Laboratoire Commun de Microbiologie

Laboratoire Commun de Microbiologie LCM-UCAD/IRD/ISRA, Centre de Recherche ISRA/IRD de Bel-Air, BP. 1386, CP. 18524

Dakar-Sénégal

Unité de Microbiologie:

Créée en 2004 du laboratoire de biologie des sols de l’IRD

Implantée au centre de recherche ISRA/IRD à Bel air

Rattachée à l’UMR113/LSTM IRD-CIRAD-UM2-INRA

Renforcée par l’UMR232/DIADE/IRD-UM2 en 2010

Regroupe des chercheurs et enseignants-chercheurs de l’UCAD, de l’IRD et de l’ISRA

Structurée en une équipe de recherche

Laboratoire Commun de Microbiologie

Objectif principal:Développer des recherches sur la diversité et le fonctionnement des symbioses fixatrices d’azote et mycorhiziennes en vue de leur utilisation pour améliorer la productivité végétale et la fertilité des sols.

Objectifs spécifiques:Caractériser la diversité des microorganismes symbiotiques (rhizobiums et champignons mycorhiziens) Etudier les mécanismes d’adaptation des symbioses végétales aux contraintes édaphiques (salinité, sécheresse) Evaluer l’impact des communautés microbiennes symbiotiques sur la régénération naturelle des peuplements forestiers et sur la revégétalisation des sols salésEtudier l’impact des essences introduites sur la structure et les fonctions des communautés microbiennes natives Utiliser les symbioses pour améliorer la productivité végétale et la fertilité des sols.

Objectifs scientifiques

EctomycorhizesNodule

s

Mycorhizes à

arbuscules

Plantes étudiées: niébé, arachide, Acacia, Coccoloba, Casuarina, Eucalyptus, Gilbertiodendron, Jatropha, Graminées fourragères

rhizobiums, Frankia

Champignons

Production scientifique(Publication, brevet)

Communautés symbiotiques

Microflore

Sol

2

Structure du solMacro-éléments (N, P)Stress abiotiques

3

1

Communautés végétales Mise en place et adaptation des symbioses

Régénération, productivité et durabilité des

écosystèmes naturels ou anthropisés

FORMATION ET VALORISATION

Formation(Master, thèse)

Transfert de technologie

(Producteur, PME champignons comestibles)

Végétation

54

Caractéristiques physico-chimiques

Communautés non symbiotiques

AXES DE RECHERCHE

Axe 1: Analyse de la structure et de la diversité fonctionnelle des communautés de symbiotes microbiens

Axe 2: Interactions entre flore non symbiotique et flore symbiotique du sol

Axe 3: Interactions entre les caractéristiques physico-chimiques du sol et les communautés de symbiotes fongiques et bactériens

Axe 4: Interactions entre la couverture végétale et la structure et la diversité fonctionnelle des communautés mycorhiziennes et rhizobiennes des sols

Axe 5: Impact de la diversité des symbiotes fongiques et bactériens sur l’adaptation des plantes aux stress abiotiques, la productivité et la durabilité des écosystèmes naturels ou anthropisés

AXES DE RECHERCHE

Microbiologie (hottes, étuves etc.) Plateforme en microscopie (optique, loupe bino…) Biologie moléculaire (amplificateur ADN, électrophorèse,

lecteur de gel...) Conservation de souches (congélateurs -20°C, -80°C) Chambres de culture, serres, dispositifs expérimentaux en

milieu paysan, en forêt

OUTILS

Forte implication du LCM dans les formations de l’UCAD:

Coordination du Master Biotechnologies végétale et microbienne, et de la Licence Professionnelle en Agronomie

Enseignements dans les Masters Biotechnologies végétale et microbienne, Ecologie et Agroforesterie, Biomathématique-Bioinformatique, Phytopharmacie et protection des végétaux, Master International de Biotechnologies tropicales

Laboratoire d’accueil (Master 2 et thèse) de l’école doctorale « Sciences de la Vie, de la Santé et de l’Environnement »

De nouveaux modules d’enseignement en génomique dans le Master Modélisation des Plantes et Bio-informatique et en écophysiologie végétale dans le Master Ecologie et Agroforesterie

FORMATION

VALORISATION

Transfert de la technique de l’inoculation auprès des producteurs

Publications et brevets

Projet sur la production de champignons comestibles

RESSOURCES FINANCIERES

Frais structurels pris en charge par l’IRD

Parts chercheurs UMR LSTM et UMR DIADE

Projets en cours: SOLAO ANR (2008-2012), Chaire Croisée IRD/UCAD (2010-2013), 2 FIRST (2010-2012), AUF (2011-2013), FIRST (2012-2014), IFS (2012-2014)

Projets soumis : CORAF

Projets en préparation : LMI, UA, PPR-FTH, FNRAA

PARTENARIAT

Collaborations nationales : ITA, ISE, ANCAR, CNCR, CERAAS, ENSA, ROPPA, Départements de Biologie Végétale, Biologie Animale, Chimie et Biochimie ; Ecole Supérieure Polytechnique, Faculté de Médecine, Université Gaston Berger, Université de Ziguinchor, Université de Thiès, Ministère de l’Enseignement Supérieur et la Recherche Scientifique, Ministère de l’Agriculture, Ministère de l’Environnement et de la Protection de la Nature.

Collaborations internationales et régionales : Université des Antilles et de la Guyane, Université Montpellier 2, Michigan State University, Université Laval, Université d’Oran, Université Mohamed V, Université Mohamed Premier Oujda MAROC, Université Abdou Moumouni de NIAMEY (NIGER), Université d'Abomey Calavi au Bénin, Université de Bamako, Université de Nouakchott, INERA (Burkina Faso), Université de Cotonou, de Nouackchott, Université d’Alger, Université de Tananarivo, Université Cadi Ayyad (Faculté des Sciences Semlalia), KEFRI (Kenya), TSBF (Kenya), AUF, CIRAD INRA, INERA, IRAG, CILSS, UNESCO, FAO, UEMOA, AIEA (Autriche), LMI-Maroc, UMRDIA-PC, SupAgro/UM2/INRA/IRD, UMR LSTM IRD/CIRAD/SupAgro/UM2/INRA, UR SeqBio IRD, UMR CBGP INRA/IRD, Montpellier SupAgro, INRA de Dijon et INRA de Bordeaux.

SECRETARIATA. Konté

GESTION & LOGISTIQUEF. do Rego

RESPONSABLES QUALITESM. Cissoko, M. Da Sylva

CHERCHEURS PERMANENTS (14)UCAD : A. Diédhiou, T. Diop, D. Diouf, A. Kane, I. Ndoye, M. Thiao, R. Samba, S. Sylla, A. DioufIRD: A. Champion, L. Laplaze, A. BâISRA: S. Fall, D. Fall

CHERCHEURS CONTRACTUELS (3)IRD: A. Thomas (postdoc), T. Wade, N. Diagne REPRESENTANT PERSONNEL (1) ET ETUDIANT (1)

INGENIEURS & TECHNICIENS (9)IRD: J. Bakhoum, M. Cissoko, F. Do Rego, M. Faye, C. Ndiaye, P. Tendeng, A. CrabosISRA: M. Da Sylva, O. Touré

DOCTORANTS (12)N. Bakhoum, A. Dieng, M. Ngning, F. Ndoye, G. Sène, S. Sène, A. Soumaré, M. Ebenye, F. Diouf, C. Ouattara, I. Diop, F. Fall, H. Prodjinoto, I. Diedhiou

CONSEIL DE LABORATOIRE

DIRECTEUR A. Bâ

ASSEMBLEE DE LABORATOIRE

CONSEIL DE GESTION B.S. Toguebaye (UCAD), S. Fall (ISRA), G. De Noni (IRD)

Merci de votre attention