SARS-CoV-2 NGSパネル Illumina MGI · 2020-07-03 · SARS-CoV-2 NGSパネル...
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SARS-CoV-2 NGSパネル Illumina＆MGIシーケンサー対応!! 【特長】 ・SARS-CoV-2ウイルスの完全なゲノム配列決定を可能 ・非常に低いウイルスコピー数に対して卓越した感度 ・高い増幅の均一性と低いPCRバックグラウンドノイズ ・単一チューブ内および5.5時間のワークフロー 【CleanPlex® SARS-CoV-2 Panel】 本パネルは、SARS-CoV-2用のNGSパネルであり、完全ゲノム配列決定を可能にします。低ウイルスコピー、 低シークエンス深度の条件であっても卓越した感度で解析が可能なため、コストの大幅な削減につながります。 非標的DNAの除去 シャープかつクリーンな ライブラリピークが取得可能!! ▲バックグラウンドクリーニングを実施（ブルー）、未実施（オレンジ） ライブラリーのフラグメントサイズ分布 RNA Purification and QC 1. cDNA Synthesis 2. Target Amplification 3. Background Cleaning 4. Indexing & Amplification Quality Control & Sequencing CleanPlex Library Preparation Workflow ハンズオンタイム1時間で調製可能!!（トータルアッセイは5.5時間） CleanPlex® シリーズ 利点 ・高い増幅の均一性と低いPCRバックグラウンドノイズ ・正確なバリアントコール ・少ないシークエンスコスト ・単一チューブおよびハンズオンタイム3時間のワークフロー ・扱いが難しい試料（劣化したFFPE、cfDNA）との互換性 ・Illumina、MGISeqとの互換性 ・極めて高い感度（10ngインプットで1％LOD） 独自のプライマー設計アルゴリズム、均一なマルチプレックスPCR増幅、特許取得済のバックグラウンドクリーニングを組 み合わせることで、PCR、アンプリコンおよびハイブリッドキャプチャベースのターゲットエンリッチメントテクノロジーの限界を 打ち破ることができます。 ターゲットサイズ 29,903 bp アンプリコンの数 343 アンプリコンのサイズ 116 - 196 bp, Median 149bp プライマープールの数 2 メジャーな株の完全長をカバー MN908947, MT007544 Wuhan-Hu-1株(MN908947/NC_045512.2)全長を99.7%をカバーするよう設計されています。 独自開発のプライマー!! 大多数のSARS-CoV-2株の 全長解析が可能!!
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SARS-CoV-2 NGSパネルIllumina＆MGIシーケンサー対応!!
【特長】・SARS-CoV-2ウイルスの完全なゲノム配列決定を可能・非常に低いウイルスコピー数に対して卓越した感度・高い増幅の均一性と低いPCRバックグラウンドノイズ・単一チューブ内および5.5時間のワークフロー
【CleanPlex® SARS-CoV-2 Panel】
本パネルは、SARS-CoV-2用のNGSパネルであり、完全ゲノム配列決定を可能にします。低ウイルスコピー、低シークエンス深度の条件であっても卓越した感度で解析が可能なため、コストの大幅な削減につながります。
非標的DNAの除去 シャープかつクリーンなライブラリピークが取得可能!!
▲バックグラウンドクリーニングを実施（ブルー）、未実施（オレンジ）ライブラリーのフラグメントサイズ分布
RNA
Purification
and QC
1. cDNA Synthesis
2. Target Amplification
3. Background Cleaning
4. Indexing & Amplification
Quality
Control &
Sequencing
CleanPlex Library Preparation Workflow ハンズオンタイム1時間で調製可能!!（トータルアッセイは5.5時間）
CleanPlex® シリーズ
利点・高い増幅の均一性と低いPCRバックグラウンドノイズ・正確なバリアントコール・少ないシークエンスコスト・単一チューブおよびハンズオンタイム3時間のワークフロー・扱いが難しい試料（劣化したFFPE、cfDNA）との互換性・Illumina、MGISeqとの互換性・極めて高い感度（10ngインプットで1％LOD）
独自のプライマー設計アルゴリズム、均一なマルチプレックスPCR増幅、特許取得済のバックグラウンドクリーニングを組み合わせることで、PCR、アンプリコンおよびハイブリッドキャプチャベースのターゲットエンリッチメントテクノロジーの限界を打ち破ることができます。
ターゲットサイズ 29,903 bp
アンプリコンの数 343
アンプリコンのサイズ 116 - 196 bp, Median 149bp
プライマープールの数 2
メジャーな株の完全長をカバー MN908947, MT007544
Wuhan-Hu-1株(MN908947/NC_045512.2)全長を99.7%をカバーするよう設計されています。
独自開発のプライマー!! 大多数のSARS-CoV-2株の全長解析が可能!!
ゲノムカバレッジに関する参考データ
◀PEリード数とInputウイルスコピー数による10×のシークエンス深度のゲノムカバレッジ
低いウイルスコピー数においても高いゲノムカバレッジで解析可能!!
さまざまなウイルス量のサンプルを用いてテストした結果です。20 コピー/rxnであっても、50K PEで高いパフォーマンスを維持し、シークエンスコストを低く抑えることが可能です。
品名 容量 税別価格(For Illumina) 税別価格(For MGI)
CleanPlex® SARS-CoV-2 Panel
8 rxns ￥139,000 ￥129,000
96 rxns ￥737,000 ￥653,000
384 rxns ¥2,641,000 ¥2,319,000
※ CleanMag Magnetic BeadsはAgencourt™ AMPure™ XP Kit (Beckman Coulter)を代替品としてご使用いただけます。
※CleanPlex® SARS-CoV-2 Panel for Illuminaのテストデータです。
【お問い合わせ】 試薬部
TEL：052-624-4388 FAX：052-624-4389
メール：[email protected] URL：https://filgen.jp/
代理店
(July.2020)
フィルジェン 株式会社
臨床検体（鼻咽頭スワブ）から抽出した4〜40,000コピー/ µL（input：5.5 μl）RNAを使用したテストデータです。50×のシークエンス深度であっても低いシークエンスコストで全長をカバーすることが可能です。
◀PEリード数とInputウイルスコピー数による50×のシークエンス深度のゲノムカバレッジ
変異検出精度に関する参考データ 非常に高い精度でSARS-CoV-2の変異を検出することが可能!!
◀SARS-CoV-2 MT007544株RNAを使用して本パネルで全長解析を行い、検出が予想される4つの変異の検出率の結果
検出が予想される3箇所のSNVと1箇所の欠損を99％の頻度で検出することが可能です。
製品ラインナップと価格
品名 容量パネルt同時購入
税別価格(For Illumina)パネルと同時購入
税別価格(For MGI)
CleanPlex® Indexed PCR Primers8 rxns ¥32,000 -
96 rxns ¥87,000 ¥120,000
CleanMag® Magnetic Beads1 ml, 9 rxns ¥21,000 ¥21,000
5 ml, 45 rxns ¥43,000 ¥43,000
※ CleanPlex® Indexed PCR Primers と CleanMag Magnetic Beads はPanelに含まれおりませんので別途購入が必要です。
