Mise en évidence de nouveaux ligands non-peptidiques du récepteur GPR103Discovery of new non-peptide ligands for GPR103 receptor

Caractérisation des petits ARNs non codant chez Enterococcus faecalis et faecium , germes pathogènes opportunistes majeurs.

Characterization of small non coding RNAs in Enterococcus faecalis and faecium , two major opportunistic pathogens.

Post-conditionnement par les récepteurs couplés aux protéines G:Post-conditioning by G protein-coupled receptors

Etude du rôle du facteur SigmaD dans le contrôle de l’expression des autolysines et de   la flagelline chez Clostridium difficile

Analysis of the implication of SigmaD in expression of autolysins and flagellin in Clostridium difficile

Evaluation de l’intérêt de l’association d’une molécule BH3-mimétique, l’ABT-737, à différents outils d’inhibition de la protéine Mcl-1 pour le traitement des cancers de l’ovaire réfractaires à la chimiothérapie

conventionnelle.Evaluation of the interest of the association of a BH3-mimetic molecule, ABT-737, with various Mcl-1

inhibition tools for the treatment of ovarian carcinoma refractory to conventional chemotherapy .

Développement d’une stratégie d’immunothérapie des cancers colorectaux basée sur l’utilisation de cellules présentatrices d’antigène artificielles

Development of an immunotherapy strategy in colorectal cancers based on the use of artificial antigen presenting cells

Etude de la différenciation neuroendocrine dans la tumorigenèse prostatiqueNeuroendocrine differentiation in prostate cancer progression

Etude de l’implication du couple RasGRP1/RasGRP3 dans le dysfonctionnement du lymphocyte B au cours de la polyarthrite rhumatoïde

Involvement of RasGRP1/RasGRP3 in B cell dysfunction during rheumatoid arhritis

L’Activateur tissulaire du Plasminogène (tPA) dans le contrôle de la neurotransmission glutamatergiqueThe tissue type Plasminogen Activator (tPA) in the control of the glutamatergic neurotransmission

Recherche de la présence et des effets associés aux anti-androgènes sur la physiologie du Gardon (Rutilus rutilus)

Study of the occurrence and associated effects of anti-androgens on the Roach (Rutilus rutilus) physiology

Impact des anesthésies pratiquées pendant la période périnatale sur le développement du cortex cérébral et sur sa vulnérabilité aux agents excitotoxiques

Impact of anaesthesia practised during the perinatal period on cerebral cortex development and on its vulnerability to excitotoxic agents

EdNBISEEcole doctorale

Normande Biologie Intégrative,

Santé, Environnement

Stabilisation du phénotype du chondrocyte articulaire et induction de la chondrogenèse chez les cellules souches mésenchymateuses adultes en vue d’une utilisation en thérapie cellulaire du cartilage chez

l’homme.Articular chondrocyte phenotype stabilization and chondrogenesis induction in adult mesenchymal stem

cells for their use in the cell therapy in human cartilage defects

Représentation interne de la gravité et régulations végétativesInternal representation of gravity and autonomous regulation

Potentiels de dégradation microbienne associés au transfert des hydrocarbures aromatiques polycycliques le long d’un continuum bassin versant - estuaire marin

Potentials of microbiological degradation linked to the transfer of PAHs along a continuum watersheld - marine estuary

Modulation de l’angiogenèse par la protéine tyrosine phosphatase 1BModulation of angiogenesis by protein tyrosine phosphatase 1B

Impacts physiologiques et métaboliques de la nutrition soufrée et du transport de sulfate au sein de la graine de colza d’hiver sur la qualité, la conservation et la germination de la graine. Physiological and

metabolic impacts of sulfur nutrition and sulfate transport within the seed of winter oilseed rape on the quality, the conservation and the germination of the seed.

Rôle de la chromogranine A au cours de la différenciation neuroendocrine normale et pathologiqueRole of chromogranin A during normal and pathological neuroendocrine differentiation

Evaluation du profil de protéines ubiquitinées au cours de l’inflammation intestinaleEvaluation of ubiquitinated proteins during intestinal inflammation

Unité de recherche d’accueil  Centre d’Etudes et de Recherche sur le Médicament de Normandie

EA 3915, FR CNRS 3038 INC3MSujet de thèse Mise en évidence de nouveaux

ligands non-peptidiques du récepteur GPR103.

Discovery of new non-peptide ligands for GPR103 receptor.

Le CERMN est un laboratoire de recherche pharmaceutique, qui est constitué de deux départements : un département de chimie et un département de modélisation moléculaire. Les activités de deux départements sont centrées sur la conception de nouvelles molécules à visée thérapeutique dans les domaines de la cancérologie et des neurosciences principalement. Les moyens chimiques ont permis la constitution d’une chimiothèque qui fait l'objet des criblages par des partenaires biologistes ou pharmacologues. Les travaux de recherche sont menés souvent en partenariat avec l'industrie pharmaceutique ou de chimie fine.

L’objectif du projet est de découvrir les premiers ligands non peptidiques d’un récepteur couplé aux protéines G, le GPR103, dont le ligand naturel est un peptide, le 26RFa. Le 26RFa est un nouveau neuropeptide de la famille des RFamides récemment isolé du cerveau de la grenouille, puis cloné chez l'Homme et le Rat (Inserm U982, ROUEN). Par ailleurs, la recherche d'un récepteur de ce peptide a conduit à l'identification d’un RCPG orphelin, le GPR103. Des études neuroanatomiques ont révélé que l’administration intracérébro-ventriculaire du 26RFa provoque une augmentation dose-dépendante de la consommation de nourriture chez la souris qui indique que le 26RFa pourrait jouer un rôle important chez les vertébrés dans le contrôle de la prise alimentaire.Par ailleurs, le 26RFa a été synthétisé (Inserm U982, ROUEN) et sa structure 3D a été déterminée par RMN (UMR 6014 CNRS, ROUEN). Cette étude montre une variation conformationnelle du peptide en fonction des caractéristiques du milieu. D’autres peptides voisins ainsi que des pseudo-peptides proches ont été synthétisés (Inserm U982, ROUEN) et présentent des profils pharmacologiques intéressants en termes d’affinité et d’activité. Il est donc essentiel d’analyser l’ensemble des conformations de ces ligands afin de faire émerger une conformation bioactive commune en relation avec leur profil pharmacologique (Ligand Based Drug Design).En parallèle, le modèle du récepteur sera bâti par homologie de séquence avec des RCPGs proches, dont la structure 3D est connue. Ce modèle permettra l'analyse des interactions potentielles ligand-récepteur (Structure Based Drug Design).A l’aide de ces deux approches, la chimiothèque de CERMN (12200 produits) sera criblée afin d’identifier les premiers ligands non peptidiques. Dans la littérature, il est maintenant clairement admis que la combinaison de ces deux approches permet d'identifier assez sûrement de nouveaux ligands non-peptidiques

The CERMN is a pharmaceutical research laboratory, with two departments: the chemical and the molecular modelling departments. The research activities are applied in an integrated manner (both departments) to the design of molecules with potential therapeutic applications, mostly in the field of cancerology and neurosciences. Those advances have led to the recent development of chemolibraries and to close collaborations with biologists and pharmacologists. Numerous works are also closely linked to industrial partners

The overall objective is to find the first non-peptide ligands of a receptor coupled to G protein (GPCR), named GPR103, whose natural ligand is a peptide, the 26RFa. The 26RFa is a new neuropeptide of the RFamide family, recently isolated from the brain of the frog, then cloned in humans and rats (Inserm U982, Rouen). Furthermore, the search for a receptor of this peptide led to the identification of an orphan GPCR, the GPR103. Neuroanatomical studies have revealed that the intracerebroventricular administration of 26RFa induces a dose-dependent increase in food consumption in mice indicating that 26RFa could play an important role in the control of food intake in vertebrates.Furthermore, the 26RFa was synthesized (Inserm U982, Rouen) and its 3D structure has been determined by NMR (UMR 6014 CNRS, Rouen). This study has shown a conformational change of the peptide according to medium properties. Other related peptides and pseudo-peptides were synthesized (Inserm U982, Rouen) and exhibit interesting pharmacological profiles in terms of affinity and activity. It is therefore essential to analyze all conformations of these peptide ligands in order to define a common bioactive conformation in relation to their pharmacological profile (Ligand Based Drug Design).In parallel, the model of the receptor will be built by sequence homology approach using GPCRs family members, whose 3D structure is already known. This model enables the analysis of potential ligand-receptor interactions (Structure Based Drug Design). Using these two approaches, the chemical library of CERMN (12200 compounds) will be screened out to identify the first non-peptide ligands for GPR103 (hits). In the literature, it is now clearly recognized that the combination of these two approaches is one of the most effective approaches to identify new non-peptide ligands

Titulaire d’un master recherche en modélisation Candidates must have a master in organic or medicinal

moléculaire ou biophysique, le (la) candidat(e) devra posséder une expérience en modélisation moléculaire. Autonome et rigoureux, le (la) candidat(e) devra être ouvert(e) aux travaux à l’interface modélisation-chimie-biologie.

chemistry and be experienced in multi-steps organic synthesis, ideally in heterocyclic chemistry. The ability to work independently in a multidisciplinary team is essential as well as interest about chemistry/biology interface work.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010CERMN

5 rue Vaubénard 14032 Caen cedex : jana.sopkova@unicaen.fr

: +33 02 31 56 68 21

Unité de recherche d’accueil  Laboratoire de Microbiologie de l’Environnement (LME)EA956, IFR146, USC INRA2017

Sujet de thèse Caractérisation des petits ARNs non codant chez Enterococcus faecalis et faecium, germes pathogènes opportunistes majeurs.

Characterization of small non coding RNAs in Enterococcus faecalis and faecium, two major opportunistic pathogens.

La thématique majeure du Laboratoire de Microbiologie de l’Environnement (LME), soutenue par l’INRA (Département MICA pour « Microbiologie et Chaîne Alimentaire ») et par la MSTP (DS10), concerne l’étude de la résistance aux stress et l’analyse d’une relation possible entre celle-ci et la virulence chez Enterococcus faecalis, germe pathogène opportuniste. L’équipe est composée de 8 enseignants chercheurs à l’Université de Caen Basse Normandie et de 2 techniciennes. La démarche expérimentale vise à étudier les mécanismes de la tolérance aux stress, la régulation des gènes impliqués dans ces réponses et dans la virulence d’E. faecalis par des approches transcriptomiques et protéomiques

Ces dernières années, des petits ARN non-codant (sncRNAs) ont été identifiés comme des régulateurs clés de plusieurs processus cellulaires chez des organismes eucaryotes. Depuis peu, la caractérisation de sncRNAs chez les bactéries connaît un réel engouement. En effet, des sncRNAs bactériens sont capables de s’apparier à d’autres ARN, former des complexes avec des protéines ou des acides nucléiques. Certains apparaissent impliqués dans la réponse aux stress et divers métabolismes laissant supposer qu'ils pourraient également jouer un rôle central dans la pathogénicité de nombreux germes.Enterococcus faecalis et faecium sont des membres naturels de la microflore digestive de l’homme. Toutefois, certaines souches peuvent devenir pathogènes et provoquer des infections du tractus urinaire, des bactériémies, des infections intra-abdominales ou des endocardites. De plus, l’acquisition croissante d’antibiorésistances contribue à leur émergence en tant que pathogènes nosocomiaux importants. Bien que les séquences génomiques de souches d’entérocoques soient accessibles, aucun ARN présentant des fonctions régulatrices n’a été mis en évidence. Ainsi, l’identification et la caractérisation des sncRNAs comme nouveaux régulateurs de l’expression de gènes de virulence chez E. faecalis et faecium constituent l’objectif principal de cette thèse et se décompose en 3 étapes majeures :

– Une recherche des sncRNAs par hybridation de type « tiling arrays »

– Une caractérisation fonctionnelle de quelques sncRNAs en réalisant des souches mutantes

– Une recherche des gènes régulés par ces sncRNAs par des approches bionformatiques, transcriptomiques et protéomiques

Ce projet représente la première étude globale et fonctionnelle d’ARN régulateur chez les entérocoques

The major theme of the “Laboratoire de Microbiologie de l’Environnement” (LME), supported by INRA (“MICA” department for "Microbiology and Food Chain") and the MSTP (DS10), is the study of the stress resistances and the analysis of a possible relationship between these resistances and the virulence of the opportunistic pathogen Enterococcus faecalis. The team is composed of 8 senior scientists-teachers at the University of Caen Basse Normandie and 2 technicians. The experimental approach is to study the mechanisms of stress tolerance, the regulation of genes involved in these responses as well as in the virulence of E. faecalis by transcriptomic and proteomic approaches

These last years, small non coding RNAs (sncRNAs) have been identified as key regulators for several cellular metabolisms especially in eukaryotes organisms. Since recently an infatuation arises for the characterization of bacterial sncRNAs. Indeed, these last are able to form complex with other RNA, to interact with proteins or nucleic acids. Some are involved in the stress response as well as in various metabolisms that strongly suggests that they could play an important role in the pathogenicity of many bacteria. Enterococcus faecalis and faecium are members of the natural flora of human gastro-intestinal tract. However, some strains can become virulent and provoke urinary tract infections, bacteremia, intra-abdominal infections or endocarditis. Moreover, the development of antibiotic resistances in these microorganisms is in favour of their emergence as an important nosocomial pathogen. Despite the availability of the genomic sequences of several strains, none RNA with regulatory function has been shown in enterococci. Then, identification and characterization of sncRNAs as new regulators of virulence genes in E. faecalis and E. faecium are the main goal of this project and can be divided in 3 major parts:

- research of sncRNAs by “tiling arrays” hybridizations

- functional characterization of some interesting sncRNAs by using corresponding mutant strains

- identification of target genes by bioinformatic, transcriptomic and proteomic approaches

This project is the first global and functional study of regulatory RNAs in enterococci and the expected results will probably give new knowledge about mechanisms that could explain how a comensal bacterium can become a dangerous pathogen.

et il est probable que les résultats attendus de ce travail fourniront des éléments de compréhension sur les mécanismes qui permettent à un germe commensal de devenir un redoutable pathogène

Le candidat, titulaire d’un M2R, devra posséder une bonne expérience pratique dans les domaines de la microbiologie et de la biologie moléculaire. La maitrise des techniques de PCR, de clonage, de mutagénèse, d’extraction d’acides nucléiques est souhaitable. De plus, la connaissance des systèmes de régulations de l’expression des gènes chez les procaryotes serait un atout supplémentaire

The candidate, holder of a M2R, must have good experience in the fields of microbiology and molecular biology. Control of PCR techniques, cloning, mutagenesis, extraction of nucleic acids is desirable. In addition, knowledge of regulation of gene expression in prokaryotes would be an added advantage.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010Laboratoire de microbiologie de l’environnement

EA 956 USC INRA 2017Université de Caen Basse Normandie

Esplanade de la Paix14032 Caen Cedex - France

jean-christophe.giard@unicaen.fr +33 02 31 56 54 10

Unité de recherche d’accueil  Biologie Moléculaire et Cellulaire de la SignalisationUPRES EA 3919

Sujet de thèse Post-conditionnement par les récepteurs couplés aux protéines G

Post-conditioning by G protein-coupled receptors

L’équipe UPRES EA 3919 « biologie moléculaire et cellulaire de la Signalisation » fait partie de l’IFR 146 ICORE de l’Université de Caen Basse Normandie. Elle est dirigée par le Dr. Brigitte Sola et comporte trois axes principaux de recherche: la régulation du cycle cellulaire par les cyclines dans les hémopathies malignes, la régulation de la prolifération cellulaire par les estrogènes dans les cancers coliques et la régulation de la signalisation des récepteurs couplés aux protéines G et plus particulièrement, les récepteurs opioïdes.Notre groupe « opioïde » va se rapprocher de la thématique coeur-ischémie lors du prochain plan quadriennal et le projet de recherche proposé, qui s’articule autour de la cardio-protection pharmacologique par les opioïdes, s’inscrit dans cette thématique pour laquelle nous demandons un soutien.

L’ischémie myocardique est une des premières causes de morbi-mortalité. Le postconditionnement, technique développée par Zhao et al. (2003), permet d’en limiter l’étendue et les complications. Une autre stratégie de post-conditionnement est basée sur une approche pharmacologique, qui consiste à activer des récepteurs couplés aux protéines G (RCPG) exprimés dans le coeur et qui permettent de réduire l’étendue de la nécrose myocardique. Parmi les RCPG étudiés, les récepteurs opioïdes semblent intéressants comme l’ont montré les travaux de l’équipe de Gross.Le projet que nous proposons consiste à étudier à la fois in vivo et in vitro les effets cardio-protecteurs des récepteurs opioïdes en post-conditionnement. Peu de travaux ont été publiés dans ce domaine et la plupart réalisés chez l’animal. La description des mécanismes cardio-protecteurs a toutefois été réalisée in vivo avec des 3/7inhibiteurs dont la spécificité est difficile à affirmer. Le but de notre travail est de caractériser plus précisément les voies de signalisation de la cardio-protection in vitro.Pour cela, nous utiliserons des cardiomyocytes humains transformés.1. Vérification de l’effet cardio-protecteur in vitro par les opioïdes.2. Description des voies de signalisation activées par les récepteurs opioïdes(AMPc, Ca2+, MAPkinases..) en conditions normoxies et anoxies.3. Expression des récepteurs opioïdes avant et après ischémie évaluée par différentes approches : RT-qPCR, binding, immunocytochimie.4. La mitochondrie étant au centre des effets cardio-protecteurs, nous envisageons de décrire les voies de transduction entre les récepteurs et les mitochondries, et notamment le pore de transition membranaire.

Our research group UPRES EA 3919 named « molecular and cellular biology of signaling » belongs to IFR 146 ICORE of the University of Caen. This group is directed by Dr. Brigitte Sola and includes 3 major topics : regulation of cell cycle by cyclins in malignant hemopathy, regulation of cell proliferation by. estrogens in colon cancer and regulation of signal transduction mediated by G protein-coupled receptors and especially opioid receptors.For the next plan quadriennal, we plan to associate with others researchers (physiologists, cardiac imager, anesthesiologist) to create a “heart and ischemia” group. In this laboratory, we propose to study pharmacological cardio-protection by opioids.

Heart ischemia is one of the most frequent cause of morbid-mortality. Postconditioning was developed by Zhao et al. (2003) to reduce myocardial lesions. Another strategy of post-conditioning is based on pharmacological approaches.Various G protein-coupled receptors (GPCRs) are expressed in heart and their activation enable to limit size of myocardial necrosis. Among GPCRs, opioid receptors were shown to be an interesting target as demonstrated by Gross’s laboratory.We plan to study opioid-induced cardio-protection in post-conditioning both in vitro and in vivo. Few works have been published, and mostly in vivo, to describe mechanisms of cardio-protection. Those studies are based on the use of inhibitors of signaling proteins whose specificity is rarely obtained. Our goal is to better characterize these cardio-protection signaling pathways in vitro. Materials : human transformed cardiomyocytes.1. Verification of cardio-protective effects by opioids in vitro.2. Description of signaling pathways activated by opioid receptors (cAMP, Ca2+, MAPkinases..) in normal and hypoxemia.3. Opioid receptor expression by different methods (RT-qPCR, binding, immunofluorescence) in normal and hypoxic conditions.4. As mitochondria were described as the main organelle in cardio-protection, we’ ll try to describe signaling pathways between opioid receptors and mitochondria, and especially the regulation of the mitochondrial permeability transition pore.4/75. Finally, while noble gases (helium, xenon, argon) are described as neuroprotective agents, we’ll study, in collaboration with Dr. Jacques Abraini (Cycéron), the combination of opioid agonists with nobles gases in cardioprotection with in vitro and in vivo.

5. Alors que les gaz rares (helium, xenon, argon) sont décrits comme neuroprotecteurs,nous étudierons, en collaboration avec le Dr. Jacques Abraini (Cycéron), la combinaison des gaz rares et des opioïdes dans la cardio-protection à la fois chez l’animal et in vitro.Le candidat devra avoir une expérience en culture cellulaire, en biologie cellulaire, une expertise dans le domaine de la pharmacologie et plus particulièrement sur les récepteurs couplés aux protéines G. De façon plus précise, il devra avoir une expérience en binding, dans le dosage des seconds messagers ainsi qu’en microscopie confocale afin d’étudier la localisation de protéines membranaires et intracellulaires. Il devra avoir des notions sur les tests utilisés pour quantifier la mort cellulaire et éventuellement l’apoptose.

Technical skills required for this project are cell culture, cellular biology techniques, a strong background in pharmacology and particularly in the G protein-coupled receptor field. More precisely, the candidate should have an experience in binding experiments, second messengers assays and confocal microscopy to study localization of plasma membrane and intracellular proteins. Notions in cell death assays and apoptosis would be appreciated.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010Biologie Moléculaire et Cellulaire de la Signalisation

UPRES EA 3919Université de Caen Basse Normandie3ème étage, Avenue côte de nacre CHU

14032 Caen cedex allouche-s@chu-caen.fr

+33 02 31 06 54 19

Unité de recherche d’accueil  Groupe de Recherche Antimicrobiens et Micro-organismes (G.R.A.M.)

UPRES EA 2656Sujet de thèse Etude du rôle du facteur SigmaD

dans le contrôle de l’expression des autolysines et de la flagelline chez Clostridium difficile

Analysis of the implication of SigmaD in expression of autolysins and flagellin in Clostridium difficile

La politique de recherche des bactériologistes de l’équipe G.R.A.M. est construite sur deux axes: - Phylogénie et diversité génétique des bactéries à Gram positif, Staphylococcus et Clostridium : variabilité des gènes impliqués dans le turn-over de la paroi, conséquences sur la virulence et l'activité des antibiotiques.- Dynamique de la paroi bactérienne et bactéricidie des antibiotiques : rôle des autolysines dans la bactéricidie des antibiotiques ciblant la paroi bactérienne et la réponse au stress chez les bactéries à Gram positif.

Notre équipe étudie les autolysines (peptidoglycane hydrolases) des bactéries du genre Clostridium, afin d’analyser leur rôle physiologique, leur contribution à la virulence, et leur implication dans les mécanismes de la bactéricidie par les antibiotiques. Nous étudions particulièrement le système autolytique de Clostridium difficile, bactérie entéropathogène majeure, responsable de diarrhées, voire de colites pseudomembraneuses, sous antibiothérapie.

Nous avons caractérisé dans l’équipe deux autolysines chez C. difficile (Acd) (Dhalluin et al., Microbiology 2005) et chez C. perfringens (Acp) (Camiade et al., J. Bacteriol. 2010 in press). Bien que présentant le même type d’activité hydrolytique (N-acétylglucosaminidase), ces deux autolysines exercent manifestement des fonctions physiologiques différentes : Acp est responsable chez C. perfringens de la séparation des cellules filles et est impliquée dans l’activité bactéricide de la vancomycine, alors que Acd ne semble impliqué dans aucun de ces deux phénomènes chez C. difficile. Le système autolytique de C. difficile pourrait, par analogie à Bacillus subtilis, être sous le contrôle d’un facteur homologue de SigmaD contrôlant, chez B. subtilis, l’expression des protéines flagellaires et de certaines autolysines.

Le travail proposé visera à étudier, par mutagénèse et complémentation, les fonctions des régulateurs SigD et anti-SigD de C. difficile :

- vis-à-vis de l’expression du système autolytique et ses conséquences :

- dans la multiplication cellulaire (septum de division)

- dans la réponse aux antibiotiques bactéricides (amoxicilline, vancomycine).

- dans l’expression de la virulence, par les propriétés lytiques sur la paroi bactérienne (libération des toxines, synthétisées sans peptide signal ; libération de produits de clivage du peptidoglycane à activité pro-inflammatoire) ;

- sur la synthèse des flagelles et l’expression

The scientific project of G.R.A.M. research group is developed by bacteriologists in two related main topics: - Phylogeny and genetic diversity of Gram-positive bacteria, staphylococci and clostridia: variability of genes implicated in cell wall dynamics, implications for virulence and antibiotic activity.- Cell wall dynamics and bactericidal activity of antibiotics : implication of autolysins in bactericidal activity of cell wall targeting antibiotics, and in stress-induced autolysis of Gram positive bacteria.

Our laboratory is studying autolysins (peptidoglycane hydrolases) of bacteria of the genus Clostridium, to investigate their physiological role, and their implication in virulence or in bactericidal activity of antibiotics. We focuse on the analysis of the autolytic system of Clostridium difficile, a major etiological agent of antibiotic-associated diarrheae and pseudomembranous colitis.We characterized two autolysines in C. difficile (Acd) (Dhalluin et al., Microbiology 2005) and in C. perfringens (Acp) (Camiade et al., J. Bacteriol. 2010 in press). Although displaying the same type of hydrolytic activity (N-acetylglucosaminidase), these autolysins are not implicated in the same functions : Acp is involved, in C. perfringens, in separation of daughter cells during vegetative growth and in bactericidal activity of vancomycin, whereas Acd does not seem implicated in such functions in C. difficile. The autolytic system of C. difficile could be controlled by an homologuous factor homologue of SigmaD which regulates, in Bacillus subtilis, the expression flagellin and autolysins.The aim of the present project is to analyze, through mutagenesis and complementation, the role of SigD et anti-SigD putative regulators in C. difficile, regarding :

- the expression of the autolytic system, and its consequences :

- in vegetative growth (formation of division septa)

- in bacterial response to bactericidal antibiotics (amoxicillin, vancomycin).

- in the expression of virulence, through lytic properties on bacterial cell wall (liberation of toxins, synthetized without signal peptide ; liberation of peptidoglycan breakdown products with pro-inflammatory activity) ;

- flagellin synthesis and expression of mobility : C. difficile flagellin is implicated in colonization of the digestive tract through adhesin properties, and is displays immunogenic properties relevant for vaccination.

de la mobilité : en effet, la flagelline de C. difficile est impliquée dans la colonisation digestive par ses propriétés d'adhésine, et constitue l’une des protéines de colonisation les plus immunogènes dans une optique vaccinale.

formation souhaitée en bactériologie moléculaire (clonage-expression, mutagénèse dirigée-complémentation, analyse bio-informatique des génomes), chimie des protéines. microscopie électronique.

Formation in molecular bacteriology (cloning-expression, mutagenesis-complementation, bioinformatics analysis of genomes), protein chemistry, electron microscopy.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010Groupe de Recherche Antimicrobiens et Micro-organismes (G.R.A.M.)

UPRES EA 2656Université de Rouen, UFR Médecine-Pharmacie

Laboratoire G.R.A.MJean-louis.pons@univ-rouen.fr

22 Boulevard Gambetta76183 ROUEN Cedex

  Unité de recherche d’accueil Laboratoire ADEN EA4311Faculté de Médecine-Pharmacie

Nutrition et inflammation intestinaleSujet de thèse Evaluation du profil de protéines

ubiquitinées au cours de l’inflammation intestinale

Evaluation of ubiquitinated proteins during intestinal inflammation

Les travaux du groupe ADEN (EA4311 « Nutrition et Inflammation intestinale »), intégré à l’IFR MP 23, sont focalisés sur les troubles du comportement alimentaire, le syndrome de l’intestin irritable (SII) et les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), pathologies qui ont en commun l’inflammation intestinale, le dysfonctionnement de l’axe intestin-cerveau et offrent des opportunités de thérapeutiques innovantes (pharmaconutrition, neurostimulation). L’approche physiopathologique et thérapeutique est menée depuis le niveau moléculaire jusqu’à l’évaluation clinique. Cette démarche intégrée est rendue possible par les compétences multidisciplinaires des chercheurs et les outils du groupe ADEN, sur le site de la Faculté et dans les services hospitaliers impliqués.

Le syndrome de l’intestin irritable (SII) et les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) qui incluent la maladie de Crohn (MC) et la rectocolite hémorragique mettent en jeu une dérégulation de la réponse immuno-inflammatoire au niveau de la muqueuse intestinale. Ces différentes pathologies représentent des problèmes de santé publique touchant une population importante (5% pour les MICI, 10-15% pour le SII), et nécessitent des progrès physiopathologiques et thérapeutiques.

Le système protéolytique Ubiquitine-protéasome est impliqué dans la régulation de nombreux processus cellulaires, comme le cycle cellulaire, la réponse inflammatoire ou l’apoptose. L’activité protéolytique du protéasome implique deux étapes majeures : l’ubiquitination de protéines, qui cible les protéines à dégrader, puis la dégradation de ces protéines ubiquitinées par le protéasome 26S. Des études récentes suggèrent que des modifications de la protéolyse liée au protéasome seraient impliquées dans la physiopathologie de la MC et du SII mais le profil de protéines ubiquitinées au cours de l’inflammation intestinale n’a pas été étudié.

L’objectif de ce projet est donc de caractériser le profil des protéines ubiquitinées au cours d’une inflammation intestinale et de le comparer à celui observé dans l’intestin sain. Cette approche sera réalisée sur des lignées de cellules épithéliales intestinales, Caco-2 et HCT-8, dans des modèles animaux de SII et de MC puis sur des prélèvements intestinaux de patients. L’étude du profil des protéines ubiquitinées sera réalisée par analyse protéomique combinée à des immunoblots.

Ce projet devrait permettre de mieux comprendre le rôle du système ubiquitine-protéasome dans la physiopathologie du SII et de la MC et ouvrir de nouvelles perspectives en termes de ciblage thérapeutique

The research topics of our group, integrated to the IFRMP, are mainly dedicated to the study of eating disorders, irritable bowel syndrome (IBS) and inflammatory bowel diseases (IBD). These pathologies share common features of intestinal inflammation and dysregulation of the gut-brain axis and offer great opportunities for innovative therapeutic strategies (immunonutrition, neurostimulation). Our investigations explore the underlying mechanisms of these diseases from the molecular level to clinical trials. This broad range of research from the bench to the bedside is the result of our research strategy that brings together basic and clinical sciences, in a tight collaboration between laboratory scientists and health professionals.

Irritable bowel syndrome (IBS) and Inflammatory bowel diseases (IBD) including Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis are characterized by a dysregulation of the intestinal immune-inflammatory response. These diseases are of major health concern because of their high prevalence (5% for IBD, 10-15% for IBS), and new pathogenic and therapeutics advances are needed.

The Ubiquitin-proteasome system is involved in the regulation of several cellular pathways including cell cycle, inflammatory response or apoptosis. Protein degradation by the ubiquitin-proteasome system involves two steps: ubiquitinylation of the targeted proteins to be degraded followed by the degradation of these ubiquitinylated proteins by the proteasome. Recent studies suggest that proteasome-mediated protein degradation is implicated during the inflammatory response observed in patients with CD or IBS. However, until now, the pattern of ubiquitinated proteins during gut inflammation has not been reported.

Thus, the aim of this project will be to compare the pattern of ubiquitinylated proteins in inflammatory states as compared to healthy intestine. This project will be performed in intestinal epithelial cell lines Caco-2 and HCT-8, in IBS-like and CD-like animal models and finally in samples obtained from CD and IBS patients. The pattern of ubiquitinylated proteins will be studied by the combination of proteomic analysis and immunoblots. This project should contribute to a better knowledge of the importance of the ubiquitine-proteasome system in the regulation of gut inflammation and open new targeted therapeutic perspectives.

Le candidat devra posséder une solide formation dans les domaines de la biologie/physiologie

The applicant must have a solid training in cell biology/physiology in the context of inflammation. The

cellulaires appliqués à l’inflammation. Le candidat doit maîtriser ou avoir des notions des techniques de culture cellulaire, d’analyses classiques (westernblot, ELISA) et si possible des bases en analyse protéomique

applicant should have some previous knowledge of cell culture and standard techniques (westernblot, ELISA), and if possible some basic experience in proteomic analyses.

Laboratoire ADEN EA4311, Faculté de Médecine-Pharmacie, 22 bd Gambetta, 76183 ROUEN cedexCourriel : moise.coeffier@univ-rouen.fr

Tél. : 02 35 14 82 40

Unité de recherche d’accueil  Groupe Régional d’études sur le CancerEA 1772

Sujet de thèse Evaluation de l’intérêt de l’association d’une molécule BH3-mimétique, l’ABT-737, à différents outils d’inhibition de la protéine Mcl-1 pour le traitement des cancers de l’ovaire réfractaires à la chimiothérapie conventionnelle.

Evaluation of the interest of the association of a BH3-mimetic molecule, ABT-737, with various Mcl-1 inhibition tools for the treatment of ovarian carcinoma refractory to conventional chemotherapy

Le GRECAN (EA1772), unité de recherche rattachée à l’UFR des Sciences Pharmaceutiques, fait partie de l’IFR n°146 ICORE, et du Cancéropôle Nord-Ouest. Accueillie dans les locaux du CLCC François Baclesse, l’unité regroupe des personnels de différentes composantes de l’Université, de l’INSERM, du CNRS, du CLCC, et du CHU. L’objectif général, qui intègre des préoccupations en termes de retombées vers la prévention et la pratique clinique, est de contribuer à la lutte contre le cancer par :

i) la caractérisation des facteurs de risque professionnels et environnementaux ;

ii) l’exploration de voies thérapeutiques innovantes basées sur les progrès récents de la biologie des cancers, et l’introduction de nouveaux outils thérapeutiques ;

iii) l’élaboration de nouveaux outils d’aide au diagnostic, au pronostic et au choix thérapeutique, grâce à l’imagerie appliquée à l’anatomie pathologique. Site internet du GRECAN : www.grecan.org

Les cancers ovariens restent très meurtriers du fait de l’acquisition d’une chimiorésistance au cours des traitements. La protection contre l’apoptose occupe une place essentielle dans cette chimiorésistance, la surexpression des deux protéines anti-apoptotiques Bcl-xL et Mcl-1 jouant un rôle majeur. Notre équipe a ainsi démontré que l’inhibition simultanée de ces deux cibles par deux siRNA permettait d’induire à elle seule la mort des cellules résistantes à la chimiothérapie. La définition d’outils utilisables en clinique pour inhiber ces deux cibles est donc essentielle pour le succès clinique de cette stratégie.

iv) Les molécules BH3-mimétiques, qui miment le domaine BH3 des protéines pro-apoptotiques de la famille Bcl-2 constituent aujourd’hui les outils les plus performants pour l’inhibition de Bcl-x.L, l’ABT-737 (Laboratoire ABBOTT) étant la molécule la plus puissante de cette famille. Cependant, cette molécule n’est pas capable d’inhiber l’activité de la protéine Mcl-1, ce qui nécessite l’utilisation concomitante d’un autre agent. Les dérivés du platine pourraient jouer ce rôle, tel que démontré par notre équipe.

v) Ce projet concerne donc l’évaluation de l’association ABT-737 / platine (carbo- ou cisplatine) in vitro et in vivo (modèles de xénogreffes). Le potentiel thérapeutique de cette association sera également étudié ex vivo sur des nodules tumoraux prélevés chez des patientes. La réponse observée ex vivo sera corrélée avec la réponse clinique [essai clinique en cours de mise en place] afin de caractériser des

GRECAN (EA1772) is a research unit linked to the Faculty of Pharmaceutical Sciences, and is part of IFR n°146 ICORE and of North-West Canceropole. Located in the Comprehensive Cancer Centre François Baclesse, the unit comprises people from various faculties, INSERM, CNRS, François Baclesse Centre and University Hospital. The general research purpose, that integrate preoccupations in terms of transfer toward prevention and clinical practice, is to contribute to the fight against cancer by:

i) identifying and studying occupational and environmental risk factors ;

ii) exploring new therapeutic opportunities, based on most recent progresses in cancer biology, and introducing new therapeutic tools ;

iii) Elaborating new tools for prognosis and therapeutic options through the development of image processing software dedicated to cyto- and histopathology.

Chemoresistance acquisition frequently leads to therapeutic failure in ovarian carcinoma. Protection against apoptosis is strongly involved in this chemoresistance, and both Bcl-xL and Mcl-1 anti-apoptotic protein expression appear as determinant parameters. Our team recently demonstrated that their concomitant inhibition allows strong apoptosis induction in chemoresistant ovarian cells. The design of convenient tools is therefore a major challenge for the sucessfull clinical application of this strategy.BH3-mimetic molecules, which mimic the BH3 domain of pro-apoptotic proteins of Bcl-2 family, are the most powerful tools to inhibit Bcl xL, and among them, ABT-737 is probably the most potent molecule. However, ABT-737 is unable to inhibit Mcl-1 activity, the concomitant use of another agent thus remaining necessary. Platinum derivatives could present this property.This project thus aims to evaluate the interest of the association of ABT-737 with carbo- or cisplatin. We will study the interest of this strategy in vitro and in vivo (xenografts models). The therapeutic potential of this association will also be studied on tumour nodes taken from patients. The response to treatment observed ex vivo will thus be correlated with the observed clinical response (clinical trial being cuurently in preparation), in order to define predictive parameters. This multidisciplinary work will use conventional cellular and molecular biology technics as well as quantitative histo-imagery or in vivo metabolic imagery. It will be performed in collaboration with multiple clinical partners

facteurs prédictifs de la réponse au traitement. Il s’agit d’un travail multidisciplinaire qui fera appel aux techniques conventionnelles de biologie cellulaire et moléculaire et à des procédés d’histo-imagerie quantitative et d’imagerie métabolique in vivo. Il sera réalisé en partenariat étroit avec les services cliniques du Centre F. Baclesse et avec le Laboratoire Pharmaceutique ABBOTT.

of F. Baclesse Comprehensive Cancer Center and ABBOTT Pharmaceutic Laboratory.

Le candidat devra être titulaire d’un master en Biologie Cellulaire et Moléculaire ou de Cancérologie. Il devra maîtriser les bases de la biologie cellulaire oncologique. Il devra être capable de prendre très rapidement en main les techniques de culture cellulaire, de mise en évidence de l’apoptose et d’étude de l’expression génique. La manipulation préalable d’ARN interférents et une expérience en expérimentation animale seraient également appréciées. Le candidat devra présenter une aptitude au travail en équipe, et s’intégrer dans le cadre d’un projet faisant appel à diverses collaborations multidisciplinaires

The candidate should be holder of a master in Cellular and Molecular Biology or Oncology. He or she will have to control basic knowledge in oncological cellular biology. He or she should be able to quickly master cell culture, apoptosis and gene expression studies. Previous experience in the field of siRNA and of animal experimentation would be appreciated. The candidate should present an aptitude to team work in the context of a multidisciplinary collaborative work.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010Université de Caen Basse-Normandie

Groupe Régional d’études sur le CancerCLCC F. Baclesse, 3 avenue du général Harris, 14076 Caen cedex

Courriel : p.gauduchon@baclesse.frTél. : 02.31.45.50.70 (sec.)

  Unité de recherche d’accueil Génétique Médicale et Fonctionnelle du Cancer et des

Maladies NeuropsychiatriquesInserm U614 – IFRMP 23

Sujet de thèse Développement d’une stratégie d’immunothérapie des cancers colorectaux basée sur l’utilisation de cellules présentatrices d’antigène artificielles

Development of an immunotherapy strategy in colorectal cancers based on the use of artificial antigen presenting cells

L’axe stratégique de l’unité Inserm U614 est le développement de nouvelles méthodes d’exploration du matériel génétique permettant d’une part la compréhension de la physiopathologie des maladies génétiques et, d’autre part, l’optimisation du diagnostic et la prise en charge de ces maladies. L’unité U614 fait partie de l’Institut Hospitalo-Universitaire de Recherche Biomédicale de Rouen.

L'immunothérapie par transfert de lymphocytes T cytotoxiques (LTC) spécifiques d'antigènes tumoraux est une nouvelle approche thérapeutique très prometteuse dans le cadre des cancers. Pour activer et expandre in vitro de tels LTC, étape limitante de cette approche, nous avons construit des cellules présentatrices d’antigène artificielles (CPAA, Latouche & Sadelain, Nature Biotechnology, 2000). Par rapport aux cellules dendritiques, CPA autologues les plus "puissantes" in vivo, ces cellules présentent les avantages suivants :

(i) elles permettent une activation des LTC supérieure,

(ii) elles sont utilisables pour tout patient dont les cellules expriment la même molécule HLA de classe I,

(iii) elles correspondent à des lignées cellulaires stables utilisables immédiatement, et

(iv) elles représentent des CPA "universelles".

Notre projet a pour objectif de développer une stratégie d’immunothérapie dans les cancers colorectaux (CCR) basée sur l’utilisation de ce type de CPAA. Nous souhaitons :

- d’une part, cibler les antigènes partagés par l’ensemble des CCR, généralement associés à une instabilité chromosomique, et sélectionner les plus immunogènes afin de développer une stratégie d’immunothérapie applicable au plus grand nombre de patients,

- d’autre part, cibler les néo-antigènes potentiellement immunogènes spécifiques des CCR avec phénotype RER (Replication ERror), associés à une instabilité microsatellitaire, afin de développer, à plus long terme, une stratégie d’immunothérapie en particulier chez les patients jeunes atteints de syndrome HNPCC (Hereditary Non Polyposis Colorectal Cancer).Les étapes essentielles du projet, qui font appel à différentes techniques de biologie moléculaire et de biologie cellulaire, sont les suivantes :(i) détermination des antigènes les plus immunogènes, (ii) construction de CPAA exprimant ces antigènes, et (iii) activation et expansion de LTC spécifiques à activité

The strategic axis of U614 is the development of new methods of exploration of the genetic material to allow, on one hand, the comprehension of the physiopathology of genetic diseases and, on the other hand, the optimisation of the diagnosis and the management of these diseases. U614 is part of the University Hospital Institute for Biomedical Research of Rouen.

Immunotherapy based on the adoptive transfer of tumor antigen-specific cytotoxic T lymphocytes (CTLs) is a very promising new therapeutic approach in cancers. To activate and expand in vitro such CTLs, limiting step of this approach, we constructed artificial antigen presenting cells (AAPCs, Latouche & Sadelain, Nature Biotechnology, 2000). Compared to dendritic cells, the most "powerful" autologous APCs in vivo, these cells present the following advantages:

(i) they allow a greater CTL activation,(ii) they can be used for any patient sharing a same

HLA class I molecule,(iii) they correspond to readily available stable cell

lines, and(iv) they represent "universal" APCs.

The goal of our project is to develop an immunotherapy strategy in colorectal cancers (CRCs) based on the use of this type of AAPCs. Our objective is:

- to target antigens shared by most CRCs, with chromosome instability, and to select the most immunogenic ones to develop an immunotherapy strategy for most patients,

- to target potentially immunogenic neo-antigens, specific of RER (Replication ERror) CRCs, with microsatellite instability, to develop an immunotherapy strategy in particular for HNPCC (Hereditary Non Polyposis Colorectal Cancer) young patients.

The main steps of the project, wich require molecular biology and cellular biology techniques, are:

(i) to select the most immunogenic antigens,(ii) to construct AAPCs expressing these antigens,

and(iii) to activate and expand anti-tumor specific CTLs

anti-tumorale

Le candidat devra avoir des connaissances approfondies :

- en biologie cellulaire (culture de lignées cellulaires et de cellules primaires, transduction, phénotypage, …)

- en génétique moléculaire, et notamment maîtriser les techniques de clonage, séquençage, PCR et RT-PCR,

- en immunologie, et notamment en immunologie anti-cancéreuse

The candidate must have robust knowledge:- in cell biology (cell line and primary cell culture,

transduction, phenotyping,…)- in molecular biology, especially in cloning,

sequencing, doing PCR and RT-PCR,… - in immunology, especially tumor immunology

Génétique Médicale et Fonctionnelle du Cancer et des Maladies NeuropsychiatriquesInserm U614 – IFRMP 23

Faculté de Médecine et Pharmacie, 22 bvd Gambetta, 76183 Rouen Cedex 1Courriel : thierry.frebourg@chu-rouen.fr

Tél : 02 35 14 82 80

Unité de recherche d’accueil Différenciation et Communication Neuronale et Neuroendocrine (DC2N)

INSERM U982de thèse Etude de la différenciation

neuroendocrine dans la tumorigenèse prostatique

Neuroendocrine differentiation in prostate

cancer progression

De nombreuses pathologies des systèmes nerveux et neuroendocrine sont associées à des anomalies de la différenciation, la survie et l'intercommunication cellulaire. Les travaux de recherche menés au sein de l’INSERM U982 visent à élucider des mécanismes cellulaires et moléculaires de la différenciation et de la communication neuronale et neuroendocrine en physiologie et physiopathologie. Grâce à une approche multidisciplinaire, le soutien de plateformes IBISA en imagerie cellulaire et en protéomique, ainsi que des collaborations avec de nombreux autres partenaires, les recherches menées au sein des équipes «Génomique fonctionnelle et physiopathologie neuroendocrine»/ «Différenciation neuroendocrine et communication intercellulaire dans les tumeurs hormono-dépendantes et les néoplasies corticosurrénaliennes »  constituent un continuum depuis l’identification de biomarqueurs, de gènes tumoraux et de miRNA, jusqu’au développement de marqueurs pronostiques et diagnostiques et de nouveaux outils thérapeutiques de ces différentes pathologies. Le cancer de la prostate (CaP) est le cancer le plus fréquent en France avec 62 245 nouveaux cas en 2005. Il constitue la 4è cause de décès chez l’homme en France et représente donc un problème majeur de santé publique. Les causes de la transition du CaP du stade androgéno-dépendant (AD) vers le stade androgéno-indépendant (AI), qui est incurable, restent mal connues. Néanmoins, le fait que l’androgéno-indépendance s’accompagne fréquemment d’une différenciation neuroendocrine (NED), suggère que les cellules neuroendocrines (NE) pourraient jouer un rôle crucial dans le développement tumoral au stade AI, notamment via les neuropeptides qu’elles produisent, et dont certains sont connus pour favoriser la croissance, la dissémination et la néoangiogenèse dans d’autres types de cancers.

Dans ce contexte, la connaissance des mécanismes moléculaires et cellulaires qui déterminent l’acquisition du phénotype NE, est essentielle pour comprendre l’évolution des CaP. Parmi les acteurs moléculaires pouvant constituer un maillon clé dans la différenciation NE, figure REST. Ce répresseur de la transcription orchestre la mise en place et le maintien du phénotype NE dans les cellules PC12 et est, de manière intéressante, impliqué dans diverses pathologies. REST est différentiellement exprimé dans des lignées cancéreuses prostatiques AD et AI après induction de la NED. Nous rechercherons d’éventuelles variations d’expression de REST dans du tissu prostatique humain sain et tumoral AD et AI. Le rôle de REST dans la progression du CaP sera évalué en recherchant ses effets sur la croissance, l’invasion et la NED des cellules LNCaP, PC3 et DU145, ainsi que dans un modèle de xénogreffes de cellules LNCaP chez

Several pathologies of the central nervous system and the neuroendocrine system are associated with abnormalities in cell differentiation, migration, survival and intercommunication. The research project conducted at INSERM U982 aims to elucidate the cellular and molecular mechanisms of neuronal and neuroendocrine differentiation and communication involving neuropeptides, in physiology and pathophysiology. Using a multidisciplinary approach with the support of imaging and proteomic IBISA platforms, and in collaboration with numerous other prestigious partners, the work carried out by the teams named “Functional genomics and neuroendocrine pathophysiology”/”Neuroendocrine differentiation and intercellular communication in hormono-dependant tumors and adrenocortical neoplasms” constitutes a continuum from the characterization of biomarkers, tumoral genes and miRNA, to the development of pronostic and diagnostic tools as well as new therapeutics tools for these pathologies.

Prostate Cancer (PCa) is the leading cause of cancer deaths in France with 62 245 new cases in 2005. It is the fourth most common cause of cancer-related deaths among men in France and thus, constitutes a major health problem. The natural history of PCa while on androgen deprivation therapy is the attainment of an incurable androgen-independent (AI) state. The specific mechanisms involved in the progression of PCa from androgen dependence to androgen independence, are still poorly understood. However, the fact that a neuroendocrine differentiation (NED) is frequently observed at the AI state, strongly suggests that neuroendocrine (NE) cells could play a critical role in tumor progression. This could be notably due to the variety of neuropeptides that they secrete. Some of them, are known to promote growth, metastasis and neoangiogenesis in other cancer types. Thus, NED process is of general oncological interest.In this context, a better understanding of the underlying molecular and cellular mechanisms leading to NE differentiation would help understanding PCa progression. The transcriptional regulator REST could play a critical role in NED in PCa. Of interest, this protein is governing the establishment and the maintenance of the NE phenotype in PC12 cells, and is also involved in various pathologies. REST is differentially expressed in AD and AI prostate cancer cell lines after induction of NED. We are planning to measure REST expression (mRNA and protein levels) in normal prostate tissue as well as AD and AI prostate tumor samples. The role of REST in PCa progression will be studied by measuring its effects on growth, invasion and NED of prostate cancer cells, as well as on a xenograft model of LNCaP cells in nude mice.This project would contribute: i) to get a better

des souris « nude ». Ce projet de recherche permettra i) de comprendre l’importance de la différenciation NE et de REST dans la tumorigenèse, et ii) d’identifier de nouvelles cibles biologiques pour proposer des stratégies thérapeutiques applicables aux stades avancés du CaP.

understanding of NE differentiation and the role of REST in tumorigenesis, and ii) to help identifying new therapeutic targets for advanced PCa

Le(a) candidat(e) devra être titulaire d'un master spécialité ou parcours Physiopathologie. Il(Elle) devra être familiarisé(e) avec la cancérologie et la régulation de l’expression des gènes. Des connaissances en neuroendocrinologie seront également appréciées.D'un point de vue expérimental, le(a) candidat(e) devra maîtriser la culture cellulaire, la manipulation d'animaux de laboratoire, les techniques de Biochimie et de Biologie moléculaire (invalidation de gène) ainsi que les acquisitions d'images en microscopie confocale.

The applicant should be graduated of a Master of Science Specialty or Option Physiopathology. The candidate should be familiar with cancer and gene regulation. Knowledge in neuroendocrinology will be an advantage.The candidate should master culture cells, animal handling, biochemistry and molecular biology technics, as well as confocal microscopy analysis skills.

Différenciation et Communication Neuronale et Neuroendocrine (DC2N)UFR des Sciences et des Techniques

Université de RouenPlace Emile Blondel ; Bâtiment Principal

76821 Mont-Saint-Aignan cedexCourriel : valerie.perrot@univ-rouen.fr

Tél. : 02 35 14 69 45

Unité de recherche d’accueil Unité mixte INSERM Université de Rouen U905 INSERM"Physiopathologie et biothérapies des pathologies

inflammatoires et autoimmunes"Sujet de thèse Etude de l’implication du couple

RasGRP1/RasGRP3 dans le dysfonctionnement du lymphocyte B au cours de la polyarthrite rhumatoïde

Involvement of RasGRP1/RasGRP3 in B cell dysfunction during rheumatoid arhritis

Les principaux thèmes de recherche de l'unité sont : Immuno-régulation; Physiopathologie, diagnostic et biothérapies des maladies auto-immunes musculaires; Physiopathologie, diagnostic et biothérapies de la polyarthrite rhumatoïde; Physiopathologie, diagnostic et biothérapies des maladies immunodermatologiques.

Cette unité, intégrée à l’Institut Hospitalo-universitaire Normandie Rouen et à l'IFRMP 23, a pour thème de recherche les maladies inflammatoires et auto-immunes de l’appareil locomoteur et de la peau. Pour cela, elle développe une recherche fondamentale sur les mécanismes de régulation de la réponse immunitaire normale et pathologique, et une recherche translationnelle incluant des essais cliniques. Adossée au service de rhumatologie, l’équipe «physiopathologie et biothérapies des pathologies immunitaires de l’appareil locomoteur» étudie les mécanismes physiologiques et physiopathologiques de régulation de l’auto-immunité à travers le développement de modèles murins de myosite et d’arthrite auto-immunes, l’analyse du rôle immuno-régulateur des ectonucléotides et participe à la mise en oeuvre d’essais cliniques dans le domaine des myopathies inflammatoires et de la polyarthrite rhumatoïde. Adossée à la clinique dermatologique et au centre de référence national des maladies bulleuses auto-immunes, l’équipe «physiopathologie et thérapeutiques innovantes des maladies immunodermatologiques » étudie les mécanismes physiopathologiques des maladies dermatologiques auto-immunes et des toxidermies médicamenteuses et développe de nouvelles approches thérapeutiques à travers des modèles expérimentaux et des essais cliniques. Parallèlement à l’innovation diagnostique et théranostique (protéome, transcriptome), l’unité développe une recherche sur les biothérapies moléculaires et les thérapies cellulaire et génique.Le lymphocyte B (LB) joue un rôle central dans la physiopathologie de la polyarthrite rhumatoïde (PR). Certaines anomalies des voies de signalisation du récepteur du LB (BCR) peuvent conduire à leur dysfonctionnement, en favorisant notamment l’émergence de l’auto-immunité. Les analyses des transcriptomes de cellules mononucléées et de tissu synovial de PR ont montré une dérégulation de plusieurs gènes impliqués dans les voies de signalisation du BCR dont le gène Ras guanyl nucleotide exchange factor (RasGRP3) exprimé

The main research topics of the unit are :

Immunoregulation;Pathogenesis, diagnosis and biotherapy of inflammatory myopathies;Pathogenesis, diagnosis and biotherapy of rheumatoid arthritis;Pathogenesis, diagnosis and biotherapy of immuno-dermatological diseases.

The Inserm U905 research unit, integrated to the Rouen Institute for Medical Research and innovation (www.ihunormandyrouen.fr) and IFRMP 23, is dedicated to the study of inflammatory and autoimmune diseases of the locomotor apparatus and the skin. To this aim, the laboratory develops a basic research focused on the mechanisms regulating the immune system, in normal and pathological conditions, and a translational research including clinical trials. The team «Pathogenesis and biotherapy of inflammatory diseases of the locomotor apparatus», in close collaboration with the Rheumatology Department of the Rouen University Hospital, studies the physiological and physiopathological mechanisms regulating autoimmunity through the development of murine models of myositis and rheumatoid arthritis, analyses the immuno-regulatory roles of ectonucleotides and contributes to clinical trials in inflammatory myopathies and rheumatoid arthritis. The team «Pathogenesis and innovative therapies of immuno-dermatological diseases», in collaboration with the Dermatology Department of the Rouen University Hospital and the National Reference Centre for Bullous Skin Autoimmune Diseases, investigates the physiopathological mechanisms of autoimmune skin diseases and drug allergy, and develops new therapeutic approaches in immunodermatology through experimental models and clinical trials.The Inserm U905 is strongly involved in the identification of new biomarkers characterized by proteomic and transcriptomic analyses and the development of projects based on molecular biotherapies and celland gene therapies.

B cells play a key role in the rheumatoid arthritis (RA) pathophysiology. Indeed, some intra-cellular pathways of B cell receptor (BCR) can lead to their dysfunction, with notably the autoimmunity dysregulation. Transcriptomic analysis from peripheral mononuclear cells and synovium have shown the dysregulation of several genes involved in the BCR inta-cellular

principalement par les LB. La protéine RasGRP3 active la voie Ras-Raf-Mek-Erk ayant un rôle majeur dans le contrôle de la prolifération des LB. Par ailleurs, dans les modèles murins RasGRP1-/- et RasGRP3-/-, la répression de RasGRP3 au niveau du LB représentait un moyen de régulation de l’auto-immunité induite par la répression de RasGRP1 au sein du lymphocyte T (LT). Or, l’absence de RasGRP1 se traduisait par un lupus érythémateux disséminé (LED) dans ce modèle et chez l’Homme. Sachant que la PR représente un spectre de maladies allant des formes inflammatoires (sans auto-anticorps détectés) aux formes « très auto-immunes » (facteurs rhumatoïdes, anti-CCP, anti-nucléaire), nous suggérons l’hypothèse qu’une dérégulation du couple RasGRP1/RasGRP3 peut contribuer au dysfonctionnement du LB au cours de la PR. Le projet de thèse a donc pour objectif

i) d’étudier les niveaux d’expression du couple RasGRP1/RasGRP3 dans les LB ou LT de sujets sains et dans différentes circonstances pathologiques [LED, Sjögren, arthrose, spondylarthropathie] ;ii) d’identifier une corrélation entre ces niveaux d’expression et l’activité de la maladie ou le titre des auto-Ac de patients atteints de PR;iii) d’étudier les effets du TNF sur ces gènes ; iv) d’étudier les effets de la répression du gène RasGRP3 dans les LB humains sur la prolifération et la synthèse de cytokines. Ceci devrait permettre de mieux comprendre l’implication des LB dans la physiopathologie de la PR.

pathways, including Ras guanyl nucleotide exchange factor (RasGRP3) gene mainly expressed in B cell. RasGRP3 activates the following pathway Ras-Raf-Mek-Erk which controls the B cell proliferation. Moreover, in the RasGRP1-/- and RasGRP3-/- mice, the RasGRP3 under-expression in B cells was a mean to regulate the autoimmunity induced by the RasGRP1 suppression in T cells. The KO mouse for RasGRP1 presented a phenotype similar to the human systemic lupus erythematosus (SLE). Since RA is a disease with a spectrum from inflammatory phenotype (without autoantibodies) to auto-immune phenotype (with rheumatoid factors, anti-CCP, anti-nuclear antibodies), we suggest the hypothesis that the RasGRP1/RasGRP3 dysregulation could contribute to the B cell dysfunction during RA. The objectives of this doctoral programme are :

i) to measure the gene expression level of RasGRP1/RasGRP3 in B and T cells in healthy donors and in different pathologies such as lupus, Goujerot Sjögren, spondylarthropathies;ii) to identify a correlation between these gene exprssion levels with the disease activity or the antibodies titers in RA patients;iii) to evaluate the TNF effects on these genes; iv) to study the effects of RasGRP3 suppression on human B cell proliferation and on their cytokine synthesis. These investigations could help us to better understand the involvement of B cells in RA pathophysiology.

Le candidat devra avoir des connaissances portant sur les mécanismes physiologiques et physiopathologiques en Immunologie humaine. Il est demandé d'avoir des connaissances et une expérience de laboratoire en biologie moléculaire et en culture cellulaire

The applicant should have some skills in the physiological and pathophysiological mechanisms in human Immunology. Experience in laboratory on molecular biology and cellular cultures is required.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010UNIVERSITE DE ROUEN

Inserm 905, 3ème étage, Bâtiment Recherche, Faculté de Médecine-Pharmacie, 22 Bd gambetta, 76183 Rouen cedex 1

Courriel : olivier.vittecoq@chu-rouen.frTél. : 02 32 88 90 19

  Unité de recherche d’accueil UMR CNRS 6232 Ci-NAPS « SP2U » Equipe SP2U « Sérines Protéases et Physiopathologie de

l’Unité Neurovasculaire » unité INSERM U919Sujet de thèse L’Activateur tissulaire du

Plasminogène (tPA) dans le contrôle de la neurotransmission glutamatergique

The tissue type Plasminogen Activator (tPA) in the control of the glutamatergic neurotransmission

L’unité INSERM U919 « sérines protéases et physiopathologie de l’unité neurovasculaire » (SP2U) est une création d’unité de novo au 1er Janvier 2008, faisant suite à un programme INSERM-Avenir 2005. Depuis 2005, nos travaux de recherche se focalisent sur le rôle des protéases et plus particulièrement des sérines protéases, dans le contrôle des évènements moléculaires et cellulaires consécutifs à un accident vasculaire cérébral ou à un traumatisme médullaire. Initialement centrées sur l’influence de ces protéases dans le contrôle de la neurotransmission glutamatergique de type N-Methyl-D-Aspartate, nos recherches se sont élargies à l’ensemble de l’unité neurovasculaire. De même, initialement très fondamentales, nos approches tendent de plus en plus à associer des approches transversales, avec comme objectifs le développement et l’utilisation d’outils diagnostiques ou thérapeutiques pour la clinique.

Nous avons démontré que le tPA potentialise la signalisation des récepteurs glutamatergiques de type NMDA et la neurotoxicité associée (Nat Med, 2001, 2003, J. Biol. Chem., 2004 ; J Cereb Blood Flow Metab., 2008, Brain., 2009). Plus récemment, nous avons démontré que cet effet requière la présence de la sous-unité NR2D des récepteurs NMDA (Cell Death Differ., 2009). L’objectif de ce programme est de décrire les évènements moléculaires fins par lesquels le tPA peut influencer la fonction et le devenir neuronal. Pour cela, nous avons généré un ensemble de mutéines dérivées du tPA (tPAdeltaF, tPAdeltaGF, tPAdeltaK1, tPAdeltaK2, tPAK2* (mutation(s) ponctuelle(s)) - Collaboration avec R. Lijnen, Leuven University).a- Toutes ces mutéines seront caractérisées pour leur activité fibrinolytique et leur aptitude à influencer le devenir neuronal in vitro. Ces études incluront des mesures d'influx de calcium, d'activation de Kinases, de survie neuronale, d'interaction avec les récepteurs NMDA, d'activation extra et synaptique, de L-LTP (coll. P. Dutar, Paris), d'activation du pro-BDNF et du pro-PDGF-C. Chaque mutéine sera également utilisée pour des immuno-précipitations permettant d’identifier de nouveaux partenaires potentiels (coll. plateforme proteomique, IFRMP23, Rouen).b- Les mutéines sélectionnées (a) seront testées in vivo chez la souris en utilisant un modèle thrombo-embolique. La reperfusion induite par le tPA et ses mutéines sera évaluée. Le volume ischémié sera mesuré par analyses histologiques et par IRM (7T). Le comportement et les scores neurologiques seront également étudiés. La surexpression des mutéines au niveau plasmatique sera envisagée par injection hydrodynamique d’ADN.

The INSERM Unit U919 entitled « serine proteases and physiopathology of the neurovascular unit » (SP2U) was created “de novo” in January 1st 2008 following a 3 years program INSERM-Avenir started in 2005. Our work of research from 2005 is mainly dedicated to the role of serine proteases in the control of the molecular events occurring during ischemic stroke and spinal cord injuries. Initially focused on the influence of serine proteases in the control of the N-Methyl-D-Aspartate glutamatergic signalling and neurotoxicity 2005-2010, a second axis was more recently developed focusing on the role of serine proteases in the control of the homeostasis of the blood brain barrier 2008-2010. Our research is always performed with as objectives, the development of original tools for putative clinical applications.

We have previously demonstrated that tPA can promote NMDA receptor-mediated signalling and subsequent neurotoxicity (Nat Med, 2001, 2003, J. Biol. Chem, 2004, J Cereb Blood Flow Metab., 2008, Brain, 2009). More recently, we have evidence that this effect requires the presence of the NR2D subunit in functional NMDA receptors (Cell Death Differ, 2009).

The aim of this program is to understand the molecular events through which tPA can influence neuronal functions and outcome.

We have generated a set of tPA related muteins (tPAdeltaF, tPAdeltaGF, tPAdeltaK1, tPAdeltaK2, tPAK2* (point mutations) (coll R. Lijnen, Leuven University).a- All these home made molecules will be characterized for their fibrinolytic activity, ability to influence neuronal functions in vitro. Investigations will include calcium influx, kinase activation, neuronal death/survival, NMDA receptor subunits interaction and cleavage, activation of either synaptic or extrasynaptic NMDA receptors, long term potentiation and long term depression (coll Dutar, Paris), activation of pro-BDNF and pro-PDGF-C. Each mutein will also be used as bait for pull down assays for putative proteomic identification of new partners (collaboration plateform proteomic, XXX, Rouen). b- Selected muteins (a) will be tested in vivo, in in situ thrombo-embolic stroke model in mice with rtPA-induced reperfusion. The evolution of brain injury will be evaluated by using histological and MRI analyses (7T), behaviour tasks/neurological scores. The opportunity to selectively over-express tPA related muteins in the plasma will be envisaged by using an hydrodynamic injection of plasmid DNA.Long term perspectives c-Based on results obtained in a and b, transgenic mice over-expressing selected tPA

Perspectives à long terme c- Sur la base des résultats obtenus en a- et b-, des souris transgéniques surexprimant l’une de ces mutéines seront générées afin d’évaluer les phénotypes et découvrir de nouvelles fonctions potentielles du tPA (coll. clinique de la souris).

related muteins in brain structures will be generated for evaluation of differential phenotype and discovery of putative new functions for tPA.

Formation en neurosciences (master II) avec de bonnes bases en biologie moléculaire

Neurosciences training (master degree) including bases in molecular biology.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010

UMR CNRS 6232 Ci-NAPS « SP2UGIP Cyceron, Boulevard Henri Becquerel, 14073 Caen Cedex.

Courriel : vivien@cyceron.frTél. : 0231470160/66

  Unité de recherche d’accueil Laboratoire d’Ecotoxicologie – Milieux AquatiquesEA 3222

Sujet de thèse Recherche de la présence et des effets associés aux anti-androgènes sur la physiologie du Gardon (Rutilus rutilus)

Study of the occurrence and associated effects of anti-androgens on the Roach (Rutilus rutilus) physiology

Le Laboratoire d’Ecotoxicologie – Milieux Aquatiques (LEMA) de l’Université du Havre a pour objectif d’identifier les effets et de mettre en évidence les mécanismes d’action des xénobiotiques sur les organismes aquatiques. Les travaux mettent en œuvre une combinaison d’outils visant à intégrer différents niveaux de la complexité biologique (des molécules aux organismes et aux populations) et de les valider par une approche à la fois de terrain et de laboratoire. Les activités du LEMA sont structurées suivant deux axes, dont l’un cherche à identifier les acteurs moléculaires impliqués dans la réponse des organismes aux xénobiotiques. Elle implique notamment la mise en œuvre de techniques d’étude du transcriptome, du protéome et du métabolome afin de dégager les relations mécanistiques entre les réponses et de pouvoir développer des biomarqueurs pertinents lors d’une altération toxicologique. Le second axe est dédié à l’étude et à la compréhension d’altérations de fonctions physiologiques clés des organismes : immunotoxicité, neurotoxicité, génotoxicité et perturbations du système endocrinien. Les approches impliquent tout particulièrement des études à la fois moléculaires (gènes, enzymes, molécules signal), cellulaires (cytométrie en flux, toxicocinétique), histopathologiques ainsi que la mesure de paramètres biotiques et écologiques.

Récemment, il a été découvert que les effluents d'eaux usées peuvent contenir des niveaux élevés de composés présentant une activité anti-androgénique. Or les anti-androgènes peuvent bloquer l'activité des récepteurs aux androgènes (AR) et pourraient interférer avec la physiologie des organismes vivants et conduire à des démasculinisation d'organismes aquatiques tels que les poissons. Une combinaison d'approches est proposée afin d'étudier la fréquence et l'effet de ces composés.Un test cellulaire utilisant un système rapporteur permettant d’étudier la capacité d’induction d’une activité de transcription dépendante du récepteur AR (test YAS : yeast androgen screen) sera utilisé pour étudier la présence d'anti-androgènes à la fois dans les sédiments et dans la bile du gardon (Rutilus rutilus) échantillonnées en France, où certaines de ces activités ont été récemment détectés dans un des échantillons de sédiments. Les effets de ces composés sur le métabolisme des stéroïdes seront alors étudiés en mesurant l'expression de gènes clés (Star, AR, CYP3, CYP 17, CYP 11, CYP19a1b et CYP19a1a), l'activité de l’aromatase gonadique et cérébrale (CYP19a1b et CYP19ala) et la synthèse d'oxy-androgènes chez les poissons mâles.

The Laboratory of Ecotoxicology - Aquatic Environments (LEMA) of the University of Le Havre aims to identify the effects and to highlight the mechanisms of action of xenobiotics on aquatic organisms. Research strategy involves a combination of tools to integrate different levels of biological complexity (from molecules to organisms and populations) and to validate the approach to both field and laboratory. LEMA's activities are structured along two axes; one seeks to identify the molecular mechanisms involved in the response of organisms to xenobiotics. It implies the implementation of studies on the transcriptome, proteome and metabolome to identify the mechanistic relationships between responses and to develop biomarkers relevant to any toxicological alteration. The second axis is dedicated to the study and understanding of alterations in key physiological functions of the organisms. This includes studies on immunotoxicity, neurotoxicity, genotoxicity and endocrine disruption. The approaches involve works on both molecular (genes, enzymes, signal molecules), cell (flow cytometry, toxicokinetics), histopathology and ecological traits.

Project summary: Recently it has been discovered that wastewater effluents can contain high levels of antiandrogenic activity. Antiandrogens can block androgen receptor activity and there is concern that exposure to these contaminants could cause desmaculinisation of aquatic organisms such as fish. A combination of approaches is proposed to study the occurrence and effect of such compounds.A cell-based antiandrogenic activity screen (YAS assay) will be used to study the occurrence of antiandrogens both in sediments and in bile of roach (Rutilus rutilus) sampled in France where some of these activities were recently detected in a few sediment samples. Effect of these compounds on the steroid synthesis will be studied by measuring the expression of key genes (Star, AR, CYP3, CYP 17, CYP 11 and CYP19), the activity of the CYP19a1b and the synthesis of oxy-androgens in male fish.

Work Plan:Objectives and Tasks:Objective A: Investigation of occurrence of antiandrogens in sediments and fish.Field sampling (sediments and fish); dissection of gonads, and bile; histological examination.Anti-YAS assay on sediment extracts and fish bile Objective B: Measurements of CYP19a1b activity and synthesis of oxy-androgensAssessment of CYP19a1b activity.

Objectifs et tâches:

Objectif A: Etude de la présence d’anti-androgènes dans les sédiments et les poissons. 1. Échantillonnage sur le terrain (sédiments et

poissons); dissection des gonades, prélèvement de bile, examen histologique.

2. Dosage anti-YAS sur des extraits des sédiments et la bile de poisson

Objectif B: Analyse de la synthèse et de l'activité des CYP19 et de métabolites d’anti-androgènes 3. Évaluation de l'activité CYP19a1b. 4. identification des oxy-androgènes

Objectif C: Analyse de l'expression de certains gènes clés impliqués dans le métabolisme de stéroïdes 1. Mise en place et validation des protocoles qPCR. 2. Mesure des niveaux d'expression dans le poisson

Planning:

Objectif A: Présence d’anti-androgènes Tâche 1. Echantillonnage de sédiments (1-6 mois) Tâche 2. Echantillonnage des gardons (2 mois) Tâche 3. Test anti-YAS (6 mois)

Etape1. Achever les tâches 1-3 et préparer une publication dans une revue scientifique (12mo)

Production 1. Diffusion des résultats - Publication

Objectif B: Activité aromatase et synthèse d’oxy-androgènes Tâche 5. Mesure des activités CYP19a (6 mois) Tâche 6. Identification des oxy-androgènes (6 mois) Etape 2. Achever les tâches 4-5 et préparer une publication dans une revue scientifique (24 Mo) Production 2. Diffusion des résultats - publication / présentation de la conférence

Objectif C: analyse de l'expression de certains gènes clés impliqués dans la production de stéroïdes Tâche 7. QPCR de certains gènes (8 mois) Tâche 8. Rédaction (4 mois)

Milestone 3. Compléter les tâches 7-8, préparer une publication et le manuscrit de thèse (36 mois) Production 3. Thèse - publication

identification of oxy-androgensObjective C: Measurements of the expression of selected key genes involved in steroid productionSet up and validation of qPCR protocols.Measurement of expression levels in fishTime Line:Objective A: Occurrence of antiandrogensTask 1. sediment sampling (1-6 mo)Task 2. fish collection (2 mo)Task 3. anti-YAS assay (6 mo)

Milestone 1. Complete tasks 1-3 and prepare for publication in a peer-reviewed journal (12mo) Deliverable 1. Dissemination of results – publication

Objective B: CYP19a1b activity and synthesis of oxy-androgensTask 5. Assessment of CYP19a1b activity (6 mo)Task 6. identification of oxy-androgens (6 mo)

Milestone 2. Complete tasks 4-5 and prepare for publication in a peer-reviewed journal; (24 mo)Deliverable 2. Dissemination of results – publication/conference presentation

Objective C: Measurements of the expression of selected key genes involved in steroid productionTask 7. qPcr of selected genes (8 mo)Task 8. Redaction (4 mo)

Milestone 3. Complete tasks 7-8 prepare for publication in a peer-reviewed journal + manuscript (36 mo)Deliverable 3. thesis – publication/conference presentation

Une formation en toxicologie, écotoxicologie, biochimie ou biologie moléculaire incluant une expérience de laboratoire de recherche est requise. Un intérêt pour les études en environnement, pour le travail d’équipe et des capacités à respecter ses objectifs serait apprécié

Training in toxicology, ecotoxicology, biochemistry, or environmental chemistry including laboratory research experience is required.An enthusiastic interest in environmental issues, the ability to work well with others and the ability to meet tight time plans would be an advantage.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010Laboratoire d’Ecotoxicologie – Milieux Aquatiques EA 3222

25, rue Philippe LebonBP 540

76058 Le HavreCourriel : minier@univ-lehavre.fr

Tél. : 02 32 74 43 03

  Unité de recherche d’accueil Neuropsychopharmacologie Expérimentale EA 4359

Sujet de thèse Impact des anesthésies pratiquées pendant la période périnatale sur le développement du cortex cérébral et sur sa vulnérabilité aux agents excitotoxiques.

Impact of anaesthesia practised during the perinatal period on cerebral cortex development and on its vulnerability to excitotoxic agents.

L’Unité de Neuropsychopharmacologie, EA 4359, dirigée par le Pr J.J.Bonnet, s’est jusqu’alors focalisée sur la compréhension de la physiopathologie des troubles anxio-dépressifs, grâce à des approches neurochimiques et comportementales, souvent menées en partenariat avec l’industrie pharmaceutique. L’Unité de Neuropsychopharmacologie est intégrée à l’IFRMP et abrite le service commun d’analyse comportementale. Dans le but d’opérer un rapprochement thématique avec l’EA 4309, dirigée par le Dr B. Gonzalez, l’équipe de Neuropsychopharmacologie met son expertise concernant l’étude des récepteurs des neurotransmetteurs et l’analyse comportementale au service de la thématique « Troubles du développement cérébral induits par l’exposition à des agents pharmacologiques ». Le projet de co-direction de thèse entre deux membres de ces deux unités de recherche s’inscrit dans cette dynamique.

Dans les pays développés, les lésions cérébrales constituent la première cause de paralysie du nouveau-né. Les enfants prématurés ou nés à terme peuvent être soumis à des interventions thérapeutiques qui nécessitent l’emploi d’agents anesthésiques pouvant interférer avec les processus de développement cérébral. En effet, certains d’entre eux agissent en modifiant les neurotransmissions médiées par les récepteurs GABAA et/ou NMDA du glutamate. D’autres, de nature opioïde, interfèrent indirectement avec les transmissions glutamatergiques. Or le GABA et le glutamate jouent des rôles majeurs dans le développement du cortex cérébral. L’étude de l’innocuité des anesthésiques chez le nouveau-né peut être modélisée chez la Souris. En effet, la maturité développementale du cortex de souris âgées de 2 (P2), 5 (P5) ou 10 jours (P10) correspond respectivement chez l’humain à 24, 30-32 ou 37-39 semaines d’aménorrhée. Nous proposons d’étudier chez la Souris l’effet d’anesthésiques (bloqueur NMDA, benzodiazépine, barbiturique, morphinique) administrés en fin de gestation, ou à P2, P5 ou P10, sur les marqueurs de nécrose et d’apoptose identifiés au sein de tranches cérébrales. Nous évaluerons aussi l’effet des anesthésiques sur la vulnérabilité du cortex aux agents excitotoxiques en mimant une stimulation excessive des récepteurs NMDA dans le modèle de Souris nouveau-née. Le récepteur NMDA est constitué de sous-unités, dont NR2A, impliquée dans la survie neuronale, et NR2B, impliquée dans l’apoptose. Nous évaluerons par immunohistochimie, radioliaison et

The Neuropsychopharmacology Unit, EA 4359 directed by Pr J.J. Bonnet, has been focusing for several years on the understanding of the physiopathology of anxio-depressive disorders, by means of neurochemical and behavioral approaches, often conducted in partnership with pharmaceutical industry. The platform of behavioral analysis of IFRMP 23 takes place in this research unit. In the aim to gather up thematics with EA 4309, directed by Dr B. Gonzalez, the Neuropsychopharmacology Unit team brings its expertise on neurotransmitters receptors study and behavioral analysis to the topic concerning the troubles in brain development induced by exposition to pharmacological agents. In line with this objective, the present project includes a co-direction of thesis between two members of both laboratories.

In industrialized countries, brain lesions constitute the first cause of palsy in neonates. Preterm and term infants can undergo therapeutic surgery under anaesthesia, which could interfere with brain development processes. Many anaesthetic agents indeed act by modifying neurotransmissions involving GABA A and/or NMDA glutamatergic receptors. Others are opioids which indirectly interact with glutamatergic transmission. GABA and glutamate are two neurotransmitters which play major roles in cerebral cortex development. In order to study the safety of anaesthetic procedures in neonates, murine animal models can be used. Cortex developmental maturity of 2-day old (P2), 5-day old (P5) or 10-day old (P10) mice correspond to 24, 30-32, or 37-39 weeks of gestational age in the human, respectively. We will study, in mice, the effects of anaesthetics (NMDA antagonist, benzodiazepine, barbiturate, opioid) administered during late pregnancy, or at P2, P5 or P10, on necrosis and apoptosis markers identified in brain slices. We will measure the cortical vulnerability to excitotoxic agents mimicking an excessive stimulation of NMDA receptors in the neonate mice model. The glutamatergic NMDA receptor is constituted of subunits, among which NR2A is involved in cell survival and NR2B is involved in apoptosis. We will evaluate the impact of anaesthetics on the cortical expression of both subunits by means of immunohistochemistry, binding and in situ hybridization. If deleterious effects appear, we will test pharmacological inhibition of NR2B in vivo before anaesthesia.Finally we will study the long-term impact of perinatal anaesthesia on behavioral features in adult mice by measuring locomotor activity and cognitive abilities.

hybridation in situ, l’impact des anesthésiques sur l’expression corticale de ces deux sous-unités. Si un effet délétère apparaît, nous chercherons à l’inhiber par un agent pharmacologique inhibiteur de NR2B, administré in vivo avant l’anesthésie. Enfin, nous évaluerons l’impact des anesthésies périnatales sur le comportement cognitif et moteur des souris devenues adultes par des tests comportementaux.

Le (la) candidat(e) devra être titulaire d’un M2 Neurosciences. Des connaissances concernant plus particulièrement le développement cérébral seraient appréciées. Le (la) candidat(e) devra posséder des compétences en expérimentation animale. Une expérience en histologie, marquage de récepteurs et/ou hybridation in situ est également souhaitable

The applicant must have a Master’s degree in Neuroscience. A background in the field of brain development should be particularly appreciated. The applicant must be competent in animal experimentation. An expertise in histology, receptor labeling and/or in situ hybridization is also expected.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010EA 4359 Faculté de Médecine-Pharmacie,

22 Bd Gambetta, 76183 Rouen cedexisabelle.leroux-Nicollet@univ-rouen.fr

Tél. : 02 35 14 86 02

  Unité de recherche d’accueil Laboratoire Matrice Extracellulaire et Pathologie (LMEP), IFR 146 ICORE, Université de Caen/Basse-Normandie EA

3214 Sujet de thèse Stabilisation du phénotype du

chondrocyte articulaire et induction de la chondrogenèse chez les cellules souches mésenchymateuses adultes en vue d’une utilisation en thérapie cellulaire du cartilage chez l’homme.

Articular chondrocyte phenotype stabilization and chondrogenesis induction in adult mesenchymal stem cells for their use in the cell therapy in human cartilage defects.

Le LMEP (IFR 146 ICORE (Interactions Cellules-Organismes-Environnement)), développe une recherche fondamentale et appliquée portant sur les aspects physiopathologiques de la matrice extracellulaire (ex : arthrose). Il étudie notamment les mécanismes moléculaires qui contrôlent l’expression des principaux gènes matriciels des chondrocytes (collagène de type II, agrécannes, etc…). Il a ainsi pu montrer l’importance de certains facteurs de croissance et de transcription dans la dédifférenciation des chondrocytes, un mécanisme observé dans le cartilage arthrosique. L’équipe s’intéresse aussi aux biomatériaux (collagène) permettant la transplantation de chondrocytes autologues afin de réparer les lésions du cartilage. Dans ce cadre, le LMEP a participé au projet intégré européen GENOSTEM (6ème PCRD), dont l’objectif était de caractériser les cellules souches mésenchymateuses adultes (CSM) et de les utiliser en thérapie cellulaire du cartilage. Il poursuit cette approche dans le cadre d’un projet ANR/TecSan intitulé PROMOCART.

L’incidence socio-économique de l’arthrose est liée au très faible potentiel de réparation du cartilage. Actuellement, les thérapies réparatrices ne restaurent pas les propriétés biomécaniques du cartilage. Ainsi, la transplantation de chondrocytes autologues (TCA) selon Brittberg et al. (1994), employée pour le traitement des lésions limitées du cartilage, implique une amplification cellulaire en culture monocouche qui s’accompagne d’une dédifférenciation chondrocytaire. Pour un contrôle moléculaire optimum du phénotype des chondrocytes avant la greffe, la technologie s’oriente vers une combinaison des chondrocytes avec des biomatériaux, et l’utilisation de cytokines.Les enjeux de ce projet visent à contrôler les mécanismes nécessaires au maintien du phénotype différencié des chondrocytes, lors de leur amplification ou au sein d’un biomatériau de collagène. Dans ce cadre, les propriétés chondrogéniques de la BMP2, pour restaurer le phénotype des chondrocytes humains, ou pour induire le lignage chondrocytaire de cellules souches mésenchymateuses adultes humaines, seront exploitées. Après avoir identifié la meilleure combinaison [cellule-biomatériau-BMP2/cytokines], il faudra bloquer l’induction du collagène I dans les chondrocytes dédifférenciés (siRNA, leurres nucléotidiques), altération représentant un évènement majeur dans l’arthrose. Ce projet prévoit des essais précliniques par greffe en

The Extracellular Matrix and Pathology Laboratory (EMPL) (ICORE (Interactions Cells-Organisms-Environment) 146 Federative Institute of Research), develops a fundamental and applied research concerning the physiopathological and metabolic aspects of Extracellular Matrix (ECM). The main theme of EMPL consists to study the molecular mechanisms controlling the expression of the major ECM genes of chondrocytes (type II collagen, aggrecan, TGF-ß type II receptor, etc.). We have demonstrated the importance of several transcription and growth factors in the dedifferentiation of chondrocytes, a process observed in osteoarthritis. The team has also interest in biomaterials (collagen sponges) allowing the autologous chondrocyte transplantation in order to repair cartilage. EMPL participated to the Integrated European project GENOSTEM, which aimed to characterize human adult mesenchymal stem cells and to use them in the repair of cartilage. This project is presently developped in the context of an ANR/TecSan program, entitled PROMOCART.

The important incidence of osteoarthritis (OA) is due to the limited repair capacity of cartilage. The current repair therapies do not allow to restore the cartilage biomechanical properties. Therefore, the Brittberg’s autologous chondrocyte implantation (ACI), employed for the treatment of small cartilage defects, implies a cellular amplification in culture which induces a phenotypic shift toward chondrocyte dedifferentiation. For an optimal molecular control of the chondrocyte phenotype before the ACI, the technology took an orientation to favor a combination of chondrocytes with biomaterials/cytokines. This project aims at controlling the molecular mechanisms which regulate the expression of the differentiated chondrocyte phenotype, during their culture within a collagen biomaterial. In this context, the chondrogenic properties of BMP2/other cytokines, in order to restore the phenotype of human chondrocytes, or to define the chondrogenic lineage from adult mesenchymal stem cells, will be exploited. Once the best combination [cell-biomaterial-BMP2/other cytokines] will be identified, it will be necessary to develop a loss of function strategy (siRNA, decoy nucleotides) in order to block type I collagen induction in dedifferentiated chondrocytes, a phenotypic alteration which represents a major event in OA. This project will also imply preclinical trials in the nude mouse model after subcutaneous implantation of the neocartilage and in the sheep model of OA (developped at Lyon Civil

sous-cutané chez la souris nude pour vérifier la qualité du cartilage reconstruit et sur le modèle d’arthrose chez la brebis. Ces essais seront étendus chez l’homme avec les chirurgiens orthopédistes de l’hôpital de Lyon-Sud. Ce projet de thèse s’intègre dans un programme ANR TecSan (PROMOCART) au sein d’un réseau de 5 partenaires (fin du projet 9-2012 ; possiblement 2013, si réponse positive à l’appel d’offres ANR/TecSan, projet CLINICART), dont les retombées concernent le traitement des arthroses débutantes et les pertes de substances chondrales lors de chocs traumatiques.

Hospices). If the animal model results are conclusives, human clinical trials using ACI will be performed (Hôpital Lyon-Sud, Pr B Moyen). This thesis project is part of an ANR TecSan program (PROMOCART). This network includes 5 partners (project end, 9-2012 ; possibly 2013 if positive answer after ANR/TecSan 2010 calls, CLINICART program), and the objectives concern the repair of small lesions in early OA or the loss of chondral substance following traumatic lesions.

La réussite de ce projet de thèse est conditionnée par : - de solides connaissances sur le lignage chondrocytaire et sur les mécanismes moléculaires qui régissent la physiopathologie du cartilage. - de réelles compétences en techniques : I. de culture cellulaire (plus spécifiquement, chondrocytes et cellules souches mésenchymateuses adultes (moelle osseuse et sang de cordon ombilical), culture tridimensionnelle en tension d’oxygène variable), II. de biologie cellulaire et biochimique (ELISA, tests de viabilité et de prolifération, nucléofection, immuno-empreinte, cytométrie de flux), III. de biologie moléculaire (RT-PCR en temps réel, expériences de retardement sur gel et d’immunoprécipitation de la chromatine (simple et double), interférence par l’ARN).

The success of this PhD project is conditioned by: - A strong knowledge on the definition of chondrocyte lineage and on the molecular mechanisms involved in cartilage physiopathology. - Real technical competency: I. in cell culture (more specifically, chondrocytes and adult mesenchymal stem cells (bone marrow and umbilical cord), 3D models of cell culture and in various oxygen tension), II. Biochemistry and Cellular Biology (ELISA, viability and cell proliferation assays, Western-blot, flow cytometry),III. Molecular Biology (real time RT-PCR, gel retardation assay, Chromatin Immunoprecipitation (ChIP, Re-ChIP), RNA interference, decoy strategy, etc…).

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010UFR de Médecine EA 3222

Laboratoire Matrice Extracellulaire et Pathologie (LMEP),CHU niveau 3, Avenue de la Côte de Nacre, 14032 CAEN CEDEX

Courriel : philippe.galera@unicaen.fr ou karim.boumediene@unicaen.frTél. : 02/31/06/82/18

Unité de recherche d’accueil « Mobilités : Cognition et Temporalité » INSERM-ESPRISujet de thèse Représentation interne de la

gravité et régulations végétatives

Internal representation of gravity and autonomous regulation

L’objectif de notre équipe pluridisciplinaire est l’étude des processus cognitifs intervenant dans les mobilités ainsi que leurs facteurs de variation temporels - en conditions normale et pathologique - et leur réhabilitation. Le programme de notre équipe est organisé en 3 axes complémentaires. Deux concernent chacun un type de mobilité - les déplacements routiers et la marche - et le troisième, un modèle de mobilité, l’oculomotricité. Notre équipe intègre des compétences complémentaires dans des domaines très diversifiés (neurosciences, sciences du sport, pharmacologie, rééducation et autres spécialités médicales).

La capacité à se situer par rapport au monde environnant est un pré requis à tout comportement moteur adapté. Cette capacité reposerait sur des représentations (ou modèles) internes de grandeurs physiques pertinentes et en tout premier lieu de la gravité, véritable pivot autour duquel s’organise la perception spatiale et la motricité. Le modèle interne de la gravité repose principalement sur le système vestibulaire. D’autre part, nous avons montré que le modèle interne de la gravité est utilisé par le système végétatif pour la régulation des fonctions sur lesquelles la gravité a une influence importante (au premier plan le système cardiovasculaire).L’objectif de ce travail de thèse est de déterminer dans quelle mesure un trouble de la représentation interne de la gravité pourrait être à l’origine de dysrégulations végétatives. Cette question sera abordée lors de 3 expérimentations dans lesquelles les réponses vestibulaires (réflexes vestibulo-oculaires), perceptuelles et végétatives, ainsi que leur adaptation avec le temps seront évaluées :

un sujet placé dans un environnement gravito-inertiel différent de 1 ne peut se faire une représentation correcte de la gravité (ambiguïté fondamentale entre gravité et accélération linéaire inertielle). Des vols paraboliques (projet ESA) permettront de produire des phases gravitaires de 2g et 0g.

des sujets en alitement prolongé présentent à leur lever des dysrégulations végétatives importantes se manifestant en particulier par des pertes de connaissances inopinées. L’alitement prolongé est d’ailleurs un modèle validé de certains effets de l’impesanteur sur les spationautes. Notre hypothèse est que l’alitement (second projet ESA portant sur un alitement de 3 semaines) est à l’origine de modifications vestibulaires elles-mêmes à l’origine d’une représentation interne erronée.

Des patients présentant des lésions vestibulaires périphériques ont nécessairement une représentation interne de la gravité altérée

The scientific goal of our multidisciplinary team is the study of cognitive processes implicated in mobility as well as their temporal fluctuations. Our team programme is organised along 3 lines. Two concern one type of mobility – car driving and ambulation – while the third is a mobility model, oculomotricity. For each of these lines, we will be interested not only in the cognitive mechanisms brought into play (and more particularly in the attentional processes for lines 1 and 3, in representation of space for lines 2 and 3 and in the time fluctuations of these processes for lines 1 and 2) but also in disturbances and processes of adjustment or rehabilitation.

The ability to execute appropriate behavioral and motor responses depends critically on our capacity to construct an accurate internal representation of our orientation in space. An accurate internal representation of gravity is particularly important because it plays a pivotal role in spatial perception an motricity. Vestibular sensory signals are among those that may make an essential contribution to the construction of such 'internal models'. Moreover, we previously demonstrated that internal representation of gravity is used to regulate autonomous functions on which gravity has an important impact, particularly – but not only – cardiovascular regulation.The aim of this doctoral project is to evaluate the impact of a faulty internal representation of gravity on autonomous regulation. To this end, vestibular (vestibule-ocular reflexes), perceptual and autonomous responses, as well as their adaptation, will be evaluated during 3 experimental conditions:

when gravito-inertial acceleration is different from 1g, internal representation of gravity in necessarily inaccurate because the otolith organs, like any linear accelerometer, sense inertial and gravitational accelerations equivalently. Periods of 2g and 0g will be produced during parabolic flights (ESA project).

After prolonged bed-rest, most subjects experience cardiovascular decontioning as well as other autonomous dysregulations. Head down tilt bed-rest is a validated model of somme effects of weightlessness on astronauts. Our hypothesis is that bed-rest induces alterations in vestibular system thus in internal representation of the gravity.

Patients suffering from peripheral vestibular lesions have necessarily an altered internal representation of gravity.

Titulaire d'un master 2 recherche, le candidat devra attester d'un niveau de maîtrise satisfaisant du champ The Candidate must have a research master's degree

théorique dans lequel s'inscrit le projet. Des compétences en physiologie humaine sont demandées. Une maîtrise des outils méthodologiques nécessaires à la conduite de ce projet (oculométrie, analyse de paramètres cardiovasculaires) sera appréciée.

and will have to give evidence of a satisfactory level of control of the theoretical field of project. Skills in human physiology are requested. Knowledge of the methodological tools necessary for the conduct of this project (oculometry, analysis of cardiovascular parameters) will be appreciated.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2010UFR de Médecine – UFR STAPS

Université de Caen Basse-Normandie 14032 Caen CEDEXCourriel : pierre.denise@unicaen.fr

Tél. : 02.31.06.82.14

  Unité de recherche d’accueil Laboratoire Morphodynamique Continentale et Côtière (M2C)

UMR CNRS 6143Sujet de thèse Potentiels de dégradation

microbienne associés au transfert des hydrocarbures aromatiques polycycliques le long d’un continuum bassin versant - estuaire marin

Potentials of microbiological degradation linked to the transfer of PAHs along a continuum watersheld - marine estuary

Le laboratoire M2C (UMR 6143, Université de Rouen et de Caen) s'est fondé autour de plusieurs thématiques de recherche en Géosciences réparties entre deux équipes de recherches principales : (i) « Dynamiques des surfaces continentales » (comprenant l'étude des transferts hydrosédimentaires dans les bassins versants) et (ii) « Dynamiques des systèmes côtiers » (comprenant les processus physiques, sédimentaires et biochimiques caractérisant la zone côtière). Le laboratoire M2C s'est récemment (depuis 2008) étendu à l'interdisciplinarité par le rattachement de microbiologistes environnementaux (étude des bactéries résistantes aux antibiotiques et aux métaux lourds, étude des contaminations fécales, étude de souches environnementales du genre Pseudomonas et étude de la dégradation de contaminants organiques).

Les hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAP) sont des composants organiques hydrophobes ayant des propriétés toxiques, mutagènes et cancérigènes. Majoritairement d'origine atmosphérique, les HAP sont déposés sur les sols puis transférés à l'hydrosphère par le biais de ruissellements et d'infiltrations. Au cours de leur transfert entre les différents compartiments d'un bassin versant, les HAP sont partiellement éliminés par les processus naturels de biodégradation. La biodégradation des HAP par atténuation naturelle est toutefois lente et limitée dans l'environnement principalement en raison du caractère hydrophobe de ces molécules. Les HAP s'adsorbent facilement aux particules organiques ce qui les rendent particulièrement inaccessibles et donc non biodisponibles. Le manque de nutriments inorganiques et/ou la performance écologique (fitness) variable des microorganismes dégradeurs de HAP pourraient également expliquer cette faible biodégradation.L'objectif principal de ce projet de thèse pluridisciplinaire est de mieux comprendre (i) la dynamique, (ii) la biodisponibilité et la(iii) biodégradabilité des HAP, le long d'un continuum bassin versant - estuaire marin dans une zone fortement anthropisée.(i) Des analyses Géo-physico-chimiques seront réalisées dans les différents compartiments du continuum (sol, eau de surface et sédiment), à des fréquences variables (saisonnières ou en hautes fréquences). (ii) Trois approches complémentaires seront utilisées pour étudier la biodisponibilité des HAP: Une approche chimique (extraction avec différents solvants), une

The M2C laboratory (UMR 6143, CNRS - university of Rouen and Caen) was based on various fields of research in geosciences with two major research teams: (i) “Dynamics of continental surfaces” (including the study of the hydrosedimentary transfer in watershed) and (ii) “Dynamics of coastal systems” (including the physical, sedimentary and biogeochemical processes charactering the coastal area). The M2C laboratory has recently (since 2008) expanded to the inter-disciplinarity by incorporating a team of environmental microbiologists (study of bacterial resistances to heavy metals and antibiotics, study of faecal contamination, study of environmental strains of Pseudomonas and study of organic contaminants degradation).

The polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are hydrophobic organic compounds of particular concern because of their toxic, mutagenic, and carcinogenic properties. The major source of PAHs results from incomplete combustion of wood, coal, coke and fuel for domestic heating and traffic sector. Once being deposited on soils, PAHs are transferred to the hydrosphere by means of runoff and infiltration. During their transfer between the different compartments of a watershed, PAHs are partially eliminated by natural processes of biodegradation. Biodegradation by natural attenuation of PAHs is however slow and limited in environmental conditions mainly due to the hydrophobic character of these molecules. PAHs easily adsorbed to organic particles making them particularly inaccessible and therefore not bioavailable. Lack of inorganic nutrients or the variable fitness of PAH-degrading microorganisms could also explain this unsuccessful biodegradation.

The main objective of this multidisciplinary PhD project is to better understand (i) the dynamic, (ii) the bioavailability and (iii) the biodegradability of PAHs along a continuum watershed - marine estuary in an highly anthropized area.(i) Geo-physico-chemical analyses will be performed in different compartments of the continuum (soil, surface water and sediment), at variable frequencies (from seasonal to high frequencies).(ii) Three complementary approaches will be used to investigate the bioavailability of PAHs: A chemical approach (extraction of PAHs using different solvents), a geochemical approach (characterization of the organic matter), and a microbiological approach (in situ study of the genes involved in the biosurfactant production).

approche géochimique (caractérisation de la matière organique) et une approche microbiologique (étude in situ des gènes impliqués dans la production de biosurfactants).(iii) La diversité microbienne spécifique et le potentiel génétique de dégradation des HAP seront déterminés à partir d'échantillons environnementaux et compléter par des études en microcosmes utilisant des substrats marqués au 13C (DNA-SIP).

(iii) The specific microbial diversity and the genetic potential for PAH-degradation will be determined from environmental samples and completed with studies in microcosms using 13C-labeled substrates (DNA-SIP).

La/le candidat(e) sera avant tout un(e) écologiste microbien(ne) maîtrisant les outils moléculaires d'étude des micro-organismes dans l'environnement (extraction des acides nucléiques, qPCR, DGGE).Même si non indispensables, des connaissances en hydrologie et géochimie seront appréciées.

Applicants must have a good understanding of diversity-function relationships and a solid background in basic molecular approaches (PCR-DGGE, clone library-sequencing, qPCR). Experiences in geochemistry and hydrology would improve application’s value.

Date limite de dépôt de candidature / Deadline 25/06/2008UMR CNRS 6143, Irèse A, place Emile Blondel, Université de Rouen,

76821 Mont Saint Aignan cedexCourriel : sylvie.barray@univ-rouen.fr

Tél. : 0232769450

  Unité de recherche d’accueil Pharmacologie des dysfonctionnements endothéliaux et myocardiquesInserm U644

Sujet de thèse Modulation de l’angiogenèse par la protéine tyrosine phosphatase 1B

Modulation of angiogenesis by protein tyrosine phosphatase 1B

La recherche menée par l’Inserm U644, intégrée à l’IFRMP, concerne les mécanismes et le traitement de pathologies cardiovasculaires, et en particulier, la protection vasculaire et l’amélioration de la fonction contractile cardiaque. Cette recherche est abordée de façon transversale, au plan expérimental et chez le malade. Dans le domaine vasculaire, ces travaux portent essentiellement sur la recherche de protection de certaines cellules vasculaires, les cellules endothéliales, face aux agressions subies par les facteurs de risque et pathologies cardiovasculaires (infarctus, insuffisance cardiaque, choc septique, hypertension etc.). Les recherches visent également à développer de nouvelles stratégies de biothérapie permettant de stimuler la croissance des vaisseaux sanguins. Dans le domaine cardiaque, les travaux portent essentiellement sur l’amélioration de la détection non invasive de la dysfonction contractile cardiaque, sur l’évaluation de nouveaux traitements de l’insuffisance cardiaque, et sur l’étude des liens existants entre stress oxydatif et dysfonction cardiaque. Ces travaux s’effectuent en étroite interaction avec diverses Services Hospitaliers, et l’industrieL’angiogenèse définit les processus conduisant à la croissance des vaisseaux sanguins. Notre groupe recherche de nouvelles voies thérapeutiques stimulant l’angiogenèse après un infarctus du myocarde. Nous avons récemment découvert les effets protecteurs vasculaires d’une approche basée sur l’inhibition de la tyrosine phosphatase 1B (PTP1B). Dans la mesure où la PTP1B participe également à la régulation négative de l’activité des facteurs de croissance, l’inhibition de cette enzyme pourrait exercer un effet stimulant sur l’angiogenèse. Nos résultats préliminaires suggèrent que l’inhibition de la PTP1B augmente la migration de cellules endothéliales en culture induite par des facteurs de croissance. En parallèle, chez les souris déficientes en PTP1B (PTP1B-/-), on observe une meilleure invasion de cellules vasculaires dans un modèle d’implants sous-cutanés de matrigel contenant des facteurs de croissance. Enfin, nous avons mesuré une augmentation de la densité capillaire dans le cœur de souris PTP1B-/- soumis à un infarctus.Le projet de thèse consiste donc à tester si l’inhibition pharmacologique de la PTP1B, ou l’invalidation de l’expression du gène PTP1B, exerce un effet pro-angiogénique dans l’insuffisance cardiaque post-infarctus, puis d’identifier les mécanismes et cibles moléculaires impliquées dans cet effet. Nous caractériserons un phénotype migratoire et prolifératif de cellules endothéliales issues des souris PTP1B-/-. Dans le modèle matrigel chez ces mêmes souris, nous évaluerons les quantités relatives de sous-populations de cellules inflammatoires connues pour contribuer à la

The research performed in the Inserm U644 Unit, integrated to the IFRMP, concerns the evaluation of the mechanisms and treatment of cardiovascular diseases, and especially vascular protection and improvement of cardiac contractile function. This research is transversal and performed both in experimental models and in human. Regarding vascular research, our work mostly concerns the protection of vascular endothelial cells in the context of cardiovascular risk factors or cardiovascular diseases (myocardial infarction, heart failure, septic shock, hypertension, etc…). We also investigate new biotherapy approaches for stimulation of angiogenesis and vasculogenesis. Regarding cardiac research, our work mostly concerns the improvement of non invasive detection of cardiac contractile dysfunction, the search for new treatments of heart failure, and the study of the links between oxidative stress and heart failure. Most studies are performed in collaboration with clinical departments in our University Hospital, or with the industry.Angiogenesis defines the processes implied in the development of new blood vessels. Our group evaluates new pathways inducing enhanced angiogenesis after myocardial infarction as a new therapeutic approach. We recently discovered the protective vascular effects of a strategy based on tyrosine phosphatase 1B (PTP1B) inhibition. Of note, PTP1B has been implied in a negative regulation of the activity of several growth factors, thus inhibition of this enzyme might exert stimulating effects on angiogenesis.Our preliminary results showed that PTP1B inhibition increases the cellular migration of murine cardiac endothelial cells stimulated by growth factors. Moreover, in PTP1B deficient mice (PTP1B-/-), we observed a greater invasion of blood vessels cells within a model of subcutaneous matrigel tissue implants containing growth factors. Lastly, we also observed an increase in capillary density in PTP1B-/- mouse hearts subjected to myocardial infarction.

The project of the thesis consists in assessing if pharmacological PTP1B inhibition or genetic PTP1B deficiency stimulates angiogenesis in heart failure after myocardial infarction as well as identifying the molecular targets involved in this angiogenic response. We will characterize the migratory and proliferative phenotype in endothelial cells originating from PTP1B-/- mice. With the matrigel model used in PTP1B-/- mice, we will evaluate the relative amounts of inflammatory cells subpopulations known to contribute to enhance angiogenesis. Finally, in mice with heart failure, we will evaluate the effect of PTP1B deficiency, whether ubiquitous or limited to the endothelium, on myocardial perfusion and cardiac function measured by MRI and echocardiography. This work should help to elucidate the role of PTP1B in

stimulation de l’angiogenèse. Enfin, chez les souris insuffisantes cardiaques, nous évaluerons l’effet de la déficience en PTP1B, soit globale soit limitée à l’endothélium, sur la perfusion et la fonction cardiaques mesurées par IRM et échocardiographie. Ces travaux participeront à évaluer l’apport possible d’un contrôle de l’activité PTP1B dans l’angiogenèse post-infarctus.

post-infarction angiogenesis as well as the cellular mechanism(s) involved.

Le projet de recherche de type physiopathologie s'intéresse aux mécanismes de l’angiogenèse et à l’augmentation de la perfusion myocardique dans le post-infarctus. La réalisation de ce projet requiert de la part de l'étudiant :1- Une connaissance des bases de la physiologie cardio-vasculaire ainsi que des mécanismes cellulaires et moléculaires impliqués dans l’angiogenèse. 2- Une maîtrise de la manipulation des animaux, du suivi de lignées murines génétiquement modifiées, et une aptitude à la mise en place d’un protocole chez l’animal.3- Une maîtrise des techniques de base de la culture de lignées cellulaires4- Une expérience pratique dans la préparation de coupes histologiques, dans la réalisation d’immuno-marquages, dans la manipulation de microscopes à épifluorescence et dans la maîtrise d’outils informatiques d’analyse d’images.5- La connaissance de techniques de biologie moléculaire telles que la RT-PCR semi-quantitative et le Western-Blot.

The project corresponds to a research in pathophysiology aimed toward a better understanding of the mechanisms of angiogenesis and increased cardiac perfusion after myocardial infarction. It will require the following skills::1- A basic knowledge of cardiovascular physiology as well as of the cellular and molecular mechanisms involved in angiogenesis. 2- A capacity to master animal experimentation, follow-up of genetically modified mouse strains.3- A mastering of the basic cell culture techniques4- Some experience in the preparation of histologic sections, immunohistochemistry, use of fluorescent microscopy, and computerized image analysis.5- Knowledge of basic molecular biology techniques such as semi quantitative PCR and le Western-Blot.

UFR Médecine Pharmacie Inserm U644, 22 Boulevard Gambetta,76183 Rouen Cédex

Courriel : Vincent.Richard@univ-rouen.frTél. : 02 35 14 83 62

  Unité de recherche d’accueil UMR INRA/UCBN 950 EVA (Ecophysiologie Végétale, Agronomie et nutritions N, S, C)

INRA, Département Environnement-AgronomieSujet de thèse Impacts physiologiques et

métaboliques de la nutrition soufrée et du transport de sulfate au sein de la graine de colza d’hiver sur la qualité, la conservation et la germination de la graine.

Physiological and metabolic impacts of sulfur nutrition and sulfate transport within the seed of winter oilseed rape on the quality, the conservation and the germination of the seed.

Constituée de 3 équipes (“Azote”, “Carbone-Défoliation”, “Ecologie Interaction plante-plante”), l'UMR 950 EVA conduit des recherches de biologie intégrative sur les métabolismes de l'azote (N), du carbone (C) et du soufre (S) chez des plantes de grande culture (colza) et des espèces fourragères prairiales (ray-grass, trèfle, luzerne…). Les principaux objectifs sont d’identifier les déterminants physiologiques et moléculaires intervenant dans l'efficience d’utilisation du N et du S par les végétaux dans le contexte d'une agriculture durable optimisant fertilisation, maintien/augmentation du rendement et préservation de l'environnement. Les processus et les facteurs de régulation impliqués dans le stockage et la mobilisation des réserves N (protéines, acides aminés), C (amidon, fructanes) et S (sulfate, glutathion) sont plus spécifiquement étudiés en vue d’améliorer l’efficience d’utilisation de ces éléments et in fine le rendement et la qualité des produits récoltés (fourrage, graine). Les travaux de recherche reposent sur des approches de biologie moléculaire, de protéomique, de biochimie, de physiologie (en particulier l’étude des flux de N, C et S via l’utilisation de traceurs isotopiques 15N, 13C et 34S), d'agronomie et d'écologie, permettant de passer de l'expression d'un gène ou d’une protéine à l'étude de sa fonction à l’échelle de la cellule, du tissu ou de la plante entière isolée ou en interaction au sein d’un peuplement ou d’une communauté.

L’étude des impacts physiologiques et agronomiques d’une limitation en soufre (S) chez le colza, une oléagineuse très exigeante en S présente un intérêt particulier dans le contexte actuel d’appauvrissement des sols en S. Des travaux réalisés au sein de notre UMR ont montré qu’une restriction en S appliquée dès le début de la montaison affecte le rendement (-33%) et la qualité grainière avec une baisse significative de la teneur en protéines (-10%), en huile (-30%) et en acides gras de type oméga 3 et 6. Chez la graine d’Arabidopsis, des résultats récents indiquent que les transporteurs de sulfate permettant d’acheminer cet anion jusqu’aux sites de stockage et d’assimilation joueraient un rôle primordial pour la synthèse d’acides aminés soufrés indispensables à la production des protéines de la graine. Ces transporteurs pourraient aussi jouer un rôle majeur dans les processus germinatifs (via la mobilisation du S). Par ailleurs, le sulfate de la graine pourrait contribuer à une meilleure longévité des graines et à une vigueur germinative accrue via la synthèse de glutathion, un antioxydant puissant.L’ensemble de ces résultats suggère que le niveau

The UMR 950 EVA is constituted of 3 teams (“Azote”, “Carbone-Defoliation” and “Ecologie Interaction plante-plante”), and develops integrative biology researches on nitrogen (N), carbon (C) and sulphur (S) metabolisms in crop plants (oilseed rape) and forages/grasses species (ryegrass, white clover, alfalfa…). The main objectives aim to determine the physiological and molecular determinants that are involved in N and S use efficiency by plants within the context of sustainable agriculture optimising fertilization inputs, maintain/increase of productivity and preservation of environment. The processes and factors of regulation involved in the storage and mobilization of N (amino acids, proteins), C (starch, fructans) and S (sulphate, glutathione) reserves are more specifically studied in order to improve the use efficiency of these elements and in fine the yield and quality of plants products (shoot production, grain). Researches are performed using modern techniques in molecular biology, proteomic, biochemistry, physiology (especially study of N, C and S fluxes by using the isotopic tracers 15N, 13C and 34S), agronomy and ecology, studying gene or protein expression and their function at the cellular, tissular, and whole plant levels (under isolated conditions or in interaction within population or community).

The study of physiological and agronomic impacts of mineral sulphur (S) restriction in rapeseed, an oleaginous crop very demanding in S, has a particular interest in the current context of S impoverishment in soil. Recent works obtained in our UMR showed that S restriction applied early in the bolting stage affects seed yield (-33%) and grain quality with a significant decrease in protein content (-10%), in oil (-30%), and in fatty acid omega 3 and 6. In Arabidopsis seeds recent results indicate that sulphate transporters responsible for distributing this anion to cellular sites of storage and assimilation will play a crucial role in the synthesis of sulphur amino acids necessary for seed protein production. These transporters may also play a major role in the germination processes (via S mobilization). Furthermore, sulphate in seed could contribute to the greater longevity of seed and to improve the germination stage via the synthesis of glutathione, a strong antioxidant compound.All these results suggest that the level of accumulation of sulphate in the seed and sulphate transporters are key factors of yield and seed quality.This thesis project aims to determine the impact of variable S fertilization on the grain quality and germination processes. This project will be (1) ascertain whether the level of accumulation of sulphate in the

d’accumulation de sulfate dans la graine et les transporteurs de sulfate sont des facteurs clef du rendement et de la qualité de la graine.Ce projet de thèse vise donc à déterminer l’incidence d’une fertilisation variable en S sur la qualité grainière et la vigueur germinative. Ce projet s’attachera (1) à vérifier si le niveau d’accumulation de sulfate dans la graine joue un rôle dans l’élaboration des composantes du rendement et (2) à caractériser le rôle des transporteurs de sulfate dans la graine. L’étude sera conduite au niveau physiologique (flux de S au niveau plante entière), métabolique (activités enzymatiques clefs de la voie d’assimilation du S, évolution des principaux composés soufrés, modifications protéomiques associées) et au niveau transcriptomique (expression des transporteurs de sulfate dans la graine).

seed plays a role in the elaboration of yield components and (2) characterize the role of sulphate transporters in the seed. The study will be conducted at the physiological (whole plant S fluxes), metabolic (activities of the key enzymes involved in the assimilation pathway of S, changes of the main S compounds, associated modifications of seed proteome) and transcriptomic levels (expression of sulphate transporters in the seed).

Le candidat doit être titulaire d’un diplôme de Master 2 Recherche en Biologie cellulaire ou équivalent. Une solide formation en Sciences du végétal et plus particulièrement en physiologie de la nutrition des plantes est requise. La maîtrise ou une expérience probante des méthodologies relevant de la biochimie, de la protéomique voire de la biologie moléculaire serait fortement appréciée. La capacité à utiliser les techniques de marquage isotopique pour déterminer les flux d’éléments à différentes échelles (plante entière, organe/tissu) constituera un point fort pour le recrutement en thèse.

The candidate must be titular of Master 2 Research degree in Cell Biology or equivalent. A solid background in Plant science, especially in physiology of plant nutrition is required. The expertise or a relevant experience in the methodologies in the disciplinary of the biochemistry, proteomics, an if possible in molecular biology would be greatly appreciated. The ability to use isotopic labeling techniques to determine the fluxes of elements at different scales (whole plant, organ / tissue) will be considered as strength for the recruitment in thesis.

Université de Caen Basse-Normandie, IBFA, IFR 146 ICORE, UMR INRA/UCBN 950 EVA Rue de Lausanne, 14032 CAEN Cedex

Adresse email : jean-christophe.avice@unicaen.frTél. : 02 31 56 54 18

  Unité de recherche d’accueil Différenciation et Communication Neuronale et Neuroendocrine (DC2N)

INSERM U982Sujet de thèse Rôle de la chromogranine A au

cours de la différenciation neuroendocrine normale et pathologique

Role of chromogranin A during normal and pathological neuroendocrine differentiation

Les travaux menés dans l’unité visent à élucider le rôle de neuropeptides dans les mécanismes de la différenciation neuronale et neuroendocrine, ainsi que dans la communication intercellulaire, puis à transférer les données obtenues dans les domaines médical et biotechnologique. Un des axes de recherche du laboratoire Inserm U982, coordonné par Youssef Anouar, consiste à déterminer le rôle des chromogranines dans la différenciation neuroendocrine saine et pathologique. Grâce à une approche multidisciplinaire, au soutien de plateformes IBiSA en imagerie cellulaire et en protéomique, au CHU de Rouen et à de nombreux autres partenaires, les recherches menées par les différentes équipes de l’unité permettent le développement de nouveaux outils diagnostiques et thérapeutiques qui font actuellement l’objet d’études précliniques et cliniques. La différenciation neuroendocrine est un processus complexe permettant à des cellules précurseurs ou des cellules pathologiques de produire et de sécréter des hormones peptidiques qui contrôlent la croissance d’autres cellules, ainsi que de nombreuses fonctions spécifiques de commande de l’organisme. Les cellules neuroendocrines stockent les hormones dans les granules de sécrétion (GS) qui libèrent leur contenu par un processus d’exocytose provoquée par un influx calcique, ce qui constitue la voie de sécrétion régulée. Les pathologies endocriniennes, et les anomalies de sécrétion hormonale qui en résultent, ont des conséquences néfastes sur l’ensemble de l’organisme (hypertension, diabète, troubles sexuels, cancer...). Parmi les protéines libérées en excès par les cellules neuroendocrines pathologiques, on retrouve la chromogranine A (CgA), un marqueur de la différenciation neuroendocrine normale ou pathologique. Dans des cellules naturellement dépourvues de voie de sécrétion régulée et de CgA, l’expression de cette dernière entraîne l’apparition de GS capables de contenir des hormones pouvant être libérées de manière régulée. L’objectif de ce projet de thèse vise à élucider le mécanisme d’action de la CgA dans la sécrétion neuroendocrine. Le projet consiste à : 1) isoler par fractionnement subcellulaire les GS induits par la CgA et analyser leur morphologie par microscopie électronique,2) identifier leur protéome par spectrométrie de masse (LC-MS/MS), et3) étudier les interactions entre la CgA et les protéines identifiées par les techniques de GST-pull down et co-immunoprécipitation. L’élucidation du rôle de la CgA et de ses partenaires au cours de la différenciation neuroendocrine permettra d’envisager la régulation de leurs interactions comme moyen thérapeutique dans des pathologies associées à des dérèglements de la

The research project of the laboratory aims to elucidate the mechanisms of neuronal and neuroendocrine differentiation and cell communication involving neuropeptides, and then to transfer the data obtained to medical and biotechnological fields. One of the research axes of the INSERM U982 coordinated by Youssef Anouar, is to determine the role of chromogranins during normal and pathological neuroendocrine differentiation. Using a multidisciplinary approach with the support of imaging and proteomic IBiSA platforms, of Rouen CHU and numerous collaborations with other partners, research projects conducted by the different teams lead to the development of new diagnostic, prognostic and therapeutic tools which are currently validated in preclinical and clinical studies. Neuroendocrine differentiation is a complex process allowing precursor cells or pathologic cells to produce and secrete peptide hormones which control the growth of other cells, as well as a variety of specific organismic responses. Neuroendocrine cells store hormones in secretory granules (SG) which release their content by exocytosis triggered by calcium influx, a process known as the regulated secretory pathway. Endocrine pathologies, and the resulting abnormal hormone secretion, have deleterious effects on the whole organism (hypertension, diabetes, reproductive dysfunction, cancer...). Among the proteins excessively released by pathologic neuroendorine cells, chromogranin A (CgA) has been established as a marker of neuroendocrine differentiation. In cells naturally devoid of a regulated secretory pathway and CgA, the expression of the latter induces the formation of SG able to store hormones which are liberated in a regulated manner. The objective of this thesis project is to elucidate the mechanism of action of CgA in neuroendocrine secretion. This project aims to :1) isolate by subcellular fractionation SG induced by CgA and analyze their morphology by electron microscopy,2) identify their proteome by mass spectrometry (LC-MS/MS), and3) Investigate the interactions between CgA and the proteins identified, through GST-pull down and co-immunoprecipitation techniques. Elucidation of the function of CgA and its partners during neuroendocrine differentiation may allow targeting their interactions as a therapeutic strategy for pathologies associated with disregulated hormone secretion, such as neuroendocrine tumors.

sécrétion hormonale, telles que les tumeurs neuroendocrines.

Le candidat devra posséder une solide formation dans les domaines de la biologie/physiologie cellulaire appliquée aux neurosciences. Le candidat doit maîtriser les techniques de Western-blot, d’immunocytochimie, de culture de lignées cellulaires, de fractionnement subcellulaire et devra utiliser les méthodes d’analyses par microscopie confocale, vidéo-microscopie et microscopie à onde évanescente. Des connaissances en protéomique représenteront un avantage.

The applicant must have a solid training in cell biology/physiology and neurosciences. The applicant should have expertise for Western-blotting, immunocytochemistry, culturing of tumoral cells, subcellular fractionation, confocal microscope analysis, time-lapse microscopy, and TIRF microscopy. Knowledge in proteomics will be an advantage.

UFR des Sciences et des TechniquesUniversité de Rouen

Place Emile Blondel ; Bâtiment Principal76821 Mont-Saint-Aignan cedex

Courriel : youssef.anouar@univ-rouen.frTél. : 0235146661

  Unité de recherche d’accueil ADEN « Nutrition et inflammation intestinale »EA4311

Sujet de thèse Evaluation du profil de protéines ubiquitinées au cours de l’inflammation intestinale

Evaluation of ubiquitinated proteins during intestinal inflammation.

Les travaux du groupe ADEN (EA4311 « Nutrition et Inflammation intestinale »), intégré à l’IFR MP 23, sont focalisés sur les troubles du comportement alimentaire, le syndrome de l’intestin irritable (SII) et les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI), pathologies qui ont en commun l’inflammation intestinale, le dysfonctionnement de l’axe intestin-cerveau et offrent des opportunités de thérapeutiques innovantes (pharmaconutrition, neurostimulation). L’approche physiopathologique et thérapeutique est menée depuis le niveau moléculaire jusqu’à l’évaluation clinique. Cette démarche intégrée est rendue possible par les compétences multidisciplinaires des chercheurs et les outils du groupe ADEN, sur le site de la Faculté et dans les services hospitaliers impliquésLe syndrome de l’intestin irritable (SII) et les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) qui incluent la maladie de Crohn (MC) et la rectocolite hémorragique mettent en jeu une dérégulation de la réponse immuno-inflammatoire au niveau de la muqueuse intestinale. Ces différentes pathologies représentent des problèmes de santé publique touchant une population importante (5% pour les MICI, 10-15% pour le SII), et nécessitent des progrès physiopathologiques et thérapeutiques. Le système protéolytique Ubiquitine-protéasome est impliqué dans la régulation de nombreux processus cellulaires, comme le cycle cellulaire, la réponse inflammatoire ou l’apoptose. L’activité protéolytique du protéasome implique deux étapes majeures : l’ubiquitination de protéines, qui cible les protéines à dégrader, puis la dégradation de ces protéines ubiquitinées par le protéasome 26S. Des études récentes suggèrent que des modifications de la protéolyse liée au protéasome seraient impliquées dans la physiopathologie de la MC et du SII mais le profil de protéines ubiquitinées au cours de l’inflammation intestinale n’a pas été étudié.L’objectif de ce projet est donc de caractériser le profil des protéines ubiquitinées au cours d’une inflammation intestinale et de le comparer à celui observé dans l’intestin sain. Cette approche sera réalisée sur des lignées de cellules épithéliales intestinales, Caco-2 et HCT-8, dans des modèles animaux de SII et de MC puis sur des prélèvements intestinaux de patients. L’étude du profil des protéines ubiquitinées sera réalisée par analyse protéomique combinée à des immunoblots. Ce projet devrait permettre de mieux comprendre le rôle du système ubiquitine-protéasome dans la physiopathologie du SII et de la MC et ouvrir de nouvelles perspectives en termes de ciblage thérapeutique.

The research topics of our group, integrated to the IFRMP, are mainly dedicated to the study of eating disorders, irritable bowel syndrome (IBS) and inflammatory bowel diseases (IBD). These pathologies share common features of intestinal inflammation and dysregulation of the gut-brain axis and offer great opportunities for innovative therapeutic strategies (immunonutrition, neurostimulation). Our investigations explore the underlying mechanisms of these diseases from the molecular level to clinical trials. This broad range of research from the bench to the bedside is the result of our research strategy that brings together basic and clinical sciences, in a tight collaboration between laboratory scientists and health professionals.Irritable bowel syndrome (IBS) and Inflammatory bowel diseases (IBD) including Crohn’s disease (CD) and ulcerative colitis are characterized by a dysregulation of the intestinal immune-inflammatory response. These diseases are of major health concern because of their high prevalence (5% for IBD, 10-15% for IBS), and new pathogenic and therapeutics advances are needed.The Ubiquitin-proteasome system is involved in the regulation of several cellular pathways including cell cycle, inflammatory response or apoptosis. Protein degradation by the ubiquitin-proteasome system involves two steps: ubiquitinylation of the targeted proteins to be degraded followed by the degradation of these ubiquitinylated proteins by the proteasome. Recent studies suggest that proteasome-mediated protein degradation is implicated during the inflammatory response observed in patients with CD or IBS. However, until now, the pattern of ubiquitinated proteins during gut inflammation has not been reported. Thus, the aim of this project will be to compare the pattern of ubiquitinylated proteins in inflammatory states as compared to healthy intestine. This project will be performed in intestinal epithelial cell lines Caco-2 and HCT-8, in IBS-like and CD-like animal models and finally in samples obtained from CD and IBS patients. The pattern of ubiquitinylated proteins will be studied by the combination of proteomic analysis and immunoblots. This project should contribute to a better knowledge of the importance of the ubiquitine-proteasome system in the regulation of gut inflammation and open new targeted therapeutic perspectives.

Le candidat devra posséder une solide formation dans The applicant must have a solid training in cell

les domaines de la biologie/physiologie cellulaires appliqués à l’inflammation. Le candidat doit maîtriser ou avoir des notions des techniques de culture cellulaire, d’analyses classiques (westernblot, ELISA) et si possible des bases en analyse protéomique.

biology/physiology in the context of inflammation. The applicant should have some previous knowledge of cell culture and standard techniques (westernblot, ELISA), and if possible some basic experience in proteomic analyses.

Faculté de Médecine-Pharmacie, 22 boulevard Gambetta, 76183 ROUEN cedexCourriel : moise.coeffier@univ-rouen.fr

Tél. : 02 35 14 82 45