Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9...

36
FRÉDÉRIC BERGERON DOMINIQUE CARON MYRIAM DUPONT HIVER 2014 Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane

Transcript of Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9...

Page 1: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

FRÉDÉRIC BERGERON DOMINIQUE CARON MYRIAM DUPONT HIVER 2014

Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane

Page 2: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Objectifs de la présentation

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 2

Apprendre à faire une recherche structurée dans les bases de données bibliographiques.

Apprendre à utiliser correctement la syntaxe et à

exploiter au maximum les thésaurus à l’intérieur des bases de données Pubmed et Cochrane.

Page 3: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Plan de la présentation

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 3

Apprendre à faire une recherche structurée: Méthode 1 Méthode 2 Plan de concept

Pubmed et Cochrane

Exercices pratiques

Page 4: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Structurer sa recherche

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 4

La recherche à l’intérieur des bases de données bibliographiques se fait à l’aide de deux méthodes de recherche différentes qui se complètent: Méthode 1 Méthode 2

Page 5: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Méthode de recherche 1

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 5

Utilisation du langage naturel ou de ses propres mots afin de repérer des documents sur le sujet d’intérêt.

Le choix et l’orthographe du mot ont une incidence majeure sur les résultats de recherche.

Astuce : utilisation de variantes orthographiques et de synonymes pour chaque concept afin de maximiser le repérage.

Vocabulaire libre

Page 6: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Méthode de recherche 1

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 6

1. Traduction

Obésité -> Obesity

2. Synonymes et variantes orthographiques

Exemple Je cherche des articles qui portent sur l’obésité

Body weight, body weights, body-weight, body fat distribution, fat tissue distribution, overweight, over weight, over eat, over eating, obesities, obese, visceral obesity, morbid obesity, morbid obesities, abdominal obesity, body fat, waist, body fat, fat load, body mass index, quetelet index, BMI

Page 7: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Outils - Dictionnaire en ligne

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 7

Repérer un maximum de synonymes et de variantes orthographiques

Portail Terminologique de Santé

Page 8: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Outils - Les symboles

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 8

Pour gagner du temps et de la précision

* Troncature : placée à la fin d’un terme, elle permet de repérer toutes les terminaisons possibles de ce terme. Child* permet de repêcher child, children, childhood.

" "

Guillemets: entourent une phrase, une expression ou une série de mots. Ils permettent de repérer une série de mots placée dans le même ordre d’apparition. "Heart arrest" ou "Cardiac arrest" permet de repêcher ces mots tels qu’ils apparaissent dans le texte.

Page 9: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Méthode de recherche 2

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9

Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus

Validation des mots dans un dictionnaire appelé thésaurus avant de les utiliser pour la recherche.

Une seule appellation possible et une seule orthographe à utiliser pour l’ensemble des variantes orthographiques.

L’appellation à utiliser et la manière de l’écrire sont imposées par la base de données.

Page 10: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Méthode de recherche 2

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 10

Je cherche des articles qui parlent de l’adhésion des patients à la prescription d’un médicament.

Exemple

Synonymes et variantes orthographiques

Patient cooperation, patient adherence, patient nonadherence, patient non adherence, patient non-adherence, patient compliance, patient noncompliance, patient non compliance, patient non-compliance

Page 11: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Les opérateurs booléens

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 11

Pour lier les différents concepts

ET Limite la recherche à l’intersection des

concepts

OU Unit les différents concepts

SAUF Exclut un ou

plusieurs concepts non souhaités

Précise la recherche, mais ATTENTION

Page 12: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Plan conceptuel

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 12

aged OR "older adult" OR elderl* OR senior* OR adult*

vaccine* OR immunization* OR "Immunization program*" OR vaccination OR "active immunization" OR "Immunologic adjuvants" OR Immunoadjuvant*

AND

Sujet: Vaccination des personnes âgées

Concept #1

Concept #2

Méthode 1: Méthode 2:

Page 13: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 13

Recherche dans

Page 14: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Recherche simple

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 14

Saisie de mots-clés à la Google

Exemple Je cherche des articles qui portent sur l’obésité chez les enfants.

Recherche des mots effectuée dans tous les champs de la notice. • Consulter la boîte Search Details

Recherche moins précise et résultats nombreux.

Page 15: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Recherche simple

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 15

Saisie par champs

Exemple

La recherche est effectuée au sein du ou des champs spécifiés. Connaissance nécessaire des étiquettes de champs et de la syntaxe de recherche. La précision de la recherche est augmentée.

Je cherche des articles dont le titre et le résumé contiennent les termes obésité et enfants.

Page 16: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Notice détaillée

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 16

Informations bibliographiques: auteur[AU], titre[TI], périodique[TA], année[DP].

Résumé [TIAB]

Vocabulaire contrôlé [MeSH]

Type de publication [PT]

Page 17: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Recherche avancée

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 17

Là où il est possible de sélectionner ses champs pour la recherche quand l’on ne connait pas la syntaxe.

Plusieurs boîtes de recherche, accès disponible sur la page d’accueil

Connaissance de la syntaxe non nécessaire. Historique de recherche.

Page 18: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Recherche avancée

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 18

Exemple

Sélection du ou des champs voulus et ajout des termes dans la boîte de recherche. Recherche plus précise et résultats moins nombreux.

Je cherche des articles dont le titre et le résumé contiennent les termes obésité et enfants.

Page 19: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Recherche MeSH

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 19

Recherche uniquement dans le champ MeSH. Utilise le vocabulaire contrôlé de la base de données. Recherche plus précise et les résultats plus pertinents.

Page 20: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

MeSH

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 20

Définition

Subdivisions (qualifier un MeSH)

Transformation du MeSH en concept majeur

Explosion du MeSH par défaut Synonymes

Suggestions de MeSH

Page 21: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

MeSH (suite)

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 21

Structures arborescentes « explosées »

Concepts plus généraux

Concept plus spécifique

Concepts plus généraux

Concept plus spécifique

Page 22: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

MeSH (suite)

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 22

Cocher les options voulues et cliquer sur Add to search builder

Page 23: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

MeSH et cie.

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 23

Vocabulaire contrôlé

MeSH -> Medical Subject Headings

Terme suivant une barre oblique après un MeSH -> subdivision

MeSH suivi d’un astérisque -> Concept majeur

Page 24: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Syntaxe de recherche

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 24

Concept[champ] AND Concept[champ]

(Caffeine[MH] OR Caffeine[TIAB])AND (Obesity[MH] OR Obesit*[TIAB])

Exemple Les effets de la caféine sur l’obésité

Page 25: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Filtres cliniques

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 25

Un ensemble de stratégies de recherche (équations de recherche réalisées par PubMed) pour les questions touchant le diagnostic, la thérapeutique, le pronostic et l'étiologie. Très utiles pour ceux qui ont besoin d'identifier des articles portant sur la médecine fondée sur des données probantes (Evidence-Based Medicine).

Page 26: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Filtres cliniques

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 26

Préciser les critères de sensibilité et spécificité : • Narrow / specific search : recherche étroite, seuls

les articles les plus pertinents sont retenus OU • Broad / sensitive search: recherche plus large, les

articles pertinents et articles connexes

Page 27: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Obtenir le texte de l’article Le bouton permet d’accéder au document. Ce bouton est disponible seulement si vous accédez à Pubmed par l’entremise de la bibliothèque.

Sinon, il faudra le commander au service de Prêt entre bibliothèques au coût de 5$.

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 27

Liens à suivre

Page 28: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Compte personnel NCBI

Gratuit!

Permet de sauvegarder vos recherches pendant 6 mois.

Recevoir des alertes (Courriel, Fil RSS) lorsqu’un nouvel article est publié sur un sujet (stratégie de recherche).

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 28

Principaux avantages:

Page 29: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 29

Recherche dans

Page 30: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Contenu Tableau des sept bases de données:

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 30

Nom de la base Contenu Nombre d’articles

Cochrane Database of Systematic Reviews Les revues systématiques produites par un groupe Cochrane. 8134

Database of Abstracts of Reviews of Effects Les revues systématiques autres que Cochrane (Surtout DARE). 26 123

Cochrane Central Register of Controlled Trials Les études cliniques à la base des revues systématiques. 724 977

The Cochrane Methodology Register Les études sur les méthodologies employées pour les revues systématiques. 15 764

Health Technology Assessment Database Les études sur l’évaluation de la technologie médicale. 12 685

The NHS Economic Evaluation Database Les études sur le coût/bénéfices des interventions cliniques. 14 916

About The Cochrane Collaboration Les groupes COCHRANE 81

Page 31: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Modes de recherche

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 31

Deux modes principaux

Le répertoire : navigation par

sujet

La base de données générale: recherche simple et avancée

Page 32: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 32

Accès au thésaurus

Page 33: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 33

Thésaurus

Résultats par base de données Explosion du MeSH

Combinaison de recherches

Définition

Subdivisions (qualifier un MeSH)

Page 34: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 34

Notice détaillée

MeSH :kw

Titre :ti

Résumé :ab

Tableaux :tb

Page 35: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Syntaxe de recherche

BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 35

Concept:champ AND Concept:champ

(Caffeine:kw OR Caffeine:ti OR Caffeine:ab) AND (Obesity:kw OR Obesit*:ti OR Obesit*:ab)

Exemple Les effets de la caféine sur l’obésité

Page 36: Recherche d’articles scientifiques: Pubmed et Cochrane · BIBLIOTHÈQUE DE L'UNIVERSITÉ LAVAL 9 Vocabulaire contrôlé ou mots issus d’un thésaurus Validation des mots dans

Merci