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BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVALBIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 1

MDD-6106 Méthodologie de la recherche en sciences dentaires

Par la bibliothécaire-conseil

Marie-Claude Laferrière M.S.I.

15 septembre 2017

Recherche dans les bases de données PubMed et Embase


Plan de la présentation

Site web de la Bibliothèque

Recherche dans les bases de données PubMedet Embase (Vocabulaire libre et contrôlé)

Apprendre à faire une recherche structurée à l’aide d’un plan de concept


• Services

» Bibliométrie et impact de la recherche

» Bureau du Droit d’auteur

» CorpusUL – Dépôt institutionnel de l'Université Laval

» Logiciels de gestion de références bibliographiques (EndNote et Zotero)

• Collections et ressources

» Catalogue Ariane

» Films, disques, etc. (Médiathèque)

» Ressources électroniques

» Explorer par discipline : Médecine dentaire

La Bibliothèque : services et collections

http://www.bibl.ulaval.ca/services/bibliometrie

https://www.bda.ulaval.ca/

http://www.bibl.ulaval.ca/services/depot-institutionnel

http://www.bibl.ulaval.ca/services/logiciels-gestion-references-bibliographiques

http://ariane25.bibl.ulaval.ca/ariane

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http://www.bibl.ulaval.ca/services/acces-aux-ressources-electroniques

http://www.bibl.ulaval.ca/web/medecine-dentaire


• Vous trouverez les ressources propres à votre discipline telle que:

» les bases de données spécialisées pour retrouver des articles en médecine dentaire;

» les ensembles de livres électroniques en sciences de la santé;

» les dictionnaires et encyclopédies en médecine dentaire;

» les nouveautés à la bibliothèque;

» et plus !

Explorer par discipline : Médecine dentaire


Accès à distance aux ressources électroniques

IDUL

NIP

Modalités et conditions d'accès

• Une fois la session activée, vous pouvez consulter toutes les ressources électroniques désirées.

• Vous devrez donc vous déconnecter à la fin de votre session de travail en cliquant sur dans le coin gauche du navigateur.

• La session expire à la fermeture du navigateur Web ou après 60 minutes d'inactivité.


Recherche dans les bases de

données PubMed et Embase


Interroger une base de données

La recherche à l’intérieur des bases de données bibliographiques se fait à l’aide de deux méthodes de recherche différentes qui se complètent:

Vocabulaire libre (mots-clés)

Vocabulaire contrôlé

(thésaurus ou sujet)


Vocabulaire libre (mots-clés)


La recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Généralités

Le vocabulaire libre est la méthode de recherche la plus utilisée.

Utilisation de ses propres mots, afin de repérer des documents sur le sujet d’intérêt.

Le choix et l’orthographe du mot ont une incidence majeure sur les résultats de recherche.

Les champs à privilégier dans la recherche:• PubMed: [Title/Abstract] • Embase: ti,ab


Recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Vos termes de recherche

Les termes utilisés par l’auteur

OlysioLes articles qui parlent d’Olysio

directement

Pas nécessairement ceux qui parlent de Simeprevir

ou de Galexos

?

Exemple : Je m'intéresse aux traitements de l’hépatite C chronique chez l’adulte


Outils pour trouver du vocabulaire

• HeTOP - Portail Terminologique de Santé (CiSMeF)• Traduit le MeSH de Medline

• Grand dictionnaire terminologique (OQLF)

• TERMIUM Plus (Gouvernement du Canada)

Dictionnaires gratuits en ligne

• Notes de cours, manuels, articles scientifiques et vous!

Autres sources

Disponibles : Explorer par discipline > Médecine dentaire > Atlas, dictionnaires et encyclopédies Dictionnaire et ressources sélectionnés > Sélection de dictionnaires et autres ressources > Dictionnaires, grammaires et encyclopédies en ligne

http://www.hetop.eu/hetop/

http://www.granddictionnaire.com/

http://www.btb.termiumplus.gc.ca/tpv2alpha/alpha-fra.html?lang=fra





http://www.btb.termiumplus.gc.ca/tpv2alpha/alpha-fra.html?lang=fra&i=1&srchtxt=&go=Rechercher

http://www.btb.termiumplus.gc.ca/tpv2alpha/alpha-fra.html?lang=fra&i=1&srchtxt=&go=Rechercher

http://www.bibl.ulaval.ca/web/medecine-dentaire/dictionnaires-et-encyclopedies

http://www.bibl.ulaval.ca/chercher-autres-sujets/chercher-dictionnaires-grammaires-encyclopedies


Exercice – HeTOP

Utilisez le HeTOP - Portail Terminologique de Santé du CISMeF.

Trouvez cinq synonymes anglophones pour la maladie Diabète de type 1.

Autoimmune diabetes

Brittle diabetes mellitus

Insulin dependent diabetes mellitus

Juvenile-onset diabetes / Juvenile onset diabetes

Sudden-onset diabetes mellitus


Exemple - PubMed

1. Traduction

Consultation d’HeTOP

Obésité > Obesity

2. Synonymes et variantes orthographiques

Body weight, body weights, body-weight, body fat distribution, fat tissue distribution, overweight, over weight, over eat, over eating, obesities, obese, visceral obesity, morbidobesity, morbid obesities, abdominal obesity, body fat, waist, body fat, fat load, body mass index, quetelet index, BMI, etc.

Je cherche des articles qui portent sur l’obésité

Astuce: utilisation de variantes orthographiques et de synonymes pour chacun des concepts afin de maximiser le repérage.


Outils - Les symboles

Troncature : placée à la fin d’un terme, elle permet de repérer toutes les terminaisons possibles de ce terme.

Child* permet de repêcher child, children, childhood.

Guillemets: entourent une phrase, une expression ou une série de mots. Ils permettent de repérer une série de mots placée dans le même ordre d’apparition.

"Mouth protector" ou "Mouth guard" permet de repêcher ces mots tels qu’ils apparaissent dans le texte.

Pour gagner du temps et de la précision

$ * ? | +

""*

Voir le tableau Astuces et syntaxe – Bases de données en sciences de la santé

http://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/medecine/astuces_synthaxe_bd_sante.pdf


Exercices - Recherche simple

Combien trouvez-vous d’articles sur le

diabète insulino-dépendant (Type 1)?

diabetes type 1 = 68 203

Insulin-Dependent Diabetes = 90 882

"type 1 diabetes" = 29 495

diabetes mellitus type 1 = 68 283

Combien trouvez-vous d’articles de

l’auteur Kevin J. Donly?

Donly, Kevin J[Author] = 55

Donly, Kevin[Author] = 63

Donly KJ[Author] = 127

Donly KJ[Author] OR Donly, Kevin J[Author] OR Donly, Kevin[Author] = 135

Utilisez la recherche simple. Utilisez la recherche Advanced.


Vocabulaire

contrôlé (thésaurus ou sujet)


Méthode de recherche faite à partir de termes normalisés

Le langage propre utilisé par une base de données pour décrire le contenu des articles scientifiques qu’elle indexe.

Pour utiliser cette méthode, on doit d’abord valider notre terme dans le dictionnaire de la base de données, appelé « thésaurus ».

Le champ à privilégier dans les bases de données est:

PubMed > MeSH (Medical Subject Headings)

ex: "Diabetes Mellitus, Type 1"[Mesh]Embase > Emtreeex: 'insulin dependent diabetes mellitus'/de

Recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus ou sujet)

Généralités


Recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus ou sujet)

Avantage: supprime l'ambiguïté du langage naturel (synonymes / variantes orthographiques)

Permet de regrouper et de repérer tous les documents sur un sujet donné.

DiabetesMellitus, Type 1

Insulin-Dependent

Diabetes

AutoimmuneDiabetes

Juvenile-Onset

Diabetes


Thésaurus

• Listes de termes normalisés:

» Utilisés uniquement dans un domaine particulier.

» Classés par ordre sémantique et hiérarchique.

• Plusieurs termes sont attribués à chaque référence.

Ils permettent de décrire de la manière la plus

spécifique possible le contenu de l’article.

Par conséquent, les articles sont indexés uniformément, peu importe le vocabulaire utilisé

par l’auteur.


Thésaurus en santé

La plupart des bases de données disciplinaires en santé publient un thésaurus et souvent celui-ci est intégré au logiciel de la base.

PubMed

MeSH

(Medical SubjectHeadings)

Embase

Emtree

CINAHL

Descripteurs Cinahl

Cochrane

MeSH

(même que PubMed)

PsyINFO

Thesaurus

(sous l’onglet « Term Finder »)


Recherche MeSH - PubMed

Je cherche des articles sur la prévention de la carie dentaire.


Recherche MeSH


Définition du MeSH

Subdivisions

Transformation du MeSH en concept majeur [MAJR]

Empêcher l’explosion automatique du MeSH


Concepts plus larges Concepts spécifiques

> Recherchés automatiquement dans PubMed. Pour l'empêcher, sélectionner Do not include MeSH terms found below this term in the MeSH hierarchy.


Vous sélectionnez les options voulues et cliquez sur Add to search builder. Puis sur SearchPubMed pour lancer la recherche.


Exercice – MeSH | subdivisions

Combien trouvez-vous d’articles sur les complications du bruxisme du sommeil?

"Sleep Bruxism/ complications"[Mesh] = 96


Pour raffiner rapidement les résultats de recherche (Langue, âge, date de publication,

journal en dentisterie, etc.)

Les filtres sont des termes du vocabulaire contrôlé (MeSH).

Attention! Show = affichage et non-sélection.


Exercice – MeSH | Filtre et concept majeur

Vous vous intéressez à la cervicalgie. Combien de résultats obtenez-vous en sélectionnant le concept majeur? Combien

d’entre eux sont des revues systématiques?

"Neck Pain"[Majr] = 3 680Filters : Systematic Reviews = 283


Pour combiner des recherches, vous pouvez utiliser l’historique de recherche qui se trouve dans Advanced.


Combiner deux MeSH

Vous pouvez également utiliser les opérateurs booléens du Builder dans le MeSH Database pour combiner uniquement des MeSH.


Exercice – MeSH | combiner deux recherches

Combien trouvez-vous d’articles sur les soins dentaires dansles foyers pour personnes âgées?

"Dental Care for Aged"[Mesh] AND "Homes for the Aged"[Mesh] = 141

("Dental Care"[Mesh]) AND "Homes for the Aged"[Mesh] = 185


Recherche Emtree - Embase



Je cherche des articles sur la prévention de la carie dentaire.


Les termes plus spécifiques sont recherchés automatiquement dans Embase. Pour l'empêcher, désélectionner Explode.

Explosion du Emtree

Transformation du Emtreeen concept majeur /mj Remarquez la hiérarchie

de Dental cariesd’Emtree est différente de celle du MeSH.


Définition du Emtree

Synonymes du Emtree


Dans Embase, il y a uniquement des subdivisions pour la recherche sur les maladies (Diseases Search), les médicaments (Drugs Search) et les équipements (Devices Search). > Si sur le bouton bleu, il est inscrit Take this query to Advanced Search, c’est qu’il n’y a pas de subdivisions disponibles.


Pour raffiner rapidement les résultats de recherche (Langue, âge, date de publication, etc.)


Pour combiner des recherches, vous devez utiliser l’historique de recherche qui se trouve dans le haut de la page de résultats.


Exercice – Emtree

Combien trouvez-vous d’articles sur les

complications du bruxisme du sommeil?

'bruxism'/exp/dm_co

= 650

Vous vous intéressez à la cervicalgie. Combien de

résultats obtenez-vous en sélectionnant le concept majeur? Combien d’entre

eux sont des revues littérature?

'neck pain'/mj = 4 114

AND 'review‘/it = 399

Combien trouvez-vous d’articles sur les soins

dentaires dans les foyers pour personnes âgées?

'home for the aged'/de AND 'dental

procedure'/exp

= 247


Gestion des résultats


Obtenir le texte de l’article

• Le bouton permet de vérifier si un document est disponible à l’Université Laval.

» Ce dernier est visible avec le Format: Abstract ou si vous cliquez sur le titre de la notice.

» Directement sur la page de résultats.

• Si la Bibliothèque n’est pas abonnée à la revue recherchée, on peut alors faire une recherche avec Google Scholar pour voir si l’article est disponible gratuitement sur le Web.

• Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques (PEB) au coût de 5$.



• Send to (sur la page de résultats) permet plusieurs options:

» File : enregistrer les notices sélectionnées» E-mail : envoyer les notices par courriel» Clipboard : permets de rassembler plusieurs notices sélectionnées. Peut contenir jusqu’à 500

notices (effacées après 8 heures d’inactivité).

Les options sont aussi disponibles dans le Clipboard.


Création d’un compte dans les bases de données

• Sauvegarder des stratégies de recherche.

• Obtenir des alertes par courriel.

• Personnaliser l’interface de PubMed (pas Embase).

• Nécessité de s’inscrire.

Vous permet de :

Créez votre compte My NCBI


Apprendre à faire une recherche structurée à l’aide d’un plan de concept


Élaboration d’une stratégie de recherche

Formuler son sujet de recherche

Identifier les principaux concepts

Trouver le vocabulaire approprié

Formuler des équations de

recherche (opérateurs booléens)

Analyser et évaluer les

résultats de la recherche


1. Formuler son sujet de recherche

PICO

• Patient (population): Adultes

• Intervention : Soie dentaire

• Comparateur : aucun

• Outcomes : Prévention ou diminution des maladies parodontales

Cerner et délimiter son sujet en l’exprimant sous la forme d’un énoncé ou d’un PICO.

Est-ce que l’utilisation de la soie dentaire prévientles maladies parodontales chez l’adulte?


2. Identifier les principaux concepts

Peu importe la base de données, une recherche efficace requiert un choix pertinent des concepts.

Concept 1

• Soie dentaire

Concept 2

• Maladies parodontales

Est-ce que l’utilisation de la soie dentaire prévient

les maladies parodontales chez l’adulte?


3. Trouver le vocabulaire approprié | outils

Vocabulaire libre Vocabulaire contrôlé

Dictionnaires• HeTOP - Portail Terminologique de Santé (CiSMeF)

• Grand dictionnaire terminologique (OQLF)

• TERMIUM Plus (Gouvernement du Canada)

Autres documentations

• Notes de cours

• Manuels

• Articles scientifiques

Et vous!

La plupart des bases de données disciplinaires en santé publient un thésaurus et souvent celui-ci est intégré au logiciel de la base.

• MeSH (Medline et Cochrane)• Emtree (Embase)• Descripteurs CINAHL • Thésaurus (PsycINFO et Eric)• etc.



http://www.btb.termiumplus.gc.ca/tpv2alpha/alpha-fra.html?lang=fra


3. Trouver le vocabulaire approprié | analyse d’articles

Résumé

Titre

Sujets de la base de données (MeSH,

Emtree, Descripteurs CINAHL)

Recherche

vocabulaire libre

Recherche

vocabulaire contrôlé

Combinaison des deux

recherches


3. Trouver le vocabulaire approprié

Concept 1Soie dentaire

Vocabulaire libre (mots-clés) Vocabulaire contrôlé

Dental flossDental tape*Clean* interdental / inter-dentalClean* interproximal / inter-proximal

MeSH:"Dental Devices, Home Care"[Mesh]

Emtree: 'dental floss'/de

Vocabulaire libre et contrôlé

Concept 2Maladies

parodontales

Vocabulaire libre (mots-clés) Vocabulaire contrôlé

Periodontal Disease*Gingivi*Gingival pocket*Periodontal pocket*Gum(Gums) inflammationGum(Gums) bleed* (blood)

MeSH: "Periodontal Diseases"[Mesh]

Emtree: 'periodontal disease'/exp


4. Formuler des équations de recherche en utilisant

les opérateurs booléensPour lier les différents concepts ou les différents champs

AND (ET)

Limite la recherche à

l’intersection des concepts

OR (OU)Unit les différents concepts

NOT(SAUF)

Exclut un ou plusieurs concepts

non souhaités

Précise la recherche, mais

ATTENTION

Soie

dentaireMaladies

parodontales

Gum Gingiva

Adultes Enfants


4. Formuler des équations de recherche en

utilisant les opérateurs booléens

ET/AND

Concept 1 Équation de recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Équation de recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus)

OU / OR

Concept 2Équation de recherche en vocabulaire libre (mots-clés)

Équation de recherche en vocabulaire contrôlé (thésaurus)

OU / OR

Zones de recherche

Title Abstract Keyword (de l’auteur)

Zone de recherche

Sujet

(spécifique à une base de données)


Équations de recherche dans EmbaseÀ partir de votre plan de concept, vous pouvez formuler plusieurs équations simples de recherche, puis vous les combinez à l’aide de l’historique de recherche.

Combinaison des

deux concepts

9. 4 AND 10 = 691 résultats

1. (floss* OR 'dental tape*'):ab,ti = 1 331 résultats

2. (clean* NEAR/4 (interdental OR 'inter dental' OR interproximal OR 'inter proximal')):ab,ti= 209 résultats

3. 'dental floss'/de = 4158résultats

Concept 1Soie dentaire

4. 1 OR 2 OR 3 = 5 495 résultats

5. periodont*:ab,ti = 64 645 résultats

6. gingiv*:ab,ti = 44 792 résultats

7. ((gum OR gums) AND (blood* OR bleed* OR inflamm*)):ti,ab = 2 922 résultats

8. ((blood OR bleed*) NEAR/4 prob*):ab,ti = 14 086 résultats

9. 'periodontal disease'/exp = 93 572 résultats

Concept 2Maladies parodontales

10. 5 OR 6 OR 7 OR 8 OR 9 = 141 233 résultats


Les stratégies de recherche sont dans la section « Appendices » des Cochrane Reviews.

Référence

Sambunjak D, Nickerson JW, Poklepovic T, Johnson TM, Imai P, Tugwell P, Worthington HV. Flossing for the management of periodontal diseases and dental caries in adults. Cochrane Database of Systematic Reviews 2011, Issue 12. Art. No.: CD008829. DOI: 10.1002/14651858.CD008829.pub2.

Exemple de stratégie dans Cochrane Library


5. Évaluer les résultats de la recherche

Vous obtenez trop de résultats

• Limitation de la recherche par date de publication, par langue, par type de documents, etc.

• Ajout de termes spécifiques en utilisation l’opérateur booléen AND (et).

Vous obtenez trop peu de résultats

• Augmentation de la portée de la recherche en utilisant des termes plus généraux.

• Ajout de mots-clés (synonymes) en utilisant l’opérateur booléen OR (ou).


Pour plus d’information!

• PubMed

» Tutoriel : http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Medline/player.htm

» Guide d’utilisation :

• PubMed : http://www.bibl.ulaval.ca/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline.pdf

• MeSH : http://www.bibl.ulaval.ca/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh.pdf

» PubMed help – http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.PubMed_Quick_Start

• Plan de concept

» Tutoriel : http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Plan_concepts_Nursing/Plan_concepts_Nursing.htm

» PDF: http://www4.bibl.ulaval.ca/cgi-bin/Diapason/plan_concepts.pl

• Astuces et syntaxe – Bases de données en santé http://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/medecine/astuces_synthaxe_bd_sante.pdf

• Comment trouver des documents pertinents à partir d’une publication parfaite sur mon sujethttp://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/foresterie/images/comment-trouver.jpg

http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Medline/player.htm

http://www.bibl.ulaval.ca/bd/bd_guides_utilisation/guide_medline.pdf

http://www.bibl.ulaval.ca/bd/bd_guides_utilisation/guide_mesh.pdf

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK3827/#pubmedhelp.PubMed_Quick_Start

http://www.bibl.ulaval.ca/capsule/Plan_concepts_Nursing/Plan_concepts_Nursing.htm

http://www4.bibl.ulaval.ca/cgi-bin/Diapason/plan_concepts.pl

http://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/medecine/astuces_synthaxe_bd_sante.pdf

http://www.bibl.ulaval.ca/fichiers_site/portails/foresterie/images/comment-trouver.jpg


Marie-Claude LaferrièreConseillère à la documentationBibliothèque scientifiqueBureau 1018-C418 656-2131, poste [email protected]

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