Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

88
! !

Transcript of Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

Page 1: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

����������� �������������� ��� ���������������������������� �������� ���� ����������� �����

�������������������������� ���������� �������������� ��������� �����������������������

���������� ���������������������� ���������������������� ������������������������������������������������������ ���������������� ���������������������������������������������� ��� �������� �������

������������������������������

������������������ ���������!���� ���������!����

� � � �� �� � � �� ������������� ��������������� �������������� �������

Page 2: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

!������!������

�� �"������������"�����������" #����������������$������������������������������������%&

" ��������������

" #������������������������������������������������������ '

�� �"�"������ ������ ����������������� ������ ����������� �� ������ ����������" (��� $ )����*+ ���&���,�������� '

" #���������������,��$ ������-����&�./������0

" #�����������������������������������

�� !"!"���������������� �� ������ ����" 1��������������������������� '

" 1����������������������'

" 2����������3#���������������3���������� �����.��0'

�� #"�!��������$�#"�!��������$��������%����������%���

Page 3: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

&' �

� � �� ����� ����� � �� ����� �������� ��������(�����������(���

����4�������������

Page 4: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���

����4�������������

&')�*&'+�

Page 5: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���,

� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���

����4�������������

Page 6: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���,

� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���

����4�������������

1������5���6��������������#����4�����

#����4����

1������5���6������������

#����4�������������������1������5���6�������������7����

Page 7: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���,

� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���

�,�- �(���.���� ������� ��/��������� �0��$�1� �

Page 8: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���,

� � �� ����� ����� � �� ����� ������������������(�����������(���

�,�- �(���.���� ������� ��/��������� �0��$�1� �

� ���1��0���������������

Page 9: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

!�����!�����/��0��/��0��

#��4����������

2����2��������������

3�/����3�/������������ �������� ���� �� ��/�������� ��/������

������ ���� ������ �������������� ���������� ����

�������� �������� ���� ��� ������ ���

/� �������

�����������

��1�0�/�0�� 1��1�0�/�0�� 1

3�/����3�/�����/���������/���������������� ��������� ���

�������� �������� ���� ��� ������ ���

Page 10: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

8����������������������� ���������'

4(�4(� ����� ����� ����� �1����� �1 � ���� � ���� ������ ���������� ����55

#�����6������������� ���� �� �����5

Page 11: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���������������������������������� �������� ���� �� ���5�� ���5

Page 12: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���������������������������������� �������� ���� �� ���5�� ���5

Page 13: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���������������������������������� �������� ���� �� ���5�� ���5

Page 14: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�������(�6��(������������(�6��(��������������� �������� ���� �� ���5�� ���5

Page 15: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique
Page 16: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

9������ ���������������������� )����*+ ����:����

�������������6����������������

�"�"������ ������ ������������������ ������ �������������� ������ ����������

Page 17: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

SouthSouthDananéDanané

�������������� ������ ���2;<��������������������:�������� ���4�����$ 7&����������

���������� ����������������������

����������������������������������������������������������������55

=>�?�

@A�?�

�������$B=&) ��7, -

#�������$B@&) ��7,8-

������ $=@&�) ��7 �-

�������$BC&�) �7��+-

D�����$=@&) ��7+8-

) ��9�- ���� ����(��0������) ����1

����������E�����;<2����:��� �������

�����������

� �����������

��������� ��

����� �������

��� ����������

�������

Page 18: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�������������� �� ������ ��������1����1

8��������������������'

Page 19: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

(����������=(����������B

/���������������������������'

Page 20: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

(����������=(����������B

9�������:

/�����=

/�����B

-������

/�����=

/�����B

-������

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

Page 21: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

(����������=(����������B

9�������:

/�����=

/�����B

-������

/�����=

/�����B

-������

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

Page 22: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

(����������=(����������B

1�5���������������!�������������

/�����=

/�����B

-������

/�����=

/�����B

-������

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

Page 23: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

(����������=(����������B

+�������������=�������������� ��

/�����=

/�����B

-������

/�����=

/�����B

-������

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

Page 24: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

(����������=(����������B

+�������������=�������������� ��

/�����=

/�����B

-������

/�����=

/�����B

-������

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

Page 25: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

(����������=(����������B

+�������������B�������������� ��+�������������=�������������� ��

/�����=

/�����B

-������

/�����=

/�����B

-������

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

Page 26: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

(����������=(����������B

+�������������B�������������� ��+�������������=�������������� ��

/�����=

/�����B

-������

/�����=

/�����B

-������

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

Page 27: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

(����������=(����������B

(��������(����������=�$��������&�F�(����������B�$���� &

(��������(����������=��$�����&�� (����������B�$� &�

:0��0�/����� �����: 0��0�/����� �����55

Page 28: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�������������������������������������������,�����������������

����������������������������������������

�����������������������������

1�������:������ ��%������� ��/����� ��/ �;����� ��%������� ��/����� ��/ �;���

$-��������������B>>>�#����������G ���&

Page 29: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

����� ������������� ������������0���1/�0��/����0���1/�0��/

H�=@

H�B@

H�I

����� ��������% �1�����0������/6����� ���/���� �������

���� ��<����������0���1/�0��/� /�������%��� ��

Page 30: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

����� ������������� ������������1�������1���

���� �

( !�:�������������� �����������

#������������F��$�������������&

���� �G�����������

Page 31: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

����������������������������6��(������ ��������������������������������6��(������ ����(��0�(��0�=��=��

������������ ����������:����������������J������� �������:����������������������

2���������������

(����������= (����������BF

2���������������

(����������= (����������B�

>���������K������������ ������L>�>A���������K��������������������������������>�>A6>�=A��#������>�=A6>�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������

=��������-������������������5���

����F�> ����F�=

Page 32: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

������������������������(�����������(�����������

$$ ������-����O ������-����O�������>������������>�����&&

��������������������������N�������N�������33��:���:�

$1����$1���� �6����6���**��0�����0���>�����>�����&&

���������������������������������� �������� ���� �� ����(��0������ ���� ����(��0������ ��/ �;���/ �;�������������������������������������������

?�/6 6(�

��� �?�������N�������

�@#@!�

�� ��

�@���

�@���

�@�&�

�@&&&

=��9������/�� ���1�����A

Page 33: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

������������������������(�����������(�����������

$$ ������-����O ������-����O�������>������������>�����&&

��������������������������N�������N�������33��:���:�

$1����$1���� �6����6���**��0�����0���>�����>�����&&

/��,����/��,��������4������������4��������:������:������ �����������:������������:�����������������������������������������������BB3������3������>�����C�#�� �������">�����C�#�� �������"

?�/6 6(���F>�P>

��� �?�������N�������

�@#@!�

�� ��

�@���

�@���

�@�&�

# ; �

�@&&&

=��9������/�� ���1�����A

3��; ���#���<����6���/

D�3��; ���#���<����6���/

!��

���������������������������������� �������� ���� �� ����(��0������ ���� ����(��0������ ��/ �;���/ �;�������������������������������������������

Page 34: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/

/�����-

/������

=�����������

Page 35: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

/�����-

/������

!����� ����������������������

=�����������

��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/

Page 36: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

/�����-

/������

!����� ����������������������

=�����������

��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/

Page 37: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

/�����-

/������

!����� ����������������������

=����������� B������������

��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/

Page 38: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/

/�����-

/������

!����� ����������������������

=����������� B������������

K������� ����������������������

Page 39: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

��������3��; �����������3��; ���#���<����6���/#���<����6���/

/�����-

/������

!����� ����������������������

=����������� B������������

K������� ����������������������

/��,����F���������.���0����� ��� ��������.���0����������������������4��������

Page 40: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

#�����������������

6 K����������������������� �����������6 9������ /��,��������4��������

+�������������������

#��������������������'�Q%�'

Page 41: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���0����0��������� ���������������� ����������������������������������

1�4������������������������

-�2� �9�2�2�-�-�2�-�-�2�-�-�2�-�-�2�-�-�-�9�2� �-�9�2�-�9� �-�-�2�2�-�2�2�-�2�2�-�2�2�-�2�2�2� �-�9�2�

:��������,�������������K-

=�A ��������������������� �����$2--&���$ -&���$2-&�

@������������������������� �������������'

Page 42: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

!/��A��!/��A��/���� �������/���� �������

$--2& !����� R����=

$-222-2& !�����R����B�$����J�������������&

$-2& !����� R����@

����,�����K-

�����5��������������������� ������� ����� �����������������������

Page 43: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

'�������� ��������'�������� ��������

#�������������� ��B6@,���������������������������������������

Page 44: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

=&�#��������������������5������ ������� ����� �����������������������

B&�1�S�����:��� A>���@A>���� ��������� ��<>���

Page 45: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���������1���������1

��������������K- Q���������������K-

1�4���������������������������������,�����K-������������������������� ����������������������

�����������$���������K-&

����� �K-

Page 46: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�"�"���������1���������1>�>��0����� �/����� ���4�/ ��0����� �/����� ���4�/ � #D��#D��

8"8"�����6����1�����6����1>> ��<��������<������ ��=� �;���=� �;���#D�� ��#D�� �� ��������������� =;���

Page 47: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

E �1��� ����E �1��� ����

2����� ������� ����������

Page 48: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

������������������61�61�0���00��;���0���00��;���

/�������������������

#������������

#������������

TU

!������������

!����������������

Page 49: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

��1/�0��/��1/�0��/

0%

5%

10%

15%

20%

25%

118

218

221

223

225

228

231

233

235

237

239

242

245

252

255

259

263

270

283

326

Freq

uenc

y

0%

10%

20%

30%

40%

50%

60%

70%

80%

91 94 98 101 110

�������������������:������������:�

/�:�������������/�:�������������

-��������S�

#�������������:���������������������������

Page 50: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

,","E �1��� ����E �1��� ��������������0���� /������0���� / "������ ���������� "������ ���������� ������������������ �0�/�/���0�/�/��)"�#��� ���)"�#��� ��� 6��(���6��(��� /���� �����������/���� ����������� �� �������� ����������������������������+"�+"������/��� ����1/�0��/�����/��� ����1/�0��/ �<���

Page 51: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

F�������&9�������� ���� �� �������������� ������� ������������� ���5

7��������B ������� ���� (���������������������������������'

7��������@!��������#������������������3#������+��������3 ����������������� ������'

!"�!"��������������������� ����<��������� ����<�������

Page 52: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���������� �������� ���� �� �������������5�� �������������5

�����������!���������������������������6��������-����

� K������������������������������:���������������� ������������'

Page 53: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

���������� �������� ���� �� �������������5�� �������������5

-� �V (��:��� ��������������:����������:��������$��5����������5&

C��������������������������������������$<�����=;�������������������&

DjiboutiDjiboutin(42)n(42)

DakarDakarn(37)n(37)

SouthSouthDananéDananén(118)n(118)

NiameyNiameyn(43)n(43)

$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&

Page 54: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�=!>��=!>�(��0�(��0� �/���� �����������@ �/���� �����������@

-3.0 -1.5 0.0 1.5AXE I

-1.70

-1.02

-0.34

0.34

1.02

1.70

AX

E II

NiameyDjiboutiDakarDanané

Sites

�������������������� �����������

$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&

Page 55: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

����������������������������6��(������ ��������������������������������6��(������ ����(��0�(��0�=��=��

������������ ����������:����������������J������� �������:����������������������

2���������������

(����������= (����������BF

2���������������

(����������= (����������B�

>���������K������������ ������L>�>A���������K��������������������������������>�>A6>�=A��#������>�=A6>�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������

=��������-������������������5���

����F�> ����F�=

Page 56: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�������:����������:��� ��������������������������:����:����������������������������������������

θθθθθθθθ==0.1890.189(0.121(0.121--0.265)0.265)

θθθθθθθθ==0.2100.210(0.152(0.152--0.272)0.272)

θθθθθθθθ==0.2460.246(0.166(0.166--0.321)0.321)

DjiboutiDjibouti

DakarDakar

SudSudDananéDanané

NiameyNiamey

�����������������������������������������

3 �������������� ����6��(������ �������/ #G�6���� ����0��������

>���������K������������ ������

L>�>A��������K��������������������������������>�>A6 >�=A��#������>�=A6 >�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������

=��������-������������������5���

$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&

Page 57: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�������:������������������:���������������������:���:���������������������������������������

θθθθθθθθ==0.1050.105(0.081(0.081--0.172)0.172)

θθθθθθθθ==0.2460.246(0.166(0.166--0.321)0.321)

θθθθθθθθ==0.0840.084(0.074(0.074--0.171)0.171)

DjiboutiDjibouti

DakarDakar

SudSudDananéDanané

NiameyNiamey

θθθθθθθθ==0.1890.189(0.121(0.121--0.265)0.265)

θθθθθθθθ==0.2100.210(0.152(0.152--0.272)0.272)

θθθθθθθθ==0.2460.246(0.166(0.166--0.321)0.321)

��� ��%����� ��%������������ ������������� ��������������� �������� ���� �� ������ ����

6��(�����0�6��(�����0� ��� �� �� ����� �� �� ��# � �H�# � �H� ����0���0�� ����0���0������������

>���������K������������ ������

L>�>A��������K��������������������������������>�>A6 >�=A��#������>�=A6 >�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������

=��������-������������������5���

$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&

Page 58: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

=���6��(�����������=���6��(��������������������� (��0(��0/���� �����������/���� �����������

θθθθθθθθ==0.0260.026(0.008(0.008--0.048)0.048)

DjiboutiDjibouti

DakarDakar

SudSudDananéDanané

NiameyNiamey

K���� ����������:������,�6K�����

���,�����!����� ����� ��������

θθθθθθθθ==0.1050.105(0.081(0.081--0.172)0.172) θθθθθθθθ==0.0840.084

(0.074(0.074--0.171)0.171)

θθθθθθθθ==0.1890.189(0.121(0.121--0.265)0.265)

θθθθθθθθ==0.2100.210(0.152(0.152--0.272)0.272)

θθθθθθθθ==0.2460.246(0.166(0.166--0.321)0.321)

>���������K������������ ������

L>�>A��������K��������������������������������>�>A6 >�=A��#������>�=A6 >�BA��/���M>�BA��������N��������������������������������

=��������-������������������5���

$������ ���!���������������� �� ���� B>><�-W2#�&

Page 59: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�������9��������������������9����������������������� �������� ���� �� ������ ����/ �;���/ �;������ /�����5� /�����5

?�/6 6(�

#G�6���D� /�1

# � �H

!��

�� �� �@���

�@���

�@�&�

�@&+'

�@��

�@&�,

�@�&�

�@�8 �@�+8

# ; �

&�������B�������>�����" ����

Page 60: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�������� #��������������������������

������������������������������

5

5

Page 61: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

!�������1����������!�������1������������������������������������ �������������,���������������,��33���������'���������'

?�/6 6(�?�/6 6(�

#G�6���#G�6���D� /�1D� /�1

# � �H# � �H

!��!��

�� �� �� �� �@����@���

�@����@���

�@�&�

�@�&�

�@&+'�@&+'

�@�� �@��

�@&�,�@&�,

�@�&��@�&�

�@�8 �@�8 �@�+8�@�+8

θθθθθθθθ = = 0.1930.193

# ; �# ; �

&�������B�������>�����" �������0��&������B�������>�����" ����

Page 62: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

����������= ����������=

��� ������������������������ ����������������������������������-�����

Page 63: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

F�������&9�������� ���� �� �������������� ������� ������������� ���5

F��������F��������9�9������� ���� ��� �������������� ����� �������������� ���� ���� ���5�� ���� ���5

7��������@!��������#������������������3#������+��������3 ����������������� ������'

Page 64: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

K��/��,��������4��������

!����� �������������������

K���������

/��,��������4��������

K������� ���������������:��� ����

1������%

Page 65: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

No LinkageNo Linkagedisequilibriumdisequilibrium

SudSudDananéDanané

No LinkageNo Linkagedisequilibriumdisequilibrium

NiameyNiamey

No Linkage No Linkage disequilibriumdisequilibrium

DakarDakar Linkage Linkage DisequilibriumDisequilibriumDjiboutiDjibouti

Page 66: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

6 1����������������������� �����������6 G����������������5�������6 1������

Q���������9������ /��,��� ����4�������� ����X������'

Page 67: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

3��; ���3��; �������<����6���/����<����6���/

" �������� ��������

" ������

" 1��������

" ���� ��������

" !��������������

" #���������

Page 68: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

0

50

100

150

200

250

Jan 19

97MarMay Ju

lSep Nov

Jan 19

98MarMay Ju

lSep Nov

Jan 19

99MarMay Ju

lSep Nov

Jan 20

00MarMay Ju

lSep Nov

Jan 20

01MarMay Ju

lSep Nov

Jan 20

02MarMay

1998 1999 2002

Mon

thly

inci

denc

e of

clin

ical

mal

aria

atta

cks

sampling periods of clinical malaria isolates, Djibouti-city, CHA Bouffard

$!����� ��(�������������������� ���� G���+����������� B>>AO==@=;6@B=�&

Page 69: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

1998 1999 2002

0

20

40

60

80

K1K1 Mad20Mad20 RO33RO33 3D73D7 FC27FC27

msp1msp1 block2block2 msp2msp2

percentage

�� 6���������6��������� 6���������6��������� �� 6��;��6��;�� ��� ����� !�� ! ������� �������������#G�6���#G�6���

Isolates with only one allele detected by locus

Q�����������������������������������

$!����� ��(�������������������� ���� G���+����������� B>>AO==@=;6@B=�&

Page 70: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

0%

20%

40%

60%

80%

100%

19981998(Sept.-Dec., n=46)

19991999(April, n=61)

20022002(March-May, n=32)

Unb

iase

d ex

pect

ed h

eter

ozyg

ocity

Unb

iase

d ex

pect

ed h

eter

ozyg

ocity msp1msp1 block2block2

msp2msp2

#���� ���������������%�����1������������/��

����������%�����1����������%�����1���0��0� �������� �������� ���� �� ����� ���6����6����>> ������� ��� ������0�������� ��� ������0� &'''&'''����/������/��

$!����� ��(�������������������� ���� G���+����������� B>>AO==@=;6@B=�&

Page 71: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

����������B

����� �5��������V�/�����������������������������5����� ��

R���������������������������������� �������������������������:������������� �����������

Page 72: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

F�������&9�������� ���� �� �������������� ������� ������������� ���5

F��������9������� ���� ��� �������������� ���� ���� ���5

F��������F��������9��� ����� � �� ��� ��/������9��� ����� � �� ��� ��/��������� � �� ���������� � �� ����������� �������������� �������� ���� ��%�����1�5��%�����1�5

Page 73: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

������������������������� �� ��/����� F�K���� ����������������J�����J���

����������1F�K���� ����������������������

���/6�� ������� ��������������#�%�����1

Page 74: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

����������9��������� �����F 9������ �����F�G5������������S��������

F�- ����������S�������

� ��:����������������������������������������������������������,���:������������������

Page 75: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

9��������� �����6������������� �����������

9��������� �����������������������

@������������� =��������

�����������2������������ � #������������� V�9��������� �������+��R��������

Trans < 1 b/Trans < 1 b/perspers/y/yP rate <5%P rate <5%DjiboutiDjibouti

Trans < 1 b/Trans < 1 b/perspers/y/yP rate <5%P rate <5%

DakarDakar

Trans > 300 b/Trans > 300 b/perspers/y/yP rate >80%P rate >80%

southsouthDananéDanané

Trans < 1 b/Trans < 1 b/perspers/y/yP rate <5%P rate <5%�������� 30%30%

NiameyNiamey

$������ ���!���������������� �� ���� B>>A����������&

Page 76: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

9��������� �����6������������� �����������

#�������������������� ��������������:����������������

�����������2������������ � #������������� V�9��������� ������+� R��� ����

TransTrans < 1 b/pers/y< 1 b/pers/yMean MultMean Mult.: 1.31.: 1.31

DjiboutiDjibouti

TransTrans < 1 b/pers/y< 1 b/pers/yMean MultMean Mult.: 1.41.: 1.41

DakarDakar

TransTrans > 300 b/pers/y> 300 b/pers/yMean MultMean Mult.: 2.68.: 2.68

southsouthDananéDanané

TransTrans < 1 b/pers/y< 1 b/pers/yMean MultMean Mult.: 1.63.: 1.63

NiameyNiamey

$������ ���!���������������� �� ���� B>>A����������&

Page 77: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

H=0.53H=0.53DjiboutiDjibouti

������ ����������������� ������������������������������ �����

#�����������������

H=0.76H=0.76NiameyNiamey

H=0.73H=0.73DakarDakar

3� ����������������������%�����1

H=0.76H=0.76SouthSouth

DananéDanané

Page 78: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

H=0.76H=0.76SouthSouth

DananéDanané

�X��������/�:�������������������������:����������� �����

#��������������������:������������������� �����

H=0.76H=0.76NiameyNiamey

H=0.73H=0.73DakarDakar

H=0.53H=0.53DjiboutiDjibouti

Page 79: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

H=0.53H=0.53DjiboutiDjibouti

H=0.76H=0.76SouthSouth

DananéDanané

��,��V�K������/�: ������������������������������������������� �����

#���������������������������������

!���6���� ��������

H=0.76H=0.76NiameyNiamey

H=0.73H=0.73DakarDakar

�/���������������%�����1

Page 80: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

#����������������� ���������S�������'

0

0,5

1

1,5

2

2,5

3

Djibouti Dakar Niamey Danané

Mul

tiplic

ity

00,10,20,30,40,50,60,70,80,91

Het

eroz

ygos

ity

Multiplicity Heterozygosity

L�=�J���JY L�=�J���JY L�=�J���JY M@>>�J���JY

� � �� ��� ��/������ ����� � ����A� ����0������������%�����1�6���%��

Page 81: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

!���������!���������

/��������������� �����������������:�����

6 ������������������������������V���������������

6 �������������������������

Page 82: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

DananDananéé

NiameyNiameyDakarDakar

DiengaDienga

DjiboutiDjibouti

THIAGOTHIAGO

TEMEYE SALANETEMEYE SALANE

SANINTESANINTENDIAKHAYENDIAKHAYE

MALLAMALLA

FATIFATINN

TIPTENGATIPTENGA

S29S29--3030NIOKO II S26NIOKO II S26

PISSY S17PISSY S17

KATKATEE

YOUKOUTYOUKOUT

TCHOLLIRE TCHOLLIRE IIII

SAKDJESAKDJE

BOCKIBOCKI

MELEN/MELEN/NKOLAFENDEKNKOLAFENDEKMIATTA / DJOUZEMIATTA / DJOUZEENDEGUE/ENDEGUE/ABDELONABDELON

ZOEBEFAM/ZOEBEFAM/NKOLEMBOULANKOLEMBOULA

YEN/YEN/MEBAN IIMEBAN II

NIENANIENA

TENASSOTENASSO

Q. SAMAGANQ. SAMAGAN

Q. DOGONAQ. DOGONA

Q. KUINIMAQ. KUINIMA

TIABEDJITIABEDJI

LANDELANDERUNDE/BAITILRUNDE/BAITIL

SAMALSAMALTHIOBOTHIOBO

BANTATABANTATA

ASSONIASSONI

��������%����������%��

Page 83: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

Centre Centre MurazMuraz& & InstitutInstitut P. P. RichetRichet

M.C. HenryM.C. HenryS.B. S.B. AssiAssi

InstitutInstitut PasteurPasteuràà ParisParis

O. O. PuijalonPuijalon

IRD IRD Montpellier,Montpellier,F. F. RenaudRenaudP. DurandP. Durand

UnitUnitéé de de RechercheRecherche en en BiologieBiologie & & EpidEpidéémiologie miologie

ParasitairesParasitaires -- IMTSSAIMTSSAC. C. RogierRogier

B. B. PradinesPradinesT. T. FusaiFusai

H. H. BouchibaBouchiba

DGA (DGA (DynapopDynapop), ), SociSociééttéé Pathologie ExotiquePathologie Exotique, SANOFI , SANOFI –– Impact MalariaImpact MalariaService de SantService de Santéé des des ArmArmééeses

MinistMinistèèrere de de la Santla Santéé DjiboutiDjibouti

M.A. M.A. KamilKamil

INSERM U399INSERM U399LaboratoireLaboratoire de de ParasitologieParasitologie et et

MycologieMycologie

P. P. ParolaParola

Hôpital Hôpital PrincipalPrincipalde Dakarde Dakar

B. WadeB. Wade

HôpitalHôpital National National de Niameyde Niamey

E. E. AdehossiAdehossi

HIA HIA LaveranLaveranE. E. GarnotelGarnotel

hervebogreau @ yahoo.fr

Page 84: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�����S���������9������ �����

($�����&F��������J�$��������Z��������&

($�����&F��������J�$��������Z��������&

�����S��������$�&�F�(�$��������&�:���������F�($���������&�Z(�$��������&

F�($�����&�($�����&�Z�($����&�($����&�F�B�($����&�($����&�

#� �!���

Page 85: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�����S���������9������ �����

($�����&F��������J�$��������Z��������&�F�P�J�=B

($�����&F��������J�$��������Z��������&�F�C�J�=B

�����S��������$�&�F�(�$��������&�:���������F�($���������&�Z(�$��������&

F�($�����&�($�����&�Z�($����&�($����&�F�B�($����&�($����&�

���$����&�F��P����$����&�F�C

F�B���$�B�J�@�&���$�=�J�@&�F�C�J�I�

#� �!���

Page 86: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�����S��������9������ ������

" �F=6[��\

(�5(�(B5(�(=5(�-��������� ���(�

(B5(B(=5(B-������B�� ���(B

(=5(=-������=�� ���(=-���������������������

�������������

-��������� ���(�

-������B�� ���(B

-������=�� ����(=

-����������������������������������

#� �!���

Page 87: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�����S��������9������ ������

" �F=6[��\

(�5(�(B5(�(=5(�-��������� ���(�

(B5(B(=5(B-������B�� ���(B

(=5(=-������=�� ���(=-���������������������

�������������

-��������� ���(�

-������B�� ���(B

-������=�� ����(=

-����������������������������������

#� �!���

Page 88: Génétique des populations de Plasmodium falciparum en Afrique

�����S��������9������ ������

" �F=6[��\ F�=�� .$BJ@&\ Z�$=J@&\ 0F�=�� .AJI0�F�CJI�

(�5(�(B5(�(=5(�-��������� ���(�

$=J@&\(=5(B-������B�� ���(B

$BJ@&\-������=�� ���(=-���������������������

�������������

-��������� ���(�

-������B�� ���(B

-������=�� ����(=

-����������������������������������

#� �!���