Analyse des Données Génomiques Introduction à Linux et langage R
Introduction à l’analyse de données NGS
Le Laboratoire des Leishmanioses
Organise un Atelier
Sur
Salle de conférences Institut Pasteur du Maroc
Casablanca, du 27 au 29 Mars 2019
Contact Dr Meryem LEMRANI – GSM +212661464818 - [email protected]
Fiche d’inscription téléchargeable sur le site www.pasteur.ma A envoyer au [email protected]
Projet Leishield-MATI- RISE
Enseignantes Ø Dr. Fatma GUERFALI Institut Pasteur de Tunis Ø Dr. Amel GHOUILA H3ABioNet, Institut Pasteur de Tunis
Organisateurs Ø Dr Meryem LEMRANI Laboratoire des Leishmanioses Ø Dr Adil El HAMOUCH Laboratoire des Leishmanioses Ø Dr Fatima MAACHI Service Enseignement
Contact Dr Meryem LEMRANI – GSM +212661464818 - [email protected]
Fiche d’inscription téléchargeable sur le site www.pasteur.ma A envoyer au [email protected]
Projet Leishield-MATI- RISE
PROGRAMME
Mercredi27Mars 9:00-10:30 IntroductionauxplateformesNGS
10:30-10:45 Pause 10:45-12:30 IntroductionàlapréparationdelibrairiesNGSetl’analysededonnées 12:30-14:00 Pause 14:00-15:30 Introductionàl’environnementLinux 15:30-15-45 Pause 15:45-17:15 CommandesbasiquesLinux
Jeudi28Mars 9:00-10:30 ManipulationdesfichiersavecLinux
10:30-10:45 Pause 10:45-12:30 Introductionàlaprogrammationbash 12:30-14:00 Pause 14:00-15:30 IntroductionàR 15:30-15-45 Pause 15:45-17:15 Rstudioetlibrairiespourl’analysededonnéesBioinformatiques
Vendredi29Mars 9:00-10:30 FormatsdefichiersetoutilsutilisésdanslesanalysesNGS(DNAseq)
10:30-10:45 Pause 10:45-12:30 Pipelined’analysesNGS:Exercice(I) 12:30-14:00 Pause 14:00-15:30 Pipelined’analysesNGS:Exercice(II) 15:30-15-45 Pause 15:45-17:15 IntroductionàlaplateformeGalaxy
Contact Dr Meryem LEMRANI – GSM +212661464818 - [email protected]
Fiche d’inscription téléchargeable sur le site www.pasteur.ma A envoyer au [email protected]
Projet Leishield-MATI- RISE
PROGRAMME
Outils à installer: � PuTTY Pour les utilisateurs de Windows, il faut installer l’outil PuTTy Instructions d’installation de PuTTY https://www.01net.com/telecharger/windows/Internet/serveur_ftp/fiches/20166.html � R Studio Pour installer R Studio, télécharger sur ce site la version appropriée en fonction de votre système d’exploitation https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
Top Related