Laboratoire National de Référence Insectes, acariens ... · Rapport annuel d'activité, année...
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Laboratoire National de Référence
Insectes, acariens phytoparasites et auxiliaires sur toutes matrices
Rapport annuel d'activité, année 2013
A. Introduction
Les faits marquants de l'année
Le laboratoire a vu son accréditation renouvelée par le COFRAC le 1er mars 2013
après son premier audit de surveillance qui a eu lieu le 15 janvier 2013. Après
formation, Raphaëlle Mouttet est devenue Responsable Assurance Qualité du
laboratoire, Philippe Reynaud en ayant assuré l’intérim après le départ du précédent
RAQ.
B. Activités de développement, d'analyse et d'EST
1. Méthodes disponibles au LNR
1.1. INDICATEUR COP Référence n°1
Indicateur COP Référence n°1-i) Précisez ici le nombre de méthodes
développées ou révisées que vous avez proposées à l’autorité compétente au
cours de l’année N
2
Donner le nom et une brève description de chacune de ces méthodes
Révision de la méthode officielle MOA 023 identification morphologique de
Diabrotica virgifera au stade adulte
Révision méthode officielle MOA 007 identification d’aleurodes d’intérêt
agronomique (3 parties)
2
Indicateur COP Référence n°1-ii) Précisez ici le nombre de méthodes
développées ou révisées qui sont susceptibles d’être prêtes pour être
proposées à l’autorité compétente au cours de l’année N+1
0
1.2. Matériels biologiques ou chimiques, matériaux de référence et échantillons
et souches d'intérêt
Décrire ici les collections d'échantillons biologiques ou d'autre nature
(environnement, aliment...) conservés par le LNR; indiquer les méthodes de
conservation, la température, le nombre de "repositories", le nombre
d'échantillons par souche, l'enregistrement associé...).
La collection se compose d’échantillons entomologiques (larves et adultes d’insectes
et acariens nuisibles à l’agriculture ou à la forêt) qui sont conservés selon plusieurs
modalités :
dans l’alcool : 22 276 spécimens
en lame de collection : 10 915 spécimens
ADN : 3 760 spécimens
A sec : 527 spécimens
Sous forme d’images : 2 041 spécimens
L’ensemble de la collection est entièrement informatisée (depuis 1996) sur une base
de données interne au laboratoire.
Nombre de souches/échantillons reçu(e)s et mises en collection dans l'année
1911
Nombre de souches/échantillons maintenus au total
32228
2. Activités d'analyses de première intention pour l'année N
Nombre d'analyses de première intention réalisées dans l'année, de biotypie,
sérotypie, caractérisation moléculaire...
2117
Détaillez ici par type d'analyse de première intention
Dans le détail, 49 pour identification de Bemisia tabaci et Trialeurodes vaporarium,
3
12 pour identification de Diabrotica virgifera virgifera et 2 056 pour identification
autres arthropodes.
3. Activités de confirmation et activités de laboratoire expert
3.1. Analyses de seconde intention
Nombre d'analyses de seconde intention réalisées dans l'année, de biotypie,
sérotypie, caractérisation moléculaire...
0
3.2. Activités de production et de contrôle de matériaux de référence et de
réactifs biologiques, contribution à l’inspection, AMM
Le LNR produit-il et fournit-il des réactifs ?
Non
Le LNR fournit-il des matériaux de référence ?
Oui
Quelles sont les bases réglementaires, normatives ou infra-réglementaires
(notes de service) ?
NS/DGAL/DGPRAT 2012-8074 du 27 mars 2012
Quels sont les types de matériaux de référence (MRE, MRI, contrôles positifs
ou négatifs, autre) produits et fournis ?
autres
Quel est le format (sérum, souche, produit chimique, autre) de ces matériaux
de référence ?
lames et spécimens d'insectes
Quel est le nombre de lots produits et fournis par an ?
4
(moyenne sur les 5 dernières années)
25
Quelles sont les quantités produites/fournies par lot ?
(moyenne sur les 5 dernières années)
2
Estimez le temps consacré à la production/mise à disposition ? (moyenne sur
les 5 dernières années)
non évaluable, le laboratoire ne produit pas de lot de matériaux de référence mais
transmet des spécimens de genres ou d'espèces d'intérêt pour le destinataire
Quels contrôles internes réalisez-vous sur ces matériaux de référence?
vérification morphologique
A quels clients fournissez-vous ces matériaux de référence ?
à des partenaires scientifiques
Sous quelles conditions fournissez-vous ces matériaux de référence (à la
demande, à titre gracieux, autres) ?
fournis à titre gracieux.
Le LNR réalise-t-il des contrôles de réactifs commerciaux ?
Non
4. Analyse de l'évolution des tendances en termes d'activité
Détaillez ici l'analyse de l'évolution des tendances en termes d'activité
(augmentation, diminution... sur les 5 dernières années)
Le laboratoire existe depuis 18 ans, pour les cinq dernières années le nombre
5
d’analyses est relativement constant avec un peu plus de 3000 analyses
entomologiques par an. Cependant, une première diminution observée en 2011 s’est
confirmée en 2012, puis 2013. Elle s’interprète par la délégation d’analyses
officielles auprès de laboratoires agréés pour Bemisia tabaci et Diabrotica v. virgifera
mais aussi par une diminution du nombre d’échantillons envoyés par certains SRAL.
Les causes de cette diminution ne sont pas précisément connues, mais pourraient
correspondre à une baisse de la quantité de végétaux ou produits végétaux importés
en France ces deux dernières années (crise économique) conjuguées à une
absence de crise phytosanitaire en cours impliquant des arthropodes.
5. Activités d'expertise scientifique et technique
5.1. Demandes d’expertise scientifique et technique du ministère (chargé de
l’agriculture, santé, etc…) ou d’instances communautaires et internationales
qui concernent votre domaine de compétence
Nombre de rapports d'EST rendus dans l'année
0
Détaillez ici les demandes d'EST et les noms des mandataires
Plusieurs notes d’alerte ont été émises en 2013 dans le cadre de l’activité de veille
du laboratoire et elles ont concerné :
Des signalements :
- Le premier signalement de Leptodictya balbusae en France ;
- La découverte en Corse d’un aleurode invasif, Aleuroclava aucubae ;
- La découverte sur l’île de la Réunion de l’aleurode réglementé,
Aleurocanthus spiniferus
- Le début d’invasion dans la Caraïbe par Crypticerya multicicatrices ;
- Le suivi de la dissémination de Psacothea hilaris en Lombardie (Italie) ;
Des alertes:
- le premier signalement de Halyomorpha halys ;
- - l’interception en métropole et la découverte en Guadeloupe de l’aleurode
invasive Singhiella simplex ;
- La première découverte d’Anoplophora glabripennis en Corse ;
- La première détection de Diabrotica virgifera dans le département de la
Somme ;
- Le signalement d’Aroma bungii dans l’agglomération italienne de Milan ;
- Le premier signalement de Drosophila suzukii sur l’île de la Réunion;
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L’unité a apporté son expertise pour l’examen de 5 documents régionaux ou
internationaux (OEPP/IPPC).
5.2. Autres expertises
Les membres de l'équipe du LNR peuvent avoir des activités d'expertise
(internes: CES, GT ou externe: EFSA...) ou des activités auprès de
commissions de normalisation (Afnor...). Détaillez ici ces activités et estimez le
temps qui y est consacré.
Le laboratoire participe aussi à d’autres activités d’expertise en tant que membre des
Groupes de Travail « mouches des fruits » et Drosophila suzukii en lien avec le CES
Anses en santé des végétaux (15 jours), en tant que membre du Panel OEPP sur le
diagnostic en entomologie (9 jours en 2013) ou au Groupe de Travail ‘Parasaissetia
nigra’ de l’EFSA (2 jours)
5.3. Dossiers de demande d'agrément
Nombre de dossiers de demande d'agrément étudiés dans l'année
0
C. Animation du réseau de laboratoires officiels
5.4 Organisation d'EILA
INDICATEUR COP Référence n°2
Indicateur COP Référence n°2-a. Précisez ici le nombre d'EILA organisés par le
LNR au cours de l’année N
1
Ces EILA ont-ils été réalisés selon la norme 17043 (avec ou sans accréditation)
?
Non
Si vous n'êtes pas accrédité 17043, avez-vous bénéficié d'un audit interne ?
7
Non
Détaillez ici le nombre de laboratoires ayant participé pour chaque EILA; le
nombre de laboratoires ayant obtenu des résultats défavorables pour chaque
EILA; les actions mises en œuvre pour l'identification des causes et des
mesures correctives
Diabrotica
participants : LDA33, LDA71 + Anses LSV unité entomologie + 3labos étrangers
(Roumanie, Tunisie, Belgique)
0 laboratoire agréé a obtenu des résultats défavorables
Indicateur COP Référence n°2-a. Précisez ici le nombre d'EILA que vous
prévoyez d'organiser au cours de l’année N+1
0
Indicateur COP Référence n°2-a. Ces EILA sont-ils réalisés selon la norme
17043 avec ou sans accréditation ?
Non
Indicateur COP Référence n°2-b. Précisez ici le nombre d'EIL (hors EILA - dont
EILV en lien avec méthodes en cours de validation telles que précisées dans le
paragraphe 1.1) organisés par le LNR au cours de l’année N
0
Indicateur COP Référence n°2-b. Précisez ici le nombre d'EIL (hors EILA) que
vous prévoyez d'organiser au cours de l’année N+1
0
Indicateur COP Référence n°3. Le cas échéant, indiquez que le système qualité
en référence à la norme NF EN ISO/CEI 17043 est en place
en cours de déploiement
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Précisez s'il a été évalué par audit interne
Non
5.6. Formation, organisation d'ateliers, accueil de stagiaires
Nombre de journées d'échange et de restitution rassemblant les laboratoires
agréés du réseau organisées dans l'année
1
Détaillez ici ces activités et indiquez le nombre de participants par atelier
40 participants
restitution des EILA et présentation d'information technique
Nombre de sessions de formation des personnels des laboratoires agréés aux
méthodes utilisées pour les contrôles officiels que le LNR a organisées dans
l'année
0
5.7. Activités de conseil aux professionnels
Détaillez ici ces activités et estimez le temps qui y est consacré
L’unité a réalisé de nombreuses formations : plus de 20 stagiaires à l’entomologie
générale (formation technique des SRAL) ou aux techniques d’identification de
laboratoire (stage co- organisé avec le CIRAD à destination des professionnels de
l’agriculture et de l’environnement). Les formations de l’unité ont aussi concerné des
stagiaires à l’international, formation à l’analyse du risque dans le cadre du jumelage
Ukraine/UE, Kiev, Ukraine (15 participants).
5.8. EILA auxquels le LNR a participé dans l'année
Détaillez les EILA auxquels vous, en tant que LNR, vous avez participé dans
l'année
9
Le laboratoire a participé à l’EILA qu’il a organisé et qui a concerné la détection de
Diabrotica virgifera.
D. Participation aux activités de surveillance
6. Existence et gestion d'un réseau
6.1. Indiquer si le LNR est intégré à un (ou des) dispositif(s) de surveillance ?
Oui, plusieurs
A combien de dispositifs de surveillance le LNR est-il intégré ?
9
6.2. Indiquer qui est le gestionnaire de ce dispositif
DGAL / SDQPV
6.3. Préciser si d'autres unités/entités de l'agence sont intégrées dans ce
dispositif à vos cotés
Non
7. Les partenaires et acteurs de ce dispositif de surveillance
Sont acteurs ou partenaires de ce dispositif (plusieurs réponses possibles) :
Le réseau de laboratoire du LNR
8. Modalités de surveillance
Préciser si ce dispositif repose (plusieurs réponses possibles) :
Sur des modalités de surveillance programmées (active)
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9. Autres activités du LNR en matière de surveillance
En dehors des aspects analytiques, quelles sont les autres activités auxquelles
le LNR (avec éventuellement les autres unités de l'agence impliquées) participe
dans le cadre de la surveillance ? (plusieurs réponses possibles)
Appui scientifique et technique
E. Activités de recherche en lien avec l’activité de référence
10.1. Recherches méthodologiques pour la référence
Détaillez ici les recherches méthodologiques que vous avez réalisées dans
l'année : objectifs, partenariats, apports du LNR, projets retenus dans le cadre
d'appels à projets...
Les travaux méthodologiques ont porté sur :
La rédaction d’une méthode d’identification de Spodoptera spp. (méthode
OEPP)
La révision de la méthode officielle MOA007 des aleurodes d’intérêt
agronomique
La révision de la méthode officielle MOA023 identification des adultes de
Diabrotica virgifera virgifera
Le développement d’un test moléculaire d'identification de Ceratitis capitata
(Tests de validation en cours)
La participation au développement de la méthode d’identification de
Dendroctonus ponderosae méthode IPPC
La rédaction d’une méthode d’identification de Bactrocera zonata, méthode
OEPP
Autres projets en cours : ANR BICORAMICS ; FP7 PURE ; IPABRIO ;
TUBITAK (projets sur l’identification moléculaire et morphologique des cochenilles de
la famille des Pseudococcidae se développant sur vigne en Europe et Amérique du
Sud, le porteur du projet est l’INRA de Sophia-Antipolis); BIOFIS (construction d’une
base de donnée sur les ravageurs en agricultures, insectes et acariens réglementés
et espèces voisines). Co encadrement d’une thèse portant sur “A study of the
behavior, ecology and control of legume flower thrips, megalurothrips sjostedti
(trybom) in beans towards the development of an integrated pest management (ipm)
program in Kenya” (Andnet Bayleyegn Abtew) Erasmus Mundus Joint Doctoral
Programme University of Montpellier SupAgro and University of Catania.
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F. Liste des publications et communications dans le cadre du mandat
Publications de l'année destinées aux professionnels (Les publications qui
figureront dans le rapport doivent être sous presse ou publiées.)
- Delpoux, C., J. F. Germain, G. Delvare, A. Franck, F. Normand, and S. Quilici.
(2013). Les cochenilles à sécrétions cireuses sur manguiers à la Réunion. Icerya
seychellarum, ravageur en recrudescence. Phytoma 665 : 45-49.
- Kuntzmann, P. and J. F. Germain. (2013). Cochenille, une espèce nouvelle pour
l'Alsace sur la vigne. Phytoma 666 : 6-7.
Publications scientifiques internationales de l'année (Les publications qui
figureront dans le rapport doivent être sous presse ou publiées.)
- Balmes, V. (2013). Protocole Diagnostic : Bactrocera zonata. Bulletin OEPP/EPPO
43(3) : 412-416.
- Fried, G., V. Balmes, and J. F. Germain. (2013). A contribution to the inventory and
study of the impacts of phytophagous insects found on Baccharis halimifolia in its
introduced range in France. EPPO Bulletin 43 : 285-289.
- Germain, J. F. (2013). Quatre espèces de Cochenilles invasives nouvelles pour l’île
de la Réunion (Hemiptera, Coccoidea). Bulletin de la société entomologique de
France. 118(4) : 509-511.
- Germain, J. F., C. Chatot, I. Meusnier, E. Artige, J. Y. Rasplus, and A. Cruaud.
(2013). Molecular identification of Epitrix potato flea beetles (Coleoptera:
Chrysomelidae) in Europe and North America. Bulletin of Entomological Research
103(3) : 354-362.
- Moignot, B. and P. Reynaud. (2013). Quelle méthodologie en vue d'une
hiérarchisation des organismes nuisibles en santé du végétal ? Euroreference 9 : 5-
9.
- Mouttet, R., I. Kaplan, P. Bearez, E. Amiens-Desneux, and N. Desneux. (2013).
Spatiotemporal patterns of induced resistance and susceptibility linking diverse plant
parasites. Oecologia : 1-8.
Communications internationales de l'année (Les publications qui figureront
dans le rapport doivent être sous presse ou publiées.)
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- Germain, J. F., J. Minatchy, D. Pastou, P. Bagny, S. Merion, R. Pallas, S. Quilici,
and D. Matile-Ferrero. (2013). An updated list of the Scale Insects from Reunion
Island (Indian Ocean). Sofia, Bulgaria. Proceedings of the XIII International
Symposium on Scales insects Studies.
- Ramel, J. M. and J. P. Rossi. (2013). Geographical range of Cydalima perspectalis
(Walker, 1859) [Lepidoptera: Pyraloidea: Crambidae: Spilomelinae] and its recent
expansion in France. 70-71. Blagoevgrad, Bulgaria, Pensoft. 18th European
Congress of Lepidopterology.
G. Activités du LR-UE
Avez-vous également des activités de LR-UE ?
Non
H. Détention d'autres mandats de référence
Le LNR détient-il d'autres mandats de référence dans le même domaine de
compétences
Non