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3ème année Virologie
Picornaviridae
Entérovirus, hépatovirus (VHA) et Parechovirus.
Structure virions : 20-30 nm diamètre. ARNmc, linéaire, non segmenté, ARN+. Capside icosaédrique, non enveloppés.
EntérovirusPoliovirus
Epidémio Trois sérotype. Épidémio : réservoir humain. Élimination salive et selles. Féco-oral. Mondiale. Saisonnier. Vaccin obligatoire.
Physiopat
- Phase alimentaire où le virus se multiplie niveau muqueuse pharyngé et muqueuse intestinal. (IgA sécrétoires)
- Phase lymphatique où le virus se multiplie dans ganglion et provoque Ac. Si marche élimination.
- 10% passage sang (Phase virémique), si neutralisé alors forme atténué. 2% SNC pour poliomyélite.
CliniqueForme spinale classiqueIncubation 2-3 semaines.Phase d'invasion ou pré-paralytique (4-5jours), déjà SNC. Phase d'état ou paralytique brutal (flasque). Évolution lente (2-3semaines). Récupération possible, incomplète.
Diagnostic Examen LCR. Diagnostic viro direct (PCR du génome), indirecte (sérologie), ttt symptomatique (pas d'antiviraux). Déclaration obligatoire, vaccination obligatoire
VaccinVaccin inactivé ou tué : composé de trois types. Ac dans le sang seulement. Cher.Vaccin atténué (pas france) : trois types vivant sans neurovirulence. CI : ID et enceinte.
Coxsackievirus et Echovirus
Physio-patho
Phase alimentaire où le virus se multiplie niveau muqueuse pharyngé et muqueuse intestinal.Phase lymphatique où le virus se multiplie dans ganglion et provoque Ac. Si marche élimination.Phase virémique : sang vers tissus, organes. Selon sérotype partout.
Clinique
Atteinte SNC PoliomyéliteEncéphaliteméningite lymphocytaire
PoliovirusEchovirus, Coxsackievirusles trois
Manif cutanéo-muqueuse
Herpangine (vésicule)Syndrome main pied boucheexanthème fébrileexanthème de boston
Coxsackievirus ACoxsackievirus A16Echovirus, Cox A B, polioechovirus 16
Manif musculaire Myalgie épidémique Bornholm Coxsackievirus B
Atteinte cardiaque Myocardite et péricardite Coxsackievirus B
Atteinte respiratoire Rhinopharyngite bronchite et pneumonieBronchiolite
Échovirus, Coxsackievirus A et B.entérovirus 68
Atteinte hépatique Hépatite Coxsackievirus B
Manif oculaire Conjonctivite aiguë hémorragique. Entérovirus 70, Coxsackievirus A24.
Vaccin pas de vaccin.
Rhinovirus humain.Rhume ++ Incubation rapide (1-3J), puis éternuement, rhinorhée, malaise. Parfois autres localisation.Évolution favorable 2-5J. Cependant complication respiratoire enfant ou surinfection possible. Pas vaccin.
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3ème année Virologie
Togaviridae
Rubivirus rubeolaeVirus de la Rubéole
Structure virion
ARNmc +, monosegmenté, linéaire. Capside icosaédrique. Enveloppe. 60-70nm. Un seul type antigénique =>vaccin. Ag d'importance : hémagglutinine (HA) immunogène.
Épidémio
Réservoir humain. Transmission directe et aérienne. 8J avant et 8J après éruption (contagiosité pdt 16j). Mondial, saisonnier, endémique. Ac anti-rubéole=immunité durable.
Pouvoir pathogène
- Primo-infection Se multiplie dans muqueuse respiratoire et ganglion cervicaux, puis sang pour virémie. Donne infection généralisé dans la plus part des organes. Synthèse d’Ac, réponse immune.Classique : incubation 16J, durée 4j. Adénopathie cervicale, fièvre modérée, absence catarrhe oculo-nasal, éruption élément maculeux rose pale petit, espacés. Tache papule vésicule bulle.Existe inapparente ou sans éruption ou morbilliforme.Complication : arthralgie, encéphalite, thrombopénie.
- Rubéole congénital Dans les 3 premiers mois. Si primo-infection maternelle. Nécrose, inhibition mitose, phénomènes auto-immuns, apoptose.Mort in utero ou embryopathie : œil, oreille, cœur, snc ; foetotoxicité infection persistante, excrétion virus grorge, urine, larmes = contagiosité+++
Attention à primo-infection de la femme enceinte.
Diagnostic labo
- Direct : génome par PCR sur amniotique (17SA) ou sang (22SA).- Indirect : Ac. IgM puis IgG. Titrage par ELISA<15UI/ml : doit être vacciner
avant grossesse.Ac apparaissent 15J après contagion, résiduel plateau. Réinfection IgG en 7-11J. Recherche IgM par immunocapture, et test d'avidité des IgG. IgA présent pour primo-infection.
Traitement Aucun.
ProphylaxieVaccin trivalent (rougeole oreillon rubéole). SC. Éviter grossesse dans les 2 mois après vaccination. CI : ID, grossesse.
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3ème année Virologie
Parvoviridae
Erythovirus B19 (=Parvovirus B19)
Structure ADN mc, linaire, un segment. Capside icosaédrique. Nu.
Épidémio Homme, direct aérienne, transplacentaire ou sanguine. Mondiale. Endémique. Fin hiver. (10 % chez <5ans et 70 % chez >60ans)
Pouvoir pathogène
Virus inhalé → migration vers précurseur érythroïde de la moelle osseuse → virémie → synthèse Ac-> réaction Ac-Ag formant complexe immun = l'éruption et arthralgie
Clinique
Mégalérythème : 1semaine incubation avec fièvre, céphalées et douleur musculaire puis 2semaines d'éruptions maculopapuleuses en aile de papillon.Évolution favorableErythroblastopenie aiguë ou chronique: chez ceux déjà anomalie GR ou les ID.Infection in utero si primo infection de la mère, mort fœtus si pas de tansfusion
Diagnostic Direct par PCR. Indirect recherche IgM et IgG anti-virus B19
TraitementPas spécifique. Pour fœtal : exsanguino-transfusion. Pour adulte transfusion. Pas vaccin.
C oronaviridae
Structure ARN monocaténaire, +, capside héliocoïdale, enveloppe.Clinique Respiratoire, digestif, SNC. Rhinite, pharyngite, bronchiolite. GE.Traitement Juste hygiène.
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3ème année Virologie
Orthomyxoviridae
Influenza A B C. Affinité pour muco-protéine.
Structure type A : 8segments, ARNmc -. Capside hélicoïdale. Enveloppe (M1, M2, glycoprotéines)
Propriétés Ag :Ag de l'enveloppe : HA (hemagglutinine) et NA (neuraminidase). Spécifique des sous type.
Segment Protéine codée Localisation Fonction
1 PB2
En relation avec ARNComplexe transcriptase/
polymérase2 PB1
3 PA
4 HA Glycoprot d'enveloppe Hémagglutinine
5 NP Capside Rôle dans réplication
6 NA Glycoprot d'enveloppe Neuraminidase
7 M1 et M2 Couche interne enveloppeProtéine de matriceDiverse interaction
8 NS1 et NS2 Prot non structurale Rôle dans multiplication
Modifications majeures : sauts antigéniques : cassures antigéniques
(pandémie)
Modifications mineures : glissements antigéniques : dérives
progressives (chaque année)
Type concerné A A et B
Mécanisme1) réassortiment de gène entre souche2) transmission direct homme-animal.
Mutation ponctuelle
Conséquence taxonomique
Emergence de nouveaux sous-types AÉmergence de nouveaux variants
A et B
Conséquence immunitaire
Absence d’immunité croisée entre 2sous-types A
Immunité croisée partielle entre 2 variants consécutifs
Conséquence épidémio Pandémie tous les 10-30ans Épidémie tous les ans
Conséquence vaccinal Péremption du vaccin Vaccin encore valide
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3ème année Virologie
Multiplication
1) Adsorption/fixation de l’hémagglutinine sur les récepteurs cellulaires = acide sialique2) Pénétration par endocytose → formation d’un endosome3) Fusion entre enveloppe virale et membrane de l'endosome, dû à un abaissement du pH, entraînant un changement de conformation de l' hémagglutinine→ Libération des ribonucléoprotéines (RNP)4) Migration des 8 fragments d'ARNv vers le noyau5) Réplication des différents fragments d'ARN par action du complexe polymérase (PB1, PB2, PA)6) Transcription de chaque fragment en ARNm (+)→migration vers le cytoplasme7) Traduction en protéines sur les ribosomes de la cellule8) Insertion de l’ hémagglutinine et neuraminidase dans la membrane plasmique9) Formation des NC dans le noyau10) Migration vers le cytoplasme11) Assemblage et formation du bourgeon avec pénétration des NC dans le bourgeon12) Libération des virions par action de la neuraminidase
Épidémio Transmission direct, aérienne et indirecte. Automne hivers. Enfant.
PhysiopathoPénétration inhalation. Multiplication dans muqueuse respiratoire cilié : nécrose et hypersécrétion, entraînant surinfections bactériennes.
Clinique
- Forme typique : incubation 1-2J, brutal avec fièvre céphalée courbature, irritation conjonctive laryngo et bronchique. Dure 3-4J. Guérie en 3-5J possible asthénie résiduelle.
- Complication du virus lui même, pneumonie grippale primitive (œdème), neuro, du à surinfection.
- Immunité dure 1an. Ac dans muqueuse respiratoire
TraitementSymptomatique + complications bactériennesAntivirale : anti-neuraminidase (Oseltramivir, Zanamavir)
Prophylaxie Oseltamivir+++, amantadine : sujets non vaccinés à riqueVaccin Vaccination inactivé
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3ème année Virologie
Paramyxoviridae
Para-influenza (FHN), oreillons (FHN), VRS (F), rougeole (FH).
Structure : Enveloppe (F : facteur de fusion, H : hémagglutinine, N : neuraminidase), capside hélicoïdale, ARNmc -, linéaire monosegmenté
Parainfluenza : Tractus respiratoire, souvent chez nourrisson et enfant. Ni chimio ni vaccin.
OreillonsRubulavirus
Epidémio Homme, salive, contagiosité de 6J avant à 10j après, immunité durable.
PhysiopathoPénétration salive et rhinopharyngé, multiplication cell rhinopharynx et ganglions locaux. Virémie. Dissémination glande salivaire, méninge et autres système glandulaire : tropisme glandulaire et neurotropisme. Excrétion virus salive- urine.
Clinique Inapparente 1/3. Incubation 3 semaines, fièvre modéré, parotidite.Autres localisations : méningite, orchite, ovarite, pancréatite, hépatite, thyroïdite.
Traitement Pas de ttt.Prophylaxie par vaccin à virus vivant atténué sauf enceinte et ID
Rougeole ou virus morbilleuxMorbillivirus
Epidémio Enveloppe avec F H pas N.Mondial, humain, transmission direct ou sécrétion rhino et oculaire. Contagieux 4jours avant, 2 après.
Physio-patho
Pénétration aérienne, multiplication muqueuse respiratoire et conjonctivale, système lymphoïde, virémie, leucocyte (leucopénie), invasion tissus (endothélium vasculaire et tégument).
Clinique
Incubation 10-12J. Invasion marquée par catarrhe oculo-nasale, toux, fièvre élevé, exanthème et énanthème (signe de Köplick)Guéri en 8J.Complication respiratoire (ou surinfection), otites, nerveuse, kératite.Pan encéphalite sclérosante subaiguë. Mortel, 1/1Mo. Sept ans après rougeole.
Traitement Pas ttt. Prophylaxie : Ig standard. Vaccin à virus vivant atténué
Virus respiratoire Syncytial (VRS)Pneumovirus
Epidémio Très résistant et très contagieux. Mondial.Clinique Bronchiolite du nourrisson, pneumonie et bronchite chez enfant, syndrome grippaux.
Diagnostic Ag ou génome par PCR dans sécrétion respiratoire.
TraitementTtt : symptomatique, ribavirine pour sévère. Prévention Ag=palivizumab. Vaccin en développement.
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3ème année Virologie
Rhabdoviridae
Virus de la Rage
Epidémio
Méningo-encéphalite des mammifèresARCmc non segmenté, linéaire, -Capside hélicoïdale, protéine N. Enveloppé en forme d’obus. Porte glycoprotéine G à propriété H.
Physiopatho
Transmission par morsure, griffure ou léchage et manipulation d'objets souillés. Multiplication au point d’inoculation dans les cellules musculaires striées pendant 3j. Place pour sérovaccination d’urgence.Puis point de non retour.Phase centripète : cheminement le long des nerfs, arrivé SNC. Multiplication dans neurones, corps de Négri.Phase centrifuge : diffusion le long des nerfs. Glande salivaire, papille de la langue, rétine, cornée.
Clinique
Incubation à durée variable - Phase début : fièvre légère, hyperesthésie.- Phase d’état : encéphalite forme spastique ou furieuse : 41°, hallucination,
contracture. Hydrophobie, aérophobie, modification voix, écoulement salive, trouble conscience, coma, mort 2-10J.Encéphalite forme paralytique : paralysie flasque ascendante avec évolution plus lente.
Traitement Pas efficace quand déclarée. Uniquement Préventif : Désinfecté plaie et Injecter Ig antiarabique avant 3jours!! Vaccin curatif inactivé en 3 injections.Prophylaxie : vaccin préventif, et animaux domestique et renard.
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3ème année Virologie
Adenoviridae
Epidémio ADN bicaténaire, capside icosaédrique, nu.Direct ou indirect sécrétion respiratoire, féco-oral, matériel ophtalmo pour chaque infection.
PhysiopathoPénétration aérienne, multiplication gorge, voie respiratoire, œil, TD. Affinité pour tissu lymphoïde.
Clinique
A : intestinal asymptotique de l’enfantB : épidémie, pharyngite, pneumonie (20%) ; épidémie d’infection respiratoire ; cystite hémorragique et infection rénale, asymptotique.C : 50%. Endémique enfant. Adénopharyngite, adénite mésentérique, infection latente du tissu lymphoïde.D : épidémie de kératoconjonctivite. Asymptotique.E : rare, respiratoire.F : Gastro-entérite enfant.G : Gastro-entérite
Traitement symptomatique
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3ème année Virologie
Herpersviridae
ADN bicaténaire, linéaire. Capside icosaédrique. Enveloppé. 120-200nm. Virus humain.
Multiplication intracellulaire Phase d’initiation de l’infection : adsorption sur récepteur. Fusion enveloppe. Décapsidation.Phase d’éclipse de synthèse : ADNv synthèse prot et propre réplication.Phase d’assemblage, maturation, libération par lyse.ADN polymérase ADN dépendante d’origine virale.
HSV
Epidémio Alphaherpesvirinae, simplex virus. 1 labial, 2 génital. HHV1 et 2.Humain, transmission direct. 1 par salive, 2 IST.
Physiopatho
- Primo-infection Pénétration par muqueuse respective. Multiplication dans cellules épithéliales des muqueuses. Lyse formant vésicule riche en virus. Pénétration dans fibres sensitives proches : neurone centripète. Localisation dans ganglion nerveux régionaux (Gasser ou sacré).
- Latence : État latent dans neurone. ADN épisomal présent mais pas intégré. Ni réplication, ni expression mais transcription ARNv.
- Réactivation : Lésion vésiculaire de la primo infection. Fréquence variable.
Clinique
- HHV1 : gingivo-stomatite de l’enfant, éruption muqueuse, douleur, fièvre, adénopathie cervicale. 90% inapparente. Réactivation : bouton de fièvre, par fièvre soleil règle fatigue stress.
- HHV2 : éruption vésiculeuse sur organe externe, lésion douleur avec fièvre et adénopathie inguinale. Réactivation : symptôme moins fort, excrétion intermittente de virus.
Manifestations Graves : - HHV1 : Kératite herpétique (conjonctivite voir cornée, vers cécité).
Encéphalite herpétique (convulsion, trouble, paralysie, coma, mortel 70% ou sequelle). ID : lésion extensive, localisation viscéral mortel.
- HHV2 : Herpès neonatal 3/100k. Fièvre et localisation généralisé. Favorable si œil peau bouche.
Diagnostic Direct par PCR, indirect par IgM IgG.
Traitement Ttt existe, aciclovir, valaciclovir. Pour formes resistantes : foscarnet, ganciclovir. Vaccin en développement.
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3ème année VirologieVZV varicelle
Epidémio
Alphaherpesvirinae, varicellovirus. HHV3Mondiale, humain. Direct par salive ou contact lésion. Varicelle Primo-infection. Zona = réactivation.Contagieux 2/3J avant, 5J après.
Physipatho
Primo-infection : pénétration aérienne, multiplication tractus respiratoire supérieur, ganglion lymphatique, virémie. Par vague successive multiplication dans organe cible (cell épiderme formant vésicule), cheminement le long des nerfs.Phase de latence dans ganglion nerveux ; racine postérieur du nerf rachidien ou ganglion sensitif du nerf crânien. Multiplication du virus et cheminement le long des nerfs.Récurrence (zona) : atteinte de la peau, réaction inflammatoire de la racine du nerf concerné : douleur intense et éruption de vésicule sur la peau.
Clinique
- Typique de l’enfant : incubation 2weeks, fièvre 2J, éruption vésiculeuse d’abord tête puis face puis tronc puis membre. Macule, papule, vésicule puis croûte sans trace aux 8ème J. Par poussée.
- Complication : surinfection de grattage. Pneumonie +/- hépatite (mort 10%), encéphalite (rare).
- Enceinte : varicelle grave mère. Si <20ème risque faible, si après : mort 20%.- ID : varicelle hémorragique, infection disséminée (pneumopathie, hépatite,
pancréatite, encéphalite. - Zona : Typique maladie douloureuse, adénopathie et douleur intense, éruption,
douleur persistante, évolution en 15J avec croûte qui tombe.- Complication : kératite, algie post zostérienne, dissémination viscéral chez ID. Pas
de risque fœtal.Diagnostic Direct par isolement cell et PCR.
Indirect par détection et quantification des IgM et IgG spécifique.Prophylaxie vaccin atténué.
TraitementSymptomatique. Spécifique par (val)aciclovir, ID ou IC mais grave chez F.enceinte et nouveau né. Foscarnet ou ganciclovir si résistance.
Cytomegalovirs CMV
Epidémio Betaherpesvirinae, cytomegalovirus. HHV5Humain, mondial surtout défavorable. Direct par salive urine, sécrétion génitale, lait, larme, sang, transplacentaire. Mais pas indirect car fragile.
Physioatho
- Primo-infection : Pénétration, dissémination sanguine vers Rein, glande salivaire, moelle osseuse, poumon, foie, snc, dig, peau, et dans les cell macrophagique, LT LB, endothélium vasc.
- Latence : persistance dans LB LT, macrophage, cell réticulo-endothéliale, cell epith glandulaire.
- Réactivation : asymptomatique mais virémie et excrétion. Symptomatique chez ID.
Clinique
- Primo-infection : asymptomatique souvent si vieux possible éruption, fièvre prolongé, syndrome mononucléosique mais sans angine. Complication poumon hépatite, anémie hémolytique et thrombopénie, encéphalite.
- Congénital : 95% non détection dont 15% anomalie tardive. 5% symptomatique dont 15% tardive, 80% infection localisé, 5% maladie inclusion cytomégalique.
- ID : primo infection : fièvre prolongé, pneumopathie, hépatite, glomérulonéphrite, colite, encéphalite, rejet d’organe.
DiagnosticDirect : PCR génique, isolement des cell.Indicrect : détection IgM anti CMV et quantification par immunocapture des IgG anti CMV par Elisa.
Traitement (Val)Ganciclovir, foscarnet, cidofovir.
ProphylaxieChoix donneur/receveur. Valaciclovir ou valganciclovir. Ig riche en Ac antiCMV au transplanté. Vaccin en dev.
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3ème année Virologie
Autre betaherpesvirusHHV6 et HHV7.
Virus Epstein-Barr EBV.
Epidémio HHV4. Gammaherpesvirinae, Lymphocryptovirus.Humain (95% adulte). Interhumaine salive, transplacentaire, baisé, sang.
PhysiopathoPrimo infection, Multiplication oropharynx, infection LB circulant immortalisant et prolifération, latence dans cell epith oropharynx et LB. Réactivation et multiplication salivaire.
CliniquePrimo infection : MNI. Incubation 20-60J. fièvre, angine, adénopathie et splénomégalie, parfois éruption, guérie en 2-3 semaines mais asthénie résistante. Nombreuses Pathologies associées.
DiagnosticPrimo infection par clinique et hématologie, biochimique et viro (IgM anti VCA). Parfois ancienne par IgG anti VCA ou anti EBNA. PCR pour pathologie associé.
Traitement MNI par spécifique. Lymphome par rituximab (contre CD20).Prophylaxie vaccin en développement
HHV8 : agent du sarcome de kaposi endémique chez ID, associé au lymphome des séreuses et à la maladie de Castelman multicentrique.
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3ème année Virologie
Papillomaviridae
Alphapapillomavirus, Beta ... Zeta, 30 genres et 120 espèces.ADN bc, circulaire, torsadé. Capside icosaédrique, nu, 55nm.
Epidémio
- TransmissionRéservoir humain. IST. Femme surtout. 6% 18-35ans sont porteuses.Installation cancer invasif. Intégration du génome viral, expression gène, immortalisation.Initiation, promotion, progression.
- Soit régression des lésions spontanées ou ttt, soit persistance dans l’épithélium sans lésion ou cancer.
Physipatho
Microtraumatisme entrainant pénétration. Cell germinal de la couche basale de l’épithélium, multiplication. Cell différenciées au niveau du noyau, formation d’une verrue ou d’un condylome (végétation), par hypertrophie des papilles dermiques ou par hyperplasie des différentes couches cell de l’épithélium.
Clinique
- Tumeur bénigne de la peau et des muqueuses. Verrue, papillome oraux, condylome ano-génitaux (acuminé ou plan).
- Cancer ORL. Type 16.- Cancer génitaux Type 16 et 18.
DiagnosticPrélèvement (frotti ou biopsie). Examen cytologie du frotti. Efficace, détection lésion précoce, présence koïlocyste. PCR, hybridation moléculaire. Génotypage par PCR ou séquençage. 16 18 ou 33.
TraitementCondylome par topique, cryothérapie, laser.Neoplasie intra épithéliale du col : laser et suivi.Carcinome invasif du col : chirurgie.
ProphylaxieVaccin et suivi. Gardasil ou cervarix.
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