Post on 04-Apr-2015
ABG-2007 – Programmation métabolique chez les juvéniles de bars Marie Vagner
Programmation métabolique chez les juvéniles de bars
Marie VAGNER
Valorisation des Compétences“ un nouveau chapitre de la thèse ” ®
ABG-2007 – Programmation métabolique chez les juvéniles de bars Marie Vagner
Cadre général et enjeuxde votre thèse
…Poissons nourris avec farines et huiles de poissons
PB: Aquaculture + Stocks naturels de poissons
Nécessité de substituer farines de poissons par farines végétales
PB: Produits végétaux non adaptés pour besoins en HUFA (oméga 3)
Grand intérêt économique et écologique à produire des poissons
pouvant mieux incorporer des farines végétales
Pourrait être possible par concept de programmation métabolique
PB: Adaptation aux produits végétaux affectée / T°C > optimale
ABG-2007 – Programmation métabolique chez les juvéniles de bars Marie Vagner
Cadre général et enjeuxde votre thèse
Tenter d’orienter les processus métaboliques des juvéniles
- par un conditionnement larvaire
- régime pauvre en HUFA / d’huiles végétales
Objectif de la thèseObjectif de la thèse
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Cadre général et enjeuxde votre thèse
Adaptation Reproduction Nutrition des poissons
IFREMER- Brest
Unité Mixte de Recherche 1067
« Nutrition et qualité » et « nutrition aquaculture environnement »
INRA de Saint-Pée-sur-Nivelle
Génomique et physiologie des poissons
Université de Bordeaux 1
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Cadre général et enjeuxde votre thèse
Unité Mixte de Recherche 1067
•Reproduction
•Adaptabilité aux facteurs environnementaux
•Nutrition pour production aquacole de qualité
- Malformations larvaires
- Substituts nutritionnels aux farines et huiles de poissons
Adaptation Reproduction Nutrition des poissons
IFREMER- Brest
« Nutrition et qualité » et « nutrition aquaculture environnement »
INRA de Saint-Pée-sur-Nivelle
Génomique et physiologie des poissons
Université de Bordeaux 1
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● Compétences du laboratoire en physiologie, zootechnie, nutrition, biochimie, microbiologie, biologie moléculaire, génomique.
● Plusieurs collaborations:
nationales (UMR) internationales (FINEFISH, FORM)
nouvelle collaboration avec l’Écosse suite à mon sejour
Cadre général et enjeuxde votre thèse
● Programmation métabolique = un nouvel essor
ABG-2007 – Programmation métabolique chez les juvéniles de bars Marie Vagner
Sujet de thèse intéressant car :
- application directe,
- grand rôle dans le devenir écologique et économique des ressources naturelles
- aspect pluridisciplinaire
- technique de pointe en biologie moléculaire
● Mon parcours, pourquoi cette thèse?
Cadre général et enjeuxde votre thèse
DEUG, Licence et Master de biologie marine (ULR et Bordeaux 1)
DEA (master recherche) en écophysiologie du mulet en Sardaigne
naissance de mon intérêt pour le modèle poisson
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Déroulement, gestion, coût du projet
● Préparation, financements et cadrage
- Financement 50% IFREMER et 50% INRA
- Encadrement officiel par Jeannine Person-Le-Ruyet
- Collaboration
José Zambonino et Jean Robin
4 techniciens
- Cadrage rigoureux du projet avant mon arrivée
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● Conduite du projet
Déroulement, gestion, coût du projet
2004D J F M A M J J A S O N D J F M A M J J A S O N D J F M A M J J A S O N
BibliographieExpérience larvaireAnalyse zootechniqueAnalyse biochimiqueRapport d'avancement IfremerExpérience juvénileAnalyse biologie moléculaireColloqueCongésAnalyse enzymatiqueComité de thèsePublicationsRevue de publicationMissionRédaction
2005 2006 2007
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Déroulement du projet
• Réunions régulières avec mes encadrants organisées à mon initiative
• Rapports annuels IFREMER à rédiger pour le renouvellement de la bourse
• Comité de thèse à la fin de la première année et avant la rédaction
• Programme de départ assez bien respecté
• Quelques aspects de recherche (température et gène d’inconfort) abandonnés
faute de résultats pertinents ou de temps.
• D’autres éléments greffés au projet (séjour en Écosse) pas prévu au départ.
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● Evaluation du coût
Déroulement, gestion, coût du projet
INRA11%
UBO0%
IFREMER89%
Coût total: 211,7 kE
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Déroulement, gestion, coût du projet
● Evaluation du coût
Frais de fonctionnement
53%
Investissement1%
Ressources humaines 43%
Animaux0% Missions
4%
Comité de thèse1%
Consommables0%
Analyses49%
Salaires45%
Informatique1%
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Nature Dépenses Quantité/ unité Coût unitaire Coût total (KE) Financement
3 ans 1380 par mois 34,5 ifremer 3 ans2214,67 par mois 39,9 INRA
techniciens 620h ifremerstagiaires 12h 0 ifremersecrétaire 10h ifremerchercheurs 94h ifremer
3 chercheurs 1,1 INRA2 chercheurs 0,3 UBO4 chercheurscompris dans salaires Ifremer
fournitures de bureau ifremerutilisation structures ifremervoiture de service 700 km14.33 centimes/ km 0,1 ifremer
6 5,0 ifremer5 2,7 INRA
animaux 300000 100 000 larves=150 euro
0,5 ifremer
biologie moléculaire 8 mois 92,3 ifremerenzymologie 1 mois 0,2 ifremerbiochimie 8 mois1823,2 euro/ mois 9,1 ifremerhybridation in situ 1,5 ifremerenzymologie delta-6 D 1,8 ifremerordinateur 1 990 1,0 ifremerlogiciels ordinateurs
3 80+168+100 0,4 Ifremer
tenues de labo 0,1 Ifremertotal 211,7
FDF
0,5
missions
Invest
RH
bourses de thèse
20,7
comité de thèse
Tableau global
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Compétences, savoir-faire
acquis● Compétences dans la discipline
- Techniques du laboratoire ARN: biologie moléculaire,
biochimique,
enzymologie
- Techniques d’enzymologie au carbone C14 lors de mon séjour en Ecosse
- Recherche bibliographique, écriture et revue de publications
- Présentations orales et poster
- Anglais
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● Méthodes
Compétences, savoir-faire acquis
- Gestion de mon temps et de mon matériel
- Organisation
- Planning hebdomadaire pour suivre les idées directrices
- Classement des priorités
● Compétences en communication / négociations
● Compétences en formation professionnelle / pédagogie (Écosse)
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● Administratif / linguistique
- Organisation du séjour en Écosse de A à Zaspects logistiques, administratifs et scientifiques
- Anglais utilisé pour publications et en Écosse - Rédaction de certains rapports en français
Compétences, savoir-faire acquis
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Qualités mises en oeuvre
• Professionnelles- adaptabilité- diplomatie- échange / communication- capacités d’analyse et de synthèse
• Personnelles- confiance en moi- autonomie- pédagogie / patience
• Reseau90% dans le milieu de la recherche en biologie (congrès, labo de DEA, de thèse, anciens étudiants)
10% dans d’autres milieux de recherche (autre doctorants, anciens étudiants) ou autres (agro-industrie, milieu médical)
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Résulats & Impacts de la thèse
● Impacts pour le laboratoire- Publication de deux articles scientifiques - Acquisition d’une nouvelle technique de dosage enzymatique (Ecosse)
Encourageant de continuer dans cette voie de rechercheEncourageant de continuer dans cette voie de recherche
● Impacts pour la recherche, l’économie et la société- Possible d’orienter les processus métaboliques des poissons- Les produits végétaux peuvent être une solution de substitution aux farines animales
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Résulats & Impacts de la thèse
Aspects personnels Acquisition de compétences techniques Capacités de réflexion plus large applicables à d’autres domaines de la
biologie
Perspectives professionnelles identifiées
●Post-doctorat = passerelle incontournable●Prête à modifier mon angle de recherche●Poste d’enseignant-chercheur●Poste de chercheur
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Merci de votre attention
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Cadre général et enjeuxde votre thèse
● Concept de programmation métabolique
= MEMOIRE DE L’ORGANISME
= processus adaptatif au niveau cellulaire,
moléculaire et biochimique intervenant pendant
une période critique du développement de
l’organisme