1. Mendeley logiciel de gestion des rfrences bibliographiquesfrancoismagnan@gmail.com http://www.francoismagnan.infoSupport pour les stages : Urfist de Toulouse le 14/11/2013 Observatoire Midi Pyrnes le 20/11/2013

2. Plan Introduction : Mendeley : prsentation gnrale I En local a) Prsentation de linterface b) Capture de rfrences c) Capturer les documents, traitement du pdf d) Insertions traitement de texte II En ligne a) Fonctions sociales : gratuit, payant, public, priv b) Groupes de travail c) La catalogue de recherche III Perspectives 3. Introduction Mendeley : prsentation gnrale 4. Permet de capturer grer insrer les rfrences bibliographiques et documents, traitement annotation des PDF Logiciel propritaire, gratuit Windows Macintosh et Linux En anglais Smartphone, tablettes : apps IOS et Android 5. Site, rseau social : visibilit Capture des rfrences en ligne puis passent en local si synchro. Catalogue de recherche (millions de rfrences) Groupes de travail : partage, annotation pdf Ouvrir un compte est obligatoire En ligne : 2 giga gratuit bibliothque + 500 mega gratuits groupes de travail 6. 2008 : Initiative de deux doctorants allemands et d'un dveloppeur anglais : prototype Un investisseur de LastFM : lancement de la version beta publique dbut 2009 Juillet 2011 : premire version non beta Investors & Advisers : aujourdhui viennent de Last.fm, Skype, Warner, aussi 7. Et 2012 : 2 millions utilisateurs, 270 millions documents chargs par utilisateurs, 65 millions documents uniques. Parmi les utilisateurs : 30 % sciences biomdicales 20 % sciences de l'ingnieurs, informatique, technologies de l'information, 20 % sciences sociales humaines 8. 1/ En local De la capture linsertion des rfrences 9. a) Prsentation de linterface Et des dossiers 10. Interface 3 panneaux31 2 1/ Bibliothque et dossiers 2/ Elments du dossier slectionn 3/ Informations bibliographiques de llment slectionn 11. Organisation des dossiers Recently added, Favorites, needs review : permet de distinguer des rfrencesDossier My Publications : permet aux auteurs de mettre en ligne leurs articles sur leur page profil personnel 12. Modifier les rfrences Le 3me panneau indique le type du document (livre ou chapitre de livre, article de revue, thse, page web etc : 20 types)Ainsi que les autres informations bibliographiques 13. b) Capture de rfrences 14. Installation du Web Importer Le faire glisser dans la barre de favoris du navigateur 15. Liste de sites compatibles 16. Utiliser le Web Importer Sur la page web contenant une liste de rsultats : clic sur le bookmarkletDans longlet qui souvre clic sur import afin dimporter les rfrence de votre choix 17. Utiliser le Web Importer Sur une page web contenant un et un seul rsultat Plus de possibilits : classement dans un dossier, tags, n otes, enregistre ment de lapage 18. Mendeley : utiliser le Web ImporterView in your Mendeley Library permet de complter ldition de la rfrence directement dans la bibliothque 19. Mendeley : utiliser le Web ImporterAprs avoir cliqu sur View in your Mendeley LibraryLa rfrence bibliographique peut tre complte directement dans linterface web 20. Mendeley : utiliser le Web Importer DansMendeley desktop (le logiciel, en local) il faudra synchroniser pour que les captures du web importer apparaissent 21. Mendeley : quand le site nest pas compatible Clic sur le Web Importer enregistrera une copie de la page Dans Mendeley desktop : Add Documents puis Add Entry Manually (pour entrer manuellement les rfrences) 22. Exercices : Si sur un catalogue, la liste de rsultats ne peut tre rcupre, essayez dimporter depuis un rsultat sur sa propre page 1/ Sur Pubmed, recherches sur le terme de votre choix (par exemple paleontology) en choisissant le catalogue PMC. En simultan, rcuprer les PDF. 1/ Science direct : 3 rfrences de votre choix 2/ Rfdoc : 3 rfrences de votre choix 23. 3/ Nature : ajouter 3 rfrences de votre choix revue Nature 4/ Catalogue Mendeley : 3 rfrences 5/ Catalogue du Sudoc : 3 rfrences 6 / Comment faire sur un site non compatible : Archipel http://catalogue.biu-toulouse.fr/ 24. c) Capturer les documents, les PDF Traitement des PDF 25. Mendeley : capturer les documents En ligne : clic sur Web importer : capture de la page html, ou du PDF affich par le navigateur si Mendeley peut rcuprer ses mtadonnes En local : faire glisser les documents dans Mendeley (tous les formats) En local : menu Add Document Add file : ajout de fichier un par un Add folder : ajout des pdf (seuls les pdf) dun dossier Watch folder : surveillance permanente dun dossier et ajout automatique des fichiers pdf quil contient Ds quun PDF est ajout, Mendeley lorsque cest possible - en extrait les mtadonnes 26. Lecteur PDF pour annoter et surligner les passages Navigateur d'annotation dans lecteur PDF 27. Exercices Rcuprer le dossier articles PDF Annoter surligner un pdf, remarquer le navigateur dannotations et lexport des annotations 28. Dans Mendeley, clic droit sur des documents PDF pour les renommer automatiquement Module pour classer renommer les documents PDF dans un dossier externe Tools/Option/File Organizer choisir les paramtres de classement Folder Path nom de dossier Filename : noms de fichiers => Faites un dossier avec les PDF, dossiers : nom revue, fichiers : avec 29. d) Insertions dans le traitement de texte 30. Styles bibliographiques Sur Mendeley et Zotero, standardiss grce au langage CSL, format libre labor selon les usages de prsentation bibliographique utiliss par les revues scientifiques Liste de styles CSL mendeley http://www.mendeley.com/citationstyle s/ 31. Les styles bibliographiques peuvent tre spars en deux grands groupes le systme dit de Vancouver avec des citations numriques qui renvoient un numro d'apparition dans la liste bibliographique (classement par ordre d'apparition dans le texte) 32. le systme de Harvard avec des citations auteur-date : binme (auteur + date) pour la citation dans le texte , rfrences dans la liste bibliographique (par ordre alphabtique et chronologique).http://infolit.be/LELiS/ch04s02.html d'aprs Bernard POCHET- Universit de Lige 33. http://infolit.be/LELiS/ch04s02.htmlBernard POCHET- Universit de Lige 34. http://infolit.be/LELiS/ch04s02.html Bernard POCHET- Universit de Lige 35. Styles numrotation : Les possibles insertions dans le traitement de texte (1) Numro dappel => insr par icne citation Rf zone bas de page par ordre de numro => insre par icne citation Bibliog. fin de document par ordre alphab. auteur => insre par icne bibliography 36. Styles numrotation : Les possibles insertions dans le traitement de texte (1) Styles CSL avec numro dappel, rfrences numrotes en zone bas de page et biblio finale classe selon ordre alpha. auteurs Modern Humanities Research Association Note with bibliography Chicago Manual of style (full note) Chicago Manual of style (note) 37. Styles numrotation : Les possibles insertions de dans le traitement de texte (2) Numro dappel => insr par icne citation Bibliog. fin de document par ordre numrotation => insre par icne bibliography 38. Styles numrotation : Les possibles insertions dans le traitement de texte (2) Styles CSL avec Numro dappel, (pas de rfrences numrotes en zone bas de page) et biblio finale classe selon ordre apparition dans le texte IEEE Nature Journal Vancouver 39. Styles au format (auteur date) American Anthropological Association American Psychological Association 6th Edition Cell Chicago Manual of Style author date Elseviers Harvard Style (with titles) Modern Langage Association 40. Styles auteur date : Les possibles insertions dans le traitement de texte Auteur et date => insrs par icne citation Bibliog. fin de document par ordre alphab. auteur => insre par icne bibliography 41. Traitement de texte Tools Install pour installer plugin Word 2007 : ruban rfrences Insert citation, recherche ou Go to Mendeley et slectionner la rfrence clic sur Send to citation Insert bibliography Changer de style avec menu style Mise jour : refresh 42. Exercices Insrer trois citations Insrer la bibliographie Modifier une citation Modifier le style Dans Mendeley, changer le nom dun auteur, puis mettre jour le document 43. Editeur de style visuel Mendeley Mendeley propose env. 2800 styles Exigences des revues scientifiques pour les styles : prolifration avec diffrences minuscules Mendeley dispose dun diteur visuel CSL en ligne pour les personnaliser http://csl.mendeley.com/ Tutoriel : https://github.com/citation-styleeditor/csl-editor/wiki/User-guide-for-theCSL-Editor 44. Editeur de style visuel Mendeley Partir dun style existant pour le personnaliser : soit recherche par nom dans lditeur, soit recherche par chantillonPour personnaliser, slectionner un lment d'une citation, en modifier le format afin d'laborer un nouveau style, lenregistrer au format CSL, puis lajouter Mendeley 45. 2 / En ligne a) Fonctions sociales : gratuit, payant, public, priv b) Groupes de travail 46. a) Fonctions sociales : gratuit, payant, public, priv 47. Dashboard Flux dactivit de vos contacts, groupes 48. Groupes Trouver des groupes de travail publics 49. People 50. Editer le profil 51. Rglages profilsRglages importants : qui verra votre profil (CV, publications, etc.) 52. a) Ce qui est gratuit ou payant, ce qui est public ou priv 53. compte gratuit/compte payant Stockage gratuit 2 gigas Moins cher des comptes payants 5 euros par mois : stockage total 5 gigas jusqu' 10 groupes privs Compte payant : bnficier de conseils de lecture d'articles personnaliss en fonction de la bibliothque 54. Synchronisation pas automatique : clic sur Sync Library pour que captures en ligne parviennent en local ou pour que les annotations PDF en local soient prises en compte sur le compte en ligneAfin de ne pas dpasser la limite de stockage : paramtrer par vous-mme ce qui va tre mis en ligne : sur un dossier clic droit Edit settings 55. Ce qui est public, visible tous Informations que vous placez sur votre profil => vous pouvez les rendre prives (My Account, privacy) Catalogue Groupes publics Les profils publics 56. Ce qui est priv Groupes privs Bibliothque Messagerie Dashboard, flux d'information Onglet People, recherche de profils 57. b) Groupes de travail 58. Les groupes de travail permettent la collaboration et le partage de documents dans un cadre priv Si publics seules les rfrences peuvent tre partages Si privs document notamment PDF peuvent tre partags et annots en commun Participants doivent possder un compte Possibilit 10 membres 5 groupes max. 59. Crer un groupe : panneau de gauche Page overview sur le logiciel, page en ligne indique activits du groupe Pour ajouter document au groupe simplement le faire glisser Possibilit annoter surligner le document une couleur par personne 60. Ensemble des annotations apparat dans un volet qui permet navigation Possibilit d'exporter le PDF annot via le menu fichier du lecteur PDF Possibilit d'exporter les annotations seules Sur le document export les noms des diffrents commentateurs seront distincts 61. c) Le catalogue de recherche 62. Accessible tous sur l'onglet papers prs de 34 millions de document ou rfrences Constitus de doc. mis en ligne dans le dossier my publications par les utilisateurs Aussi documents scientifiques crawls par Mendeley Rfrences issues de sites d'diteurs 63. Recherche avance filtrage par type de document et auteur Recherche simple donne aussi de bon rsultats sur un mot Possible restreindre la recherche aux documents en accs libre et gratuit Documents trouvs peuvent tre sauvegards directement dans la bibliothque 64. Pour chaque rsultat un nombre de lecteurs est prcis => Outil garde des statistiques de lecture qui sont anonymes Rsultats peuvent tre partags sur les rseaux sociaux Facebook Twitter A ct d'un rsultat conseil de document similaire et statistiques de lecture comme pourcentage de lecteurs par discipline scientifique 65. III PERSPECTIVES A/ MENDELEY ACHET PAR ELSEVIER Opportunit de dveloppement ou menace ? 66. Faits 1 Avril 2013 : lditeur Elsevier achte Mendeley pour la somme de $69M$100M selon Techcrunch Les 50 membres de lquipe de Mendeley rejoignent les 7000 employs dElsevier. Or Elsevier critiqu pour ses pratiques de prix excessives 67. Faits 2 Elsevier possde les outils Scopus et ScienceDirect Scopus : base de donnes scientifique de citations et de rsums bibliographiques ScienceDirect donne accs payant 11 million articles de 2,500 revues SciVerse, un hub (point central) pour interroger les outils dElsevier, Scopus, ScienceDirect, etc. 68. Engagements de Mendeley L'espace de stockage est doubl : le compte gratuit Mendeley dispose de 2Go, Mendeley Plus et comptes MIE 5 Go, et Mendeley comptes Pro 10Go. Mendeley promet quil y aura toujours une version gratuite. (comprendre accessible sans verser de largent Elsevier) 69. Engagements de Mendeley Donnes toujours en possession des utilisateurs nous continuerons soutenir les standards ouverts et les formats de donnes pour l'importation et l'exportation et veiller leur portabilit Continuer travailler avec les autres diteurs, ne pas favoriser les contenus d'Elsevier sur son propre moteur de recherche et de recommandation 70. Interoprabilit des outils Scopus et ScienceDirect seront interoprable avec Mendeley : Exportation des donnes et document vers Mendeley facilite Enrichies des donnes de Mendeley (recommandations, statistiques du lectorat)Objectif : crer un centre de dcouverte, un workflow et rseau de collaboration pour la communaut scientifique mondiale 71. Perspectives Aujourdhui Mendeley toujours gratuit, une offre plus intressante : capacit de stockage dans le cloud. Discours de Mendeley : promet de continuer promouvoir une science plus ouverte et collaborative Quid de lavenir pour un petit outil adoss un gant de ldition scientifique ? Fonctionnalits de Mendeley pas menaces actuellement, mais pourra ton demain utiliser cet outil sans se lier Elsevier ? 72. III PERSPECTIVES B) MENDELEY INSTITUTIONAL EDITION Offre conjointe Mendeley Swets 73. Mendeley install au niveau dun tablissement. En liaison avec les abonnements aux revues scientifiques (Swets = entreprise de services dabonnements) 74. Pour les chercheurs : accs la version pro de Mendeley en association avec laccs aux abonnements Pour les bibliothcaires/administrateurs : Tableau de bord : visibilit des revues dans lesquels les membres ont publis, visibilit du lectorat de leurs publications 75. Accs des statistiques de lecture et de publication Lecture : quelles sont les revues les plus lues, les revues dans lesquelles les chercheurs publient le plus Combien darticles de vos propres collections sont ajoutes aux bibliothques virtuelles de votre institution les plus lues, ceux qui ne sont pas lus 76. Visibilit des lacunes dans les collections : les titres consults par les chercheurs et absents des collections Comparer les statistiques de lecture des articles crits par les chercheurs de votre institution par rapport aux autres institutions