Impacts direct et indirect d’un prédateur introduit, le ... · hot-spot mondial de...

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Ecologie et impacts d’un prédateur introduit au sein d’un hot-spot mondial de biodiversité. Le chat haret Felis s. catus dans l’archipel néo-calédonien Pauline Palmas Direction : Eric Vidal & Elsa Bonnaud Financeurs : Comité de thèse 2016 1 Inscription : octobre 2014 Soutenance : octobre 2017

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Ecologie et impacts d’un prédateur introduit au sein d’un hot-spot mondial de biodiversité. Le chat haret Felis s. catus

dans l’archipel néo-calédonien

Pauline Palmas

Direction : Eric Vidal & Elsa Bonnaud

Financeurs :

Comité de thèse 2016

1

Inscription : octobre 2014 Soutenance : octobre 2017

2

Des espaces à fort intérêt de conservation… ◊ 5,3% des terres émergées mais 2/3 des extinctions récentes et 37%

des espèces animales et végétales les plus menacées

◊ 10 « hotspots de biodiversité » sont en totalité ou majoritairement composés d’îles

Des écosystèmes fragiles …

◊ réseaux trophiques « simplifiés » ; niches vacantes ◊ espèces naïves, espèces peu compétitives

(Tershy et al. 2015 BioScience. 65: 592-597)

(Mittermeier et al. 2011. in Springer (eds.) Biodiversity Hotspot 3-22)

Importance des îles pour la biodiversité terrestre

Invasions Biologiques : 1ère cause de déclin de Biodiversité en système insulaire

Impact des espèces envahissantes dans les îles

3

Invasions Biologiques : 1ère cause de déclin de Biodiversité en système insulaire

Impact des espèces envahissantes dans les îles

4

87 oiseaux 45 mammifères 10 reptiles

596 sp. à risque d’extinction

Extinction 58%

Menace

Invasions Biologiques : 1ère cause de déclin de Biodiversité en système insulaire

Impact des espèces envahissantes dans les îles

5

Espèces éteintes

Espèces menacées

Oiseaux Mammifères Reptiles

B M R

87 oiseaux 45 mammifères 10 reptiles

596 sp. à risque d’extinction

Extinction 58%

Menace

Invasions Biologiques : 1ère cause de déclin de Biodiversité en système insulaire

Impact des espèces envahissantes dans les îles

6

Espèces éteintes

Espèces menacées

Oiseaux Mammifères Reptiles

B M R

Extinction 58%

Extinction Menace

87 oiseaux 45 mammifères 10 reptiles

596 sp. à risque d’extinction

Menace

26% des extinctions 72% sp à risque

63 sp. 430 sp.

Invasions Biologiques : 1ère cause de déclin de Biodiversité en système insulaire

Impact des espèces envahissantes dans les îles

7

Espèces éteintes

Espèces menacées

Oiseaux Mammifères Reptiles

B M R

Extinction 58%

Extinction Menace

87 oiseaux 45 mammifères 10 reptiles

596 sp. à risque d’extinction

Menace

26% des extinctions 72% sp à risque

63 sp. 430 sp.

Le chat : prédateur apical envahissant

Chat haret

(Medina et al., 2011. )

Chat haret • Domestication ancienne

• Mammifère largement introduit dans les îles initialement sans prédateur

• Forte capacité de dispersion et forte fécondité

• Prédateur généraliste et opportuniste

Impact important sur la biodiversité Problématique écologique mondiale dans le contexte d’érosion

de la biodiversité

Manque de données sur la zone Pacifique (Micronésie, Polynésie, Mélanésie…) hors ces zones abritent une

biodiversité unique

8

Le chat : différents statuts / différents régimes aimentaires

Chat haret Chat haret • Chat de compagnie

• Chat de ferme/de maison

• Chat errant/relaché/ensauvagé

• Chat haret

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Le chat : différents statuts / différents régimes aimentaires

Chat haret Chat haret • Chat de compagnie

• Chat de ferme/de maison

• Chat errant/relaché/ensauvagé

• Chat haret

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Le chat : différents statuts / différents régimes aimentaires

Chat haret Chat haret • Chat de compagnie

• Chat de ferme/de maison

• Chat errant/relaché/ensauvagé

• Chat haret

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Le chat : différents statuts / différents régimes aimentaires

Chat haret Chat haret • Chat de compagnie

• Chat de ferme/de maison

• Chat errant/relaché/ensauvagé

• Chat haret

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Le chat : différents statuts / différents régimes aimentaires

Chat haret Chat haret • Chat de compagnie

• Chat de ferme/de maison

• Chat errant/relaché/ensauvagé

• Chat haret

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Le chat : différents statuts / différents régimes aimentaires

Chat haret

(Medina et al., 2011. )

Chat haret • Chat de compagnie

• Chat de ferme/de maison

• Chat errant/relaché/ensauvagé

• Chat haret

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impact

Site d’étude : Archipel de Nouvelle Calédonie Enjeux de conservation

Taux d’endémisme de la faune exceptionnels : • 91 % d’endémisme chez les squamates • 2 sous espèces d’oiseaux marins endémiques • 3 sp. de roussettes endémiques

Introduit avec l’arrivée des Européens vers 1860

Présence de populations de chats harets dans tous les types d’habitats, du bord de mer jusqu’aux plus haut

sommets et indépendamment de la présence de l’homme

Felis s. catus

Olivier Hébert

Lioscincus vivae Pterodroma leucoptera Pteropus vetulus

Nouvelle Calédonie

15

16

Organisation du travail de thèse

2

5

1

Ecologie et impacts d’un prédateur introduit au sein d’un hot-spot mondial de biodiversité. Le chat haret Felis s. catus dans l’archipel néo-calédonien

5 volets

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Abondance, Densités, Prélèvements

Génotypage : outil d’individualisation des fèces

3 Déplacements, Territoires

4 Opération de contrôle expérimental

Questions scientifiques

- Quels groupes de proies sont consommés dans chacun des habitats et à quelles intensités ?

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot 1

Rongeurs Chauve-souris Oiseaux Squamates Insectes

Un vrai temps à gecko !

17

- Le chat haret consomme t’il des espèces endémiques et en danger d’extinction et dans quels habitats ?

1

Méthodologie

- Etude du régime alimentaire des chats harets caractériser la faune impactée - Collecte de fèces de chats harets puis analyse macroscopique (à la loupe) au

laboratoire

Attribution des restes de proies à un groupe de proies

ou une espèce

18

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

1

Méthodologie

Forêt humide

Maquis/forêt humide

Forêt sur calcaire

Forêt sèche

19

Forêt sèche Forêt Humide Maquis / Forêt Forêt sur Calcaire Savane Lac

5346 fèces de 4 types d’ habitats : 14 sites (4-6 sessions /année et 1 à 2 années de récolte)

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

1

20

Résultats Prédation sur les catégories de proies :

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Introduite

Natives

1

21

Résultats

• Forte et constante dans tous les habitats Base du régime alimentaire permettant un maintien des populations de chat haret

Prédation sur les catégories de proies :

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Introduite

Natives

1

22

Résultats

• Forte et constante dans tous les habitats Base du régime alimentaire permettant un maintien des populations de chat haret

• Forte dans tous les habitats

Prédation sur les catégories de proies :

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Introduite

Natives

1

23

Résultats

• Forte et constante dans tous les habitats Base du régime alimentaire permettant un maintien des populations de chat haret

• Forte dans tous les habitats

Prédation sur les catégories de proies :

• Prédation variable

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Introduite

Natives

1

24

Résultats

• Forte et constante dans tous les habitats Base du régime alimentaire permettant un maintien des populations de chat haret

• Forte dans tous les habitats

Prédation sur les catégories de proies :

• Prédation variable

• Assez faible / autres études

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Introduite

Natives

1

25

Résultats

• Forte et constante dans tous les habitats Base du régime alimentaire permettant un maintien des populations de chat haret

• Forte dans tous les habitats

Prédation sur les catégories de proies :

• Prédation variable

• Assez faible / autres études

• Prédation fréquente Originalité

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Introduite

Natives

1

• Forte plasticité du régime alimentaire qui confirme le

caractère généraliste du chat haret

26

Résultats

• Forte et constante dans tous les habitats Base du régime alimentaire permettant un maintien des populations de chat haret

• Forte dans tous les habitats

Prédation sur les catégories de proies :

• Prédation variable

• Assez faible / autres études

• Prédation fréquente Originalité

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Introduite

Natives

1

• Forte plasticité du régime alimentaire qui confirme le

caractère généraliste du chat haret

27

Résultats

• Forte et constante dans tous les habitats Base du régime alimentaire permettant un maintien des populations de chat haret

• Forte dans tous les habitats

Prédation sur les catégories de proies :

• Prédation variable

• Assez faible / autres études

• Prédation fréquente Originalité

Le chat haret représente une menace pour de nombreuses espèces endémiques notamment roussettes, oiseaux marins et lézards

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Introduite

Natives

1

Résultats

28

sp. détectées dans les fèces de chat

sp. présentes sur les zones prospectées

sp. présentes en NC mais pas sur sites d’étude

Espèces de scinques prédatées sur les différents habitats

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

1

Résultats

29

sp. détectées dans les fèces de chat

sp. présentes sur les zones prospectées

sp. présentes en NC mais pas sur sites d’étude

Espèces de scinques prédatées sur les différents habitats

• Au total 71% des espèces présentes sur nos sites

sont prédatées

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

1

Résultats

30

sp. détectées dans les fèces de chat

sp. présentes sur les zones prospectées

sp. présentes en NC mais pas sur sites d’étude

Espèces de scinques prédatées sur les différents habitats

• Au total 71% des espèces présentes sur nos sites

sont prédatées

• Sur les différents habitats : plus le nombre d’espèces présentes est grand, plus

un grand nombre d’espèces sont consommées

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

1

Résultats

31

sp. détectées dans les fèces de chat

sp. présentes sur les zones prospectées

sp. présentes en NC mais pas sur sites d’étude

Espèces de scinques prédatées sur les différents habitats

• Au total 71% des espèces présentes sur nos sites

sont prédatées

• Sur les différents habitats : plus le nombre d’espèces présentes est grand, plus

un grand nombre d’espèces sont consommées

Le chat haret représente une menace pour de espèces de lézards et particulièrement sur les habitats abritant de nombreuses sp. microendémiques.

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

32

1

Résultats

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

12

7 1 12 4 20 n sp IUCN

Le chat haret consomme au moins 20 espèces menacées : - 16 espèces de lézards - 2 espèces de roussettes - 2 espèces d’oiseaux

Toutes sont endémiques (sauf Pétrel de Gould qui est sub endémique)

33

1

Résultats

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

12

7 1 12 4 20 n sp IUCN

Le chat haret consomme au moins 20 espèces menacées : - 16 espèces de lézards - 2 espèces de roussettes - 2 espèces d’oiseaux

Toutes sont endémiques (sauf Pétrel de Gould qui est sub endémique)

34

1

Résultats

5 9 6

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

12

7 1 12 4 20 n sp IUCN

Le chat haret consomme au moins 20 espèces menacées : - 16 espèces de lézards - 2 espèces de roussettes - 2 espèces d’oiseaux

Toutes sont endémiques (sauf Pétrel de Gould qui est sub endémique)

35

1

Résultats

5 9 6

Et la plupart dans les habitats Habitats prioritaires en terme de conservation, action de lutte contre chat haret

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

12

7 1 12 4 20 n sp IUCN

Conclusions

36

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Conclusions • Cette étude comble un manque important de connaissances concernant la

problématique du chat haret dans le Pacifique Sud

37

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Conclusions • Cette étude comble un manque important de connaissances concernant la

problématique du chat haret dans le Pacifique Sud

38

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

• Cette étude montre

- des patrons originaux sur les roussettes

Conclusions • Cette étude comble un manque important de connaissances concernant la

problématique du chat haret dans le Pacifique Sud

39

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

• Cette étude montre

- des patrons originaux sur les roussettes

- des taux de prédation sur les lézards élevés et une majorité d’espèces (et certainement toutes)

Conclusions • Cette étude comble un manque important de connaissances concernant la

problématique du chat haret dans le Pacifique Sud

40

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

• Cette étude montre

- des patrons originaux sur les roussettes

- des taux de prédation sur les lézards élevés et une majorité d’espèces (et certainement toutes)

- nombreuses espèces

endémiques et menacées concernées

Conclusions • Cette étude comble un manque important de connaissances concernant la

problématique du chat haret dans le Pacifique Sud

41

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

• Cette étude montre

- des patrons originaux sur les roussettes

- des taux de prédation sur les lézards élevés et une majorité d’espèces (et certainement toutes)

- nombreuses espèces

endémiques et menacées concernées

- et pas de cas de prédation de Cagou

Conclusions Ce volet permet de - poser le cadre de la

problématique chat haret en Nouvelle Calédonie

42

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

- top-lister le chat haret sur le plan stratégique de lutte contre les espèces envahissantes en Nouvelle Calédonie

Conclusions Ce volet permet de - poser le cadre de la

problématique chat haret en Nouvelle Calédonie

43

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

- top-lister le chat haret sur le plan stratégique de lutte contre les espèces envahissantes en Nouvelle Calédonie

- Donner des pistes de gestion des populations de chat haret : Prioriser les habitats, et cibler les sites prioritaires

Conclusions & Perspectives

44

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Conclusions & Perspectives

45

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Nouvelle Calédonie : 0.12% de la surface des iles du

monde MAIS

33% des espèces IUCN avérées menacées par la prédation du

chat haret

Conclusions & Perspectives

46

1 Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

Polynésie? ? Micronésie Papouasie ? Vanuatu ?

- Montre l’importance de continuer à étudier ces questions sur les îles et régions du monde sur lesquelles peu ou pas d’informations sont détenues

- En priorité sur îles à haute

valeur de biodiversité et contexte écologique différents : tailles différentes, autres habitats sur lesquelles les compositions en mammifères different

Nouvelle Calédonie : 0.12% de la surface des iles du

monde MAIS

33% des espèces IUCN avérées menacées par la prédation du

chat haret

47

Mauruuru ! Publications : 1) Régime alimentaire Biol. Cons. Soumis 2) Note Cagou Plos One Soumis Participations à des conférences : SFE 2016, Marseille, Prés. orale et posters NEOBIOTA 2016, Vianden, Luxembourg, Prés. orale et poster ICCB-ECCB 2015, Montpellier Poster SERA 2014, Nouméa Présentation orale ISLAND BIOLOGY 2014, Honolulu, Hawaï, Prés. Orale Prévues: ISLAND INVASIVES 2017, Dundee, Ecosse

Merci à tous mes collègues pour leur aide sur le terrain et au

laboratoire !

Merci à l’UNC et ED de m’avoir permis de venir présenter mes

travaux ici.

1

48

Résultats

Prédation sur les catégories de proies :

Ecologie trophique à l’échelle du hotspot

NS

3

49

Quelques résultats

• Tailles des territoires des chats (MCP) Femelle VS Mâle

* = Test de significativité à 5%, Welch t-test (t = -3.193, df = 3.0142, P= 0.04927)

Airefemelle : 53.04±23.85 ha Airemâle : 645.4±370.6 ha

Territoire des mâles 12 fois > territoire des femelles

*

Déplacements, Territoires

3

50

Quelques résultats

• Distances parcourues Femelle VS Mâle & Jour VS Nuit

***

✔ Sur 24h les mâles parcourent 2 fois plus de distance que les

femelles

Les chats harets parcourent des distances comparables le jour et la

nuit

Déplacements, Territoires

3

51

Analyses à venir

• Déplacements

Calcul de la vitesse de déplacements des chats sur les trajets sur pistes / non pistes (Mc Gregor 2016)

Distance maximale entre cœur de territoire et colonie (si fréquentation de la colonie)

• Territoires Territoire J/N et Travail sur Ker 95 et Ker 50

Chevauchement des territoires

Déplacements, Territoires

Genotyping Method

• Individualisation of samples is based on the allelic variability • The combinaison of different sizes of each allele amplified allow us to discriminate individuals

FCA149 FCA441 FCA105 FCA031 FCA178

Alleles amplified by specific cat primer pairs for each sample

52

Scat 1

Scat 2

Scat 3

= Same combination of alleles Probably 2 samples belong the same individual

Cat 2

Cat 1

Cat 2

≠ 2 combinations of alleles

Probably 2 samples belong the 2 individuals