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Gérer ses références bibliographiques : sortir de RefWorks Bibliothèque Michel Serres Outils et solutions Ecole Centrale de Lyon- Septembre 2009
Gérer ses références bibliographiques
Sortir du logiciel
PRESENTATION
L'Ecole centrale de Lyon va arrêter son abonnement à l'outil de gestion bibliographique Refworks car elle juge qu'il ne garantit pas un niveau suffisant de protection des données des chercheurs et des informations à caractère personnel. L'arrêt sera effectif à compter du 1er janvier 2010. Afin de faciliter la transition vers de nouveaux outils, la bibliothèque vous accompagnera durant les mois qui suivent. Ce document liste un ensemble d’outils pertinents utilisables du niveau « élève 1ère année » au niveau « Chercheur ».
PRINCIPES :
La plupart des outils de gestion de références bibliographiques disposent de fonctions d’import-export de leur base de données.
La marche à suivre consistera à : 1. Identifier un outil compatible avec votre traitement de texte vous servant à rédiger vos
documents (articles, rapports, thèses,…) 2. Exporter tout ou partie de sa base de données depuis Refworks sous la forme d’un fichier
dans un format identifié 3. Importer le fichier précédemment exporté dans un nouveau logiciel supportant ce format
POINTS CLÉS :
Identifier les formats compatibles entre l’ancien et le nouvel outil (privilégier RIS) Identifier les données non standards (champs personnalisés, tag, notes) Penser aux fichiers joints (pdf d’articles,...) qu’il faudra réintroduire dans le nouvel outil Procéder si possible à un test sur une partie de sa base avant toute opération globale
OUTILS PROPOSÉS :
Utilisateurs WORD ou OpenOffice Utilisateurs LaTeX Zotero Bibus EndNote
BibTeX JabRef BibDesk
Découvrez de nouveaux outils et les comparer avec la base ECLORE (Inist/CNRS) : http://eclore.veille.inist.fr/-/Eclore/?Eclore=interro
http://bibli.ec-lyon.fr/Formation 1
Gérer ses références bibliographiques : sortir de RefWorks Bibliothèque Michel Serres Outils et solutions Ecole Centrale de Lyon- Septembre 2009
UTILISATEURS DE MICROSOFT ORD OU
ZOTERO
Type d’outil : installation sur poste utilisateur (extension du navigateur Firefox) Statut : gratuit et libre Plate-forme : tout type de plate-forme supportant le navigateur Firefox Version recommandée : 1.0.10 Fonctions travail collaboratif : Oui ; en test sur version 2.0+ (nombreuses autres
fonctionnalités) Téléchargement : http://www.zotero.org Ressources :
o Descriptif [fr] : http://www.projet-plume.org/fr/fiche/zotero o Actualités [fr] : http://zotero.hypotheses.org o Tutoriels [fr] :
Documentation officielle http://www.zotero.org/support/fr/start
Introduction sur le site de l’Urfist PACA : http://tinyurl.com/lqc4mq
Manuel des Hôpitaux de Lyon (44 pages) : http://tinyurl.com/cpar95
Manuel de formation de Lyon 1 : http://tinyurl.com/yck7gmz
Site de l’EHESS : http://lodel.ehess.fr/cerc/document.php?id=259
Présentation : http://tinyurl.com/n7ldfx
Présentation : http://urfist.u-strasbg.fr/supports/bddbi_fi/Zotero_1_2008.pdf
Tutoriels de l’UPMC : http://tinyurl.com/kl8dfz
Procédure d’import-export :
o Dans Refworks : Outils > Exporter les références > choisir le format « Bibliographic Software (EndNote, Reference Manager, ProCite) » puis choisir « télécharger » ou « envoyer par email »
o Dans Zotero : Cliquer sur « Actions » et cliquer sur Importer… ; choisir le fichier. Note : des problèmes d’encodage des caractères accentués peuvent survenir
Cas des fichiers joints : sélectionner une référence dans Zotero, cliquer sur , choisir « Attach Stored Copy of File… » et sélectionner le fichier. Ou procéder par glisser-déposer de l’explorateur de fichiers vers Zotero
BIBUS
Type d’outil : installation sur poste utilisateur Statut : gratuit et libre Plate-forme : UNIX-like, Windows, MacOS X Version recommandée : 1.5rc1 Fonctions travail collaboratif : partage de la base de données possible sur un réseau Téléchargement : http://sourceforge.net/projects/bibus-biblio/
Ressources : o Descriptif [fr] : http://www.projet-plume.org/fr/fiche/bibus o Tutoriels [fr] :
Documentation officielle : http://tinyurl.com/3o3anl
http://bibli.ec-lyon.fr/Formation 2
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Diaporama : http://www.projet-plume.org/files/Bibus_journee_PLUME.pdf
Procédure d’import-export :
o Dans Refworks : Outils > Exporter les références > choisir le format « Bibliographic Software (EndNote, Reference Manager, ProCite) » puis choisir « télécharger » ou « envoyer par email »
o Dans Bibus : Fichier > Importer > choisir “RIS” et UTF-8 en encodage de fichier Cas des fichiers joints : Sélectionnez une référence. Menu « Référence » > Editer la référence.
Dans la fenêtre d’édition > onglet « Fulltext files » > chercher le fichier via pour le champ « File/URL ». Note : la procédure peut être automatisée via les noms de fichiers
EndNote
Type d’outil : installation sur poste utilisateur Statut : payant et propriétaire Plate-forme : Windows, MacOS X Version recommandée : EndNote X+ Fonctions travail collaboratif : possibilité de couplage avec un compte EndNote Web qui
dispose de fonctions de travail collaboratif Téléchargement : http://www.endnote.com
Ressources : o FAQ [en] : http://www.endnote.com/support/faqs/index.asp o Tutoriel [fr] de l’Université de Laval : http://tinyurl.com/kjlh8a o Présentations des Urfist [fr] :
http://urfist.u-strasbg.fr/supports/bddbi_fi/EndNote_1_2008.pdf http://tinyurl.com/l7txdp (plusieurs supports pour EndNote X, X1, X2)
Procédure d’import-export :
o Dans Refworks : Outils > Exporter les références > choisir le format « Bibliographic Software (EndNote, Reference Manager, ProCite) » puis choisir « télécharger » ou « envoyer par email » Voir : http://www.endnote.com/support/Faqs/Import/faq13.asp
o Dans EndNote : Ouvrir une base existante ou créer une nouvelle base. Puis Fichier > Import… > choisir le fichier d’import et « Reference Manager (RIS) » dans les options d’import. Note : les doublons peuvent être supprimés ou signalés et l’encodage modifié à l’import
Cas des fichiers joints : Sélectionnez une référence. Puis menu Références > PDF > « Lier à un PDF… »
UTILISATEURS DU LOGICIEL
Format et outils BibTeX
BibTeX est un puissant outil logiciel permettant aux auteurs utilisant LaTeX de gérer leurs références bibliographiques lors de la rédaction d’un document. Par extension, BibTeX désigne aussi le format de fichier contenant les références bibliographiques dans l’environnement LaTeX. Il existe des logiciels facilitant la saisie, la recherche et la gestion des références, basés sur BibTeX. Ces logiciels disposent de fonctions avancées comme l’interrogation de bases de données distantes (ArXiv, Pubmed, etc.) ou la recherche dans des fichiers attachés (pdf d’articles, etc.). Plus d’information :
http://www.projet-plume.org/fr/fiche/bibtex http://www.eleves.ens.fr/home/peyre/BibTeX.pdf
http://bibli.ec-lyon.fr/Formation 3
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JabRef
Type d’outil : interface graphique de gestion de références bibliographiques ; installation sur poste utilisateur
Statut : gratuit et libre Plate-forme : UNIX-like, Windows, MacOS X (nécessite une machine JAVA) Version recommandée : 2.5 Fonctions travail collaboratif : partage du fichier de base de données (BibTeX) possible Téléchargement : http://jabref.sourceforge.net/download.php Ressources :
o Descriptif [fr] : http://www.projet-plume.org/fr/fiche/jabref o Tutoriel [fr] :
Documentation officielle : http://jabref.sourceforge.net/help/fr/Contents.php Court tutoriel : http://stephlefevre.free.fr/logiciels/JabRef.php Diaporama : http://www.projet-plume.org/files/jabref.pdf
Procédure d’import-export :
o Dans Refworks : Outils > Exporter les références > choisir le format « Bibliographic Software (EndNote, Reference Manager, ProCite) » puis choisir « télécharger » ou « envoyer par email »
o Dans JabRef : Fichier > Importer dans une nouvelle base. Les clés BibTeX sont générées automatiquement. Les doublons sont identifiés pour suppression éventuelle
Cas des fichiers joints : double-cliquer sur une référence > dans l’onglet , puis cliquer
sur au niveau de l’entrée « File » et choisir le fichier (pdf,….) à lier à la référence
BibDesk
Type d’outil : interface graphique de gestion de références bibliographiques ; installation sur poste utilisateur
Statut : gratuit et libre Plate-forme : MacOs X Version recommandée : v1.3.21 Fonctions travail collaboratif : partage du fichier de base de données (BibTeX) possible Téléchargement : http://bibdesk.sourceforge.net
Ressources : o Descriptif [fr] : http://www.framasoft.net/article4272.html o Documentation [en] : http://bibdesk.sourceforge.net/manual/ o Support [en] : http://sourceforge.net/apps/mediawiki/bibdesk/index.php o BibDesk + CiteUlike : http://www.academicproductivity.com/2009/citeulike-bibdesk-
sync-your-references-and-live-smarter/
Procédure d’import-export :
o Dans Refworks : Outils > Exporter les références > choisir le format « BibTeX – Refworks ID » ou « Bibliographic Software (EndNote, Reference Manager, ProCite) » puis choisir « télécharger » ou « envoyer par email »
o Dans BibDesk : Fichier > Ouvrir (choisir l’encodage UTF-8). Dans le cas d’un fichier RIS, l’extension doit être « .ris ». Sauvegarder ce fichier avant son ouverture.
Cas des fichiers joints : Double-cliquer sur une référence pour ouvrir la fenêtre d’édition. Sélectionnez le fichier à joindre dans l’explorateur et le déposer dans la zone « Drop Files Here »
http://bibli.ec-lyon.fr/Formation 4