1

28 Rue du Docteur Finlay

75015 Paris gisbv@genoplante.com

Directeurs de publication : Hélène Lucas, Pascual Perez Secrétaires de rédaction : Romain Piovan, Maxime Szambien

La lettre d’information du

Edito L’année 2013 touchant à sa fin, toute l'équipe du GIS

Biotechnologies Vertes vous souhaite de très bonnes fêtes de

fin d’année.

Cette année a été marquée pour notre communauté de

recherche par l’évolution des appels à projets de l’ANR, la

construction du programme cadre européen « Horizon 2020 »,

et par la mise en place du nouvel appel à projets Innovation

2030 "Concours Mondial d'Innovation".

L’importance du partenariat public-privé pour les agences de

financement confirme le rôle structurant du GIS BV pour

définir des priorités de recherche communes, favoriser

l'incubation de projets et produire des résultats de recherche.

Le GIS BV a renforcé en 2013 sa politique d’animation de la

communauté de recherche publique-privée autour des

thématiques d’intérêt du GIS en organisant 5 Comités

d'Animation Thématique et 2 Ateliers Scientifiques,

rassemblant au total près de 200 participants. Ces rencontres

ont permis de produire un ensemble de documents de

synthèse sur lesquels le GIS peut appuyer ses réflexions

scientifiques et stratégiques.

Ces animations scientifiques ont également permis de faire

émerger des groupes de travail au partenariat élargi qui se

sont mobilisés pour proposer des projets aux différents appels

d’offre. Nous tenons à remercier chaleureusement les

animateurs des Comités d'Animation Thématique et des

Ateliers Scientifiques sans lesquels rien de ceci n’aurait été

possible.

…/…

Sommaire

P.1 Edito

P.2 Accord Génoplante-Valor DEINOVE

P.3 Lancement du programme H2020

P.3 Dossier : Projets Investissements d’avenir

P.4 RapsodyN

P.5 Biomass for the Future (BFF)

P.6 SUNRISE

P.7 Concours d’Innovation Mondial

P.8 Événements passés

P.8 Colloque Modélisation

P.8 Workshop ETP « Plants for the future »

P.8 Offres d’emplois

P.9 Nouveaux projets labellisés GIS BV

P.10 Agenda du GIS BV

P.11 Colloques 2014

P.12 Animation Scientifique du GIS BV

P.12 Atelier scientifique New Breeding

Techniques : outils de rupture ?

N°9 – DÉCEMBRE 2013 https://twitter.com/gisbiotechverte

2

Dix-sept nouveaux projets financés par l’ANR ont été

labellisés en 2013 par le Comité Stratégique du GIS BV,

portant à 62 le nombre de projets suivis par le GIS BV en

2013. Ils contribueront à l’apport de nouvelles

connaissances scientifiques et de technologies innovantes

pour l'ensemble des membres du GIS et pour la

communauté internationale. Nous saluons les équipes de

recherche qui ont rejoint notre communauté et leur

adressons tous nos vœux de succès pour la réalisation de

leur projet.

2013 a aussi été la première année pleine de recherche

pour la plupart des Projets « Investissements d'Avenir »

labellisés par le GIS. Nous félicitons les coordinateurs et les

équipes de recherche impliqués dans ces projets pour leur

remarquable travail, qui a permis d'atteindre la grande

majorité des objectifs scientifiques planifiés, et même

parfois de les dépasser Ces projets ont déjà un impact en

termes de visibilité internationale et leur capacité à

entrainer d'autres projets et acteurs se fait sentir, augurant

le meilleur pour les années à venir.

Au cours de l'année à venir, le GIS BV, avec l’appui de

Génoplante-Valor, poursuivra sa politique d'animation

scientifique avec le soutien de ses partenaires et en

collaboration avec le Groupe de Travail "Biologies des

plantes et Biotechnologies" de l'Alliance AllEnvi. Il

s'emploiera à favoriser encore davantage la transversalité

entre les disciplines et entre les projets, et renforcera sa

présence sur le territoire européen via la plateforme

technologique "Plants for the Future". Nous nous

réjouissons de commencer 2014 à vos côtés !

Hélène Lucas, présidente du Directoire Opérationnel

Pascual Perez, vice-président du Directoire Opérationnel

Suivez-nous sur les réseaux sociaux!

Retrouvez l’actualité des biotechnologies vertes

et du GIS BV sur twitter et l inkedin.

DEINOVE conclut un accord avec Génoplante-Valor*

sur un brevet portant sur l’amélioration des voies

de biosynthèse des isoprénoïdes

DEINOVE (Alternext Paris : ALDEI), société

technologique qui conçoit et développe une nouvelle

génération de procédés industriels fondée sur les

bactéries Déinocoques, annonce avoir signé avec la

société Génoplante Valor via INRA Transfert, la filiale

de valorisation de l’Institut National de la Recherche

Agronomique, un contrat d’option de licence sur un

brevet portant sur l’amélioration des voies de

biosynthèse des isoprénoïdes.

DEINOVE mettra en œuvre cette technologie dans le

cadre du programme DEINOCHEM pour renforcer les

capacités des bactéries Déinocoques à produire des

composés chimiques à partir de matières premières

biosourcées. Cette propriété intellectuelle a été générée

dans le cadre d’un programme de recherche ANR

Génomique labellisé Génoplante.

Voir le communiqué de presse :

http://www.deinove.com/sites/default/files/pdf_news

/17122013_deinove_cp_inra.pdf

*La société Génoplante-Valor soutient le GIS BV dans la

gestion, l’animation et la contractualisation. Elle valorise

les résultats issus de Génoplante et de certains projets

labellisés GIS BV.

3

Lancement du programme H2020

Le coup d’envoi officiel français du programme cadre européen HORIZON 2020 a été donné le 16 décembre à Paris

par Madame Geneviève Fioraso, ministre de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche. Ce nouveau programme

pour la recherche et l’innovation, doté d’un budget global de 79 milliards d’euros, soit une augmentation d’environ

30% par rapport au programme cadre précédent, démarrera le 1er janvier 2014 pour une durée de 7 ans.

Les premiers appels à proposition du défi sociétal 2 « Sécurité alimentaire, agriculture durable, recherche

marine et maritime et bioéconomie » ont été publiés le 11 décembre 2013. Au sein de ce défi, les appels

« Sustainable food security » et « Innovative, Sustainable and Inclusive Bioeconomy » représentent 335 millions

d’euros pour la période 2014-2015, auxquels viennent s’ajouter 77,5 millions d’euros dans le cadre de la 3ème priorité

« primauté industrielle ».

A noter que des opportunités en bioéconomie sont également présentes dans d’autres priorités, telles que « Factory of

the future » ou « Sustainable process industries » au sein de l’axe « Nanotechnologies, matériaux avancés et procédés

avancés de fabrication, biotechnologie ».

Retrouvez toutes ces informations sur le portail français d’H2020 :

http://www.horizon2020.gouv.fr

Dossier : Projets Investissements d’Avenir

Parmi les 62 projets suivis par le GIS Biotechnologies Vertes, 7 sont issus du Programme Investissements d’Avenir

« Biotechnologies et Bioressources ». Démarrés en 2011 (1ère vague) ou en 2012 (2ème vague), tous tiennent leur

réunion annuelle au cours des derniers mois de chaque année du projet.

Ces réunions annuelles sont l’occasion de ressembler les représentants et scientifiques issus

des partenaires des projets. Organisées autour de la présentation des principaux résultats

obtenus au cours de l’année écoulée, parfois en présence du Scientific Advisory Board du

projet, elles favorisent les liens entre partenaires et contribuent à l’établissement d’une vision

globale de l’avancée du projet pour chacun.

Elles sont aussi un lieu d’échange et de questionnement scientifique de grande qualité. Ces réunions annuelles se

concluent généralement par l’Assemblée Générale du projet, instance de gouvernance présidée par le coordinateur.

Un représentant du GIS Biotechnologies Vertes et de Génoplante-Valor, en tant que membres invités, assistent à

l’ensemble de ces réunions annuelles et Assemblées Générales.

Dans ce numéro, nous vous présentons les principaux résultats obtenus au cours de l’année 2013 pour trois de ces

projets : Rapsodyn (colza), Sunrise (tournesol) et Biomass for the Future (miscanthus et sorgho).

4

Rapsodyn (90 mois, 2012-2019) a pour ambition de

développer des variétés de colza présentant des

rendements optimisés et une efficacité d’utilisation de

l’azote (NUE) améliorée en conditions de bas intrants

azotés.

La 1ère année du projet a été essentiellement consacrée

à la constitution d’un panel de plus de 200 accessions

de colza choisies pour maximiser la diversité

génétique du colza d’hiver oléagineux. Cette ressource,

qui est au cœur des analyses de génétique

d’association de Rapsodyn, a été génotypée grâce à

une puce Infinium 60K SNP et 30 accessions sont en

cours de re-séquençage complet (les données sont

déjà disponibles pour 16 de ces lignées).

Parallèlement, le génotypage de matériel végétal

complémentaire permettant des analyses génétiques

par liaison (populations d’haploïdes doublés) et/ou

par association (population NAM de colza) a

également été initié en 2013. L’ensemble des données

de génotypage est disponible pour les partenaires de

Rapsodyn.

Concernant le phénotypage, il a été essentiellement

focalisé en 2013 sur les populations biparentales qui

étaient disponibles dès le début du projet (populations

HD en dispositif simple ou semi-connecté). Les essais

menés en 2012/2013 (5 environnements, 2 conditions

de nutrition azotée, 4250 parcelles expérimentales)

ont permis d’acquérir des données de rendement en

huile et d’efficience d’utilisation de l’azote (NUE) chez

le colza cultivé sous contrainte azotée. Les analyses

génétiques par liaison ont d’ores et déjà permis

d’identifier quelques régions génomiques qui

contrôlent les caractères quantitatifs étudiés dans le

cadre de Rapsodyn.

Ces travaux viennent renforcer les résultats acquis

précédemment dans le projet ANR GENERGY (2008-

2012) et font l’objet d’une publication en cours

d’évaluation (Bouchet et al. soumis).

Par ailleurs, 3 QTL critiques pour le rendement et la

réponse à la nutrition azotée vont être introgressés

dans le matériel élite apporté par les sélectionneurs

partenaires. Une première action menée en 2013 à

consister à choisir les receveurs adéquats parmi les

15-20 élites de chaque obtenteur. Les croisements

sont en cours de réalisation entre les élites et les

donneurs porteurs des allèles favorables pour chaque

QTL ciblé.

Enfin, un point essentiel concerne la mise en place

d’un système d’information Rapsodyn intégrant dans

sa majeure partie les outils GnpIS. Parallèlement, le

développement d’algorithmes spécifiques pour le

traitement de données NGS (Next Generation

Sequencing) chez les polyploïdes a débuté.

Après cet excellent démarrage en 2013, la seconde

année du projet devrait être marquée par le

séquençage de l’exome de l’intégralité des accessions

du panel afin de mettre en œuvre les analyses de

génétique d’association. Par ailleurs, les essais

expérimentaux réalisés pendant la campagne

2013/2014 (phénotypage du panel dans 7

environnements, 2 conditions de nutrition N)

serviront également de support aux développements

de protocoles de phénotypage moyen-haut débit pour

l’évaluation du statut azoté des plantes (ex. vols de

drones, utilisation de pinces multiplex).

Pour plus d’informations : http://www.rapsodyn.fr/

5

Piloté par l’Institut Jean-Pierre Bourgin (IJPB) du

centre INRA de Versailles-Grignon, le projet BFF

(Biomass for the Future) vise à relever les enjeux

environnementaux et sociétaux de la production et de

l’exploitation de biomasse pour favoriser le

développement de filières vertes d’avenir.

L’objectif est de développer deux filières de biomasse

non alimentaire en France, le miscanthus et le sorgho

ayant un faible impact environnemental et une

composition adaptée aux applications industrielles, et

de structurer l’ensemble de la chaîne de valeur

industrielle pour les secteurs des biomatériaux et de

bioénergies, en particulier au niveau local.

La réunion annuelle du projet BFF a eu lieu les 21 et

22 novembre 2013 dans les locaux du CIRAD à

Montpellier. L’évènement a été ouvert par Anne-

Yvonne Le Dain, députée de la 2ème circonscription de

l’Hérault, qui a mis l’accent sur les enjeux liés à la

biomasse et la responsabilité sociétale des acteurs

scientifiques. Au terme de cette première année de

travail collaboratif, cet évènement fut l’occasion pour

les partenaires et chercheurs impliqués de faire un

premier état d’avancement des différents groupes de

travail.

Les leaders des différents groupes de travail ont

insisté sur la nécessité de renforcer les interactions

entre les groupes de travail pour optimiser l’échange

de données et d’informations et contribuer à

maintenir l’élan du projet. L’accent a également été

mis sur l’importance de la structuration de la chaîne

de valeur et du rôle des territoires dans le cadre de la

mise en œuvre des filières sorgho et miscanthus.

Celles-ci doivent en effet faire face aux défis

scientifiques et agronomiques de demain et répondre

aux besoins des industriels. Dans cette optique, le rôle

de l’association de préfiguration Biomis G3 a

particulièrement été souligné.

Enfin, cet évènement a aussi été l’occasion lors de

l’Assemblée Générale de valider l’entrée de deux

nouveaux partenaires dans le projet, la société de

construction Alkern, et le groupe coopératif agricole

Axereal, qui viendront apporter leurs réseau et savoir-

faire aux partenaires de BFF.

Principaux résultats

Des progrès significatifs ont été réalisés au cours de

cette première année, notamment dans le

développement de méthodes de fabrication de

matériaux de construction basés sur le miscanthus, et

des composites de polypropylène renforcés par des

fibres de miscanthus ; la mise en place des premiers

essais en champs et le développement des futurs outils

d’analyse de la biomasse (moléculaires, histologiques,

anatomiques et biochimiques). 54 génotypes de

sorgho, 24 génotypes de miscanthus et 22 de maïs

vont pouvoir être quantifiés pour des traits d’intérêt.

La deuxième année permettra de finaliser la mise au

point des méthodes d’analyse, de développer d’autres

outils (fluorescence, multiphoton), de poursuivre le

développement de nouvelles variétés de sorgho, et de

nouveaux clones de miscanthus.

Pour plus d’informations :

http://www.biomassforthefuture.org/

6

Le projet SUNRISE, coordonné

par Patrick Vincourt du

Laboratoire des Interactions

Plantes Microorganismes (UMR

INRA-CNRS, Toulouse) a pour

objectif principal l’amélioration

de la production d’huile issue de

la culture d'hybrides de tournesol en condition de

disponibilité réduite en eau via l’amélioration

génétique du tournesol Helianthus annuus et une

meilleure valorisation de sa diversité génétique.

La disponibilité prochaine de la séquence génomique

de Helianthus annuus ainsi que la rupture créée par

l’arrivée des nouvelles technologies de séquençage et

le développement de plateformes de phénotypage et

de bio-informatique modifient le panorama de la

recherche sur le tournesol. Ce contexte favorable

permet de relever ce défi et de renforcer la

compétitivité de la filière tournesol et plus

généralement de l’industrie française des semences.

La première réunion annuelle du projet SUNRISE s’est

déroulée les 5 et 6 décembre 2013. Elle a réunit les

participants du projet dans les locaux du Centre INRA

de Toulouse Midi-Pyrénées pour faire un état des lieux

du projet au terme de sa première année. S’est tenue à

cette occasion la seconde Assemblée Générale du

projet réunissant l’ensemble des partenaires. Ce

rassemblement a donné l’occasion aux participants de

visiter la plateforme HELIAPHEN, consacrée au

phénotypage à haut débit de plantes cultivées en

extérieur en pots.

Principaux résultats

Le matériel génétique mobilisé pour le projet SUNRISE

s’articule en trois principaux ensembles : un plan de

croisement factoriel incomplet d’hybrides ; un

dispositif de type « Nested Association Mapping »

(« NAM-DRR ») en cours de développement ; un

dispositif de type « North Carolina III » à partir de la

population de RIL « INEDI » (« INEDI-NCIII ») qui sera

expérimenté pour la première fois en 2014.

Par ailleurs, d’autres ressources sont en cours de

création : des lignées d’introgression à partir de 6

écotypes sauvages d’origines écologiques très diverses

(stade BC1), une population de TILLING notamment

pour la génétique reverse.

L’analyse du dispositif « GWA-hybrid » s’appuiera sur

les données de séquençage des 72 lignées parentales

impliquées. Ces données sont également utilisées pour

développer une puce AXIOM qui sera mobilisée pour

l’analyse des dispositifs « NAM-DRR » et « INEDI-

NCIII ». La puce sera disponible au cours des

prochains mois, et sera exploitée à partir de la fin de

l’année 2014. Les données de séquençage seront mises

très prochainement à la disposition des partenaires.

L’intégration de données bioinformatiques a débuté et

une archive SUNRISE a été mise en place ; des

améliorations sont attendues pour 2014, notamment

pour préparer l’arrivée des données SNPs. Des progrès

ont également été réalisés sur les modèles

environnementaux éco-physiologique (SUNFLO).

L’approche dite « source-puits » sera utilisée pour la

modélisation fonctionnelle.

Les travaux de phénotypage (agronomique,

physiologique et moléculaire) ont également débuté,

en particulier sur le dispositif « GWA-hybrid » (7 sites

au cours de l’année 2013). Sur un sous-ensemble de ce

dispositif, des différences importantes de vigueur

germinative ont été observées entre génotypes soumis

à un stress osmotique (PEG) . Divers nouveaux outils

de phénotypage sont en cours de test (ex : drones) ou

d’étude de faisabilité (ex : petit robot circulant dans

l’inter-rang au champ), ou sont déjà mobilisés pour

l’analyse de sous-dispositifs d’analyse génétique

(plateforme HELIAPHEN). Les progrès notables

réalisés au cours de cette première année confirment

l’impact important qu’aura SUNRISE sur la filière

tournesol en France.

Pour plus d’informations :

http://www.sunrise-project.fr

7

Concours d’Innovation Mondial 7 ambitions stratégiques pour innover en France La commission Innovation 2030 mise en place en Avril

2013 et présidée par Anne Lauvergeon a retenu 7

ambitions stratégiques correspondant à des

opportunités au fort potentiel pour l’économie

française.

Ces ambitions reposent sur des attentes sociétales

fortes, des secteurs en croissance et visent à créer de

l’emploi et des richesses sur le long terme.

Dans ce contexte, l’Etat met en place un Concours

Mondial d’Innovation dont l’objectif est de repérer et

d’accompagner les futurs talents de l’économie

française dans leurs projets d’innovation.

Il prévoit d’affecter un budget de 300 millions d’euros

pour cofinancer des projets innovants en lien avec les

7 ambitions définies par la commission. Ce

cofinancement sera réalisé dans le cadre des

Investissements d’Avenir et s’appuiera sur Bpifrance.

Parmi les 7 ambitions pour lesquelles les entreprises

pourront déposer leur projet d’innovation, le GIS BV a

identifié deux ambitions d’intérêt en lien avec le

programme Biotechnologies Vertes :

- Ambition n°4 : les protéines végétales et la

chimie du végétal

- Ambition n°7 : la valorisation de données

massives (Big Data)

Processus de sélection

Le processus de sélection aura lieu en 3 phases :

la première phase, dite d’amorçage permettra de

sélectionner 100 projets au stade très amont de

leur développement. Les projets sélectionnés

recevrons une aide financière sous forme de

subventions pouvant atteindre 200 000 euros.

la deuxième phase, dite de levée de risque,

permettra d’accompagner les projets les plus

prometteurs sur des travaux de R&D.

la dernière phrase, dite de développement,

permettra d’accompagner, à nouveau après une

sélection des projets sur base des travaux

précédents, une industrialisation des innovations.

Les porteurs de projets n’ont pas l’obligation à

participer à chacune de ces 3 phases.

En fonction de la maturité de leur projet, ils peuvent

soit demander un financement dès la phase

d’amorçage ou ne soumettre leur projet qu’en phase

de levée de risque. Un appel à projets sera ouvert par

phase avec un calendrier spécifique et un cahier des

charges dédié.

Agenda

- 30 janvier 2014 : Première clôture

intermédiaire

- 31 mars 2014 : Seconde clôture

intermédiaire

- 30 juin 2014 : Dépôt des dossiers de

candidature en ligne

Retrouver toutes les informations sur le site :

http://www.innovation2030.org/fr/

8

Evénements passés

Colloque Modélisation multi-échelle des plantes, 26-27 novembre 2013 Le GIS Biotechnologies Vertes était présent au colloque Modélisation multi-échelle des

plantes organisé les 26 et 27 septembre par le groupe de travail 4 « Biologie des plantes

et biotechnologies » de l’Alliance pour l’Environnement (AllEnvi) à l’ENS de Lyon. Cet

évènement, regroupant des spécialistes de la modélisation dans différents domaines du

végétal, fut l’occasion pour les chercheurs de faire le point sur les technologies et

approches utilisées aujourd’hui dans la modélisation des plantes, aux niveaux

moléculaire, biochimique, mécanique, racinaire ou plante entière. La tenue d’une table

ronde a permis de discuter du potentiel d’utilisation de la modélisation en biologie

végétale, des problématiques de recherche partagées et des nécessaires interactions

avec les plateformes haut débit.

Plant ETP Research Strategy Workshop, 27-28 novembre 2013

Les 27 et 28 novembre, le GIS BV a participé au workshop organisé par l'European Technology

Plateform (ETP) « Plants for the Future » à Bruxelles. Aux cotés de 33 participants issus

d'institutions ou entreprises de 12 nationalités européennes différentes, le GIS BV a activement

contribué aux réflexions sur le premier document d'orientation H2020 "2014-2016" soumis par

l'ETP à la Commission Européenne. De plus, ce workshop a permis de référencer et partager les

priorités scientifiques de chacune des structures représentées, et a été l'occasion de partager des premières idées de

projets à soumettre pour les deux années à venir.

Le GIS BV est référencé par l'ETP « Plants for the Future » comme plateforme française de référence.

Offres d’emplois: GÉNÉTICIEN

Entreprise : Biogemma

Durée : 12 mois

Lieu : Chappes (63), France

Contact : rh@biogemma.com.

Lien : http://www.breedwheat.fr/fr/jobs.php

POSTDOC

Organisme : Institut de Biologie Physico-Chimique

Laboratoire : Chloroplast Membrane and Molecular physiology ( UMR 7141/CNRS/UPMC)

Durée : 24 mois

Lieu : Paris (75), France

Contact : wolman@ibpc.fr

Lien : http://urlz.fr/bzB

9

Nouveaux projets labellisés GIS BV

17 projets labellisés en 2013 15 nouveaux projets de recherche parmi les projets

sélectionnés lors des appels 2013 BioAdapt, Jeunes

Chercheuses – Jeunes Chercheurs (JCJC) et Blanc ont

été labellisés par le Comité Stratégique du GIS BV le 13

novembre 2013. Ils viennent s’ajouter aux deux

projets BioAdapt 2012 labellisés lors du Comité

Stratégique du 12 mars 2013.

Ces projets bénéficieront ainsi d’un soutien privilégié

du GIS BV pour la mise en valeur des résultats, la

gestion de la propriété intellectuelle et la participation

à un collectif scientifique public-privé dont l’objectif

est de favoriser la transversalité, les échanges et

l’expression commune de positionnements pour la

recherche.

7 projets de recherche ANR BioAdapt ont été

labellisés cette année : le projet RNAdapt, porté par

Martin Crespi (CNRS, Gif-sur-Yvette), qui vise à étudier

le rôle des ARN non-codants dans l’adaptation de

l'architecture racinaire à la carence en phosphate chez

Arabodpsis – ABCPaPoGen, coordonné par Laure

Kaiser-Arnauld (CNRS, Gif-sur-Yvette), qui a pour

objectif l’étude des mécanismes d’adaptation de

parasitoïdes (Cotesia sesamiae et Hyposoter

didymator) utilisés en lutte biologique contre les

ravageurs des cultures, pour des caractères

comportementaux et physiologiques d’adaptation à

l’hôte et à son habitat - AdapTom, coordonné par

Mathilde Causse (INRA UR GAFL, Avignon), qui a pour

objectif d'étudier la résistance au stress hydrique chez

la tomate par une approche multi-échelle (génomique,

génétique, physiologique) via l'identification et la

caractérisation de régions chromosomiques (approche

QTL), de gènes, d'allèles et de phénotypes d'intérêt -

EFFECTOORES, coordonné par Pere Mestre (INRA

UMR 1131, Colmar), qui a pour objectif d'identifier des

gènes de résistance potentiels à des pathogènes chez 3

plantes cultivées (tomate, tournesol, vigne), via

l'utilisation d'effecteurs Oomycètes - EvoMetoNicks,

coordonné par Sylvain Merlot (ISV CNRS, Gif-sur-

Yvette), qui vise à améliorer les connaissances

actuelles sur les mécanismes moléculaires impliqués

dans la résistance des plantes au nickel et son

hyperaccumulation dans celles-ci - PRAISE, coordonné

par Isabelle Litrico (INRA UR3PF), qui propose le

développement d'une nouvelle méthode

d'amélioration génétique des plantes fourragères

prairiales en conditions multi-espèces, en se basant

principalement sur des connaissances génétiques et

écologiques – et REGLISSE, coordonné par Laurent

Nussaume (CEA/CNRS/Aix-Marseille Université), qui

vise à améliorer les connaissances sur les réponses de

la plante aux variations de Phosphate Inorganique (Pi)

dans le sol, en se focalisant sur les modifications du

métabolisme lipidique engendrées au niveau des

membranes cellulaires, et ses conséquences

physiologiques.

Parmi les projets ANR blanc 2013 sélectionnés pour

financement, 6 projets ont été labellisés par le GIS BV :

AfriCrop, projet coordonné par Yves Vigouroux (IRD

UMR DIADE, Montpellier), qui vise à retracer l’histoire

évolutive de la domestication de 4 plantes cultivées

africaines (riz africain, mil, fonio, igname africaine) en

combinant l’analyse de données génétiques,

archéologiques et anthropologiques – BugsInACell,

coordonné par Peter Mergaert (ISV CNRS, Gif-sur-

Yvette), qui a pour objectif l’étude des mécanismes de

différenciation du bactéroïde fixateur d’azote dans les

nodules, en étudiant 3 morphotypes de bactéroïdes

correspondant chacun à une plante hôte spécifique –

ChloroRNP, coordonné par Francis-André Wollman

(CNRS, UPMC, Paris), propose d’améliorer la

compréhension des mécanismes moléculaires nucléo-

chloroplastiques chez l’algue modèle Chlamydomonas

reinhardtii, en étudiant la génération, la stabilité et la

dégradation des transcrits chloroplastiques et en

caractérisant l’action moléculaire et biochimique des

facteurs ROGEs

10

le projet Fe-S traffic, porté par Nicolas Rouhier

(Université de Lorraine, INRA IaM UMR 1136, Nancy),

a pour objectif l’étude du mode d’action moléculaire

des protéines Fe-S, essentielles pour de nombreux

processus cellulaires fondamentaux (photosynthèse,

respiration, etc) – INASEED, coordonné par Gwyneth

Ingram (RDP, CNRS, ENS, Lyon), a pour objectifs le

développement de nouveaux outils permettant une

caractérisation biochimique de la cuticule des graines

chez Arabidopsis, et l’étude du rôle d’une réponse de

type auto-immune dans la formation de la cuticule

durant l’embryogénèse – et InteGrape, coordonné par

Philippe Hugueney (INRA SVQV, Colmar), qui vise à

étudier la TPS (Terpène synthase) et le cytochrome

p450 chez la vigne, deux familles de gènes

particulièrement représentées chez cette espèce, en

combinant différentes approches (génomique,

génétique et évolutive).

Enfin, 4 projets du programme ANR Jeunes

Chercheuses - Jeunes Chercheurs (JCJC) ont

également été labellisés: Bugspit, coordonné par

Sugio Akiko (INRA IGEPP, Rennes), qui a pour objectif

l’étude des rôles des protéines salivaires et des

symbiontes des pucerons dans l’adaptation à leur

plante hôte, en s’intéressant aux gènes impliqués dans

le processus d’adaptation du puceron du pois –

EXTRACHROM, coordonné par Marie Mirouze (IRD

Montpellier), qui vise à caractériser la partie

extrachromosomale mobile du génome (mobilome) du

riz, en s’appuyant sur une technique permettant de

séquencer les éléments transposables chez

Arabidopsis – le projet INCITE, coordonné par Romain

Barnard (INRA UMR 1347 Agroécologie, Dijon), qui a

pour objectif global une meilleure compréhension des

interactions plante/communauté microbienne du

sol/précipitations – et SYBIOPOP, coordonné par

Vincent Segura (INRA UR 588 AGPF, Orléans), qui vise

à mieux comprendre les déterminants moléculaires et

génétiques responsables de la qualité

lignocellulosique chez le peuplier, via une approche

systémique intégrant une analyse du polymorphisme

et de données phénotypiques.

Agenda du GIS BV

Atelier scientifique

New Breeding Techniques,

Outils de rupture ?

1er avril 2014, Paris

Instances du GIS BV

Comité de Propriété Intellectuelle et Valorisation

2 janvier 2014

Comité Pédagogique Transversal

24 janvier 2014 (à confirmer)

Directoire Opérationnel

28 janvier 2014

Comité Stratégique

18 mars 2014

Comité Développement Durable

15 mai 2014

Comités d’Animation Thématiques (CAT*)

Interactions Abiotiques

25 avril 2014, Paris

Qualité Produits et Nouveaux

Usages 13 mai 2014, Paris

Méthodes d’Amélioration des

Plantes 26 mai 2014, Paris

Inscription gratuite mais obligatoire. Pour plus de

renseignement : szambien@genoplante.com

*Les CAT permettent de favoriser les échanges

scientifiques entre membres de la communauté

rassemblée sous l’égide du GIS Biotechnologies Vertes,

et d’offrir aux participants l’opportunité de partager et

construire une vision collective de la thématique afin de

dégager des voies d’exploration à mettre en avant pour

de futurs projets.

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Colloques 2014

20 janvier 2014, Paris, France

Forum Recherche Industrie de l’Institut Carnot 3BCAR - Bioénergie : les

avancées actuelles de 3BCAR pour une exploitation industrielle future

3 - 7 Février 2014, Aussois, France

11èmes Rencontres Plantes-Bactéries

9-22 Février 2014, Vienna, Austria

Translational Cereal Genomics – Plant Transformation Technologies III –

Plant Gene Discovery & “Omics” Technologies – Applied Vegetable Genomics

1-2 avril 2014, Copenhagen, Denmark

European Biomass to power

22-25 avril 2014, Avignon, France

XVIIIth EUCARPIA Meeting of the Tomato Working Group

18-23 Mai 2014, Montpellier, France

4th International Symposium on Weeds and Invasive Plants

22-26 juin 2014, Dublin, Ireland

Plant Biology Europe FESPB/PSO 2014 Congress

18-20 août 2014, Brisbane, Australia

ProMUSA Symposium

31 août – 4 septembre 2014, Hamburg, Germany

1st INPPO World congress on Plant Proteomics: Methodology to Biology

26-29 août 2014, Montpellier, France

Phosphorus in soils and plants

1-2 septembre 2014, St. Louis, US

Plant genomic congress USA

12-14 octobre 2014, Lisbon, Portugal

Annual meeting European Seeds Association

GIS Biotechnologies Vertes c/o Genoplante Valor - 28 rue du Docteur Finlay - 75015 Paris - France Tél : +33 (0)1 42 75 95 83 - Fax : + 33(0)1 45 75 63 45.

Animation Scientifique du GIS BV Atelier Scientifique « New Breeding Techniques », 1er avril 2014

Le 1er avril 2014, le Département Biologie et Amélioration des Plantes de l’INRA, le GIS BV et l’Alliance AllEnvi

s’associeront pour organiser un Atelier Scientifique autour des « New Breeding Techniques ».

Le terme "New Breeding Techniques" englobe un

ensemble d'outils qui génèrent des plantes pour

lesquelles se posent des questions réglementaires au

niveau national et européen. Le terme a été repris dans

différents contextes, suscitant parfois un enthousiasme

quelque peu déconnecté de la réalité de certaines de ces

techniques.

Dans ce contexte, il semble important d'identifier

clairement les techniques concernées, d'évaluer leur

nouveauté et leur utilité pour la sélection végétale, de

préciser les verrous empêchant leur utilisation à grande

échelle, et d’identifier les fronts de recherche nécessaires

à leur évolution ou perfectionnement.

Les objectifs de cet atelier sont de (i) favoriser les échanges au sein de la communauté concernée, (ii) dresser

un état de l'art en France, en Europe et à l'international, (iii) animer une table ronde et faire émerger des

axes prioritaires de recherche. Pour accéder au programme et vous inscrire :

http://gisbiotechnologiesvertes.com/fr/?option=com_breezingforms&view=form&Itemid=360

Vous souhaitez nous faire part de votre intérêt pour un sujet, ou contribuer à la rédaction d’articles dans la lettre

d’information du GIS BV ? N’hésitez pas à nous contacter par mail : piovan@genoplante.com