1Lecointre et Le Guyader, 2006 (39 €)

2

Eucaryotes

ArchéesBactéries

D'après Wolfe-Simon et al. (2005)

L'arbre du vivant

Les 10 règnes d'Eucaryotes,

les 2 règnes d'Archées

et les 5 règnes

de Bactéries

3

Position des Mimivirus dans l’arbre du Vivant

Arbre phylogénétique construit à partir des séquences de 7 protéines universellement conservées dans les organismes cellulaires, et toutes présentes chez Mimivirus

D’après Raoult et al., 2004.

4

L'appareil cinétique d'une Bactérie Salmonella typhimurium

D'après Morgan et Khan (2001)

MotAB = moteur basal

C rod sens de la rotation

5

200 nm

Microtubules (tubuline)

Prolongement du plasmalemme

undulipodium

Cinétosome (granule basal)

L'appareil cinétique des Eucaryotes : undulipodium et cinétosome

D'après Margulis et Schwattz (1985)

6

Différences entre Bactéries et Archées

Caractéristique Bactéries Archées (Eucaryotes)

Peptidoglycane dans la paroi cellulaire

Présent Absent (absent)

Muréine dans la paroi cellulaire

Présente Absente (absente)

Lipides membranaires Hydrocarbu-res linéaires

Hydrocarbu-res ramifiés

(hydrocarbu-res linéaires)

ARN polymérase 1 sorte Plusieurs sortes

(plusieurs sortes)

Acide aminé initiateur début synthèse protéines

Formyl-méthionine

Méthionine (Méthionine)

Introns Absents Rares (présents)

Réponse à streptomycine et chloramphénicol (synthèse protéines)

Inhibée Non inhibée (non inhibée)

Histone associée à DNA Non Oui Oui

7

Longueur d'onde

Bleu Vert RougeInfra-rouge

Spectre visible

Bactério-chloro-phylle

Chloro-Chloro-phylla phylla aa

Chlorophylle Chlorophylle bb

Phyco-érythrine

Béta carotèneLes spectres d'absor-ption des pigments photosynthétiques

8

CH2

CH

CH3

N N

CH3

CH2 CH3

NNH

CH3

CH3

Mg

O

C OCH3

O

H

H

CH2

CH2

CO

O

CH3CH3

H H

La chlorophylle a

En vert : les 4 cycles pyrol

En bleu : le phytol

D'après Jeffrey (1989)

9

Une cellule de Cyanobactérie

Paroi cellulaire : contient de la muréine (polymère d'acide di-amino-pimélique, d'acide muramique, etc.) caractéristique des Bactéries

PlasmalemmeCytoplasme

Thylakoïde : Chloro-phylles, xanthophyl-les

Phycobilisomes : Phycoérythrine, phycocyanine, allo-phycocyanine

ADN proca-ryo-tique

Ribo-some 70S

Airosome (vacuole gazeuse)

Cyanamylon (proche du glycogène ; polysaccharide ; produit de la photosynthèse)

Globule lipidique

Granule structuré (réserves protéiques)

Carboxysome : enzymes photosynthèse

10

Coefficient d'absorption de la lumière (%)

Longueur d'onde (nm)

100

90

80

70

60

50

40

30

20

10

400 700500 600

Spectre d'absorption de la lumière des pigments photosynthétiques

Chlorophylle a : deux pics d'absorption. Le bleu et le jaune sont peu absorbés

Phycoérythrine (phycobiline). N'absorbe pas dans le rouge

Phycocyanine (phycobiline). N'absorbe pas dans le bleu

Allophycocyanine (phycobiline). N'absorbe pas dans le bleu

D'après Gantt (1990). Noter qu'il s'agit en fait d'une Rhodobionte

11

Apport atmosphérique : 60 Mt/a (= Tg/a)

OCÉAN

Apports des fleuves : 80 Mt/a

Puits océan profond : 420 Mt/a

Upwellings : 90 Mt/a

Fixation N2Cyanobacté-ries : 90 Mt/a

L'azote "manquant" : 90-100 Mt/a Les Cyano-bactéries ?

Apport atmosphérique : 60 Mt/a (= Tg/a)

OCÉAN

Apports des fleuves : 80 Mt/a

Puits océan profond : 420 Mt/a

Upwellings : 90 Mt/a

Fixation N2Cyanobacté-ries : 90 Mt/a

L'azote "manquant" : 90-100 Mt/a Les Cyano-bactéries ?

Bilan en azote de l’océan mondial

D’après Kolber (2006)

Embryo-biontes

Charo-phycées

Chloro-phycées

Prasinophycées

Rhodo-biontes Glauco-

cysto-biontes

Lobosa

Mycétobiontes

Microsporidies

Fungi

Choanoflagellés

Métazoaires (= animaux)

Para-basalia

Retorta-mona-dines

Euglé-noïdes

Kinéto-plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa)

Percolobiontes

Chromobiontes

Oobiontes

Labyrinthulobiontes

Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio-laires

Forami-nifères

Chlorarach-niobiontes

EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES

STRAMÉNOPILES

ALVÉOLÉSALVÉOLÉS

RHIZARIARHIZARIA

AMOEBOBIONTES

OPISTHOCHONTES

Centro-helida Actinophryda

Haptobiontes

Cryptobiontes

Ch

rom

alvé

olé

sC

hro

mal

véo

lés

Ch

loro

bio

nte

s

Vir

idip

lan

tae

Eugléno-biontes

Archamaeba

Phytomyxea

Haplo-sporidies

Un

ich

on

tes

Diplo-monadines

Oxymo-nadines

Str

epto

bio

nte

s

Euglyphides

Re

tari

a

Ce

rco

bio

nte

s

LES 10 RÈGNES D’EUCARYOTES

Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIA ARCHAEPLASTIDIA

(= PLANTAE)(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010)Cours C.F.

Boudouresque 2010

Embryo-biontes

Charo-phycées

Chloro-phycées

Prasinophycées

Rhodo-biontes Glauco-

cysto-biontes

Lobosa

Mycétobiontes

Microsporidies

Fungi

Choanoflagellés

Métazoaires (= animaux)

Para-basalia

Retorta-mona-dines

Euglé-noïdes

Kinéto-plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa)

Percolobiontes

Chromobiontes

Oobiontes

Labyrinthulobiontes

Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio-laires

Forami-nifères

Chlorarach-niobiontes

EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES

STRAMÉNOPILES

ALVÉOLÉSALVÉOLÉS

RHIZARIARHIZARIA

AMOEBOBIONTES

OPISTHOCHONTES

Centro-helida Actinophryda

Haptobiontes

Cryptobiontes

Ch

rom

alvé

olé

sC

hro

mal

véo

lés

Ch

loro

bio

nte

s

Vir

idip

lan

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Eugléno-biontes

Archamaeba

Phytomyxea

Haplo-sporidies

Un

ich

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tes

Diplo-monadines

Oxymo-nadines

Str

epto

bio

nte

s

Euglyphides

Re

tari

a

Ce

rco

bio

nte

s

Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIA ARCHAEPLASTIDIA

(= PLANTAE)(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Ce que la tradition (au sens large) a nommé ‘végétaux’ : un ensemble polyphylétique

Il manque ici les Procaryotes : Cyanobactéries (‘algues bleues’), Actinobactéries et Planctobactéries

Embryo-biontes

Charo-phycées

Chloro-phycées

Prasinophycées

Rhodo-biontes Glauco-

cysto-biontes

Lobosa

Mycétobiontes

Microsporidies

Fungi

Choanoflagellés

Métazoaires (= animaux)

Para-basalia

Retorta-mona-dines

Euglé-noïdes

Kinéto-plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa)

Percolobiontes

Chromobiontes

Oobiontes

Labyrinthulobiontes

Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio-laires

Forami-nifères

Chlorarach-niobiontes

EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES

STRAMÉNOPILES

ALVÉOLÉSALVÉOLÉS

RHIZARIARHIZARIA

AMOEBOBIONTES

OPISTHOCHONTES

Centro-helida Actinophryda

Haptobiontes

Cryptobiontes

Ch

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véo

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Ch

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bio

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Vir

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Eugléno-biontes

Archamaeba

Phytomyxea

Haplo-sporidies

Un

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Diplo-monadines

Oxymo-nadines

Str

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bio

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s

Euglyphides

Re

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Ce

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bio

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s

Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIARCHAEPLASTIDI

A (= PLANTAE)A (= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Ce que la tradition a nommé ‘Algues’ : un ensemble polyphylétique

D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010)

Il manque ici les Procaryotes : Cyanobactéries,

Embryo-biontes

Charo-phycées

Chloro-phycées

Prasinophycées

Rhodo-biontes Glauco-

cysto-biontes

Lobosa

Mycétobiontes

Microsporidies

Fungi

Choanoflagellés

Métazoaires (= animaux)

Para-basalia

Retorta-mona-dines

Euglé-noïdes

Kinéto-plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa)

Percolobiontes

Chromobiontes

Oobiontes

Labyrinthulobiontes

Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio-laires

Forami-nifères

Chlorarach-niobiontes

EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES

STRAMÉNOPILES

ALVÉOLÉSALVÉOLÉS

RHIZARIARHIZARIA

AMOEBOBIONTES

OPISTHOCHONTES

Centro-helida Actinophryda

Haptobiontes

Cryptobiontes

Ch

rom

alvé

olé

sC

hro

mal

véo

lés

Ch

loro

bio

nte

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Vir

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Eugléno-biontes

Archamaeba

Phytomyxea

Haplo-sporidies

Un

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Diplo-monadines

Oxymo-nadines

Str

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bio

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Euglyphides

Re

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Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIARCHAEPLASTIDI

A (= PLANTAE)A (= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Ce que la tradition a nommé ‘champignons’

D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010)

Il manque ici les Procaryotes : Planctobactéries et Actinobactéries

Embryo-biontes

Charo-phycées

Chloro-phycées

Prasinophycées

Rhodo-biontes Glauco-

cysto-biontes

Lobosa

Mycétobiontes

Microsporidies

Fungi

Choanoflagellés

Métazoaires (= animaux)

Para-basalia

Retorta-mona-dines

Euglé-noïdes

Kinéto-plastides

Acrasiobiontes (= Heterolobosa)

Percolobiontes

Chromobiontes

Oobiontes

Labyrinthulobiontes

Ciliés

Dinobiontes

Apicomplexes

Radio-laires

Forami-nifères

Chlorarach-niobiontes

EXCAVATESEXCAVATES DISCICRISTATESDISCICRISTATES

STRAMÉNOPILES

ALVÉOLÉSALVÉOLÉS

RHIZARIARHIZARIA

AMOEBOBIONTES

OPISTHOCHONTES

Centro-helida Actinophryda

Haptobiontes

Cryptobiontes

Ch

rom

alvé

olé

sC

hro

mal

véo

lés

Ch

loro

bio

nte

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Vir

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tae

Eugléno-biontes

Archamaeba

Phytomyxea

Haplo-sporidies

Un

ich

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tes

Diplo-monadines

Oxymo-nadines

Str

epto

bio

nte

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Euglyphides

Re

tari

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Ce

rco

bio

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s

Bichontes = les 8 autres règnesARCHAEPLASTIDIA ARCHAEPLASTIDIA

(= PLANTAE)(= PLANTAE)

Ellobiopsidés

Ce que la tradition a nommé ‘algues’ (en vert) et ‘protozoaires’ (en jaune)

En bleu : taxons revendiqués par les ‘botanistes’ et les ‘zoologistes’

D’après Baldauf (2003, 2008), simplifié et mis à jour (Boudouresque, 2010)