Post on 04-Apr-2015
1Lecointre et Le Guyader, 2006 (39 €)
2
Eucaryotes
ArchéesBactéries
D'après Wolfe-Simon et al. (2005)
L'arbre du vivant
Les 10 règnes d'Eucaryotes,
les 2 règnes d'Archées
et les 5 règnes
de Bactéries
3
Position des Mimivirus dans l’arbre du Vivant
Arbre phylogénétique construit à partir des séquences de 7 protéines universellement conservées dans les organismes cellulaires, et toutes présentes chez Mimivirus
D’après Raoult et al., 2004.
4
L'appareil cinétique d'une Bactérie Salmonella typhimurium
D'après Morgan et Khan (2001)
MotAB = moteur basal
C rod sens de la rotation
5
200 nm
Microtubules (tubuline)
Prolongement du plasmalemme
undulipodium
Cinétosome (granule basal)
L'appareil cinétique des Eucaryotes : undulipodium et cinétosome
D'après Margulis et Schwattz (1985)
6
Différences entre Bactéries et Archées
Caractéristique Bactéries Archées (Eucaryotes)
Peptidoglycane dans la paroi cellulaire
Présent Absent (absent)
Muréine dans la paroi cellulaire
Présente Absente (absente)
Lipides membranaires Hydrocarbu-res linéaires
Hydrocarbu-res ramifiés
(hydrocarbu-res linéaires)
ARN polymérase 1 sorte Plusieurs sortes
(plusieurs sortes)
Acide aminé initiateur début synthèse protéines
Formyl-méthionine
Méthionine (Méthionine)
Introns Absents Rares (présents)
Réponse à streptomycine et chloramphénicol (synthèse protéines)
Inhibée Non inhibée (non inhibée)
Histone associée à DNA Non Oui Oui
7
Longueur d'onde
Bleu Vert RougeInfra-rouge
Spectre visible
Bactério-chloro-phylle
Chloro-Chloro-phylla phylla aa
Chlorophylle Chlorophylle bb
Phyco-érythrine
Béta carotèneLes spectres d'absor-ption des pigments photosynthétiques
8
CH2
CH
CH3
N N
CH3
CH2 CH3
NNH
CH3
CH3
Mg
O
C OCH3
O
H
H
CH2
CH2
CO
O
CH3CH3
H H
La chlorophylle a
En vert : les 4 cycles pyrol
En bleu : le phytol
D'après Jeffrey (1989)
9
Une cellule de Cyanobactérie
Paroi cellulaire : contient de la muréine (polymère d'acide di-amino-pimélique, d'acide muramique, etc.) caractéristique des Bactéries
PlasmalemmeCytoplasme
Thylakoïde : Chloro-phylles, xanthophyl-les
Phycobilisomes : Phycoérythrine, phycocyanine, allo-phycocyanine
ADN proca-ryo-tique
Ribo-some 70S
Airosome (vacuole gazeuse)
Cyanamylon (proche du glycogène ; polysaccharide ; produit de la photosynthèse)
Globule lipidique
Granule structuré (réserves protéiques)
Carboxysome : enzymes photosynthèse
10
Coefficient d'absorption de la lumière (%)
Longueur d'onde (nm)
100
90
80
70
60
50
40
30
20
10
400 700500 600
Spectre d'absorption de la lumière des pigments photosynthétiques
Chlorophylle a : deux pics d'absorption. Le bleu et le jaune sont peu absorbés
Phycoérythrine (phycobiline). N'absorbe pas dans le rouge
Phycocyanine (phycobiline). N'absorbe pas dans le bleu
Allophycocyanine (phycobiline). N'absorbe pas dans le bleu
D'après Gantt (1990). Noter qu'il s'agit en fait d'une Rhodobionte
11
Apport atmosphérique : 60 Mt/a (= Tg/a)
OCÉAN
Apports des fleuves : 80 Mt/a
Puits océan profond : 420 Mt/a
Upwellings : 90 Mt/a
Fixation N2Cyanobacté-ries : 90 Mt/a
L'azote "manquant" : 90-100 Mt/a Les Cyano-bactéries ?
Apport atmosphérique : 60 Mt/a (= Tg/a)
OCÉAN
Apports des fleuves : 80 Mt/a
Puits océan profond : 420 Mt/a
Upwellings : 90 Mt/a
Fixation N2Cyanobacté-ries : 90 Mt/a
L'azote "manquant" : 90-100 Mt/a Les Cyano-bactéries ?
Bilan en azote de l’océan mondial
D’après Kolber (2006)
Embryo-biontes
Charo-phycées
Chloro-phycées
Prasinophycées
Rhodo-biontes Glauco-
cysto-biontes
Lobosa
Mycétobiontes
Microsporidies
Fungi
Choanoflagellés
Métazoaires (= animaux)
Para-basalia
Retorta-mona-dines
Euglé-noïdes
Kinéto-plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa)
Percolobiontes
Chromobiontes
Oobiontes
Labyrinthulobiontes
Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio-laires
Forami-nifères
Chlorarach-niobiontes
EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES
STRAMÉNOPILES
ALVÉOLÉSALVÉOLÉS
RHIZARIARHIZARIA
AMOEBOBIONTES
OPISTHOCHONTES
Centro-helida Actinophryda
Haptobiontes
Cryptobiontes
Ch
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Eugléno-biontes
Archamaeba
Phytomyxea
Haplo-sporidies
Un
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Diplo-monadines
Oxymo-nadines
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Euglyphides
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LES 10 RÈGNES D’EUCARYOTES
Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIA ARCHAEPLASTIDIA
(= PLANTAE)(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010)Cours C.F.
Boudouresque 2010
Embryo-biontes
Charo-phycées
Chloro-phycées
Prasinophycées
Rhodo-biontes Glauco-
cysto-biontes
Lobosa
Mycétobiontes
Microsporidies
Fungi
Choanoflagellés
Métazoaires (= animaux)
Para-basalia
Retorta-mona-dines
Euglé-noïdes
Kinéto-plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa)
Percolobiontes
Chromobiontes
Oobiontes
Labyrinthulobiontes
Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio-laires
Forami-nifères
Chlorarach-niobiontes
EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES
STRAMÉNOPILES
ALVÉOLÉSALVÉOLÉS
RHIZARIARHIZARIA
AMOEBOBIONTES
OPISTHOCHONTES
Centro-helida Actinophryda
Haptobiontes
Cryptobiontes
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Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIA ARCHAEPLASTIDIA
(= PLANTAE)(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Ce que la tradition (au sens large) a nommé ‘végétaux’ : un ensemble polyphylétique
Il manque ici les Procaryotes : Cyanobactéries (‘algues bleues’), Actinobactéries et Planctobactéries
Embryo-biontes
Charo-phycées
Chloro-phycées
Prasinophycées
Rhodo-biontes Glauco-
cysto-biontes
Lobosa
Mycétobiontes
Microsporidies
Fungi
Choanoflagellés
Métazoaires (= animaux)
Para-basalia
Retorta-mona-dines
Euglé-noïdes
Kinéto-plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa)
Percolobiontes
Chromobiontes
Oobiontes
Labyrinthulobiontes
Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio-laires
Forami-nifères
Chlorarach-niobiontes
EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES
STRAMÉNOPILES
ALVÉOLÉSALVÉOLÉS
RHIZARIARHIZARIA
AMOEBOBIONTES
OPISTHOCHONTES
Centro-helida Actinophryda
Haptobiontes
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Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIARCHAEPLASTIDI
A (= PLANTAE)A (= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Ce que la tradition a nommé ‘Algues’ : un ensemble polyphylétique
D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010)
Il manque ici les Procaryotes : Cyanobactéries,
Embryo-biontes
Charo-phycées
Chloro-phycées
Prasinophycées
Rhodo-biontes Glauco-
cysto-biontes
Lobosa
Mycétobiontes
Microsporidies
Fungi
Choanoflagellés
Métazoaires (= animaux)
Para-basalia
Retorta-mona-dines
Euglé-noïdes
Kinéto-plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa)
Percolobiontes
Chromobiontes
Oobiontes
Labyrinthulobiontes
Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio-laires
Forami-nifères
Chlorarach-niobiontes
EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES
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ALVÉOLÉSALVÉOLÉS
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Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIARCHAEPLASTIDI
A (= PLANTAE)A (= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Ce que la tradition a nommé ‘champignons’
D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010)
Il manque ici les Procaryotes : Planctobactéries et Actinobactéries
Embryo-biontes
Charo-phycées
Chloro-phycées
Prasinophycées
Rhodo-biontes Glauco-
cysto-biontes
Lobosa
Mycétobiontes
Microsporidies
Fungi
Choanoflagellés
Métazoaires (= animaux)
Para-basalia
Retorta-mona-dines
Euglé-noïdes
Kinéto-plastides
Acrasiobiontes (= Heterolobosa)
Percolobiontes
Chromobiontes
Oobiontes
Labyrinthulobiontes
Ciliés
Dinobiontes
Apicomplexes
Radio-laires
Forami-nifères
Chlorarach-niobiontes
EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES
STRAMÉNOPILES
ALVÉOLÉSALVÉOLÉS
RHIZARIARHIZARIA
AMOEBOBIONTES
OPISTHOCHONTES
Centro-helida Actinophryda
Haptobiontes
Cryptobiontes
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Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIA ARCHAEPLASTIDIA
(= PLANTAE)(= PLANTAE)
Ellobiopsidés
Ce que la tradition a nommé ‘algues’ (en vert) et ‘protozoaires’ (en jaune)
En bleu : taxons revendiqués par les ‘botanistes’ et les ‘zoologistes’
D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010)