Société de services spécialisée en nutrition et santé...

32
Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II Dr Pauline Grimm Ingénieur de recherche Société de services spécialisée en nutrition et santé animale

Transcript of Société de services spécialisée en nutrition et santé...

Page 1: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Dr Pauline Grimm

Ingénieur de recherche Société de services spécialisée en nutrition et santé animale

Page 2: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Accompagner nos clients dans le développement de produits

2

Conseil

Revue bibliographique Positionnement sur le marché Aide à la formulation

Valorisation

Publication des résultats Présentation en congrès Accompagnement des dossiers d’enregistrement

Test

Cinétique Innocuité / Toxicité Appétence / Préférence Efficacité / Effet dose Digestibilité

Page 3: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Microbiote

digestif

Alimentation

Santé

Production Comportement

Performance

Nos expertises méthodologiques

3

Page 4: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Station expérimentale

Laboratoire d’analyses Salle de chirurgie

Réseau académique et terrain

Nos moyens de recherche

Page 5: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le rôle essentiel du microbiote gastro-intestinal

pour la santé du cheval

Page 6: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Sources d’énergie

Anatomie digestive équine

Merritt et Julliand, 2013

ESTOMAC

8-15 L

I. GRÊLE

50 L 25 m

GROS INTESTIN

120 L 10 m

6

Page 7: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Sources d’énergie

Digestion

Temps de rétention des digesta

Activité X

enzymatique

microbienne

7

Page 8: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Sources d’énergie

Temps de rétention moyens

ESTOMAC

0,5-10h

I. GRÊLE

1-8h

GROS INTESTIN

10-30h

Merritt et Julliand, 2013

8

Page 9: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Sources d’énergie

Digestion enzymatique

ESTOMAC

I. GRÊLE GROS INTESTIN

9

Page 10: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Sources d’énergie

Digestion microbienne

ESTOMAC

I. GRÊLE GROS INTESTIN

10

Page 11: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Microbiote du gros intestin équin Structure et fonction

11

Page 12: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Composition bactérienne

12

Techniques de biologie moléculaire

Séquençage

qPCR

Page 13: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Composition bactérienne

Firmicutes ( 20 à 59 %)

Bacteroidetes (2 à 65 %)

Proteobacteria (0 à 14 %)

Verrucomicrobia (0 à 24 %)

Spirochaetes (1 à 9 %)

Fibrobacteres (1 à 7 %)

Actinobacteria (0 à 2 %)

Other

13

Julliand and Grimm, 2016

Clostridiaceae Lachnospiraceae

Ruminococcaceae

Prevotellaceae Rikenellaceae

Bacteroidales S24-7

Phylum Family

Page 14: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II 14

Cæcum

Côlon VD

Fèces

Grimm, données personnelles

Composition bactérienne

Caecum CVD CVG PC Fèces CDD CDG

Page 15: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Composition bactérienne

98 % d’espèces inconnues !!!

15

Page 16: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Composition bactérienne

16

©LA

B T

O F

IELD

©LA

B T

O F

IELD

Techniques culturales

Page 17: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Composition bactérienne

17

Bactéries fibrolytiques

Bactéries amylolytiques

Bactéries utilisatrices de lactate

107 – 1011 de bactéries anaérobies totales / mL

Cellulo Hemicellulo Pectino

104 - 108 106 - 108 106 - 108 108 105 - 108

Julliand et Grimm, 2016

Page 18: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Fonctions bactériennes

18

C2 + C3 + C4 Lactate

C2 + C3 +C4

Lactate

Hydrolyse et fermentation

Amidon et sucres simples

Fibres (cellulose, hémicelluloses, pectines)

AGV= Acides Gras Volatiles

C3

C2 : Acétate (73 %) C3 : Propionate (18 %) C4 : Butyrate (6%)

Bactéries fibrolytiques

Bactéries amylolytiques

Bactéries utilisatrices de lactate

Lactate

> 50 % de l’énergie du cheval

Cellulo Hemicellulo Pectino

Page 19: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Microbiote du gros intestin équin Rôle dans la santé du cheval

19

Page 20: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Un écosystème en équilibre…

EUBIOSE

20

Page 21: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Un écosystème en équilibre…fragile

DYSBIOSE Coliques

Colites Fourbures Diarrhées

21

Page 22: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Régime riche en amidon, dysbiose et coliques

DYSBIOSE

22

Coliques

Page 23: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Coliques du cheval

23

(Hudson et al, 2001; Gonçalves et al, 2002; White et al, 2009)

COLIQUE = douleurs abdominales Souvent origine digestive

Gros intestin le plus touché

1ère cause d’urgence et de mortalité Incidence : 4 à 26 % par an Impact financier : 115 millions $ aux Etats-Unis entre 1998 et 1999 Principal facteur de risque: Régimes riches en amidon

Page 24: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II 24

Bactéries fibrolytiques

Bactéries amylolytiques

Bactéries utilisatrices de

lactate

Fibres (cellulose, hémicelluloses, pectines)

Lactate

C3

pH

(Goodson et al., 1988; Julliand et al., 2001; Medina et al., 2002)

Régime riche en amidon et dysbiose

Amidon et sucres simples Amidon et sucres simples

> 200 g /100 kg PV/repas

Non digéré entièrement en ante-cæcal

C2 + C3 + C4 Lactate

C2 + C3 +C4

Lactate

+ Gaz

Page 25: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Julliand et al, 2001

Régime riche en amidon et dysbiose

100% Foin 50% Foin 50% Orge

70% Foin 30% Orge

Bactéries cellulolytiques dans le gros intestin

(106 CFU / mL)

0,5

1,0

1,5

1,9

0,1 0,1

Lactate dans le gros intestin

(mg/L)

100

200

300

400

436

227

53

6,7

6,4

6,3

25

Page 26: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Régime riche en amidon et dysbiose

Cæcum (Foin) Cæcum (Foin/Orge)

Colon (Foin) Colon (Foin/Orge)

Feces (Foin) Feces (Foin/Orge)

100 % Foin vs 56 % Foin + 44 % Orge

26

Grimm, données personnelles

Page 27: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Régime riche en amidon et dysbiose

0

200

400

600

800

1000

1200

Nombre d'espèces

Richesse

0

1

2

3

4

5

6

7

Indice de Shannon

Diversité

100 % Foin

56% Foin/44% Orge

* *

Grimm, données personnelles

27

Page 28: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Dysbiose et coliques

28

Fibrobacter 2,7 % 0,4 % 0,5%

Ruminococcaceae 1,4 % 0,3 % 0,2 %

Bacillus-Lactobacillus- Streptococcus (BLS)

3,9 % 5,5 % 9,2 %

Lactate 1,0 mM 2,5 mM 6 mM

Veillonellaceae 1,2 % 1,3 % 1,3 %

Simple Colonic Obstruction and Distension

S

i

m

i

l

a

r

Daly et al., 2012

Fibro

Amylo

Fibro

Lacto

Accumulation de lactate?

Page 29: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Autres impacts de la dysbiose

Diarrhées

Inflammation ?

Stress / Anxiété ? Fourbure

DYSBIOSE

29

Coliques

Page 30: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Dysbiose et comportement

30

Vigilance

Destrez et al., 2015

Modification of bacteria concentration

Page 31: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Conclusion et perspectives

31

No microbes, no horse!

Page 32: Société de services spécialisée en nutrition et santé animalerelaiswebcasting.com/aftaa/2017/03_Pauline_Grimm_AFTAA.pdf · EUBIOSE 20 . AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Le Mans 7/12/2017 AFTAA Session Immunité et Nutrition II

Merci !

32