Génétique

20
Génétique Génétique Analyse d’article Analyse d’article Investissement parental Investissement parental et et management d’une espèce de manchot menacée management d’une espèce de manchot menacée Baugnée Axelle Baugnée Axelle Lambrecht Lambrecht Carole Carole Maiti Estelle Maiti Estelle Rosier Anne- Rosier Anne- Sophie Sophie Travail du Travail du groupe : groupe :

description

Génétique . Investissement parental et management d’une espèce de manchot menacée. Analyse d’article. Travail du groupe :. Baugnée Axelle Lambrecht Carole Maiti Estelle Rosier Anne-Sophie. Manchot des Antipodes ( pingouins aux yeux jaunes). Classification Embranchement : Vertébrés - PowerPoint PPT Presentation

Transcript of Génétique

Page 1: Génétique

Génétique Génétique Analyse d’articleAnalyse d’article

Investissement parentalInvestissement parentaletet

management d’une espèce de manchot menacéemanagement d’une espèce de manchot menacée

Baugnée AxelleBaugnée AxelleLambrecht CaroleLambrecht CaroleMaiti EstelleMaiti EstelleRosier Anne-SophieRosier Anne-Sophie

Travail du groupe :Travail du groupe :

Page 2: Génétique

Manchot des AntipodesManchot des Antipodes((pingouins aux yeux jaunes)pingouins aux yeux jaunes)

ClassificationClassification• Embranchement : Embranchement : VertébrésVertébrés• Classe : Classe : OiseauxOiseaux• Ordre : Ordre : SphénisciformesSphénisciformes• Famille : Famille : SphéniscidésSphéniscidés• Genre et espèce : Genre et espèce : Megadyptes antipodesMegadyptes antipodes

Page 3: Génétique

Répartition géographiqueRépartition géographique• Iles Auckland Iles Auckland • Ile Campbell Ile Campbell • Nouvelle-Zélande : Ile Stewart Nouvelle-Zélande : Ile Stewart • Nouvelle-Zélande : Nouvelle-Zélande : Ile du Sud côte sud-est dont la péninsule

Otago

BiologieBiologie• taille animal : taille animal : 60-78cm60-78cm• Poids : Poids : 5-6 kg5-6 kg• Nourriture : Nourriture : poisson calamarpoisson calamar• Durée vie : Durée vie : 10 à 23 ans10 à 23 ans

Caractéristiques de l’espèceCaractéristiques de l’espèce• SolitaireSolitaire• TerritoriauxTerritoriaux• non migrateurnon migrateur

La mue 1x/anLa mue 1x/an• en février/marsen février/mars• Duré : Duré : 3-4sem3-4sem

Page 4: Génétique

La reproductionLa reproduction• Aout : début de la saison de reproductionAout : début de la saison de reproduction• Mi- septembre à mi-octobre :Mi- septembre à mi-octobre :

– AccouplementAccouplement– ponte 12 jours plus tardponte 12 jours plus tard– Incubation : Incubation : 39 à 51 jours39 à 51 jours

• Période de garde du poussin : Période de garde du poussin : 6 semaines6 semaines• Période de post-garde Période de post-garde • Mi-février :Mi-février :

– poussin autonome à : poussin autonome à : 106 jours106 jours – mue et quitte le nidmue et quitte le nid

• Maturité sexuelle :Maturité sexuelle :– femelle : femelle : 2-3 ans2-3 ans– Mâle : Mâle : 3-5ans 3-5ans

• Causes de divorce du coupleCauses de divorce du couple– mort du partenairemort du partenaire– échec de la reproductionéchec de la reproduction

Page 5: Génétique

Objectifs de l’étudeObjectifs de l’étudeEn 1992 on recense 5930-6970 individus : Espèce en voie de En 1992 on recense 5930-6970 individus : Espèce en voie de

disparitiondisparition

CausesCauses• Activités humainesActivités humaines• Introduction de nouveaux prédateursIntroduction de nouveaux prédateurs• Appauvrissement des ressources alimentairesAppauvrissement des ressources alimentaires• Caractéristique de l’espèce : maintiennent leur progéniture en vie Caractéristique de l’espèce : maintiennent leur progéniture en vie

au détriment de leur succès reproducteur et de leur vie au détriment de leur succès reproducteur et de leur vie

Page 6: Génétique

Méthodes utiliséesMéthodes utilisées

Péninsule Otago côte sud Est de la Nouvelle ZélandePéninsule Otago côte sud Est de la Nouvelle Zélande

• départ : départ : – mid section : MSmid section : MS– double bay : DBdouble bay : DB

• arrivée :arrivée :– Pipikaretu beachPipikaretu beach– Ryans beachRyans beach

4 aires d’études sur 3 saisons de reproduction : 1992 – 93 – 944 aires d’études sur 3 saisons de reproduction : 1992 – 93 – 94

Choix des aires Choix des aires d’étudesd’études

Page 7: Génétique

Etudes des animauxEtudes des animaux

1.1. Les adultes :Les adultes :• Identification des adultes de MS et DBIdentification des adultes de MS et DB

– bague en acier numérotée sur la nageoirebague en acier numérotée sur la nageoire• Détermination du sexeDétermination du sexe

– mesures morphologiquesmesures morphologiques– mise en présence d’un partenaire demise en présence d’un partenaire de

sexe connusexe connu– comportement durant la pontecomportement durant la ponte

• Pesée des adultes :Pesée des adultes :– 3 prises en 1992 et 19943 prises en 1992 et 1994

• IncubationIncubation• GardeGarde• post gardpost gard

– 2 prises en 19932 prises en 1993• IncubationIncubation• post gardepost garde

Page 8: Génétique

2.2. LesLes oisillonsoisillons• Identification individuelleIdentification individuelle

– à la naissance : couleur sur la nageoire ou peinture sur la à la naissance : couleur sur la nageoire ou peinture sur la griffegriffe

– à 14 jours : étiquette numérotée sur la patteà 14 jours : étiquette numérotée sur la patte– avant la première mue : bague sur la nageoireavant la première mue : bague sur la nageoire

• Pesée : le matin tous les 7 à 10 jrs de la naissance à la 1Pesée : le matin tous les 7 à 10 jrs de la naissance à la 1èreère mue mue• Mesure de la longueur du becMesure de la longueur du bec

Page 9: Génétique

Manipulation des couvéesManipulation des couvées

• But : comparer paramètres de reproduction pour les nids à un But : comparer paramètres de reproduction pour les nids à un poussin et à deux poussinspoussin et à deux poussins

RemarqueRemarque : seuls les couples qui ont déjà eu des poussins ayant atteint leur : seuls les couples qui ont déjà eu des poussins ayant atteint leur 11èreère mue sont pris en compte dans l’étude mue sont pris en compte dans l’étude

• Principe : transfert de poussin âgé de moins de 3 jrs à un couple Principe : transfert de poussin âgé de moins de 3 jrs à un couple adoption situé sur une autre aire de reproductionadoption situé sur une autre aire de reproduction

• Type de nids :Type de nids :– naturel 2 poussins = nid doublenaturel 2 poussins = nid double– naturel 1 poussin = nid simplenaturel 1 poussin = nid simple– artificiel 1 poussin = nid simple manipuléartificiel 1 poussin = nid simple manipulé

RemarqueRemarque : l’effet environnement est supprimé pour l’étude : l’effet environnement est supprimé pour l’étude

Page 10: Génétique

Résultats et conclusionsRésultats et conclusions

Étude de variance : présentationÉtude de variance : présentation• Variable :Variable :

– effet saison effet saison – effet couvée effet couvée

• AnalyseAnalyse– Anova 2Anova 2– Régression curviligneRégression curviligne

Page 11: Génétique

Effet de la saisonEffet de la saison• La ponte : La ponte : retard entre 1993-94retard entre 1993-94• Les paramètres de croissance : Les paramètres de croissance :

– Poids poussin Poids poussin – Longueur du culmenLongueur du culmen

• L’environnement :L’environnement : – Ressources alimentaires faibles en 1994 mortalité plus élevéeRessources alimentaires faibles en 1994 mortalité plus élevée

• Le poids des adultes :Le poids des adultes : évaluer pour chacune des 3 étapes de la reproductionévaluer pour chacune des 3 étapes de la reproduction

– Incubation: Incubation: femelles 1994<92-93femelles 1994<92-93– Garde : Garde : mâles et femelles 94<92mâles et femelles 94<92– Post garde : Post garde : entrée précoce en 1994entrée précoce en 1994

Conclusion :Conclusion : effet de la saison marqué : en 1994 appauvrissement des ressources effet de la saison marqué : en 1994 appauvrissement des ressources en nourritures durant 2moisen nourritures durant 2mois

Page 12: Génétique

Effet de la couvéeEffet de la couvée• Court terme : Court terme :

– Période de garde : meilleure maintenance des femelles pour couvée Période de garde : meilleure maintenance des femelles pour couvée uniqueunique

– Post garde : à terme car perte de poids femelle moins important Post garde : à terme car perte de poids femelle moins important • Long terme :Long terme :

– la mue pas repoussée en hiver meilleure survie des individusla mue pas repoussée en hiver meilleure survie des individus• Age au sevrage :Age au sevrage :

– Sevrage précoce pour les nids simplesSevrage précoce pour les nids simples• Divorce :Divorce :

– Pas d’effet significatifPas d’effet significatif

Page 13: Génétique

Proposition d’approche Proposition d’approche génétique (1)génétique (1)

Quels caractères utiliser pour estimer le taux de survie ?Quels caractères utiliser pour estimer le taux de survie ?

• Facteurs qui peuvent varierFacteurs qui peuvent varier– AnimalAnimal– Environnement Environnement

• Modèle génétique Modèle génétique

P=m+G+E (m=0)P=m+G+E (m=0) avec G=A+Anavec G=A+An E=Ep+EtE=Ep+Et

Page 14: Génétique

Animal Animal • Paramètres non additifs :Paramètres non additifs :

– pas transmis aux descendants (D+I)pas transmis aux descendants (D+I)

• Paramètres additifs : Paramètres additifs : – Adaptation aux changements environnementAdaptation aux changements environnement– Résistances aux maladiesRésistances aux maladies– Utilisation optimale des ressourcesUtilisation optimale des ressources

Page 15: Génétique

Environnement Environnement • Permanent :Permanent :

– Prédateurs Prédateurs – CongénèresCongénères

• Temporaire :Temporaire :– ClimatClimat– AlimentationAlimentation– Nombre de petitsNombre de petits

Page 16: Génétique

Proposition d’approche Proposition d’approche génétique (2)génétique (2)

Importance de la diversité génétiqueImportance de la diversité génétique• Départ de toute évolution et adaptationDépart de toute évolution et adaptation• Petite population : vortex d’extinctionPetite population : vortex d’extinction

Héritabilité Héritabilité • FaibleFaible• Modérée Modérée • ForteForte

Remarques Remarques • On ne peut pas choisir les couplesOn ne peut pas choisir les couples• Si catastrophe naturelle risque de disparition totale de la Si catastrophe naturelle risque de disparition totale de la

population sauvage : reste juste les animaux en zoopopulation sauvage : reste juste les animaux en zoo

Page 17: Génétique

Conclusion de l’approche Conclusion de l’approche génétiquegénétique

En tant que futur vétérinaire : En tant que futur vétérinaire : • Difficulté d’agir sur le terrainDifficulté d’agir sur le terrain• Elevage en semi-captivitéElevage en semi-captivité• Avec réinsertion dans la nature par Avec réinsertion dans la nature par

aprèsaprès

Page 18: Génétique

Critique Critique • Méthode utiliséeMéthode utilisée

1.1. Échantillonnage : Échantillonnage : – Taille insuffisanteTaille insuffisante– Cible mal adaptéeCible mal adaptée

2.2. Conditions expérimentalesConditions expérimentales– Alimentation Alimentation – Reproducteurs : pas de prise en compte des variations Reproducteurs : pas de prise en compte des variations

inter-couplesinter-couples

• Rédaction articleRédaction article1.1. Mise en page des résultats pas assez systématiqueMise en page des résultats pas assez systématique2.2. Données incomplètesDonnées incomplètes

Page 19: Génétique
Page 20: Génétique

BibliographieBibliographie• Adélie penguins: citizen of the frozen continent, New Zealand Geographic Adélie penguins: citizen of the frozen continent, New Zealand Geographic

n°57 (June 2002)n°57 (June 2002)• Detilleux J. , Génétique quantitative 1°doctorat, 2004-2005Detilleux J. , Génétique quantitative 1°doctorat, 2004-2005• Edge K.-A. and al. , Parental investment and the management of an Edge K.-A. and al. , Parental investment and the management of an

endangered penguin, Biological Conservation 88 (1999) p367-378endangered penguin, Biological Conservation 88 (1999) p367-378• Emperor Penguins, Australian Geographic n°20 (Oct-Dec 1990Emperor Penguins, Australian Geographic n°20 (Oct-Dec 1990• Fujiwara K., Encyclopedia of Spheniscidae – TBSFujiwara K., Encyclopedia of Spheniscidae – TBS• Houston, D. 1998. "Yellow Eyed Penguin" (On-line). Accessed March 14, 2001)Houston, D. 1998. "Yellow Eyed Penguin" (On-line). Accessed March 14, 2001)• Houston, D. 1998. "Yellow Eyed Penguin: population Status" (On-line). Houston, D. 1998. "Yellow Eyed Penguin: population Status" (On-line).

Accessed March 14, 2001Accessed March 14, 2001• Reilly P., Penguins of the World, OUP, Oxford, 1994.Reilly P., Penguins of the World, OUP, Oxford, 1994.• Rémy M., Guide des manchots - Delachaux et NiestléRémy M., Guide des manchots - Delachaux et Niestlé• Soper T., Antarctica - A Guide to the Wildlife (illustrations by Dafila Scott) - Soper T., Antarctica - A Guide to the Wildlife (illustrations by Dafila Scott) -

Coll. BradtColl. Bradt• Sparks J. and Soper T., Penguins, Facts on File Publications, Oxford, 1987.Sparks J. and Soper T., Penguins, Facts on File Publications, Oxford, 1987.• Stonehouse, . 1997. "Yellow Eyed" (On-line). Accessed February 12, 2001Stonehouse, . 1997. "Yellow Eyed" (On-line). Accessed February 12, 2001• Vernon, A. 1991. The Hoiho, New Zealand's Yellow-Eyed Penguin.. New York: Vernon, A. 1991. The Hoiho, New Zealand's Yellow-Eyed Penguin.. New York:

Putnam's Sons.Putnam's Sons.• Williams T.D., The Penguins, OUP, Oxford, 1995. Williams T.D., The Penguins, OUP, Oxford, 1995. • Vernon, A. 1991. The Hoiho, New Zealand's Yellow-Eyed Penguin.. New York: Vernon, A. 1991. The Hoiho, New Zealand's Yellow-Eyed Penguin.. New York:

Putnam's Sons.Putnam's Sons.• Yellow Eyed Penguin Trust, 1998. "Yellow Eyed Penguin" (On-line). Accessed Yellow Eyed Penguin Trust, 1998. "Yellow Eyed Penguin" (On-line). Accessed

March 14, 2001March 14, 2001