La gestion bibliographique avec Jabref

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Introduction Présentation Jabref Créer une base de données Créer une entrée Quelques fonctionnalités Conclusion La gestion bibliographique automatisée avec Jabref Atelier sur les outils numériques au service de la recherche scientifique A.Haddouche (Doctorant) Ecole Nationale Supérieur de Statistique et d’Économie Appliquée (ENSSEA) LAboratoire de MOdélisation des Phénomènes Stochastiques (LAMOPS) Tipaza, Algérie Mai 2016 [email protected] La gestion bibliographique automatisée avec Jabref

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JabrefAtelier sur les outils numériques au service de la recherche scientifique

A.Haddouche (Doctorant)

Ecole Nationale Supérieur de Statistique et d’Économie Appliquée (ENSSEA)LAboratoire de MOdélisation des Phénomènes Stochastiques (LAMOPS)

Tipaza, Algérie

Mai 2016

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1 Introduction

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4 Créer une entrée

5 Quelques fonctionnalités

6 Conclusion

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Introduction

Les outils de gestion bibliographique permettent de gérer des références(article, livre, ....etc) au sein d’une base de données :

Description de chaque référence (article, monographie, page web,thèse, . . . )Importation des références depuis des bases bibliographiques en ligne(Medline, ArXiv, INSPEC, Citeseer. . . )Partager sa bibliothèque numérique avec d’autre chercheurs.Recherches dans votre collection de documents selon plusieurscritères (auteur, journal, ...etc).

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Quelques logiciels de gestion bibliographiqueLogiciels de gestion de références bibliographiques avec différents types de license

Logiciels libres (open source) et gratuits : Zotero, Connotea, JabRef,Bibus.Logiciels propriétaires et gratuit : EndNote Basic, Mendeley.Logiciels propriétaires et payants : EndNote, Refworks, Papers.

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Quelques logiciels de gestion bibliographiqueLes principaux criteres de comparaison

La licence du logiciel.La recherche de références sur le web ou sur des bases de donnéesconnectées au logiciel et l’importation de ces référencesLa capacité de stockage et le classement de ces références.L’édition avec l’insertion des références dans la thèse ou le mémoireet la réalisation d’une bibliographie avec des styles conformes auxnormes de présentation des revues scientifiques.Le partage des références avec d’autres chercheurs.

Pour une comparaison entre plus détaillée :www.mediatum.ub.tum.de/doc/1272837/1272837.pdf

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1 Introduction

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Pourquoi choisir Jabref ?

Pour les rédacteurs en sciences dites « dures », l’utilisation de LaTex etl’usage de BibTex avec un fichier bien formalisé forment un pré requisimplicite pour soumettre des articles dans la plupart des revues. Jabrefest un logiciel de gestion bibliographique adapté à LaTex.

JabRef offre l’opportunité de formaliser des bibliographies demanière très stricte.Il est Open source et s’installe facilement.Compatible avec plusieurs traitements de texte.Son point fort est la souplesse d’utilisation, l’adaptabilité, maissurtout la rigueur de création de fichier BibTex.

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C’est quoi le format .bib de BibTex ?

Pour pouvoir citer des références dans un fichier Latex, l’utilisateur doitstocker sa base de référence dans un fichier de format .bib. Ce fichier estdivisé en entrées où chaque entrée contient :

Un type de référence, comme @ARTICLE ou @BOOK, qui définitle format de la citation.Des clefs bibtexkey pour chaque référence.Divers champs, comme author, journal, title...etc qui sontinformatifs ou obligatoires selon le type de référence.

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Le format .bib

Exemple d’un fichier .bib

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Le format .bibExemple : usage d’un fichier .bib

Pour citer un article avec Latex :

Chercher manuellement la clé Bibtex de l’article dans sa base dedonnée (le fichier .bib)Copier la clé, et la coller dans Latex : /cite{ Clé BibTex del’article }

Jabref vous fournit une interface conviviale à votre base de données etpermet de citer un article sans avoir à chercher sa clé dans votre fichier.Bib

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Installation de Jabref

Site web : www.jabref.orgCompatibilité : Windows, Mac OS X, GNU/Linux.Dernière mise à jour : 2016-04-18.Licence : GNU Général Public Licence version 2.0 (Open source).

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Installation de JabrefExemple d’interface de Jabref

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1 Introduction

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4 Créer une entrée

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6 Conclusion

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Créer une bdd

Menu/Fichier/Nouvelle base Une base vide apparaît.

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Créer une bddEnregistrer la bdd

Enregistrer votre bdd Menu/Fichier/Enregistrer la base sous

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Créer une bddRésultat

Base de données vide : exemple.bib

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ManuellementAutomatiquement

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1 Introduction

2 Présentation Jabref

3 Créer une base de données

4 Créer une entréeManuellementAutomatiquement

5 Quelques fonctionnalités

6 Conclusion

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Créer une entréeComment ?

Créer une nouvelle entrée

Automatiquement

Importer les référances

Site web

Jstor, DirectScience,...

Bdd Jabref

Springer, Google Scholar,...

Manuellement

Choisir type d’éntrée

Remplir les champs

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Manuellement

Ajoutez une nouvelle entrée : Menu/Bibtex/Nouvelle entréeChoisir le type de document : Book, Phdthesis, Article...etcRepérer les différents onglets : Champs requis, champs optionnel,général, ... etcFinaliser une entrée en créant automatiquement ou manuellement laclé BibTex

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ManuellementAjouter une nouvelle entrée

Menu/Bibtex/Nouvelle entrée

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ManuellementAjouter une nouvelle entrée

Nouvelle entrée vide

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ManuellementRepérer les différents onglets

Remplir les champs ’à la main’

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ManuellementCréer la clé BibTex automatiquement

Cliquer sur la ’clé’

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ManuellementCréer la clé BibTex manuellement

Taper une ’clé’ au choix

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Automatiquement

Importer les références automatiquement (les champs) à partir desdifférentes base de données connecter à Jabref (Springer, Googlescholar, IEEXPLOR, ...etc)Télécharger le fichier qui contient les références à partir d’un siteweb

Copier le contenue du fichier.Coller tout sur Jabref et les champs se remplirons de façonautomatique

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AutomatiquementImporter des références à partir de Jabref.

Choisir une Bdd/Écrire l’équation de recherche

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AutomatiquementImporter des références à partir de Jabref.

Sélectionner/Cliquer sur OK

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AutomatiquementImporter des références à partir d’un site web.

Cliquer sur Cite this Item

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AutomatiquementImporter des références à partir d’un site web.

Export a text file/Copier le contenue

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AutomatiquementImporter des références à partir d’un site web.

Coller dans Jabref

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Ajouter un lien vers une entréeFaire une recherche dans la base de donnéesCiter une référence dans LaTexCréer des groupesÉtiqueter des références

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1 Introduction

2 Présentation Jabref

3 Créer une base de données

4 Créer une entrée

5 Quelques fonctionnalitésAjouter un lien vers une entréeFaire une recherche dans la base de donnéesCiter une référence dans LaTexCréer des groupesÉtiqueter des références

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Ajouter un lien vers une entréeFaire une recherche dans la base de donnéesCiter une référence dans LaTexCréer des groupesÉtiqueter des références

Ajouter un lien vers une entrée

JabRef permet de lier les références au fichier PDF. Pour cela :Cliquer deux fois sur la référance.Dans l’onglet Général d’une référence, cliquer sur + , et donner lechemin du fichier PDF.

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Ajouter un lien vers une entrée

Double clique sur la référence. Général/+/Exporter .Choisir le fichier

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Faire une recherche dans la base de données

On peut faire une recherche par :Le nom de l’auteur ou titre de l’entrée.L’année de publicationLe journal si c’est un article publierPar un mot-clé définie au préalablePar une chaîne de caractère dans le résumé de l’entrée (l’abstract).

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Faire une recherche dans la base de donnée

Menu/Recherche/Taper l’équation de recherche

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Citer une référence dans LaTex

Clic droit sur la référence/Clic sur Copier Cite {BibTex}

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Citer une référence dans LaTex

A la fin du fichier LaTex, coller la clé BibTex, indiquer à Latex le cheminpour accéder à la Bdd et choisir le style de bibliographie

Exemple :

...Voir l’article de F.Sharpe /cite{F.Sharpe1963}/bilbiographystyle {STYLE}

/bibliography{C://exemple.bib}

Résulat :...Voir l’article de F.Sharpe[1]

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Citer une référence dans LaTexLes différents style de bibliographie

Les styles standards :alpha : Première lettre de chaque auteur + références par ordrealphabétique.unsrt : Numérotation + références par ordre d’apparition.plain : Numérotation + références par ordre alphabétique.abbrv : Comme plain, mais abrège les prénom. d’auteurs

Pour plus de styles : www.reed.edu/cis/help/LaTeX/bibtexstyles.html

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Créer des groupes

Les groupes rassemblent des références selon des sujets ou centresd’intérêts communs. On peut

Grouper des entrées à partir de keyword, author, journal.... etcCréer une arborescence dans notre base de donnéesCréer des groupes manuelle ou dynamique.

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Créer des groupes

Menu /Groupe/Afficher l’interface des groupes/+

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Exemple de groupes

Exemple de groupes

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Ajouter un lien vers une entréeFaire une recherche dans la base de donnéesCiter une référence dans LaTexCréer des groupesÉtiqueter des références

Étiqueter des références

C’est une façon simplifiée de mettre en avant certaines références.Clic droit sur l’entrée/ Étiqueter l’entrée

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Plan

1 Introduction

2 Présentation Jabref

3 Créer une base de données

4 Créer une entrée

5 Quelques fonctionnalités

6 Conclusion

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Conclusion

Un outil de gestion bibliographique comme Jabref vous aide à organiservotre travail de recherche et :

Un travail de recherche organisé=

Une thèse réussie

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William F.Sharpe.A simplified model for portfolio analysis.Management Science, 9(2) :277–293, January 1963.

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