimdé et al., 2001Djimdé et al., 2001

Exemple 2 : suivi de résistance à Mali

1424 patients, 1997-1999, la prévalence de pfcrt T76 est mesurée et comparée avec la parasite

• L’approche d’épidémiologie moléculaire : perspectives d’interventions stratégiques ciblant des facteurs de virulence du parasite

• Connaissance mutation � connaissance résistance� changement de lutte

� � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � � �

Conclusion et perspectives

Références• Greenwood B. The molecular epidemiology of malaria. Tropical Medicine

and International Health, 2000 volume 7 (12); 1012–1021.• Djimdé A et al. A molecular marker of chloroquine-resistant falciparum

malaria. N Engl J Med, Vol. 344 (4) January 25, 2001.• Djimdé et al. Application of a molecular marker for surveillance of

chloroquine-resistant falciparum malaria. The lancet, Vol. 358 (9285); 890-891, 2001.

• Abel. Apport de l’épidémiologie génétique pour l’étude de la susceptibilité/résistance au paludisme dans les populations humaines, Paris 1999.

• Schulte A. A conceptual and historical framework for molecularepidemiology. In : Schulte A.P et Perera P.F. Molecular epidemiology : principles and practices. London: academic press, 1993; 4-19

• Randrianarivelojosia et al. First evidence of pfcrt mutant Plasmodiumfalciparum in Madagascar. Trans R Soc Trop Med H, 2006

• Détection de la résistance aux médicaments

• Détection de la résistance à l’insecticide

• Différenciation entre rechute et réinfection• Cytokines, TNF…

• Analyse de l’origine du repas de sang

• Recherche de marqueurs génétiques de virulence• HLA cl I et II

• Etude de la corrélation génétique entre populations

de moustiques

• Etude de la multiplicité de l’infection• Malformation des GR

• Différenciation d’espèces et sous-espèces• Détection d’infections mixtes• Hémoglobinopathies

VecteurParasiteHôte

Applications de la biologie moléculaire à l’épidémiologie