Surveillance programmée de la résistance aux antibiotiques chez les bactéries d’origine
animale : résultats majeurs en 2017
LNR résistance antimicrobienne Agnès Perrin-Guyomard, Anses
Laboratoire de Fougères
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
15/11/17 Rencontres scientifiques de l’Anses 2
Surveillance programmée, continue, harmonisée Evaluer les niveaux de résistance aux antibiotiques chez les animaux producteurs d’aliments : volailles (années paires), animaux de boucherie (années impaires) Evaluer les niveaux de résistance aux antibiotiques des bactéries d’origine alimentaire (diffusion dans la chaîne alimentaire et exposition du consommateur ) Suivre les tendances et les émergences
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
15/11/17 Rencontres scientifiques de l’Anses 3
Texte d’exécution Décision 2013/652/UE
Base réglementaire Directive zoonose 2003/99/CE
LNR Résistance Antimicrobienne
Laboratoires d’analyses agréés
Instructions techniques Notes de service DGAl
Pilotage
Services déconcentrés
Prélèvements
Isolements
CMI
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4
Filière : volailles Elevage : prélèvements d’environnements (contrôles officiels) Abattoir : carcasses et caeca Distribution : viandes fraîches de poulet
Prélèvements
Poule pondeuse Poulet de chair Dinde
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Echantillonnage
- non ciblé, aléatoire
- uniforme sur tous les mois de l’année (du 01/01 au 31/12)
- représentatif de la production française, proportionnel à la population humaine
- au moins 300 prélèvements de caeca et 300 prélèvements de viandes
- 170 isolats pour chaque combinaison espèce bactérienne/espèce animale
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Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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- Salmonella spp.
- Campylobacter jejuni
- Escherichia coli commensales indicatrices (flore dominante/caeca)
- Escherichia coli résistantes aux céphalosporines ou carbapénèmes BLSE/AmpC/Carba (flore sous-dominante/ caeca et viandes) : enrichissement et recherche sélective sur milieu avec antibiotiques
Isolements
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Sensibilité aux ATBs
- Concentration Minimale Inhibitrice (CMI) en milieu liquide
- Microplaques harmonisées au niveau européen
Panel 1 : E. coli/Salmonelles = 14 antibiotiques (9 familles) ; Campylobacter = 6 antibiotiques (4 familles)
Panel 2 : 10 antibiotiques (famille des β-lactamines)
- Interprétation selon les seuils épidémiologiques de l’EUCAST2
- Remontée des données à l’EFSA (rapport européen)
- Séquençage des souches présentant des profils d’intérêt (LRUE)
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Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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8 15/11/17
Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca
Multirésistance (R) chez le poulet (N=188) et chez la dinde (N=182)
20,2
13,8
7,4
15,4
22,9
14,4
4,3
1,6
Sensible
1R
2R
3R
4R
5R
6R
7R
0 5 10 15 20 25
Pourcentage de souches dans la catégorie
18,7 12,6
16,5
15,9
14,8
17 3,3
0,5
0,5
Sensible
1R
2R
3R
4R
5R
6R
7R
8R
0 5 10 15 20
Pourcentage de souches dans la catégorie
17% en 2007* 4,5% en 2007*
AMP-TET-SMX-TMP AMP-TET-SMX-TMP-CIP
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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9 15/11/17
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
% re
sist
ance
Ampicilline
Sulphaméthoxazole
Tétracycline
Triméthoprime
Ciprofloxacine
Acide Nalidixique
Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca
Evolution dans le temps (% de résistance élevés)
Diminution significative. Testé par une régression linéaire simple
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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0
2
4
6
8
10
12
14
16
18
20
2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
% re
sist
ance
Ceftazidime
Céfotaxime
Chloramphénicol
Gentamicine
Colistine
Méropénème
Diminution significative. Testé par une régression linéaire simple
Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca
Evolution dans le temps (% de résistance modérés à rares)
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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11 15/11/17
Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca
Evolution dans le temps (% de résistance élevés)
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
100
2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
% ré
sist
ance
Ampicilline
Chloramphénicole
Ciprofloxacine
Acide Nalidixique
Sulphaméthoxazole
Tétracycline
Triméthoprime
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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12 15/11/17
0
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
% ré
sist
ance
Céfotaxime
Ceftazidime
Colistine
Gentamicine
Méropénème
Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca
Evolution dans le temps (% de résistance modérés à rares)
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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Caeca Viande
Flore dominante Flore sous-dominante (Recherche Sélective)
3,2% (N souches =188) 44% (N prélèvements =300) 63,2% (N prélèvements =321)
0,5% (N souches =182) 28% (N prélèvements =300)
E. coli résistantes aux céphalosporines
‒ Co-Résistances associées : TET et SMX majoritairement
‒ pas de souche productrice de carbapénèmase
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Antibiotiques (Seuil épidémiologique en mg/L)
Poulet (N=188) Dindes (N=164)
n % [intervalle de confiance] n % [intervalle de
confiance]
Ciprofloxacine (0,5) 123 65,4 [58,6-72,2] 95 57,9 [50,4-65,5] Acide nalidixique (16) 119 63,3 [56,4-70,2] 88 53,7 [46,0-61,3]
Tétracycline (1) 127 67,6 [60,9-74,2] 115 70,1 [63,1-77,1]
Gentamicine (2) 0 0,0 [0,0-1,6] 0 0,0 [0-1,8]
Streptomycine (4) 2 1,1 [0,0-2,5] 1 0,6 [0-1,8]
Erythromycine (4) 0 0,0 [0,0-1,6] 0 0,0 [0-1,8]
Sensibilité aux antibiotiques/Campylobacter jejuni /caeca
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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15 15/11/17
20.2%
25,0%
54,8%
Sensibles
1R
2R
Sensibles
1R
2R
CIP-TET
23,2%
25,6%
50,6%
0,6%
Sensibles
1R
2R
3R
Sensibles
1R
2R
3R
CIP-TET
Sensibilité aux antibiotiques/ Campylobacter jejuni /caeca
Multirésistance (R) chez le poulet (N=188) et chez la dinde (N=164)
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
Rencontres scientifiques de l’Anses
16 15/11/17
Sensibilité aux antibiotiques/ Campylobacter jejuni /caeca
Evolution dans le temps
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
80%
90%
100%
2009 2010 2011 2012 2013 2014 2016
% r
ésis
tanc
e
Tétracycline
Ciprofloxacine
Acide nalidixique
Streptomycine
Gentamicine
Erythromycine
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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17 15/11/17
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
Rencontres scientifiques de l’Anses
18 15/11/17
Sensibilité aux antibiotiques/E. coli indicatrices/caeca Evolution dans le temps
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
Rencontres scientifiques de l’Anses
19 15/11/17
Multirésistance/E. coli indicatrices/caeca
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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20 15/11/17
Travaux de recherche
Publiés
Dispositif général Spécifications techniques 2016 Résultats 2016
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21 15/11/17
- Epidémiologie de la résistance à la colistine en élevage (Agnès Perrin-Guyomard, Isabelle Kempf, Yannick Blanchard, Pamela Houée, Laetitia Ledevendec)
- Caractérisation de plasmides de E. coli résistants aux céphalosporines de troisième génération isolés de poulets de chair (Fabrice Touzain, Laetitia Le Devendec, Claire de Boisseson, Sandrine Baron, Eric Jouy, Agnès Perrin-Guyomard, Blanchard Yannick, Isabelle Kempf)
- Analyse des résultats et propriétés des systèmes de surveillance : évaluation du lien entre usage et antibiorésistance et de l’impact des mesures de gestion des risques mises en place en France (Claire Chauvin, Julie David, Pascal Sanders, Agnès Perrin-Guyomard, Mireille Bruneau, Gérard Moulin, Anne Chevance, Eric Jouy)
Travaux de recherche
En cours
Dispositif général Spécifications techniques 2015 Résultats 2016
16/11/16 Rencontres scientifiques de l’Anses
22
Conclusions
‒ Campylobacter jejuni (poulet) : augmentation des % de R aux quinolones et fluoroquinolones
‒ E. coli : o Diminution de certains pourcentages de résistance o % de souches sensibles à tous les antibiotiques en progression
‒ E. coli BLSE : proportion de prélèvements de viandes de poulet + >50%
Perspectives ‒ Consolider la réduction des % de résistance
‒ Réduire la prévalence des E. coli BLSE dans la viande de poulet à la distribution
Remerciements
Les Services Déconcentrés
Les Laboratoires agréés
Anses Fougères Anses Maisons Alfort
Anses Lyon Anses Ploufragan
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