Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect...

66
République Algérienne Démocratique et Populaire Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique Université de Larbi Tébessi-Tébessa- Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie Département : Biologie Appliquée MEMOIRE DE MASTER Domaine: Science de la nature et de la vie Filière: Sciences biologiques Option : Microbiologie appliquée à la santé et à l’environnement Thème Présenté par Badri Ghalia Tahri Nabila Devant le jury Président : Dr MECHAI Abdelbasset (MCA) Université de Tébessa Rappoteur : Dr BOUKOUCHA Mourad (MCB) Université de Tébessa Examinateur: Mr MENASRIA Taha (MAA) Université de Tébessa Date de soutenance: 29/05/2016 Note : Mention : Aspect bactériologique des infections du pied diabétique

Transcript of Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect...

Page 1: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

République Algérienne Démocratique et Populaire

Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche Scientifique

Université de Larbi Tébessi-Tébessa- Faculté des Sciences Exactes et des Sciences de la Nature et de la Vie

Département : Biologie Appliquée

MEMOIRE DE MASTER Domaine: Science de la nature et de la vie

Filière: Sciences biologiques

Option : Microbiologie appliquée à la santé et à l’environnement

Thème

Présenté par

Badri Ghalia

Tahri Nabila

Devant le jury

Président : Dr MECHAI Abdelbasset (MCA) Université de Tébessa

Rappoteur : Dr BOUKOUCHA Mourad (MCB) Université de Tébessa

Examinateur: Mr MENASRIA Taha (MAA) Université de Tébessa

Date de soutenance: 29/05/2016

Note : Mention :

Aspect bactériologique des infections du pied diabétique

Page 2: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

ملخص

والتي ، ولھا مضاعفات خطیرة على مرضى السكري، تعد القدم السكریة مشكلة حقیقة على الصحة العامة

،كون بمثابة مقر عدوى بكتیریةت ھذه الحالة أضعفھا االعتالل العصبي وأمراض األوعیة الدمویة و قد، أصبحت أكثر تزایدا

ترشد العالج بالمضادات الحیویة عن طریق دراسة علم األحیاء وینبغي أن یس. وھذا یتطلب استجابة متعددة التخصصات

ومن ھذا المنطلق اقترح موضوع دراستنا وكان الھدف منھ ھو تقییم تنوع البكتیریا المسؤولة عن ھذا المرض . الدقیقة

على مستوى یخضع للعالج ( مریض من منطقة تبسة 25وقد تم أخذ عینات ل .ودراسة حساسیتھا للمضادات الحیویة

ھذه العینات جمعت عن طریق المسح، )المستشفى بسبب القدم السكریة و یعاني من جروح سطحیة وعمیقة نوعا ما

)(Ecouvillonnage نتائج الفحص المجھري ، و دراسة الخصائص . 2016واستغرقت دراستنا ثالثة أشھر لعام

15، تلیھا )٪48.83(ساللة les Staphylococcus spp 24 ة في ساللة بكتیریة و المتمثل 43الكیمیائیة ، بینت وجود

دراسة قابلیة مقاومة المضادات .Pseudomonas aéruginosa (%16,27)و )Entérobactéries )34.88٪ ساللة

,les staphylocoques (15profils)الحیویة كشفت عن وجود العدید من التشكیالت المقاومة

entérobactéries(18profils) les مقاومة، وھذه المقاومة أثرت في كل الطبقات وبمدى مختلف Staphylococcus

spp توبرامیسین ). ٪50(، كانامایسین )٪58.33(، الكلیندامیسین )٪66.66(لالریثرومیسین و حمض الفوسیدیك

مقاومة les entérobactéries، )٪4.16( ، سیبروفلوكساسین )٪12.5(، أمیكاسین )٪29.16(، بیفلوكساسین )20.83٪(

،االسید نلدكسیك )٪77.27(، حمض االموكسسلین أسید كلوفانیك)٪81.81(، كانامایسین (%100)أموكسسلین

سیبروفلوكساسین ، )٪45.45(بیفلوكساسین ، )٪(54.54سیفوكسیتین، ) ٪59.09(سیفوتكسیم،)72.72٪(

Pseudomonas aéruginosaاوأخیر) ٪9.09(فوسفومیسین، )٪18.18(أمیكاسین، )٪22.72(وتوبرامیسین

)٪71.42(اظھرمقاومة ملحوظة مع امیبینام

.المضادات الحیویة،القدم السكریة،عفن :الكلمات المفتاحیة

Page 3: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Abstract Diabetic foot presents a real public health problem and a serious complication of the

diabetic population that is becoming increasingly large. Such weakened localization by

neuropathies and vascular involvement may serve as an entry point a bacterial infection,

which can exacerbated the vital prognosis and requires a multi health-response with antibiotic

therapy guided by a valid microbiological study. In this regard, our work was carried out to

assess the frequency of the bacteria responsible of this infection and to appreciate their

evolution of antibiotic susceptibility. Twenty-five hospitalized patients from Tebessa with a

diabetic foot, presenting superficial and moderately deep lesions were examined (swabbing)

over a three month in 2016. The results of direct examination, culturing and biochemical

characterization, showed that among 43 isolated strains, Staphylococcus spp. have occupied

the first rank with 24 isolates (48.83%), followed by enterobacteria (15 isolates, 34.88%) and

Pseudomonas aeruginoasa with only seven isolates (16.27%). The antibiotic susceptibility

revealed a variety of resistance profiles for staphylococci (15 profiles) and enterobacteria (11

profiles) affected all antibiotic classes with varying extent. Staphylococcus spp resistance to

erythromycin and fusidic Acid affects (66.66%) of isolates, Clindamycin (58.33%),

Kanamycin (50%), Tobramycin (20.83%), Pefloxacin (29,16%), Amikacin (12.5%) and

Ciprofloxacin (4.16%). For the enterobacteria, resistance affected the Amxicilline (100%),

Kanamycin (81.81%), Amoxicillin Clavulanic Acid (77.27%), nalidixic acid (72.72%),

Cifotaxime (59.09%), Cefoxitin (54.54%), Pefloxacin (45.45%), Ciprofloxacin/Tobramycin

(22.72%), amikacin (18.18%) the Fosfomycin (9.09%). Finally, for Pseudomenas aeruginosa

the results had showed a remarkable resistance to Imipinem (71.42%).

Keywords: Infection, Diabetic Foot, Antibiotics.

Page 4: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résumé

Le pied diabétique est un véritable problème de santé publique, une complication

redoutable de la population des diabétiques qui devienne de plus en pulse nombreuse, Cette

localisation fragilisée par les neuropathies et les atteintes vasculaires peut servir comme siège

d’une infection bactérienne, qui peut aggraver le pronostic vital et nécessite une intervention

multidisciplinaire. L’antibiothérapie doit être guidée par une étude microbiologique valide.

Dans ce sens, notre travail a été proposé et a eu pour objectif ; d’évaluer la fréquence des

bactéries responsables de cette infection et d’apprécier l’évolution de la sensibilité aux

antibiotiques. Vingt Cinq patients de la région de Tébessa admis à l’hôpital pour pied

diabétique, présentant des lésions superficielles et moyennement profondes, ont été prélevés

par écouvillonnage pendant une période de trois mois en 2016. Les résultats de l’examen

direct, la mise en culture et la caractérisation biochimique, ont montré que parmi les 43

souches bactériennes isolées les Staphylococcus spp. Ont occupés le premier rang [24 souches

(48,83%)], suivie par les Entérobactéries [15 souches (34,88%) ]et enfin Pseudomonas

aeruginosa [ 7souches (16,27%)]. L’étude de la sensibilité aux antibiotiques a révélé une

multitude de profils de résistance pour les staphylocoques (15profils), les entérobactéries

(18profils), la résistance a touchée toute les classes avec ampleur variable, la résistance de

Staphylococcus spp .à l’Erythromycine et Acide fusidique (66,66%), Clindamycine (58,33%),

Kanamycine (50%) , Tobramycine (20,83%), Pefloxacine (29,16%), Amikacine (12,5%),

Ciproflaxine (4,16%), pour les entérobactéries la résistance a touchée l'Amoxicilline (100%),

Kanamycine (81,81%), Amoxicilline +Acide Clavulanique (77,27%),

Acidenalidixique(72,72%), Cifotaxime (59,09%), Céfoxitine (54,54%), Pefloxacine

(45,45%), Ciproflaxine et Tobramycine (22,72%), Amikacine (18,18%), Fosfomycine

(9,09%). Enfin pour Pseudomenas aérugenosa une résistance remarquable a été observée vis-

à-vis de l’imipinem (71,42%).

Mots clés: Infection, Pied diabétique, Antibiotiques.

Page 5: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Dédicace

.

Je remercier tout d’abord ‘Dieu ‘qui nous donné la force et

la foi pour élaboré ce travaille.

Je dédis ce modeste travaille au personnelles, les plus chère

au monde qui m’ont entouré d’amour, d’affection et de

tendresse, A la belle rose et coronaire de ma vie ‘EL

GHALIA’, ma mère qui a toujours veillé a mon bien être

et mon confort.

Au secret de mon existence de meilleur père et à très chère

frère Haroun et Moussa.

A mes chère sœurs : Zina, Nasira, Fatma-Zohra, Rabiaa,

Samira, Alia, Samahe, Sawsine. Et spécialement à la petite

Enfant : Feulla, Hadjer, Yaakoube, Liwa, Raide, Ridha ,

Chohoba, chahoda, Idriss, choaibe, Anfola, kanoza,

Omaima, Elwardi, Yazide.

A ma chère sœur pendant les années universitaire,

Kaouther

A ma fidèle amis : Nabila

A mes amies : Asma, widad, Nawal, Takwa, Abir, Ahlame,

Selaf, Ibtisame, Fatima, zoubaida, Nesrine, Zahra,…Et a

tout les étudients de la Microbiologie en spéciale et en

générale a tout les étudients et les professeurs de la

biologie.

Et en fin a tout les familles Badri en bir-el-Ater.

Page 6: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10
Page 7: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Dédicace

D’abord et toujours je remercie le bon Dieu tout puissant, qui m’a donné la

force et la patience de mener ce travail à bien. La Réalisation de ce travail ne saurait être considérée comme le fruit d’un

effort individuel, tout au contraire ce travail est la résultante d’un ensemble conjugué d’apports humains. Je dédie ce travail à :

A MA MERE, la perle de mon cœur l’être le plus chère au monde, l’unique femme que je remercie au fond du cœur ; c’est la principale raisons de mes

réussites MON PERE, l’homme le plus cher du monde

Je dédie spécialement ce travail à Ma GRANDE MERE Et à Mon GRAND PERE que je souhaite la langue vie

Dédicace particulier à mon oncle IBRAHIM qui m’a toujours aidé et qui a sacrifier beaucoup de son temps au cours des années précédentes

À mon cher oncle EL HACHEMI qui m’a toujours aidé avec ces précieux conseils

À mon cher frère KAMEL l’être la plus proche à mon cœur qui m’a donnée le courage

À mon trop chère frère l’être la plus fidèle AKRAM «BAZBOUZA » À mes chères sœurs que j’aime beaucoup KHAOULA, WIDED je remercie

pour leur accueil chaleureux et leur sympathie Je remercie sincèrement :

À mes tantes : KHADRA, NAWA, OUM ELKHIRE, FATMA A mes oncles : HOUSSINE,SALEH, OMOR, ABDALWAHEB

J’adresse mes remerciements également à : WARIDA, DJAMILA, RADIA, YASMINA

LES petites enfants : LINA, SALSABIL, CHOUAIB, INAS, LOUDJAINE À la mémoire de mon cousin KAMEL et mon oncle ABDRRAHMENE que je

ne l’oublierai jamais A tout qui porte le nom de la famille TAHRI, je ne citerai pas de noms ici

pour ne pas en oublier certains À mes copines la plus fidèles qui partager avec moi les plus beaux souvenirs

au cours des années précédentes Asma, Ghalia, Kaouther A Mes Amies Fidèles: Nadia, Nesrine, Zoubaida, Kaouther , Chahra, Alai

À mes collèges de la promotion MASTER II MICROBIOLOGIE APPLIQUE

2016 À tous ceux que j’aime

NABILA

.

Page 8: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10
Page 9: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Remerciement

Nous tenons à exprimer notre remerciement et notre profonde gratitude avant tout

à " Dieu" le tout puissant de nous avoir guidé durant toutes les années et permis de

réaliser ce mémoire en donnant la force, le courage et la volonté.

Nous voulons exprimer nos sincères remerciements et notre grand respect

à notre encadreur Le Dr. Boukoucha Mourad.

Pour avoir accepté de diriger ce travail, et pour ces précieux conseils, son suivie, et

son assistance durant toute la préparation de ce mémoire.

Nos remerciement aussi chaleureusement l’ensemble des membres de jury de ce

mémoire :

Dr. Mechai Abdel basset ,A l’honneur que vous nous faites en acceptant de présider

le jury de notre mémoire et pour nous l’occasion de vous témoigner notre profonde

reconnaissance pour vos qualités humaine.

Mes remerciements vont également Mr .Menasria. Taha ; pour avoir accepté de

juger et examiner ce travail.

Nous exprimions nos plus vifs remerciements à Mme chadi Hafidha, pour leur aide

et encouragement lors de la préparation de ce mémoire

Sans oublier tout personnel de laboratoire et de service médecine interne de

l’établissement de santé publique BOUGUERA BOULARAAS

A tout nos familles pour leur amour.

Nous tenons à remercier également tout les enseignants du département de science

de la nature et de la vie.

Page 10: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Table des matières Abstract

Résumé

Remerciement

Dédicace

Liste des tableaux

Liste des figures

Liste des symboles

Table des matières

Introduction................................................................................................................................. 01

Première partie : Synthèse bibliographique

I. Notions générales sur le diabète …………………………………………………………….. 02

I.1.Définition ………………………………………………………………………………….... 02

I.2. Complications de diabète ………………………………………………………...... 02

A. Rétinopathie………………………………………………………………………………… 02

B. Néphropathie ………………………………………………………………………………... 02

C. Neuropathie…………………………………………………………...................................... 02

D. Le pied diabétique…………………………………………………………………………… 02

I.3. Les infections du pied diabétique………………………………………………………… 03

A. Symptomatologie de l’affection du pied diabétique………………………………….. 03

B. Les principaux facteurs favorisant l’infection du pied diabétique …………………… 04

C. Différents aspects de l’infection du pied diabétique…………………………………… 04

Infections superficielles des tissus …………………………………….. 04

Infections profondes des tissus ……………………………………......... 04

I.4.Étiologie bactérienne de l’infection du pied diabétique …………………………………… 05

Les Entérobactéries ……………………………………………………. 05

Les Pseudomonas …………………………………………………........ 06

Les streptocoques……………………………………………………… 06

Clostridium sulfito-réducteurs………………………………………… 06

Les Staphylocoques……………………………………………………... 06

Page 11: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Deuxième partie : Etude expérimentale

1. Objectif de l’étude …………………………………………………………………………… 07

2. Matériel et Méthodes ………………………………………………………………………... 07

2.1. Phase de prélèvement………………………………………………………………………. 07

2.1.1. Matériel…………………………………………………………………………………... 07

2.1.2. Méthodes………………………………………………………………………………... 10

2.2. Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire ……………………………….. 10

2.2.1. Matériel…………………………………………………………………………………... 10

2.2.1. 1.Examen direct …………………………………………………………………………. 10

2.2.1.2. Mise en culture ………………………………………………………………………… 10

2.2.1.3. Caractérisation biochimique des souches bactériennes……………………………… 12

2.2.1. 4. Etude de la sensibilité aux antibiotiques………………………………………………. 12

2.2.2. Méthodes…………………………………………………………………………………. 14

2.2.2.1 .Examen direct………………………………………..………………………………… 14

2.2.2.2. Mise en culture……………………………………………..……... 14

2.2.2.3. Caractérisation biochimique des souches……………………………………………… 14

2.2.2.3. 1.Tests préliminaires …………………………………………... 14

2.2.2.3.2. Caractérisation biochimique détaillée…………………………… 15

2.2.2.4. Etude de la sensibilité aux antibiotiques ………………………… 15

3. Résultats

1. Examen direct microscopique après coloration……………………………………………... 19

2. Mise en culture ……………………………………………………………………………... 22

3. Caractérisation biochimique des bactéries isolées………………………………………….. 24

4. Etude de la sensibilité aux antibiotiques…………………………………………………… 26

Discussion..................................................................................................................................... 34

Conclusion

Référence bibliographique

Annexes

Page 12: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

LISTE DES TABLEAUX

Tableau Titre Page 01 Grade et intérêt pronostic. 05

02

Récapitulatif des malades choisis et de l’ensemble des caractéristiques correspondantes.

08

03

Les valeurs critiques, pour l’interprétation des résultats de l’étude de la sensibilité aux antibiotiques des Staphylococcus spp sur milieu gélosé (EUCAST ,2016).

16

04

Les valeurs critiques, pour l’interprétation des résultats

de l’étude de la sensibilité aux antibiotiques des

Entérobactéries sur milieu gélosé (EUCAST ,2016).

17

05

Les valeurs critiques, pour l’interprétation des résultats

de l’étude de la sensibilité aux antibiotiques des

Pseudomonas sur milieu gélosé (EUCAST ,2016).

18

06

Profil biochimique des Entérobactéries isolées. 25

07

Résultats de l’étude de la sensibilité des staphylococcus.spp et des Staphylococcus aureus aux antibiotiques testés sur milieu gélose.

28

08

Résultats de l’étude de la sensibilité des entérobactéries aux antibiotiques testés sur milieu gélose.

31

09

Résultats de l’étude de la sensibilité des Pseudomonas aux antibiotiques testés sur milieu gélose.

33

Page 13: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

LISTE DES FIGURES

Figure Titre page

01 les différents stades d’infection bactérienne. 3

02 Infection superficielle. 4

03 Infection profond. 5

04 Aspect microscopiques des polynucléaires neutrophiles. 19

05 Aspect microscopiques des polynucléaires neutrophiles isolée 20

06

Aspect microscopiques des polynucléaires neutrophiles associée

avec des bactéries.

20

07 Pourcentage des souches isolées après l'examen direct. 21

08 Aspect microscopique d’un frottis montre la présence des bacilles Gram

21

09 Aspect microscopique d’un frottis montre des cocci Gram+. 21

10 Aspect microscopique d’un frottis montre la présence des Champignons.

22

11 Pourcentage des bactéries après la mise en culture. 23

12 Aspect macroscopique des déférents isolats sur les milieux de cultures utilisées.

23

13

Prévalence des différents germes isolés dans les prélèvements de l’infection du pied diabétique.

24

14 Abondance Relative des différentes espèces d’Entérobactéries isolées. 26

15 Abondance Relative de la résistance des staphylocoques aux antibiotiques.

29

16 Abondance Relative de la résistance des Entérobactéries aux antibiotiques.

32

17 Abondance Relative de la résistance des Pseudomonas aérogénosa aux antibiotiques.

33

Page 14: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Liste des Symboles

API: Appareillage et procédé d’identification.

CA-SFM:Comité de l'Antibiogramme de la Société Française de Microbiologie.

EUCAST: European Comity on Antimicrobial Susceptibility Testing.

GN : Gélose nutritif.

ID: Diabète Insulinodépendante.

MCF: McFarland.

MH : Mueller-Hinton.

NID: Diabète Non Insulinodépendante.

Page 15: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10
Page 16: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Introduction

1

1. INTRODUCTION

Le pied diabétique, une des majeurs complications, qui atteignent les diabétiques avec

d’autres complications : cardiovasculaires, insuffisance rénale et oculaires, Elle constitue un

problème économique de santé publique, particulièrement lorsqu'une amputation est

nécessaire, ce qui implique un traitement complémentaire et une hospitalisation prolongé.

Une situation aggravée par L'augmentation mondiale de la prévalence du diabète de

type 2 qui a pour conséquence une augmentation de l'incidence d'ulcères du pied chez le

patient diabétique ( Pin et al., 2003).Plusieurs facteurs contribuent au développement des

ulcères des pieds chez les patients diabétiques la neuropathie périphérique et L'insuffisance

vasculaire ces deux facteurs sont à l’origine de perte de sensibilité, atrophie musculaire

intrinsèque, sécheresse cutanée ,ischémie et des problèmes circulatoires (Edmons et al.,1994)

A ces deux facteurs déjà cités s’ajoute un troisième facteur représenté par l’infection

bactérienne qui vienne s’installer, l’infection d’une ulcération d’un pied diabétique multiplie

le risque d’amputation par un facteur de 10 (Richard &Schuldiner , 2008).

L’infection du pied diabétique consiste en une invasion des tissus par des bactéries,

accompagnée d’une multiplication avec ou sans réponse inflammatoire. L’infection d’un

pied diabétique peut être superficielle ou plus profonde qui peut engager le pronostic vital et

qui nécessite un traitement médicochirurgical d’urgence (Jean et al., 2007).

L’infection du pied diabétique avec la spécificité de sa localisation (pied fragilisé) et

un statut immunitaire générale affaiblie (diabète) constitue un motif fréquent de prescription

d’antibiotiques. Cette dernière est basée sur des résultats de l’étude microbiologique qui a

pour but l’identification de l’agent infectieux responsable et étudier sa sensibilité aux

antibiotiques afin de conduire l’antibiothérapie. Cette tache rend le rôle de microbiologiste

central et primordiale dans la prise en charge de cette pathologie infectieuse qui nécessite une

collaboration multidisciplinaire (Cunha & Ankle, 2000).

Dans ce sens et en l’absence des études faites sur cette pathologie infectieuse dans notre pays

et notre région de Tébessa, notre étude a été proposée et qui a eu pour objectif :

La détermination de la fréquence des bactéries responsables de cette infection.

Déterminer l’implication mixte ou isolée des bactéries dans cette pathologie.

La corrélation entre réaction immunitaire cellulaire et présence ou absence de bactérie.

Étudier l’évolution de la sensibilité des bactéries aux antibiotiques.

Page 17: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Notions générales sur le diabète

2

I. Notions générales sur le diabète I.1.Définition

Le diabète est une pathologie caractérisée par son évolution chronique, survienne

lorsque notre organisme devient incapable de produire l’insuline, ou d’utiliser ce dernier

d’une manière efficace (Nam, 2013). Et par conséquent une élévation de glucose est

observée dans le temps, ce qui peut conduire à des complications, vasculaires et

neuropathiques (Margaret, 2014).

I.2. Complications de diabète

Le diabète se caractérisé sur le plan métabolique par une hyperglycémie, mais aussi

par la des complications principalement la Rétinopathie, Néphropathie et Neuropathie, et en

dernier lieu la complication la plus grave représenté par le pied diabétique.

A. Rétinopathie

Caractérisé par l’augmentation de la perméabilité des capillaires rétiniens, ce qui cause

l’extravasation du contenu vasculaire, par rupture de la barrière hématorétinienne, et par

conséquent l’apparition des hémorragies, et des œdèmes. (Gabriel & Nelly, 2002).

B. Néphropathie

Elle apparait suite à une hypertrophie rénale et une augmentation de la filtration

glomérulaire, le problème des lésions peut être résolu avec un meilleur équilibre glycémiques.

(Simon & Jean, 2000).

C. Neuropathie

La neuropathie périphérique est l'atteinte du système nerveux périphérique. Elle

prédomine au niveau des membres inférieurs en raison de la plus grande fragilité des nerfs

sensitifs longs peu myélinisés. La polynévrite diabétique est une forme clinique fréquente

elle joue un rôle majeur dans l'apparition des lésions des pieds. (Agnès & Pierre, 2015).

D. Le pied diabétique

Le pied diabétique est un état pathologique atteignant le pied directement en rapport

avec la maladie diabétique sous jacente, caractérisé, par l'association complexe, des troubles

circulatoires périphériques, neuropathie périphérique, perte de la sensibilité normale.

L'ensemble de ces troubles aboutit à des ulcérations, diminution de l’hydratation (sécheresse),

fissures, et par conséquence l’augmentation du risque d’infection surtout bactérienne.

Page 18: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Notions générales sur le diabète

3

I.3. Les infections du pied diabétique

Le pied diabétique est une pathologie fréquente et plurifactorielle, dont la prise en

charge nécessite une collaboration multidisciplinaire. Ce qui minimise le risque d’amputation.

(Darbellay et al., 2011). Il s’agit d’une Atteinte structurelle et/ou fonctionnelle du pied

conséquence de l’hyperglycémie chronique, la neuropathie et/ou de l’artériopathie et/ou de

l’infection (joel et al., 2012).

L’infection est définie par processus invasif de tissu de pied, la multiplication des

bactéries organismes entraîne des lésions tissulaires dans le cas du pied diabétique, cette

infection est en règle secondaire à une plaie cutanée (Jean et al., 2007).

Le dépistage précoce des patients à risque, la prise des mesures préventives, ainsi et la mise

en place d’un traitement adéquat, peuvent résoudre le problème (Johan et al., 2007).

Figure 1. Les différents stades d’infection bactérienne (Mesmin, 2004).

A. Symptomatologie de l’affection du pied diabétique

Caractérisé par une insensibilité à la douleur, ce qui favorise les plaies liées au

frottement et aux corps étranger (Khalid, 2011), une atteinte vasculaire qui sont très

courante chez ces personnes et qui apparaissent parallèlement à la neuropathie (Andrew,

2005), des ulcères qui apparaissent chez un diabétique suite à l’accumulation de plusieurs

facteurs de risque (Neuropathies, vascularites) (Andrew, 2005).

Page 19: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Notions générales sur le diabète

4

B. Les principaux facteurs favorisant l’infection du pied diabétique

Les facteurs déclenchant une infection du pied diabétique les plus fréquents sont :

• des chaussures inadaptées aux déformations du pied

• une hyperpression répétitive lors de la marche

• des ongles blessants

• la présence de corps étrangers dans la chaussure, des soins inadaptés

• la marche pieds nus. (Jacques et al., 2015).

C. Différents aspects de l’infection du pied diabétique

Infections superficielles des tissus :

Atteinte cutanée uniquement sans atteinte des tissus sous-cutanés avec les signes

suivants : chaleur et douleur locale,érythème < 2 cm de large autour de la plaie,

tuméfaction écoulement purulent (joel et al., 2012).

Figure 2. Infection superficielle (www.centre-podologique.com)

Infections profondes des tissus

Des Infections qui peuvent touchés les structures au dessus de la peau et se manifeste

par: Collections purulentes, abcédassions et qui peut aller jusqu’au l’ostéite (joel et al., 2012).

Page 20: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Notions générales sur le diabète

5

Figure 3 .Infection profond (Hervé, 2007).

Les signes de l'infection du pied diabétique sont classés selon David, 2013 en 4 grades

représentés par le tableau suivant:

Tableau 1. Grade et intérêt pronostic (David, 2013)

Symptômes Grade Risque d’amputation (%)

Pas de signes d’infection 1 3

Atteinte non extensive 2 3

atteinte des structures sous-

cutanées (fascia, tendons,

articulation, os), sans signes

systémiques

3 46

Signes d’inflammation systémique : au moins 2 signes parmi : -Température > 38°C ou < 36°C - pouls > 90/min

4 70

I.4. Étiologie bactérienne de l’infection du pied diabétique

Les entérobactéries

Les entérobactéries ce sont des bacilles non sporulé, Gram négative, aérobie-

anaérobie facultative, les entérobactéries sont également oxydase négative, ont des besoins

nutritionnelle relativement simple et fermentent les sucres en divers produits finaux,

(Madigan & Martinko, 2008).

Page 21: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Notions générales sur le diabète

6

Les Pseudomonas

Les bactéries du genre Pseudomonas sont des bacilles à Gram négatif, non sporulés,

généralement, aérobies à métabolisme strictement respiratoire (Mezaache, 2012).

Les streptocoques

Des bactéries Gram positive, habituellement en paires ou en chainette, non sporulant

aéro-anaérobie facultative, catalase négative, métabolisme habituellement fermentatif (Paul,

2004). La fasciite nécrosante est une maladie potentiellement grave atteignant les tissus

cutanés profonds. Elle est la plupart du temps causée par une bactérie du type streptocoque A.

Clostridium sulfito-réducteurs

Des bacilles à Gram positive, anaérobie strict, métabolisme habituellement

fermentatif, se trouvent notamment dans le sol et les intestin de l’homme et autre animaux,

certains espèce sont pathogènes (Paul, 2004). Ces bactéries contiennent des endospores qui

provoque généralement leur déformation (Tortora et al., 2003). Si les spores germent dans

des tissus anaérobies, les bactéries se développent et sécrètent la toxine à qui dégrade le tissus

musculaire. Cette multiplication s’accompagné souvent d’une accumulation de gaz

(principalement de l’hydrogène résultant d’une fermentation des glucides) et de produits

toxiques provenant de la dégradation des tissus musculaires (Prescott et al., 2010).

Les Staphylocoques

Des cocci à Gram positif, l’espèce la plus importante, Staphylococcus aureus, Cette

derniere produit de nombreux toxines qui contribuent à sa pathogénicité en accroissant sa

capacité à pénétré dans l’organisme et tissus. L’infection des plais chirurgicales par cette

bactérie est un problème courant dans les hôpitaux. En outre, la capacité de S .aureus à

devenir rapidement résistant aux antibiotiques tel que l’oxacilline ce qui rend cette bactérie

redoutable pour les patients hospitalisés (Tortora et al., 2003).

Page 22: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

7

1. Objectif de l’étude

Notre étude pratique à été réalisée au niveau du laboratoire de microbiologie appliqué

de la faculté des sciences exactes et sciences de la nature et de la vie (université de

Tébessa).Le prélèvement des malades cible de notre étude a été réalisé au niveau de la

wilaya de Tébessa (Est Algérie).

Vingt cinq patients des deux sexes ont été prélevés dans une période de trois mois

(début février jusqu’au fin avril), nos objectifs étaient de :

Visualiser et déterminer la fréquence de l’étiologie bactérienne responsable de

l’infection du pied diabétique par isolement et identification biochimique des

microorganismes responsables.

Apprécier l’évolution de la sensibilité aux antibiotiques des bactéries par une étude

de la sensibilité aux antibiotiques.

2. Matériel et Méthodes

2.1. Phase de prélèvement

2.1.1. Matériel

a) Matériel biologique

Le matériel biologique est représenté par le pied des malades admis pour hospitalisation au

service de médecine interne Bouguera Boulaaras) à Békaria wilaya de Tébessa. Le choix des

malades a été effectué selon des critères de choix, qui sont les suivants :

Malades admis et diagnostiqués cliniquement (pied diabétique).

Présence d’un état de diabète (ID, NID).

deux sexes masculin et féminin.

Tout âge confondu.

diffèrent aspect et stade de l’infection du pied sont inclus.

Malades soumis ou non à une antibiothérapie.

Page 23: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

8

Tableau 2. Récapitulatif des malades choisis et de l’ensemble des caractéristiques

correspondantes (P : patient)

patients sexe Age diabète Type

Type d'infection

Localisation déformation Traitement

diabétique P 1 F 53 I Récidive Moyennement

profond Orteils en griffe

insuline

P 2 H 51 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 3 H 46 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 4 H 49 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 5 H 54 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 6 H 49 II Récidive Moyennement profond

/ orale

P 7 H 47 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 8 H 34 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 9 H 44 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 10 H 50 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 11 H 47 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 12 H 49 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

Page 24: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

9

Tableau 2. (Suite)

patients sexe Age diabète Type

Type d'infection

Localisation déformation Traitement

diabétique

P 13 H 46 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 14 H 52 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 15 H 45 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 16 H 51 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 17 H 39 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 18 H 43 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 19 H 52 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 20 H 49 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 21 F 51 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 22 H 47 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 23 F 50 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

P 24 H 43 I Primo-Infection

Superficielle / insuline

P 25 H 46 I Récidive Moyennement profond

/ insuline

Page 25: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

10

b) Matériel de prélèvement

Des écouvillons stériles fermés hermétiquement ont été utilisés pour assurée un bon

prélèvement, l’écouvillonnage permet la collecte des bactéries réellement responsables de

l’infection. D’un autre coté des écouvillons stériles pré-remplies par un bouillon nutritif

d’enrichissement ont été utilisés pour la mise en enrichissement immédiate des prélèvements

réalisés avec les écouvillons stériles sec et assurer un transport adéquat des échantillons.

2.1.2. Méthodes

préparation de la plaie

Avant le prélèvement, débridement de la plaie et nettoyage au sérum physiologique

ou savon antiseptique pour éliminer la flore bactérienne colonisant, rincer, sécher avant de

réaliser le prélèvement.

Technique de prélèvement

Frotter la surface de la plaie avec un écouvillon stérile puis introduire ce dernier dans

un tube contenant l'eau peptoné (3ml), en utilise 2 écouvillons (1 pour examen microscopique

et l’autre pour la culture).

Les prélèvements sont ensuite acheminés rapidement au laboratoire de microbiologie.

2.2. Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire

Une fois les prélèvements sont aux niveaux de laboratoire, une série d’analyses

bactériologique sont effectués :

2.2.1. Matériel

2.2.1. 1.Examen direct

a). Lames propre dégraissées

b). Colorants pour coloration des frottis :

Bleu de méthylène (coloration au bleu de méthylène)

Violet de gentiane, leguole, alcool, fushine (coloration de Gram).

2.2.1.2. Mise en culture

Ce sont des milieux ordinaires, enrichies et sélectifs pour isolement, pour l’identification

spécifique ont été utilisés.

Page 26: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

11

Gélose nutritive, ce milieu permettant la culture des bactéries peu exigeantes.

(Annexe I)

Gélose au sang, c’est un milieu d’isolement enrichi sur lequel les

Streptocoques se développent bien. Il permet, la lecture du caractère

hémolytique. (Annexe)

Gélose Chapman, ce milieu contient un inhibiteur : fortes concentrations en

chlorure de sodium (75 g.L-1), ce qui permet un isolement sélectif de

Staphylococcus tolérant les fortes concentrations en NaCl, et la fermentation de

mannitol. (Annexe I)

La gélose Hektoene, est un milieu pour l’isolement des entérobactéries, deux

indicateurs sont présents dans le milieu : le bleu de bromothymol (indicateur de

pH), la fuschine acide (qui se colore en présence d'aldéhyde). (Annexe I)

La gélose de Sabouraud constitue un milieu classique pour la culture,

l'isolement et l'identification des levures et des moisissures saprophytes ou

pathogènes. (Annexe I)

La gélose au cétrimide, est un milieu sélectif, qui permet l'isolement des

Pseudomonas et notamment de P.aeruginosa. Ce milieu, proche du milieu King

A, favorise aussi la production de pigments par P.aeruginosa (Annexe I)

Le milieu viande foie, L'étude du type respiratoire d'une bactérie (c'est à dire

ses rapports avec l'O 2) nécessite un milieu de culture riche contenant un

gradient de pression partielle en dioxygène, mené à la recherche des anaérobies

sulfito-réducteurs. (Annexe I)

Page 27: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

12

2.2.1.3. Caractérisation biochimique des souches bactériennes

a) caractérisation préliminaire

Disques oxydase

Eau oxygénée pour détermination de la catalase

b) caractérisation détaillée

La galerie biochimique API 20 E, système standardisé pour l’identification

des entérobactéries, comportant 20 tests biochimique miniaturise, il comporte

20 microtubes contenant des substrats déshydraté .les microtubes sont inoculé

avec une suspension bactérienne.les réactions produits pendant la période

d’incubation se traduisant par des virages colorés spontanés ou révélés par

l’addition des réactifs. La lecture de ces réactions se fait à l’aide de tableau de

lecture et l’identification est obtenue à l’aide d’un catalogue analytique ou d’un

logiciel d’identification.

2.2.1.4. Etude de la sensibilité aux antibiotiques:

L’antibiogramme est réalisé selon la méthode recommandée par EUCAST 2016

(European Comity on Antimicrobial Susceptibility Testing) de disque (la méthode de

diffusion en gélose).

a)Écouvillons stériles

b) Disques d’antibiotiques

Un ensemble de disques d’antibiotiques ont été utilisés selon le genre bactérien

isolé et suivant les recommandations EUCAST 2016, une liste de molécules

d’antibiotiques a été appliquée sur les différentes catégories de bactéries isolées dans

notre étude :

b.1) Antibiotiques testés sur les entérobactéries

Penicillines: Amoxicilline Clavulanic Acid(AMC), Amoxicilline (AMX),

céphalosporine: Cifotaxime(CTX), Céfoxitine(FOX),

Page 28: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

13

Fluoroquinolones : Acide nalidixique(NA), Pefloxacine (PEF), Ciproflaxine(CIP),

Aminoglycosides; Kanamycine(K), Amikacin(AK), Tobramycine(TOB),

Nitrofuranes ; Nitrofurantoin(F),

Divers: Fosfomycine(FOS),

b.2) Antibiotiques testés sur les staphylocoques:

Fluoroquinolones : Pefloxacine (PEF), Ciproflaxine(CIP),

Aminoglycosides; Amikacine(AK), Tobramycine(TOB)

Macrolides; Erythromycine(E), Clindamycine (DA)

Miscellaneous agents; Acid fusidic(FC),

Aminosides; Kanamycine(k)

b.3) Antibiotiques testés sur les Pseudomonas

Penicillines: Ticarcillin(TC), Ticarcillin cluvalinic acid(TTC),

Carbapenems: Imipenème(IMI)

Aminoglycosides: : Gentamicine(GN),

c) Milieu Muller Hinton (MH)

Gélose Mueller-Hinton, permet de tester l'action des antibiotiques en disques sur les

bactéries, il a des caractéristiques chimiques bien déterminées, dont l’épaisseur doit être de 4

mm (Annexe).

d) la suspension La méthode nécessite la préparation d’une suspension bactérienne 0.5 de la

gamme de MacFarland.

Page 29: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

14

2.2.2. Méthodes

2.2.2.1. Examen direct

Préparation du frottis: la confection du frottis sur une lame neuve, en frottant

l'écouvillon porteur de prélèvement, Pour réaliser un frottis mince. Ce dernier est Fixé

par passage rapide à travers la flamme du bec bunsen sans trop le chauffer.

Coloration au bleu de Méthylène

Coloration simple: Frottis fin est traité par un seul colorant basique pendant 2 à 3

minutes puis rincé pour étudier la réaction cellulaire et pour apprécier les bactéries, permet de

distinguer à la fois la morphologie des bactéries et d’apprécier la qualité et la quantité de la

réaction immunitaire cellulaire.

Coloration de Gram

La coloration de Gram permet de distinguer à la fois la morphologie des bactéries

(cocci ou bâtonnets) et de les classer en deux groupes celui des Gram positifs et des Gram

négatifs. Celles qui retiennent le violet de Gentiane après l'action de l'alcool sont des Gram

positives, Celles qui sont décolorées et prennent la couleur d'un second colorant sont dites

Gram négatif (annexe).

2.2.2.2. Mise en culture

Consiste à ensemencer des milieux de culture à partir des écouvillons qui ont servi au

prélèvement. On dépose l’inoculum, on réalise des stries à l’aide d’une pipette Pasteur. Ces

milieux ont été incubés à 37 °C pendant 24 à 48 heures.

2.2.2.3. Caractérisation biochimique des souches

2.2.2.3. 1.Tests préliminaires

a.1) Test catalase

Principe

La catalase est une enzyme qui catalyse la décomposition de l’eau oxygénée H2O2

(peroxyde d’hydrogène) en H2O et O2. Il empêche l’accumulation d’H2O2 qui est toxique

pour la cellule bactérienne.

Page 30: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

15

Technique

La mise en évidence de la catalase consiste à déposé sur une lame propre et sèche,

une goutte d’H2O2 à 10 volumes et ajouter une colonie prélevée directement avec une

pipette pasteur en milieu gélose, la présence de catalase se manifeste par un dégagement

immédiat des bulles gazeux.

b) Test oxydase

principe

C’est un test fondamental pour orienter l’identification des bacilles à gram négative. Les

oxydases sont des enzymes qui catalyse une réaction d’oxydoréduction impliquant une

molécule de dioxygène(O2) comme accepteur d’électron, la mise en évidence de l’enzyme est

effectuée en utilisant des disques d’oxydase, elle consiste à déposer sur une lame un disque

d’oxydase, et l’imbiber avec une goutte d’eau physiologique stérile. L’appariation d’une

coloration violette brune, signifié que la bactérie est oxydase positive.

2.2.2.3.2. Caractérisation biochimique détaillée

Pour les entérobactéries, elle a été réalisée, selon des étapes comportant : Préparation

de la galerie, préparation de l’inoculum et inoculation de la galerie (annexe I). La lecture des

résultats à été faite à l'aide de logiciel API 20 E (Version 1,2003), et les présentations

graphiques réaliser par Excel (Version 6, 2007).

2.2.2.4. Etude de la sensibilité aux antibiotiques

L’antibiogramme est réalisé selon la méthode recommandée par EUCAST 2016

(European Comity on Antimicrobial Susceptibility Testing) de disque (la méthode de

diffusion en gélose). Les étapes comportent La préparation de la suspension et

ensemencement de 0.5 MCF, tremper l’écouvillon dans la suspension bactérienne et

ensemencer les boites en stries attaché sur toute la surface de milieu, enfin on applique les

disques d’antibiotiques sur la gélose Mueller-Hinton en appuyant légèrement à l’aide d’une

pince flambé à la flamme du bec-bunsen. Les boites sont ensuit porté à l’étuve à 37C°

pendant 24 heures (annexe I).

Lecture et interprétation

La lecture et l’interprétation des isolats (sensible, résistant) a été faite selon les

diamètres critique (EUCAST 2016). Permettra de détecté le phénotype sensible et résistant.

Page 31: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

16

Tableau 3. Les valeurs critiques, pour l’interprétation des résultats de l’étude de la sensibilité

aux antibiotiques des Staphylococcus spp sur milieu gélosé (EUCAST, 2016).

Antibiotiques

Diamètre de la zone

S≥ R

Pefloxacine 22 16

Ciproflaxcine 20 20

Erythromycine 21 18

Clindamycine 22 19

Amikacine 18 16

Kanamycine 17* 15*

Acid fusidic 24 24

Tobramycine 20* 20*

Page 32: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

17

Tableau 4. Les valeurs critiques, pour l’interprétation des résultats de l’étude de la sensibilité

aux antibiotiques des Entérobactéries sur milieu gélosé (EUCAST ,2016). (R : résistante, S :

sensible)

Antibiotiques

Diamètre de la zone

S≥ R

Acide nalidixique 20* 15*

Pefloxacine 22* 19*

Fosfomycine 14* 14*

Ciproflaxine 22 19

Kanamycine 17* 15*

Amikacin 18 15

Céfoxitine 21 21

Nitrofurantoin 11 11

Tobramycine 17 14

Amoxicilline Clavulanic Acid 19 19

Cifotaxime 20 17

Amoxicilline 14 14

(*): Des valeurs critique tirées à partir de CA-SFM 2013.

Page 33: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Matériel et méthodes

18

Tableau 5. Les valeurs critiques, pour l’interprétation des résultats de l’étude de la sensibilité

aux antibiotiques des Pseudomonas sur milieu gélosé (EUCAST ,2016). (R : résistante, S :

sensible).

Antibiotiques

Diamètre de la zone

S≥ R

Ticarcillin 18 18

Gentamicine 15 15

Imipenème 20 17

Ticarcillin- cluvalinic acid 18 18

Page 34: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

19

1. Examen direct microscopique après coloration

La lecture des différents frottis colorés au bleu de méthylène et par la coloration de

Gram nous à fournis un ensemble de résultats qui concernent les bactéries présentent dans le

prélèvement ainsi que la réaction cellulaire immunitaire accompagnante :

Concernant la réaction cellulaire

Les polynucléaires neutrophiles (PN) ont été visualisés avec une abondance variable

(rare, assez nombreux, très nombreux)

La réaction cellulaire à polynucléaire était positif avec 15 frottis /25patient ce qui

représente (60%) et négatif avec 10 frottis /25patient ce qui représente (40%).Cette

réaction cellulaire est associe avec des bactéries sur 12 frottis /25patient (48%), et

isolée (absence de bactérie) ce qui représente 13 frottis /25patient et qui représente

(52%).

Figure 4. Aspect microscopiques des polynucléaires neutrophiles

Page 35: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

20

Figure 5. Aspect microscopiques des polynucléaires neutrophiles isolés.

Figure 6. Aspect microscopiques des polynucléaires neutrophiles associés avec des bactéries

Aspect bactériologique de l’examen direct

La lecture des différents frottis colorés au bleu de méthylène et au Gram a visualisé des

bactéries avec différentes formes et dispositions ainsi que des levures. Des combinaisons

variables sur le même frottis entre les différentes formes bactériennes.

Des bacilles à Gram négatif 22Frottis /25(88%).

Des cocci à Gram positif 21 Frottis /25 (84%)

Des levures 5frottis /25(20%)

Combinaison bacilles et cocci 18 frottis/25(72%)

Combinaison bacilles, cocci et levures 5frottis/25(20%)

Bacille isolé 1 frottis/25(4%)

Cocci isolé 2 frottis/25(8%)

Page 36: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

21

Figure 7. Abondance Relative des bactéries après examen direct

Figure 8. Aspect microscopique des bacilles Gram-.

Figure 9. Aspect microscopique des cocci Gram+

Page 37: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

22

Figure 10. Aspect microscopique des Champignons

2. Mise en culture

La mise en culture a permis d'isoler les différents groupes bactériens observés à l'examen

direct. Les colonies bactériennes sur milieux sélectifs étaient composées par un seul type de

colonie et deux types de colonies différenciés selon l’aspect (grosse ou petite colonie) et

dégradant un composant de milieu ou non.

Milieu Chapman : culture positif 21/25 patient ce qui représente (84%), avec deux

types de colonies enregistrés sur trois boites de culture

Milieu Hekteon : culture positif 22/25 patient ce qui représente (88%).

Milieu viande foie: 00/25 patient ce qui représente (0%)

Milieu gélose au sang : 00/25 beta hémolyse ce qui représente (0%)

Page 38: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

23

Figure 11. Pourcentage des bactéries après mise en culture

Figure 12. Aspect macroscopique des différents isolats sur les milieux de cultures utilisées

Page 39: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

24

3. Caractérisation biochimique des bactéries isolées

L’identification préliminaire et détaillée des différentes souches bactériennes isolées, a

permis de déterminer des pourcentages variables pour les différents groupes bactériens

(Figure13). D’après les résultats obtenus, les Staphylocoques spp étaient les germes les plus

abondant (21/43) (48,83%), les Entérobactéries (15 /43) (34,88%), les Pseudomonas

aérogénosa (7/43) (16,27%).

Figure13. Différents groupes bactériens identifiés biochimiquement

Page 40: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

25

Tableau 6. Profil biochimique détaillé des Entérobactéries isolées.

écha

ntillo

ns

ONPG

ADH

LDC

ODC

CIT

H 2S

URE

TDA

IND

VP

GEL

GLU

MAN

INO

SOR

RHA

SAC

MEL

AMY

ARA

OX

Souc

he is

olée

E1 - - - - + - - + + - - - - + - - - - - - - Providencia stuartii

E23 - + - - + - - + + + + + - + - - - - + + - Providencia stuartii

E6 - + - - + - + + + - + - + - + - + - + + - Providencia rettgeri

E13 - - - - + - + + + - + + - + - - - - + - - Providencia rettgeri

E22 - + - + + - + + + - + + - + - - - - + - - Providencia rettgeri

E5 - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - Flavimonas horyzihabita

E10 + + + + + - + + - + + + + - - + + + + + - Enterobacter gergoviae

E25 - + - + + + + + + + + + + + + + + + + + - Enterobacter sakazakii

E11 - + - - + - - + - + + + - - - - - - - - - Chryseomonas luteola

E15 + - + + + - + + + + + + + + + + + + + + - Klebsiella ornithinolytica

E14 + - + + + - + + + - + + + - - + + + + + - Kluyvera spp

E16 + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + - Serratia odorifira 1

E20 + + - + + - - + + - + + + - + + + + + + - Serratia odorifira 1

E21 + + + + + - + + + - + + + + + + + + + + - Serratia odorifira 1

E24 + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + - Serratia odorifira 1

Page 41: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

26

Figure 14. Pourcentage des différentes espèces d’Entérobactéries isolé.

4. Etude de la sensibilité aux antibiotiques

Plusieurs profils de résistance ont été visualisés :

Profils de résistance des staphylocoques

Profil 01 : Pefloxacine (R), Erythromycine(R), Clindamycine(R), Kanamycine, (R), Acid

fusidic, (R).Observés avec deux isolats (2/24) (8.33%)

Profil 02: Erythromycine(R), Clindamycine(R), Kanamycine, (R), Acid fusidic, (R).

Observé avec deux isolats (2/24) (8.33%)

Profil 03:, Erythromycine(R), Acid fusidic, (R Observé avec deux isolats (2/24) (8.33%)

Profil 04 : Erythromycine(R), Clindamycine(R), Acid fusidic, (R Observé avec deux

isolats (2/24) (8.33%)

Profil 05 : Pefloxacine (R), Ciproflaxine (R), Kanamycine, (R), Tobramycine(R). Observé

avec un seul isolat (1/24) (4.16%)

Profil 06: Erythromycine(R), Clindamycine(R), Acid fusidic, (R). Observé avec un seul

isolat (1/24) (4.16%)

Page 42: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

27

Profil 07 : Pefloxacine (R), Erythromycine(R, Clindamycine(R), Kanamycine, (R), Acid

fusidic, (R), Tobramycine(R Observé avec un seul isolat (1/24) (4.16%)

Profil 08 : Erythromycine(R, Clindamycine(R), Kanamycine, (R), Acid fusidic, (R).

Observé avec un seul isolat (1/24) (4.16%)

Profil 09: Erythromycine (R, Clindamycine(R), Amikacine (R), Kanamycine, (R), Acid

fusidic, (R), Tobramycine(R), Observé avec un seul isolat (1/24) (4.16%)

Profil 10: Pefloxacine (R), Erythromycine(R, Clindamycine(R), Amikacin (R), Kanamycine,

(R), Acid fusidic, (R), Observé avec un seul isolat (1/24) (4.16%)

Profil 11 : Acid fusidic, (R Observé avec un seul isolat (1/24) (4.16%)

Profil 12: Kanamycine, (R), Acid fusidic, (R), Tobramycine(R), Observé avec un seul

isolat (1/24) (4.16%)

Profil 13: Erythromycine(R), Clindamycine(R), Kanamycine, (R), Observé avec un seul

isolat (1/24) (4.16%)

Profil 14: Pefloxacine(R), Erythromycine(R), Clindamycine(R), Acid fusidic, (R

Tobramycine(R), Observé avec un seul isolat (1/24) (4.16%)

Profil 15: Pefloxacine (R), Erythromycine(R), Clindamycine(R), Amikacin (R),

Kanamycine, (R), Observé avec un seul isolat (1/24) (4.16%)

Page 43: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

28

Tableau 7. Résultats de l’étude de la sensibilité des staphylococcus.spp aux antibiotiques

testés sur milieu gélose (a : petite colonie ; b : grande colonie), E:Echantillon, P: Patient

. (PEF):Pefloxacine, (CIP):Ciproflaxcine, (E):Erythromycine, (DA):Clindamycine, (AK):Amikacine,

(K):Kanamycine, (FC):Acid fusidic, (TOB):Tobramycine.

TOB

FC

K

AK

DA

E

CIP

PEF

Disque d'ATB Patient

S R R S R R S R E 1/P1

S S S S S S S S E 2/P2 S S S S S S S S E 3/P3

R S R S S S R R E 4/P4 S S S S S S S S E 5/P5 S R R S R R S S E 6/P6 S R R S R R S S E 9/P9

S S S S S S S S E 11/P11 S R R S R R S R E 12 a/P12 S R S S R R S S E 12 b/P12 R R R S R R S R E 13 a/P13

S S S S S S S S E 13 /P13 S R S S S R S S E 14 a/P14

S R S S S R S S E 14 b/P14 S R S S R R S S E 16/P16

S R R S R R S S E 17/P17 R R R R R R S S E 18/P18

S R R R R R S R E 19/P19 S R S S S S S S E 20/P20 S R S S R R S S E 21/P21 R R R S S S S S E 22/P22

S S R S R R S S E 23/P23

R R S S R R S R E 24/P24 S S R R R R S R E 25/P25

Page 44: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

29

Figure 15. Pourcentage de la résistance des staphylocoques aux antibiotiques

Les résultats nous a permis de constater que les souches de staphylocoque présentent

une résistance à : l’Erythromycine, Acid fusidic, (16/24) (66,66%), Clindamycine (14/24)

(58,33%), Kanamycine(12/24), (50%), Tobramycine(5/24), (20,83%), Pefloxacine (7/24),

(29,16%), Amikacine (3/24), (12,5%), Ciproflaxine(1/24), (4,16%).

Profils de Résistance des Entérobactéries

Profil 1: Acide nalidixique(R), Kanamycine(R), Céfoxitine(R), Nitrofurantoin(R),

Amoxicilline Clavulanic Acid(R), Cifotaxime(R), Ampicilline(R), Observé avec quatre

isolat (4/22) (18.18%)

Profil 2 : Acidenalidixique(R), Pefloxacine(R); Ciproflaxine(R), Kanamycine(R),

Céfoxitine(R), Nitrofurantoin(R), Tobramycine(R), Amoxicillie.ClavulanicAcid(R),

Cifotaxime(R), Ampicillie(R), Observé avec deux isolats (2/22) (9.09%)

Profil 3: Nitrofurantoin(R), Tobramycine(R), Amoxicilline Clavulanic Acid(R),

Ampicilline(R), Observé avec deux isolats (2/22) (9.09%)

Profil 4 : Acide nalidixique(R), Pefloxacine(R), Ciproflaxine(R), Kanamycine(R),

Amikacine(R), Nitrofurantoin(R); Amoxicilline ClavulanicAcid(R), Cifotaxime(R),

Ampicilline(R), Observé avec un seul isolat (1/22) (4.54%).

Profil 5: Acide nalidixique (R), Kanamycine (R), Céfoxitine(R), Amoxicilline

ClavulanicAcid(R), Cifotaxime(R), Ampicilline(R), Observé avec un seul isolat (1/22)

(4.54%).

Page 45: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

30

Profil 6 : Acide nalidixique(R), Pefloxacine(R), Ciproflaxine(R), Kanamycine(R),

Céfoxitine(R), Nitrofuraoin(R), Amoxicilline ClavulanicAcid(R), Cifotaxime(R),

Ampicilline(R).Observé avec un seul isolat (1/22) (4.54%)

Profil 7: Acide nalidixique(R), Pefloxacine(R), Ciproflaxine(R), Kanamycine(R),

Nitrofuraoin(R), Tobramycine(R), Amoxicilline Clavulanic Acid(R), Ampicilline(R),

Observé avec un seul isolat (1/22) (4.54%)

Profil 8 : Acide nalidixique(R), Kanamycine(R), Nitrofurantoin(R), Ampicilline(R),

Observé avec un seul isolat, (1/22) (4.54%)

Profil 9: Acide nalidixique(R), Pefloxacine(R), Kanamycine(R), Nitrofurantoin(R),

Ampicilline(R). Observé avec un seul isolat, (1/22) (4.54%).

Profil 10 : Pefloxacine(R), Ciproflaxine(R), Nitrofurantoin(R), Ampicilline(R) . Observé

avec un seul isolat, (1/22) (4.54%).

Profil 11 : Acide nalidixique(R), Pefloxacine(R), Fosfomycine(R), Kanamycine(R),

Nitrofurantoin(R), AmoxicillineClavulanicAcid(R), Cifotaxime(R), Ampicilline(R), Observé

avec un seul isolat, (1/22) (4.54%).

Profil 12 : Amoxicilline Clavulanic Acid(R), Ampicilline(R), Observé avec un seul isolat,

(1/22) (4.54%).

Profil 13: Acide nalidixique(R), Kanamycine(R), Amikacine(R), Céfoxitine(R),

Amoxicilline ClavulanicAcid(R), Cifotaxime(R) Ampicilline(R), Observé avec un seul

isolat, (1/22) (4.54%).

Profil 14: Fosfomycine(R), Ciproflaxine(R), Amikacine(R), Céfoxitine(R),

Nitrofurantoin(R), Tobramycine(R), Amoxicilline ClavulanicAcid(R), Cifotaxime(R),

Ampicilline(R), Observé avec un seul isolat, (1/22) (4.54%).

Profil 15 : Nitrofurantoin(R), Amoxicilline Clavulanic Acid(R), Ampicilline(R),Observé

avec un seul isolat(1/22) (4.54%).

Profil 16: Acide nalidixique(R), Pefloxacine(R), Kanamycine(R), Céfoxitine(R),

Nitrofurantoin (R), Tobramycine(R), Ampicilline(R). Observé avec un seul isolat (1/22)

(4.54%).

Profil 17 : Acide nalidixique(R), Pefloxacine(R), Kanamycine(R), Céfoxitine(R),

Nitrofurantoin(R), Amoxicilline ClavulanicAcid(R), Cifotaxime(R), Ampicilline(R),

Observé avec un seul isolat (1/22) (4.54%).

Profil 18 : Acide nalidixique(R), Pefloxacine(R), Kanamycine(R), Amikacine(R),

Céfoxitine(R), Cifotaxime(R), Ampicilline(R). Observé avec un seul isolat (1/22)

(4.54%).

Page 46: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

31

Tableau 8. Résultats de l’étude de la sensibilité des Entérobactéries aux antibiotiques testés

sur milieu gélose. (R : résistante, S : sensible).

AM

CTX

AMC

TOB

F

FOX

AK

K

CIP

FOS

PEF

NA

Disque d'ATB Echantillon

R R R R R R S R R S R R E 1/P1

R R R S R R S R S S S R E 3/P3 R R R S R S R R R S R R E 5/P5

R R R S S R S R S S S R E 6/P6 R R R S R R S R S S S R E 7/P7 R R R S R R S R R S R R E 8/P8 R S R R R S S R R S R R E 10/P10 R S S S R S S R S S S R E 11/P11 R S S S R S S R S S R R E 12/P12 R S S S R S S R S S R S E 13/P13 R R R S R S S R S R R R E 14/P14 R S R S S S S S S S S S E 15/P15 R R R S R R S R S S S R E 16/P16 R R R S S R R R S S S R E 17/P17 R R R R R R R R R R S S E 18/P18 R R R S R R S R S S S R E 19/P19 R S R S R S S S S S S S E 20/P20 R S R R R S S S S S S S E 21/P21 R S R R R S S S S S S S E 22/P22 R S S S S R S R S S R R E 23/P23 R R R S R R S R S S R R E 24/P24 R R S S S R R R S S R R E 25/P25

Page 47: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

32

Figure 16. Pourcentage de la résistance des Entérobactéries aux antibiotiques.

Nous avons également constaté que nos isolats ont montrés une résistance très élevée

à l'Amoxicilline (22/22) (100%), Kanamycine (18/22), (81,81%), Nitrofurantoin et

Amoxicilline Clavulanic Acid (17/22) (77,27%), Acide nalidixique (16/22) (72,72%).

Cifotaxime (13/22) (59,09%), Céfoxitine (12/22) (54,54%), Pefloxacine (10/22) (45,45%)

Ciproflaxine, Tobramycine (5/22) (22,72%), Amikacine (4/22) (18,18%), et la Fosfomycine

(2/22) (9,09%).

Page 48: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Résultats

33

Profils de Résistance aux des Pseudomonas

Profil 1 : Imipenème(R). Observes avec Cinque isolat. (5/7) (71.42%)

Profil 2 : Gentamicine(R). Observes avec un seul isolat (1/7) (14.28%)

Tableau 9. Résultats de l’étude de la sensibilité des Pseudomona aerogenosas aux

antibiotiques testés sur milieu gélose. (R : résistante, S : sensible).

Disque d'antibiotique Echantillons

TC

TTC

GN

IMI

E 3/P3 S S S R E 7/P7 S S S R E 8/P8 S S R S E 12/P12 S S S R E 17/P17 S S S R E 18/P18 S S S S E 19/P19 S S S R

Ces résultats nous permet de constater une résistance très importante à l' Imipnème (5/7),

(71,42%), une faible résistance à Gentamicine (1/7),(14,28%) et une sensible à Ticarcilline et

Ticarcilline+ Acide clavunalique.

Figure 17. Pourcentage de la résistance des Pseudomonas aérogénosa aux antibiotiques

Page 49: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Discussion

34

DISCUSION

L’installation d’une antibiothérapie convenable en urgence est une obligation pour le

clinicien vis–à-vis d’une infection du pied diabétique. Cette dernière intervention doit être

guidée par une étude microbiologique, initiée par un bon prélèvement. En l’absence de

consensus, plusieurs techniques ont été proposés par divers auteurs pour mettre en évidence

aussi bien les germes aérobies que les germes anaérobies (Lipsky et al., 2004 ; Adil et al.,

2015).

Dans Notre étude réservé à l’infection du pied diabétique avec son aspect

bactériologique, on a opté pour la technique de prélèvement par écouvillonnage adapté aux

infections superficielles et moyennement profondes des malades inclus dans notre étude, les

techniques réservés aux infections profondes par aiguille et biopsie ont été exclus (Jean et al.,

2007). Afin d’enrichir les bactéries stressés par une éventuelle antibiothérapie l’écouvillon

destiné a la mise en culture a été plongée immédiatement après prélèvement dans un bouillon

nutritif (eau péptoné) qui joue un double rôle d’enrichissement direct et de dilution de

l’antibiotique administré en premier intention pour réduire son effet pendant l’acheminement

de prélèvement au laboratoire (Johnson et al., 1995). Toutefois on a introduit dans notre

étude bactériologique de mise en culture un procédé de recherche des bactéries anaérobies

représenté par le milieu viande foie en profondeur, associé à d’autres milieux consacrés à la

recherché des bactéries aérobies et mêmes à des levures (Praz & Houriet, 2002).

La mise en culture à la recherche des différentes étiologies bactériennes a été orientée

par un examen direct des frottis confectionnés à partir des prélèvements collectés. Les

résultats de l’étude microscopiques préliminaires ont montrés clairement l’aspect

polybacterien de l’infection de pied diabétique justifier par la combinaison bacilles et cocci

sur 18/25 frottis (72%), combinaison bacilles, cocci et levures 5/25 frottis (20%) (Hunt,

1992).un autre coté la réaction immunitaire à polynucléaire neutrophile n’était pas toujours

présente avec tout les malades, ceci peut être expliqué par l’altération de l'immunité cellulaire

naturelle à polynucléaire et mauvais fonctionnement de chimiotactisme qui attracte ces

dernier au site de l’infection. Les résultats obtenus à l’examen direct permettent d’orienter le

clinicien pour l’installation d’une antibiothérapie probabiliste (Praz & Houriet, 2002).

Une très bonne corrélation a été observée entre examen direct des frottis et mise en

culture. La combinaison de milieux sélective pour entérobactéries, staphylocoques, anaérobies

associée à un milieu enrichie, ordinaire et enfin un milieu pour isolement sélectif des levures a

permis d’isoler la totalité des germes observés à l’examen direct contrairement à la mauvaise

Page 50: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Discussion

35

corrélation entre les deux observées lors de l’utilisation de la biopsie comme moyen de

prélèvement tissulaire (Bowler et al.,2001). Suite à cette mise en culture combiné par la suite

à une caractérisation biochimique, on a constaté l’absence totale des streptocoques beta

hémolytiques et des anaérobies. D’un autre coté notre étude a révélé une prédominance nette

des Staphylocoques spp. qui a occupé le premier rang avec (21/43) (48,83%), suivie des

Entérobactéries (15 /43) (34,88%) et en dernier lieu le Pseudomonas spp (7 /43) (16,27%).

Un ordre de fréquence qui a été vérifier dans plusieurs étude faite sur l’infection de pied

diabétique (Sapico et al., 1980).

Toutefois l’ordre de fréquence peut être parfois inversé, dans certaine étude et dans le

même contexte les entérobactéries ont occupait le premier rang avant les staphylocoques,

c’est le cas de l’étude effectué par Shankar EM au sud de l’Inde qui a révélé la prédominance

nette des entérobactéries (57.6%) par rapport à celle des staphylocoques (42.3%)( Shankar et

al .,2005). L’absence des anaérobies dans notre étude peut être justifié par la nature des

lésions superficielle des atteintes de pied diabétique inclus dans notre étude, ces germes ont

été souvent isolés lors des infections profondes avec aspiration à l’aiguille fine ou par biopsie

tissulaire (Gerding, 1995).

L’étude de la sensibilité des différentes bactéries aux antibiotiques a révélé plusieurs

profils de résistance aux antibiotiques, concernant le Staphylococcus spp. , 15 profils de

résistance ont été enregistrés. La résistance était croisée entre plusieurs classes

d’antibiotiques, avec une prédominance de résistance touchant l’acide fucidique et

l’érythromycine (66.66%). Toutefois le ciprofloxacine reste efficace avec un nombre de

souches très limité qui a montré une résistance à cette molécule (4.16 %). D’un autre coté les

entérobactéries ont montrés 18 profils de résistance, toute les classes ont été touchés, aucune

molécule n’était à l’abri de la résistance et avec une ampleur variable. , Les betalactamines

ont été les plus touchés avec une résistance à (100 %) à l’Amoxicilline (77.27%) à

l’association (amoxicilline + acide clavunalique), la cefotaxime (59.09 %) .et deuxième classe

touché était les aminosides. La résistance a touchée fortement la Kanamycine avec

(81.81%).et enfin la résistance a atteint aussi les quinolones et les fluoroquinolones avec une

ampleur supérieur à celle observés avec les staphylocoques. La résistance a touchée

respectivement l’acide nalidixique (72.72 %), la pefloxacine (45.45%) et la ciprofloxacine

(22.27 %). Cette multi-résistance a été appriciés dans d’autres études telle que l’analyse

rétrospective systématique du profil bactériologique des germes isolés des plaies de pied qui

comportait cent soixante-deux prélèvements, de janvier 2004 jusqu’au mai 2007 mené par S.

Hannat ( Hannat et al., 2008).

Page 51: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Discussion

36

Enfin le Pseudomenas aeruginosa, parmi les quatre molécules testés, la résistance a

touché sélectivement l’imipinem (5/7), (71,42%).Le Pseudomenas aeruginosa s’est révélé

sensible à la ticarcilline et à la ticarcilline+ac clavunalique.La résistance à l’imipinem,

constitue un problème de santé publique où sont isolées lors des reprises chirurgicales et lors

des hospitalisations de longue durée (Adil et al., 2015).

Page 52: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Conclusion CONCLUSION ET PERSPECTIVES

Les infections du pied diabétique, un état pathologique qui ne cesse pas à apparaitre, suite à l’émergence de la pathologie métabolique représentée par le diabète, Cette dernière responsable d’une baisse de l’immunité générale et locale.

Notre étude effectuée sur un nombre de malades pressentant la symptomatologie du pied diabétique, nous a permis de conclure le suivant :

L’atteinte infectieuse de pied diabétique est polybactérienne dans la majorité des cas.

Le processus inflammatoire représenté par les polynucléaires neutrophiles n’est pas toujours exprimé.

L’infection staphylococcique est prédominante, suivie de celle à Entérobactéries et enfin à Pseudomonas aéruginosa.

Une Multi-résistance aux antibiotiques de différentes classes a été enregistrée avec les Staphylocoques et les Entérobactéries. La résistance à touchée toutes les molécules avec une ampleur variable, Elle était croisée entre plusieurs classes à la fois, ce qui augmente le risque d’échec de l’antibiothérapie de première intention.

Le Pseudomonas aéruginosa, a exprimé une résistance particulaire à l’imipenème.

L’infection de pied diabétique avec son aspect microbiologique, nécessite obligatoirement le passage par une étude bactériologique, pour guider l’antibiothérapie probabiliste, qui a peut de chance pour guérir une infection du pied diabétique vu la multi-résistance observée.

A l’avenir, il serait intéressant d’approfondir nos recherches par l’introduction d’un nombre plus élargie de malades, des méthodes de typage (sérotypage), pour comprendre mieux la circulation des souches et enfin mettre en place d’autres procédés de prélèvement, d’enrichissement sélective et de mise en culture pour la recherche de bactéries anaérobies strictes.

Page 53: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Référence bibliographique

-A-

1. Adil Z.,Mohamed T., Abdellatif B.,Tarik L .,Mustapha B .,Mostafa E & Cherqui

H.2015.The Pan African Medical Journal. Profil bactériologique du pied diabétique et son

impact sur le choix des antibiotiques, pp7.

2. Agnès H., Pierre L.2015. Les neuropathies périphériques chez les diabétiques.

ATELIERS, vol 74, pp1.

3. Andrew B. 2005. Le pied diabétique : épidémiologie, facteurs de risque et état des soins,

pp2.

-B-

4. Bowler P.,Duerden B & Armstrong D.2001. Wound microbiology and associated

approaches to wound management. Clin Microbiol Rev ,14: 244–69.s .

-C-

5. Cunha B ., Ankle S .2000. Antibiotic selection for diabetic foot infections: a review.

39 ,253-7.

-D-

6. David B.2013. Infections du pied diabétique : vers une harmonisation des pratiques,

Journées du GERICCO, Maladies Infectieuses et Tropicales CHU de Nantes, , pp5.

7.Darbellay P .,Uckay I.,Dominguez D.,Mugnai D.,Filtri L.,Lew D & Assal M.2011.

Traitement du pied diabétique infecté : une approche multidisciplinaire par excellence, Revue

Médicale Suisse .www.revmed.ch.pp 1.

-E-

8. Edmons M., Foster., Boulton M., Connor H & Cavanagh P.1994. Classification and

management of neurpathic and neuroischemic ulcers., eds. The foot in diabetes, 2. Ed.

Chichester : Wyley & Sons, 109-20.

Page 54: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

-G-

9. Gabriel P & Nelly H.2002.Endocrinologie Diabétologie Nutrition.4ème édution. MED-.

LINE.pp196-197.

10. Gerding D. 1995. Foot infections in diabetic patients: the role of anaerobes. Clin Infect

Dis;20:S283–8 .

-H-

11 . Hannat S., Sahli F .,Khettabi S.,.Chermat R .,Mekideche F & Malek R . 2008.Profil

bactériologique des lésions trophiques du pied diabétique et leur résistance aux antibiotiques, ,

revue diabéte et metabolism elsevier, Volume 34, Supplement 3, March, pp 82.

12. Hervé D .2007. Ostéite du pied chez le patient diabétique,Service de Maladies

Infectieuses et Tropicales, Hôpital Pellegrin –Bordeaux,pp7.

13. Hunt J .1992. Foot infections in diabetes are rarely due to asinglemicroorganism.Diabet

Med. Oct; 9(8): 749-52.

-J-

14. Jacques M .,Marie L.,Agnès H & Jocelyne B.2015. Médecine des maladies

métaboliques, Revu de formation médicale contenue, société francophone du diabéte

alfediam, ELSEVIER MASSON, pp 11.

15. Jean P., chidiac & Louis B. 2007.Médecine et maladies infectieuses. Recommandations

pour la pratique clinique Prise en charge du pied diabétique infecté,

http://france.elsevier.com/direct/MEDMAL.ELSEVIER MASSON ,pp3.

16. Joel l, Sylvie G., Jean P & Olivier R . 2012. Infection du pied diabétique de l’adulte,

Guide infections du pied diabétique de l’adulte, Bon usage de l’antibiothérapie en franche

comté, pp 6.

17. Johan W.,Patricia S., Frank N., Luc F., Paul V.,Hilde B & Paul V. 2007. Diabète

sucré de type 2, Société Scientifique de Médecine Générale belges, pp 46.

18. Johnson S .,Lebahn F .,Peterson L & Gerding D .1995 .Use of an anaerobic

collectionand transport swab device to recover anaerobic bacteria from infected foot ulcers in

diabetics. Clin Infect Dis;20:S289–90.

Page 55: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

-K-

19. Khalid S .2011. Pied diabétique, pp13.

-L-

20.Lipsky B., Berendt A & Deery H. 2004. Diagnosis and treatment if diabetic foot

infections. Clin Infect Dis ; 39 : 885-910

-M-

21. Margaret . 2014. Charte du diabète pour le Canada, Document d’accompagnement,

www.mydiabetescharter. pp 1.

22. Madigan M & Martinko J .2008.Brock .Biologie des micro-organismes.11e édition.

PEARSON. France. pp354.

23. Mezaache S.2012. Localisation des déterminants de la suppression de quelques souches

de pseudomonas isolées de la rhizosphère de la pomme de terre, Thèse de doctorat,

Département de Microbiologie, pp19.

24. Mesmin D.2004. Le pied diabétique. A report from the international consensus on

diagnosingand treatingthe infected diabeticfoot. B. A. Lipsky, DiabetesMetabRes Rev2004,

pp 18.

-N-

25. Nam H .2013 .Atlas du diabète de la fid. Fédération Internationale du Diabète, 6eme

édition, pp 22.

-P-

26. Paul S.2004.Bactériologie. 6eédition. Dunod .Paris. pp513.

27. Pin C., Peter B & Philippe J.2003. Evaluation et prise en charge du pied diabétique,

Rev Med Suisse

28.Praz G & Houriet P . 2002. Infections et diabète : le pied diabétique, Rev Med Suisse n°

2408

29.Prescott.,Harley.,klein.,wiley.,sherwood&woolverton.2010 .Microbiologie ,

3ème édition.Boeck Université .paris ,pp 965.

Page 56: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

-R-

30.Richard J & Schuldiner S .2008. Epidémiologie du pied diabétique. Rev Med Int ; 29 :

S222-S230.

-S-

31. Sapico F.,Canawati H .,Witte J .,Montgomerie J., Wagner F & Bessman A.

1980 .Quantitative aerobic and anaerobic bacteriology of infected diabetic feet. J Clin

Microbiol;12:413–20.

32. Shankar E .,Mohan V., Premalantha G .,Srinivasan R & Usha A. 2005. Bacterial

etiology of diabetic foot infections in South India. Eur J Intern Med;16:567–70.

33. Simon I & JeanV .2000.Endocrinologie et communication cellulaires, EDP SCIENCEe,

Grenoble, pp 315.

-T-

34. Tortora., Funke & Case.2003. Introduction a la microbiologie, canada, pp348- 351.

35. www .Centre-podologique.com .

.

Page 57: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Annexe I

Les milieux de culture

1-Hektoen (en grammes par litre d'eau distillée)

Composition Quantité Peptone 12g Extrait de levure 3g NaCl 5g Sels biliaires 9g Thiosulfate de sodium 5g Citrate de fer ammoniacal 1,5g Lactose 12g Salicine 2g Saccharose 12g BBT 0,002g Fuchsine acide 0 ,1g Agar 14g

PH final = 7,5 .Ne pas auto-claver 2-Gélose nutritif (GN) Composition Quantité Peptone 5g /l extrait de viande 1g /l extrait de levure 5g /l chlorure de sodium 5g /l Agar 15g /l

Auto-clavé à 121C° pendant 20 min. 3-Sabauraud Composition Quantité Peptone 10g Glucose masse 20g Agar-agar 15g Eau distillée 1000 ml

vitamines et facteurs de croissance pH=6

Auto-clave à 121C° pendant 20 min. 4- Chapman Composition Quantité Peptone 10g Extrait de viande de boeuf 1g Chlorure de sodium 75g Mannitol 10g Rouge de phénol 0,025g Agar-agar 15g Eau distillée 1L

pH=7,5 Auto-clave à 121C° pendant 20 min.

Page 58: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

5- Mueller-Hinton (MH) Composition Quantité infusion de viande de boeuf 300ml peptone de caseine 17,5g amidon de mais 1,5 g Agar 17 g

pH=7,4 Auto-clavé à 121C° pendant 20 min.

6 -Gélose au sang de cheval Préparation • Liquéfier la gélose nutritive(GN) et atteindre son refroidissement a 45°C.

• Ajouter stérilement, a l'aide d'une pipette Pasteur (1 goutte = 0,05 ml), la Quantité de sang nécessaire pour

obtenir une concentration finale en sang de 5%.

• Homogénéiser en faisant rouler le tube entre les mains, en évitant la formation de bulles.

• Couler en boite de Pétri en évitant la formation de bulles d’air.

7-Gélose glucosée viande-foie

Composition Quantité Peptone viande-foie 30g

Glucose 2g

Amidon soluble 2g

Sulfite de sodium 2,5g

- Citrate de fer ammoniacal 0,5 g

Agar agar bactériologique 11 g

pH du milieu prêt-à-l’emploi à 25°C : 7,6 ± 0,2.

Page 59: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Préparation de la galerie API 20 E

Technique

Réunir fond et couvercle d’une boite d’incubation et répartir environ 5ml d’eau

distillé stérile dans les alvéoles pour créé une atmosphère humide;

Inscrire la référence de la souche sur la languette latérale de la boite;

Sortir la galerie de son emballage;

Placer la galerie dans la boite d’incubation;

Préparation de l’inoculum

A l’aide d’une pipette pasteur, prélever à partir une culture pur jeun sur milieu

gélosé (Hekteon);

Réaliser une suspension bactérienne dense dans 10ml d’eau physiologique stérile

en homogénéisant soigneusement les bactéries dans le milieu;

Inoculation de la galerie

Introduire la suspension bactérienne dans les tubes de la galerie à l’aide d’une

pipette pasteur (pour éviter la formation des bulles au fond de tube, poser les points

de la pipette sur la coté de la cupule, en inclinant légèrement la boit d’incubation vers

l’avant, et incubé pendant 24h à 37°C.

Page 60: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Annexe II

Tableau 1. Les résultats de l’examen direct après coloration au bleu de méthylène et de Gram Echantillon Polynucléaire

neutrophile bacille cocci Levure

E1 + + + -

E2 + - + -

E3 + + + +

E4 - - + -

E5 + + + -

E6 - + + -

E7 - + - -

E8 + + - -

E9 - - + -

E10 + + - -

E11 - + + +

E12 + + + +

E13 + + + -

E14 + + + -

E15 + + - -

E16 + + + +

E17 - + + +

E18 - + + -

E19 + + + -

E20 - + + -

E21 - + + -

E22 + + + -

E23 - + + -

E24 + + + -

E25 + + + -

E : échantillon

Page 61: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Tableau 02. Résultats de la mise en culture sur les différents milieux (Chapman, Hektoene, GN,

sabouraud) a prouve la présence des germes pathogènes, dans plusieurs prélèvements. Milieux

Echantillons

Chapman Hektoene GN Sabouraud

E 1 + + + -

E 2 + - + -

E 3 + + + +

E 4 + - + -

E 5 + + + -

E 6 + + + -

E 7 - + + -

E 8 - + + -

E 9 + - + -

E 10 - + + -

E 11 + + + +

E 12 + + + +

E 13 + + + -

E 14 + + + -

E 15 - + + -

E 16 + + + +

E 17 + + + +

E 18 + + + -

E 19 + + + -

E 20 + + + -

E 21 + + + -

E 22 + + + -

E 23 + + + -

E 24 + + + -

E 25 + + + -

Page 62: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Tableau03 : Résultats des testes preliminaires et d’identification biochimique détaillé pour les isolats cocci Gram + Echantillon Mannitol Catalase Coagulase

E 1 + + -

E 2 + - -

E 3 + - -

E 4 + + -

E 5 + + -

E 6 + - +

E 9 + - -

E 11 - - -

E 12 - + -

E 13 + - -

E 14 - - -

E 16 - - -

E 17 - - -

E 18 - - -

E 19 - - -

E 20 + + -

E 21 + - -

E 22 + - -

E 23 + - -

E 24 - - -

E 25 - - -

Page 63: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Tableau 04. Résultats de la mesure des diamètres d’inhibition des staphylococcus spp et des Staphylococcus aureus aux antibiotiques testes sur milieu gélose.

TOB FC K AK DA E CIP PEF Echantillon

Disque

d'ATB

25 ≤6 13 27 ≤6 ≤6 27 7 E 1

28 30 28 27 32 30 35 30 E 2

30 30 30 27 32 30 33 30 E 3

10 35 ≤6 22 35 32 14 8 E 4

24 27 29 30 22 31 30 27 E 5

24 ≤6 11 25 ≤6 ≤6 32 24 E 6

30 ≤6 10 23 ≤6 ≤6 25 30 E 9

23 35 25 25 30 30 30 31 E 11

20 ≤6 ≤6 21 ≤6 ≤6 24 12 E 12 a

20 ≤6 22 22 ≤6 ≤6 23 28 E 12 b

17 ≤6 ≤6 20 ≤6 ≤6 22 10 E 13 a

27 33 31 30 30 30 30 29 E 13 b

24 20 30 28 33 ≤6 27 25 E 14 a

30 15 32 25 35 13 32 30 E 14 b

28 23 36 36 ≤6 17 33 27 E 16

38 20 8 37 ≤6 ≤6 38 31 E 17

≤6 ≤6 7 ≤6 10 ≤6 21 30 E 18

30 18 ≤6 ≤6 ≤6 10 37 ≤6 E 19

20 17 29 22 27 27 28 29 E 20

21 ≤6 ≤6 20 ≤6 ≤6 33 27 E 21

18 23 21 20 25 27 30 24 E 22

33 32 17 22 15 17 30 25 E 23

11 ≤6 11 20 ≤6 ≤6 33 21 E 24

24 25 25 11 10 ≤6 29 24 E 25

a: petite colonie, b: grande colonie

≤6:résistante

Page 64: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Tableau 05. Résultats de la mesure des diamètres des entérobactéries aux antibiotiques.

AMX

CTX

AMC

TOB

F

FOX

AK

K

CIP

FOS

PEF

NA

Echantillon

Disque

d'ATB

≤6 ≤6 ≤6 11 ≤6 12 23 15 ≤6 16 ≤6 ≤6 E 1

≤6 17 ≤6 26 ≤6 ≤6 26 13 40 25 22 ≤6 E 3

≤6 ≤6 ≤6 26 ≤6 25 ≤6 13 10 27 ≤6 ≤6 E 5

≤6 10 ≤6 31 12 ≤6 31 15 35 15 22 ≤6 E 6

≤6 17 ≤6 18 ≤6 ≤6 21 7 26 18 24 13 E 7

≤6 15 ≤6 25 ≤6 ≤6 26 14 ≤6 27 ≤6 ≤6 E 8

≤6 27 ≤6 10 ≤6 27 20 13 ≤6 18 ≤6 ≤6 E 10

≤6 38 28 27 ≤6 27 28 10 25 36 23 ≤6 E 11

≤6 32 21 24 07 28 26 09 22 30 12 ≤6 E 12

≤6 32 20 17 ≤6 28 27 10 27 18 12 20 E 13

≤6 13 ≤6 17 ≤6 28 20 ≤6 23 10 10 ≤6 E 14

≤6 30 15 17 13 25 20 20 30 16 26 20 E 15

≤6 13 ≤6 21 ≤6 ≤6 22 11 34 14 22 11 E 16

≤6 ≤6 ≤6 22 19 17 ≤6 10 22 30 30 13 E 17

≤6 ≤6 ≤6 10 ≤6 ≤6 13 8 17 ≤6 30 20 E 18

≤6 11 ≤6 18 ≤6 ≤6 23 11 36 30 23 11 E 19

≤6 33 8 17 ≤6 28 20 23 36 27 30 26 E 20

≤6 20 ≤6 13 ≤6 24 18 20 28 26 25 20 E 21

≤6 25 ≤6 12 ≤6 24 18 20 30 23 26 23 E 22

≤6 20 25 17 17 ≤6 22 10 23 24 17 7 E 23

≤6 12 ≤6 16 ≤6 ≤6 20 ≤6 25 15 11 ≤6 E 24

10 16 28 11 20 ≤6 ≤6 ≤6 23 25 17 ≤6 E 25

Page 65: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Tableau 06. Résultats de la mesure des diamètres des pseudomonas aux antibiotiques.

GN TTC TC IMI Echantillon

Disque

d'ATB

16 39 37 17 E 3

16 27 25 12 E7

14 32 30 20 E8

15 33 31 10 E12

15 38 36 ≤6 E17

20 34 32 22 E18

20 40 38 ≤6 E19

≤6 : résistante

Tableau 7 : Récapitulatif des disques d’antibiotiques utilisés pour l’étude de la sensibilité des bacilles (Gram-) et des cocci (Gram+) aux antibiotiques.

Disque d’antibiotique

Code de disque Disque d’antibiotique

Code de disque

Amoxicilline Amx Fosfomycine FOS Acide nalidixique NA Pefloxacine PEF Kanamycine K Ciproflaxine CIP Céfoxitine FOX Cifotaxime CTX Amikacin AK Gentamicine GN Tobramycine TOB Erythromycine E Clindamycine DA Acide fusidic FC Amoxicilline Clavulanic Acid

AMC

Ticarcilline TIC Imipenème IMI Ticarcilline Acide Clavulanic

TTC Nitrofurantoin F

Page 66: Aspect bactériologique des infections du pied diabé · PDF fileAspect bactériologique des infections du pied ... Phase d’analyse microbiologique au niveau de laboratoire .. 10

Fiche de renseignements pour Prélèvements Du pied diabétique

Nom : Prénom(s) : Age :

Sexe : Masculin : Féminin :

Médecine généraliste : diabétologue :

Diabéte type : Année de diagnostique

Examens des pieds :

Hygiène : bonne moyenne : mauvais :

Pieds : chauds : froids :

Peau : lisse : sèche :

Œdème oui : non :

Odeur : Abondance :

Mobilité de la cheville : normale réduit :

Déformation : pied plat : pied creux : orteils en griffe :

Antibiothérapie :