PROFIL DE SENSIBILITÉ AUX ANTIBIOTIQUES DES...
Transcript of PROFIL DE SENSIBILITÉ AUX ANTIBIOTIQUES DES...
UNIVERSITE CHEIKH ANTA DIOP DE DAKAR
FACULTE DE MEDECINE, DE PHARMACIE ET D’ODONTOLOGIE
ANNEE 2012 N°47
THESE
POUR OBTENIR LE GRADE DE DOCTEUR EN PHARMACIE
(DIPLÔME D’ETAT)
PRESENTEE ET SOUTENUE PUBLIQUEMENT
LE 19 JUILLET 2012
PAR
M. ABDOULAYE CISSE
Né le 05 Avril 1984 à Bargny (SENEGAL)
MEMBRES DU JURY
PRẾSIDENT : M. Mounibé DIARRA Professeur titulaire
MEMBRES : M. Abdourahmane TALL Maître de conférences agrégé
Mme
M.
Amy Gassama
Djibril
SOW
FALL
Maître de conférences agrégé
Maître de conférences agrégé
DIRECTEUR DE THESE :
Co DIRECTEUR DE THESE
M.
M.
Cheikh Saad Bouh
Abdoulaye
BOYE
SECK
Professeur titulaire
Assistant
PROFIL DE SENSIBILITÉ AUX ANTIBIOTIQUES DES
BACILLES A GRAM NEGATIF ISOLÉS D’INFECTIONS
PURULENTES DE LA SPHÈRE ORL A DAKAR
FACULTE DE MEDECINE DE PHARMACIE ET D’ODONTOLOGIE
DECANAT & DIRECTION
DOYEN M. ABDARAHMANE DIA
PREMIER ASSESSEUR AMADOU DIOUF
DEUXIEME ASSESSEUR M. MALICK SEMBENE
CHEF DES SERVICES ADMINISTRATIFS M. SEYBATOU MAGATTE NDAW
DAKAR, LE 16 MAI 2012
LISTE DU PERSONNEL ENSEIGNANT PAR GRADE
ANNEE UNIVERSITAIRE 2011–2012
I. MEDECINE
PROFESSEURS TITULAIRES
M. José Marie AFOUTOU Histologie-Embryologie
M. Mamadou BA Pédiatrie
M. Mamadou BA Urologie
M. Serigne Abdou BA Cardiologie
M. Moussa BADIANE Radiologie
M. Seydou Boubakar BADIANE Neurochirurgie
M. Cheikh Ahmed Tidiane CISSE Gynécologie-Obstétrique
M Fallou CISSE Physiologie
M. Moussa Fafa CISSE Bactériologie-Virologie
§M. Jean Marie DANGOU Anatomie et Cytologie
Patho.
M. Abdarahmane DIA Anatomie-Chirurgie Générale
Mme Anta TAL DIA Médecine Préventive
M. Baye Assane DIAGNE Urologie
*M. Mame Thierno DIENG Dermatologie
M. Amadou Gallo DIOP Neurologie
M. Bernard Marcel DIOP Maladies Infectieuses
M EL Hadj Malick DIOP O-R-L
MmeThérèse MOREIRA DIOP Médecine Interne
M. Alassane DIOUF Gynécologie-Obstétrique
M. Boucar DIOUF Néphrologie
M. Raymond DIOUF O.R.L
M. Souvasin DIOUF Orthopédie-Traumatologie
M. Babacar FALL Chirurgie Générale
M. Ibrahima FALL Chirurgie Pédiatrique
Mme Sylvie SECK GASSAMA Biophysique
Mme Gisèle WOTO GAYE Anatomie Pathologique
M. Oumar GAYE Parasitologie
§ M. Lamine GUEYE Physiologie
M. Momar GUEYE Psychiatrie
*M. Serigne Maguèye GUEYE Urologie
M. Abdoul Almamy HANE Pneumophtisiologie
+*M. Mamadou Mourtalla KA Médecine Interne
M. Abdoul KANE Cardiologie
M. Assane KANE Dermatologie
M. Victorino MENDES Anatomie Pathologique
M. Jean Charles MOREAU Gynécologie-Obstétrique
M. Abdoulaye NDIAYE Anatomie-Orthopédie-
Trauma
M. Issa NDIAYE O.R.L
*M. Madoune Robert NDIAYE Ophtalmologie
M. Mouhamadou NDIAYE Chirurgie Thoracique&Cardio-
vasculaire
M. Mouhamadou Mansour NDIAYE Neurologie
M. Ousmane NDIAYE Pédiatrie
M. Papa Amadou NDIAYE Ophtalmologie
M. Alain Khassim NDOYE Urologie
*M. Mamadou NDOYE Chirurgie Infantile
*M. Abdou NIANG CM / Néphrologie
Mme Mbayang NDIAYE NIANG Physiologie
*M. Youssoupha SAKHO Neurochirurgie
M. Mohamadou Guélaye SALL Pédiatrie
M. Niama DIOP SALL Biochimie Médicale
M. Abdoulaye SAMB Physiologie
M. Mamadou SARR Pédiatrie
M. Moustapha SARR Cardiologie
§Mme Awa Marie COLL SECK Maladies Infectieuses
M. Seydina Issa Laye SEYE Orthopédie-Traumatologie
M. EL Hassane SIDIBE Endocrinologie-
Métabolisme
Nutrition-Diabétologie
*M. Masserigne SOUMARE Maladies Infectieuses
M. Ahmad Iyane SOW Bactériologie-Virologie
M. Housseyn Dembel SOW Pédiatrie
M. Mamadou Lamine SOW Médecine Légale
*M Papa Salif SOW Maladies Infectieuses
Mme.Haby SIGNATE SY Pédiatrie
M. Mouhamadou Habib SY Orthopédie-Traumatologie
§M Cheickna SYLLA Urologie
*M. Cheikh Tidiane TOURE Chirurgie Générale
M. Meïssa TOURE Biochimie Médicale
___________________________________________________________________________
__
+ Disponibilité
* Associé
§ Détachement
MAITRES DE CONFERENCES AGREGE
M. Abdoulaye BA Physiologie
Mme Aïssata LY BA Radiologie
M. EL Hadj Amadou BA Ophtalmologie
Mme Mariame GUEYE BA Gynécologie-Obstétrique
M. Momar Codé BA Neurochirurgie
M. Mamadou Diarrah BEYE Anesthésie-Réanimation
M. Boubacar CAMARA Pédiatrie
M. Mamadou Lamine CISSE Gynécologie-Obstétrique
M. Ahmadou DEM Cancérologie
+ *M Ibrahima DIAGNE Pédiatrie
M. Bay Karim DIALLO O.R.L
M. Djibril DIALLO Gynécologie-Obstétrique
*+M. Issakha DIALLO Santé Publique
M. Saïdou DIALLO Rhumatologie
* M. Babacar DIAO Urologie
M. Maboury DIAO Cardiologie
*M. Oumar DIARRA Chirurgie Thoracique & Cardio-
Vasculaire
M. Alassane DIATTA Biochimie Médicale
M. Charles Bertin DIEME Orthopédie-traumatologie
M. Madieng DIENG Chirurgie Générale
M. Yémou DIENG Parasitologie
M. El Hadj Ibrahima DIOP Orthopédie-Traumatologie
M. Ibrahima Bara DIOP Cardiologie
M. Mamadou DIOP Anatomie
M. Saïd Norou DIOP Médecine Interne II
M. Saliou DIOP Hématologie
Mme. Sokhna BA DIOP Radiologie
Mme. Elisabeth DIOUF Anesthésiologie-
Réanimation
M. Mamadou Lamine DIOUF Hépatologie / Gastro-
Entérologie
M. Saliou DIOUF Pédiatrie
Mme Awa Oumar TOURE FALL Hématologie Clinique
M. Pape Ahmed FALL Urologie
M. Babacar FAYE Parasitologie
§ Mme. Mame Awa FAYE Maladies Infectieuses
M. Oumar FAYE Parasitologie
M. Oumar FAYE Histologie-Embryologie
M. EL Hadj Fary KA Clinique
Médicale/Néphrologie
M. Ousmane KA Chirurgie Générale
M. Oumar KANE Anesthésie-Réanimation
M. Abdoulaye LEYE Clinique Médicale /
Médecine Interne
Mme Fatimata LY Dermatologie
*M. Mouhamadou MBENGUE Hépathologie / Gastro-
Entérologie
§ M. Mamadou MBODJ Biophysique
*M. Claude MOREIRA Pédiatrie
M. Philipe Marc MOREIRA Gynécologie
M. Moustapha NDIAYE Neurologie
*M. Papa NDIAYE Médecine Préventive
*M. Souhaïbou NDONGO Médecine Interne
*M. Cheikh Tidiane NDOUR Maladies Infectieuses
M. Jean Marc Ndiaga NDOYE Anatomie
Mme Marie DIOP NDOYE Anesthésie-Réanimation
M. Oumar NDOYE Biophysique
M. Gabriel NGOM Chirurgie Péditriaque
M. El Hadji NIANG Radiologie
Mme Suzanne Oumou NIANG Dermatologie
M. Abdoulaye POUYE CM / Médecine Interne
Mme Paule Aïda NDOYE ROTH Ophtalmologie
M. André Daniel SANE Orthopédie-
Traumatologie
Mme Fatou Samba D. NDIAYE SENE Médecine Interne
M. Moussa SEYDI Maladies Infectieuses
§ Mme Hassanatou TOURE SOW Biophysique
M. Omar SYLLA Psychiatrie
M. Abdourahmane TALL O.R.L
M. Mamadou Habib THIAM Psychiatrie
___________________________________________________________________________
__ + Disponibilité
* Associé
§ Détachement
MAITRES-ASSISTANTS
Mme Fatou Diallo AGNE Biochimie Médicale
Mme Ndèye Méry DIA BADIANE Maladies Infectieuses
M. El Hadj Souleymane CAMARA Orthopédie-Traumatologie
Mme. Mariama Safiétou KA CISSE Médecine Interne
M. André Vauvert DANSOKHO Orthopédie-Traumatologie
M. Daouda DIA Hépatologie / Gastro-Entérologie
Mme Ndèye Ramatoulaye DIAGNE Pédiatrie
M. Abdoulaye Séga DIALLO Histologie-Embryologie
M. Sylvie Audrey G. DIOP Maladies Infectieuses
M. Ansoumana DIATTA Pneumophtisiologie
M. Amadou Lamine FALL Pédiatrie
Mme Mame Coumba GAYE FALL Médecine du Travail
*M. Serigne Modou Kane GUEYE Gynécologie-Obstétrique
M. Adama KANE Cardiologie
Mme Yacine Dia KANE Pneumophtisiologie
*M. Abdoul Aziz KASSE Cancérologie
M. Ibrahima KONATE Chirurgie Générale
M. Noël Magloire MANGA Maladies Infectieuses
Mme Aminata DIACK MBAYE Pédiatrie
Mme Ndèye Maïmouna NDOUR MBAYE Médecine Interne
M. Amadou Koura NDAO Neurologie
M. Assane NDIAYE Anatomie
M. Jean Louis Abdourahim NDIAYE Parasitologie Médicale
* M. Malick NDIAYE O.R.L.
M. Mor NDIAYE Médecine du Travail
M. Ndaraw NDOYE Neurochirurgie
M. Lamine NIANG Urologie
Mme Anne Aurore SANKALE Chirurgie plastique et
reconstructive
Mme Anna SARR Médecine Interne
M. Ndéné Gaston SARR Biochimie Médicale
M. Amadou Makhtar SECK Psychiatrie
M. Gora SECK Physiologie
*M. Ibrahima SECK Médecine Préventive
Mme Aïda SYLLA Psychiatrie
M. Assane SYLLA Pédiatrie
M. Kamadore TOURE Santé Publique
Mme Nafissatou Oumar TOURE Pneumologie
M. Silly TOURE Stomatologie
Mme Aïssatou Magatte WANE Ophtalmologie
M. Issa WONE Médecine Préventive
ASSISTANTS
Mme Nafissatou Ndiaye BA Anatomie Pathologique
Mme Fatou CISSE Biochimie Médicale
M. Boubacar Samba DANKOKO Médecine Préventive
M. Mouhamadou Lamine DIA Bactériologie-Virologie
M Sidy Akhmed DIA Médecine du Travail
M. Chérif Mohamed M. DIAL Anatomie Pathologique
Mme. Mama SY DIALLO Histologie-embryologie
Mme. Marie Joseph DIEME Anatomie Pathologique
M. Dialo DIOP Bactériologie-Virologie
Mme. Abibatou SALL FALL Hématologie
M. Blaise Félix FAYE Hématologie Médicale
M. Macoura GADJI Hématologie
Mme Roughyatou KA Bactériologie – Virologie
M.Aïnina NDIAYE Anatomie
M. Boucar NDONG Biophysique
Mme Fatou Bintou SAR SARR Physiologie
M. Moussa SECK Hématologie
M. Mohamed Maniboliot SOUMAH Médecine légale
M. Roger Clément Kouly TINE Parasitologie Médicale
CHEFS DE CLINIQUE-ASSISTANTS
DES SERVICES UNIVERSITAIRES DES HOPITAUX
M. Idrissa BA Pédopsychiatrie
Mme Aïssatou BA Pédiatrie
M. Mamadou Diawo BAH Anesthésie-Réanimation
Mlle. Marie Louise BASSENE Hépato-gastroentérologie
M. Malick BODIAN Cardiologie
M. Amadou Gabriel CISS Chirurgie Thoracique & Cardio.
Vasc.
M. Mamadou CISSE Chirurgie Générale
M Mouhamadou Moustapha CISSE Néphrologie
Mme Ndèye Fatou COULIBALY Orthopédie-Traumatologie
M. Mamadou COUME Médecine Interne
M. Abdoulaye DANFA Psychiatrie
M. Richard Edouard Alain DEGUENONVO O-R-L
M. Mohamed Tété Etienne DIADHIOU Gynécologie-Obstétrique
M. Moussa DIALLO Dermatologie
M. Demba DIEDHIOU Médecine Interne II
Mme Mame Salimata DIENE Neurochirurgie
*M. Mamadou Moustapha DIENG Cancérologie
M. Pape Adama DIENG Chirurgie Thoracique & Cardio-
Vasculaire
Mme. Seynabou FALL DIENG Médecine Interne I
*Mme Marie Edouard Faye DIEME Gynécologie Obstétrique
Melle. Evelyne Siga DIOM O.R.L.
M. Abdoulaye Ndoye DIOP Radiodiagnostic
M. Pape Saloum DIOP Chirurgie Générale
M. Rudolph DIOP Stomatologie
M. Assane DIOUF Maladies Infectieuses
M. Doudou DIOUF Cancérologie
M. Boubacar FALL Urologie
M. Lamine FALL Pédopschyatrie
M. Mohamed Lamine FALL Anesthésie-réanimation
Mm. Anna Modji Basse FAYE Neurologie
M. Atoumane FAYE Médecine Interne
M. Papa Lamine FAYE Psychiatrie
*M. Papa Moctar FAYE Pédiatrie
Mme. Louise FORTES Maladies Infectieuses
M. Pape Macoumba GAYE Cancéro-radiothérapie
M. Aly Mbara KA Ophtalmologie
M. Amadou Ndiassé KASSE Orthopédie-Traumatologie
M. Yakham Mohamed LEYE Médecine Interne
M. Alassane MBAYE Cardiologie
M. Magatte MBAYE Gynécologie-Obstétrique
M. Lamine NDIAYE Chirurgie Plastique et
Reconstructive
M. Maodo NDIAYE Dermatologie
M. Mouhamadou Bamba NDIAYE Cardiologie
M. Papa Ibrahima NDIAYE Anesthésie Réanimation
Mme Ndèye Dialé Ndiaye NDONGO Psychiatrie
M. Oumar NDOUR Chirurgie Pédiatrique
Mme Marguerite Edith D. QUENUM Ophtalmologie
M. Jean Claude François SANE Orthopédie-Traumatologie
Mme Lala Bouna SECK Neurologie
Mme. Marième Soda DIOP SENE Neurologie
Melle Adjaratou Dieynabou SOW Neurologie
M. Alioune Badara THIAM Neurochirurgie
*M. Amath THIAM Urologie
M. Mbaye THIOUB Neurochirurgie
___________________________________________________________________________
__ + Disponibilité
* Associé
§ Détachement
II. PHARMACIE
PROFESSEURS TITULAIRES
M. Emmanuel BASSENE Pharmacognosie et Botanique
M. Cheikh Saad Bouh BOYE Bactériologie-Virologie
*M. Aynina CISSE Biochimie Pharmaceutique
Mme Aïssatou Gaye DIALLO Bactériologie-Virologie
Mme Aminata SALL DIALLO Physiologie Pharmaceutique
M. Mounibé DIARRA Physique Pharmaceutique M. Alioune DIEYE Immunologie
* M. Amadou Moctar DIEYE Pharmacologie et Pharmacodynamie
M. Pape Amadou DIOP Biochimie Pharmaceutique
M. Amadou DIOUF Toxicologie
M. Babacar FAYE Pharmacologie et Pharmacodynamie
*M. Souleymane MBOUP Bactériologie-Virologie
* M. Omar NDIR Parasitologie
MAITRES DE CONFERENCES AGREGES
Melle Thérèse DIENG Parasitologie
M. Tandakha Ndiaye DIEYE Immunologie
M. Yérim Mbagnick DIOP Chimie Analytique
M. Djibril FALL Pharmacie Chimique & Chimie Orga.
M. Mamadou FALL Toxicologie
M. Bara NDIAYE Chimie Analytique
M. Daouda NDIAYE Parasitologie
Mme. Maguette D.SYLLA NIANG Immunologie
Mme. Philomène LOPEZ SALL Biochimie Pharmaceutique
M. Mamadou SARR Physiologie Pharmaceutique
M. Guata yoro SY Pharmacologie et Pharmacodynamie
M. Oumar THIOUNE Pharmacie Galénique
M. Alassane WELE Chimie Thérapeutique
MAITRES DE CONFERENCES
. M. Matar SECK Pharmacie Chimique et Chimie Organique
MAITRES-ASSISTANTS
Mme. Rokhaya Ndiaye DIALLO Biochimie Pharmaceutique
M. Pape Madièye GUEYE Biochimie Pharmaceutique
M. Modou Oumy KANE Physiologie
M. Gora MBAYE Physique Pharmaceutique
Mme Aïssatou GUEYE NDIAYE Bactériologie-Virologie
*M. Augustin NDIAYE Physique Pharmaceutique
*M. Mamadou NDIAYE Pharmacologie et Pharmacodynamie
Mme Rita B. NONGONIERMA Pharmacognosie
Mme. Awa Ndiaye SY Pharmacologie
ASSISTANTS Melle Aïda Sadikh BADIANE Parasitologie
Mme Kady Diatta BADJI Botanique
M. Makhtar CAMARA Bactériologie-virologie
M. William DIATTA Botanique
M. Adama DIEDHIOU Chimie Thérapeutique & Organique
M. Amadou DIOP Chimie Analytique
M. Ahmédou Bamba K. FALL Pharmacie Galénique
M. Alioune Dior FALL Pharmacognosie
*M. Babacar FAYE Chimie Générale
Mme. Rokhaya Sylla GUEYE Pharmacie Chimique et Chimie Organique
M. Babacar MBENGUE Immunologie
*Mme Halimatou Diop NDIAYE Bactériologie – Virologie
M. Mouhamadou NDIAYE Parasitologie
M. Idrissa NDOYE Pharmacie Chimique et Chimie
Organique
Mme. Mathilde M. P. Cabral NDIOR Toxicologie
M. Serigne Omar SARR Chimie Analytique & Bromatologie
M. Abdoulaye SECK Bactériologie –Virologie
* M. Mame Cheikh SECK Parasitologie
ATTACHES
M. Louis Augustin D. DIOUF Physique Pharmaceutique
M. Djiby FAYE Pharmacie Galénique
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__
* Associé
III. CHIRURGIE DENTAIRE
PROFESSEUR TITULAIRE
M. Boubacar DIALLO Chirurgie Buccale
M. Papa Demba DIALLO Parodontologie
Mme Ndioro NDIAYE Odontologie Préventive et Sociale
M. Malick SEMBENE Parodontologie
MAITRES DE CONFERENCES AGREGES
Mme Khady DIOP BA Orthopédie Dento-Faciale
M Henri Michel BENOIST Parodontologie
*M. Falou DIAGNE Orthopédie Dento-Faciale
Mme Adam Marie SECK DIALLO Parodontologie
M. Daouda FAYE Odontologie Préventive et Sociale
M. Abdoul Wakhabe KANE Odontologie Cons. Endodontie
§ Mme Charlotte FATY NDIAYE Chirurgie Buccale
Mme Fatou gaye NDIAYE Odontologie Conservatrice Endodontie
* M. Pape Ibrahima NGOM Orthopédie Dento-Faciale
Mme Soukèye DIA TINE Chirurgie Buccale
M. Babacar TOURE Odontologie Conservatrice Endodontie
CHARGE D’ENSEIGNEMENT
M. Abdoul Aziz YAM Pédodontie-Prévention
MAITRES ASSISTANTS
Mme Aïssatou TAMBA BA Pédodontie-Prévention
M. Daouda CISSE Odontologie Prév. et Sociale
Mme Fatou DIOP Pédodontie-Prévention
M. Babacar FAYE Odontologie Cons. Endodontie
M. Malick FAYE Pédodontie
M. Cheikh Mouhamadou M. LO Odontologie Prév. Sociale
*M. Malick MBAYE Odontologie Cons. Endodontie
M. El Hadj Babacar MBODJ Prothèse Dentaire
M. Paul Débé Amadou NIANG Chirurgie Buccale
Mme Farimata youga DIENG SARR Matières Fondamentales
M. Mouhamed SARR Odontologie Cons. Endodontie
*M. Mohamed Talla SECK Prothèse Dentaire
ASSISTANTS
M. Abdou BA Chirurgie Buccale
M Alpha BADIANE Orthopédie Dento-Faciale
M. Khaly BANE O.C.E.
Mme Binetou C. GASSAMA BARRY Chirurgie Buccale
*M. Khalifa DIENG Odontologie Légale
*M. Lambane DIENG Prothèse Dentaire
M. Abdoulaye DIOUF Parodontologie
M. Massamba DIOUF Odontologie Prév. et Sociale
M. Joseph Samba DIOUF Orthopédie Dento-Faciale
*M. Moctar GUEYE Prothèse Dentaire
Mme Ndèye Nguiniane Diouf GAYE Odontologie Pédiatrique
M. Papa Abdou LECOR Anatomo- Physiologie
Mme Fatou LEYE O.C.E.
M. Edmond NABHANE Prothèse Dentaire
M. Cheikh NDIAYE Prothèse Dentaire
M. Oumar Harouna SALL Matières Fondamentales
M. Babacar TAMBA Chirurgie Buccale
M. Saïd Nourou TOURE Prothèse Dentaire
__________________________________________________
_
* Associé
§ Détachement
DEDICACES
C'est Toi que nous adorons et c'est Toi dont nous implorons
le secours, louanges à Allah, l'Eternel, l'Omniscient, le Tout
Puissant.
Ta miséricorde est sur ceux qui espèrent de Toi.
Tu nous as permis de surmonter les difficultés avec
sérénité. Guide nos pas sur le chemin qu'il nous reste à
parcourir afin que nous demeurions fidèles à tes
recommandations.
Ouvres-nous les portes de ton savoir et de ta connaissance.
"Amin"
IN MEMORIUM
A mes frères, cousins, oncles, tantes, grands-parents:
Reposez en paix. Que dieu vous accueille dans son paradis.
Je dédie ce travail …
A mon père
Je connais tes vertus d'homme, ton courage exceptionnel.
Tu as beaucoup compté pour moi, et aucun mot ne saurait exprimer tout l'amour
que je ressens pour toi.
Ce modeste travail est le fruit des multiples efforts fournis pour l'éducation et la
réussite de tes enfants.
Depuis tant d'années tu attendais ce jour qui, je l'espère te comblera de bonheur.
Que Dieu t'accorde longue vie et une santé de fer.
Affection indéfectible
A ma mère "sama serigne"
Avec courage et dignité tu as subi les souffrances de ce monde, espérant édifier
un avenir meilleur pour tes enfants. Adorable mère, tes efforts n’ont pas été
vains.
Voilà enfin tes prières exaucées
Mère, ton amour, ta compréhension et ta confiance ont fait de moi ce que je suis
aujourd'hui.
Dis-moi mère, que serais-je devenu sans toi ?
Tu t'es toujours sacrifiée pour nous ; et ton soutien qui ne m'a jamais fait défaut
m'a été d'une grande aide.
Dis-moi mère, comment te remercier, comment payer cette dette infinie ?
Mon amour et mon respect pour toi ont beau être grand, ils ne pourront jamais
égaler tes peines et tes tourments.
Mère, à toi je dis Merci et je prie pour que Dieu te donne longue vie et bonne
santé.
A mon maitre et guide Serigne Cheikh Al Makhtoum Sy.
A Mes frères et Sœurs
Vous faites partie de ceux que j'aime le plus au monde.
Rien n'est plus important qu'une famille unie, comme nous l'avons toujours été
et comme je souhaite que nous le restions toujours.
Ce travail est le vôtre.
A mes neveux et nièces :
Je vous souhaite du courage et une vie pleine de succès.
A ma grande sœur Fatou Cissé et son mari Mouhamed Gueye.
Que Dieu fortifie votre union et vous prête longue vie et bonne santé.
A mon grand frère, ami et confident… "Dr Serigne cissé"
Je ne saurais écrire en si peu de mots tout ce que vous représentez pour moi.
Votre soutien et votre aide ont été inestimables.
Que Dieu vous garde encore parmi nous pour que vous puissiez continuer à nous
assister aussi bien que vous l’avez toujours fait.
Encore une fois merci frère.
A la famille Cissé, Gueye, Seck, Pouye de Bargny
Toute ma sympathie
A Cynthia Nykerk et ses parents Dave et Mary
Ma profonde reconnaissance.
A mes oncles et tantes.
Mon affection et ma gratitude.
A Pouye Laye Diop, Serigne Pouye, Baye weuss, Pape Tafsir, Mansour bah,
Moussa Ndour, Mame Ass, Moussa Samb, Bill, Behel, Babacar (alias Diatt),
Abasse, et tous les ‘‘Aramndouleurs’’
Que nos liens fraternels se consolident et que notre amitié se perpétue.
A tous mes amis
Je ne citerai pas vos noms, de peur d'en oublier certains mais je suis convaincu
que vous saurez vous reconnaître.
"Que Dieu nous donne ce qu'il y a de mieux pour nous
A Imam Adama Bâ, Cheikh Ousmane Sall, Matar Sarr, Mbaye Aw, Serigne
Dame Diop, Diawara Niane
Vous n'avez cessé de m'encourager et de prier pour moi.
Merci pour votre soutien.
Puisse Dieu vous élever au rang des grands maitres spirituels.
A mes cousins et cousines
A Madame Thiam, Khady Thiam, Amadou Diop, Dr Assane Dieng, Omar
Sagna, Pa Badji, Djibi, Michel et toute l’équipe du Micro CSB
Pour l'élaboration de ce travail, vous avez mis toute votre ardeur, votre désir de
bien faire, votre amabilité.
Tous mes remerciements.
A Moussa Ndour, Ass, Djibi, Mouhamed, Naby, Ababacar Sarr, Francis,
Paterne, Cheikh Tall Thiam, Mody……..
Je n'oublierai jamais les moments passés ensemble au campus social, moments
de stress, de tristesse et de bonheur.
Soyez assurés de mon amitié profonde et sincère !
A mes amis et cothèsards,
Aliou Diaw, Mariéme Ndiongue, Josiane, Abdoulaye Diop, Fousseyni, Adja
Diop, Mambu.
A tous mes amis de la promotion 2010 de pharmacie :Koumba Simone Dieng,
Moussa Ndour, Ndiogou, Jannot, Aicha Diallo, Aissatou Gueye, Marie Louise
Depina, Héléne, Lithio, Aboubakry, Madiagne, Cheikh Camara, Isaac,
Ndiaga, Khadim Syll…
Le chemin a été long, mais très agréable avec vous depuis les révisions au Jardin
Botanique en 1ère
année jusqu'aux activités de Fin de Promotion en 5ième
année.
Sachez que ces souvenirs resteront à jamais gravés dans ma mémoire.
A ma future épouse espoir.
Sincères remerciements
A tout le personnel du laboratoire de Bactériologie- Virologie du CHU
Aristide Le Dantec particulièrement l'équipe Micro CSB Système.
A tout le personnel du service d’ORL et CCF du CHU FANN pour leur très
bonne collaboration
A Dr Fatoumata Diouf, Marthe Elie Diouf, Brigitte Parodi, Dr Mbop, Matar
Fall, Koumba Simone Dieng, Moussa Ndour « camarade de galère » pour
vos conseils précieux.
Vous n'avez cessé de m'encourager ; merci infiniment.
A Dr Soares et tout le personnel de la Pharmacie Actuel.
Dès le 1er
jour vous m'avez aimé et adopté comme votre frère, fils et ami.
Merci pour cette "Terranga" que je n'oublierais jamais
A Dr Seydina Alioune Mbengue, Dr Louise, Dr Galass ainsi qu’à leurs
personnels. Merci pour tout.
A Dr Gora Niang et famille.
Profonde gratitude.
Aux familles Gueye, Aw et Diouf particulièrement à ma sœur et amie Bana
Aw et Vieux Madiagne Diouf plus qu’un ami mais un frère.
Merci pour votre assistance et votre soutien sans faille.
Que Dieu vous prête longue vie et bonne santé.
A tous ceux qui de près ou de loin ont contribué à l'élaboration de ce
travail.
REMERCIEMENTS
A notre Maître, Juge et Directeur de thèse, Monsieur le Professeur CHEIKH SAAD-BOUH BOYE
Notre passage dans votre laboratoire de Bactériologie nous a
permis d'apprécier vos qualités d'homme de rigueur. Votre
simplicité contraste avec votre culture scientifique et votre goût
du travail bien fait qui nous ont tant inspiré.
Soyez assuré, cher Maître de notre profonde gratitude. Nous vous
remercions d'avoir accepté de diriger ce travail malgré vos lourdes
charges.
A notre Maître et Juge, Monsieur le Professeur Mounibé DIARRA
La qualité de votre enseignement et la spontanéité avec laquelle
vous avez accepté d'être notre juge, malgré vos multiples
occupations, nous ont profondément marquées.
Trouvez ici, cher Maître, le témoignage de notre profonde
gratitude et l'expression de nos sentiments respectueux.
A notre Maître et Juge, Monsieur Abdourahmane TALL Maitre de conférences agrégé
Vous nous faites un grand honneur en acceptant de siéger notre
jury de thèse, malgré vos multiples sollicitations
Nous admirons la simplicité, la bonté, la constante disponibilité,
l'amour du prochain qui ont fait de vous un maître exemplaire,
prestigieux et respectable.
Soyez assuré cher Maître de notre très haute considération et de
notre profonde gratitude.
A notre Maître et Juge, Madame Amy Gassama SOW Maitre de conférences agrégé
La spontanéité avec laquelle vous avez accepté de siéger dans
notre jury de thèse nous a fait énormément plaisir.
Soyez assuré de notre vive et respectueuse reconnaissance et de
notre profond attachement.
A notre Maître et Juge, Monsieur Djibril FALL Maitre de conférences agrégé
Vous nous avez honorés en acceptant avec spontanéité de juger
ce travail.
Nous avons été comblés par les enseignements de qualités dont
nous avons bénéficié à vos côtés.
Vos qualités humaines et votre connaissance large font de vous
un modèle incontesté.
Veuillez accepter cher maitre, nos sincères remerciements
A notre Maître et Co- Directeur de Thèse Docteur Abdoulaye Seck
Vous nous avez initiés à la recherche dans la rigueur et vous avez
conduit ce travail avec beaucoup d’intérêt.
Vous avez su nous mettre à l’aise dans votre service.
Votre disponibilité, générosité, rigueur et sympathie font de vous
une personne que nous admirons.
Nous avons eu en face de nous, non seulement un Maître, mais
aussi un ami.
Nous espérons ne pas vous avoir déçu.
« Par délibération, la faculté a arrêté que les opinions émises
dans les dissertations qui lui seront présentées doivent être
considérées comme propres à leurs auteurs et qu'elle n'entend
leur donner aucune approbation. »
Figure 1 : Coupe verticale de l’oreille ............................................................... 2
Figure 2 : Coupe verticale de la paroi externe de la fosse nasale droite ............ 4
Figure 3 : Coupe de la région nasale de la face .................................................. 4
Figure 4 : Coupe verticale de la tête .................................................................. 6
Figure 5 : Algorithme d’isolement et d’identification d’Haemophilus
influenzae ......................................................................................................... 29
Figure 6 : Algorithme d’isolement et d’identification de Moraxella
catarrhalis ........................................................................................................ 30
Figure 7: Algorithme d’isolement et d’identification des entérobactéries ........ 31
Figure 8 : Algorithme d’isolement et d’identification de Pseudomonas
aeruginosa ....................................................................................................... 32
Figure 9: Répartition des germes isolés ........................................................... 38
LISTE DES FIGURES
Tableau I : Conditions de réalisation des antibiogrammes des différents
germes. ............................................................................................................. 34
Tableau II : Répartition des patients selon l’âge et le sexe ............................. 37
Tableau III : Répartition des souches isolées en fonction du prélèvement ...... 38
Tableau IV : Profil de sensibilité des souches de Pseudomonas aeruginosa
isolées .............................................................................................................. 40
Tableau V : phénotypes de résistance des souches de Pseudomonas
aeruginosa aux bêta-lactamines ................................................................... 40
Tableau VI : Profil de sensibilité des souches de Klebsiella pneumoniae
isolées .............................................................................................................. 41
Tableau VII : phénotypes de résistance des souches de Klebsiella pneumoniae
aux beta-lactamines .......................................................................................... 41
LISTE DES TABLEAUX
SOMMAIRE
INTRODUCTION .............................................................................................1
PREMIERE PARTIE: GENERALITES
I- GENERALITES SUR LES INFECTIONS DE LA SPHERE ORL .. 2
I-1. DEFINITION .............................................................................................. 2
I-2. DESCRIPTION ANATOMIQUE ................................................................ 2
I-2-1. L’OREILLE ............................................................................................. 2
I-2-2. LES FOSSES NASALES ET LES SINUS ............................................... 3
I-2-3. LE PHARYNX, LE LARYNX ET LE VOILE DU PALAIS ................... 5
I-3. ASPECTS CLINIQUES DES INFECTIONS ORL...................................... 7
I-3-1. ANGINES ................................................................................................ 7
I-3-2. RHINO-PHARYNGITES......................................................................... 7
I-3-3. LES OTITES ........................................................................................... 8
I-3-4.LES SINUSITES ..................................................................................... 10
I-3-5. LARYNGITE ......................................................................................... 12
I-3-6. AUTRES FORMES CLINIQUES .......................................................... 12
I-4. GERMES EN CAUSE ............................................................................... 12
I-4-1. RAPPELS EPIDEMIOLOGIQUES........................................................ 12
I-4-2. LES PRINCIPALES BACTERIES ........................................................ 13
I-4-2-1. Haemophilus influenzae ...................................................................... 13
I-4-2-2. Moraxella catarrhalis ......................................................................... 14
I-4-2-3. Les streptocoques ................................................................................ 14
I-4-2-4. Pseudomonas aeruginosa .................................................................... 15
I-4-2-5. Les entérobactéries .............................................................................. 16
I-4-2-6. Les bactéries anaérobies ...................................................................... 16
I-4-3. LES CHAMPIGNONS ........................................................................... 16
I-4-4. LES VIRUS ............................................................................................ 17
I-5. RESISTANCE BACTERIENNE ............................................................... 17
I-5-1. LES DIFFERENTS TYPES DE RESISTANCE ..................................... 18
I-5-2. SUPPORT GENETIQUE ....................................................................... 19
I-5-2-1. Résistance chromosomique ................................................................ 19
I-5-2-2. Résistance extra-chromosomique ........................................................ 20
I-5-3. MECANISMES DE RESISTANCE AUX ANTIBIOTIQUES ............... 20
I-6. EVOLUTION DE LA SENSIBILITE DES DIFFERENTS GERMES ...... 21
I-6-1. Haemophilus influenza ........................................................................... 21
I-6-2. Moraxella catarrhalis ............................................................................. 21
I-6-3. Streptococcus pneumonia ....................................................................... 22
I-6-4. Streptococcus pyogenes .......................................................................... 22
I-6-5. Pseudomonas aeruginosa ....................................................................... 22
I-6-6. Entérobactéries ....................................................................................... 23
DEUXIEME PARTIE: TRAVAIL PERSONNEL
I- CADRE DE L’ETUDE ....................................................................... 24
II- OBJECTIFS DE L’ETUDE ............................................................. 24
III- MATERIELS ET METHODES ..................................................... 24
III-1. MATERIELS .......................................................................................... 24
III-1-1. POPULATION D’ETUDES ................................................................ 24
III-1-2. MATERIELS ....................................................................................... 24
III-2. METHODOLOGIE ................................................................................. 26
III-2-1. PRELEVEMENTS .............................................................................. 26
III-2-2. ANALYSES BACTERIOLOGIQUES ................................................ 27
IV-RESULTATS ................................................................................... 37
IV-1. POPULATION D’ETUDE ..................................................................... 37
IV-2. BACTERIOLOGIE ................................................................................ 37
IV-3. SENSIBILITE AUX ANTIBIOTIQUES ................................................ 39
V-DISCUSSION ..................................................................................... 43
RECOMMANDATIONS ............................................................................... 51
CONCLUSION............................................................................................... 52
BIBLIOGRAPHIE ......................................................................................... 54
INTRODUCTION
1
Les infections ORL constituent un problème de santé publique, de par leur
fréquence, la multiplicité de leurs manifestations cliniques ainsi que leurs
complications. Elles sont d’origine virale dans 70 % des cas contre 30% pour
une origine bactérienne [2].
L’utilisation abusive des antibiotiques dans les infections, particulièrement
celles d’ORL a favorisé l'apparition de la résistance aux antibiotiques.
L’épidémiologie des agents étiologiques de ces infections doit être bien connue
par le médecin afin de promouvoir l’utilisation judicieuse de l'antibiothérapie.
Cette dernière, lorsqu'elle est justifiée, ne peut être que probabiliste basée sur les
données épidémiologiques locales.
De nombreuses études ont montré que les bactéries les plus fréquemment
isolées de ces prélèvements d’ORL sont Streptococcus pneumoniae,
Haemophilus influenzae et Moraxella catarrhalis et dans les angines,
Streptococcus pyogenes. Les autres espèces (Staphylococcus aureus,
Pseudomonas aeruginosa, entérobactéries et anaérobies) sont retrouvées avec
une fréquence plus faible.
Dans certains cas, ces infections peuvent devenir purulentes du fait de la
présence de germes pyogènes. Peu d’études ont été consacrées à ces infections
purulentes en ORL.
C’est dans ce cadre que nous avons mené cette étude dont les objectifs
étaient :
D’isoler et d’identifier les bacilles à Gram négatif responsables
d’infections purulentes en ORL.
D’étudier leur profil de sensibilité vis-à-vis des antibiotiques.
2
I. GÉNÉRALITÉS SUR LES INFECTIONS DE LA SPHÈRE ORL
I-1. Définition
L’ORL ou oto-rhino-laryngologie est une spécialité médicale et
chirurgicale étudiant la physiologie des oreilles, du nez et de la gorge (larynx et
pharynx), la pathologie et le traitement des maladies d’une région anatomique
comprise entre la base du crâne (en haut) et l’orifice supérieur du thorax (en
bas), excepté les dents et les yeux [39].
I-2. Description anatomique [54]
II--22--11.. LL’’oorreeiillllee
L’oreille est un organe neurosensoriel à double fonction : il assure
l’audition et joue un rôle très important dans l’équilibre. Cet organe comprend
plusieurs parties : l’oreille externe, l’oreille moyenne et l’oreille interne (Cf.
figure1).
Figure 1 : Coupe frontale de l’oreille [52]
3
L’oreille externe
Elle est constituée par le pavillon et le conduit auditif externe (CAE).
L’oreille externe collecte les sons. Le CAE peut être assimilé à un diverticule
cutané étendu de la conque à la membrane tympanique qu’il tapisse.
L’oreille moyenne
Elle comprend un ensemble de cavités aériennes centré sur la caisse du
tympan (ou tympanum), prolongé vers l’avant par le protympanum et la trompe
d’Eustache, et vers l’arrière par les cellules mastoïdiennes. La membrane
tympanique sépare la caisse et le CAE.
L’oreille interne
Elle contient les organes neurosensoriels pour les deux grandes fonctions :
Le canal cochléaire pour l’audition et les macules de l’utricule et du saccule
ainsi que les cupules des canaux semi-circulaires dont l’ensemble constitue le
vestibule destiné à l’équilibre.
II--22--22.. LLeess ffoosssseess nnaassaalleess eett lleess ssiinnuuss
Ceux-ci constituent avec le cavum une unité anatomique qui représente la
partie purement aérienne des voies aéro-digestives supérieures. L’infection de
l’un de ces éléments risque de retentir sur les autres parties de cet ensemble (cf.
figure 2 et 3).
4
Figure 2 : Coupe frontale de la paroi externe de la fosse nasale droite [53].
Figure 3 : Coupe frontale de la région nasale de la face [53].
Les fosses nasales
Elles forment deux cavités situées au milieu du massif facial supérieur,
sous la partie médiane de l’étage antérieur de la base du crâne, séparées par une
cloison sagittale, et protégées en avant par un auvent appelé pyramide nasale.
Leur paroi latérale joue un rôle considérable dans la physiologie respiratoire
grâce aux cornets qui augmentent considérablement la surface muqueuse et
protègent les méats. Dans le méat moyen débouchent les sinus antérieurs, et
dans le méat inférieur le canal lacrymal.
5
La muqueuse nasale a une fonction olfactive et respiratoire.
Les sinus de la face
Ils constituent un ensemble de cavités pneumatiques dérivées des fosses
nasales, creusées à la périphérie des cavités orbitaires.
Il y a quatre types de sinus :
Le sinus maxillaire : l’ostium se situe à la partie supéro-médiale de la
cavité sinusienne, expliquant son éventuel mauvais drainage.
Les cellules ethmoïdales : elles sont situées entre la partie haute des
fosses nasales et l’orbite.
Le sinus sphénoïdal : il est situé en haut et en arrière des fosses nasales,
sous l’étage moyen de la base du crâne.
Le sinus frontal : Le développement varie beaucoup d’un sujet à l’autre
et chez un même sujet d’un côté à l’autre. L’agénésie n’est pas
exceptionnelle.
II--22--33.. LLee pphhaarryynnxx,, llee llaarryynnxx eett llee vvooiillee dduu ppaallaaiiss ((ccff.. FFiigguurree 44))
Le pharynx
C’est un conduit musculo-membraneux, disposé verticalement en avant de
la colonne cervicale, derrière la face, étendu de la base du crâne à la partie
supérieure du cou. Il constitue un large vestibule où se croisent la voie
respiratoire et la voie digestive.
La partie supérieure du pharynx constitue le cavum nasopharyngien ou
rhinopharynx. L’oropharynx, centre du carrefour aéro-digestif, correspond à la
partie postérieure de la cavité buccale et comprend, de chaque côté, la loge de
6
l’amygdale palatine, entre les deux piliers du voile. L’hypopharynx, situé devant
les 5ème
et 6ème
vertèbres cervicales, au-dessous de l’oropharynx, est séparé de lui
par un plan fictif passant par l’os hyoïde. C’est une région essentiellement
digestive mais dont l’atteinte peut engendrer des troubles respiratoires.
Le larynx
C’est un tube coudé et rétréci à la partie moyenne, constituant la partie
supérieure de la trachée. Il a trois fonctions :
respiratoire, lorsque les cordes s’écartent.
phonatoire, lorsque celles-ci se rapprochent.
sphinctérienne en constituant une barrière de protection pour la
trachée.
Le voile du palais
Cette cloison musculo-membraneuse sépare les portions nasale et buccale
du pharynx.
Figure 4 : Coupe verticale de la tête [29].
7
I-3 Aspects cliniques des infections ORL
I-3-1. Angines [16]
L'angine est une inflammation du pharynx et/ou de ses annexes
lymphoïdes, qui se manifeste par une douleur constrictive de la gorge spontanée
ou augmentée à la déglutition, un érythème, et à des degrés divers d'intensité et
de fréquence, de la fièvre et une hypertrophie ganglionnaire locorégionale.
Ce syndrome concerne prioritairement l'enfant de plus de 2 ans et l'adulte
de moins de 40 ans. La grande majorité des angines sont érythémateuses ou
érythématopultacées. Les angines ulcéreuses et pseudomembraneuses sont
beaucoup plus rares. Elles doivent entraîner une prise en charge particulière en
raison d'étiologies spécifiques.
Les angines érythémateuses et érythématopultacées sont causées par le
streptocoque A dans 15 à 25 % des cas chez l'adulte et dans 25 à 50 % des cas
chez l'enfant, notamment à l'occasion d’endémies.
Plus rarement, les streptocoques C, G et F peuvent entrainer une angine.
Plus de la moitié des angines sont d'étiologie virale.
I-3-2. Rhino-pharyngites [16]
La rhinopharyngite est la première pathologie infectieuse de l’enfant et la
première cause de consultation en pédiatrie. Son incidence est plus élevée chez
l’enfant, particulièrement en âge préscolaire, que chez l’adulte. Elle est définie
comme une atteinte inflammatoire de l’étage supérieur du pharynx
(Rhinopharynx) à laquelle vient s’associer de façon variable une atteinte nasale.
Elle est principalement d'origine virale et reste une pathologie bénigne,
d'évolution spontanément favorable en 7 à 10 jours.
8
I-3-3. Les otites [9, 29, 46, 48, 55]
LLeess oottiitteess aaiigguuëëss
C’est une pathologie inflammatoire ou infectieuse de l’oreille externe ou
de l’oreille moyenne.
Si les otites externes surviennent à tout âge, les otites moyennes aiguës
sont essentiellement observées chez l’enfant, en particulier avant l’âge de 3 ans.
Elles sont plus rares chez l’adulte mais les séquelles fonctionnelles
auditives et/ou infectieuses d’otites de l’enfance peuvent persister à l’âge adulte
sous la forme d’une otite chronique.
L’otite moyenne aiguë de l’enfant
C’est une complication infectieuse la plus commune de l’enfance.
Environ 70% des enfants font une otite aiguë avant l’âge de 3 ans. La
survenue d’un premier épisode avant l’âge de 3 mois est un facteur pronostic
péjoratif en ce qui concerne le risque de récidives et de survenue d’une otite
chronique.
Le sexe mâle et la vie en collectivité sont des facteurs de risques reconnus
de survenue et de récidive des otites aiguës.
La survenue d’un épisode de rhinopharyngite virale et le
dysfonctionnement de la trompe d’Eustache qui en résulte sont les facteurs
déclenchant de l’infection de l’oreille moyenne.
Il est établi que ce sont les germes situés dans le rhinopharynx qui, en
colonisant l’oreille moyenne, déterminent la survenue d’une otite.
9
Les germes responsables d’otite moyenne aiguë (OMA) sont
essentiellement Haemophilus influenzae et Streptococcus pneumoniae.
Chez l’enfant de moins de trois mois la fréquence des otites à
Pseudomonas aeruginosa et à Staphylococcus aureus justifie la pratique d’une
paracentèse.
L’otite moyenne aiguë de l’adulte
Elle est le plus souvent unilatérale. Le diagnostic est facile devant une
otalgie importante, pulsatile, associée à une baisse de l’audition et à une
température supérieure à 38° C.
Ces otites sont le plus souvent dues à Haemophilus influenzae ou à
Staphylococcus aureus.
LLeess oottiitteess cchhrroonniiqquueess
L’otite moyenne chronique (OMC) est une inflammation de l’ensemble
des cavités de l’oreille moyenne prolongée au-delà de trois mois. Le caractère
extrêmement vague de cette définition traduit bien la complexité de cette
maladie qui reste aujourd’hui encore au centre des préoccupations des
otologistes.
Malgré les multiples facettes sous laquelle elle se présente chez l’adulte et
malgré le caractère multifactoriel de sa pathogénie, l’OMC peut être conçue
comme l’équivalent d’un trouble de cicatrisation d’une blessure auriculaire de
l’enfance qui, pour des raisons encore mal connues, se différencie en un certain
nombre de tableaux cliniques bien différents (l’otite muqueuse à tympan ouvert,
l’otite cholestéatomateuse).
10
La culture de l’otorrhée purulente montre la prédominance régulière de
trois bactéries aérobies : Pseudomonas aeruginosa, Staphylococcus aureus et
Proteus mirabilis.
Les otites externes
C’est une pathologie inflammatoire ou infectieuse de la peau du conduit
auditif externe.
Elle se manifeste par une douleur intense irradiant à la joue et au cou
associé à un écoulement purulent.
Les germes responsables sont Pseudomonas aeruginosa et Staphylococcus
aureus.
Les mycoses du conduit auditif sont particulièrement fréquentes dans les
pays tropicaux et en période estivale. Elles se manifestent par un prurit et un
écoulement.
À l’examen, le conduit est comblé par des formations filamenteuses
blanches ou noires. Le prélèvement effectué en cas de doute montre la présence
de Candida albicans ou d’Aspergillus niger.
I-3-4. Les sinusites [8, 18, 27, 29]
Les sinus de la face sont tapissés d’une muqueuse de type respiratoire.
Leur infection par des bactéries est responsable d’une sinusite.
Les rhinites virales ou coryza sont le phénomène initiateur le plus fréquent
des sinusites aiguës. D’autres facteurs tels qu’une déviation de cloison, une
infection dentaire ou une polypose naso-sinusienne prédisposent à l’infection
des sinus.
11
LLeess ssiinnuussiitteess aaiigguuëëss
Les sinusites aiguës sont une complication des rhinopharyngites virales. Il
est probable que l’altération de la clairance muco-ciliaire et les lésions
muqueuses secondaires à une infection virale favorisent la réplication
bactérienne.
Une sinusite aiguë peut également être l’extension directe d’une infection
dentaire ou chronique d’une molaire ou d’une prémolaire du maxillaire
supérieur. La sinusite est alors dite unilatérale et s’accompagne d’une rhinorrhée
fétide et parfois d’une inflammation cutanée en regard. En l’absence de soins
dentaires, l’évolution de la sinusite se fait vers la chronicité.
Les germes responsables des sinusites aiguës sont essentiellement
Haemophilus influenzae et Streptococcus pneumoniae chez l’adulte. La présence
des germes anaérobies est surtout fréquente au cours des sinusites d’origine
dentaire.
LLeess ssiinnuussiitteess cchhrroonniiqquueess
Le développement d’une sinusite chronique est classiquement rapporté à
la répétition et à l’insuffisance de traitements d’épisodes de sinusite aiguë. Il est
favorisé par des facteurs locaux (mycose, corps étrangers), régionaux (foyer
infectieux dentaire) ou généraux (terrain immuno-déprimé).
Le diagnostic de sinusite chronique est difficile et est souvent rapporté à
tort chez un patient présentant des céphalées ou des douleurs de la face.
Une sinusite chronique en dehors d’une poussée de réchauffement est soit
asymptomatique, soit se manifeste par une rhinorrhée purulente antérieure et/ou
postérieure, une obstruction nasale et parfois une sensation de plénitude de la
face.
12
Les germes en cause sont multiples : Streptococcus pneumoniae,
Haemophilus influenzae, streptocoques alpha et bêta hémolytiques,
Staphylococcus aureus.
Des bacilles à Gram négatif en particulier Pseudomonas aeruginosa,
Klebsiella pneumoniae et Proteus mirabilis.
Des germes anaérobies, seuls ou en association à des germes aérobies,
sont retrouvés dans 30 à 50% des prélèvements.
I-3-5. Laryngite [46]
C’est une inflammation du larynx pouvant siéger à l’étage sous-glottique,
sus-glottique ou au niveau de l’orifice glottique. De nombreux virus, et parfois
bactéries, peuvent pénétrer dans le corps par la gorge et infecter rapidement le
larynx.
I-3-6. Autres formes cliniques [46]
Adéno-phlegmons : Inflammation avec suppuration (abcès) au niveau
d'un ganglion lymphatique et s'étendant au tissu cellulaire voisin.
Cellulites : La cellulite cervico-faciale est une infection poly microbienne
du tissu cellulo-adipeux ayant une tendance extensive.
I-4.Germes en causes
I-4-1. Rappels épidémiologiques [12, 18]
De nombreuses études à travers le monde ont montré que :
Dans les otites moyennes aigues: Haemophilus influenzae est le germe le
plus fréquemment isolé suivi de Streptococcus pneumoniae et de
Moraxella catarrhalis.
13
Dans les sinusites aigues la même tendance est observée.
Il faut cependant noter que les bacilles à Gram négatif et staphylocoques
sont très rarement isolés dans ces types de pathologies.
Le nombre de décès dû aux infections respiratoires aiguës chez les enfants
de moins de 5 ans dans le monde est estimé actuellement à 1.900.000/an. Les
infections respiratoires aiguës sont les infections les plus fréquentes de l’enfant.
Elles sont la cause de 30 à 40% des hospitalisations d’enfants.
Les pneumonies et broncho-pneumonies représentent 70 – 80% des
admissions pour infections respiratoires aiguës.
I-4-2-Principales bactéries
I-4-2-1. Haemophilus influenzae [18, 22]
H. influenzae appartient à la famille des Pasteurellaceae et fait partie de la
flore normale des muqueuses des voies respiratoires supérieures de l’enfant et de
l’adulte.
H. influenzae est avant tout responsable d’infections communautaires de la
sphère ORL de l’enfant et de l’adulte et de surinfections broncho-pulmonaires
de l’adulte (plus rarement de l’enfant lors de différentes anomalies, dilatation de
bronches, mucoviscidose). Ces infections sont provoquées par des souches non
capsulées, exceptionnellement par des souches capsulées.
H. influenzae se place en tête avec le pneumocoque et est responsable
d’une pathologie communautaire en l’occurrence la pneumonie à tous les âges
de la vie.
14
I-4-2-2. Moraxella catarrhalis [1, 23]
M. catarrhalis appartient à la famille des Moraxellaceae. Il est strictement
humain et fait partie de la flore commensale du nez et du rhino-pharynx.
M. catarrhalis est responsable d’infections aiguës localisées telles que
l’otite moyenne, la sinusite et des broncho-pneumopathies qui peuvent être
mortelles, de maladies systémiques incluant endocardites et méningites. Il est
aussi responsable de plusieurs cas d’infections respiratoires basses chez les
patients âgés souffrant d’une obstruction pulmonaire chronique, d’une bronchite
chronique ou d’une pneumonie franche.
I-4-2-3. Les streptocoques [14, 25]
Streptococcus pneumoniae et Streptococcus pyogenes appartiennent à la
famille des Streptococcaceae.
Streptococcus pneumoniae
Le pneumocoque est un des hôtes normaux des voies respiratoires
supérieures de l'homme. Il se transmet d'homme à homme par voie aérienne. On
ne le trouve pas dans la nature et très rarement chez l'animal qui est, dans ce cas,
contaminé par l'homme.
La pneumonie franche lobaire aiguë est la plus classique des
pneumococcies ; elle cède bien aux traitements antibiotiques mais reste
redoutable chez le sujet âge ou immunodéprimé.
Parfois l'infection respiratoire à pneumocoque est une bronchite catarrhale
grave chez le nourrisson (bronchite capillaire), le vieillard ou l'immunodéprimé.
Les séreuses peuvent être infectées : pleurésie avec risque d'empyème,
péricardite, synovite ou péritonite.
15
Le pneumocoque est également responsable d'autres infections ORL (otites,
mastoïdites, sinusites, angines, pharyngites et laryngites). Ces infections sont
plus fréquentes chez l'enfant.
La bactérie peut atteindre les méninges par contiguïté ou par voie
hématogène provoquant une méningite purulente d'évolution souvent sévère ou
compliquée par la survenue de cloisonnements de l'espace sous-arachnoïdien.
Le pouvoir pathogène du pneumocoque dépend de la présence de la capsule
qui le rend résistant à la phagocytose. En se fixant à la capsule, les anticorps
protecteurs rendent la phagocytose plus facile (ce sont des opsonines).
Streptococcus pyogenes
Le streptocoque bêta-hémolytique du groupe A est la principale cause
d'infections à streptocoque chez l'homme mais on peut en trouver dans la gorge
des sujets bien portants.
Les streptococcies aiguës sont bénignes ou sévères mais sont susceptibles
d'occasionner des affections non suppuratives redoutables en pathologies auto-
immunes regroupées sous l'appellation de syndromes post-streptococciques
telles que le rhumatisme articulaire aigu (RAA), la glomérulonéphrite aiguë
(GNA) entre autres.
I-4-2-4. Pseudomonas aeruginosa [24]
Pseudomonas aeruginosa est l'espèce bactérienne dont l'habitat est le plus
vaste. Il vit à l'état saprophyte dans l'eau et les sols humides ou à la surface des
végétaux mais résiste mal à la dessiccation. Il vit également à l'état commensal
dans l'intestin de l'homme et des animaux. Plus rarement, il est isolé de la peau
et des muqueuses de l'homme et des animaux.
16
Pseudomonas aeruginosa peut être impliqué dans des infections
communautaires et c'est l'un des germes le plus fréquemment isolé lors
d'infections nosocomiales. À lui seul, il représente environ 90% de toutes les
espèces de Pseudomonas spp. isolées au laboratoire.
Il est le prototype des bactéries pathogènes opportunistes et il est isolé
d'infections très diverses.
I-4-2-5. Les entérobactéries [21]
La famille des Enterobacteriaceae comprend de plusieurs genres et espèces
( exemple : Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter aerogenes
etc.) et sont définies comme des bacilles à Gram négatif mobiles grâce à une
ciliature péritriche ou immobiles, aéro-anaérobies facultatifs, se développent
aisément sur des milieux ordinaires, fermentent le glucose, sont dépourvus
d’oxydase, possèdent en général une catalase et réduisent les nitrates en nitrites,
poussent facilement sur les milieux ordinaires en 24 heures à 37°C sur milieux
gélosés. Les colonies sont habituellement lisses, brillantes ou parfois rugueuses.
Leurs exigences nutritionnelles sont en général réduites et la plupart se
multiplient en milieu synthétique avec comme source de carbone simple comme
le glucose.
I-4-2-6. Les bactéries anaérobies [20, 48]
Elles peuvent être retrouvées dans les infections ORL tels que Bacteroides
fragilis, ainsi que Fusobacterium, qui, associé à un spirochète est responsable de
l’angine de Vincent.
I-4-3. Les champignons [28, 44]
Ils peuvent être à l’origine d’infections ORL. Il y a l’aspergillose des fosses
nasales et des cavités annexes, due à Aspergillus fumigatus avec un début est
17
marqué par une rhinite vaso-motrice suivie d’un tableau de rhino-sinusite
purulente. Il y a également les otomycoses telles que la candidose du conduit
auditif externe due à Candida albicans et l’aspergillose du conduit auditif
externe due à Aspergillus niger.
I-4-4. Les virus [7, 15, 31, 40]
Les infections respiratoires virales représentent environ 70% des causes
d’infections respiratoires aiguës.
La gravité d’une infection virale est fonction du virus respiratoire et d’une susceptibilité
individuelle des agents de surinfection. De manière générale, les bactéries sont surtout des
agents de surinfection.
Les virus les plus fréquemment retrouvés sont : le rhinovirus, le virus syncitial
respiratoire, le virus para influenzae 2 et l’adénovirus.
Les virus plus rarement retrouvés sont : le virus influenzae B et le virus para influenzae
1.
Ces virus peuvent provoquer des manifestations respiratoires associées à d’autres
manifestations cliniques.
I-5. Résistance bactérienne
La résistance bactérienne aux antibiotiques est apparue rapidement après
leur introduction dans le traitement des maladies infectieuses. Cette résistance
est un facteur majeur compliquant le traitement des infections bactériennes et la
dissémination des souches multi résistantes.
La résistance bactérienne aux antibiotiques se caractérise par son caractère
naturel ou acquis, son mécanisme et son support génétique. [51]
Deux définitions de la résistance bactérienne aux antibiotiques peuvent être
retenues:
18
une souche est dite « résistante » lorsque la concentration d’antibiotique
qu’elle est capable de supporter est notamment plus élevée que la
concentration atteignable in vivo.
une souche est dite « résistante» lorsqu’elle supporte une concentration
d’antibiotique notamment plus élevée que celle qui inhibe le
développement de la majorité des autres souches de la même espèce.
I-5-1. Les différents types de résistances [11]
D’une manière générale, la résistance des bactéries aux antibiotiques est
de déterminisme génétique. Elle est soit naturelle, soit acquise. Elle peut aussi
être clinique.
La résistance naturelle
La résistance naturelle d’une espèce ou d’un genre est une caractéristique
propre, concernant l’ensemble des souches de l’espèce ou du genre. Elle est
portée par un chromosome donc toujours transmissible à la descendance
(transmission verticale), elle possède aussi un caractère permettant de définir le
phénotype sauvage de l’espèce.
La résistance naturelle aide à l’identification d’une espèce.
La résistance acquise
La résistance acquise, pour sa part ne concerne qu’une proportion plus ou
moins importante des souches d’une espèce.
Elle résulte d’une modification génétique par mutation ou par acquisition
de plasmides ou transposons, (résistance extra chromosomique) transmissible
horizontalement, parfois entre espèces différentes.
Elle définit des phénotypes «résistants».
19
Les résistances croisées s’expriment au sein d’une même classe
d’antibiotiques et sont dues au même mécanisme de résistance.
La résistance clinique
Elle se traduit par l’échec thérapeutique. Plusieurs facteurs entrent en
cause dans ce type de résistance :
des facteurs environnementaux (cations, protéines inhibitrices etc.)
la pharmacocinétique
le choix judicieux de l’antibiotique
les mécanismes développés par les bactéries.
I-5-2. Support génétique [11, 32]
Au plan génétique, la résistance acquise peut survenir par mutation
ponctuelle, par remaniement du génome ou par acquisition de matériel génétique
étranger.
I-5-2-1. Résistance chromosomique (résistance naturelle)
Il peut s’agir :
D’une mutation ponctuelle dans un gène de résistance entraînant par
exemple une hypersécrétion d’enzymes inactivant les antibiotiques ou
dans un gène de structure qui modifie le spectre d’une enzyme.
Une mutation se caractérise par la rareté, la spontanéité, la discontinuité,
la spécificité, l’indépendance et la stabilité.
D’un remaniement du génome. A titre d’exemple, il peut s’agir de
l’insertion de séquences apportant un promoteur permettant d’exprimer
20
des gènes silencieux ou alors de l’acquisition de fragments de
chromosomes étrangers par transformation.
I-5-2-2. Résistance extra-chromosomique (résistance acquise)
L’information génétique est portée par des plasmides transférables à
d’autres bactéries par conjugaison, par transduction ou par transformation.
L’ensemble de ces gènes peut être sur des fragments d’ADN appelés
« transposons » qui peuvent s’intégrer soit dans des plasmides, soit dans le
chromosome.
I-5-3. Mécanisme de résistance des germes aux antibiotiques [11]
Pour agir, l’antibiotique doit pénétrer dans la bactérie, trouver la cible
moléculaire de son action, y parvenir sous sa forme active et s’y maintenir à son
contact à une concentration suffisante.
Les mécanismes de la résistance reposent sur le blocage de ces différentes
étapes d’action d’un antibiotique :
l’absence de pénétration de l’antibiotique par diminution ou
suppression de la perméabilité pariétale ou membranaire.
l’altération de la cible moléculaire soit par modification du site de
fixation de la cible ou par dégradation enzymatique de cette cible. Dans
certains cas, la cible peut avoir disparu ou être substituée par une autre
molécule ; dans tous les cas l’antibiotique ne pourra pas se fixer.
La sortie excessive de l’antibiotique hors de la bactérie va entraîner une
concentration insuffisante de l’antibiotique dans la bactérie.
L’inactivation enzymatique de l’antibiotique : celui-ci pourra être
détruit par les bactéries soit par hydrolyse (pénicillinase,
21
céphalosporinase, etc.) ou alors il peut être modifié dans sa structure
chimique et c’est ce qui se passe avec les aminosides si la bactérie
possède une acetylase, une adenylase ou une phosphorylase. Ces enzymes
d’inactivation sont très nombreuses et il en existe pour la plupart des
bactéries.
I-6. Evolution de la sensibilité des différents germes
I-6-1. Haemophillus influenzae [5, 32, 42]
Il secrète des β-lactamases ce qui est à l’origine de sa résistance aux
amino-pénicillines. La résistance à l’amoxicilline peut être observée chez des
souches non productrices de β-lactamase mais par modification d’affinité de la
cible des PLP ou par diminution de la perméabilité de la membrane externe aux
antibiotiques. Il y a une émergence de la résistance au co-trimoxazole. La
résistance au chloramphénicol est rare dans la plupart des pays du monde. Les
macrolides classiques (érythromycine, spiramycine, lincomycine) sont peu actifs
sur Haemophilus contrairement aux nouveaux (azithromycine, clarithromycine).
I-6-2. Moraxella catarrhalis [5, 32, 42]
La majorité des souches est sensible aux céphamycines, aux
céphalosporines, à l’association amoxicilline-acide clavulanique, aux
tétracyclines et au co-trimoxazole. Environ 90 % des souches produisent une β-
lactamase plasmidique TEM1 ; l’efficacité de l’amoxicilline est restaurée par
son association avec l’acide clavulanique.
I-6-3. Streptococcus pneumoniae [5, 32, 45]
La résistance des pneumocoques aux β-lactamines est due à la modification
d’affinité d’une ou de plusieurs cibles de type PLP (Protéines Liant la
Pénicilline). Ce qui définit alors une résistance de niveau variable : BNR (bas
22
niveau de résistance) et HNR (haut niveau de résistance). S. pneumoniae
présente une sensibilité diminuée à la pénicilline mais avec un bas niveau de
résistance. De plus, les pneumocoques peuvent acquérir dans leur matériel
génétique des fragments d’ADN provenant d’autres espèces bactériennes,
notamment des streptocoques α-viridans commensaux du nasopharynx. Ce qui
conduit à l’altération des PLP et au développement de la résistance aux
antibiotiques. Une résistance aux céphalosporines de troisième génération a
également été observée. Celle-ci est souvent associée à la résistance aux
tétracyclines, aux macrolides (anciens et nouveaux) et au co-trimoxazole. La
résistance aux macrolides est due à une modification de la cible et à un efflux de
l’antibiotique à l’extérieur de la bactérie.
I-6-4. Streptococcus pyogenes [5, 9, 10, 42]
Il présente une sensibilité à la pénicilline et aux céphalosporines. Une
résistance naturelle à bas niveau vis-à-vis des aminosides liée à son métabolisme
uniquement anaérobie est également notée. Par contre une résistance aux
macrolides est observée. Les streptocoques résistants aux anciens macrolides
sont aussi résistants aux nouveaux.
I-6-5. Pseudomonas aeruginosa [13]
Il présente une résistance naturelle à de nombreux antibiotiques en raison
de l’imperméabilité de sa paroi ; en effet une surexpression de la porine OprM,
constituant de la membrane externe du système d’efflux MexAB et MexXY, a
été notée. Celle-ci est à l’origine de la diminution de sa sensibilité à la
ticarcilline. Il produit également une céphalosporinase chromosomique. Au
cours des temps, les souches ont développé une résistance acquise. La plupart
des isolats de Pseudomonas aeruginosa résiste aux aminopénicillines, à
l’association amoxicilline-acide clavulanique, aux céphalosporines de première,
de deuxième et parfois de troisième génération de même qu’aux tétracyclines,
23
aux macrolides, à la rifampicine et aux phénicolés. Le bacille pyocyanique
résiste aux β-lactamines par production de β-lactamases, aux aminosides par
diminution de la perméabilité de la membrane externe et aux fluoroquinolones
par modification du lipopolysaccharide de sa paroi.
Les antibiotiques pouvant être actifs sur P. aeruginosa, sont la ticarcilline,
associée ou non à l’acide clavulanique, la pipéracilline, associée ou non au
tazobactam, la ceftazidime, le céfépime, l’aztréonam, l’imipénéme, le
méropénème, l’amikacine, la tobramycine, la ciprofloxacine, la fosfomycine et
la colistine. La ciprofloxacine et la fosfomycine doivent être utilisés en
association avec d’autres classes d’antibiotiques pour éviter la sélection de
mutants résistants.
I-6-6. Entérobactéries [3, 26]
Elles résistent aux β-lactamines par production de β-lactamase à spectre
étendu (BLSE) surtout chez Klebsiella pneumoniae et Escherichia coli et
Enterobacter cloacae. Une résistance aux céphalosporines de troisième
génération est également observée par production d’une céphalosporinase,
surtout chez les espèces du genre Enterobacter. Les entérobactéries ont un taux
élevé de résistance acquise à la pénicilline A. Une augmentation de la résistance
aux aminosides a été notée, due à la diffusion d’enzymes inactivatrices.
24
I. Cadre de l’étude
Cette étude prospective a été réalisée à l’Unité de Recherche, d’Expertise et
de Biotechnologie Microbienne du laboratoire de bactériologie-virologie de
l’hôpital Aristide Le Dantec en collaboration avec la clinique d’ORL et CCF de
l’hôpital de FANN d’octobre 2010 à Juillet 2011.
II. Objectifs de l’étude
L’objectif était d’isoler et identifier les bactéries à Gram négatif
responsables d’infections purulentes de la sphère ORL et d’étudier leur profil
sensibilité aux antibiotiques.
III. Matériels et méthodes
III-1. Matériels
III-1-1. Population d’étude
Les patients inclus dans l’étude présentaient une infection purulente de la
sphère ORL. Ils étaient soit hospitalisés soit reçus en consultation externe sans
distinction d’âge et de sexe.
III-1-2. Matériels
Miroir de Clar
Microscope muni d’aspirateur
Spéculum auriculaire
Otoscope
Sonde d’aspiration molle
Écouvillons stériles
Tubes à hémolyse
Seringues
25
Eau physiologique
Glacière
Réfrigérant
Anse de platine
Boîtes de Pétri
Bec Bunsen
Pipettes Pasteur
Jarre d’incubation
Générateur de CO2 ou bougie
Etuve à 37°C
Autoclave
Lames porte-objet
Microscope optique
Micro galerie d’identification
Pinces
Boîtes de Pétri
Pipettes graduées
Densitomètre
Tubes Mac Farland 0,5
Milieux de culture
Gélose Mueller-Hinton (MH)
Gélose trypticase-soja
Gélose au sang cuit
Gélose EMB
Gélose CLED
Gélose au sang cuit+polyvitex
Bouillon thioglycolate
Bouillon cœur-cervelle
26
Glycérol
Lait écrémé
Réactifs
Disques d’oxydase
Kit coloration de Gram
Peroxyde d’hydrogène 3%
Disques d’antibiotiques
III-2. Méthodologie
III-2-1. Prélèvements
Les prélèvements ont été réalisés dans le respect strict des règles d’asepsie
et de stérilité.
Les otorrhées : le pus de l’oreille était prélevé à l’aide d’une sonde molle
adaptée à un aspirateur puis mis dans un tube stérile. Ce type de
prélèvement permettait d’éviter la contamination par les germes
saprophytes du conduit auditif externe.
Les prélèvements sinusiens : ils étaient effectués soit par aspiration à la
seringue des sécrétions purulentes de l’écoulement méatique soit par
écouvillonnage dans le pharynx postérieur.
Les pus de cellulites et de phlegmons : ils étaient obtenus par ponction à
la seringue après désinfection par la Bétadine.
Les prélèvements pharyngés : un écouvillonnage sur les surfaces de
chaque amygdale et sur la muqueuse pharyngée était effectué après
abaissement de la langue qui permettait de bien visualiser l’oropharynx et
les amygdales mais aussi éviter la contamination par les germes salivaires.
27
Les rhinorées : le prélèvement a été réalisé par écouvillonnage à l’aide
d’un spéculum nasal stérile.
Les prélèvements étaient transportés au laboratoire dans une glacière
contenant des réfrigérants puis pris en charge dans un délai de moins quatre
heures.
Une partie des prélèvements était déchargée dans du bouillon cœur-cervelle
et conservée à -70°C.
III-2-2. Analyse bactériologique
Examen macroscopique
Permet l’appréciation de l’aspect purulent ou non des prélèvements.
Examen microscopique
Pour chaque produit pathologique deux frottis ont été réalisés, l’un coloré
au Gram et l’autre au bleu de méthylène.
L’observation microscopique à l’objectif 100 permettait d’apprécier :
L’aspect de la flore
La formule leucocytaire
Culture
Tous les milieux de culture ont été soumis à un contrôle de qualité avant leur
utilisation :
28
Contrôle de stérilité et de fertilité
Contrôle de stérilité
Permet de vérifier l’absence de culture sur le milieu préparé non
ensemencé et incubé pendant 24 à 48h à l’étuve.
Contrôle de fertilité
Permet de vérifier une bonne pousse de la souche de référence repiquée
sur le milieu préparé et incubé pendant 24-48h.
Milieux de culture
Plusieurs milieux étaient ensemencés en fonction de la bactérie à isoler :
GSC + Polyvitex pour Haemophilus influenzae et Moraxella catarrhalis
Gélose CLED et EMB pour les Entérobactéries et bacilles à Gram
négatif non fermentaires.
Le bouillon d’enrichissement au thioglycolate était également utilisé dans
le but d’augmenter le taux d’isolement des germes recherchés.
Tous les milieux ensemencés étaient incubés à 37°C à l’étuve.
29
Identification des germes (Cf. Figures 5, 6, 7, 8)
Coloration de Gram Culture sur GSC supplémenté
Recherche de l’exigence en facteurs de croissance : X (hémine) et V(NAD)
Haemophilus influenzae
Galerie API-NH, latex (+)
Non H.influenzae
Non H.influenzae
Figure 5 : Algorithme d’isolement et d’identification d’Haemophilus influenzae
Petites colonies rondes à aspect
de gouttes de rosée, non
hémolytique.
Polymorphisme : petits bacilles,
longs bacilles ou coccobacilles
Gram positif
Prélèvements
(Otites, rhinopharyngite, sinusites…)
Catalase : positif
Oxydase : positif
Souche exigeant les
deux facteurs(X, V)
Souche n’exigeant pas
les deux facteurs (X, V)
Présence de colonies autour
de la strie de S.aureus
Absence de colonies
autour de la strie de
S.aureus
GLU : + LAC : −
MAL : + SAC : −
RIB : + XYL : +
Méthode des disques
→ Ensemencement sur gélose
→ Dépôt de disque de facteurs X, V et XV
Test de Satellitisme
→ Ensemencement sur GSO
→ Strie de S. aureus
30
Culture sur GSC supplémentée Coloration au Gram
Moraxella catarrhalis
Figure 6 : Algorithme d’isolement et d’identification de Moraxella catarrhalis
Prélèvements
(Otites, Rhinopharyngite,
sinusites…..)
Petites colonies rondes,
lisses, grises, pas
d’hémolyse.
Diplocoques en
grain de café Gram
Négatif
Test à la catalase : Positif
Test à l’oxydase : Positif
PEN (−) URE (−) Gal(−) PROA(−)
GLU (−) LIP (+) GGT(−) FRU( −)
MAL(−) SAC( −) ODC( −) IND( −)
31
Culture sur milieu EMB Coloration au Gram
Suspicion d’entérobactéries
‘
− +
+ −
+ - + -
Enterobacter Klebsiella Citrobacter E. coli
→E. aerogenes →K. pneumoniae →C. freundii -Urée −
(ADH−, LDC+) (Indole+) (H2S+) -Indole+
→E. cloacae →Autres Klebsiella →Autres Citrobacter
(ADH+, LDC−) (Indole−) (H2S−)
Figure 7: Algorithme d’isolement et d’identification des entérobactéries
Présence de colonies après
24heures d’incubation à
37°C à l’étuve
Prélèvements
(Otite, rhinopharyngite,
cellulites….)
Bacille Gram Négatif
Lactose
E. coli
Klebsiella
Enterobacter
Citrobacter
Proteus
Providencia
Salmonella
Shigella
ODC CS
VP
Oxydase : Négatif
Glucose : Positif
32
Culture sur gélose Mac Conkey Coloration au Gram
Mini-galerie d’identification
Pseudomonas aeruginosa
Figure 8 : Algorithme d’isolement et d’identification de Pseudomonas aeruginosa
Prélèvement
(Otites, rhinopharyngite,
cellulite…)
Colonies Lactose négatif, « en œuf
sur le plat » avec des pigments bleu-
vert et une odeur caractéristique
(acacia ou seringa)
Bacilles à Gram
négatif
Test à la catalase : positif
Test à l’oxydase : négatif
Mannitol (-) CS (-) Glucose (-) Gaz (-) Urée:(-)
Indole (-)
Mobilité (+) Lactose (−) H2S (-)
33
Antibiogramme
Mode opératoire :
Une suspension bactérienne était préparée à partir d’une ou de deux
colonies d’une culture jeune de 18 à 24h avec de l’eau physiologique.
La suspension était calibrée à l’aide d’un densitomètre avec un inoculum
de :
0,5 Mac Farland pour les Entérobactéries et bacilles non-fermentaires.
1 Mac Farland pour Moraxella catarrhalis et Haemophilus influenzae.
Après calibrage, ces suspensions étaient diluées au :
1/100éme
pour les Entérobactéries et bacilles non fermentaires
1/10éme
pour M. catarrhalis et H. influenzae.
Les conditions de réalisation de l’antibiogramme des différents germes sont
résumées dans le tableau I.
34
Tableau I : Conditions de réalisation des antibiogrammes des différents
germes.
Caractéristiques
Germes
H. influenzae M.catarrhalis Entérobactéries Pseudomonas et
Acinetobacter
Durée de la culture
bactérienne(h)
24 24 24 24
Milieux HTM GSC + Poly vitex MH MH
Incubation 37°C, 5%CO2 35°C, 5%CO2 37°, sans CO2 37, sans CO2
Temps
d’incubation
24h 24h 24h 24h
Inoculum
(McFarland)
1,0 1,0 0,5 0,5
Souches de contrôle
H influenzae
ATCC 49247
Les boîtes de pétri étaient ensemencées par écouvillonnage et les disques
d’antibiotiques choisis en fonction du germe isolé étaient appliqués à la surface
de la gélose à l’aide d’un distributeur de disques.
Haemophilus influenzae : Amoxicilline, Amoxicilline/acide clavulanique,
ticarcilline, ceftriaxone, cefotaxime, cefepime,
ciprofloxacine, lévofloxacine, ofloxacine,
clindamycine, chloramphénicol, pristinamycine,
tétracycline.
35
Moraxella catarrhalis : Amoxicilline, Amoxicilline/acide clavulanique,
ticarcilline, ceftriaxone, cefotaxime, cefepime,
clarithromycine, érythromycine, spiramycine,
vancomycine, teicoplanine, chloramphénicol,
pristinamycine, tétracycline.
Entérobactéries : Amoxicilline, Amoxicilline/acide clavulanique,
ticarcilline, ticarcilline/acide clavulanique,
pipéracilliine, pipéracilliine/tazobactam,
cefuroxime,
ceftazidime, ceftriaxone, cefotaxime, cefepime,
céfaclor, céfixime, aztréonam, imipenem,
amikacine, gentamycine, tobramycine, acide
nalidixique, ciprofloxacine, pefloxacine, colistine,
chloramphénicol,
doxycycline, tétracycline.
Pseudomonas et Acinetobacter baumannii: pipéracilliine, ticarcilline,
ticarcilline/acide clavulanique, ceftazidime,
cefsulodine, cefepime, aztréonam, imipenem,
gentamicine, netilmicine, tobramycine,
ciprofloxacine, lévofloxacine, ofloxacine, colistine.
36
Détection de la production de bêta-lactamase
La détection était basée sur la recherche de synergie entre un disque
Amoxicilline/acide clavulanique (ou Ticarcilline/acide clavulanique) et des
disques de céphalosporines de 3eme
génération (cefotaxime, ceftazidime),
céfépime et aztréonam (voir photo1).
Photo 1 : image de Klebsiella pneumoniae βLSE isolée de pharyngite.
Lecture, interprétation et exploitation des résultats :
Les diamètres d’inhibition ont été mesurés à l’aide d’un pied à coulisse.
L’interprétation des résultats était réalisée suivant les recommandations du CA-
SFM 2011) avec comme outil d’exploitation le logiciel WHONET 5.4 (World
Health Organisation Network).
Conservation des souches bactériennes
Toutes les souches pathogènes isolées ont été conservées dans une souchetéque
au freezer à -80°C et portant les mentions ci-dessous :
- Le nom et le numéro de la souche
- Un code d’identification de l’espèce
- La date de conservation
- Le milieu de conservation
37
IIVV.. RREESSUULLTTAATTSS
IV-1- Population d’étude
103 patients ont été inclus dans l’étude avec une prédominance des
hommes sur les femmes (sexe ratio=1,32) et environ 3/4 de la population
composée d’adultes (Cf. Tableau II).
Tableau II : Répartition des patients selon l’âge et le sexe
Sexe
Patients Total
Enfants
(≤ 15 ans)
Adultes
(> 15 ans)
N %
Féminin 13 31 44 43
Masculin 16 43 59 57
Total 29 74 103 100
Ces patients présentaient pour la plupart des cas des otites (OMC, OMA),
des cellulites, phlegmons ou des laryngites. Quelques cas d’angines, de sinusites
et de rhinopharyngites ont été diagnostiqués.
IV-2-Bactériologie
55 bacilles à Gram négatif responsables d’infections purulentes de la
sphère ORL ont été isolés et identifiés à partir de 46 prélèvements sur le total
des 103 échantillons collectés.
Parmi ces germes, Pseudomonas aeruginosa est le plus fréquemment isolé
(60%) principalement dans les prélèvements d’otites, de cellulites et de
phlegmons, suivi de Klebsiella pneumoniae (15%) et de Citrobacter freundii
(9%) (cf. figure 9 et tableau III).
Deux souches de M. catarrhalis et d’H.influenzae étaient également
isolées.
38
Autres bactéries : E.coli,A.baumanii,E.enterogens, H influenzae, M catarrhalis
Figure 9:Répartition des bactéries isolées
Tableau III : Répartition des souches isolées en fonction du prélèvement
Germes isolés Types de prélèvements
Cell-phleg Gorge Larynx Naso. Oreille Sinus TOTAL
Moraxella catarrhalis _ _ _ 1 1 _ 2
Haemophilus influenzae _ _ _ 1 _ 1 2
Klebsiella pneumoniae 3 1 1 1 2 _ 8
Escherichia coli _ _ 1 _ 1 _ 2
Enterobacter aerogenes _ _ _ _ 2 _ 2
Citrobacter freundii 1 _ 1 1 3 _ 6
A. baumannii _ _ _ _ 1 _ 1
Ps. Aeruginosa 8 _ 3 1 20 _ 32
Total 12 1 6 5 30 1 55
Cell-phleg : cellulite et phlegmons, Naso : Nasopharynx
39
IV-3- Sensibilité aux antibiotiques
- Pseudomonas aeruginosa (n= 32)
Les souches isolées étaient généralement sensibles aux antibiotiques testés.
L’imipénéme, la ciprofloxacine et les aminosides étaient les antibiotiques les
plus actifs sur les souches isolées.
Différents phénotypes ont été observés:
Pour les bêta-lactamines, les phénotypes détectés étaient :
Sauvages (quinze (15) souches).
Pénicillinase (deux(02) souches).
Céphalosporinase de haut niveau (huit (08) souches).
Bêta-lactamase à spectre élargi probablement de type OXA, ( trois (03)
Souches).
Carbapénémase (deux (02) souches).
Phénotype D2 (deux (02) souches).
Concernant les quinolones, quatre (04) souches de phénotypes IV étaient
détectées. Par contre, pour les aminosides, trois (03) souches étaient de
phénotypes GT (résistantes à la fois à la gentamycine et à la tobramycine).
(Cf. Tableau IV et V)
40
Tableau IV : Profil de sensibilité des souches de Pseudomonas aeruginosa
isolées.
Antibiotiques Nombre Résistance(%) Sensibilité(%)
Pipéracilline 32 38 62
Ticarcilline 32 45 55
Ticarcilline/Ac clav 32 44 56
Pipéracilline/Tazobactam 32 35 65
Ceftazidime 32 44 56
Céfépime 32 44 56
Aztréonam 32 34 66
Imipenem 32 6 94
Amikacine 32 9 91
Gentamicine 32 9 91
Tobramycine 32 9 91
Ciprofloxacine 32 10 90
Lévofloxacine 32 12 88
Colistine 32 9 91
Tableau V : Phénotypes de résistance des souches de Pseudomonas
aeruginosa aux bêta-lactamines.
Antibiotiques
Phénotypes
Sauvage
(n=15)
Pénicillinase
(n= 2)
CHN
(n=8)
BLSE
type
OXA,
(n=3)
Carbapénémase
(n=2)
D2
(n=2)
Ticarcilline
Tic/Acide clav
S R R R R S
S S R R R S
Pipéracilline S R R R S S
Pip/tazobactam S S R R S S
Ceftazidime S S R R R S
Céfépime S S S/R R R S
Aztréonam S R R R S S
Imipénéme S S S S R R
Klebsiella pneumoniae (n=8)
Les souches isolées présentaient des sensibilités relativement bonnes aux
antibiotiques testés. Les aminosides, l’aztréonam et la ciprofloxacine étaient les
molécules les plus actives sur les souches isolées.
Différents phénotypes ont été observés:
41
Concernant les bêta-lactamines, les phénotypes suivants ont été détectés :
Pénicillinase de bas niveau (Sauvages) (cinq (05) souches).
Céphalosporinase hyper-produite (deux (02) souches).
Une (01) souche était sécrétrice de bêta-lactamase à spectre élargi.
Seules deux (02) souches étaient résistantes aux aminosides et étaient de
phénotype GT. (Cf. Tableau VI et VII).
Tableau VI : Profil de sensibilité des souches de Klebsiella pneumoniae
isolées.
Antibiotiques Nombre Résistance(n) Sensibilité(n)
Amox/Ac clav 8 6 2
Céfuroxime 8 3 5
Ceftriaxone 8 3 5
Céfépime 8 3 5
Aztréonam 8 2 6
Amikacine 8 0 8
Gentamicine 8 2 6
Tobramycine 8 2 6
Ciprofloxacine 8 2 6
Colistine 8 0 8
Chloramphénicol 8 1 7
Tableau VII : Phénotypes de résistance des souches de Klebsiella
pneumoniae aux beta-lactamines.
Antibiotiques
Phénotypes
PBN(Sauvage)
(n=5)
Case HP
(n=2)
βLSE+
(n=1)
Ampicilline R R R
Amox/Ac.clav R/S R R
Ceftriaxone S R R
Aztréonam S R/S R
Gentamicine S R R
Tobramycine S R R
Amikacine S S S
Ciprofloxacine S S R
Colistine S S S
Chloramphénicol S S S
42
Moraxella catarrhalis (n=2)
Toutes les deux souches étaient ampi-R et productrices de beta-lactamase.
Elles étaient relativement sensibles aux autres antibiotiques testés.
Haemophilus influenzae (n=2)
Les deux souches isolées étaient ampi-R et productrices de beta-lactamase.
Elles étaient sensibles au chloramphénicol et à la clarithromycine mais
résistantes à la pristinamycine et à l’ofloxacine. La sensibilité aux autres
antibiotiques testés était variable.
Escherichia coli (n=2)
Les deux souches isolées étaient de phénotype pénicillinase de haut niveau.
Une des souches était cependant résistante à la ciprofloxacine.
Enterobacter aerogenes (n=2)
Une des souches isolée était de phénotype sauvage et l’autre possédait une
céphalosporinase de haut niveau sensible à la ciprofloxacine, à l’aztréonam et au
chloramphénicol.
Citrobacter freundii (n=6)
Seule une souche était de phénotype sauvage. Toutes les autres souches
isolées possédaient une céphalosporinase de haut niveau.
La sensibilité aux autres antibiotiques était relativement bonne.
Acinetobacter baumannii (n=1)
Cette souche possédait une pénicillinase associée à une céphalosporinase.
Elle était résistante à tous les aminosides et était de phénotype GTN.
43
V-Discussion
Durant notre étude, nous avons adopté une approche méthodologique
permettant une meilleure réalisation des prélèvements. Cependant, des
difficultés étaient rencontrées particulièrement lors des prélèvements de pus
d’origine auriculaire liées à l’épaisseur de l’écouvillon qui favorisait la
contamination par les germes saprophytes du conduit auditif externe. De ce fait,
il a été procédé à l’aspiration du pus à l’aide d’une sonde molle adaptée à un
aspirateur. Selon certains auteurs l’utilisation d’écouvillon en alginate était plus
appropriée pour réaliser ces types de prélèvement [3].
L’absence d’un milieu de transport pourrait réduire le taux d’isolement des
germes fragiles malgré la conservation et l’acheminement des échantillons à
+4°C et leur traitement dans les 4h au laboratoire.
Cette étude avait permis d’isoler des bacilles à Gram négatif impliqués
dans les infections ORL dans 45% des échantillons.
Parmi ces germes, Pseudomonas aeruginosa représentait 60% des isolats
particulièrement au niveau des otites, cellulites et phlegmons suivi de Klebsiella
pneumoniae.
Cette fréquence d’isolement des Pseudomonas aeruginosa a été observée
dans les OMC et OMA du nourrisson de moins de 3 mois suivis des
Entérobactéries [19, 41, 47,48].
Cette prédominance des Pseudomonas aeruginosa dans les OMC a été
également observée en 2000 au service d’ORL du CHU HALD [34].
Récemment, une étude réalisée au service d’ORL du CHU de FANN et
portant sur le profil bactériologique des OMC avait montré cette même tendance
[36].
44
La rareté d’isolement de Moraxella catarrhalis pourrait être due au manque
d’expérience et de conditions de réalisations adéquates. En effet, dans notre
étude, deux souches de Moraxella catarrhalis étaient isolées respectivement
d’une OMA et d’une rhinopharyngite chez deux enfants.
Des études réalisées en France et aux USA ont montré que l’OMA est le
plus souvent précoce et survient le plus souvent chez l’enfant âgé de 6 mois à 3
ans [4, 16]. Cependant, de nombreuses études ont évoqué une grande fréquence
d’isolement de Moraxella catarrhalis dans les OMA en pédiatrie [8, 40, 47, 28].
Un portage élevé de Moraxella catarrhalis et d’Haemophilus influenzae
dans le rhinopharynx chez l’enfant a été rapporté dans des études réalisées en
Inde [27], en Chine [15] et en Pologne [30].
Deux souches d’Haemophilus influenzae ont été isolées respectivement
d’une sinusite maxillaire et d’une rhinopharyngite.
Des études menées en Suisse [1] et aux USA [12, 45] ont montré que
Haemophilus influenzae est le germe le plus fréquemment rencontré dans les
sinusites maxillaires.
Dans les cellulites et phlegmons, Pseudomonas aeruginosa et Klebsiella
pneumoniae ont été les germes les plus isolés. Cependant ces germes sont
rarement mis en cause du fait du caractère polymicrobien des prélèvements issus
de ces affections [38].
Dans notre étude, les prélèvements laryngés étaient issus de patients
hospitalisés et canulés, souvent sujets à des suppurations fréquentes au niveau de
l’orifice dans lequel est logée la canule. Le pus qui y était prélevé était souvent
poly microbien et P. aeruginosa restait le germe le plus fréquemment isolé.
45
Chez ces patients hospitalisés la plupart des germes isolés étaient résistants
aux antibiotiques.
Pseudomonas aeruginosa présentait une sensibilité relativement
bonne aux amino-pénicillines. En effet, seules 38% et 45% des souches étaient
résistantes respectivement à la pipéracilline et à la ticarcilline. L’activité de ces
molécules sur ce germe a connu une baisse par rapport à celle trouvée lors d’une
récente étude où aucune des souches de Pseudomonas isolée n’a été résistante à
la ticarcilline et à la pipéracilline [36].
La majorité des souches (56%) étaient sensibles à la fois à la ceftazidime et
au céfépime.
En 2000, une étude réalisée à Dakar n’avait révélé aucune résistance au
céfépime et à la ceftazidime [17]. Cette excellente activité avait moyennement
baissé en 2006 avec 24% des souches (n=41) de P. aeruginosa résistantes au
céfépime et 37,5% (n=41) à la ceftazidime [6].
Une récente étude menée au service d’ORL du CHU de FANN avait fait
état de 53% (n=35) de souches de P.aeruginosa résistantes à la ceftazidime [36].
Dans notre étude, l’imipénéme et l’aztréonam montraient une très bonne
activité avec respectivement 94% et 66% de sensibilité. Seules deux souches
étaient résistantes à l’imipénéme, elles étaient de phénotype carbapénémase.
Une excellente activité de l’imipénéme et de l’aztréonam sur P.
aeruginosa a été observée dans l’étude menée au service d’ORL de FANN
(100% de sensibilité) [36].
En 2009, des souches de Pseudomonas résistantes à l’imipénéme et de
phénotypes carbapénémase (OXA 48) ont été retrouvées lors d’une étude
menée à Dakar [37].
46
Les aminosides avaient une excellente activité sur les souches de
Pseudomonas, 91% des souches étaient sensibles à la fois à la gentamycine, à la
tobramycine et à l’amikacine. Trois souches de phénotypes GT (résistants à la
fois à la gentamycine et à la tobramycine) étaient détectées.
Ces résultats sont comparables à ceux d’une étude réalisée à Dakar en 2006
[6].
La majorité des souches de Pseudomonas aeruginosa étaient sensibles aux
quinolones.
En effet, la Ciprofloxacine était active sur 90% des souches de
Pseudomonas aeruginosa. Ce taux de sensibilité est comparable à celui observé
à Dakar en 2006 (94,7%) [6]. Ces taux de sensibilité sont néanmoins en baisse
par rapport à celui observé dans l’étude menée en ORL en 2000 (100%) [17].
Seules 9% des souches de Pseudomonas aeruginosa étaient résistantes à la
colistine contrairement aux résultats de l’étude de Ndiaye O. réalisée en 2011
dans laquelle aucune souche de Pseudomonas aeruginosa isolée n’était
résistante à la colistine [36].
La souche d’Acinetobacter baumannii isolée n’était sensible qu’aux
quinolones et à l’imipénéme. Elle était résistante à tous les aminosides et bêta-
lactamines. Elle possédait une céphalosporinase et était de phénotype GTN
(résistante à la fois à la gentamycine, la tobramycine et la netilmicine).
Les entérobactéries présentaient des profils de sensibilité variables
aux pénicillines.
Une seule souche de Klebsiella pneumoniae sécrétrice de bêta-lactamase a
été isolée. Elle n’a été sensible qu’à l’amikacine, au chloramphénicol et à
l’imipénéme.
47
Des études menées à Dakar [6] et aux USA [43] ont montré que la plupart
des souches sécrétrices de bêta-lactamase isolées d’infections ORL étaient
H.influenzae ou M.catarrhalis.
Des résistances à l’amoxicilline étaient notées surtout pour E. coli et
Citrobacter freundii et à l’association amoxicilline/acide clavulanique pour deux
(2) souches de Klebsiella pneumoniae et d’E. Coli isolées.
Une étude réalisée en 2006 à Dakar avait montré 100% de résistance des
entérobactéries (n=12) à l’amoxicilline et à l’association amoxicilline/acide
clavulanique [6].
Nos résultats ont montré des résistances au ceftriaxone et au céfépime chez
trois (3) souches de Klebsiella pneumoniae.
Les deux souches d’Escherichia coli isolées étaient toutes sensibles au
ceftriaxone et au céfépime.
En 2006, une excellente activité du ceftriaxone et du céfépime a été
observée chez les entérobactéries isolées d’infections ORL à Dakar [6].
L’ensemble des souches d’entérobactéries isolées étaient sensibles à
l’Imipénéme. Quant à l’aztréonam, il était inactif sur deux (2) souches de
Klebsiella pneumoniae.
Cette excellente activité de l’imipénéme sur les entérobactéries a été
retrouvée dans l’étude menée par Wang Y et al. [50] en Chine.
Une souche sur six de Citrobacter freundii isolée était résistante à la
tobramycine et 2 souches de Klebsiella pneumoniae étaient résistantes à la fois
à la gentamycine et à la tobramycine.
48
Les résultats d’une étude menée à Dakar en 2006, avaient montré que
toutes les souches d’entérobactéries isolées d’infections ORL étaient sensibles
aux aminosides [6].
Les quinolones avaient une bonne activité sur les entérobactéries à
l’exception de deux (2) souches de Klebsiella pneumoniae et d’une souche d’E.
Coli résistante à la ciprofloxacine. Par contre, aucune résistance de ces germes à
la ciprofloxacine n’a été observée dans des études antérieures menées à Dakar
entre 2000 et 2006 [6, 34].
Le chloramphénicol avait une activité variable sur les différentes souches
d’entérobactéries isolées. Des résistances à cet antibiotique ont été notés
respectivement chez une souche de Klebsiella pneumoniae et 3 souches C.
freundii.
En 2006, une étude avait montré que le chloramphénicol était inactif sur les
souches d’entérobactéries isolées d’infections ORL à Dakar [6].
Une excellente activité des cyclines a été observée sur les entérobactéries à
l’exception des E. coli qui étaient résistants à la doxycycline et à la tétracycline.
En 2006, 02 souches sur 12 d’entérobactéries isolées d’infections de la
sphère ORL au CHU HALD de Dakar étaient sensibles à la doxycycline [6].
Dans le Nord du Liban, un taux de résistance de 43,2% de résistance à la
doxycycline a été observé chez les entérobactéries isolées d’infections ORL
[26].
Les deux souches de Moraxella catarrhalis isolées étaient
résistantes à l’ampicilline et au céfépime. Elles étaient toutes deux sécrétrices de
bêta-lactamase mais sensibles à l’association amoxicilline/acide clavulanique.
49
En 2006, cinq (05) souches de M. catarrhalis (n=08) isolées au service
d’ORL du CHU HALD étaient sécrétrices de bêta-lactamase et résistantes à
l’ampicilline [6], alors que Vanessa avait trouvé une bonne sensibilité des
souches de Moraxella catarrhalis (n=10) à l’association amoxicilline/acide
clavulanique et aux céphalosporines de 2ème
et 3ème
génération [49]. Parmi ces
souches, trois (03) étaient sécrétrices de bêta-lactamase.
En France, plus de 90% des souches de Moraxella catarrhalis isolées
d’infections ORL en 2001 étaient sensibles à l’association amoxicilline/acide
clavulanique, aux céphalosporines et aux macrolides [2].
A l’exception de la spiramycine, les souches de Moraxella catarrhalis
isolées avaient une très bonne sensibilité aux macrolides.
Des taux de sensibilité aux macrolides variables entre 60% et 90% étaient
observés dans l’étude menée en 2006 au CHU HALD et quelques cliniques de la
place [49].
Les deux souches étaient toutes résistantes à la ciprofloxacine mais
sensibles à la lévofloxacine et à l’ofloxacine.
En 2008, 8 souches de M. catarrhalis (n=9) isolées de pathologies ORL à
Dakar étaient résistantes à l’ofloxacine [35].
Quant à la pristinamycine, elle était inactive sur les deux souches isolées.
Cette résistance a été signalée entre 2001 et 2006 sur dix souches de M.
catarrhalis isolées d’infections ORL à Dakar [50].
Aucune résistance n’a été observée avec la tétracycline alors que l’activité
de cette molécule sur Moraxella avait baissé de 100% à 70% entre 2004 et 2006
[6,33].
50
Les deux souches d’Haemophilus influenzae isolées étaient
sécrétrices de bêta-lactamase et n’étaient sensibles qu’aux quinolones, au
chloramphénicol et à la clarithromycine par contre elles étaient résistantes à
l’ampicilline, à la clindamycine, à la pristinamycine et à la tétracycline.
En 2006, Vanessa avait isolé deux (02) souches d’Haemophilus influenzae
sécrétrices de β-lactamase et résistantes à l’ampicilline [49].
L’étude menée à Dakar en 2008 avait montré une bonne sensibilité des
souches d’Haemophilus influenzae isolées d’infections ORL aux bêta-
lactamines, à l’ofloxacine et au chloramphénicol [35].
Toutes les souches d’Haemophilus influenzae étaient résistantes à la
tétracycline. Une augmentation de la résistance d’Haemophilus influenzae à
cette molécule a été observée à Dakar entre 1998 et 2003 avec un taux passant
de 2% à 70%. En 2006, ce taux de résistance à la tétracycline était de 100%
[50].
51
RECOMMANDATIONS
Au terme de notre étude, quelques recommandations nous semblent
nécessaires :
L’acheminement plus rapide des prélèvements permettra d’augmenter les
taux d’isolement des germes fragiles.
Pour le pus de l’oreille, le prélèvement par aspiration semble le mieux
indiqué.
La ciprofloxacine reste toujours une molécule de choix dans le traitement
des otites purulentes dues à Pseudomonas aeruginosa.
L’association amoxicilline/acide clavulanique pourrait être prescrite en
première intention dans le traitement des rhinopharyngites et sinusites
dues à Moraxella catarrhalis et Haemophilus influenzae.
52
Cette étude prospective a été réalisée à Dakar à l’Unité de Recherche,
d’Expertise et de Biotechnologie Microbienne du Laboratoire de Bactériologie-
virologie de l’hôpital Aristide Le Dantec en collaboration avec le service
d’ORL du CHU de FANN, entre octobre 2010 et juillet 2011.
Au total, 103 patients présentant des infections purulentes de la sphère
ORL (otites, sinusite, laryngite, rhinopharyngite, cellulite et phlegmon) ont été
recrutés à partir des services d’hospitalisation et de consultation externe. Cette
population était constituée de 72% d’adultes et 28% d’enfant.
55 bacilles à Gram négatif ont été isolées dont :
2 souches de M. catarrhalis
2 souches d’H. influenzae
8 souches de K. pneumoniae
2 souches d’E. coli
2 souches d’E. aerogenes
6 souches de C. freundii
1 souche d’A. baumannii
32 souches de P. aeruginosa
La majorité des souches était sensible aux antibiotiques testés.
Ainsi, dans les otites purulentes, la ciprofloxacine reste toujours très
efficace sur les germes en cause, de même que l’association amoxicilline/acide
clavulanique qui pourrait être proposée comme molécule de premier choix dans
les infections à M. catarrhalis et H. influenzae (sinusite et rhinopharyngite).
53
Les quinolones, aminosides et imipenèmes étaient très efficaces sur les
germes isolés de cellulites et phlegmons.
Pour une bonne prise en charge de ces infections respiratoires, il serait
intéressant:
De rechercher la part de l’étiologie virale et bactérienne afin de bien
spécifier les notions de co-infection.
de la mise en place d’une surveillance continue de la sensibilité aux
antibiotiques des bactéries responsables d’infections de la sphère ORL
afin d’adapter l’antibiothérapie en fonction de l’évolution de la résistance
pour bien guider les cliniciens dans leurs choix de traitement.
De rechercher le mécanisme moléculaire de résistance mis en jeu.
54
1- Aebi C.
Moraxella catarrhalis - pathogen or commensal?
Adv Exp Med Biol. 2011; 697:107-16.
2- Agence Française de Sécurité Sanitaire des Produits de Santé
Antibiothérapie par voie générale en pratique courante : Otite Moyenne
Aigue
Presse Méd 2001, 30(36) :1781-91.
3- Agence Française de Sécurité Sanitaire des Produits de Santé
Antibiothérapie par voie générale en pratique courante
Otite moyenne aiguë
Méd Mal Infect 2001, 31(39) :25-28
4- Alter SJ, Vidwan NK, Sobande PO, Omoloja A, Bennett JS.
Common childhood bacterial infections.
Curr Probl Pediatr Adolesc Health Care 2011; 41(10):256-83.
5- Ammari H, Ramdani-Bouguessa N, Bellouni R.
Antibiothérapie dans les infections ORL
Méd Maghreb, 2001, 91: 28-31.
6- Annie, R, E.
Étude de la sensibilité des souches isolées d’infections de la sphère ORL à
Dakar.
Thèse Pharm Dakar 2006, n°41.
55
7- Binks MJ, Cheng AC, Smith-Vaughan H, Sloots T, Nissen M, Whiley
D, McDonnell J, Leach AJ.
Viral-bacterial co-infection in Australian Indigenous children with acute otitis
media.
BMC Infect Dis 2011;11:161
8- Bonfils P in Pathologie ORL et cervico-faciale. Comprendre Agir Traiter
Ellipses/Édition Marketing, Paris, 1996 : 384 p.
9- Boukadida J, Hannechi N, Boukadida N, Ben Said H, Elmerberch H,
Errai S.
β-haemolytic streptococci in acute pharyngitis
East Med Health J 2003; 9,( 1-2): 172-7
10- Bouvet A, Aubry-Damon H, Pean Y.
Émergence de la résistance aux macrolides des Streptococcus pyogenes ou
streptocoques bêta-hémolytiques du groupe A
BEH 2004 ; 32-33 :154-5
11- Briand M. Y. Une histoire de la résistance aux antibiotiques A propos de
six bactéries, édition Harmattan Paris 2009 pages : 147-166
12- Brook I
Microbiology and antimicrobial management of sinusitis.
J Laryngol Otol. 2005; 119(4):251-8.
56
13- Cavallo J D, Plesiat P, couetdic G, leblanc F.
Mechanism of β-lactam resistance in Pseudomonas aeruginosa:
prevalence of OprM-overproducing strains in a French multicentre study
(1997).
J. Antimicrob Chemother, 2002, 50, 1039: 1043
14- Chiu S, Ho P, Chow F, Yuen K, Lau Y.
Nasopharyngeal carriage of antimicrobial-resistant Streptococcus
pneumoniae among young children attending 79 kindergartens and day
care centers in Hong Kong
Antimicrob Agents and Chemother, 2001, 45, 10: 2765-2770
15- Chiu SS, Chan KH, Chen H, Young BW, Lim W, Wong WH, Peiris
JS
Virologically confirmed population-based burden of hospitalization
caused by respiratory syncytial virus, adenovirus, and parainfluenza
viruses in children in Hong Kong.
Pediatr Infect Dis J 2010; 29(12):1088-92.
16- Collège français ORL et CCF
Abrégé d’ORL : connaissances et pratiques, édition Elsevier Masson; 2éme
édition 2009 :page 267
17- Diop M. épouse Diouf
Étude bactériologique des otites moyennes chroniques au CHU A. Le
Dantec (Dakar)
Thèse Pharm Dakar, 2001, n°34.
57
18- Ehanno P.
Sinusites aiguës de l’adulte. Diagnostic - Prise en charge
Lett infect 2003; 18, 1: 11-16.
19- Geyer M, Howell-Jones R, Cunningham R, McNulty C; Health
Protection Agency GP Microbiology Laboratory Use Group.
Consensus of microbiology reporting of ear swab results to primary care
clinicians in patients with otitis externa.
Br J Biomed Sci. 2011;68(4):174-80.
20- Grossjean J, Clavé D, Archambaud M, Pasquier C. Bactéries
anaérobies. In. Bactériologie et virologie pratique 1ére
édition, édition de
boeck 2009 Bruxelles, pages :177.
21- Grossjean J, Clavé D, Archambaud M, Pasquier C. Entérobactéries.
In. Bactériologie et virologie pratique 1ére
édition, édition de boeck 2009
Bruxelles, Pages : 125-128
22- Grossjean J, Clavé D, Archambaud M, Pasquier C. Haemophilus
influenzae. In. Bactériologie et virologie pratique 1ére
édition, édition de
boeck 2009 Bruxelles, Pages : 139-140
23- Grossjean J, Clavé D, Archambaud M, Pasquier C. Moraxella
catarrhalis. In. Bactériologie et virologie pratique 1ére
édition, édition de
boeck 2009 Bruxelles, Pages : 123-124
24- Grossjean J, Clavé D, Archambaud M, Pasquier C. Pseudomonas
aeruginosa. In. Bactériologie et virologie pratique 1ére
édition, édition de
boeck 2009 Bruxelles, Pages : 166
58
25- Grossjean J, Clavé D, Archambaud M, Pasquier C. Streptocoques. In.
Bactériologie et virologie pratique 1ére
édition, édition de boeck 2009
Bruxelles Pages : 116-117
26- Hamze M, Izard D.
Sensibilité des entérobactéries aux antibiotiques. Situation en 1997 au
Nord du Liban.
Sante 2003;13(2):107-12.
27- Jain A, Kumar P, Awashi S.
High nasopharyngeal carriage of drug resistant Streptococcus pneumoniae
and Haemophilus influenzae in North Indian schoolchildren.
Trop Med and Int Health 2005, 10, 3: 234-239
28- Kaieda S.
Fungal infection in the oto-rhino-laryngologic area.
Nihon Rinsho 2008; 66(12):2290-3.
29- Legent F, Fleury P, Nary P, Beauvillain C. Pathologie cervico-faciale.
Abrégé d’oto-rhino-laryngologie, édition Masson, Paris, 1999, 5e édition :
386 p.
30- Liu K, Pichichero ME.
Clinical Significance of Serum S100A12 in Acute Otitis Media in Young
Children.
Pediatr Infect Dis J 2012 ; 31(3): 56-8.
59
31- López Pérez G, Morfín Maciel BM, Navarrete N, Aguirre A.
Identification of influenzae, parainfluenzae, adenovirus and respiratory
syncytial virus during rhinopharyngitis in a group of Mexican children
with asthma and wheezing.
Rev Alerg Mex 2009; 56(3):86-91.
32- Mainardi J L.
Bêta-lactamines et entérocoques. In. Courvalin P, Leclercq R, Biagen E :
Antibiogramme 2éme
édition, édition Eska 2006 : pages 133-135.
33- Mangane M.
Sensibilité aux antibiotiques de Streptococcus pneumoniae, Streptococcus
pyogenes,
Haemophilus influenzae et Moraxella catarrhalis isolés d’infections
respiratoires aiguës
Thèse Pharm Dakar, 2004, n°74.
34- Marshall E M.
Place des germes non exigeants et les bactéries anaérobies dans les
infections respiratoires basses à Dakar.
Thèse Pharm Dakar, 2000, n°9.
35- Ndiaye A.G., Boye C.S., Hounkponou E., Gueye F.G., Badiane A.
Antimicrobial susceptibility of select respiratory tract pathogens in Dakar,
Senegal
J Infect Dev Ctries 2009; 3(9):660-666.
60
36- Ndiaye O.
Profil Bactériologie des otites moyennes chroniques au CHU FANN
Thèse Pharm Dakar, 2011, n°25.
37- Olivier M, Coralie B, Alfred K, Seck A, Arouna O, Bercion R,
Breurec S, Garin B.
Class D OXA-48 Carbapenemase in multidrug-Resistant
Enterobacteria, Sénégal
Emerging Infect Dis 2011, 17, 1: 143-144
38- Pavlović M, Nikolić J
Antimicrobial treatment of polymicrobial infections.
Med Preg 2010;63(11):37-46.
39- Petit Larousse de la médecine Domart A, Bourneuf J.
Oto-rhino-laryngologie
Larousse-Bordas, France, 1997 : 665-666
40- Pettigrew MM, Gent JF, Pyles RB, Miller AL, Nokso-Koivisto
J, Chonmaitree T.
Viral-bacterial interactions and risk of acute otitis media complicating
upper respiratory tract infection.
J Clin Microbiol 2011; 49(11):3750-5.
61
41- Roland PS, Stroman DW.
Microbiology of acute otitis externa.
Laryngoscop 2002; 112:1166-77.
42- Rosenthal AZ, Elowitz MB.
Following evolution of bacterial antibiotic resistance in real time.
Nat Genet 2011; 44(1):11-3.
43- Sader HS, Jacobs MR, Fritsche TR.
Review of the spectrum and potency of orally administered
cephalosporins and amoxicillin/clavulanate
Diagn Microbiol Infect Dis 2007; 57(3):5S-12S.
44- Saunders JE, Raju RP, Boone JL, Hales NW, Berryhill WE
Antibiotic resistance and otomycosis in the draining ear: culture results by
diagnosis.
Am J Otolaryngol 2011; 32(6):470-6.
45- Schrag S, MCgee L., Whitney C., Beall B.
Emergence of Streptococcus pneumoniae with very high level resistance
to penicillin
Antimicrob Agents Chemother, 2004; 48( 8) : 3016-3023.
46- Simon D, Francis G, Ferrand J.Y. In Pathologies ORL/ stomatologies
Med express 2000. Edition Estem : 26-28 et 35
62
47- Stoll D, Klossek JM, Barbaza MO; Groupe ORLI
Prospective study of 43 severe complications of acute rhinosinusitis.
Rev Laryngol Otol Rhinol (Bord). 2006;127(4):195-201
48- Tran Ba Huy P. ORL. Paris Ellipses, collection Universités
francophones, 1996 : 510 p.
49- Vanessa S L.
Évaluation de la sensibilité aux antibiotiques des souches de H.
influenzae, M. catarrhalis, S. pneumoniae et S. pyogenes dans les
infections respiratoires aiguës hautes et basses.
Thèse Pharm., Dakar, 2006, n°24
50- Wang Y, Zhang R, Li W, Feng Y, Leng T.
Serious antimicrobial resistance status of pathogens causing hospital-
acquired lower respiratory tract infections in North China.
J Int Med Res. 2009; 37(3):899-907.
51- Yala D, Merad A S, Mohamedi D, Ouar Korich M N.
Résistance bactérienne aux Antibiotiques
Med Maghreb, 2001 ; 91:13-14.
52- http://www.auriol.free.fr/images/oreille.gif (consulté le 22/02/2011)
53- http://www.nyankunde.org/orl.htm (Consulté le 02/04/2012)
54- http://www.discovercreation.org/newlet/pharynx.jpg (consulté le
22/04/12)
63
55- http://www.infectiologie.com/site/medias/Recos/2011-
infections6respiratoires-hautes-Recommandations.pdf (consulté le
23/05/2012)
Je jure en présence des maîtres de la faculté, des
conseillers de l’ordre des pharmaciens et de mes condisciples :
D’honorer ceux qui m’ont instruit dans les préceptes de
mon art et leur témoigner ma reconnaissance en restant fidèle
à leur enseignement ;
D’exercer, dans l’intérêt de la santé publique, ma
profession avec conscience et de respecter non seulement la
législation en vigueur, mais aussi les règles de l’honneur, de la
probité et du désintéressement ;
De ne jamais oublier ma responsabilité et mes devoirs
envers le malade et sa dignité humaine.
En aucun cas, je ne consentirai à utiliser mes connaissances et
mon état pour corrompre les mœurs et favoriser des actes
criminels.
Que les hommes m’accordent leur estime si je suis fidèle
à mes promesses.
Que je sois couvert d’opprobre et méprisé de mes
confrères si j’y manque.