UNIVERSITÉ DE LA MÉDITERRANÉE CENTRE D’OCÉANOLOGIE DE MARSEILLE

L'évaluation de la racine des Bilatériens avec des méthodes phylogénomiques

évolutives

Responsable de l’unité d’enseignement « Diversité des Organismes Vivants » : Prof. Charles F. Boudouresque

CHIKH YazidSPROCK Ivonel

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

Le séquençage de génome est un outil puissant afin de résoudre les interrelations entre différents groupes d’organismes vivants par la recherche d’homologie , d’orthologie et de paralogie de séquences.

Dunn et al. (2008) se sont intéressés à un échantillon génétique limité de 29 espèces, Recueillant un total de 39,9 Mpb de séquences EST*.

Dans cette étude des nouvelles séquences EST ont été introduites afin d’améliorer la phylogénie des métazoaires.

Acoelomorphe et Nemertodermatide ont été longtemps un sujet de controverse pour leurs classifications. L’emplacement d’Acoelomorpha dans sa nouvelle case permettrais de comprendre l’évolution de l’arbre phylogénétique des bilateriens.

*Expressed Sequence Tag

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

Obtention d’EST

La construction d’une banque d’ADNc à partir d’ARNm, qui permet de reconstituer la structure probable d’un génome.

Leurs avantages

Enorme quantité et diversité des données des banques d’EST.

Reconstitution via les contig des séquences complètes d'ADNc

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

94 Espèces Banque d’EST

Séquençage et Assemblage

1 espèce de Spongiaires2 espèces d’Aceolomorphe2 espèces de Nermatodermatide1 espèce d’Entoprocte1 espèce de Cycliophore

*basic local alignment search tool** Markov Cluster algorithm

BLAST* MCL**

Homologie Paralogie

(Alignement des séquences)

SuperarbreSupermatrice

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

Arbre phylogénétique simplifié de Metazoa le plus probable

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

Acoelomorphe est le groupe externe le plus éminent pour faire des comparaisons entre protostomien et deutérostomien.

1) Acoelomorphe comme groupe frère des autres Bilatériens

Evolution rapide de séquences des espèces examinées

Acoeles ont été difficile à les emplacer

Acoele et Némertodermatide ACOELOMORPHE Groupe frère de

NephrozoaLes caractères morphologiques pour lesquelles on place et rassembler les Acoelomorphes, sont principalement ultra-structurales.

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

Les Acoelomorphes possèdent un système nerveux orthogonal et autre antérieur en forme d’anneau centralisé.

Caractère ancestral pour le Bilatérien

Le placement cohérent d’Acoelomorphe est groupe frère de Nephrozoa.

Dans Némertodermatide et Acoele il y a un orifice pour le système digestif Cet orifice est homologue à la bouche des bilatériens (Hejnol y Martiridale 2008).

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

2) Diminution le support de placement de Xenoturbella dans le Deutérostomien

Aucun support robuste au placement de Xenoturbella avec Deutérostomien

Les analyses de la nouvelle matrice placent Xenoturberlla avec Acoelomorpha

Des arguments morphologiques soutiennent le placement de Xenoturbella avec Acoelomorphe (Haszprunar, 1996 in présent étude). Par contre, un soutien morphologique fort n’a pas été apporté pour le placement avec Deutérostomien.

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

3) Cycliophores, Ectoproctes, Entoproctes et leurs parents

Première inclusion de Cycliophora dans une étude phylogénomique.

Symbion Pandora

Placement du cycliophore Symbion Pandora comme groupe frère d’ectoproctes.

Le clade composé d ’Entoprocta et Cycliophora a été placé comme frère d’Ectoprocte (Faible support de bootstrap!!!)

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

Entoprocta, Ectoprocta et Cycliophores

Polyzoa

Groupe frère de Platyzoa dans Spiralia

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

4) Cténophores et la base de l’arbre des Métazoaires

Cténophores comme groupe frère de tous les autres métazoaires.

Philippe et al. (2009) ont placé à Porifera comme frère de tous les autres métazoaires.

Schierwater et al. (2009) ont conclu que «Diploblastiques» (y compris Cténophore et Porifera), est frère de tous les autres animaux.

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

Indiscernable!!!

D’après Schierwater et al. 2009, PLoS Biology.

INTRODUCTION MATERIEL ET METHODES

RESULTATS ET DISCUSSION CONCLUSION

Le placement d’Acoelomorphe en effet un groupe frère de tous les autres Bilatériens.

  

Le placement des Cténophores est encore en débat.

Il faut faire plusieurs analyses phylogénétique (l'échantillonnage taxon plus loin, à la fois avec EST noveaux et projets de génomes pour Porifera Cténophore en particulier) pour éclaircir les divisions les plus profondes dans l'arbre de la vie de métazoaires.

Merci pour votre attention!