Sélection_Assistée par Marqueurs pour la création de nouvelles ...

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Photo J.M. Abiven Sélection Assistée par Marqueurs (SAM) pour la création de nouvelles variétés de pomme de terre Marhadour 1 , S., Abiven 2 , J.M., Aurousseau 3 , F., Dubreuil 4 , H., Le Hingrat 5 , Y. Les marqueurs moléculaires sont devenus un outil de sélection Depuis 2008, les sélectionneurs des Etablissements Producteurs Régionaux Bretagne Plants, Comité Nord et Grocep utilisent des marqueurs moléculaires dans certaines étapes de leur selection. Quelles sont les cibles ? Les caractères poursuivis jusqu’à présent sont des résistances à différents bioagresseurs: nématodes (G. rostochiensis et G. pallida). virus PVY Les résistances concernées sont de type monogénique ou oligogé- nique. Un peu plus de 3500 tests ont été réalisés en 2011 dans les labora- toires professionnels 1 FN3PT INRA UMR 1349 IGEPP, Keraiber 29260 Ploudaniel France 2 Bretagne Plants, Station de création variétale, Kerloï, 29260 Ploudaniel, France 3 Station de recherche du Comité Nord, 76110 Bretteville du Grand Caux, France 4 Grocep, Station de Lavergne, BP3, 87370 Laurière, France 5 FN3PT, Roudouhir, 29460 Hanvec, France S. Marhadour, Juillet 2012 Perspectives Le travail sur la résistance au mildiou continue avec des perspecti- ves de résultat à moyen terme. Un travail sur les collections des stations de création variétale a été initié avec l’objectif de positionner la diversité génétique utili- sée par les obtenteurs avec celle présente dans la collection Inra. Sélection Assistée par Marqueurs ? Qu’est ce qu’un marqueur moléculaire ? Un marqueur moléculaire est révélé au laboratoire. Il indique la présence ou l’absence d’un caractère recherché dans le génome d’un hybride(ex: résistant ou sensible). La plupart des caractères nécessitent l’utilisation simultanée de plusieurs marqueurs car ils sont expliqués par plusieurs régions génomiques (QTL, locus à effet quantitatifs). Un partenariat étroit avec l’Inra Le programme de développement des marqueurs est issu d’un parte- nariat étroit avec l’Inra, UMR IGEPP site de Ploudaniel initié en 2003. Depuis de nombreuses années, l’Inra met à disposition des obten- teurs des géniteurs de résistance . Depuis 2009, des marqueurs asso- ciés sont aussi proposés. Cette mise à disposition est, en général, le résultat d’un travail d’une vingtaine d’années à partir du croisement initial. Ce travail sera renforcé dans le cadre de l’UMT Innoplant. Comment s’y prend-on ? Choix du matériel à tester en fonction des marqueurs disponibles Extraction de l’ADN Mise en oeuvre des marqueurs Analyse des résultats Sélection des génotypes sur marqueurs Poursuite de la sélection au champ

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Photo J.M. Abiven

Sélection Assistée par Marqueurs (SAM) pour la création de nouvelles variétés de pomme de terre

Marhadour1, S., Abiven2, J.M., Aurousseau3, F., Dubreuil4, H., Le Hingrat5, Y.

Les marqueurs moléculaires sont devenus un outil de sélection Depuis 2008, les sélectionneurs des Etablissements Producteurs Régionaux Bretagne Plants, Comité Nord et Grocep utilisent des marqueurs moléculaires dans certaines étapes de leur selection.

Quelles sont les cibles ? Les caractères poursuivis jusqu’à présent sont des résistances à différents bioagresseurs:

nématodes (G. rostochiensis et G. pallida). virus PVY

Les résistances concernées sont de type monogénique ou oligogé-nique. Un peu plus de 3500 tests ont été réalisés en 2011 dans les labora-toires professionnels

1 F N 3 P T I N R A U M R 1 3 4 9 I G E P P , K e r a i b e r 2 9 2 6 0 P l o u d a n i e l F r a n c e 2 B r e t a g n e P l a n t s , S t a t i o n d e c r é a t i o n v a r i é t a l e , K e r l o ï , 2 9 2 6 0 P l o u d a n i e l , F r a n c e 3 S t a t i o n d e r e c h e r c h e d u C o m i t é N o r d , 7 6 1 1 0 B r e t t e v i l l e d u G r a n d C a u x , F r a n c e 4 G r o c e p , S t a t i o n d e L a v e r g n e , B P 3 , 8 7 3 7 0 L a u r i è r e , F r a n c e 5 F N 3 P T , R o u d o u h i r , 2 9 4 6 0 H a n v e c , F r a n c e

S. Marhadour, Juillet 2012

Perspectives Le travail sur la résistance au mildiou continue avec des perspecti-ves de résultat à moyen terme. Un travail sur les collections des stations de création variétale a été initié avec l’objectif de positionner la diversité génétique utili-sée par les obtenteurs avec celle présente dans la collection Inra.

Sélection Assistée par Marqueurs ?

Qu’est ce qu’un marqueur moléculaire ? Un marqueur moléculaire est révélé au laboratoire. Il indique la présence ou l’absence d’un caractère recherché dans le génome d’un hybride(ex: résistant ou sensible).

La plupart des caractères nécessitent l’utilisation simultanée de plusieurs marqueurs car ils sont expliqués par plusieurs régions génomiques (QTL, locus à effet quantitatifs).

Un partenariat étroit avec l’Inra Le programme de développement des marqueurs est issu d’un parte-nariat étroit avec l’Inra, UMR IGEPP site de Ploudaniel initié en 2003. Depuis de nombreuses années, l’Inra met à disposition des obten-teurs des géniteurs de résistance . Depuis 2009, des marqueurs asso-ciés sont aussi proposés. Cette mise à disposition est, en général, le résultat d’un travail d’une vingtaine d’années à partir du croisement initial. Ce travail sera renforcé dans le cadre de l’UMT Innoplant.

Comment s’y prend-on ?

Choix du matériel à tester en fonction des marqueurs

disponibles

Extraction de l’ADN

Mise en oeuvre des marqueurs

Analyse des résultats

Sélection des génotypessur marqueurs

Poursuite de la sélection au champ