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FORMATION M1 BTVRECHERCHE
DOCUMENTAIRE
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Quelques rappels sur la BU
• Belle-Beille :
— Lettres, langues, sciences, sciences humaines
— 8h30-20h du lundi au jeudi
— 8h30-18h le vendredi et le samedi
• Saint-Serge :
— Droit, économie, gestion, médecine, tourisme, patrimoine
— 8h30-22h30 du lundi au samedi
• Le site de la BU : http://bu.univ-angers.fr/
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Plan de la formation
I. Trouver un document à partir d'une référence précise / Rappels sur la bibliographie
II. Trouver un document sur un sujet
— Dans le catalogue de la BU
— Dans les bases d'articles en ligne
— Sur le web
III. Evaluer ses résultats
IV. Citer
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Trouver un document à partir d'une référence précise
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Dans le catalogue de la BU
• Ce qu'on trouve dans les catalogues :
— Une description des livres /revues présents dans la
bibliothèque (titre, auteur, etc...) et où les trouver = c'est
une notice
• Ce qu'on ne trouve pas dans le catalogue :
— Le détail ou le texte intégral de chaque article pour les
périodiques. Recherche uniquement par titre de revue.
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Petit exercice de recherche dans le catalogue (1)
Vous cherchez ces documents dans le catalogue de la bibliothèque...
Biologie végétale / J-C. Laberche, Paris : Dunod, 2010
V. Chassany, Mini-manuel de biologie végétale : cours + QCM, Paris : Dunod, 2014.
J. Molinier, G. Ries, C. Zipfel, et B. Hohn. « Transgeneration Memory of Stress in Plants ». Nature 442, n 7106 (31 août ᵒ2006)
ALKHALFIOUI F, RENARD M, MONTRICHARD F. (2007). Unique properties of NADPthioredoxin reductase C in legume. J. Exp. Bot. 58, 969-978.
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Chercher une revue / un article
> Des revues sous forme papier et /ou en ligne
> Filtre permettant de limiter la recherche aux
revues
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Aller plus loin...
• La BU possède-t-elle ces documents ? Comment les trouver ?
— Soyer, Jessica, sous la direction de Christophe Bertsch.
« Caracterisation de la regulation de l’expression des
genes codant des effecteurs chez Leptosphaeria
maculans ». Université de Haute-Alsace, 2013.
— Kawamura, Koji, et al. « Kernel methods for phenotyping
complex plant architecture » (mai 2013).
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Le Sudoc
> C'est un catalogue qui permet de trouver les
notices des ouvrages présents dans toutes les
BU de France.
- Pour trouver une référence
- Pour faire une demande de PEB
> Préférez la recherche avancée
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Le Sudoc
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Archives Ouvertes
• Pour rechercher une référence précise qu'on ne trouve pas dans les catalogues :
— On peut utiliser Google ou Google Scholar pour la
localiser
— Certains documents peuvent se trouver sur des
Archives Ouvertes ( articles de recherche sur des
plates-formes à la disposition de tous sur le web)
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Trouver un document sur un sujet dans un catalogue
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Chercher des documents sur un sujet
• Pour commencer une recherche :
— Wikipedia, encyclopédie collaborative en ligne
Pour prendre connaissance d'un sujet, mais vérifier la
fiabilité des informations (historique, bandeaux
d'avertissement, comparer avec d'autres sources, aller
voir les sources primaires)
— Encyclopédies, manuels
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Chercher par sujet à la BU
• Vous cherchez, dans le catalogue, des documents sur les processus de transgénèse végétale.
• Vous cherchez des documents sur les bio-agresseurs des végétaux.
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Les rebonds dans le catalogue
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Quelques astuces de recherche
•« Tous les mots suivants» : ET (correspond aux 2 critères).
•« Cette expression exacte » : recherche non pas une combinaison de termes mais une expression exacte (ex : « développement durable »)
= documents sur les semences de céréalescéréale
ssemences
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Quelques astuces de recherche
•« Au moins un des mots suivants » : OU (correspond à au moins un des critères, élargit la recherche)
•« Aucun des mots suivants » : SAUF (exclut un critère, restreint la recherche)
semences graines = documents comprenant le mot semences, ou graines, ou les 2
semences céréales = documents sur les semences mais pas de céréales
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La troncature
• La troncature : Taper * pour remplacer une ou plusieurs lettres d'un mot
— Permet de faire une recherche large (ex : végéta*
cherche végétal, végétaux, végétation, végétalisé...) ou
si on hésite sur l'orthographe d'un mot
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Trouver des références d'articles sur un sujet
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Techniques de l'Ingénieur
• Comment y accéder ?
— Onglet Bases de données > Technologie
— LA base de références sur les sciences de l'ingénieur,
des références sur les bioprocédés (notamment
chimiques) et l'environnement
• Tutoriel vidéo :
— Cliquer sur le + en face du nom de la base, puis sur
« Tutoriel vidéo »
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Techniques de l'Ingénieur
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Techniques de l'Ingénieur
• La recherche avancée
— Utiliser les opérateurs booléens
— Sélectionner une thématique ou une base
— Trier par date, nom d'auteur, mots clés...
• Visualiser et récupérer les résultats
— Accès au sommaire, à une fiche documentaire, au
texte intégral en format PDF
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Techniques de l'Ingénieur
• Vous avez la recherche suivante à mener dans les TI :
— Vous faites une recherche sur l'utilisation des
engrais minéraux à base d'azote
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Web of Science
• Onglet Bases en ligne > Biologie et santé. W.O.K. donne accès à :
— Web of science : Base de données bibliographiques,
pas toujours accès au texte intégral. Plus de 9 200
journaux, disponibles dans plus de 45 langues.
Domaines : sciences, sciences sociales, Arts et
Lettres. Comprend aussi les bases Index Chemicus
et Conference proceedings
— Medline
— Journal of citation reports
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Web of Science
• Si recherche uniquement sur Web of Science
— Cliquer sur « Select a database » ou sur onglet
« Web of science »
• Langue d'interrogation : anglais (et surtout des sources en anglais)
• Tutoriel vidéo :
— Cliquer sur le + en face du nom de la base, puis sur
« Tutoriel vidéo »
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Web of Science
• Affiner la recherche / étudier les résultats:
— Refine results pour restreindre la recherche
— Analyze results : Permet de repérer des auteurs, des
institutions ou des journaux par rapport à une
problématique.
— Create citation report : tableau statistique des citations
(combien de fois un article est cité, et par qui)
• Visualiser les résultats
— Bouton BUA + : texte intégral ou services
complémentaires
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Exercice d'application
• Exercice d'application : (pensez à traduire les termes de recherche en anglais)
— Cherchez des articles sur les traitements
fongicides de la tavelure du pommier utilisables
en agriculture biologique.
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GreenFILE
• Pour y accéder :
— Onglet Bases en ligne > Biologie et santé
• Des références bibliographiques :
— Sur tout ce qui concerne l'environnement et l'écologie,
avec des ramifications vers le droit, la santé...
— avec pour la plupart un résumé. Souvent accès au texte
intégral mais pas toujours.
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Recherche dans GreenFILE
• Recherche en anglais
• Utiliser la recherche avancée (apparaît par défaut)
— Opérateurs booléens AND / OR / NOT
— Champs de recherche : ALL TXT pour une
recherche générale, SUBJECTS TERMS pour un
mot-clé sujet.
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Recherche dans GreenFILE
• Limiter sa recherche :
— Encadré « Ciblez vos résultats »
— « Options de recherche » pour affiner davantage
• Utilisation de l'index et du thesaurus :
— Pour vérifier ses termes de recherche
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Recherche dans GreenFILE
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Recherche dans GreenFILE
• Dans GreenFile, vous avez à mener une recherche sur le thème suivant (pensez à traduire vos termes de recherche en anglais) :
— Les réactions adaptatives des plantes à la
contamination par des métaux lourds
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PubMed
• Advanced Search
— Permet de combiner des critères de recherche
• MeSH database :
— Accès via la page d'accueil de PubMed
— Permet de faire une recherche plus ciblée en utilisant des mots-clés précis
— Taper un terme de recherche, cocher l'entrée qui convient, puis cliquer sur
« Add to Search builder » puis sur « Search PubMed »
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PubMed et le NCBI
• NCBI : National Center for Biotechnology Information
— http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
— un site de référence, propose de nombreuses banques de
données sur la génétique du végétal.
— De nombreuses banques de données développées par le
NCBI (Nucleotides, Protein, PubMed, ...).
— All databases : permet d'interroger toutes les banques
en une seule fois. Les données d'une banque peuvent
être reliées à celles d'une autre banque (ex : séquences
nucléiques contenant un gène et protéines codées par
ces gènes)
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PubMed
• PubMed :
— La partie « Articles » du NCBI
— Accès préférable via le site de la BU : Bases en ligne >
Biologie & santé > PubMed car lien vers le texte en ligne
quand la BU est abonnée.
— Références d'articles dans tous les domaines
biomédicaux (biochimie, biologie...), depuis 1966
jusqu'à aujourd'hui.
— Recherche en anglais
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PubMed
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PubMed
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PubMed
• Accès aux résultats :
— Cliquer sur le titre de l'article pour avoir accès au
résumé, aux mots-clés MeSH, aux liens
— Puis onglet BUA+ pour obtenir le lien vers le texte en
ligne si la BU est abonnée
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Les autres bases du NCBI
• Possibilité de lancer une recherche sur les autres bases directement à partir de PubMed
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Les autres bases du NCBI
• Quelques autres bases du NCBI :
— BLAST : permet de repérer les similitudes entre les
séquences en les comparant à des bases de données
— GENE : base de données de séquences génétiques
— Protein : bases de données de protéines
— Taxonomy : permet de retrouver les catégories
auxquelles appartient un organisme
— Et beaucoup d'autres...
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PubMed
• Lancez une recherche sur la production de protéines LEA chez les plants de riz.
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Évaluer les résultats
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Évaluer ses résultats
• Pour une recherche sur le feu bactérien chez le pommier, observez les résultats sur la diapo suivante.
— Classez-les selon qu'ils vous semblent pertinents ou pas à
utiliser dans un travail de type universitaire.
— Indiquez quels critères vous ont permis de faire votre
choix.
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Evaluer ses résultats
— http://www.bacteriologie.wikibis.com/feu_bacterien.php
— http://www.cliniquedesplantes.fr/fiches/le-feu-bacterien-du-pommier/vo
ir.html
— http://tel.archives-ouvertes.fr/tel-00482385/fr/
— http://bu.univ-angers.fr/rechercher/description?notice=000152442
— http://jacqueshenry.wordpress.com/2012/05/17/bonne-nouvelle-le-gene-de
-resistance-a-erwinia-amylovora-identifie-mots-cle-feu-bacterien-strep
tomycine-genie-genetique/
— http://link.springer.com/article/10.1007/s11105-011-0334-1
— http://prodinra.inra.fr/?locale=fr#!ConsultNotice:13665
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Evaluer les résultats
• Évaluer la pertinence des résultats, en particulier sur le web, en appliquant quelques critères d'évaluation.
— La source (l'auteur)
— La date (création, mise à jour)
— L'adresse Url (privilégier les .gouv.fr = site
gouvernemental, .edu = écoles et universités, exclure
les .com = site commercial...)
— Les objectifs du site (commerciaux, politiques,
polémiques....)
— L'existence d'un comité de lecture
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Google Scholar
•Utiliser Google Scholar http://scholar.google.fr/
— Recherche uniquement sur des travaux universitaires
— Utiliser la recherche avancée
— Possibilité de paramétrer Google Scholar pour que tous les
articles en ligne auxquels la BU est abonnée apparaissent
en lien (dans « Paramètres »)
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Citer
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Citation et plagiat
Citer ses sources :
— Appuie votre argumentation par des références validées
— Respecter le droit d'auteur : pas de plagiat / de copier-coller
— Citations : toujours mentionner l'auteur et l'ouvrage /l'article (en
note, par ex). Si vous reprenez une phrase à l'identique, la mettre
entre guillemets. Si vous reprenez les idées en paraphrasant, citer
la source également.
— Proposer une bibliographie à la fin de son travail – par ordre
alphabétique d'auteur en général. Normes APA disponibles sur
Zotero.
— Se tester : http://prezi.com/bdhvxdlzp6o8/comment-utiliser-les-
documents-trouves-eviter-le-plagiat/
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Zotero
• Zotero : logiciel libre, un plugin de Mozilla Firefox
— Enregistrer toujours sur la même machine, ou créez-vous un
compte
— Télécharger Zotero : http://www.zotero.org/
— Importer des références : icône dans la barre d'adresses ou
manuellement
— Possibilité d'organiser ses références par fichiers, d'y ajouter
des mots-clés (marqueurs), des notes...
— Possibilité d'intégrer un plugin directement dans votre
traitement de texte pour y intégrer des notes :
http://www.zotero.org/support/word_processor_plugin_installation_for_zotero_2.1
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Zotero
Possibilité de classer sa bibliothèque par fichiers
Cliquer sur l'icône pour enregistrer la référence
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Zotero
Capturer page courante
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Zotero•Pour créer une bibliographie :
— Sélectionner les notices ou le fichier, clic droit, créer une
bibliographie. Choisir ensuite le style de citation et le
format d'enregistrement (RTF conseillé)
•• + d'informations :
— http://bu.univ-angers.fr/formation/zotero
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Vous pouvez retrouver cette présentation en ligne :
Pour retrouver la présentation
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