Parcours Microbiologie
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LICENCE des Sciences de la Vie (LMD5) Parcours Microbiologie
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LICENCE des Sciences de la Vie (LMD5)
Parcours
Microbiologie
Responsable Parcours MIC
Marie-Hélène BOYER
Tel : 04 67 14 46 66Bât 24 - 3ème étage droite (labo DGIMI)
7 UEs obligatoires :
- HAV502V : Approche pratique de la biodiversité bactérienne (6 ECTS)
Mauld LAMARQUE
- HAV509V : Biologie Moléculaire (5 ECTS) Vincent COULON
- HAV510V : Biotechnologies (4 ECTS) Lien BACH
- HAV517V : Immunologie (4 ECTS) Franck MENNECHET
- HAV520V : Microbiologie 3 (5 ECTS) Marie-Hélène BOYER
- HAV533V: Techniques de la communication et anglais scientifique (4 ECTS)
Ian ROBBINS
- HAV541L : Anglais (2 ECTS)
L3 Semestre 5
Approche pratique de la biodiversité bactérienne
• UE de 49,5 h répartis en 10 séances
• UE exclusivement de Travaux Pratiques
• Début TPs: semaine 37
Lundi 13 Septembre, 13h30
Mardi 14 septembre 13h30
• Où ?: salle de TP de microbiologie, Bât. 26
• Matériel: masque, blouse,
marqueur fin permanent
• Evaluation
→ un rapport écrit
→ une présentation orale de 10 min.
• Responsable: Mauld Lamarque
Enseignants: Mauld Lamarque
Objectif
Explorer en travaux pratiques des outils de bactériologie classique, de biologie moléculaire et
de bioinformatique, afin de sonder la diversité des micro-organismes de l’environnement.
Approche pratique de la biodiversité bactérienne
Echantillon de terre
Micro-organismes du sol cultivables
Identifier des bactériesDéterminer le Gram
Isolement: obtention de colonies pures
Déterminer le type
respiratoire
Caractères biochimiques
Galeries Api
Identification de genre et d’espèce
BACTERIOLOGIE CLASSIQUE
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4
5
6
7
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Approche pratique de la biodiversité bactérienne
Isolement: obtention de colonies pures
Extraction ADN génomique
Amplification du gène rrsA (PCR)
Identification de genre et d’espèce
BIOLOGIE MOLECULAIRE
4
5
6
7
8
Echantillon de terre
Micro-organismes du sol cultivables
Identifier des bactériesDéterminer le Gram
1
2
3
Séquençage ADN
Analyse bioinformatique
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HLBI509V – Biologie moléculaire
Le cours débute mardi 14/09 8h, A5.01(attention 2e créneau les jeudis 9h45 pendant 4 semaines)
Les TD débutent le mercredi 22/09 11h30, TD 36.310 (MIC A)
le mardi 21/09 9h45, TD36.312 (MIC B)
La biologie moléculaire :
sujet d’étude en soi (comment un génome est
organisé, dupliqué, comment les gènes s’expriment)
outil au service des autres branches de la biologie
Eric Harshbarger
Responsable: [email protected]
HLBI509V: Biologie Moléculaire
Compétences à acquérir :
Connaître les mécanismes des grands principes de la biologie
moléculaire et les principaux acteurs moléculaires
Savoir interpréter un résultat d’expérience de biologie moléculaire,
analyser le résultat, et ses limites
Cours magistraux 24h
TD 18h
Contrôle « Continu » 1h
Quizz sur moodle (attention plutôt facile)
Evaluation:
Examen de fin de semestre 70% ou 100%
Contrôle « Continu » 1h 30% si supérieur (règle du max)
Auto-évaluation : Quizz, Wooclap
Wooclap
Biotechnologies Végétales Biotechnologies Animales et Humaines
Biotechnologie des Microorganismes
Biotechnologies
Multiplication in vitro
Production de plantes OGM
Plant farming
Thérapie génique
Clonage
Aide à la fertilité
Fermentation
Production de substances (médicaments, additifs alimentaires…)
Biotechnologies HAV510VResponsable UE: Liên [email protected]
Biotechnologies HAV510VResponsable UE: Liên [email protected]
12 Cours Magistraux• 4 CM Biotechnologies Végétales (L. Bach) • 4 CM Biotechnologie des Microorganismes (JL Aymeric)• 4 CM Biotechnologies Animales et Humaines (S. Guyomarc’h)
Evaluation
Note examen final 70%
Note compte rendu de TP 30%
7 Travaux Dirigés: (S Guyomarc’h, JL Aymeric, M Ingouff, L Bach)• Exemples concrets d’application + Annales (6 séances)• Atelier rédaction compte rendu de travaux pratiques (1 séance)
7h de Travaux Pratiques (M Ingouff, L Castaings, L Bach)• Illustration de biotechnologies autour de l’ADN recombinant chez les plantes• Découverte de la culture in vitro de plantes
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HAV520V : Microbiologie 3
Génétique moléculaire (elements genet.mobiles et résistance, CRISP, système à 2
composants, quorum sensing, transferts horizontaux…)
12h
Métabolisme bactérien 4.5h
Bactéries à morphologie particulière 3h
Microbiote 1.5h
Prévention et contrôle des maladies virales 1.5h
Echappement des virus du système immunitaire 1.5h
Parasitologie 3h
CM (27h)
TD (15h)
Génétique moléculaire 7.5h
Métabolisme 1.5h
Bactéries à morphologie particulière 1.5h
Virologie 3h
Parasitologie 1.5h
HAV533V
Techniques de Communication Scientifique et Anglais Scientifique
Resp : Ian Robbins, Anne-Marie Martinez, Guilhem Desbrosses
Format : Cours-TD : 1h30 x 7The Publishing Process ; Reader-Writer Responsability
Atelier : 1h30 x 7Analysis of a research article. Elaboration of a research seminar
Colloque : 4h x 2Delivery of a Research Seminar
Début des cours-TD : la semaine prochaine (semaine du 13 septèmbre)
Beware : this UE is in English (all teaching staff are bilingual).
Description de l’UE
Suite logique de l’UE de S4 (Bases de la physiologie et de l’immunologie) et se propose d’approfondir les connaissances en immunologie fondamentale, appliquée et clinique.
Nous aborderons les notions d’immunologie « non conventionnelles » et nous développerons les stratégies d’immunothérapies innovantes.
UE Fortement orientée clinique (médecine).
100% CC (CM: 16.5h TD: 6h TP: 10.5h)
2 notes de CC + 2 notes de TP
-Principes essentiels gouvernant le fonctionnement du système immunitaire.
-Immunité naturelle et rôle de l’immunité innée dans la stimulation des réponses adaptatives. -Orientation de la réponse immunitaire adaptative. -De l’immunologie clinique à l’immunologie fondamentale et vice et versa. -Déficits immunitaires & Immunothérapies. -Mécanismes d’échappement - contrôle de qualité. -Techniques immunologiques analytique (Cryométrie de flux) et à visées thérapeutiques (CART cells, anticorps recombinants). -Tolérance immunitaire centrale et périphérique ; auto-immunité. -Immunité anti-tumorale. -Greffes et rejets de greffes. -Mécanismes du contrôle de l’activation des lymphocytes - Les hypersensibilités. -Vaccinations: la révolution des vaccins de nouvelles générations.
Premier cours: Lundi 13/09 a 11h30 en A36.01
Donne accès :
au Master Biologie Santé (UM) Michel Vignes
au Master IMHE (interactions microorganismes
hôtes environnement) (UM) Anne-Sophie Gosselin
Master MEEF Biotechnologie
autres Masters en France
L3 Microbiologie
Emploi du temps
l'EDT est accessible à partir de l’ENT ou du site de la FDS
Groupes etudiants/
FDS/
semestre 1 2021-22/
L3/
L3 SV/
L3SV MIC
Modalités de Contrôle des Connaissances
(MCC)
Une UE est acquise :
- si la note est supérieure ou égale à 10/20,
- par compensation si la note est inférieure à 10/20 mais que cette UE fait partie d’un semestre acquis ou acquis par compensation.
Compensation entre les UE d’un semestre
Compensation annuelle
Les UE acquises ou validées par compensation semestrielle ou annuelle ne peuvent pas être repassées en session2
Impossible de changer de parcours entre le S5 et le S6
Emploi du temps MIC
Equivalences LMD5/LMD4
HAV502V Approche pratique de la Biodiversité bactérienne HLBI510
HAV509V Biologie Moléculaire [SV] HLBI504
HAV510V Biotechnlologie S5 HLBI512
HAV517V Immunologie (de la réponse aux infections aux maladies auto-immunes)HLBI606
HAV520V Microbiologie 3 HLBI626
HAV533V Techniques de communication et Anglais Scientifique HLBI514
à faire…….
Nomination de 4 ou 5 délégués dans les
semaines à venir
Journée forum des entreprises
Le JEUDI 21 octobre 2021 de 13h à 18h
