Medline: PubMed et Ovid - bibliothequeduchum.ca · uniques / Accès / Portail documentaire:...
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Medline: PubMed et Ovid
Daniela Ziegler
Bibliothécaire – Informationniste
Centre de documentation du CHUM
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uniques / Accès / Portail documentaire: quelques précisions)
Medline – en quelques mots
Medline (Ovid et PubMed)
Réputation et accès
Interface de recherche
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Recherche par mots-clés
Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Les ressources électroniques Centre de documentation CHUM
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Portail documentaire CHUM pour les documents disponibles en versions électroniques
Catalogue pour localiser les monographies et les périodiques en
format imprimé sur les rayons du réseau des points de services du Centre de documentation du CHUM
banques de données
Manuels(textbook, handbook), vidéos, etc.
Périodiques électroniques
La collection papier et numérique
en chiffres
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120 000 livres;
564 périodiques en papier ou microforme documents
audiovisuels;
344 abonnements disponibles à distance grâce à notre
partenariat avec le Réseau universitaire intégré de santé de
l’Université de Montréal (RUIS de l'UdeM).
Documents uniques Centre de documentation du CHUM
Liste non exhaustive
Périodiques électroniques
Cerebrovascular diseases (plus récent 1 an et non disponible UdeM)
Clinical neurosurgery
Journal of marriage and family (plus récent 1 an et non disponible UdeM)
Journal of neurotrauma (plus récent 1an et non disponible UdeM)
Journal of knee surgery
Journal of vascular and interventional radiology
Methods of information in medicine
ORL : journal for oto-rhino-laryngology and its related specialitie
Seminars in nephrology
Stereotactic and functional neurosurgery (plus récent 1an=non disponible UdeM)
Thrombosis and haemostais
Tissue engineering A + B + C (plus récent 1an=non disponible UdeM)
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Documents uniques Centre de documentation du CHUM
Liste non exhaustive
Exemple de
périodique
électronique
Périodiques imprimés
Actualités néphrologiques Jean Hamburger, Hôpital Necker
Auto-apprentissage
Clinical EEG and neuroscience
Frontiers of radiation therapy and oncology (monographie?)
Genetic counseling (UdeM online après 3 mois, pas papier)
Lymphology
Neurosurgery clinics of north America
Revue de laryngologie, otologie, rhinologie
Seminars in thrombosis and hemostasis (et online)
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Documents uniques Centre de documentation du CHUM
Liste non exhaustive
Périodiques imprimés
Clinical EEG and neuroscience
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Documents uniques Centre de documentation du CHUM
Liste non exhaustive
Exemple de
périodique
imprimé
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Pour avoir accès aux ressources, il faut s’identifier:
Pour s’identifier au Portail du CHUM, vous avez besoin
du code p et
du mot de passe.
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Pour avoir accès aux ressources, il faut s’identifier:
p0123456
***********
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Pour avoir accès aux ressources, il faut s’identifier:
p0123456
***********
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Raccourci vers la CINHAL qui est une banque de
données bibliographiques répertoriant plus de 2 900
périodiques dédiés aux disciplines des sciences
infirmières et des sciences paramédicales.
Raccourci vers le Portail documentaire du CHUM
Raccourci vers Medline qui est une banque de données
internationale en sciences de la santé et sciences
biomédicales.
Raccourci vers UpToDate qui est une banque de
données probantes actuelles.
Quelques raccourcis du Portail Intranet du CHUM
Document non disponible Quoi faire?
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Faites une demande
de PEB
(prêt entre bibliothèques)!
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Medline – en quelques mots
MEDLINE = Medical Literature Analysis and
Retrieval System Online
est une banque de données bibliographiques regroupant la
littérature relative aux sciences biologiques et biomédicales;
contient plus de 19 millions d'articles, référencés provenant
de plus de 5 000 sources différentes;
les 5600 (et +) journaux y indexés sont choisis par un comité
d'experts appelé Literature Selection Technical Review
Committee en fonction de critères de qualité et de portée.
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Medline Ovid et PubMed
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Ovid Medline : National Library of Medicine (NLM), avec
l’interface de recherche fournie par OVID Technologies
PubMed: National Library of Medicine (NLM), avec
l’interface de recherche fournie par National Center for
Biotechnology Information (NCBI)
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Medline (Ovid et PubMed)
Réputation et accès
Interface de recherche
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Recherche par mots-clés
Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Medline Ovid: réputation
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Depuis 20 ans, Ovid offre à sa clientèle médicale, scientifique et
universitaire des services et des produits de qualité.
Ovid fait partie du groupe Wolters Kluwer Health, fournisseur
leader mondial de l'information pour les professionnels et les
étudiants en médecine, soins infirmiers, paramédicaux et de la
pharmacie.
Source: Innovative Online Research Solutions. Ovid. [En ligne]
http://www.ovid.com/site/pdf/capabilities_brochure/cababilities_brochure_en_0809.pdf
Medline Ovid: accès
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L’accès est possible à partir de la page d’accueil du Portail
documentaire.
PubMed Réputation
Outil développé par la NLM (US National Library of Medicine) qui indexe la
littérature biomédicale depuis 1879 afin de fournir aux professionnels de la
santé l'accès aux informations nécessaires pour la recherche en soins de
santé et pour l'éducation.
l'Index Medicus regroupait les tables des matières des principales revues
biomédicales et de médecine, américaines et internationales mais depuis
2004 il est devenu une banque de données connue sous le nom de
MEDLINE.
La version MEDLINE disponible gratuitement sur Internet est offerte par le
NCBI (National Center for Biotechnology Information) et elle peut être
consultée à travers l’interface proposée par PubMed.
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Medline: PubMed Accès: les portes d’entrées
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Adresse URL de PubMed:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
Adresse URL de PubMed avec le profil spécifique de l’UdeM:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?otool=icaumtlib&myncbis
hare=umontreal&dr=citation
Adresse URL de PubMed avec le profil spécifique du CHUM
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?holding=pqccdmlib
Pourquoi utiliser les profils spécifiques?
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Medline: PubMed Accès: Le profil spécifique CHUM et UdeM
Les filtres préétablis permettent de raffiner la
recherche.
Cette option n’est pas disponible lorsqu’on
fait une recherche avec inscription (My
NCBI).
Medline: PubMed Accès: le profil spécifique CHUM et UdeM
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Des boutons d’accès rapide pour obtenir :
1. les documents en format numérique
(Collection électronique du CD CHUM)
2. les documents en format papier
(Collection imprimée du CD CHUM)
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Medline: PubMed Accès: le profil spécifique CHUM et UdeM
Le bouton d’accès rapide pour
repérer les documents en format
papier.
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Le bouton d’accès rapide pour obtenir
les documents en format
électronique.
Medline: PubMed Accès: le profil spécifique CHUM et UdeM
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Accès
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Medline (Ovid et PubMed)
Producteurs de contenu
Réputation et accès
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Recherche par mots-clés
Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
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Recherche par mots-clés
Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Medline Ovid et PubMed: contenu
Ovid:
+ l’accès à 14 autres banques de données (Centre de documentation du
CHUM): Embase, Cochrane, Health Technology Assessment , etc.
PubMed:
ayant la même couverture temporelle on y trouve des articles indexés, ceux en
traitement et ceux non retenus, publiés dans des revues indexées sélectivement,
+ de nombreuses banques de données sont disponibles sur le site du NCBI
(National Center for Biotechnology Information): BLAST, Entrez, GenBank,
Molecular Modeling Databanque,OMIM, etc.
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Medline Ovid et PubMed: mise-à-jour du contenu
Ovid: MEDLINE In-Process mis à jour quotidiennement
MEDLINE Daily Update mis à jour quotidiennement
MEDLINE mis à jour chaque semaine
Délai minimum de 3 semaines entre la publication des articles et leur disponibilité dans
MEDLINE
Suspension des mises à jour en décembre de chaque année pour une révision globale
PubMed: Nouvelles références versées tous les jours, mais temporairement sans descripteurs
Délai minimum de 1 semaine entre la publication des articles et leur disponibilité
Lors de la révision annuelle, reprise des mises à jour plus rapide que sur Ovid
Centre de documentation, 2012
Source: MEDLINE: comparaison des interfaces Ovid Medline et PubMed. Bibliothèques de science de la santé. Université de
Montréal. 2011. [En ligne]. http://www.bib.umontreal.ca/SA/caps42.htm
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Medline (Ovid et PubMed)
Réputation et accès
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Recherche par mots-clés
Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Ovid: La recherche permet d'inclure les related terms. Par default, les résultats sont
affichés par pertinence. Il est possible également de trier les résultats par pertinence, par année
de publication, par sujet, par auteur, par journal, par type de publication, etc.
La recherche permet de repérer les expressions entières, ex.: gestational
diabetes lorsque la case est cochée. On doit enlever le crochet si on
veut élargir la recherche et faire une recherche par mots-clés.
PubMed: Permet de faire une recherche par mots-clés et par descripteurs MeSH dans la même
opération, à partir de l'écran principal. Le champ Search details indique de quelle façon la
question a été traitée.
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Medline Ovid et PubMed: recherche par mots-clés
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On remarque que PubMed a fait une
correspondance entre les termes de
recherche et les descripteurs MeSH.
PubMed Recherche simple
Centre de documentation, 2012
PubMed Les caractéristiques de la recherche simple
permet de retrouver les documents qui ne sont pas encore indexés
ne permet pas l’inclusion des termes spécifiques (reliés à un MeSH
générique) ou des expressions lorsque la troncature est utilisée (*) ex: cardiomyopath* pour cardiomyopathies, cardiomyopathy, etc.
impose les guillemets pour chercher une expression exacte
ex: "tuberculosis vaccines" [All Fields]
Si les guillemets sont omis, l’expression sera interprétée: "tuberculosis vaccines"[MeSH Terms] OR ("tuberculosis"[All Fields] AND
"vaccines"[All Fields]) OR "tuberculosis vaccines"[All Fields]
970 résultats
18065 résultats
Recherche effectuée dans PubMed, le 9 mai 2012
Centre de documentation, 2012
PubMed Recherche avancée
Ce type de recherche
permet d’utiliser les
MeSH sans passer par
la MeSH Databanque.
Dans ce cas, il n’y a
pas d’accès à la
définition, ni à
l’arborescence des
MeSH.
Démonstration
Show index List
affiche en ordre
alphabétique
les termes
disponibles
dans la catégorie
choisie
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Medline – en quelques mots
Medline (Ovid et PubMed)
Réputation et accès
Interface de recherche
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Recherche par mots-clés
Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Plan de la présentation
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MeSH est l'acronyme de «Medical Subject Headings»
Les MeSH sont des descripteurs (termes décrivant les sujets d’un article)
employés par la NLM (National Library of Medicine – É.-U.) pour
indexer les articles dans la banque de données Medline
Les MeSH sont une caractéristique distinctive de MEDLINE
Les MeSH imposent l'uniformité et la cohérence d’indexation de la
littérature biomédicales.
Medline PubMed: recherche par descripteurs MeSH
Centre de documentation, 2012
Les MeSH peuvent englober une seule notion ou plusieurs à la fois:
Un MeSH simple : Infarction
Un MeSH composé: Myocardial Infarction
Les termes MeSH sont organisés hiérarchiquement, classés dans
MeSH Tree Structures et ils sont mis à jour annuellement
Les MeSH sont exclusivement en anglais
Pour la traduction en anglais des MeSH, on peut utiliser le Portail de
terminologie de santé (CiSMeF): http://pts.chu-rouen.fr/index.html
Medline PubMed: recherche par descripteurs MeSH
Centre de documentation, 2012
La recherche par MeSH à partir du menu
déroulant principal est la plus usuelle.
Medline PubMed: recherche par descripteurs MeSH
Centre de documentation, 2012
L’accès est possible également par l’onglet
Resources Literature MeSH Databanque.
Medline PubMed: recherche par descripteurs MeSH
Centre de documentation, 2012
PubMed: Utilisation des MeSH dans la recherche simple H Pylori – agent causal des cancers gastriques
On peut restreindre la recherche en choisissant un ou
plusieurs qualificatifs ( Subheadings).
Permet de repêcher les articles traitant
le sujet de façon centrale.
Permet d’exclure les termes
spécifiques qui sont inclus par défaut.
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MeSH
Définition
Qualificatifs
Synonymes
Indexation antérieure
1984 – 1990
Deuxième arborescence
Première arborescence
Medline PubMed: descripteurs MeSH – la structure
Centre de documentation, 2012
On ajoute le terme trouvé au
PubMed search builder en
cliquant sur Add to search
builder et on fait la recherche
du deuxième terme.
Medline PubMed: recherche par descripteurs MeSH
Centre de documentation, 2012
1
2
3
Stomach Neoplasms
Medline PubMed: recherche par descripteurs MeSH
Centre de documentation, 2012
permet de retrouver seulement les documents qui sont
indexés dans la banque de données Medline
permet de préciser la recherche en utilisant les termes
qui sont liés à un descripteur MeSH (les termes
spécifiques et les termes génériques
Medline PubMed: recherche par descripteurs MeSH
Centre de documentation, 2012
Medline - PubMed Faire une recherche par MeSH à partir d’un document précis
1. Faire la recherche à partir d’un document
connu, considéré pertinent
2. Chercher la description complète du
document: résumé, descripteurs MeSH,
etc.
3. Cliquer sur le MeSH désiré
4. Choisir Add to Search
5. Refaire l’opération avec le deuxième
terme
6. Cliquer sur Search
Ovid:
Propose des descripteurs MeSH lorsque la case est
cochée dans la recherche avancée. Ensuite, on peut choisir soit Focus si on
veut restreindre la recherche au sujet principal, soit Explode pour inclure les
termes spécifiques.
PubMed:
On fait la recherche dans le MeSH Databanque pour trouver des descripteurs.
Les termes spécifiques sont automatiquement inclus - Explode. Si on veut
restreindre la recherche aux sujets principaux, on doit cocher la case Restrict to
MeSH Major Topic . Il est aussi possible de faire ce type de recherche sous
l'option Advanced.
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Medline Ovid et PubMed: recherche par descripteurs MeSH
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Medline (Ovid et PubMed)
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Recherche par mots-clés
Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Plan de la présentation
Ovid: Les énoncés de recherche peuvent être combinés à partir de la page principale de recherche,
en choisissant Search History. On utilise les opérateurs AND ou OR pour la combinaison.
Cette fonction est indépendante du type de recherche choisi.
Centre de documentation, 2012
Medline Ovid: combinaison des énoncés de recherche
PubMed: Il est possible de combiner les énoncés dans le mode recherche avancée.
Les recherches effectuées en mode recherche simple seront conservées dans l’historique de
recherche et elles pourront être combinées par la suite.
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Medline PubMed: combinaison des énoncés de recherche
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Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
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Atouts
Exercices
Période de questions
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Plan de la présentation
Ovid:
Maximum de 500 références. Importation
directe vers EndNote ou Zotero avec l'option
Export.
Les notices sélectionnées peuvent être
envoyées par courriel.
Centre de documentation, 2012
Medline Ovid: exportation des références
Centre de documentation, 2012
Medline PubMed: exportation des références
Avec le navigateur
Firefox on peut
télécharger les
références directement
dans Zotero.
Maximum de 500
références par courriel.
Pas de limite pour la
sauvegarde dans un
fichier texte.
Il faut utiliser un filtre
pour importer les
notices dans EndNote.
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Medline (Ovid et PubMed)
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Recherche par mots-clés
Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Plan de la présentation
Ovid:
Si le on se débranche de la banque de données, les
recherches restent conservées pour 15 minutes.
PubMed:
Si le on se débranche de la banque de données, les
recherches restent conservées pour 8 heures.
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Medline Ovid et PubMed: conservation des recherches
Source: MEDLINE: comparaison des interfaces Ovid Medline et PubMed. Bibliothèques de science de la santé. Université de
Montréal. 2011. [En ligne]. http://www.bib.umontreal.ca/SA/caps42.htm
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Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Plan de la présentation
Ovid:
Il est possible d'utiliser la même interface de recherche pour plusieurs banques
de données répondant à un sujet de recherche (ex. Medline et Embase).
Les résultats de recherche sont plus précis avec Ovid Medline qu'avec PubMed
car Ovid Medline permet une utilisation simple des options de précision des
résultats (focus, qualificatifs, etc.)
PubMed:
La fonction Single Citation Matcher est très intuitive et permet de repérer
facilement un article sans avoir toutes les informations.
On peut créer des limites permanentes s'appliquant à toutes les recherches
ultérieures en utilisant la fonction My NCBI – filtres.
Le système fait un recherche simultanée par descripteurs MeSH et en
vocabulaire libre .
Centre de documentation, 2012
Medline Ovid et PubMed: caractéristiques
Centre de documentation, 2012
PubMed Éléments de référence bibliographique
Single Citation Matcher
Single Citation
Matcher
C’est un outil qui
permet de
retrouver la
référence
bibliographique
d’un article précis.
Centre de documentation, 2012
Aucun champ n’est obligatoire mais en ajoutant
plus d’informations on a plus des chances à
retrouver l’article qui nous intéresse.
PubMed Éléments de référence bibliographique
Single Citation Matcher
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Exercices
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Plan de la présentation
Ovid:
La recherche par descripteurs MeSH est plus efficace que le système PubMed et
elle est très facile à utiliser ayant un résultat de recherche très précis.
L’historique de recherche est visible peu importe le type de recherche choisi.
Le tri par pertinence lors de la recherche simple est très apprécié.
L’exportation directe vers les logiciels bibliographiques (Zotero et EndNotes) est
possible avec le navigateur Internet Explorer.
PubMed:
L’utilisation de profils spécifiques (collection CHUM ou UdeM)
La recherche par mots-clés est plus intuitive car elle utilise un algorithme de
recherche perfectionné.
Les nouveaux articles sont disponibles plus rapidement que dans Ovid.
Gratuit, donc accessible quand on veut consulter à l’extérieur de l’hôpital.
Centre de documentation, 2012
Medline Ovid et PubMed: atouts
Centre de documentation, 2012
Citation Sensor est une fonctionnalité de
recherche de PubMed.
Elle associe une requête avec une référence
bibliographique précise. Le système suggère
les références qui répondent mieux à notre
recherche et il les place dans un rectangle
bleu avant les autres résultats.
PubMed Intuitivité: Éléments de référence bibliographique
Citation Sensor
Centre de documentation, 2012
PubMed Recherche d’informations cliniques
Clinical Queries est un outil qui
propose trois filtres afin de
repérer les publications
pertinentes de haute qualité
Centre de documentation, 2012
PubMed Recherche d’informations cliniques
Les études cliniques,Clinical Study Category, comprennent les catégories
suivantes: étiologie
diagnostique
thérapie
pronostic
guide de prédiction clinique
Le niveau de précision peut être choisi aussi : spécifique ou sensitif
Les revues systématiques, Systematic Reviews, contiennent: des articles de revues systématiques
des méta-analyses,
des revues d’essais cliniques
des données probantes
des consensus
des guides de pratique clinique
Les filtres Medical Genetics Searches sont développés en collaboration avec
l’équipe GeneReviews: Genetic Disease Online Reviews at GeneTests,
University of Washington, Seattle.
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Medline (Ovid et PubMed)
Réputation et accès
Interface de recherche
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Recherche par descripteurs MeSH
Combinaisons des énoncés de recherche
Exportation de références
Conservation de recherches
Caractéristiques
Atouts
Exercices
Période de questions
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Plan de la présentation
Centre de documentation, 2012
PubMed Exercices
Trouvez le terme anglais correspondant pour encéphalopathies
métaboliques congénitales.
Solution proposée:
Cherchez dans le Portail terminologique de santé du CHU de
Rouen afin de trouver le terme accepté par PubMed.
Centre de documentation, 2012
PubMed Exercices
Trouvez le terme anglais correspondant pour encéphalopathies
métaboliques congénitales.
Résultat PubMed: 36628 références
Centre de documentation, 2012
PubMed Exercices
Peaufinez la recherche en choisissant les documents publiés en
2011 et en 2012, en anglais et en français et seulement ceux qui
sont en accès libre et gratuit.
Résultat PubMed:
Centre de documentation, 2012
PubMed Exercices
Quelle est la date de publication du dernier article écrit par Dr
Fernand Turgeon (Turgeon F) ?
Résultat PubMed:
Centre de documentation, 2012
PubMed Exercices
Combien d’articles a écrit Dr Jean-Claude Tardif (le cardiologue)
dans le Journal canadien de cardiologie?
Résultat PubMed:
Centre de documentation, 2012
PubMed Exercices
Trouvez les articles qui portent sur la fièvre jaune en excluant
ceux qui portent sur le vaccin contre la fièvre jaune.
Résultat PubMed:
Centre de documentation, 2012
Des questions?
Daniela Ziegler
Bibliothécaire-informationniste
Centre de documentation du CHUM
514 890-8000, poste 34772
Centre de documentation, 2012
PubMed Bibliographie
Creative commons. [Site Web]. http://creativecommons.org/licenses/ ,
consulté le 12 mai 2012
Guide de la banque de données PubMed. Bibliothèques des sciences de la
santé de l’Université de Montréal. 2011. [En Ligne].
http://www.bib.umontreal.ca/SA/guide-pubmed.htm, consulté le 13 mai
2012.
NLM Training: PubMed. National Library of Medicine of USA. 2011. [En
Ligne]. http://www.nlm.nih.gov/pubs/manuals/pm_workbook.pdf , consulté
le 13 mai 2012
Portail Terminologique de Santé. CHU de Rouen. France. [Site Web].
http://pts.chu-rouen.fr/ , consulté le 12 mai 2012
Ovid. Innovative Online Research Solutions. [En ligne]
http://www.ovid.com/site/pdf/capabilities_brochure/cababilities_brochure_en
_0809.pdf