Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

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Département 0céanographie et Dynamique des Ecosystèmes Laboratoire Environnement & Ressources –Bretagne Occidentale MONFORT P. Janvier 2014 - RST.ODE/UL.LER/BO - 14-001 Etude sanitaire microbiologique Zone aval de la ria de l’Odet L’Odet, une diversité d’usages (photos : P. Monfort )

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Département 0céanographie et Dynamique des Ecosystèmes

Laboratoire Environnement & Ressources –Bretagne Occidentale

MONFORT P.

Janvier 2014 - RST.ODE/UL.LER/BO - 14-001

Etude sanitaire microbiologique

Zone aval de la ria de l’Odet

L’Odet, une diversité d’usages (photos : P. Monfort )

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Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

1. Introduction.....................................................................................7

2. Description générale de la zone.........................................................8

2.1 – Caractéristiques du bassin versant de l’Odet ..........................................................8 2.2 – Caractéristiques climatiques .................................................................................10

2.2.1 - Les températures ...................................................................................10 2.2.2 - La pluviométrie ......................................................................................11 2.2.3 - L’insolation ............................................................................................13 2.2.4 - Les vents................................................................................................14

2.3 – Caractéristiques géologiques ................................................................................15 2.3.1 – Histoire géologique.................................................................................15

2.4 – Caractéristiques hydrographiques .........................................................................16 2.5 – Caractéristiques de l’occupation des sols........................................................19 Carte 10 : Evaluation des zones humides sur le bassin versant de l’Odet (source :.............21 Marais de l’Atlantique). ................................................................................................21 2.6 – Caractéristiques du bocage...................................................................................21 2.6 – Caractéristiques hydrologiques et sédimentologiques ............................................23 2.7 – Caractéristiques de l’environnement naturel et gestion patrimoniale ......................25

2.7.1 – Les ZNIEFF ..............................................................................................25 2.7.2 – Le Réseau NATURA 2000 .........................................................................27 2.7.3 – Les protections foncières.........................................................................27 2.7.3 – Les protections réglementaires ................................................................27

2.5 – Données de la surveillance....................................................................................29 2.5.1 - Qualité des eaux de baignade ..................................................................29 2.5.2 - Qualité des eaux conchylicoles ................................................................29 2.5.3 - Qualité des eaux estuariennes .................................................................38

2.6 – Caractéristiques de la zone de production ..............................................................40

3. Contexte réglementaire ....................................................................42

3.1 – Généralités..........................................................................................................42 3.2 – Réglementation des zones conchylicoles de production...........................................43

3.2.1 - Critères microbiologiques........................................................................43 3.2.2 – Critères chimiques ..................................................................................45

4. Etude de zone ..................................................................................46

4.1 – Echantillonnage ...................................................................................................46 4.2 – Méthode de dénombrement des E.coli dans les coquillages ....................................46 4.3 – Qualité bactériologique de la zone ........................................................................47 4.4 – Qualité chimique des coquillages ..........................................................................49

5. Identification des sources de contamination ......................................51

5.1 – La population....................................................................................................51 5.2 – Le tourisme .........................................................................................................52 5.3 – L’assainissement..................................................................................................54 5.4 – L’agriculture ........................................................................................................61 5.5 – L’aquaculture d’eau douce ...................................................................................67 5.5 – L’industrie .........................................................................................................68 Carte 34 : Localisation des industries sur le bassin versant par types d’activité (source : SIVALODET).

..................................................................................................................................68 5.6 – La plaisance.........................................................................................................70

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Introduction – 3

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

5.7 – La faune sauvage .................................................................................................72 5.8 – Inventaire des émissaires .....................................................................................73

6. Conclusions ..................................... ............................................74

7. Bibliographie ...................................................................................75

9. Annexes......................................... ...............................................78

9.1– Echelle des temps géologiques ..............................................................................78 9.2– Données relative à la survie des bactéries fécales dans le milieu marin .....................79 9.3– Réseaux de surveillance de la qualité des eaux sur le bassin versant de l’Odet ..........80 9.4– Technique de dénombrement des E. coli (méthode NPP 3x5tubes) ..........................81 9.5 – Résultats bactériologiques des coques de l’Odet ....................................................82 9.6 – Résultats chimiques des coques de l’Odet .............................................................83 9.7 – Notion d’équivalent-habitant................................................................................84 9.8 – Types et caractéristiques des stations d’épuration du bassin versant .......................85 9.9 – Données brutes des flux bactériens moyens annuels en provenance du bassin versant et de la

station d’épuration de quimper agglomération ..............................................................86 9.10 – Modélisation de la dispersion des flux bactériens en provenance du bassin versant au sein de

l’estuaire de l’Odet en périodes hivernale et estivale......................................................87 9.11 – Contamination bactérienne des eaux par abreuvage des animaux et pompe à museau89

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Introduction – 4

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

REMERCIEMENTS

La rédaction de ce rapport a pu se formaliser grâce à l’apport des données géographiques

fournies par les administrations départementales des Territoires et de la Mer, de l’Agence

Régionale de Santé et de la Direction Départementale de la Protection des Populations.

Nos remerciements s’adressent également à :

M. Cadiou, Mme Blanchard et M. Le Dez du SIVALODET pour la mise à disposition des

informations acquises dans le cadre du SAGE de l’Odet.

M. Gardelle de la commune de Quimper pour la mise à disposition des informations

relatives à l’assainissement collectif de l’agglomération quimpéroise.

Le forum des marais de l’Atlantique pour la mise à disposition des données concernant les

zones humides.

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Introduction – 5

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Type de rapport : RST (Rapports de résultats de recherches Scientifiques et/ou Techniques)

Numéro d'identification du rapport :

LER/BO/CC/14.001

Diffusion : libre

Validé par :Clara Galland-Henaff

Coordinatrice du Réseau Microbiologique (REMI)

date de publication Février 2014

nombre de pages : 89

bibliographie : oui

illustration(s) : oui

langue du rapport : Français

Titre du rapport :Etude sanitaire microbiologique – Zone aval de la ria de l’Odet

Co-auteurs : Nom, Prénom

MONFORT Patrick

Organisme / Direction / Service,

laboratoire

IFREMER / LER/BO/Concarneau

Collaborateurs : nom, prénom

Organisme / Direction / Service,

laboratoire

Organisme commanditaire : Convention DPMA – DGAL - Ifremer

Titre du contrat :

Organisme(s) réalisateur(s) : nom(s) développé(s), sigle(s), adresse(s)

IFREMER Centre de Brest, B.P. 70, 29 280 Plouzané

Cadre de la recherche :

Programme : DESECO

Dynamique, Evaluation et Surveillance des

Ecosystèmes Côtiers

Code : PGB05

Projet :Surveillance microbiologique – étude de zone

Code : A050202

Mots-clés :

Contamination fécale, Escherichia coli, plomb, cadmium, mercure, zone conchylicole,

ceratoculture, Odet.

Commentaire :

Ce document doit être cité de la manière suivante :

Référence générale

MONFORT P. 2014. Etude sanitaire microbiologique Zone aval de la ria de l’Odet

RST.ODE/UL.LER/BO/Concarneau- 14.001, 89p.

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Introduction – 6

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

RESUME : L’activité conchylicole emblématique de l’estuaire de l’Odet était tournée pendant des décennies vers l’ostréiculture et tout particulièrement l’exploitation du gisement d’huîtres plates du Pérennou. Les mortalités importantes enregistrées dans les années 70 et 80 liées à la présence des parasites Martelia et Bonamia, associées à la médiocrité de la qualité sanitaire des eaux estuariennes ont participé au déclin de cette activité primaire sur ce territoire. Une volonté locale forte au sein de la Commission Locale de l’Eau (CLE) du Schéma d’Aménagement et de Gestion des Eaux (SAGE) de réhabiliter la qualité bactériologique en priorité puis corrélativement l’activité conchylicole ont contribué au regain d’intérêt de cet estuaire manifesté par les professionnels de la conchyliculture et notamment pour l’élevage des coques ou ceratoculture. Classé en B pour les coquillages non fouisseurs (huîtres), des demandes de concession pour l’élevage de coquillages fouisseurs (coques) supposait préalablement, comme le prévoit la réglementation européenne, l’élaboration d’une étude sanitaire. Cette dernière, engagée à la demande de l’administration, inclut d’une part un suivi de la qualité bactériologique et chimique des coques et d’autre part, une identification des sources potentielles de contamination dans une démarche de gestion préventive des risques sanitaires. Les résultats obtenus au cours de cette étude ont permis d’évaluer la qualité sanitaire des coques en deux points sur la zone aval de l’estuaire et de conclure à une qualité de salubrité B également pour ces bivalves fouisseurs. Ce constat implique donc le passage de ces coquillages dans un établissement conchylicole agréé pour en assurer la purification avant leur mise sur le marché. Dans le cadre de cette nouvelle approche méthodologique, nous avons entrepris d’identifier les sources potentielles de contaminations à l’échelle du bassin versant et de focaliser ponctuellement sur les apports en provenance du bassin versant d’une part et de la station d’épuration intercommunale de Quimper située à l’amont de l’estuaire d’autre part.. Pour y parvenir nous avons analysé de multiples informations obtenues auprès de diverses administrations, des collectivités territoriales mais également du Syndicat mixte de la VALlée de l’ODET (SIVALODET). L’analyse des données accumulées accrédite l’idée d’une contamination concomitante des eaux littorales, l’une générée préférentiellement par l’assainissement collectif et l’autre par l’activité agricole largement représentée sur le bassin versant. Les actions de réhabilitation des stations d’épuration, de l’assainissement non collectif et celles menées dans le cadre du SAGE (étude diagnostic de l’origine des contaminations fécales, suppression des points d’abreuvage des animaux, etc…) oeuvrent à la poursuite de la restauration de la qualité des eaux estuariennes et augurent de bonnes perspectives pour la pérennité de l’activité conchylicole sur le territoire.

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Introduction – 7

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

1. Introduction

Des demandes de création de concessions conchylicoles à vocation cérastocole

(élevage de coques) dans la partie aval de l’estuaire de l’Odet (zone n° 29.07.080 –

rivière de l’Odet aval) par deux professionnels ont été déposées auprès de

l’administration locale (Direction Départementale des Territoires et de la Mer du

Finistère) qui, après étude du dossier, a donné une suite favorable à cette requête.

Cette dernière a donc sollicité l’Ifremer pour la réalisation de l’étude sanitaire,

imposée par la réglementation européenne, et dont les objectifs visent à l’évaluation

de la qualité sanitaire des coquillages du groupe 2 d’une part et à l’investigation des

sources potentielles de contamination d’autre part.

Dans ce contexte, le Laboratoire Environnement Ressources Finistère Bretagne

Occidentale (LER/BO) a procédé à l’élaboration de cette étude avec la collaboration

des professionnels pour la partie échantillonnage et la participation financière du

SIVALODET mais également de la Direction des Pêches Maritimes (DPMA) et de la

Direction Générale de Alimentation (DGAL) .

Basée sur l’évaluation des paramètres microbiologique Echerichia coli (E.coli) et

chimique (plomb (Pb), cadmium (Cd) et mercure (Hg)), l’étude de zone a pour

objectifs :

- d’estimer la qualité microbiologique et chimique de la zone en vue de son

classement sanitaire par l’administration, conformément aux exigences des

règlements européens (CE n° 854/2004 et CE 1881/2006).

- de déterminer la stratégie d’échantillonnage à mettre en œuvre dans le cadre

de la surveillance sanitaire régulière de cette zone.

La stratégie d’échantillonnage de l’étude de zone est déterminée sur la base des

résultats d’une étude de dossier et d’une inspection du littoral. L’étude des

informations disponibles relatives aux sources de contaminations d’origine humaine

ou animale, acquises auprès des différents acteurs du territoire (administrations,

commune, communauté de communes, Conseil Général, professionnels,…), conduit à

identifier les sources de contamination pouvant avoir un impact potentiel sur la zone

de production (IFREMER 2009). Elle permet de surcroît d’examiner les éventuelles

variations saisonnières de la contamination et de déterminer éventuellement les

caractéristiques de la circulation des polluants au moyen d’une modélisation

mathématique des effluents.

Le Directeur Départemental des Territoires et de la Mer assure la maîtrise d’ouvrage

de cette étude de zone et le laboratoire Environnement Ressources de l’Ifremer en est

le maître d’œuvre, chargé du protocole d’étude proprement dit. L’avis de l’Ifremer

porte sur la qualité microbiologique et chimique de la zone de production. Il est

transmis à la DDTM qui, après avis de la commission, propose au Préfet un classement

sanitaire de la zone, qui lui-même, établit un arrêté préfectoral de classement.

Ce document synthétise d’une part les données relatives au bassin versant du l’Odet,

acquises auprès de différents partenaires, afin d’établir un diagnostic aussi pertinent

que possible sur l’origine éventuelle des contaminations et sur les résultats de la

qualité bactériologique et chimique des coques élevées sur la zone aval de l’Odet..

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Description générale de la zone – 8

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

2. Description générale de la zone

2.1 – Caractéristiques du bassin versant de l’Odet

Carte 1 : Localisation géographique du bassin versant de l’Odet

Ancré en Cornouaille, partie méridionale du Finistère (carte 1), située à l’extrême ouest de

la France, le bassin versant de l’Odet, d’une superficie de 725 km2 s’étend sur 34

communes dont à peine le 1/3 sont entièrement incluses dans le bassin versant. La partie

amont, constituée des sous bassins de l’Odet, du Jet et du Steïr circonscrit, quant à elle, une

surface de 540 km2 soit 74,5% de la superficie totale (tableau 1).

Tableau 1 : Caractéristiques morphométriques des sous bassins versants amont de l’Odet

(source : SIVALODET).

Caractéristiques ODET STEIR JET

Superficie 222 203 115

Altitude maximale

(m)

305 252 209

Altitude moyenne

(m)

140 110 110

Pente en amont (%o) 42 103 16

Pente en aval (%o) 2.1 2.4 3

Pente moyenne (%o) 6.6 8.5 7.8

Longueur du cours

d’eau (km)

62 28 24

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Description générale de la zone – 9

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Le bassin versant de l’Odet se caractérise par 3 grands ensembles structuraux qui

s’organisent de l’Argoat à l’Armor (carte 2) :

• Le Nord du bassin versant correspond aux contreforts sud des montagnes

noires dont les sommets avoisinent les 300 m d’altitude, secteur ou le Steir et

l’Odet prennent naissance.

• La partie centrale du bassin versant est constituée d’une zone de plateaux,

entaillée par un réseau de vallées relativement dense.

• La partie méridionale, au sud de Quimper est caractérisé par un relief peu

marqué jusqu’à la zone côtière.

Carte 2 : Relief du territoire du bassin versant de l’Odet (source : DDTM 29)

Ces caractéristiques du bassin versant influencent fortement sa réponse hydrologique et

notamment le régime des écoulements en période de crue ou d’étiage. Le temps de

concentration (tc) qui caractérise la vitesse et l’intensité de la réaction du bassin versant

aux précipitations est influencé par divers facteurs morphologiques : sa surface, sa forme,

son élévation, sa pente et son orientation. A ces facteurs, s’ajoutent encore le type de sol,

le couvert végétal et les paramètres du réseau hydrographique.

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Description générale de la zone – 10

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Avec plus de 36000 communes, la France fait figure d’exception dans le paysage

administratif européen et une accélération de la gestion intercommunale s’est initiée

depuis le début des années 1990. De nature profondément rurale et attachées aux valeurs

de solidarité et d’entraide, les communes finistériennes se sont engagées très rapidement

dans cette nouvelle organisation territoriale, plus en adéquation, par ailleurs, avec une

gestion pertinente de l’eau à l’échelle des bassins versants (liaison terre-mer). Les

communes du bassin versant de l’Odet n’ont pas échappé au phénomène et on y recense

ainsi 8 Etablissements Publics de Coopération intercommunales (2 communautés

d’agglomération et 6 communautés de communes) ainsi que deux intercommunalités de

Pays (carte 3).

Carte 3 : Le bassin versant de l’Odet au sein de la gestion territoriale (source SIVALODET)

2.2 – Caractéristiques climatiques

2.2.1 - Les températures

La caractéristique première du territoire étudié tient à son exceptionnelle douceur

(figure 1), soulignée par des températures moyennes positives tout au long de l’année et

des amplitudes thermiques peu marquées entre l’hiver (6.8°C ) et l’été (7.8°C). Le climat,

qualifié de tempéré océanique, est soumis exceptionnellement aux gelées d’une part (4 j en

moyenne à –5°C) et aux fortes chaleurs d’autres part (5 j en moyenne > à 30°C). Sur la

période 1996 – 2010, les données moyennes minimales et moyennes maximales de

températures se sont respectivement établies à 4.1 °C et à 21.9 °C.

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Description générale de la zone – 11

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

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Tem

péra

ture

(°C

)T_Moyenne

T_Min

T_Max

Figure 1 : Evolution mensuelle des températures moyennes, minimales et maximales à

la station météorologique de Quimper entre 1996 et 2010 (source : Météo France).

2.2.2 - La pluviométrie

Carte 4 : Isohyètes interannuelles de la pluviométrie (1969-1990) sur le bassin

versant de l’Odet (source : Météo France).

Les précipitations à l’échelle du Finistère montrent sur le long terme (1997 – 2006) des

moyennes abondantes, graduelles du littoral (700 mm) au centre du Département ( 1400

mm). Ce gradient de l’Armor vers l’Argoat est également perceptible sur le bassin versant

de l’Odet avec 30% à 40% de précipitations en plus à l’amont qu’à l’aval (carte 4). La

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Description générale de la zone – 12

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

pluviométrie, composante majeure du climat, participe activement aux apports en

nutriments et en bactéries vers le littoral (Corre et al. 1999, Piriou et al. 2000, Le Bec et al.

2002, Monfort et al. 2006) par le lessivage des sols, voire le dysfonctionnement des

ouvrages de l’assainissement. Sur le territoire étudié, les relevés effectués par Météo

France à la station météorologique de Quimper (figure 2) montrent une normale sur 15 ans

(1995 – 2009) de 1215.4 mm.

Cependant, cette moyenne inter-annuelle ne doit pas occulter les variations annuelles qui

peuvent être significatives. Ainsi au cours de la période de 15 ans retenue, les fluctuations

annuelles oscillent entre 962.6 mm en année sèche (2003) et 1502.4 mm en année

pluvieuse (2000). Par ailleurs, cette figure met en évidence des périodes sèches et

pluvieuses prolongées, qui en faisant varier les flux de bactéries dans les eaux, influent sur

la qualité bactériologique des eaux et des coquillages et corrélativement sur le classement

des zones conchylicoles. On soulignera également qu’en moyenne sur 10 ans (1994 – 2003),

le nombre de jours de pluie ≥ 10 mm, susceptible d’impacter la qualité des coquillages

s’élève à environ 40 jours annuellement.

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2008

2009

2010

Plu

ie (

mm

)

Pluie (mm)

Normale

Figure 2 : Evolution des précipitations annuelles entre 1996 et 2010 à la station

météorologique de Quimper (source : Météo France).

La figure 3, qui présente les résultats mensuels sur 15 ans fait apparaître une variabilité des

précipitations, classique en région Bretagne, entre une période pluvieuse d’octobre à avril

et une période sèche s’étalant de mai à septembre. Toutefois au cours de cette période

d’afflux touristique, des précipitations importantes, de nature orageuse, sont susceptibles

également de dégrader la qualité des eaux littorales, impactées d’une part, par le lessivage

des sols mais également par d’éventuels dysfonctionnements des équipements de

l’assainissement collectif et autonome. Au cours de la période étudiée, le mois le plus

pluvieux en moyenne est novembre (158.3mm) et le plus sec, juin (56.5mm).

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Description générale de la zone – 13

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

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mm

)

MoyenneMinimaMaxima

Figure 3 : Variation mensuelle de la pluviométrie entre 1996 et 2010 à la station

météorologique de Quimper (source : Météo France).

2.2.3 - L’insolation

02000400060008000

100001200014000160001800020000

Janv

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Nom

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INS_Moyenne

INS_Min

INS_Max

Figure 4 : Evolution de l’insolation entre 1996 et 2010 à la station météorologique

de Quimper (source : Météo France).

La figure 4 relative à l’insolation fait état d’une forte variabilité mensuelle, oscillant

entre 69 heures en moyenne en décembre et 211 heures en moyenne en juin. Ce

paramètre, associé au vent et à la température, participe à l’évaporation du sol et à la

transpiration des plantes et explique l’évolution de la pluie efficace, paramètre

résultant de la différence entre les précipitations (P) et l’évapotranspiration réelle

(ETR). L’insolation contribue sur le plan sanitaire, grâce aux rayons ultra-violets du

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Description générale de la zone – 14

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

soleil et à leurs effets microbicides, à réduire le temps de survie des bactéries et des

virus dans le milieu marin (Pommepuy. 1995).

2.2.4 - Les vents

Avec une fréquence des vents de 97.6% supérieure à 1.5 m/s recensée à la station

météorologique de Penmarc’h entre 1989 et 2008, ce chiffre souligne l’omniprésence

de cet élément naturel à l’extrême ouest du territoire national. La figure 5 met en

exergue la prédominance de forts vents d’ouest Nord Ouest à sud ouest (>8 m/s),

résultat du passage des perturbations ouest atlantique en hiver. Par ailleurs, des vents

soutenus de Sud-Est sont également recensés sur cette zone à certaines périodes de

l’année. Ce paramètre peut influer sur l’hydrodynamisme côtier et favoriser soit la

dispersion des effluents pollués soit au contraire la concentration des contaminations

sur les concessions conchylicoles.

Figure 5 : Fréquence des vents en fonction de leur provenance en % à la station

météorologique de Penmarc’h entre 1989 et 2008 (source : Météo France).

Page 15: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 15

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

2.3 – Caractéristiques géologiques

2.3.1 – Histoire géologique

Le bassin versant de l’Odet s’inscrit, au sud, dans une armature granito-gneissique

(carte 5), dénommée anticlinal de Cornouaille qui s’étire de la pointe du raz à l’ouest

jusqu’à Nantes à l’Est, de part et d’autre d’une zone de discontinuité ou zone broyée Sud

Armoricaine due à la tectonique hercynienne (-340 à –300 millions d’années). Au Nord, le

bassin versant fait partie intégrante du domaine centre-armoricain, constitué de terrains

briovériens et primaires peu métamorphisés (annexe 9.1).

Carte 5: Carte géologique du massif armoricain (source : BRGM Bretagne)

La carte 6 montre une composition relativement similaire des sous-bassins versants de

l’Odet et du Steïr, composés préférentiellement de roches sédimentaires (schistes,

micaschistes), peu perméables à l’infiltration des eaux et donc à la formation d’aquifère.

Le Jet, quant à lui, ancré dans la partie méridionale du bassin versant bénéficie d’une

proportion de roches magmatiques (granite, gneiss) beaucoup plus importante qui assure

une infiltration des précipitations grâce aux fissures (diaclases) qui y sont présentes. Bien

que ces aquifères soient de taille modeste, ils contribuent efficacement au soutien d’étiage

du cours d’eau.

Page 16: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 16

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 6 : Carte géologique du bassin versant de l’Odet (source : BRGM Bretagne)

2.4 – Caractéristiques hydrographiques

Carte 7 : Carte du réseau hydrographique du bassin versant de l’Odet (source : BD

Carthage).

Page 17: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 17

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Le réseau hydrographique relativement dense, dont les sources de l’Odet se situent sur les

communes de Saint Goazec et de Leuhan, enregistre une longueur des cours d’eau estimée

à près de 320 km (tableau 2). Sur l’ensemble du bassin versant on comptabilise environ

1060 km de cours d’eau (carte 7), soit une densité hydrographique de 1,46 km/km2.

L’estuaire, d’une longueur de 17 km, offre au débouché de Quimper un élargissement

important qui contribue au ralentissement des eaux et corrélativement à une

sédimentation importante pour former à marée basse un paysage de vasières au niveau de

la baie de Kérogan. A l’aval, l’estuaire se rétrécie pour former les vires-courts où le courant

est accentué avant de s’élargir progressivement jusqu’à l’embouchure.

Tableau 2 : Caractéristiques physiques des cours du bassin versant (DDTM 29 – 2011)

Sous bassin Code DCE Surface

(km2)

Linéaire de

cours d’eau

(km)

Densité

(km/km2)

Odet FRGR0078 222 309,8 1,40 Odet

Frout FRGR0078 7,8 9,5 1,21

Jet Jet FRGR0083 115,0 198,8 1,72

Steir Steir FRGR0084 203,0 300,8 1,48

estuaire FRGT15 87,9 97,6 1,11

Lendu FRGR1634 17,1 24,3 1,42

Mur St

Cadou

FRGR1633 27,6 47,9 1,73

Keriner FRGR1636 12,2 16,2 1,33

Corroac’h FRGR1635 41,2 54,8 1,33

Estuaire

SAGE 724,2 1059,6 1.46

La figure 6 qui présente l’évolution annuelle des débits de l’Odet sur la période 1990-2010

laisse apparaître une normale de 10,41 m3/s, avec un minimum enregistré en 1997 (6.27

m3/s) et un maximum observé en 2001 (15,43 m3/s). Par ailleurs, ce graphique montre

clairement sur la période analysée des cycles de variations bien identifiés entre 1992 et

1997 ou entre 1997 et 2003. Depuis cette date, aucun cycle n’émerge vraiment en raison

de la stabilité des débits. En terme de contribution au débit, cette figure souligne la

régularité du débit inter-annuel du Steir (34 à 36%), contrairement à l’Odet (40 à 46%) et au

Jet (19 à 24%). On observe en effet que ces deux rivières offrent une plus grande

fluctuation entre les années pluvieuses et les années sèches due vraisemblablement à la

nature différente du sol et du sous-sol de ces bassins versants.

L’analyse des données mensuelles des débits (figure 7) fournit un profil en adéquation avec

celui des données pluviométriques, à savoir une diminution constante des débits moyens

de janvier à septembre puis une augmentation jusqu'au mois de décembre. Cette

observation permet de définir la notion d’année hydrologique qui débute en octobre et se

termine en septembre, concept retenu pour l’évaluation dans le temps des flux polluants .

La contribution des différents sous-bassins versants corrobore l’observation formulée

précédemment quant à l’impact de la géologie sur le débit des rivières. En effet, on peut

remarquer qu’en période estivale le bassin versant du jet intervient plus activement en

terme de soutien d’étiage (roches magmatiques) comparé à celui de l’Odet (roches

sédimentaires).

Page 18: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 18

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

0

5

10

15

20

25

30

1990

1992

1994

1996

1998

2000

2002

2004

2006

2008

2010

Déb

it (m

3/s)

0.005.0010.0015.0020.0025.0030.0035.0040.0045.0050.00

% b

assi

n ve

rsan

t

Somme

% Odet

% Steir

% Jet

Normale

Figure 6 : Evolution annuelle des débits de l’Odet et pourcentage respectif par sous-bassins

versants (source : DREAL Bretagne).

0

5

10

15

20

25

30

Janvie

r

Fevr ier

MarsAvri

lMai

Juin

Juille

tAoût

Septembre

Oc tobr e

Nov em bre

Décembre

Déb

it (m

3/s)

0.005.0010.0015.0020.0025.0030.0035.0040.0045.0050.00

% b

assi

n ve

rsan

t

Somme

% Odet

% Steir

% Jet

Figure 7 : Evolution mensuelle des débits de l’Odet et pourcentage respectif par sous-

bassins versants (source : DREAL Bretagne).

Les caractéristiques hydrologiques (annexe 2) laissent apparaître un module spécifique

(moyenne des débits moyens annuels rapportée à la surface des bassins versants drainés)

relativement comparable entre les sous bassins versants du Jet (20.9 l/s/km2), de l’Odet

(22.4 l/s/km2) et du Steir (20.5 l/s/km2). Les débits journaliers maximum s’élèvent

respectivement à 32.7 m3/s, 104 m3/s et à 76.2 m3/s, débits qui conjugués aux fortes

marées peuvent provoquer d’importantes inondations à l’instar de celles qui se sont

produites en décembre 2000. En terme d’étiage, les valeurs habituellement retenues sont

représentées par le QMNA (débit mensuel minimal d’une année calendaire) et le VCN3

(débit minimal sur 3 jours consécutifs). Des valeurs spécifiques sont également imposées

par la réglementation pour satisfaire en toute circonstance à la vie aquatique des rivières

(Débit Objectif Etiage et Débit Seuil d’Alerte).

Page 19: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 19

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

2.5 – Caractéristiques de l’occupation des sols

Carte 8 : Occupation du sol du bassin versant de l’Odet en 1990 (source : Corine Land

Cover).

L’analyse de l’occupation du sol en 1990 (carte 8) du bassin versant de l’Odet montre une

faible artificialisation du territoire (7.3%), artificialisation qui a peu progressée au cours des

16 années suivantes pour représenter 8% en 2006 (carte 9). A titre de comparaison, une

étude similaire réalisée sur la commune de Penmarc’h soulignait une artificialisation de

46.5% du territoire. Ce constat témoigne de la disparité des territoires ruraux et littoraux ce

qui est une tendance générale aux échelles locale, régionale et nationale. Par opposition, la

vocation rurale du bassin versant est très marquée et n’a que faiblement évolué au cours

des données recensées, passant de 83 % en 1990 à 82 % du territoire en 2006.

Les milieux naturels, quant à eux, qui occupent essentiellement les rives du réseau

hydrographique et de l’estuaire du bassin versant, ont vu leur superficie croître

légèrement, passant de 8.5 à 9% du territoire. Cette ceinture verte constitue une réelle

protection en limitant la présence de terres labourables à proximité de l’estuaire et

corrélativement, les risques de pollution qui y sont inhérents (lessivage et érosion des sols).

Page 20: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 20

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 9 : Occupation du sol du bassin versant de l’Odet en 2006 (source : Corine

Land Cover).

Au sein de l’utilisation du sol, les zones humides occupent une place essentielle

(Fustec et Lefeuvre 2000) en raison :

�des valeurs économiques qu’elles produisent au travers de l’aquaculture ou du

tourisme,….

�des valeurs sociales et culturelles qu’elles génèrent en lien avec les activités de

pêche et de chasse ou encore les activités de loisirs naturalistes.

�des fonctions biologiques qu’elles engendrent, qu’il s’agisse du réservoir de

biodiversité ou de son rôle dans le stockage du carbone.

� des fonctions de régulation quantitative et qualitative de la ressource en eau. En

effet, ces zones ont une fonction hydrologique importante, agissant en qualité

d’écrêteur de crue en période de pluviométrie importante et d’alimentation des

nappes souterraines en période d’étiage.

� des fonctions épuratrices qu’elles procurent en permettant par l’hydromorphie

de ces zones, la dénitrification des nitrates ou la rétention des matières en suspension

et par voie de conséquence de la flore bactérienne allochtone.

En France près de 67% des zones humides métropolitaines ont disparu depuis le

début du XXème

siècle dont la moitié entre 1960 et 1990 (MEDD 2009) due au

comblement, à l’urbanisation, à l’enrésinement ou encore au drainage pour accroître

la superficie des terres cultivables.

Page 21: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 21

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 10 : Evaluation des zones humides sur le bassin versant de l’Odet (source :

SIVALODET).

Sur le bassin versant de l’Odet, un état des lieux des zones humides a été entrepris pour

une connaissance exhaustive de ces espaces aux multiples fonctions mais fragiles (carte

10). Le bilan réalisé recense 5556 hectares soit 7,7% de la superficie totale du bassin

versant. Ces zones humides associées aux espaces boisés littoraux peuvent contribuer

activement à limiter l’impact de la contamination des eaux côtières.

2.6 – Caractéristiques du bocage

Le bocage, paysage agraire emblématique du massif armoricain était caractérisé par des

haies vives enserrant une mosaïque de milieux naturels, qu’il s’agisse de bois, de landes ou

de terres cultivées. Anciennement, ces haies du bocage faisaient partie intégrante de

l’exploitation agricole, créant, au travers des espèces implantées (châtaigniers, chênes,

robiniers,…) et des structures de taille (cépées, ragosses,…), des paysages spécifiques à

chaque terroir (Préfecture de la Région Bretagne et Conseil Régional de Bretagne, 1997).

Ces haies représentaient alors un potentiel important dans la gestion courante de

l’exploitation, servant tour à tour de gisement énergétique, de piquets de clôture, à la

construction de hangar ou encore de charrette.

Après la seconde guerre mondiale, la nécessité de nourrir la population va entraîner un

développement important du machinisme agricole qui, très rapidement, s’est heurté à

l’étroitesse des parcelles agricoles liée à la multitude des petites structures existantes. Les

haies sont très tôt apparues comme un obstacle à la modernisation de l’économie agricole

et des campagnes d’arrachage et de destruction de talus, encouragées par le pouvoir

politique de l’époque, ont largement contribué à façonner les paysages actuels au cours de

vastes opérations de remembrement foncier.

Page 22: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 22

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Cette destruction importante des structures parcellaires, associée au drainage des zones

humides pour accroître les surfaces de terres cultivables, s’est accompagnée d’impacts

environnementaux insoupçonnés (inondations, pollutions, perte de biodiversité,…), les

multiples fonctions de ces barrières naturelles n’étant plus assurées. Au cours de ces 12

dernières années (1996-2008) ce sont près de 10% du linéaire bocager finistérien qui a

disparu alors que parallèlement des programmes de reconstitution voyaient le jour.

A l’échelle du bassin versant, la carte 11 fait apparaître un gradient de densité bocagère de

l’Armor (36 à 47 ml/ha) vers l’Argoat (59 à 72 ml/ha) ce qui laisse entrevoir une vocation

limitée de l’agriculture sur ces communes littorales. Cette densité bocagère du bassin

versant est proche du chiffre retenu pour la Bretagne (66 ml/ha) mais demeure inférieur à

celle du Finistère (88 ml/ha), département qui représente près du tiers du linéaire bocager

breton (DRAAF Bretagne 2010).

L’utilité de ces haies et talus, qui permettent de réduire les transferts de polluants d’origine

agricole, est aujourd’hui unanimement reconnue. Dans ce contexte, un nouveau

programme « Breizh bocage », initié dans le cadre du Projet de Développement Rural

Hexagonal (PDRH) a vu le jour. Outre son objectif de restauration de la qualité des eaux, il

vise également à développer une filière énergétique durable, à lutter contre l’érosion des

sols ou encore à préserver la biodiversité (http://www.bretagne.fr). En 2009, le SIMEOVAQ

dont les compétences ont été transférées à Quimper communauté s’est engagé, en qualité

de maître d’ouvrage dans ce programme de restauration du bocage, pour répondre à la

problématique de la matière organique sur le bassin versant du Steir.

Carte 11 : Densité cantonale du bocage sur le bassin versant de l’Odet (source :

DRAAF Bretagne).

Page 23: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 23

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

2.6 – Caractéristiques hydrologiques et sédimentologiques

Le Finistère, sur le plan de l’hydrodynamisme côtier, fait apparaître une dualité entre

la côte Nord soumise à un hydrodynamisme important comparé à la côte Sud aux

courants de marée plus faibles et à une stratification saisonnière de la masse d’eau

(carte 12). C’est dans ce contexte général que s’inscrit l’estuaire de l’Odet, localisé

dans la partie occidentale de la côte Sud du Département.

Carte 12 : Vitesses maximales des courants de marée sur les côtes bretonnes

(source : Ifremer).

L’étude relative à l’écosystème benthique de l’estuaire de l’Odet réalisée par Le Guellec et

Glémarec en 1992 met en évidence deux grands ensembles sédimentaires (carte 13) :

* Les vases que l’on retrouve majoritairement dans les anses situées sur les 2 rives

et en amont de l’estuaire, au niveau de la baie de Kerogan, large espace propice à la

sédimentation des apports en provenance du bassin versant et au «garde manger » pour la

faune avicole.

* Les sables grossiers occupent l’ensemble de l’estuaire médian et aval. Sur les vire-

courts, l’accélération du courant lié au rétrécissement de l’estuaire, donne une

configuration spécifique, essentiellement formée de graviers et de cailloutis, à l’instar de

l’entrée de la ria.

Page 24: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 24

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

* La partie côtière de l’estuaire est, quant à elle, composée essentiellement de

sables fins coquilliers.

Carte 13 : carte sédimentaire de l’estuaire de l’Odet (source : Le Guellec Glémarec 1992).

En 2001, une étude spécifique du site du Pérennou, où se situe le gisement d’huîtres plates,

a permis de caractériser plus finement les sédiments s’étalant des vire-courts à l’amont du

pont de Bénodet (In Vivo 2002). Les investigations menées (carte 14) montrent :

* des vire-courts à l’anse de Kerautret des fonds composés de matériaux grossiers

(roches, cailloutis). Les zones de cailloutis sont largement associées à la présence d’huîtres

plates,

* de Kerautret à la pointe de Lanhuron sur la rive gauche les fonds présentent un

faciès plus hétérogène, alternant roches, sables vaseux et cailloutis. Plus au sud, les fonds

sont composés de matériaux plus fins, sableux ou sablo-vaseux,

Page 25: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 25

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

* de Lanhuron à l’anse de Kerandraon, les sédiments sont représentés

essentiellement par des sables coquilliers.

Carte 1 4 : Carte sédimentaire du banc du Pérennou (source : In Vivo).

2.7 – Caractéristiques de l’environnement naturel et gestion patrimoniale

2.7.1 – Les ZNIEFF

Par la diversité de son territoire, le Finistère offre une palette de milieux naturels,

littoraux et ruraux, qui constitue un atout pour son dynamisme touristique mais aussi

un enjeu pour la préservation de sa biodiversité. Si les premiers textes réglementaires

en France étaient motivés par la protection des sites et des gibiers, depuis une

trentaine d’années, on assiste à l’élaboration d’une législation spécifique dont l’objet

est la préservation des espèces animales et végétales et bien évidemment des milieux

(habitats) qui les abritent, leur procurant des conditions environnementales

Page 26: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 26

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

indispensables à leur survie (Préfecture de la Région Bretagne et Conseil Régional de

Bretagne 1997).

La prise de conscience du caractère patrimonial des espèces et des habitats naturels a

conduit les autorités à élaborer des outils de connaissances de ce patrimoine et à

édicter de multiples réglementations pour assurer leur conservation que ce soit à

l’échelle mondiale (réserve de biosphère), européenne (NATURA 2000) ou nationale

(site classé, arrêté de biotope).

L’estuaire de l’Odet bénéficie d’une exceptionnelle richesse naturelle (carte 15) et un

inventaire national des zones naturelles d’intérêts écologique, faunistique et

floristique (ZNIEFF) , outil de connaissance du patrimoine naturel, a été réalisé sur le

territoire. Initié en 1982 par le ministère de l’environnement, l’objectif de cet

inventaire est de recenser les espaces naturels qui représentent des écosystèmes

riches et peu modifiés par l’homme.

Carte 15 : Espaces naturels du territoire du SAGE de l’Odet (source : SIVALODET).

L’inventaire distingue deux types de zone :

* Les ZNIEFF de type I, d’une superficie généralement limitée, caractérisées par leur

intérêt biologique remarquable.

* Les ZNIEFF de type II, grands ensembles naturels riches et peu modifiés ou offrant

des potentialités biologiques remarquables.

Le territoire du SAGE comprend 12 ZNIEFF de type I (carte 13), couvrant une surface

totale de 1718 hectares dont 1213 sont compris dans le périmètre du SAGE.

Le territoire recense également 2 ZNIEFF de type II, la partie relative à l’estuaire de

l’Odet (2645 ha) ainsi que la vallée de l’Aulne au Nord du territoire (3349 ha).

Page 27: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 27

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

2.7.2 – Le Réseau NATURA 2000

Le réseau NATURA 2000 est un réseau écologique européen (1753 sites en France)

identifie les sites naturels, terrestres ou marins, en raison de leur rareté ou de la

fragilité des espèces sauvages, animales ou végétales et de leur habitat. Si l’objectif

recherché vise à préserver la biodiversité, ce réseau concilie néanmoins nature,

préoccupations socio-économiques et particularités régionales et locales des Etats

membres. Le fondement de ce réseau repose sur deux directives européennes, la

directive dite « Oiseaux (Directive n°79/409/CEE du 6 avril 1979) qui créé les Zones de

Protection Spéciale (ZPS) et la directive « Habitat » (directive n°92/43/CEE du 21 mai

1992) qui impose les Zones Spéciales de Conservation (ZSC).

Le territoire de l’Odet comprend 1 ZPS, le site des rivières de Pont l’Abbé et de l’Odet

d’une superficie totale de 709 hectares. La mise en place d’une gestion durable repose

sur une politique contractuelle menée avec les partenaires locaux et s’appuie sur un

document d’objectifs (DOCOB) validé par un comité de pilotage.

2.7.3 – Les protections foncières

a - Le Conservatoire de l’Espace Littoral et des Rivages Lacustres

La protection foncière représente un outil de conservation des espaces et des espèces.

Ainsi le Conservatoire de l’Espace Littoral et des Rivages Lacustres dont la mission

consiste à transmettre, aux générations futures des espaces préservés, peut acquérir à

l’amiable, par préemption ou par expropriation, des terrains qu’il juge de nature

fortement patrimoniale. La gestion de ces terrains est confiée par voie de convention à

des collectivités territoriales ou à des associations de protection de l’environnement.

Les acquisitions foncières de cet établissement public sur la ria de l’Odet intéresse 2

sites, le bois de Roscouré (350 ha) sur la commune de Combrit et Beg ar Vir à Clohars

Fouesnant (5 ha).

b - Le Conseil Général du Finistère

La notion d’espace naturel sensible apparaît dans le code de l’urbanisme qui dispose

que « pour préserver la qualité des sites, des paysages et des milieux naturels, le

Département est compétent pour élaborer et mettre en œuvre une politique de

protection, de gestion et d’ouverture au public des espaces naturels sensibles, boisés

ou non ». La loi du 18 juillet 1985 permet aux Conseils Généraux d’instituer une Taxe

Départementale des Espaces Naturels Sensibles (TDENS) et de disposer ainsi de

moyens financiers pour l’acquisition, l’aménagement et la gestion de ces espaces

fragiles. Sur le secteur étudié, le Département du Finistère a fait l’acquisition de

terrains pour une superficie totale de près de 200 hectares.

2.7.3 – Les protections réglementaires

a – les sites classés et inscrits

Page 28: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 28

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

La législation applicable aux sites classés et inscrits relève de la loi du 2 mai 1930 qui

s’intéresse aux monuments naturels dont la conservation ou la préservation présente,

au point de vue artistique, historique, scientifique, légendaire ou pittoresque, un

intérêt général. L’objectif est de conserver les caractéristiques du site, l’esprit des lieux

en les préservant de toutes atteintes graves. Une commission départementale des

sites, perspectives et paysages participe par ses avis à la définition de la politique des

sites. Sur le bassin versant de l’Odet il existe 16 sites classés pour un total de 1462

hectares et 17 sites inscrits comptabilisant environ 760 hectares.

.

b – Les arrêtés de biotopes

Les arrêtés de protection de biotope sont des arrêtés préfectoraux régis par les articles

L411-1 et 2 du code de l’environnement et par la circulaire du 27 juillet 1990 pour

lesquels des mesures sont fixées pour conserver les biotopes nécessaires à

l’alimentation, la reproduction, le repos ou encore la survie d’espèces dites protégées.

L’autorité préfectorale a pris 4 arrêtés de protection de biotope sur l’emprise du SAGE

(carte 13) qui concernent d’une part la préservation des chauves-souris et de la

cochléaire des estuaires.

Tableau 2 : Arrêtés de biotope sur le territoire du SAGE de l’Odet

Nom Commune Création Espèces

Mine de Kerdévot Ergué Gabric 06/10/1998 Chauve-souris

Chemin du halage Quimper 18/08/2005 Cochléaire des

estuaires

Eglise Plogonnec 12/01/2001 Chauve-souris

Eglise St Gilles Elliant 21/06/2010 Chauve-souris

Cinq projets d’arrêté sont actuellement en cours, 3 concernent des tourbières sur la

commune de Quimper et deux autres intéressent l’estuaire, à savoir la baie de Kérogan et

l’anse de Combrit.

Page 29: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 29

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

2.5 – Données de la surveillance

2.5.1 - Qualité des eaux de baignade

Carte 16 : Résultats du suivi des eaux de baignade du bassin versant DE L’ODET

entre 2009 et 2012 (source : ARS 29).

Sur le territoire étudié, six points font l’objet d’une surveillance pérenne de la qualité

des eaux de baignade, réseau géré par l’Agence Régionale de Santé (ARS). La carte 16,

relative aux résultats acquis ces quatre dernières années montre une qualité sanitaire

satisfaisante des eaux de baignade situées à l’aval de l’estuaire en application de la

directive européenne 76/160/CEE. A partir de 2013 cette législation va être abrogée et

remplacée par la directice 2006/7/CE du 15 février 2006. Cette réglementation prévoit

notamment une nouvelle grille de classement des zones sur la base de 4 années de

surveillance, l’instauration d’un profil de baignade pour rechercher les causes

potentielles de contamination et une gestion préventive des risques sanitaires. Avec ce

durcissement de la législation, les simulations réalisées en 2009 par l’ARS du Finistère,

en application des nouvelles règles, confortaient le statut de « d’excellente qualité »

pour l’ensemble des plages de ce littoral cornouaillais.

2.5.2 - Qualité des eaux conchylicoles

2.5.2.1 – Généralités sur la contamination fécale des coquillages

a – Devenir des microorganismes dans l’environnement

Les microorganismes entériques (bactéries et virus), vivant dans l’intestin de l’homme

et des animaux à sang chaud, rejetés dans les eaux littorales, ne trouvent pas les

conditions optimales pour leur multiplication dans cet élément hydrique. Cependant,

soumis aux phénomènes de dilution et de sédimentation, ils vont pouvoir y survivre

Page 30: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 30

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

plus ou moins longtemps en fonction des paramètres physicochimiques (Température,

salinité,…), des facteurs environnementaux tels l’ensoleillement ou la nébulosité, la

présence de nutriments et d’osmoprotecteurs ou encore la compétitivité des flores

bactériennes, contribuant ainsi à la contamination des coquillages des gisements

naturels ou des concessions conchylicoles. La multiplicité des études relatives à la

physiologie bactérienne (Roszak and al. 1984, Mac Kay 1992, Pommepuy and al. 1992,

Gauthier and al. 1993, Trousselier and al. 1998) a permis de mettre en évidence,

qu’avant de mourir, certaines bactéries stressées dans cet environnement hostile,

pouvaient passer par un stade dit « viable non cultivable »(VNC), c'est-à-dire dans

l’incapacité de se multiplier sur les milieux de culture usuels, mais pouvaient, sous

certaines conditions, être susceptibles de retrouver leur pouvoir pathogène.

Parallèlement, de nombreux auteurs se sont intéressés à cette problématique de

survie bactérienne, soit en milieu naturel, soit en microcosme. Les résultats acquis

(annexe 9.2), parfois divergents, participent à une meilleure compréhension des

phénomènes et à une remise en cause du rôle autoépurateur illimité de l’eau de mer,

longtemps ancré dans les mentalités.

La plupart des mollusques bivalves sont des organismes benthiques, vivant soit fixés

sur un support (moule, huître) soit enfouis dans le sédiment (coque, palourde). Cette

spécificité fait de ces bivalves, des organismes planctonophages, assurant leurs

besoins physiologiques (nutrition, respiration) grâce aux échanges avec le milieu

hydrique. Pour y subvenir, ils filtrent des volumes d’eau importants, variables selon

des facteurs intrinsèques (espèce, taille, état physiologique,…) et environnementaux

(température, turbidité, temps d’émersion – His et Cantin 1995). Les particules

alimentaires sont véhiculées vers la bouche grâce au mouvement perpétuel des cils

vibratiles des branchies, créant ainsi un courant continu au sein de la cavité palléale.

Le mucus recouvrant les branchies retient les particules qui sont ensuite transportées

vers la bouche entourée de palpes labiaux. Ces derniers assurent le tri des particules,

les plus petites sont dirigées vers la bouche pour y être ingérées, les plus grosses sont

enrobées de mucus et éliminées sous forme de speudo-fécès. Les particules ingérées

transitent dans l’estomac ou elles subissent une digestion extracellulaire au niveau du

stylet cristallin (effet mécanique et actions enzymatiques). La digestion intracellulaire

se poursuit dans les tubules de la glande digestive par l’action d’enzymes lysosomales

(phosphatase, peptidase, glucosidase,…). Puis, dans l’intestin, la digestion

intracellulaire est encore présente avant l’élimination des déchets sous forme de

fécès. Au cours de ce processus, les microorganismes autochtones et allochtones au

milieu marin vont être retenus et entraînés dans l’appareil digestif. Ainsi, Al Jebouri et

Trollope 1981 estiment que l’accumulation des bactéries indicatrices dans les bivalves

s’effectue pour l’essentiel dans le tractus digestif (75 à 95%). Cette information est

confortée par les travaux de LEDO et al. 1983 pour Mytilus edulis et Kueh et Chan 1985

pour Crassostrea gigas. Minet et al. 1987, quant à eux, apportent une précision

complémentaire mettant en évidence l’intestin postérieur de la moule comme site

privilégié de l’accumulation bactérienne. Un tube digestif sensiblement plus long chez

les fouisseurs, replié sur lui-même, pourrait donc accumuler davantage de flore

microbienne anthropique, mais de surcroît, ralentir le relargage des bactéries au cours

de la décontamination. Cet aspect anatomique et physiologique des coquillages

fouisseurs, associé à un habitat sédimentaire, de 100 à 1000 fois plus contaminé que

l’eau environnante (Matson et al. 1978, Labelle et al.1980) peuvent justifier les

variations de contamination inter espèces observées sur un même site.

Cette accumulation bactérienne au sein du coquillage, variable selon les espèces, les

flores bactériennes, les sites ou encore les conditions environnementales a été

Page 31: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 31

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

rapportée dans de nombreux travaux réalisés in situ ou in vitro. Plusquellec 1983 met

en évidence un facteur de 13 pour les coliformes fécaux et de 254 pour les

streptocoques fécaux dans les moules. Cette faculté d’intégration de contaminants par

les bivalves, qu’il s’agisse de microorganismes ou de polluants chimiques a été mis à

profit pour la création de réseaux nationaux de surveillance des eaux littorales en

raison de l’augmentation de la sensibilité analytique d’une part et des moindres

variations temporelles qu’elle engendre d’autre part. Ainsi aux Etats-Unis l’évaluation

de la qualité chimique des eaux côtières s’effectue dans le cadre du « Mussel Watch »

(Golberg 1975). En France également, la création du REseau de surveillance

MIcrobiologique (REMI) des zones conchylicoles de production a fait appel aux

bivalves, véritables sentinelles de l’environnement littoral, comme indicateur

biologique de la qualité sanitaire du milieu marin.

2.5.2.2 – Qualité bactériologique

L’estuaire de l’Odet est subdivisé en trois zones conchylicoles, la zone amont classée

en salubrité D et les zones intermédiaires et aval, toutes deux classées en zone de

salubrité B pour les coquillages non fouisseurs (groupe 3) par arrêté préfectoral du

26/10/2004. Pour évaluer de manière pérenne la qualité de celles-ci, deux points de

prélèvement ont été identifiés au sein de REseau Microbiologique (REMI), Kérouzien

dans la partie médiane de l’estuaire et Combrit en aval (annexe 9.3). En complément

de cette surveillance, le SIVALODET a initié, dans le cadre de la Directive Cadre sur

l’Eau (DCE), au sein du Schéma d’Aménagement et de Gestion des Eaux (SAGE), un

programme d’actions renforcées de la qualité des eaux estuariennes. Pour ce faire, il a

complété la surveillance en y incluant trois points complémentaires en amont des

points du REseau Microbiologique (Cale neuve, Beg ar Polhoat et Rossulien). La figure

8 montre un gradient dégressif de la contamination de l’amont vers l’aval,

configuration habituelle des estuaires finistériens, induite par les apports en

provenance du bassin versant d’une part et par les phénomènes physico-chimiques au

niveau de l’estuaire (dilution, sédimentation, mortalité) d’autre part. L’analyse

statistique des données (test de Friedman) met en évidence une différence très

significative de la contamination entre l’amont et l’aval (p<0.00001), confirmant ainsi

le rôle des phénomènes physico-chimiques au sein de l’estuaire et l’absence d’apport

significatif au-delà du point « Beg ar Polhoat ».

4931449

48489528.10369

1

10

100

1000

10000

100000

1000000

CaleNeuve

Polhoat Rossulien Kerouzien Ste Marine

E.c

oli/1

00 g

Minimum

Maximum

Moyenne

Figure 8 : Variation de la contamination fécale des huîtres par point d’échantillonnage

(source : Ifremer)

Page 32: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 32

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Une analyse temporelle des données bactériologiques des huîtres sur les différents points

de surveillance de l’estuaire montre, d’une manière générale, un profil similaire, à savoir

une tendance à l’amélioration entre les années 2000 et 2006 puis une stagnation sur la

période de 2006 à 2010. Seul le point « Ste Marine », situé à l’embouchure laisse apparaître

une régularité des résultats sur la période considérée. Une analyse plus fine pourrait être

menée pour tenter d’en rechercher les causes. La réhabilitation de la STEP de Quimper a

contribué largement et rapidement à l’amélioration de la qualité bactériologique des eaux

estuariennes à partir de 2003. On peut penser que les actions de moindres ampleurs sur le

bassin versant conjugué à un échantillonnage aléatoire, plus ou moins pénalisant selon les

années, n’ont pas permis de gravir une marche supplémentaire en terme de qualité

sanitaire.

0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%

100%

2000

-200

2

2001

-200

3

2002

-200

4

2003

/200

5

2004

-200

6

2005

-200

7

2006

-200

8

2007

-200

9

2008

-201

0

Pou

rcen

tage

d'E

. co

li

>46000

≤46000

≥4600

≥230

Figure 9 : Profil de la contamination des huîtres au point « Cale Neuve » entre 2000 et 2010 (source : Ifremer)

0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%

100%

2000

-200

2

2001

-200

3

2002

-200

4

2003

-200

5

2004

-200

6

2005

-200

7

2006

-200

8

2007

-200

9

2008

-201

0

Pou

rcen

tage

d'E

. co

li

>46000

≤46000

≥4600

≥230

Figure 10 : Profil de la contamination des huîtres au point « Beg ar Polhoat » entre 2000 et 2010 (source : Ifremer).

Page 33: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 33

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%

100%

2000

-200

2

2001

-200

3

2002

-200

4

2003

-200

5

2004

-200

6

2005

-200

7

2006

-200

8

2007

-200

9

2008

-201

0P

ourc

enta

ge d

'E.

coli

>46000

≤46000

≥4600

≥230

Figure 11 : Profil de la contamination des huîtres au point « Rossulien » entre 2000 et 2010 (source : Ifremer).

0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%

100%

2000-200

2

2001-200

3

2002-2004

2003-200

5

2004-200

6

2005-2007

2006-2008

2007-2009

2008-2010

Pou

rcen

tage

d'E

. co

li

>46000

≤46000

≥4600

≥230

Figure 12 : Profil de la contamination des huîtres au point « Kerouzien » entre 2000 et 2010 (source : Ifremer).

0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%

100%

2000

-200

2

2001

-200

3

2002

-200

4

2003

/2005

2004

-200

6

2005

-200

7

2006

-200

8

2007

-200

9

2008

-201

0

Pou

rcen

tage

d'E

. co

li

>46000

≤46000

≥4600

≥230

Figure 13 : Profil de la contamination des huîtres au point « Combrit » entre 2000 et 2010 (source : Ifremer).

Page 34: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 34

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

0%10%20%30%40%50%60%70%80%90%

100%

2000

-200

2

2001

-200

3

2002

-200

4

2003

-200

5

2004

-200

6

2005

-200

7

2006

-200

8

2007

-200

9

2008

-201

0

Pou

rcen

tage

d'E

. co

li

>46000

≤46000

≥4600

≥230

Figure 14 : Profil de la contamination des huîtres au point « Sainte Marine » entre 2000 et 2010 (source : Ifremer).

L’analyse de tendance sur 10 ans au moyen du test non paramétrique de Mann-Kendall

(tableau 3) souligne une absence de tendance pour le point « Kerouzien » et par contre

une amélioration significative de la qualité des huîtres au point « Combrit ».

Tableau 3 : Analyse de tendances sur les points de suivi REMI (source : Ifremer)

Point Nom du point Support Tendance générale a (2002-2011)

Qualité microbiologique

b (2009-2011)

046-P-

002 Combrit (a)

� moyenne

046-P-

004 Kerouzien

� très mauvaise

� dégradation, � amélioration, � pas de tendance significative (seuil 5%).

Une analyse statistique des données par saison (figure 15) au moyen du test statistique non

paramétrique de Friedman montre une différence statistique significative des résultats

(p<0.046). Concrètement, ce constat signifie que la période hivernale se révèle moins

contaminée que les autres saisons.

Page 35: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 35

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

113771263412143

2787

1

10

100

1000

10000

100000

1000000

Automne Hiver Printemps Ete

E.

coli/

100

g

Minimum

Maximum

Moyenne

Figure 15 : Variation saisonnière de la contamination fécale des huîtres au point

d’échantillonnage « Cale neuve » (source : Ifremer)

Les salmonelles peuvent être à l’origine de toxi-infections alimentaires liées à la

consommation de fruits de la mer contaminés par des effluents urbains ou d’origine

agricole. La recherche de ces bactéries pathogènes dans les coquillages révèle donc un

intérêt sanitaire évident. La fréquence d’isolement des salmonelles dans les huîtres

échantillonnés (nombre de résultats positifs sur le nombre total de recherche) sur l’estuaire

de l’Odet s’élève en moyenne à 8.35%. Ce chiffre masque cependant des disparités

importantes tant dans l’espace que dans le temps. Ainsi, comme le souligne les figures 16

et 17, les coquillages situés à l’amont de l’estuaire sont significativement plus souillés que

ceux prélevés plus en aval. Par ailleurs, ces figures apportent concrètement la preuve d’une

réelle régression de la présence des salmonelles depuis 2005, phénomène qui est à mettre

à l’actif de la réhabilitation de la station d’épuration de l’agglomération quimpéroise.

0

10

20

30

40

50

60

70

Cale Neuve Polhoat Rossulien Kerouzien

Nom

bre

presence

nombre

22.4% 21.3%

10%4.9%

Figure 16 : Présence de salmonelles dans les huîtres l’Odet (partie amont) entre 2000 et

2004 (source : Ifremer).

Page 36: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 36

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

0

10

20

30

40

50

60

70

Cale Neuve Polhoat Rossulien Kerouzien

Nom

bre

presence

nombre

3.6% 3.4%

Figure 17 : Présence de salmonelles dans les huîtres l’Odet (partie amont) entre 2005 et

2009 (source : Ifremer).

05

101520253035404550

<1000 1000-10000 >10000

Classes d'E. coli

% d

e sa

lmon

elle

2.4

13.1

42.9

Figure 18 : Relation entre la présence de salmonelles et l’importance de la flore

colimétrique (source : Ifremer).

La validité des Escherichia coli en tant qu’indicateur de la présence de germes

pathogènes et notamment des salmonelles a fait l’objet de contreverse au sein de la

communauté scientifique. La répartition de l’incidence des salmonelles par classe de

contamination fécale (figure 18) souligne ici des fréquences croissantes d’isolement

dans les huîtres. Ce constat est validé par le test du Khi-Deux (p<0.001), liaison qui

corrobore de précédents travaux réalisés en Finistère (Monfort et al. 1997).

2.5.2.1 – Qualité chimique

Les résultats relatifs aux concentrations des éléments métalliques (Pb, Cd, Hg) dans les

huîtres montrent, dans leur ensemble, des teneurs inférieures aux seuils

réglementaires retenus (figures 19, 20, 21). Cependant, pour le cadmium, les

échantillons de mai 2002 laissent apparaître un dépassement de la norme sur

l’ensemble des échantillons de l’estuaire. En raison des teneurs habituellement

Page 37: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 37

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

observées avant et après cette date, on peut raisonnablement penser que ces valeurs,

anormalement élevées, relèvent davantage d’un problème analytique que d’une réelle

élévation des concentrations dans les coquillages.

Pour le plomb, depuis 10 ans les résultats soulignent leur stabilité, à l’exception du

point Rossulien qui en juin 2011 fait état de 0.98 mg/kg soit près de 10 fois plus que

les valeurs habituelles, donnée qui paraît difficilement explicable.

Le cadmium et le mercure, quant à eux, s’inscrivent depuis 10 ans dans une tendance

à l’amélioration de la qualité chimique des eaux conchylicole de cet estuaire. Le

résultat observé à Ste Marine en août 2012 (0.09 mg/kg) revêt un caractère tout à fait

exceptionnel qui n’a pas été confirmé au résultat suivant. (0.008 mg/kg).

0

0.2

0.4

0.6

0.8

1

1.2

17/09

/1998

15/06

/1999

14/05

/2002

05/11

/2002

14/02

/2006

09/08

/2006

20/02

/2007

29/08

/2007

12/02

/2008

05/08

/2008

25/02

/2009

20/08

/2009

16/02

/2010

11/08

/2010

21/02

/2011

02/08

/2011

0902

/2012

02/08

/2012

mg/

kg d

e po

ids

hum

ide

Cale neuve

Polhoat

Rossulien

Kerousien

Ste Marine

Norme Plomb : 1.5 mg/kg

Figure 19 : Evolution des teneurs en Plomb dans les huîtres de l’Odet entre 1998 et 2012

(source : Ifremer).

0

0.5

1

1.5

2

2.5

17/0

9/19

98

15/0

6/19

99

14/0

5/20

02

05/1

1/20

02

14/0

2/20

06

09/0

8/20

06

20/0

2/20

07

29/0

8/20

07

12/0

2/20

08

05/0

8/20

08

25/0

2/20

09

20/0

8/20

09

16/0

2/20

10

11/0

8/20

10

21/0

2/20

11

02/0

8/20

11

0902

/201

2

02/0

8/20

12

mg/

kg d

e po

ids

hum

ide

Cale neuve

Polhoat

Rossulien

Kerousien

Ste Marine

Norme Cadmium : 1 mg/kg

Figure 20 : Evolution des teneurs en Cadmium dans les huîtres de l’Odet entre 1998 et 2012

(source : Ifremer).

Page 38: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 38

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

00.010.020.030.040.050.060.070.080.090.1

17/09

/199

8

28/09

/199

9

05/11

/200

2

17/05

/200

6

20/02

/200

7

27/11

/200

7

05/08

/200

8

25/05

/200

9

16/02

/201

0

09/11

/201

0

02/08

/201

1

09/05

/201

2

mg/

kg d

e po

ids

hum

ide

Cale neuve

Polhoat

Rossulien

Kerousien

Ste Marine

Norme Mercure : 0.5 mg/kg

Figure 21 : Evolution des teneurs en Mercure dans les huîtres de l’Odet entre 1998 et 2012

2.5.3 - Qualité des eaux estuariennes

L’estuaire est une zone d’affrontement entre les eaux douces et marines (figure 22) où

le mélange n’est pas instantané. Dans le cas d’une stratification importante des

masses d’eau, une discontinuité entre celles-ci apparaît. C’est à cet endroit qu’une

zone de forte turbidité (bouchon vaseux) se produit sous les effets combinés des

processus de décantation des eaux fluviales et des processus de floculation-

défloculation dans le gradient de densité (Le Bec et al. 2002).

Figure 22 : Schématisation de la formation d’un bouchon vaseux (source : Ifremer)

La salinité représente un bon marqueur du mélange entre eau douce et eau marine.

De fait, la concentration d’un élément conservatif sera proportionnelle à ce paramètre

le long de l’estuaire. Tout écart d’un élément par rapport à cette droite de dilution

traduira, soit un apport ou une désorption, soit une consommation ou une adsorption

de cet élément (figure 23).

Page 39: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 39

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Figure 23 : Schéma du comportement d’un polluant selon le gradient

de salinité

L’application de cette approche aux données des eaux de l’Odet, acquises par la DDTM

29 dans le cadre du réseau patrimonial des Estuaires bretons, montre une

augmentation de la flore bactérienne allochtone en amont de l’estuaire, liée aux

apports bactériens générés par la station d’épuration de l’agglomération quimpéroise

puis sa diminution progressive jusqu’à l’embouchure, due à l’effet prépondérant de la

dilution, de la sédimentation et du phénomène de mortalité de cette flore entérique

dans un environnement hostile (figure 24). Ce constat ne révèle pas de

recontamination significative des eaux en aval de la STEP, corroborant ainsi

l’observation formulée pour les huîtres.

1

10

100

1000

10000

0 5 10 15 20 25 30 35 40

Salinité (g/l)

Nbr

e m

oyen

d'E

.col

i/100

ml E.coli

Figure 24 : Profil de contamination bactériologique des eaux estuariennes (source :

DDTM 29).

Page 40: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 40

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

2.6 – Caractéristiques de la zone de production

Le travail de recensement des gisements de mollusques comestibles des côtes de

France par Guérin-Ganivet en 1908 nous apporte de précieuses informations sur

l’activité conchylicole à cette époque. Il mentionne notamment la présence d’anciens

gisements naturels dans l’Odet qui avaient disparus à la date de son recensement. Il

indique également la présence de 2 parcs d’élevage d’huîtres indigènes dans l’anse de

Kergros et note par ailleurs l’abondance de palourdes sur la rive gauche de l’estuaire

dans sa partie aval (carte 17).

Carte 17 : Recensement des gisements coquilliers de l’Odet par Guérin-Ganivet en

1908.

Après la seconde guerre mondiale, le banc du Pérennou, classé en zone insalubre,

retrouve un développement significatif permettant son exploitation annuelle quelques

heures par jour pendant 3 jours. Les coquillages prélevés, évalués entre 40 et 50

tonnes annuellement, sont obligatoirement vendus à un professionnel de la

conchyliculture qui s’engage à assurer leur purification avant toute commercialisation

pour prévenir tout risque sanitaire. Exploité jusqu’au milieu des années 70, ce

gisement naturel a considérablement régressé en raison de l’apparition de 2 parasites,

Marteillia refringens et Bonamia ostreae, qui touchaient préférentiellement les huître

plates adultes. Emblématique de l’estuaire de l’Odet, la réhabilitation du banc du

Pérennou, voulue par les acteurs du Schéma d’Aménagement et de Gestion des Eaux

(SAGE) avait pour objectif d’affirmer la vocation conchylicole de ce territoire. A cette

fin, un nettoyage du site a été réalisé afin d’assurer une élimination des huîtres

Page 41: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Description générale de la zone – 41

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

adultes les plus infectées tout en améliorant les conditions de fixation des larves et de

développement des juvéniles.

Parallèlement, l’amélioration de la qualité sanitaire des eaux conchylicoles a par

ailleurs suscité des vocations et des demandes de création de concessions mytilicoles

et cerastocoles ont été sollicitées auprès des autorités administratives compétentes.

C’est dans ce contexte que s’inscrit ce rapport chargé d’évaluer la qualité

bactériologique des coques en vue de leur classement sanitaire. Sur cet estuaire, on

comptabilise aujourd’hui 4 conchyliculteurs qui exploitent 12 concessions pour une

superficie globale de 3,72 hectares (carte 18).

Carte 18 : Localisation des concessions et gisements sur l’estuaire de l’Odet

Page 42: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Contexte réglementaire – 42

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

3. Contexte réglementaire

3.1 – Généralités

La réglementation (figure 25) dans le domaine de l’eau a été marquée par deux conceptions

de la législation environnementale. Celle d’une approche sectorielle de « limitation des

rejets » visant à réduire les émissions de polluants dans le milieu aquatique et celle de

« milieux-usages », permettant les usages habituels de l’eau (baignade, alimentation en

eau, usage conchylicole), patrimoine naturel commun à tous qu’il convient de sauvegarder

voire de restaurer.

Malgré une multitude de textes réglementaires, les résultats de la qualité des eaux n’ont

pas été à la hauteur des objectifs escomptés en raison notamment des réelles difficultés à

faire prévaloir la protection de la ressource en eau dans les politiques industrielles et

agricoles.

Avec la mise en place de la Directive Cadre sur l’Eau (DCE), un tournant se fait jour dans la

politique de l’eau qui s’inscrit dans une optique de résultats (obtention d’un bon état

écologique des eaux à l’horizon 2015) et non plus seulement dans une politique de moyens,

pour satisfaire au développement durable de nos territoires.

Figure 25 : Evolution de la réglementation relative à l’eau

Page 43: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Contexte réglementaire – 43

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

3.2 – Réglementation des zones conchylicoles de production

Notre pays dispose depuis bien longtemps et notamment depuis un décret de 1939 d’un

arsenal juridique spécifique à l’exploitation des coquillages et à la salubrité de ceux-ci qui a

évolué au cours du temps. Aujourd’hui les textes réglementaires relèvent de la législation

européenne, règlements (CE) n° 854/2004 et (CE) n° 1666/2006, de l’arrêté du 21/05/1999

et du code rural articles R 231-35 à R 231-59, spécifiques aux produits de la mer et d’eau

douce.

Le classement des zones de production en différentes classes de salubrité (figures 26 et 27 )

est établi après une étude de zone. Cette dernière permet une évaluation des niveaux de la

contamination microbiologique (nombre d’E.coli/100g de Chair et de Liquide Intervalvaire-

CLI) et chimique (Plomb, Cadmium et Mercure en mg/kg de matière humide) et s’effectue :

� Par groupe de coquillages :

-groupe 1 : Les échinodermes (oursins) , les tuniciers (violets). Les

gastéropodes, initialement inclus dans ce groupe sont désormais exclus du

classement et de la surveillance microbiologique (règlement CE n° 558/2010).

-groupe 2 : les bivalves fouisseurs, c’est à dire les mollusques bivalves

filtreurs dont l’habitat permanent est constitué par les sédiments (coques,

palourdes…),

-groupe 3 : les bivalves non fouisseurs, c’est à dire les autres mollusques

bivalves filtreurs (moules, huîtres…).

� Sur la base du dénombrement des germes indicateurs de contamination fécale

(E.coli) pratiqué sur au moins 24 prélèvements, réalisés régulièrement sur une période

minimale d’un an et de la concentration en métaux tels que le plomb, le cadmium et le

mercure sur un prélèvement annuel au moins.

3.2.1 - Critères microbiologiques

Les critères microbiologiques sont basés sur le dénombrement dans 100 g de chair

et de liquide intervalvaire de coquillages, d’une bactérie fécale, présente dans l’intestin de

l’homme et des animaux à sang chaud (entérobactérie), Escherichia coli.

Page 44: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Contexte réglementaire – 44

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Figure 26 : Critères bactériologiques de classement des zones conchylicoles

(Règlements 854/2004).

Ainsi, trois classes de salubrité sont définies réglementairement (figure 12) :

- Les zones salubres (A). Les coquillages qui proviennent de ces zones peuvent être

mis directement sur le marché car ils satisfont les critères sanitaires des coquillages

vivants destinés à la consommation humaine immédiate.

- Zones B. les coquillages provenant des zones B peuvent être récoltés, mais ne

peuvent être mis sur le marché pour la consommation humaine qu’après avoir subi

un traitement dans un centre de purification.

- Zones C. Les coquillages provenant des zones C peuvent être récoltés mais ne

peuvent être mis sur le marché qu’après un reparcage portant sur une longue

période (minimum 2 mois).

- Zones D définies par le code rural

Un guide européen des bonnes pratiques de surveillance microbiologique, élaboré par des

experts (CEFAS 2007), émet des recommandations permettant de répondre aux exigences

du règlement européen. Il introduit une approche novatrice de la surveillance puisqu’il

préconise un diagnostic approfondi des sources de contamination, une évaluation des flux

microbiens et une étude de l’impact potentiel de ces rejets polluants sur le statut de la zone

conchylicole.

Page 45: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Contexte réglementaire – 45

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

3.2.2 – Critères chimiques

Ces critères et leurs seuils (figure 13) concernent trois contaminants, le plomb, le cadmium

et le mercure (règlement CE 1881/2006 portant fixation et teneurs maximales pour certains

contaminants dans les denrées alimentaires).

Le classement d’une zone prend en considération tout à la fois les critères microbiologiques

et chimiques, la valeur la plus élevée décidant de sa salubrité ou de son insalubrité. Celui-

ci est officialisé par un arrêté préfectoral après proposition du directeur

départemental des affaires maritimes (pour exemple, l’arrêté préfectoral du Finistère N°

2004-1377 du 26/10/2004) et ne peut excéder 10 ans.

Figure 27 : Critères chimiques de classement des zones conchylicoles (Règlement CE n°

1881/2006).

Page 46: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Etude de zone – 46

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

4. Etude de zone

4.1 – Echantillonnage

Sur les concessions à vocation cerastocole de la zone aval de l’Odet (carte 19), deux

points d’échantillonnage ont été identifiés pour évaluer la qualité sanitaire des

coquillages du groupe 2, un à l’amont du pont de Bénodet sur la rive gauche (Pors

Guen) et l’autre à l’aval du pont sur la rive droite (Pors Kériel).

Les coques (Cerastoderma edule), prélevées sur le parc par les professionnels, ont été

échantillonnées deux fois par mois jusqu’à l’obtention de 26 résultats minimum par

points requis par la réglementation pour l’analyse des données (novembre 2009 à

février 2011).

Ces échantillons, conservés en glacière, sont ensuite acheminés immédiatement par

l’Ifremer au laboratoire de l’IDHESA à Quimper, agréé par le Ministère de l’Agriculture

et accrédité COFRAC (COmité FRançais d’ACcréditation) pour le dénombrement des

Escherichia coli, par la méthode de référence XP ISO/TS 16 649-3.

Carte 19 : Localisation des stations de prélèvement de coques dans la zone aval de l’Odet

4.2 – Méthode de dénombrement des E.coli dans les coquillages

La méthode de dénombrement des Escherichia coli dans les coquillages (Annexe 9.4) fait

référence à la technique du nombre le plus probable (NPP) en 3 fois 5 tubes, méthode

normalisée par l’Association Française de NORmalisation (AFNOR) sous la référence NF XP

ISO/TS 16 649-3.

Page 47: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Etude de zone – 47

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

4.3 – Qualité bactériologique de la zone

Figure 28 : Résultats du dénombrement des E. coli dans les coques de Pors Guen

57.1

10.7 32.2

230 4600 46000

Figure 29 : Répartition des résultats bactériologiques des coques de Pors Guen par classe de

contamination fécale

Page 48: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Etude de zone – 48

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Figure 30 : Résultats du dénombrement des E. coli dans les coques de Pors Keriel

43%

10.7%46.4%

230 4600 46000

Figure 31 : Répartition des résultats bactériologiques des coques de Pors Keriel par classe

de contamination fécale

Tableau 4 : Qualité microbiologique des points de suivi de l’étude de zone

Points de surveillance Réglements 854/2004 & 1666/2006

Pors Gwen B

Pors Keriel B

Page 49: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Etude de zone – 49

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

L’estimation de la qualité microbiologique a été réalisé sur l’ensemble des résultats obtenus

(annexe 9.5) pour chacun des points de suivi, « Pors Gwen » (fig. 28 et 29) et « Pors Keriel »

(fig. 30 et 31). En prenant en compte tous les résultats, il apparaît que cette qualité

sanitaire des coques correspond à un niveau de salubrité C selon le règlement CE

854/2004, induit par 10.7% résultats compris entre 4600 et 46000 E. coli/100g CLI. Comme

le soulignent les figures 28 et 30, 3 données pour chacun des points sont supérieures au

seuil de 4600 E. coli/100g. On remarque toutefois, en rapportant ces résultats aux données

pluviométriques, qu’en date du 2/03/2010 a eu lieu un évènement pluviométrique majeur

avec 33mm au cours des 72 heures précédant le prélèvement. En prenant en considération

cet évènement climatique majeur et écartant ainsi les résultats du 2 mars 2010, on

comptabilise 4.7% de résultats supérieurs à 4600 E.coli ce qui aboutit à un classement en B

de la zone conchylicole pour les coquillages du groupe 2 (tableau 4).

4.4 – Qualité chimique des coquillages

Figure 32 : Evaluation de la qualité chimique des coques à « Pors Gwen ».

Les résultats des concentrations (annexe 9.6) en certains métaux lourds (plomb, cadmium,

mercure)

dans les coques prélevées février 2010 et janvier 2011 (figure 32) font apparaître des

teneurs nettement inférieures aux seuils réglementaires retenus. Ils induisent que ces

éléments traces métalliques (ETM) ne constituent pas un problème sanitaire majeur pour la

ria de l’Odet qui peut être classée en A pour ces paramètres (tableau 5). Par ailleurs, les

valeurs obtenues ici sont conformes à celles observées dans le cadre du réseau

d’observation des contaminants chimiques (ROCCH).

Page 50: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Etude de zone – 50

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Tableau 5 : Qualité chimique des points de surveillance « Pors Gwen » et « Pors Keriel ».

Points de surveillance Réglements 854/2004 & 1666/2006

Pors Gwenn A

Pors Keriel A

Les résultats des contaminants chimiques (Pb, Cd, Hg) sont conformes aux seuils sanitaires

réglementaires et sont en conséquence compatibles avec une qualité A de la zone

conchylicole (tableau 5).

En associant les critères microbiologiques et chimiques des coques échantillonnées sur la

zone aval de l’Odet, on conclut à un classement en B de ces coquillages fouisseurs.

Compte-tenu de l’homogénéïté du classement sur les 2 points de suivi, nous proposons

de retenir le point « Pors Kériel » comme référence des coquillages du groupe 2 dans le

cadre de la surveillance pérenne de cette zone en raison de sa facilité d’accès d’une part

et de la participation du concessionnaire à l’échantillonnage dans le respect du cahier des

prescriptions du REMI d’autre part .

Page 51: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 51

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

5. Identification des sources de contamination

Le traitement des données de ce volet concerne les chiffres communaux qui permettent

leur comparaison objective à des dates tout à fait comparables, 2009 pour la population et

2010 pour le recensement agricole et fait appel à la notion d’équivalent habitant (annexe

9.7). Ces informations sont complétées par des données plus récentes pour apprécier

l’évolution du territoire et en fournir une approche dynamique, indispensable pour une

perception pertinente des risques potentiels de contamination.

5.1 – La population

Carte 20 : Densité de population communale en 2009 sur le bassin versant de l’Odet

Avec 115,8 habitants/km2

en 2009 (carte 20), les 32 communes du bassin versant de l’Odet

retenues pour l’étude offrent une densité de population inférieure à celle du Département

(132,8) ainsi qu’à celle de la Région Bretagne (116,7). Une analyse des données montre une

disparité spatiale de ce bassin versant, plus densément peuplé au Sud (>100) qu’au Nord

(20-60), soulignant ainsi une dualité marquée entre les communes littorales et rurales. Par

ailleurs, Quimper préfecture du département, se démarque de cette moyenne statistique

avec 750,6 hab/km2. Pour une meilleure compréhension du territoire, cet instantané se doit

d’être complété par une vision plus dynamique, intégrant les évolutions démographiques.

Ainsi, sur la période 1999-2009), la carte 20 montre une stagnation voire une faible

progression pour les communes du nord-est du bassin versant, Plonéour-Lanvern, Plomelin

et Quimper. Les communes périphériques de Quimper ont vu, quant à elles, leur population

augmenter plus significativement. Ce constat peut trouver une explication sur les

communes rurales environnantes par un coût moindre du prix du foncier qui attire les

Page 52: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 52

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

jeunes couples aux revenus plus modestes et désireux d’investir dans l’immobilier.

L’accroissement sur les communes littorales est par contre à mettre à l’actif d’un solde

migratoire positif d’une population plus aisée, à la recherche d’un cadre de vie « haut de

gamme » pour leur retraite. Ces propos sont confortés par l’évolution du nombre des

résidences principales d’une part et secondaires d’autre part entre 1999 et 2009 sur ces

communes respectives (carte 21). En effet, celle-ci laisse clairement percevoir un

accroissement important des résidences secondaires sur les communes littorales (Bénodet,

Combrit). A contrario, le développement de résidences principales est particulièrement

prospère sur les communes rurales (Plogonnec, Elliant, Plonéis).

Carte 21 : Population communale en 2009 et taux annuel moyen d’évolution entre

1999 et 2009.

5.2 – Le tourisme

Le Finistère accueille annuellement près de 3 millions de visiteurs et cet afflux touristique

génère environ 31 millions de nuitées. Cette activité occupe donc une place essentielle

dans l’économie départementale avec l’agriculture et l’industrie agro-alimentaire. La zone

côtière fournit à elle seule 85% de l’offre d’hébergement ce qui traduit un tropisme

accentué pour cet espace littoral très convoité. Les résidences secondaires constituent une

composante importante de l’immobilier en Bretagne et avec en moyenne 11,3 résidences

secondaires/km2 en 2009, les communes du bassin versant de l’Odet bénéficient d’une

densité supérieure à la valeur départementale (9,9), régionale (8.5) et à fortiori nationale

(5.7). Cette valeur moyenne ne doit cependant pas masquer les disparités spatiales

existantes entre les communes rurales (<5) et littorales (45,1- 218,5).

La décennie 1990-1999 a été marquée par une dépression de la construction immobilière,

tant dans les communes littorales (Bénodet 10.3% - Combrit 7,5%) que rurales (Elliant

8.05% - Plogonnec 4,8%), phénomène structurel à l’échelle du territoire national. A

Page 53: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 53

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

contrario, la période 1999-2009 est marquée par un boom immobilier généralisé (Bénodet

38,4% - Combrit 20,3% - Elliant 13,6% - Plogonnec 15,3%). Par ailleurs, le taux de résidence

secondaire élevé sur les communes littorales (carte 22), lié au prix du foncier ne contribue

nullement à une mixité sociale et générationnelle de la population.

Carte 22 : Taux de résidences secondaires des communes du bassin versant de l’Odet

Carte 23: Nombre de lits touristiques et taux de fonction touristique des communes du

bassin versant de l’Odet.

Page 54: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 54

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

A l’échelle du bassin versant, on recense 26 structures (camping, centre de vacances) à

vocation touristique qui peuvent accueillir une population estivale estimée à 12434

personnes. Les activités de loisirs, outre la baignade et la randonnée, sont représentées

par les activités nautiques mais aussi la pêche à pied récréative très prisée des vacanciers.

Les capacités d’hébergement touristique sur les communes du bassin versant s’élevaient en

2009 à 52227 lits (carte 23), soit un taux de fonction touristique (rapport du nombre de lits

touristiques à la population résidente) pour le territoire étudié de 58,9%, légèrement

supérieur à celui du Département (52.7%). Ce taux moyen ne peut s’affranchir des données

communales qui présentent une variabilité marquée, s’étageant de 5,6% pour Ergué

Gabéric à 631% pour Bénodet, chiffre qui rappelle le tropisme des estivants vis à vis des

communes littorales. Ce dernier chiffre se situe parmi ceux les plus élevés des communes

les plus attractives du Finistère en matière d’offre touristique (Ile tudy : 1038% - Saint Nic

668% - Bénodet 631% - Brignogan 449% - Névez 434%, Fouesnant 279%, …).

5.3 – L’assainissement

L’assainissement des collectivités territoriales se dissocie entre assainissement

collectif et non collectif dans des proportions très variables. Sur le territoire du bassin

versant de l’Odet, on estime à 68% la population raccordée à un assainissement

collectif et 32% celle raccordée à un assainissement non collectif.

Carte 24 : Localisation et type de station d’épuration urbaine sur le bassin versant de l’Odet

Le territoire étudié comptabilise 19 stations d’épuration des eaux usées urbaines (carte 24),

de taille variable, oscillant entre 250 EH pour Leuhan et 267000 EH pour Quimper mais

également de technologies très diffèrentes, utilisant soit le process des boues activées, du

Page 55: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 55

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

lagunage ou encore des filtres à roseaux (annexe 9.8). Ces informations laissent présager

bien évidemment une variabilité de l’impact bactériologique de ces équipements, plus ou

moins marqué également selon leur localisation par rapport à l’estuaire, espace littoral aux

multiples usages (baignade, activités nautiques, conchyliculture, pêche à pied).

A cet égard, il nous paraît pertinent de tenter d’évaluer l’impact de la station d’épuration

de Quimper par rapport aux apports bactériens en provenance du bassin versant. Cette

approche prendra en considération deux périodes de 5 ans (1998-2002 et 2008-2012)

pour tenir compte de l’évolution technologique de la station d’épuration intervenue en

2003.

Si l’évaluation de la concentration en bactéries fécales répond avant tout à

des contraintes d’ordre réglementaire, la mesure des flux bactériens permet, quant à elle,

d’apporter un éclairage spécifique sur la contamination bactériologique du bassin versant

et notamment, d’apprécier les apports respectifs des sous bassins versants dans la

contamination étudiée, plus à même de répondre à une logique de restauration de la

qualité des eaux. Les traitements ci-dessous méritent toutefois d’être considérés avec

prudence en raison des lacunes du plan d’échantillonnage (Décalage de l’échantillonnage

du BV et de la STEP – Concentration en bactéries en amont des stations de jaugeage ). Ils

ont pour seule ambition d’établir une première estimation des apports et s’inscrivent avant

tout dans une démarche prospective de réflexion sur l’évaluation de l’état des lieux.

La moyenne annuelle des flux bactériens journaliers instantanés oscillent entre 6.1 10 12

E.

coli/j en 1998 et 3.1 1013

E. coli/j en 2000, avec des apports plus soutenus au cours de la

période d’octobre à mars. L’appréciation de l’importance des flux respectifs des sous

bassins versants souligne la part prépondérante de l’Odet dans les apports d’origine fécale,

proportion accentuée lors du calcul des flux spécifiques qui intègrent la superficie des

bassins versants et permettent ainsi une comparaison sans biais (tableau 6). La figure 33 qui

montre la répartition annuelle des flux par sous bassin versant laisse apparaître un impact

prépondérant du steir au cours des années 1998 et 2000. Une fréquence de prélèvement

plus faible conjuguée à un décalage du jour du prélèvement peut expliquer ce constat. Une

évaluation plus rigoureuse des flux bactériens mesurés aux stations de jaugeage demeure

indispensable pour une perception plus objective de la réalité des apports respectifs à

l’estuaire. Cette absence d’analyses bactériologiques sur le sous bassin versant du Steir au

cours du contrat de rivière a été corrigée depuis mars 2003 et une fréquence mensuelle

d’échantillonnage adoptée.

Tableau 6 : importance respective des sous bassins versants dans la contamination

bactériologique entre 1998 et 2002 (%). Sous bv Flux E.coli/j (%) Flux E.coli/J/ha (%)

JET 16.5 22.1 ODET 47.6 51.9 STEIR 35.9 26.0

Page 56: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 56

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

0.0

10.0

20.0

30.0

40.0

50.0

60.0

70.0

%

1998 1999 2000 2001 2002

jet flux E.coli/jodet flux E.coli/jsteir flux E.coli/j

Figure 33: Comparaison des flux bactériens des sous-bassins versants du Jet, de l’Odet et du

Steir

1E+12

1E+13

1E+14

1E+15

oct-95 juil-98 avr-01 janv-04 oct-06 juil-09 avr-12 déc-14

Flu

x m

oyen

jour

nalie

r (E

.col

i/j)

flux moyen/jour

Figure 34 : Evolution mensuelle des flux moyens journaliers d’Escherichia coli rejeté par la

station d’épuration de Quimper entre 1998 et 2012 (Source : Quimper communauté)

Excepté de juin 1999 à août 2000, les valeurs des flux bactériens moyens journaliers

(figure 34) émis dans le milieu par la station d’épuration de Quimper ne marquent pas

d’évolution notable au cours des 5 premières années d’étude. Le niveau élevé des rejets

quotidiens en bactéries fécales (1014

E.coli/j) dans la partie amont de l’estuaire pourrait

expliquer l’absence de relation révélée par les tests statistiques entre la contamination

fécale des coquillages et le paramètre pluviométrie, hypothèse confortée par la

comparaison des apports du bassin versant et de la station d’épuration (figure 35). Par

ailleurs, l’estimation de l’abattement bactérien au cours du traitement fait apparaître des

rendements moyens annuels variant de 76 à 85 %. La construction d’une nouvelle unité de

267000 équivalents-habitant, opérationnelle au cours du dernier trimestre 2003, montre

Page 57: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 57

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

une amélioration significative de la qualité de l’effluent (figure 34) dont les flux bactériens

ont été réduits de 4 à 10 fois au cours des 2 périodes d’étude (figure 35).

1

10

100

1000

10000

100000

1000000

1 2 3 4 5

Années

Eq

uiv

ale

nt

Ha

bit

an

tEH période 9802

EH Période 0812

Figure 35 : Comparaison des flux émis par la station d’épuration de Quimper au cours de 2

périodes distinctes (1998-2002 et 2008-2012).

0

20000

40000

60000

80000

100000

120000

140000

160000

180000

1998 1999 2000 2001 2002

Eq

uiv

ale

nt

ha

bit

an

t

0.0

5.0

10.0

15.0

20.0

25.0

30.0

35.0

40.0

45.0

Ra

pp

ort

ST

EP

/BV

EH BV

EH STEP

Rapport STEP / BV

Figure 36: Estimation des flux bactériens journaliers moyens du bassin versant et de la

station d’épuration de Quimper entre 1998 et 2002 (source : Quimper Communauté,

Sivalodet)

Page 58: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 58

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

0

2000

4000

6000

8000

10000

12000

2008 2009 2010 2011 2012

Mo

ye

nn

e a

nn

ue

lle

EH

0.00

0.20

0.40

0.60

0.80

1.00

1.20

1.40

1.60

1.80

Rap

port

ST

EP

/BV

Moy EH BVMoy EH STEPRapport STEP/BV

Figure 37: Estimation des flux bactériens journaliers moyens du bassin versant et de la

station d’épuration de Quimper entre 2008 et 2012 (source : Quimper Communauté,

Sivalodet)

L’analyse comparative des flux bactériens émis par la station d’épuration de Quimper d’une

part et le bassin versant d’autre part montre une diminution significative de l’impact de la

STEP par rapport à celui du bassin versant (annexe 9.9) au cours de la période 2008-2012

(fig 36 et 37). Toutefois, pour une meilleure qualité de la donnée produite, quelques

mesures correctives doivent être apportées en matière d’échantillonnage. En effet, il serait

souhaitable d’une part, d’augmenter le nombre d’échantillons annuellement sur le bassin

versant pour une meilleure représentativité des résultats et d’autre part, de coordonner

les prélèvements (STEP et BV) aux mêmes dates pour minimiser les biais. En ce qui

concerne les sous-bassins versants, sur la période 2008-2012, celui du Steir apparaît le plus

contributif en terme de pollution bactériologique avec 56% des apports en moyenne

contre 26% pour l’Odet et 18% pour le Jet. Ces chiffres diffèrent par rapport à la période

précédente où l’Odet apparaissait comme le principal sous bassin versant pourvoyeur de

bactéries. Ici encore, un échantillonnage plus étoffé permettrait de mieux appréhender la

réalité territoriale en matière de contamination bactérienne, démarche indispensable pour

la pertinence des actions à mener pour la restauration de la qualité des eaux.

Parallèlement aux rejets de la station d’épuration elle-même, les postes de refoulement

peuvent également représenter un risque sanitaire potentiel, induit par des débordements

générés par divers dysfonctionnements. Sur les 6 communes bordant l’estuaire, on recense

79 postes inclus dans l’emprise du bassin versant. Au sein de Quimper Agglomération, le

gestionnaire de l’assainissement a effectué une étude de criticité de ces ouvrages (Yvenat

et al. 2006) et conclut à un risque sanitaire éventuel pour 4 d’entre eux sur la commune de

Plomelin (Meilh Kerdour, Kergulven, Lenn Kerbernès et Lenhest). Pour ces derniers, une

étude spécifique est en cours pour estimer le coût des travaux de réhabilitation. Par

ailleurs, tous les postes de refoulement muni d’un trop plein ont été équipés de détecteurs

de surverse.

Dans le cadre du renouvellement de l’autorisation de rejets de la STEP du Corniguel, une

modélisation des rejets a été réalisée pour évaluer l’incidence des effluents sur les usages

littoraux. La modélisation mathématique fait appel à la modélisation courantologique d’une

part, associée à celle de la dispersion des apports bactériens au sein de l’estuaire d’autre

Page 59: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 59

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

part. Différents scénarios peuvent ainsi être testés en faisant varier les paramètres pris en

compte (amplitude des marées, nombre et position des rejets, flux bactériens, durée de vie

des germes-T90) pour une meilleure compréhension du fonctionnement estuarien mais

aussi pour une vision prospective de l’efficacité des actions à entreprendre.

Les zones d’influence du rejet sont très différentes entre l’hiver et l’été. L’hiver, sous

l’action d’un flux de contamination bactériologique important en provenance du bassin

versant et de la STEP, les incidences sont significatives jusqu’à Kérouzien en vives eaux

(annexe 9.9) et jusqu’à Rossulien en mortes eaux.

En période estivale, les flux bactériens en provenance de la STEP sont proportionnellement

plus importants comparés à ceux du bassin versant. Leurs impacts en vives eaux ne

dépassent pas toutefois le point de surveillance Beg ar Polhoat et n’affecte donc pas la zone

conchylicole en aval (annexe 9.10).

Le Service Public d’Assainissement Non Collectif (SPANC) est régi par la loi sur l’eau du 3

janvier 1992 et les textes d’application qui sont d’une part l’arrêté du 6 mai 1996 portant

sur les prescriptions techniques applicables au système d’assainissement et d’autre part le

décret du 13 mars 2000 relatif aux redevances d’assainissement.

Sur le bassin versant de l’Odet, le contrôle des assainissements autonomes sont assurées

par différentes structures :

• 6 structures intercommunales à savoir les communautés de communes du Pays

Glazik, celle du haut Pays Bigouden, celle de Haute Cornouaille, celle du Pays de

Châteaulin et du Porzay, Quimper Communauté et Concarneau Cornouaille

Agglomération et le SEA de Clohars-Fouesnant.

• 3 communes : Bénodet, Combrit et Tréméoc.

Les données fournies par les différents Services Publics d’Assainissement Non Collectif

(SPANC) font état de dispositifs non accaptables variant de 1 à 35% (carte 25). Cette

dispersion des résultats résulte de la divergence d’interprétation de la notion de « dispositif

non acceptable » entre les différents intervenants.

On recense sur le bassin versant 18890 assainissements autonomes dont en moyenne 15%

soit 2833 équipements sont considérés comme « Non acceptable » au regard de la

réglementation.

Sur le bassin versant, l’épandage des boues des stations d’épuration, d’origine urbaine ou

industrielle, couvre une superficie de 1997 hectares soit 2,75% du territoire (carte 26).

Page 60: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 60

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 25 : Evaluation de la typologie des installations de l’assainissement non collectif sur le

bassin versant de l’Odet (source : SIVALODET)

Carte 26 : Surfaces potentiellement épandables pour les boues de stations d’épuration

urbaines et industrielles (Source : DDTM 29).

Page 61: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 61

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

5.4 – L’agriculture

Considérée comme l’une des régions les plus défavorisées au sortir de la guerre pour des

raisons inhérentes à la pression démographique importante, à la faiblesse des emplois

industriels et à son enclavement, la Bretagne a su se hisser à la première place des régions

agricoles et agroalimentaires en France au cours des trente glorieuses (1950 – 1980). Ce

défi a pu se réaliser grâce à la création d’une agriculture et d’une agro-industrie puissantes

et dynamiques, initiées par les mouvements syndicalistes et coopératifs qui ont su

mobiliser le monde paysan vers une démarche collective de progrès technique et

économique. Cet essor fulgurant de l’agriculture, véritable pétrole vert régional, a bénéficié

indéniablement d ‘un terreau favorable lié à un contexte de croissance économique, à une

volonté politique affirmée et à la mise en place du marché commun agricole à l’échelle

européenne. Pour répondre aux besoins de la population, les exploitants agricoles

intensifient leur mode de production par une spécialisation animale affirmée et la création

des élevages hors sol, une mécanisation galopante et une croissance spectaculaire des

rendements. Cette évolution d’une agriculture de subsistance vers une agriculture

productiviste ou agroculture , qualifiée de « modèle agricole breton » a permis le maintien

sur le territoire d’une population rurale importante par la création d’emplois d’actifs

agricoles et des emplois agro-industriels représentant une part importante des emplois

salariaux.

Carte 27 : Densité des exploitations agricoles en 2000 et évolution entre 1979 et 2010 sur le

bassin versant de l’Odet (source : RGA).

Les communes du bassin versant de l’Odet n’ont pas échappé au phénomène et cette

mutation du monde agricole s’est accompagnée au fil des ans de profonds changements au

sein des structures d’exploitation. C’est ainsi que sur le territoire étudié la densité des exploitations agricoles est passée de 4.3 en 1979 à 1.1 en 2010, éradiquant ainsi 3194

exploitations du paysage rural (carte 27). Cette densité moyenne de 1.1, sensiblement

Page 62: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 62

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

identique à la moyenne départementale (1.16) est légèrement supérieure à la moyenne

régionale (1,01) traduit une concentration des exploitations agricoles par rapport à

l’échelon régional, corroborées par les surfaces agricoles moyennes utilisées qui s’élèvent à

52,7 hectares (ha) sur le bassin versant contre 47,7 ha en Bretagne. La densité

d’exploitation moyenne ne doit cependant pas masquer des disparités communales entre

Bénodet et Combrit (0.7) d’une part à faible vocation agricole et Trégourez (2.0) d’autre

part, plus fortement impliquée dans ce secteur primaire. Dans le même temps, ces

évolutions se sont accompagnées par un changement du statut des exploitations agricoles,

initialement gérées par des exploitants individuels (83.6 % des exploitations finistériennes

en 1988). Ce mode de gestion a fait place aux formes sociétaires tels les Groupements

Agricoles d’Exploitation en Commun (GAEC) et surtout les Exploitations Agricoles à

Responsabilités Limitées (EARL) dont la proportion est passée de 0.35 % en 1988 à 23 % en

2010 sur le territoire finistérien.

Cette tendance à la concentration des exploitations devrait s’accélérer au cours des

prochaines années en raison des contraintes environnementales fortes qui pèsent sur la

profession, financièrement insurmontables pour les petites et moyennes exploitations dans

un contexte économique difficile des filières.

La surface agricole sur le bassin versant occupe 59 % du territoire, pourcentage supérieur

au Département (57,2%), et a fortiori à la région (48,2%). On enregistre cependant depuis

des années un recul de ces surfaces agricoles, plus accentué d’une manière générale sur les

communes littorales. La SAU sur les communes étudiées a ainsi régressé de 16,4% entre

1979 et 2000, abandonnant 12087 hectares de surface agricole. Cette diminution durable

de la superficie agricole trouve son explication dans l’emprise de plus en plus forte de

l’urbanisation à laquelle s’ajoute l’abandon des terres les moins productives des

exploitations. Cette évolution des surfaces s’est traduite par des modifications marquées

dans l’utilisation du sol, les prairies permanentes privilégiées traditionnellement faisant

place aux prairies temporaires et surtout au maïs qui ouvrait la voie à l’intensification des

productions animales de part ses qualités énergétiques, sa mécanisation et sa souplesse

d’utilisation (récolte, stockage, alimentation).

La production laitière occupe une place privilégiée au sein de l’agriculture locale et plus

généralement à l’échelle finistérienne puisque le département occupe la 4ème

place

nationale. Base de revenus de toute exploitation familiale au sortir de la guerre, la

production laitière du département a été multipliée par 4 entre 1950 et 1980, consécutive

non seulement à l’augmentation des troupeaux mais surtout en raison de l’accroissement

spectaculaire des rendements par animal induits par les efforts de recherche en génétique

et en alimentation animale. Cette augmentation de la production a conduit les instances

européennes à instaurer des quotas laitiers par exploitation en 1984 qui allaient faire

évoluer considérablement ce secteur d’activité. En effet, en raison des primes incitatives au

départ proposées par la communauté européenne et l’Etat français et la limitation du droit

à produire, le nombre d’exploitations laitières mais aussi de vaches laitières a subi une

érosion importante depuis ces vingt dernières années. La filière viande a connu également

au cours de cette période une diminution draconienne du cheptel en raison des prix peu

rémunérateurs pratiqués. Le nombre total de bovin est ainsi passé de 129234 têtes en 1979

à 55551 en 2010 sur le territoire étudié, soit une réduction des effectifs de 43%(Carte 28).

Page 63: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 63

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 28 : Nombre de bovins en 2010 et évolution entre 1979 et 2010 (source : RGA).

Carte 29 : Inventaire non exhaustif des points d’abreuvement des animaux aux ruisseaux

(source : Sivalodet).

Les bovins, soumis au pâturage, bénéficient le plus souvent pour des raisons de facilité de

gestion, d’un accès au ruisseau (carte 29). Ce faisant, ils contribuent non seulement à

l’érosion des berges et à l’augmentation des teneurs en phosphore dans les eaux (

Bertrand et al. 2005) mais également à leur contamination significative en bactéries

Page 64: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 64

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

d’origine fécale (annexe 9.11). Une étude de la chambre d’agriculture, complémentaire à

celle du programme européen Cycleau sur le bassin versant du Belon, a mis en relation la

contamination bactériologique des eaux et l’importance des prairies le long des cours

d’eau (M. Duvillard 2008). Fort de ces constats, le SAGE de l’Odet a initié une action en

faveur de la suppression de ces points d’abreuvage.

L’activité porcine représente le second pôle agricole du territoire à l’image du Finistère qui

génère environ 34 % de la production bretonne à partir d’élevage hors-sol. Cette

production contribue à favoriser l’emploi salarié sur les exploitations agricoles mais aussi

dans les secteurs agro-alimentaires amont et aval de la filière. Fondée sur le modèle libéral

où les organisations de producteurs jouent un rôle essentiel, la filière porcine a subi ces

dernières années une concentration constante des ateliers de production. Celle-ci a été

favorisée par les crises économiques cycliques nées de la confrontation de l’offre et de la

demande qui éliminaient inexorablement les exploitants les moins performants sur le plan

technique. Créés initialement pour pallier à l’insuffisance des terres agricoles, ces élevages

industriels hors sol doivent aujourd’hui trouver les terres suffisantes pour épandre leurs

volumes conséquents de déjections animales qu’ils engendrent ou envisager leur

traitement pour se conformer à la réglementation environnementale en vigueur. Entre

1979 et 2010, le cheptel porcin a augmenté en moyenne de 26% avec toutefois de fortes

disparités communales. Si les communes de Gouesnac’h, d’Ergué-Gabéric ou encore

Plomelin ont vu une réduction drastique de leur cheptel (-100%), celle de Plogastel St

Germain a contrario sur la même période a accru ses effectifs de 467% (carte 30).

Carte 30 : Nombre de porcins et variation entre 1979 et 2000 (Source : RGA).

Page 65: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 65

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 31 : Nombre de volailles et variation entre 1979 et 2000 (Source :RGA).

La production avicole intéresse également le territoire étudié (carte 31) qui voit ses effectifs

chuter de 23,4% entre 1979 et 2010. Ce chiffre mérite sans doute d’être relativisé car les

données de plusieurs communes ne sont pas fournies pour cause de confidentialité. A titre

de comparaison, entre 1979 et 2000, le cheptel de volailles avait progressé de 66,1%. Cette

production d’intégration est organisée par de grands groupes qui structurent et organisent

l’ensemble des filières (poulets de chair, œufs), des conditions d’élevage à la

commercialisation en passant par l’abattage des animaux. Dans ce contexte, l’éleveur n’a

plus la maîtrise de sa production (origine des poussins, type d’aliment,…) et intervient

simplement en qualité de prestataire de main d’œuvre par contractualisation. La chute de

la consommation de viande de volailles en France liée, à l’affaire de la contamination des

aliments de poulets par la dioxine et aux pertes de marchés à l’exportation (concurrence

des pays tiers), ont entraîné à partir de la fin des années 90 de graves difficultés dans cette

filière animale. Ceci a incité le gouvernement à prendre des mesures incitatives pour

réduire les surfaces dédiées à la production de volailles. Ainsi pour la Bretagne, ce sont

400000 m2 de poulaillers qui ont été supprimés du circuit productif .

L’évaluation des contaminations bactériologiques potentielles d’origine animale et

humaine, à l’échelle communale, obtenue par comparaison des Equivalents-habitant

(annexe 9.7), fait état d’une production de bactéries fécales issue des cheptels en moyenne

133 fois supérieures à celle d’origine humaine. Ce chiffre cache bien évidemment des

disparités communales importantes (carte 32), les rapports variant de 0 ou 1 pour les

communes proches du littoral (combrit, bénodet, Clohars-fouesnant) à 584 pour la

commune de Plogastel St Germain. Ces chiffres synthétiques ne reflètent pas l’importance

réelle de la contamination mais associés à un Système d’Informations Géographiques (SIG),

ils contribuent à mieux orienter le diagnostic en matière de pollution bactériologique.

Page 66: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 66

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 31 : Rapport communal des contaminations bactériennes potentielles entre

l’homme et l’animal (sources : RGA, RGP, Ifremer)..

A ce constat théorique, on peut objecter que des actions ont été engagées pour réduire les

impacts de l’activité agricole sur le milieu naturel.

Au plan national, le Plan de Maîtrise des Pollutions d’Origine Agricole (PMPOA), mis en

place dans le cadre de la directive nitrates, vise à concilier l’élevage et l’environnement. Ce

programme a pour objectif de mieux gérer les effluents issus des élevages tant au siège

d’exploitation que par les pratiques culturales. Initié pour limiter les flux d’azote, ce

programme contribue bien évidemment à limiter les flux bactériens vers le réseau

hydrographique. Sur le bassin versant du Bélon 25 sièges d’exploitation ont intégré cette

démarche environnementale soit 55.6% des exploitants.

Au plan local, le SAGE de l’Odet a focalisé son action sur le diagnostic de l’origine humaine

ou animale de la contamination. Celui-ci a souligné la prépondérance de la contamination

bovine parmi les sources potentielles agricoles (IDHESA 2013). La poursuite du recensement

et L’éradication des points d’abreuvage des animaux en rivière dont l’impact sur la qualité

bactériologique des eaux s’avère très dommageable (annexe 9.10) seront donc un chantier

majeur à l’avenir pour l’amélioration de la qualité bactériologique des eaux .

La superficie des terres épandables s’élève à 35050 ha soit 48.3% de la superficie totale du

territoire. On observera que la partie amont du bassin versant, à vocation agricole plus

marquée est naturellement plus impactée par cette pratique (carte 33). La commune de

Quimper, préfecture du Finistère ainsi que les communes littorales sont, au contraire,

moins soumises à cette pression agricole.

Page 67: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 67

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 33 : Recensement des terres potentiellement épandables en effluents agricoles sur

le bassin versant de l’Odet (source : DDTM 29).

5.5 – L’aquaculture d’eau douce

La production de salmonidés adulte en France s’établissait à 47000 tonnes en 1997,

espèces élevées majoritairement dans deux régions, l’Aquitaine et la Bretagne. De 1991 à

1997, la production en augmentation de 18%, s’est concentrée dans de grandes unités

commerciales privées pour faire face à la concurrence du saumon d’élevage en provenance

de la Norvège ou d’Ecosse (diminution de 12% du nombre d’entreprises). Au cours de cette

période 1991-1997, la concentration des unités de production n’a pas été la seule évolution

notable de ce secteur. En effet, pour faire face à la concurrence étrangère sur ce marché,

les entreprises ont investi dans la filière aval afin de proposer des produits plus élaborés

pour répondre aux attentes des consommateurs, bien loin de la commercialisation de la

classique truite portion entière. De 1997 à 2007, la production a reculé de 20% pour

plafonner à 37000 tonnes. Aujourd’hui, sur le bassin versant de l’Odet, seulement trois

unités de production, soumises aux Installations Classées pour la Protection de

l’Environnement (ICPE) perdurent sur le réseau hydrographique pour une production

annuelle d’environ 450 tonnes (tableau ). Si la contamination directe par ce type d’élevage

est nulle, le rejet d’effluent, riche en matière organique peut contribuer à prolonger la

survie des bactéries allocthones présentes dans le milieu aquatique.

Tableau 7 : Inventaire des piscicultures du bassin versant de l’Odet (Source : DDPP 29).

Bassin versant Cours d’eau Commune Lieu-dit Tonnage

annuel

Odet Jet Elliant Moulin d’Elliant

140

Odet Odet Langolen Pont ar Stang 100

Corroac’h Corroac’h Plomelin Moulin mer 208

Page 68: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 68

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

5.5 – L’industrie

Les Installations Classées pour la Protection de l’Environnement (ICPE) désignent les

activités agricoles ou industrielles qui présentent des inconvénients ou des dangers

potentiels pour le voisinage ou l’environnement. Elles sont régies par le titre I du livre V du

code de l’environnement qui a codifié la loi du 19 juillet 1976 et son décret d’application du

21 septembre 1977. Selon la gravité ou l’importance des nuisances, ces installations sont

soumises soit à une simple déclaration soit à une autorisation.

Les ICPE doivent satisfaire à certaines prescriptions sisant à :

• Réduire les émissions dans l’air, dans le sol et dans l’air.

• Contrôler la production et l’élimination des déchets.

• Prévenir les risques.

Sur le bassin versant de l’Odet, la carte 34 laisse apparaître un couloir sud (Pluguffan, Saint

Evarzec) nord (Briec) qui concentre l’essentiel de l’activité industrielle où l’industrie agro-

alimentaire occupe une place prépondérante(40%).

Carte 34 : Localisation des industries sur le bassin versant par types d’activité (source :

SIVALODET).

6 industries bénéficient de leur propres stations d’épuration (tableau 8) et gèrent donc

leurs effluents industriels qu’il s’agisse des eaux usées ou des boues résiduelles. Ces

Page 69: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 69

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

dernières sont pour l’essentiel épandues sur les terres agricoles à des fins de fertilisation.

En l’absence d’abbatoir, l’impact de ces rejets en terme bactériologique demeure

vraisemblablement faible.

Tableau 8 : Emissions des industries non raccordées à une station d’épuration d’une

collectivité en 2009 (source : AELB).

Raison Sociale

Activité Commune Pollution produite T/an Pollution rejetée T/an

MES DBO N P MES DBO N P

LE GALL SAS Déchets Briec 17 4,2 0 0 3,4 0,9 0 0

SOFIDIAL Textile Guengat 0 0,3 0 0 0 0,3 0 0

Bretagne

Gateaux

Biscuiterie Laz 1,6 9,6 0,2 0 1 6,5 0,2 0

Bretagne

anti

adhérence

Traitement

Métaux

Plomelin 2,2 0,4 0 0 2,1 0,2 0 0

SCEA la

source

Aquaculture

Plomelin 8,7 0 9,2 1,6 4,3 0 9,2 1,5

Ets

Quemere

Traitement

des bois

Pleuven 0 0 0 0 0 0 0 0

On parle de sites et de sols pollués quand, du fait d’anciens dépôts de déchets ou d’autres

substances polluantes, on observe, suite à une infiltration, une pollution du sol ou des eaux

souterraines. Compte tenu de la mobilité de certaines substances ainsi que des mécanismes

de transfert, propres à certains milieux (sol ou aquifère), un sol pollué constitue en général

un risque à moyen terme pour les eaux souterraines. On distingue ainsi trois typologies de

pollution :

• Les pollutions accidentelles : déversement ponctuel de substances polluantes

sur le sol pouvant à terme polluer le sous-sol.

• Les pollutions chroniques : fuites de conduites ou de stockage, mais également

de lixiviats de dépôts de déchats.

• Les pollutions diffuses : épandages de produits solides ou liquides et retombées

atmosphériques.

Les informations relatives à ces pollutions sont recensées dans deux bases de données, la

première BASOL inventorient les pollutions effectives sur le territoire et la seconde, BASIAS

recense les sites potentiellement pollués. La base de données BASIAS comptabilise 454 sites

abritant ou ayant abrité des activités susceptibles de générer une pollution des sols sur le

territoire du SAGE (carte 35). 29% de ces sites sont toujours en activité.

Les garages et casses automobiles sont concernés dans 45% des cas, 31% affectent les

industries manufacturières ( agro-alimentaire, plasturgie, métallurgie,…), 11% proviennent

du stockage des produits et enfin 7% trouvent leur origine dans la gestion des déchets.

Page 70: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 70

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 35: Sites potentiellement pollués en 2012 (source : base de données BASIAS – BRGM)

5.6 – La plaisance

Le Finistère, premier département de France pour la pratique des activités nautiques offre

une capacité d’accueil de navires de plaisance de plus de 20 000 places en considérant

l’ensemble des capacités disponibles, qu’il s’agisse des ports ou des mouillages.

Depuis les lois de décentralisation de 1983, les communes sont devenues compétentes

pour créer, aménager et exploiter les ports maritimes affectés à la plaisance. Sur l’estuaire

de l’Odet (carte 36), comme sur l’espace côtier métropolitain, les navires de plaisance sont

accueillis :

- Dans un port de plaisance, nécessitant des infrastructures, une organisation et une

gestion rigoureuse de l’espace.

- Sur des zones de mouillages et d’Equipements légers (ZMEL) régies par la loi littoral

du 3 janvier 1986 et gérés soit par l’administration (DDTM), soit par un syndicat.

- Sur des zones de mouillages individuelles qui font l’objet d’une Autorisation

d’Occupation Temporaire (AOT) du domaine public maritime.

- Sur l’Odet on recense 3 ports, celui de Quimper géré par le Conseil Général, celui de

Bénodet géré par la commune de Bénodet et enfin celui de Sainte Marine géré par la

commune de Combrit.

Un conseil portuaire pour chaque entité, regroupant l’ensemble des usagers du

port, se réunit 1 à 2 fois par an et fournit des avis à titre consultatif sur l’ensemble

des domaines intéressant la vie portuaire.

Page 71: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 71

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Carte 36 : Localisation des ports et des mouillages de la ria de l’Odet (sources : Commune, DDTM

29).

Tableau 9 : Inventaire des ports et mouillages sur le territoire du SAGE en 2012 (source :

DDTM 29).

Commune Ports et

ZMEL

Mouillages

individuels

Mouillages

sauvages

Total Projets

Combrit 770 8 2 780 8

Plomelin 119 0 42 161 0

Quimper 0 11 2 13 0

Gouesnac’h 70 30 1 101 48

Clohars-

Benodet

824 0 0 824 6

Bénodet 0 28 55 83 0

1783 77 102 1962 62

La ria de l’Odet comptabilise 1962 emplacements (carte 36), répartis en mouillages

permanents emplacements temporaires pour les navires de passage, évalués

annuellement en moyenne à (figure 23).

Page 72: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 72

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Ces activités nautiques peuvent occasionner des impacts non négligeables sur le milieu

naturel. On citera par exemple :

- L’arrachage des herbiers à zostères par les ancres.

- L’envasement favorisé par la multiplication des navires et des systèmes d’ancrage.

- L’évacuation des déchets (eaux noires, déchets ménagers, huile usagée,…).

Sur le territoire du SAGE, un dispositif de collecte des eaux noires et brunes existe pour les

plaisanciers à Bénodet. Un projet similaire est en cours d’élaboration sur Combrit.

- L’utilisation de peintures antifouling pour l’entretien des coques de navires.

Initialement composées de Tributylétain, ces peintures ont entraîné un certain nombre de

dysfonctionnement chez la faune marine. Ainsi, on a pu observer des modifications

significative de la sexualité chez les gastéropodes marins se traduisant par l’imposition du

caractère sexuel mâle chez la femelle appelée imposex. Par ailleurs, des anomalies de

calcification de la coquille des huîtres ont été rapportées, préjudiciables à la qualité de ce

mollusque. Face à la toxicité de cet élément chimique, celui-ci a fait l’objet d’une

interdiction d’utilisation. Ceci a conduit à la substitution de ce composé par l’intégration

dans les antifoulings de sels de cuivre et de zinc mais aussi d’herbicides.

Face aux risques potentiels générés par cette activité, plusieurs textes réglementaires ont

été édictés pour encadrer cet usage et encourager une gestion environnementale

exemplaire. Ainsi, on peut citer :

- Le Code des ports maritimes qui porte sur la gestion des déchets d’exploitation et

sur les installations portuaires de réception des déchets et des résidus de cargaison.

- Le Code de l’environnement qui précise que le déversement ou l’écoulement,

direct ou indirect, de substances potentiellement délétère pour la santé ou la faune et la

flore est passible de sanctions judiciaires.

- Le décret 2003.920 du 22/9/2003, portant transposition de la directive

2000/59/CE sur les installations de réception portuaires, engage la responsabilité des

gestionnaires des ports en matière de gestion des déchets.

Dans un contexte réglementaire plus draconien mais également dans le souci d’une gestion

durable de cet espace littoral remarquable, le port de Combrit s’est doté d’une cale de

carénage avec récupération et traitement des eaux et le port de Bénodet dispose d’une aire

de carénage.

5.7 – La faune sauvage

La faune sauvage est essentiellement composée par la faune ornithologique

représentée par les espèces inféodées au territoire d’une part et les espèces

migratrices d’autre part. Ces espèces animales sont quantitativement peu présentes

sur la zone concernée et ne constitue pas un réel problème sanitaire pour la filière

conchylicole.

Page 73: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Identification des sources de contamination – 73

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

5.8 – Inventaire des émissaires

Carte 37 : Inventaire des émissaires aboutissant au littoral (source : DDTM 29)

Un inventaire des rejets arrivant au littoral a été réalisé par la DDTM 29 sur

l’ensemble des côtes finistériennes. L’estuaire de l’Odet, contrairement à d’autres,

est majoritairement bordé de milieux boisés et de terres agricoles. En l’absence

d’urbanisation de ses berges, les émissaires susceptibles de contaminer le milieu

aquatique sont essentiellement représentés par les rivières qui y aboutissent. Les

rejets d’eaux pluviales et d’eaux usées potentielles sont majoritairement identifiés

au niveau des communes littorales à l’aval de l’estuaire (carte 37).

Page 74: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Conclusions – 74

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

6. Conclusions

L’étude de la zone aval de la ria de l’Odet a permis d’estimer la qualité sanitaire des

coquillages du groupe 2 (Cerastoderma edule) en classe B et de retenir le point « Pors

Keriel » pour la surveillance régulière dans le cadre du REseau Microbiologique (REMI).

Cette étude a souligné un gradient de décontamination bactérienne des coquillages de

l’amont vers l’aval, observation récurrente sur les estuaires bretons, induit par les

phénomènes de dilution, de sédimentation et de mortalité des bactéries allochtones. Elle a

par ailleurs mis en évidence une différence significative des résultats entre les saisons, la

période hivernale ayant un impact sanitaire moindre. Une analyse comparative des flux

bactériens issus du bassin versant d’une part et de la station d’épuration de l’agglomération

quimpéroise d’autre part a été initiée sur deux périodes distinctes, 1998-2002 et 2008-

2012. Les résultats montrent une réduction significative des flux bactériens en provenance

de la station d’épuration suite à sa réhabilitation en 2003 avec un rapport de 4 à 10 fois

inférieur entre les deux périodes étudiées. Toutefois, afin d’affiner ces données et limiter

les biais d’interprétation, une meilleure adéquation entre les plans d’échantillonnage

respectifs de la station d’épuration et du bassin versant devrait être recherchée.

L’étude sanitaire réalisée à l’échelle du bassin versant a intégré l’ensemble des

informations disponibles, recueillies auprès des différents acteurs intervenant dans la

gestion de l’eau (administrations, collectivités, SIVALODET ,…) sur le territoire. La synthèse

de ces informations offre une approche holistique des sources potentielles de

contamination qui s’avèrent multiples. Sur le plan de l’assainissement, des efforts

importants ont été et sont consentis tant sur le plan collectif qu’autonome. Des efforts

devront sans doute être portés sur les postes de refoulement et sur les réseaux dont

l’impact sanitaire sur l’environnement ont longtemps été négligés. Sur le volet agricole

également la focalisation s’est longtemps portée sur l’épandage des lisiers de porcs,

occultant, à tort, l’origine bovine de la contamination. En effet, le programme cycleau

(Monfort et al. 2006) a fait émerger le rôle pregnant des abreuvages dans la dissémination

de la contamination fécale dans l’environnement aquatique. Le diagnostic relatif à la

discrimination de l’origine humaine et/ou animale initié par le SAGE de l’Odet confirme la

diversité des origines de la contamination mais également au sein des sources animales, la

prévalence des souches d’origine bovine. Dans un contexte de gestion intégrée du territoire

au sein du SAGE, les études entreprises pour mieux appréhender la complexité de cette

problématique bactérienne et les actions entreprises en faveur de la restauration de la

qualité des eaux sont de bons augures pour la pérennité de la conchyliculture sur cet

estuaire.

Page 75: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Bibliographie – 75

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

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Annexes – 78

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9. Annexes

9.1– Echelle des temps géologiques

Page 79: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 79

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.2– Données relative à la survie des bactéries fécales dans le milieu marin

Auteurs Année Type Lieu Bactérie T90(H)

Pommepuy et al. 1992 In Vivo France (sud)

France(Nord)

E ; oli

E. coli

1-5

~50

Bonnefont et al. 1990 In vitro France C.F. 12 - 81

Plusquellec 1984 In vitro France E. coli 24.1

(12.2-45.5)

Plusquellec 1984 In vivo France E.coli 2 - absence

Chevreau et al. 1978 In vivo France C.T.

E.C.

1 – 2.6

1.9 – 2.2

Penrose 1978 In vivo Canada C.T. 68.5

Gerba et Leod 1976 In vitro Mexique E. coli 72

Anson & ware 1975 In vitro Angleterre E. coli 34

Gilath 1971 In vivo Israel E.coli 0.5 - 1

Page 80: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 80

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.3– Réseaux de surveillance de la qualité des eaux sur le bassin versant de

l’Odet

Page 81: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 81

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.4– Technique de dénombrement des E. coli (méthode NPP 3x5tubes)

Page 82: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 82

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.5 – Résultats bactériologiques des coques de l’Odet

Date Pors Gwen Pors Keriel17/11/2009 3500 540003/12/2009 3500 170020/12/2009 330 49004/01/2010 940 23018/01/2010 790 49002/02/2010 70 23017/02/2010 230 79002/03/2010 5400 920018/03/2010 230 13005/04/2010 5400 350018/04/2010 130 4520/05/2010 20 11031/05/2010 490 110003/06/2010 790 540016/06/2010 1100 17001/07/2010 78 23015/07/2010 16000 70002/08/2010 490 4516/08/2010 490 70010/09/2010 1300 23030/09/2010 170 11019/10/2010 10 1004/11/2010 270 13025/11/2010 140 7818/01/2011 2200 170027/01/2011 790 49016/02/2011 3500 130024/02/2011 1700 1300

Page 83: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 83

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.6 – Résultats chimiques des coques de l’Odet

Date Lieu Cd ph Hg ph Pb ph

17/02/2010 Pors Guen 0.02288 0.01352 0.1976

18/01/2011 Pors Guen 0.056 0.291

Page 84: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 84

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.7 – Notion d’équivalent-habitant

Avec le développement de l’urbanisation et de l’industrialisation, les rejets d’eaux usées ont considérablement évolués tant sur le plan qualitatif que quantitatif. Pour ne pas hypothéquer les usages de l’eau en aval de ces rejets, des réglementations européennes (Directives Eaux Résiduaires du 21/05/1991) et nationales (loi sur l’eau du 03/01/1992, Décret du 03/06/1994, Arrêtés du 06/05/1996 et du 21/06/1996) ont été édictées. Elles fixent les obligations des communes et des particuliers et définit le rôle de l’Etat.

Ces réglementations définissent la notion d’Equivalent-Habitant (EH) qui est l’estimation de la quantité de pollution journalière rejetée par un habitant (tableau cidessous). L’équivalent-habitant permet ainsi d’exprimer, à l’aide d’une unité commune, des types de rejets différents et de pouvoir en conséquence les comparer.

Paramètres Equivalent-Habitant

Volume consommé 150 litres

Demande Biologique en Oxygène sur 5 jours (DBO5) 60 g

Demande Chimique en Oxygène (DCO) 120 g

Matières en suspension (MES) 90 g

Matières azotées (Azote total –NTK) 15 g

Matières phosphorées (phosphore total – Pt) 4 g

Cette définition officielle de l’Equivalent-Habitant n’intègre pas le paramètre relatif au rejet bactérien, ce qui nous a contraint de rechercher dans la bibliographie les données disponibles sur ce thème (Dupray 1999). Pour satisfaire aux exigences de comparaison des sources potentielles de contamination, l’IFREMER utilise les valeurs suivantes (tableau ci-dessous).

Espèces Flux E.coli/j Equivalent habitant

Homme 2.14 109 1

Bovin 5

Porcin 30

Volaille 0.06

Page 85: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 85

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.8 – Types et caractéristiques des stations d’épuration du bassin versant

Communes Type

STEP

Capacité

EH

Debit

m3/j

Boues

Destination

Boues

Quantité

Tms/an

Date

mise en

service

Bénodet Boue

activée

22000 2860 Compostage 95 2005

Briec Boue

activée

45000 5620 Epandage 109 1983

Clohars

fouenant

Lagunage 2800 550 ? ? 1988

Coray Boue

activée

3800 480 Epandage 15 1977

Elliant Boue

activée

1600 290 Epandage 13 2000

Guengat ZA Lit

bactérien

250 45 Epandage 1 1968

Guengat

pont kervern

Boue

activée

500 75 Epandage 5 1994

Guengat

Bellevue

Filtre à

roseaux

Landrevarzec Boue

activée

2100 180 Epandage 21 1978

Laz Lagunage 350 63 ? ? 2000

Leuhan

bourg

Lagunage 250 45 2006

Leuhan

ti louet

Lagunage 600 70 ? ? 1988

Pleuven St

Evarzec

Lagunage 2800 625 ? ? 1990

Pleuven mlin

du pont

Lagunage 500 100 ? ? 1994

Plogonnec Lagunage 2500 450 Epandage ? 2008

Quimper Boue

activée 267000 28000 Epandage

incinération

269

1611

2003

St Yvi bourg Boue

activée

1200 180 Epandage 12 1978

St Yvi bois

pleuven

Boue

activée

2500 320 ? 6 1976

Trégourez Boue

activée

850 165 Epandage 5 1974

Page 86: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 86

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.9 – Données brutes des flux bactériens moyens annuels en provenance du

bassin versant et de la station d’épuration de quimper agglomération

Années Flux BV(EH) Flux STEP(EH) Rapport STEP/BV1998 3878 152418 39.31999 6535 47396 7.32000 9839 44670 4.52001 18333 121023 6.62002 5747 100738 17.5

Années Flux BV(EH) Moy EH STEP Rapport STEP/BV2008 8292 11092 1.342009 7409 9479 1.282010 8130 7394 0.912011 4230 6498 1.542012 9454 5776 0.61

Page 87: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 87

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.10 – Modélisation de la dispersion des flux bactériens en provenance du

bassin versant au sein de l’estuaire de l’Odet en périodes hivernale et estivale

Page 88: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 88

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

Page 89: Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet

Annexes – 89

Etude sanitaire de la ria de l’Odet janvier 2014

9.11 – Contamination bactérienne des eaux par abreuvage des animaux et

pompe à museau

Pompe à museau (photo : P. Monfort)