La Peste Porcine Africaine.Situation et perspectives de recherche

Ferran Jori, UMR ASTREReunion INRA, 30 Octobre, Paris

Objectifs

• Passer en revue les activités et expertises de ASTRE

• Présenter projets et opportunités de financement à venir

Caractérisation des interactions à travers des enquêtes auprès des acteurs

20 chasseurs20 éleveurs25 éleveurs et chasseurs

Etudes écologiques/ Biologie moléculaire

• Mise en évidence du partage de l’espace entre cochons et sangliers équipés avec colliers GPS

• Mise en évidence d’échanges de flore intestinale (clones de E. coli fécaux cultives et caractérisés génétiquement)

Interactions cochons-sangliers• Collaboration INRA LRED en Corse

• Projet NOVPATH• Thèse Morgane LAVAL (2018-2021)

• Projet GISA Epidewild 3-i- (ONCFS, INRA)• Ardèche et PPOO

• Collaborations au Mozambique et Ouganda

Lacunes d’information

• Rôle des hôtes sauvages-• Ecologie des tiques et dynamiques hôtes-virus• Rôle des animaux survivants• Caractérisation génétique et voies de

disséminations cycle sauvage /domestique

Distribution des tiques molles potentiellement vectrices de PPA

Débuts en 2008-2009 avec l’étude des caractéristiques bio-écologiques de ces tiques et recensement/validation de points de présenceVial L. 2009. Biological and ecological characteristics of soft ticks (Ixodida: Argasidae) and their impact for predicting tick and associated disease distribution. Parasite, 16:191-202.

Premiers modèles statistiques à l’aide de données de présence sur l’Afrique (ASFRISK)

Ex: O. porcinus

De Glanville W.A., Vial L., Costard S., Wieland B., Pfeiffer D.U.Spatial multi-criteria decision analysis to predict suitabilityfor African swine fever endemicity in Africa. 2014. BMCVeterinary Research. 10:9.

Modèles MCDA à l’aide de connaissance écologique à priori + nouvelles collectes de terrain (ASFORCE)

L. Vial, E. Ducheyne, S. Filatov, A. Gerilovych, D.S. McVey, I.Sindryakova, S. Morgunov, A.A. Pérez de León, D. Kolbasov,E.M. De Clercq. Spatial multi-criteria decision analysis formodelling suitable habitats of Ornithodoros soft ticks in theWestern Palearctic region. parasitol. 2018, 249:2-16.

Contacts tiques molles-suidés sauvages ou domestiques en Afrique

MADAGASCAR: O. porcinus (vecteur connu en Afrique)

- Tiques en voie de disparition dans le pays mais génome viral détecté chez les tiquesRavaomanana J, Michaud V, Jori F, AndriatsimahavandyA, Roger F, Albina E, Vial L. First detection of African Swine Fever Virus in Ornithodoros porcinus in Madagascar and new insights into tick distribution and taxonomy. 2010. Parasites and Vectors 3:115.

- Tiques peuvent être au contact des porcs mais pas suidés sauvages (potamochères) Ravaomanana J, Jori F, Vial L, Perez R, Blanco E, Michaud V, Roger F. 2011. Assessment of interactions between African swine fever virus, buhspigs(Potamochoerus larvatus), Ornithodoros ticks and domestic pigs in northwestern Madagascar. Transboundary and Emerging Diseases. 58(3):247-54

ROLE SECONDAIRE A MADAGASCAR

SENEGAL: O. sonrai (vecteur supposé)

- Tiques au contact des porcs domestiques et génome viral détecté chez des tiquesVial L, Wieland B, Jori F, Etter E, Dixon L, Roger F. 2007. African Swine Fever virus DNA in soft ticks, Senegal. EID 13(12), 1928-1931

- Tiques ne semblent pas pouvoir rentrer en contact avec suidés sauvages (phacochères) Jori F, Vial L, Penrith ML, Perez-Sanchez R, Etter E, Albina E, Michaud V, Roger F. Review of the sylvatic cycle of African swine fever in Sub-saharan Africa and the Indian Ocean. 2013. Virus Res. 173(1):212-27.

ROLE POSSIBLE AU SENEGAL

UNE INCONNUE: leur compétence vectorielle effective?

Compétence vectorielle des tiques molles pour le virus de la PPAEn collaboration avec l’ANSES ploufragan

CIRAD: connaissance bio-écologique des tiques molles + mise en élevage de 3 espèces depuis 2008 avec développement de techniques de gorgement artificiel:

O. moubata (Afrique australe)O. porcinus (Madagascar)O. erraticus (Portugal)

ANSES: Laboratoire National PPAExpérimentations animales pour essais de transmission (cf MF Lepotier)

2 thèses en co-tutelles:- J. Bernard (2011-2015) → Premiers essais de transmission et focus sur O. porcinus- R. Pereira (2017-2020) → Mécanismes d’infection des tiques et de transmission par

les tiques selon les associations tiques-virus PPA choisies

+ autres projets utilisant les élevages sur autres questions de recherche (ex: endosymbiontes de tiques)

Expertise épidémiologique au Cirad

• Analyse de risque Quels sont les tendances spatio-temporelles à différentes échelles géographiques (identification de hotspots, de patterns, etc.)?

• Quels sont les facteurs (environnementaux, sociologiques, anthropogéniques) de risques d’introduction et propagation de la PPA en France?

• Utilisation de techniques de fouille de texte pour la collecte et l’analyse de données non-officielles (Thèse S. Valentin)

• Quelle est la valeur ajoutée de l’utilisation des sources d’information non-officielles (médias) dans la surveillance de la PPA en Europe?

• Quels sont les facteurs socio-économiques et politiques qui influence la qualité des données sanitaires (délais, cohérence avec les données officielles) ?

Expertise épidémiologique au Cirad• Veille sanitaire internationale: comment mieux anticiper la menace de la

PPA pour la France? (A. Mercier, R. Lancelot, F. Munoz)• Quelle est la vitesse de propagation de la PPA en Europe? Quels sont les facteurs qui

influencent cette vitesse de propagation?

• Modélisation de la mobilité animale (C. Coste, A. Apolloni)• Comment les mouvements d’animaux (sauvages et domestiques) influencent la

propagation du virus? Quelles sont les zones les plus à risque (hotspots de contacts et d’échanges)?

• Optimisation des méthodes de surveillance et de lutte (M. Peyre, V. Grosbois, P. Hammami, F. Bouyer)

• Comment optimiser le rôle des acteurs afin de mieux les intégrer dans les opérations de surveillance et contrôle?

• Comment évaluer et comparer l’impact des dispositifs de surveillance et de contrôle sur la dispersion du virus?

VSI – modélisation de la vitesse• Modèle d’estimation de la vitesse de propagation d’une maladie au sein d’une région (avancée du front de la

maladie)

• Estime la vitesse de propagation à partir des dates de première introduction au sein d’une zone

• A été appliqué à la DNCB dans les Balkans (Mercier et al. 2018), application prévue pour la PPA chez les sangliers sauvages en Europe

Mercier et al. 2018. Spread rate of lumpy skin disease in the Balkans, 2015–2016. Transboundary and emerging diseases 65(1): 240-243.

Virologie/ Diagnostique/Epidémiologie en Afrique et Madagascar

Projets actuels

Veille sanitaire internationale• Thématique de la Plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale (ESA) depuis

novembre 2013, co-animée par le Cirad (Alizé Mercier) et l’Anses (Julien Cauchard)

• La VSI vise à identifier, suivre et analyser des signaux relatifs aux dangers sanitaires menaçant le territoire français en santé animale

• Le but est de produire des informations validées et exploitables à des fins d’évaluation du risque (Anses), de gestion du risque (DGAL) et d’information des filières professionnelles

• Production de notes régulières sur l’évolution de la PPA en Europe et en Asie, et diffusion d’un bulletin hebdomadaire de veille sanitaire (BHVSI)

VSI – Carte interactive• Carte interactive permettant un suivi de la PPA en Europe et en Russie occidentale

(sur le site de la Plateforme ESA)

https://www.plateforme-esa.fr/carte-interactive

Données ADNS, OIE, DGAL et FAO

VSI – outil PADI-web• Platform for Automated Disease Information extraction on the web

(PADI-web)• Outil fonctionnel depuis juin 2016 (2½ ans de données)• Collecte d’information sanitaire à partir d’articles de presse en ligne

ASF STOPEchanges

Réseautage

Réunions Formations Bourses étudiants

WG Thematique LeaderWG1 Le virus PPA IAHWG2 PPA et sanglier CIRADWG3 PPA et Industrie porcine IZBWG4 Dynamique d’infection et contrôle SVAWG5 Dissémination et communication DTU

• 30 pays européens, US, Canada, Corée du Sud• EC, EFSA, FAO• 2017-2021

Réunions

• Pulawy , Décembre 2016• Madrid Juin 2017• Tallin (Estonie), Mars 2018• Lisbonne, Juillet 2018• Republique Tchèque • Riga (Lettonie), Mars 2019

Bourses• Jose Angel Barasona, UCMAnalyse du risque d’introduction de PPA par mouvement de sangliers vivants

Projet NIF NAF (2018-2022)• Terrains: Madagascar, Mozambique,

RSA• Budget total 2,5 MUSD dont

680KUSD pour CIRAD• Plusieurs volets:

• Caractérisation virale dans cycle sauvage (Suidés africains et tiques)

• Analyse de réseaux de contacts et analyse de filières porcines (SNA)

• Modélisation des dynamiques de transmission (SEIR, BE-FAST, QRA)

• Partenaires : OVI, UP, IIAM, UCM, FOFIFA

• Kick off meeting automne 2018

Cycle phacochère-tique

Source: Plowright et al.,1984

Expertise épidémiologique au CIRAD• Données actuellement à notre disposition:

• Données sanitaires• Données officielles: ADNS, OIE, FAO• Données non-officielles: ProMED, médias (PADI-web, HealthMap)• Communications d’experts (réseau de la Veille sanitaire internationale)

• Données environnementales, climatiques, socio-économiques

PPA en Chine

• Analyse de risque• Introduction de PPA en Chine • Collaboration avec FAO• Prochain atelier ISVEE sur PPA et risque de dissémination en Asie du

Sud Est (CIRAD/RVC/FAO)• Démarches pour monter un projet Horizon 2020

Oportunités de financement

• Biodiversa 2018• Vacin PPA• ERA-NET Coopération Internationale

For PolandNational Veterinary Research Institute -PiWETMammal Research Institute, Polish Academy of Sciences

For BelgiumUniversité de Liège (

For FranceCIRAD UMR ASTREID-VetINRA-ONIRIS

Merci pour votre attention!