UE ISSM 7.30 Méthodologies de la recherche médicale et chirurgicale GC Faure 08/10/09 Faculté de...
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UE ISSM 7.30Méthodologies de la recherche médicale et chirurgicale
GC Faure 08/10/09Faculté de Médecine et CHULaboratoire d’Immunologie, EA 4369Chargé de mission à la documentation UHP
Filière Médicale Francophone Nancy-Wuhan
2008 Un nouveau diplôme
universitaire (DU) associant Nancy et Wuhan
Diplôme d’Université (DU/DIU)
Méthodologies de la recherche médicale et chirurgicale Intégré dans le cursus de Master Objectifs:
Acquérir ou conforter les connaissances de base des méthodologies utiles à la pratique de la recherche médicale
DU: Thèmes abordés
3 modules de base Information scientifique et techniques de
communication Bases de données, publications, projets de recherche
Méthodes en biologie moléculaire, génomique, protéomique
ADN, ARN, gènes, protéines… Méthodes en biologie cellulaire, d’organes et
d’organisme Isolement, imagerie, cellulaire, de tissus, modèles
animaux
DU: Illustration par le biais de projets en cours à Nancy
3 modules applicatifs Applications en recherche médicale
Hémato-oncologie, Nutrition, Pathologies du vieillissement
(cardiovasculaire, articulaire) Pathologies inflammatoires aigues et
chroniques Applications en recherche chirurgicale
Chirurgie robotique, coeliochirurgie, microchirurgie
Greffes et transplantations Applications dans les biothérapies
Thérapies cellulaires et génique Thérapies moléculaires innovantes
Programme 2009 (1) 8 octobre
GC Faure Introduction, Chercher et Trouver, Lire et écrire
J. Mistral Accès à la documentation au SCD 15 octobre
C Philippe Génomique B Chenuel Physiologie et Systèmes biologiques
22 octobre C Nemos Transcriptomique/Protéomique J Felblinger Imagerie
29 octobre T Lecompte Hémostase P Rossignol Recherche clinique
Programme 2009 (2) 5 novembre
MC Béné Cytomique (1) GC Faure Cytomique (2)
12 novembre T Lecompte Recherche clinique dans le SAPL J Hubert, P Eschwège Chirurgie robotique et Urologie
19 novembre C Baumann Santé publique B Namour Biochimie
26 novembre P Gillet Pharmacologie N Tran Chirurgie expérimentale
Chercher et trouver
Des exemples, des méthodes Quelles recherches
Recherche Médicale Recherche Chirurgicale Recherche Clinique Recherche Biologique Recherche Imagerie
Où fait-on de la recherche? Universités, Facultés, UFRs
EPST (Inserm, CNRS, INRA, Inria…) EA (AERES)
CHUs CIC, CEC, CIT, CICancer, CIB CRB, Thèques… Cancéropôles
Industrie Laboratoires Pharmaceutiques Laboratoires Biotechnologies, Imagerie
Qui soutient la recherche? Les états
Les organismes publics Les Ministères (Recherche, Enseignement
supérieur, Industrie, Innovation) Les Régions L’Europe
Les organismes privés Industrie Associations charitables
Ligue, ARC, x Associations
Que fait-on en recherche médicale et chirurgicale?
Faire des expériences? Faire des manipulations? Travailler dans un laboratoire? Travailler avec des animaux? Travailler avec des patients? Travailler dans un service hospitalier? Recueillir des données et faire des
statistiques? Lire et écrire
Lire… et écrire
Accéder à l’information Papier ou numérique
Centres de documentation, bibliothèques, En ligne, via internet
Sélectionner l’information Stocker l’information
Utiliser l’information
Information scientifique et technique:Information scientifique et technique:
Matière première du médecin, du scientifique, du malade,
du consommateur Produit fini
du médecin, du scientifique, du chercheur
Produit à haute valeur ajoutée Produit à valeur stratégique
Un peu d ’histoire L ’information scientifique et technique
un phénomène récent, un siècle environ du « savant fou »... aux équipes
pléthoriques de la monographie, à la publication avec plusieurs centaines
d ’auteurs Quel futur au 3ème millénaire?
Circulation de l’information scientifiqueCirculation de l’information scientifique
Analogue au circuit de l’eau dans la nature les récepteurs reçoivent l’information sous
forme variée, pluie, neige, grêle... les émetteurs produisent de l’information… celle-ci s’accumule dans des réservoirs,
mer, lacs, neiges éternelles, glaciers les conservateurs stockent l ’information
Quelques questions
Quels outils de recherche d’information utiliser???
Quelles bases de données? Quels journaux?
VULGARISATION SCIENTIFIQUE
En images
MASSE d'information en croissance exponentielle
INTERNATIONALISATION évidentel’anglais est devenu la langue vernaculaire
Influence de la NUMERISATION
Evolution des OUTILS d’accès à l’INFORMATION et des SUPPORTS
LES DOCUMENTS PRIMAIRES
L'INFORMATION SECONDAIRE
LA LITTERATURE GRISE
La littérature scientifique
Littérature en noir et blanc: les documents primaires
Littérature en couleur: journaux et magazines
Littérature grise Littérature multicolore: les catalogues
commerciaux,
LES DOCUMENTS PRIMAIRES LES DOCUMENTS PRIMAIRES
JOURNAUX (25 000) ET ARTICLES
•ARTICLES ORIGINAUX
ANATOMIE D'UN ARTICLEANATOMIE D'UN ARTICLESCIENTIFIQUESCIENTIFIQUE
•LETTRES•REVUES GENERALES
Journaux de REVUESLIVRES ou Book series
DIDACTIQUES...TEXTBOOKS
Quelles fonctions pour une revue scientifique?
La dissémination de l’information Le contrôle de qualité de la recherche la constitution d’archives
« canoniques » la reconnaissance portée aux auteurs
La forme JOURNALest apparue la plus adéquate
Regroupement d’articles dans un ensemble diffusé en bloc aux abonnés
Parution à dates données, régulières Traitement des articles, qualité
typographie, langage non modification après publication garantie de retrouver un
article/référence
Apprendre à lire, à écrireApprendre à lire, à écrire
Ce qu’on ne nous a jamais appris à la Fac!
Apprendre à trouver connaître les bases de données apprendre à interroger ces bases
Lire, sélectionner... sur les bases de données:
TITRE, auteurs, mots-clés, résumé… Classer et retrouver...
Anatomie macroscopique d’un article scientifique:Anatomie macroscopique d’un article scientifique:
Titre «self-explaining» Auteurs (Noms, prénoms, titres...), Adresses Résumé (structuration)
Mots Clés (indexation) Abréviations (etc!) Introduction (rationale) Matériel et méthodes (reproductibilité) Résultats (statistiques) Figures et tableaux (légendes, PAO, visibilité) Discussion (des résultats aux hypothèses)
Références (normes à respecter) Remerciements (collaborations, financements)
Un exemple d ’article
Format pdf, exemple
Apprendre à lire, à écrireApprendre à lire, à écrire
Lire un article:Désordre de Lecture remerciements!, fin de l’introduction, ou début de la discussion, méthodes, références, légendes des figures et tableaux, introduction ou discussion, résultats
Ecrire:..... au maximum 4 pages double interligne à l ’heure
LA PRODUCTION D'INFORMATIONLA PRODUCTION D'INFORMATION
Physiologie d'un article scientifique
ConceptionDéveloppementNaissanceVieet Mort
Le concept d'EVALUATIONLe concept d'EVALUATION
Développement et physiologie d’un article scientifiqueDéveloppement et physiologie d’un article scientifique
Conception Fécondation in vitro ou sexualité de groupe
Embryologie beaucoup plus long que chez les éléphants les avortements sont fréquents, et
l’accouchement difficile beaucoup de partenaires, quelques bonnes fées et
des accoucheurs
Vie et mort d’un article beaucoup d’appelés, peu d’élus
EmbryologieEmbryologie
Bibliothèques et paillasses lecture, expérimentation, observation
consignation dans un cahier Ordinateur, postes et publishers
rédactions et écritures un manuscrit, soumission, éditeur, Peer
Review, referees, refus ou! révisions, manuscrit, éditeur, referees,
accepté! imprimeur, bon à tirer, publication,
diffusion, bibliothèques
Physiologie: Vie, Mort et à quoi ça sertPhysiologie: Vie, Mort et à quoi ça sert
Lieu de naissance Vie personnelle d’un article
Etre lu par des chercheurs, médecins, journalistes, étudiants
Etre compris Etre évalué, être CITE
Rester inconnu, être oublié, ressusciter
Physiologie: Vie, Mort et à quoi ça sertPhysiologie: Vie, Mort et à quoi ça sert
Vie sociale des articles Etre utile à ses auteurs (DEA, Thèse,
Titres et travaux... position) Etre utile à son environnement (équipe,
unité, université, ville, hôpital)
ETRE EVALUE
Le Concept d’évaluationLe Concept d’évaluation
Distribution des fréquences de citation des articles scientifiques
1 citation: 56% 2-4: 24% 50-99: 1% cumulé: 99.56% 1000: 1300 / 32 728 729=0.00004
Facteur d’impact… durée de citation...
L'information SECONDAIREL'information SECONDAIREou TERTIAIREou TERTIAIRE
ou PLUSou PLUSJournaux Médicauxquotidienshebdomadaires
MAGAZINES d'actualités
Journaux non médicauxquotidienshebdomadairesmensuelsautres
AUDIO-VISUEL: RADIO, TELEVISION
INTERNET: sites spécialisés
L ’information grise Les Thèses Les Brevets et Normes
Sites spécifiques Les Rapports publics Les Rapports privés
Internet? Trop d’information tue l’information
La littérature multicolore
Les catalogues des fabricants ex: SIGMA, R&D
Les revues «interface»
Les sites internet spécialisés
LES ACCES A L'INFORMATIONLES ACCES A L'INFORMATION
ABONNEMENTS
BIBLIOTHEQUES
PHOTOCOPIES
TIRES A PART
SOMMAIRES de Revues
Index de SommairesREVUES de Sommaires
... + Résumés (Summaries)
Bases de données:Medline, PuBMeDPascalCurrent Contents, Web of Science Scopus
PubMed: le site est encore amélioré
Les opportunités de l ’électronique
indexation en texte intégral outils de recherche intelligents inclusion de données actives liens hypertextes vers d’autres ressources open peer comments…living seminar multimédia utilisation du réseau
Numérisation: intérêt pratique A Nancy et
ailleurs... des étagères et
du PEB aux périodiques en texte intégral…
marcher feuilleter
«cliquer»
Sans bouger de chez soi! Regarder en haut à droite Elsevier, Academic Press,Wiley... Open access
Les Revues électroniquesLes Revues électroniques Qu’est ce qui a changé?
l’accès au réseau, dans les universités, dans les Hôpitaux
l’accès aux bases de données PUBMED (références, et résumés)
l’accès aux éditeurs et aux instructions aux auteurs Qu’est ce qui va changer?
le réseau les accès au document primaire ? et son format? les BU /SCD
A qui sont ces articles ? QUI PAYE? Qu’est ce qui ne change pas?
les end-users ! les nécessités:
de lire d’avoir des résultats, d’écrire... d’un peer-review
L’UMVF: Fédération Inter-
Universitaire pour l’Université Médicale Virtuelle Francophone GIP FIU-UMVF
MEN, MESR, MEFI JO 13 Aout 2003
33 Universités
http://www.umvf.prd.fr/info/qui/presentation.html
L’UMVF: ses missions
mettre en œuvre les technologies de l’information et de la communication pour l'enseignement (TICE) de la médecine en formations initiale et continue. Centre de ressources interactif dans le domaine de la santé Centre d’information et de prévention pour le public Diffusion et de promotion de la science médicale française dans le
monde.
produire des ressources documentaires venant en complément des cours. Etudiants de 2e cycle préparant les Epreuves Classantes Nationales
(ECN)… une banque de données Plus d'une trentaine de campus numériques disciplinaires
soutenue par la Conférence des Présidents d’Université la Conférence Nationale des Doyens des Facultés de Médecine.
Les Campus Numériqueshttp://www.umvf.prd.fr/ressources/campus.php
Plus de 45 en fait, Toutes disciplines
du premier cycle Histologie-
embryologie Microbiologie Statistiques
à l’ECN Néphrologie Neurologie Rhumatologie…
ASSIM: RAISIL Réseau d’accès à l’information scientifique en lignehttp://www.assim.refer.org
Les questions du module 8 Immunologie De 112 à 127 Une structure en
briques de connaissance
Des cas cliniques Des réponses Pas de QCMs
Doc’UMVF Nouvelle Page ECN 2010
345 items Plus de 2000 documents
pédagogiques
CISMEF Rouen S Darmoni JP Thirion
Autres ressources d’intérêt en langue française CNCI
http://www.cnci.univ-paris5.fr/welcome.html Concours Médecins étrangers
Annales QCM 2005-2007: 3x120 http://www.cnci.univ-paris5.fr/medecine/
Annales_ETR.html Les pages ECN de l’HAS +++
http://www.has-sante.fr/portail/jcms/c_646948/examen-classant-national-ecn-mot-du-president-sommaire-mode-d-emploi
Mise à jour mensuelle ORPHANET++
Aimez vous les vidéos? Utilisez vous les podcast?
UMVF: canal U http://www.canal-u.tv/themes/scienc
es_de_la_sante_et_du_sport
Au NIH, cela dépasse l’internat NIH videocasting and podcasting http://videocast.nih.gov/
Les moteurs de recherche
Google, Yahoo, Bing… Wikipedia?
Nature Medicine 2007;13: 231-233
Other resources (en anglais)
emedicine by WebMD http://emedicine.medscape.com/
Sur PubMed OMIM Books PubMedCentral (Free archives)
Méthodes de travail! À L’Ecole
Programmes… Examen
En Recherche Cahier de laboratoire Electronic-lab-book
A l’Université et tout au long de la vie Logbook Portfolio E-portfolio
Workplace-Based Assessment
Assessing a trainee’s progress Assessing competences in laboratory
procedures and clinical skills Assessing trainee’s skills in clinical
examination Case-based discussions
An hindrance: duration (5years) and diversity of training
How to help trainees in acquiring skills and competences?
Portfolio: old and new words, evolving concepts in training
From « Titres et travaux » to portfolio Logbook.. Book Portfolio
a tool for training and legitimation
E-portfolio: the future Usage of internet
and web 2.0 Access anywhere
anytime
UK: Wales Europe:Elfel project