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Page 1: Biochimie des Protéines

Biochimie des Protéines

Licence STS Biologie-Biochimie UEO26 L3

Vincent Vedel

Page 2: Biochimie des Protéines

Chap. 3: Modifications post-traductionelles

• 3.1 Généralités

• 3.2 Ajout ou retrait de petits groupements

• 3.3 Ajout d'acides gras ou de composés hydrophobiques

• 3.4 Ajout de glucides

• 3.5 Ajout de polypeptides

• 3.6 Maturation protéolytique

• 3.7 Le collagène, protéine très modifiée

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3.1 Généralités Modification Site Exemple

Acétylation K Histones

Gamma-carboxylation carbone en position gamma de E

prothrombine

Amidation G terminale gastrine

Biotinylation K pyruvate carboxylase

Carboxylation K, D, E Prothrombine

Glycosylation O-glycosylation sur S, T et hydroxylysine; N-glycosylation sur N

Groupes sanguins Collagène

Hydroxylation P, K, D et Y Collagène

Prénylation (farnesylation, geranylgeranylation)

C en C-terminal Ras

S-acylation C rhodopsine

Myristoylation G en N-terminal NADH-cytochrome b5

Méthylation K, H, R, D, E Actine

Phosphorylation Y, S, T MAP kinases

Sulfatage Y APP, thyroglobuline

Ubiquitination K Histones H2A, H2B

Page 4: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.1 Acetylation

Page 5: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.1 Acetylation

Page 6: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.1 Acetylation

Histone H3

Pas de modification

répression

K14 acétylée transcription

S10 acétylée + S28 phosphorylée

mitose

S10 phosphorylée + K14 acétylée

transcription

K4 méthylée transcription

K9 méthylée répression de la transcription

Histone H4

K8 acétylée + K16 acétylée

transcription

K5 acétylée + K12 acétylée

dépôt des histones

K20 méthylée répression

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3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.2 Amidation

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3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.3 Biotinylation

Page 9: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.4 Carboxylation

Page 10: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.5 Déimination

Page 11: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.6 Hydroxylation

Page 12: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.8 Phosphorylation

Page 13: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.8 Phosphorylation

Page 14: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.8 Phosphorylation

Page 15: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.8 Phosphorylation

Page 16: Biochimie des Protéines

3.2 Ajout ou retrait de groupements 3.2.9 Sulfatage (ou sulfatation)

Page 17: Biochimie des Protéines

3.3 Ajout d’acide gras ou de composés hydrophobiques

3.3.1 Glypiation

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3.3 Ajout d’acide gras ou de composés hydrophobiques

3.3.2 Isoprénylation

le farnésyl-diphosphate

ou le géranylgéranyldiphosphate

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3.3 Ajout d’acide gras ou de composés hydrophobiques

3.3.3 Palmitoylation et myristoylation

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3.4 Ajouts de glucides, simples ou complexes

3.4.2 Structure pyranosique

Page 21: Biochimie des Protéines

3.4 Ajouts de glucides, simples ou complexes 3.4.3 Exemples de sucres trouvés en Modifs Post-

Traduc.

Page 22: Biochimie des Protéines

3.4 Ajouts de glucides, simples ou complexes

3.4.4 Glycosylation en N et en O

Page 23: Biochimie des Protéines

3.4 Ajouts de glucides, simples ou complexes

3.4.5 Mécanismes de glycosylation des protéines

Page 24: Biochimie des Protéines

3.4 Ajouts de glucides, simples ou complexes

3.4.5 Mécanismes de glycosylation des protéines

Page 25: Biochimie des Protéines

3.4 Ajouts de glucides, simples ou complexes

3.4.6 Adressage par le biais d’une glycosylation

Page 26: Biochimie des Protéines

3.5 Ajouts de polypeptides

3.5.1 Ubiquination

Page 27: Biochimie des Protéines

3.5 Ajouts de polypeptides

3.5.1 Ubiquination

Page 28: Biochimie des Protéines

3.5 Ajouts de polypeptides

3.5.2 La règle du N-terminal et le dégron

Page 29: Biochimie des Protéines

3.6 Maturation protéolytique

Page 30: Biochimie des Protéines

3.7 Le collagène

3.7.1 Structure primaire du collagène

Page 31: Biochimie des Protéines

3.7 Le collagène

3.7.2 Structure secondaire du collagène

Page 32: Biochimie des Protéines

3.7 Le collagène

3.7.3 Structure quaternaire du collagène

Page 33: Biochimie des Protéines

3.7 Le collagène

3.7.3 Structure quaternaire du collagène

Page 34: Biochimie des Protéines

3.7 Le collagène

3.7.3 Structure quaternaire du collagène

Page 35: Biochimie des Protéines

3.7 Le collagène

3.7.4 Tannage