et dmé cin a os l B1.3 É c o l e d e m é d e c i n e u n i ... · François Bochud Unité de...

23
UNIL Université de Lausanne Faculté de biologie et de médecine Module Développement B1.3- 08 École de médecine

Transcript of et dmé cin a os l B1.3 É c o l e d e m é d e c i n e u n i ... · François Bochud Unité de...

UN

ILU

nive

rsité

de

Laus

anne

Fa

cu

lté

de

bio

log

iee

td

em

éd

ec

ine

U N I L Université de LausanneFacu l t é de b io log iee t de médec ine

Module

Développement

B1.3

- 08

Éc

ole

d

e

de

cin

e

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

- 2 -

Gouvernance du module

Responsable du module Jean-Pierre Hornung Département de biologie cellulaire et de morphologie (DBCM) [email protected]

Enseignants François Bochud Unité de Radiophysique appl. [email protected] Chanson CPMA [email protected] Dubuis-Grieder DBCM/Ecole de médecine [email protected] Fasel Département de Biochimie [email protected] Hornung DBCM [email protected] Jotterand Génétique médicale [email protected] Michalik Unité - CIG Sciences [email protected] Marazzi IUMSP [email protected] Osterheld-Haas Département de Pathologie [email protected] Raddatz Département de Physiologie [email protected] Senn CPMA [email protected] Verdun Unité de Radiophysique appl. [email protected] Volterra DBCM [email protected]

Responsable d’année

Pierre-Yves Zambelli Service d’orthopédie

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08 Table des matières

Gouvernance du module______________________________________________________2

Table des matières___________________________________________________________3

1. Descriptif du module_____________________________________________________4

2. Prérequis_______________________________________________________________5

3. Objectifs d'apprentissage __________________________________________________6 3.1. Buts _____________________________________________________________________ 6 3.2. Objectifs généraux_________________________________________________________ 7 3.3. Objectifs spécifiques _______________________________________________________ 9

3.3.1. La génétique __________________________________________________________________ 9 3.3.2. La biologie moléculaire ________________________________________________________10 3.3.3. La biologie du développement - embryologie générale ________________________________10 3.3.4. L'embryologie humaine ________________________________________________________11 3.3.5. La physiologie générale ________________________________________________________11 3.3.6. Introduction à la radiophysique médicale ___________________________________________12 3.3.7. Introduction à la statistique biomédicale____________________________________________14

4. Déroulement du module__________________________________________________16 4.1. Organisation du calendrier horaire __________________________________________ 16 4.2. Approches pédagogiques___________________________________________________ 16

4.2.1. Cours_______________________________________________________________________16 4.2.2. Travaux pratiques - Webembryology ______________________________________________17 4.2.3. Travaux pratiques - Statistique biomédicale _________________________________________18 4.2.4. Séminaire interdisciplinaire _____________________________________________________19

4.3. Examen _________________________________________________________________ 20

5. Ressources d’apprentissage (littérature, multimédia) __________________________21

- 3 -

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

1. Descriptif du module Un organisme adulte est constitué de nombreux types cellulaires différenciés qui sont groupés en organes qui remplissent des fonctions physiologiques complexes. Chaque individu est issu d’un œuf fécondé, le zygote. Cette cellule, par divisions et différenciations successives, produit à la fin du développement embryonnaire un organisme doté de toutes les fonctions nécessaires à la vie dans son environnement. Cette évolution progressive de la fécondation à la naissance met en jeu de nombreux mécanismes au niveau génétique, moléculaire et cellulaire qui assurent un développement harmonieux d’un organisme. Le développement embryonnaire met en œuvre des processus biologiques complexes pour assurer qu’à partir d’une cellule unique, plusieurs types cellulaires soient formés (la différenciation cellulaire), que ces cellules forment des organes structurés (la morphogénèse), que la taille des différentes parties du corps soit proportionnée (la régulation de la croissance), que des cellules spécialisées assurent la perpétuation de l’espèce (la reproduction), et que la perpétuation des caractères morphologiques et fonctionnels, et leur modification au cours du temps, assurent les meilleurs chances de survie de l’espèce (l’évolution). Ce module permet la transition entre, d’une part, l’étude de la structure et de la fonction des différents types cellulaires constituants les tissus des mammifères et de l’homme (module B1.2) et, d’autre part, l’étude des caractéristiques morphologiques et fonctionnels d’un système au niveau de l’organisme adulte (module B1.4, le système locomoteur). Il traitera des régulations moléculaires et génétiques qui déterminent l’expression des gènes (cours de génétique), des principes généraux de la biologie du développement qui décrivent les mécanismes du développement embryonnaire (cours de biologie animale) et de la description des étapes initiales du développement de l’embryon humain (cours d’embryologie humaine). Ce programme est complété par trois cours parallèles traitant des méthodes physiques appliquées à l’imagerie du corps humain (cours d’introduction à la radiophysique médicale), des principes physiologiques fondamentaux du fonctionnement au niveau de la cellule et des organes (cours de physiologie), et des concepts de base de la statistique appliquée aux branches biomédicales (cours de statistique biomédicale). Finalement le programme de ce module est complété par des séances de travail en petits groupes dans une salle multimédia avec des tuteurs pour approfondir l’étude du développement embryologique humain et pour exercer les notions de statistiques introduites pendant le cours.

4

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

2. Prérequis

Modules B1.1 et B1.2, et en particulier :

Biochimie – connaissances de la composition chimique des cellules et des fonctions des organelles

intracellulaires – connaissances de la structure et la fonction du noyau et de la chromatine

Histologie – Connaissance des caractéristiques structurelles et fonctionnelles des différents types

cellulaires

5

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

3. Objectifs d'apprentissage

3.1. Buts Dans les modules précédents, les caractéristiques de la matière vivante et de la cellule animale, l’unité fonctionnelle d’un organe et d’un organisme, ont été introduites. Il s’agit dans ce module d’aborder les questions : comment est-ce que ces différents types cellulaires se différencient et comment s’organisent-ils au cours du développement précoce pour former des organes et un organisme autonome et adapté à la survie dans son environnement ? D’une part la biochimie (d’un point de vue de biologie moléculaire) et la génétique continuent de développer les concepts du module précédant concernant la régulation de l’expression génétique ainsi que la réplication du patrimoine génétique d’un individu à sa descendance. D’autre part la biologie du développement décrit différents modèles animaux qui illustrent comment sont établies nos connaissances du développement embryonnaire et en particuliers les grands principes régulateurs du développement propres à la plupart des espèces, y compris l’homme. Il est associé au cours sur le développement embryonnaire humain qui met en place les notions spécifiques de la formation de l’embryon humain, de ses annexes embryonnaires et de la circulation fœtale. Ce cours est complété par un programme interactif sur le réseau internet d’étude approfondie du développement de l’embryon humain. Le programme de ce module est complété par deux cours qui préparent l’étude de l’organisme adulte d’un point de vue systémique et fonctionnel : un cours d’introduction à la radiophysique médicale qui décrit les bases de la physique appliquée aux techniques d’imagerie médicale (radiologie, tomographie, imagerie par résonance magnétique, médecine nucléaire), et un cours d’introduction à la physiologie qui décrit les propriétés physiologiques fondamentales au niveau cellulaire, qui introduisent en particulier les propriétés membranaires des cellules excitables (muscles, neurones) qui seront traitées plus en détail dans le module suivant. Le programme comprend également un cours d’introduction à la statistique, qui donne les concepts de bases pour l’analyse des données numériques issues des sciences fondamentales, biomédicales et cliniques. Ce cours s’inscrit dans un enseignement structuré de la statistique qui se distribue sur les 4 premières années d’études, pour fournir à l’étudiant les compétences nécessaires à la compréhension et la maîtrise des outils statistiques utilisés dans la littérature biomédicale.

6

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

3.2. Objectifs généraux Au terme de ce module, l'étudiant-e doit :

Génétique : • Connaître les fondements chromosomiques de l'hérédité • Connaître les principes de l'hérédité autosomique (croisements mendéliens, hérédité

monogénique chez l’homme) • Connaître les principes de la détermination chromosomique du sexe et de l'hérédité liée au

sexe • Connaître les bases de l'hérédité cytoplasmique • Connaître les principes de la recombinaison génétique et de la cartographie génétique et

chromosomique • Connaître les principes de l'interaction entre gènes et phénotype • Connaître les différents types de mutations chromosomiques • Connaître les principes de l'inactivation du chromosome X et de l'empreinte génomique

parentale • Connaître les principes de base de la génétique des populations • Connaître quelques principes de base de la génétique quantitative et de l'hérédité polygénique

et multifactorielle Biologie moléculaire (partie du cours de génétique) • Connaître l’organisation du génome humain • Connaître les principes de base du maintien de l’information génétique et des variations dans

le génome • Connaître les principes de base du génie génétique et de ses applications • Connaître les principes de base de l’analyse génotypique et de ses applications Embryologie générale • Expliquer les mécanismes fondamentaux du développement embryonnaire précoce

(segmentation, gastrulation, induction, détermination) • Connaître le développement embryonnaire des oursins, de la drosophile et des amphibiens et

expliquer les expériences réalisées avec ces modèles animaux pour l’étude des mécanismes fondamentaux en embryologie

• Comparer le développement de la drosophile et des mammifères pour le contrôle génétique de la division segmentaire de l’embryon

Embryologie humaine • Connaître les mécanismes qui régulent la fécondation • Pouvoir décrire les étapes des 4 premières semaines du développement embryonnaire • Expliquer la formation initiale du système nerveux central • Décrire l’établissement de la circulation utéro-placentaire Physiologie • Connaître la composition ionique des espaces intra- et extracellulaires • Décrire les principes physiques, chimiques et physiologiques qui caractérisent les échanges • Connaître les différentes formes de transport membranaire • Pourvoir expliquer l’homéostastasie du calcium intracellulaire

7

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

• Connaître les bases moléculaires du potentiel de membrane et du potentiel d’action et les techniques pour les mesurer

Introduction à la radiophysique médicale • Se rappeler les éléments de base de la physique atomique en vue de l'analyse des applications

médicales. • Décrire les caractéristiques des différents rayonnements qui sont utilisés en médecine

(diagnostic et thérapie). • Présenter les mécanismes d'action de la radiation sur la matière, en particulier sur la matière

vivante. • Présenter les effets des radiations sur l'organisme et les principes et les méthodes qui sous-

tendent la protection contre les radiations. • Présenter les éléments de la physique sur lesquels se fondent les diverses modalités du

diagnostic médical et de la thérapie (radiologie classique, tomodensitométrie, ultrasonographie, résonance magnétique nucléaire, médecine nucléaire, radiothérapie).

• Présenter les risques radiologiques pour le patient, le personnel médical et l'environnement, ainsi que les modalités de protection.

Introduction à la radiophysique médicale Introduction aux concepts et aux méthodes de la statistique. Les concepts et les méthodes statistiques sont illustrés à l’aide de problèmes quantitatifs fondamentaux en médecine (ainsi que d’exemples issus de disciplines enseignées dans ce module): 1. Distributions et mesures statistiques : « valeur dans la norme » ; 2. La « décision médicale » basée sur un test de diagnostic ; 3. La randomisation comme méthode de l’ « essai clinique » expérimental; 4. Le rôle de l’échantillonnage dans les « études d’observation épidémiologiques ». Chacun de ces thèmes est traité de façon relativement complète. Toutefois, ce cours est introductif et ne peut présenter exhaustivement les méthodes statistiques. L’étudiant pourra développer ses connaissances à l’aide de BOMS et d’un Polycopié de biostatistique (voir Ressources d’apprentissage).

8

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

3.3. Objectifs spécifiques

3.3.1. La génétique

• Savoir les fondements chromosomiques de l'hérédité : connaître la nature et les caractéristiques des chromosomes nucléaires (propriétés cytogénétiques) et des chromosomes des organites (mitochondries et chloroplastes).

• Connaître les modes de transmission des caractères héréditaires autosomiques : croisements mendéliens (monohybridisme, dihybridisme, tri- et polyhybridisme) et hérédité monogénique chez l'homme (mutations récessives, mutations dominantes, mutations dynamiques instables, calculs de risque pour la descendance).

• Connaître les principes de la détermination chromosomique du sexe, de la détermination du sexe masculin chez les mammifères et de la transmission des caractères héréditaires liés au sexe. Connaître les modes d'hérédité liée au sexe chez l'homme et les mutations y relatives.

• Connaître les principes de l'hérédité cytoplasmique (mitochondries et chloroplastes) : mutations, homoplasmie, hétéroplasmie, hérédité mitochondriale chez l'homme.

• Connaître le principe de la recombinaison génétique et les processus qui la génèrent (gènes non liés et assortiment indépendant, gènes liés et crossing-over)

• Savoir les principes de la cartographie génétique (fréquence de recombinaison, distance entre les gènes, carte de liaison) et de cartographie chromosomique (hybridation in situ fluorescente)

• Dans le cadre de l'étude des relations entre gènes et phénotypes, avoir connaissance des interactions entre les allèles d'un même gène et entre les gènes: haplosuffisance/insuffisance, dominance incomplète, codominance, allèles létaux, pénétrance et expressivité.

• Savoir décrire les principaux types de mutations chromosomiques, les mécanismes qui les génèrent et leurs conséquences pour leur porteur et sa descendance : anomalies numériques, anomalies structurales, anomalies chromosomiques constitutionnelles chez l'homme, anomalies chromosomiques acquises (cancer)

• Connaître les principes de l'inactivation du chromosome X, ses conséquences génétiques et phénotypiques

• Connaître le principe de l'empreinte parentale et des conséquences pathologiques liées à des anomalies affectant les gènes soumis à empreinte. Connaître les mécanismes à l'origine de la disomie uniparentale et ses conséquences.

• Connaître les principes de base de la génétique des populations : fréquences alléliques, fréquences génotypiques, la loi de Hardy-Weinberg et son application aux calculs de risque pour la descendance, exemple d'écart à la loi de Hardy-Weinberg.

Génétique

9

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

3.3.2. La biologie moléculaire (suite du cours de génétique) • Description de l’organisation du génome humain • Description des familles de gènes et des superfamilles de gènes • Définition des séquences répétées dispersées et en tandem • Comparaison des génomes humains, de singe et de souris • Analyse des variations dans le génome humain, types et origines des

mutations • Description des mécanismes de réparation des mutations et maladies

héréditaires • Connaître les principes de base du génie génétique : les enzymes de

restriction et les cartes de restriction, les analyses de liaison génétiques et les RFLPs, le PCR et le séquençage du DNA, les principes du clonage moléculaire

• Comprendre les applications du génie génétique : protéines recombinantes, organismes génétiquement modifiés et thérapie génique

• Connaître les principes de base de l’analyse génotypique et de ses applications en génétique, les empreintes génétiques, la recherche en paternité, l’utilisation des polymorphismes pour comprendre l’évolution, les SNPs et leur application en pharmacogénomique,

Biochimie Génétique

3.3.3. La biologie du développement – embryologie générale • Décrire les étapes du développement embryonnaire : la segmentation, la

gastrulation, l’organogénèse et l’histogénèse • Connaître les adaptations de la synthèse des ARN pendant le

développement embryonnaire précoce : absence de transcription au début du développement, expression à partir du stade blastula, expression des protéines à partir de l’ARN maternel pendant le première phase de développement

• Connaître les mécanismes principaux qui régissent le développement embryonnaire des amphibiens: étude expérimentale des étapes précoces des divisions cellulaires et établissement des axes de symétrie, identification des territoires présomptifs de l’embryon pour la différentiation des feuillets embryonnaires, mécanismes de la gastrulation et de l’induction de la formation du tube neural et des somites

• Expliquer les mécanismes de régulation du développement embryonnaire précoce mis en évidence par l’étude de l’oursin et des amphibiens : la théorie des gradients, le phénomène d’induction, la détermination, la différenciation

• Savoir décrire le rôle de la génétique dans le contrôle du développement embryonnaire : exemple du développement de la drosophile et des

Biologie animale Embryologie générale

10

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

mammifères.

3.3.4. L’embryologie humaine • Connaître le calendrier des étapes du développement, savoir expliquer le

mécanisme du déterminisme et de la fécondation • Décrire les étapes de la 1ère semaine du développement embryonnaire

humain ; connaître les techniques expérimentales pour mettre en évidence le rôle d’un gène chez le rongeurs (souris transgéniques, souris knock-in et knock-out)

• Décrire les étapes de la 2ème semaine du développement embryonnaire : le disque embryonnaire didermique, la formation des cavités embryonnaires et de la circulation utéro-placentaire, la formation des cavités embryonnaires, et l’établissement de la circulation utéro-placentaire.

• Décrire les étapes de la 3ème semaine du développement embryonnaire : la gastrulation et la formation du mésoderme

• Décrire les étapes de la 4ème semaine du développement embryonnaire : l’organisation des somites

• Connaître les étapes du développement précoce du système nerveux : la plaque neurale et la formation du tube neural, la morphogenèse, la différenciation cellulaire et la formation des connexions synaptiques.

Le cours est illustré par la présentation des techniques de procréation assistée, l’observation des premières étapes de la différenciation de l’embryon humain.

Embryologie médicale

3.3.5. La physiologie générale • Définir les compartiments liquidiens dans l’organisme humain • Connaître la composition des milieux intracellulaire et extracellulaire • Expliquer la répartition asymétrique des ions de part et d’autre de la

membrane. • Acquérir la notion de perméabilité sélective membranaire • Décrire les transports passifs et actifs à travers la membrane • Décrire le fonctionnement des pompes ioniques ATPases • Connaître les uniports, symports et antiports membranaires et leur rôle

respectif • Comprendre les mécanismes du transport épithélial (trans- et

paracellulaire) • Connaître les mécanismes impliqués dans l’homéostasie du calcium

intracellulaire • Comprendre les mécanismes de régulation du volume cellulaire • Expliquer comment s’établit un potentiel d’équilibre • Comprendre le principe de mesure d’un potentiel de membrane au repos

Physiologie

11

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

• Connaître la conductance relative de la membrane aux ions principaux • Définir une hyperpolarisation ou une dépolarisation membranaire • Définir ce qu’est un gradient électrochimique • Connaître la classification des principaux canaux ioniques • Connaître le principe de la technique du « patch-clamp » et « voltage

clamp » • Définir la conductance ionique élémentaire d’un canal • Connaître les régulations possibles des canaux ioniques

(agonistes/antagonistes) • Connaître les bases ioniques et moléculaires du potentiel d’action • Connaître les bases ioniques et moléculaires de la conduction du potentiel

d’action • Définir la période réfractaire du potentiel d’action et expliquer son

importance • acquérir la notion d’excitabilité membranaire • définir un potentiel gradué (électrotonique) le long d’une membrane

excitable

3.3.6. Introduction à la radiophysique médicale À l'issue de chacun des chapitres, l'étudiant doit avoir atteint les objectifs ci-dessous. Noyau et radiations

• Citer les constituants du noyau et de l'atome. • Expliquer les raisons physiques de la stabilité du noyau et de l'atome. • Décrire les principales caractéristiques du photon. • Décrire les principales méthodes de production de rayonnement et leur

utilisation en médecine. Radioactivité

• Connaître la notion d'activité et son unité de mesure. • Calculer l'activité d'une source radioactive au cours du temps. • Décrire les principaux types de désintégrations radioactives. • Expliquer le principe de la filiation radioactive et présenter un exemple

d'application médicale. Interaction radiation-matière

• Expliquer ce qu'est un rayonnement ionisant et expliquer la différence principale entre photons et électrons.

Physique

12

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

• Décrire les principales interactions entre les photons et la matière. • Calculer l'atténuation d'un faisceau de photons mono-énergétiques. • Expliquer la différence entre la dose absorbée et l'équivalent de dose.

Effets des radiations sur l'organisme

• Expliquer les différences existant entre risques stochastique et déterministe liés à l'irradiation d'organismes vivants.

• Citer les principaux effets cliniques liés à l'irradiation. • Expliquer les risques au fœtus lors d'une irradiation. • Citer les sources scientifiques à la base de notre connaissance du risque

radiologique. Protection contre les effets des radiations

• Décrire les trois principes de base de la radioprotection. • Citer les méthodes de protection face à une irradiation externe ou une

contamination. • Citer les méthodes de surveillances des personnes professionnellement

exposées aux radiations. • Citer quelques ordres de grandeur de doses reçues par la population.

Physique de la radiologie conventionnelle

• Reconnaître l'effet du contraste, de la résolution et du bruit sur une image radiologique.

• Décrire comment des rayons X sont générés dans un tube à rayons X. • Décrire le cheminement d'un photon depuis l'anode du tube jusqu'au

détecteur. • Citer les différents types de détecteurs en radiologie conventionnelles.

Physique de la tomodensitométrie (CT)

• Décrire les grandes lignes du fonctionnement d'un CT. • Expliquer quelle grandeur physique est présentée dans une image CT. • Citer les avantages et les inconvénients du CT par rapport à l'imagerie

aux rayons X par projection. Physique de la résonance magnétique (IRM)

• Citer le paramètre physique à la base de l'imagerie IRM • Citer les instruments principaux utilisés pour obtenir une image IRM. • Expliquer la différence entre T1 et T2 en IRM

13

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

• Décrire comment une coupe du patient est sélectionnée en IRM. Physique de l'ultrasonographie (US)

• Citer les caractéristiques principales d'une onde sonore et ultrasonore. • Décrire le parcours d'une onde US dans une application clinique simple

depuis l'émetteur jusqu'au détecteur. • Décrire les principaux modes d'utilisation des US en médecine.

Physique de la radiothérapie

• Citer les 4 principes radiobiologiques de base de la radiothérapie (les 4 R).

• Expliquer le lien entre la probabilité de complication et celle de stérilisation de la tumeur.

• Citer les principaux moyens d'irradiation en radiothérapie. • Expliquer la différence entre téléradiothérapie et brachythérapie.

Physique de la médecine nucléaire

• Décrire la procédure générale d'un examen diagnostique de médecine nucléaire.

• Décrire les propriétés idéales d'un marqueur en médecine nucléaire. • Donner des exemples de moyens de production de radionucléides en

médecine nucléaire. • Expliquer les différences existant entre PET et SPECT.

Risques radiologiques dans les applications médicales

• Décrire la notion de niveau de référence diagnostique. • Expliquer comment estimer un risque radiologique. • Avoir une idée des ordres de grandeur du risque d'examens

radiologiques typiques. • Citer les risques liés à l'utilisation des US et de l'IRM

3.3.7. Introduction à la statistique médicale Distributions, mesures statistiques et « valeurs dans la norme »

• Population, échantillon. • Variables statistiques. • Définition, interprétation, et utilisation de distributions de données. • Mesures statistiques principales (moyenne, écart type, médiane,

Statistique

14

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

percentiles). • Concept de « modèle mathématique » comme description d’une

distribution réelle (exemple de la distribution normale). • Application : Que signifie l’expression « valeur dans la norme ». • Application : Détermination et utilisation de courbes de croissance et

de normes en pédiatrie. Probabilités et décision

• Concepts de probabilité, probabilité conjointe, probabilité conditionnelle et leurs relations. Concept d’indépendance entre deux caractères.

• Application: décision médicale basée sur un test de diagnostic (sensibilité, spécificité, taux de faux négatifs, valeur prédictive).

La randomisation et l’essai clinique

• Concept d’étude expérimentale et de randomisation : but et nécessité de la randomisation.

• Introduction au concept de test statistique (hypothèse nulle, hypothèse alternative, statistique de test, probabilités d’erreurs de type I et de type II) basé sur la randomisation.

• Application : l’essai clinique randomisé (clinical trial) L’échantillonnage et les études d’observation épidémiologiques

• Concept d’étude d’observation, d’échantillonnage et d’inférence statistique de l’échantillon à la population.

• Le test du chi-carré. • Application : étude épidémiologique de la relation entre un facteur

antécédent et la survenue d’une une maladie ; échantillonnage prospectif, rétrospectif, transversal.

15

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

4. Déroulement du module

4.1. Organisation du calendrier horaire Le module « Développement » dure 5 semaines. Les 5 premières semaines du module sont organisées de la manière suivante : – 4 matinées d'enseignement structuré sous forme de cours magistraux (volée entière) – 1 demi-journée d'enseignement "pratique" sous forme de travaux pratiques (par demi-volée) – 3-4 demi-journées de travail individuel. A la fin du module, une période est dédiée à une révision permettant l’autoévaluation par l’étudiant de son niveau d’apprentissage. A la fin du semestre, une période est réservée aux réponses des professeurs aux questions déposées par les étudiants en vue de la révision de la matière pour les examens.

Le calendrier horaire détaillé est disponible sur le site web de l’école de médecine (www.uni.ch/fbm/). Votre horaire personnalisé est consultable via votre compte personnel MyUnil.

4.2. Approches pédagogiques L’ensemble des activités du module doivent vous aider à atteindre les objectifs formulés sous le chapitre 3 « Objectifs d’apprentissage ». Vous trouvez ci–après un descriptif de ces différentes approches pédagogiques.

4.2.1. Cours Les cours magistraux exposent les principales connaissances pour atteindre les objectifs d’apprentissage du module. Ils n’ont pas pour but de couvrir tous les objectifs. Certains enseignants mettent à dispositions leurs supports de cours (au format PowerPoint ou pdf) avant le cours. Ils sont téléchargeables sur le site de l’école de médecine. Nous vous conseillons fortement de vous préparer avec ce contenu pour mieux profiter de l’enseignement et préparer des questions pour améliorer votre compréhension du sujet. Pour le cours de Physiologie, l’enseignant fournit un polycopié avec les illustrations de son cours à la première heure d’enseignement de la physiologie.

16

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

4.2.2. Travaux pratiques

Les travaux pratiques offrent à l'étudiant: – une illustration des connaissances théoriques enseignées et/ou acquises – une opportunité d'acquérir de nouvelles connaissances en suivant les consignes – l’occasion d’entrainer l’apprentissage autonome et en petit groupe

Le programme du module 1.3 prévoit des TP dans la discipline suivante:

- embryologie humaine La présence aux TP est fortement conseillée. Elle est nécessaire pour l’acquisition des objectifs d’apprentissage propre des TP (voir détails ci-dessous) et permet de réviser le programme des cours d’embryologie générale et d’embryologie humaine en posant des questions aux enseignants et tuteurs qui encadrent les TP. 4.2.2.1 TP d’Embryologie humaine : Webembryology Buts : Etude des étapes fondamentales du développement de l’embryon humain par un

travail personnel en petits groupes Lieu : Salle Micropolis, rue du Bugnon 23.

Déroulement: Les TP se déroule en 5 séances, chaque séance est suivie par une demi-volée (A ou B). Le programme des séances est (les modules indiqués entre parenthèses correspondent aux chapitres sur le site de référence à l’adresse www.embryology.ch) :

1. Le zygote et le développement embryonnaire précoce jusqu’à l’embryon didermique

(Module 4 Fécondation, chapitre 4.6 + Module 5 Préimplantation + Module 6 Implantation + Module 7 Disque embryonnaire, chapitre 7.1)

2. Le disque embryonnaire tridermique (Module 7 Disque embryonnaire, à partir du chapitre 7.2)

3. La période embryonnaire : mise en place d’un plan d’organisation morphologique (Module 8Période embryonnaire)

4. Les annexes embryonnaires et le placenta (Module 10 Membranes foetales et placenta) 5. La formation des gamètes et la fécondation (Module 3 gamétogenèse, Module 4

Fécondation) Le travail du groupe d’étudiant est structuré selon un plan de travail et une répartition des tâches qui s’organisent comme suit :

17

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

En présence (pendant les TP) Partie 1 : 10 min Partie 2 : 80 min Partie 3 : 30 min Partie 4 : 15 min

Définition des modalités de travail, introduction théorique (facultative)

Travail de recherche en groupe avec répartition des tâches en utilisant les supports : -cours WEB -cours ex-cathedra - consultation de documentation fournie En fin de cette période : Mise en commun des réponses (étudiants) et synthèse des objectifs (enseignant)

Présentation thématique par un enseignant : - placenta - fécondation - cas cliniques à discuter

Quiz distribué en séance à compléter en commun pour valider l’acquisition des connaissances

De plus, les étudiants reçoivent 2-3 jours à l’avance le fichier contenant les consignes et les objectifs d’apprentissage. Il est fortement conseillé aux étudiants de lire attentivement ces documents avant le TP pour se préparer en révisant les notions préalables requises pour le travail de recherche sur les objectifs du TP. Il existe également une zone d’échange qui permet aux étudiants de poser des questions et le cas échéant de s’exprimer à propos du contenu de la séance. Les questions sont évaluées, regroupées, et des réponses sont fournies par l’enseignant sur la zone d’échange sur une base hebdomadaire. A la fin de la deuxième partie, il y a une courte pause, suivie d’une période d’enseignement structuré (Partie 3). Pour la séance 1 le Dr. A. Chanson présentera des documents réalisés dans leur clinique concernant les étapes précoces du développement embryonnaire humain. Pour la séance 4, la Dresse M.C. Osterheld présentera la morphologie macroscopique du placenta et les critères qui déterminent son fonctionnement normal. 4.2.2.2 TP de stastistique médicale : Buts : Exercer les outils statistiques enseignés pendant le cours à l’aide d’un logiciel de e-

learning (MOBS) qui permet à l’étudiant de tester sa compréhension des principes théoriques et de leur application.

Lieu : Salle Micropolis, rue du Bugnon 23.

Déroulement: Les TP se déroule en 1 séance de deux périodes. Les étudiants sont divisés en 3 groupes (A, B, et C), et chaque groupe prend part à une des trois séances selon le plan de la grille horaire..

- 18 -

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

4.2.3. Séminaire interdisciplinaire Le séminaire interdisciplinaire réunit les étudiants et les enseignants des cours du module pendant 2 heures le dernier jour du module. Pendant ce séminaire, les étudiantEs peuvent poser des questions sur les concepts présentés aux cours et aux TP qui n’ont pas été compris. Ces questions sont préparées quelques jours à l’avance par écrits et envoyées au responsable du module qui organise ce séminaire. Ce séminaire est également l’opportunité de présenter les points de vue croisés des différentes disciplines sur des sujets communs concernant la biologie du développement et l’étude morphologique et fonctionnelle d’un individu du niveau cellulaire au niveau des organes. La participation active des étudiantEs au séminaire interdisciplinaire est une condition indispensable pour garantir un retour efficace de la séance aux participants.

- 19 -

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

4.4. Examens Le module B1.3-07 est évalué lors de la session d’examen qui suit le semestre d’enseignement par un questionnaire à choix multiples (QCM). Ce QCM teste les objectifs d’apprentissage décrits dans ce cahier de module sous le chapitre 3 « Objectifs d’apprentissage » ainsi que les éléments du savoir abordés dans les travaux pratiques. Les résultats (notes) seront publiés à la fin de la session d’examen dans votre dossier académique de votre compte MyUnil. En fin d’année, un procès-verbal sur papier de tous vos examens de l’année vous sera remis par le président local des examens fédéraux. La réussite du QCM 1.3. donne droit à 12 crédits ECTS.

- 20 -

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

5. Ressources d’apprentissage (littérature, multimédia)

5.1. Site web Le site web officiel de l’enseignement : http://www.unil.ch/fbm/enseignement/… Sur ce site, vous trouverez l’horaire officiel du l’enseignement de l’Ecole de médecine Sur votre compte personnel du site MyUnil, vous recevez les documents en version électronique des cours et de travaux pratiques, ainsi que les informations complémentaires (cahier de module, guide méthologique pour les TP, …).

5.2. Génétique médicale (cours de la Prof. M. Jotterand) 1. Livres An introduction to genetic analysis.

Griffiths, Wessler, Lewontin and Gelbart, Suzuki and Miller 8th edition, Freeman, 2005 (ISBN 0 7167 4939 4) Introduction à l'analyse génétique. Griffiths AJF, Miller JH, Suzuki DT, Lewontin RC. Troisième édition. De Boeck, 2002 (ISBN 2 7445 0097 6) Génétique. Klug W., Cummings M., Spencer C., Huitième edition, Pearson education France, 2006 (ISBN 2 7440 71 52 8) Analyse génétique moderne. Griffiths AJF, Gelbart WM, Miller JH, Lewontin RC. Première édition. De Boeck, 2001 (ISBN 2 7445 0111 5)

5.3. Physiologie générale (cours du Prof. E. Raddatz) 1. Livres

Medical Physiology. A cellular and molecular approach W.F. Boron and E.L. Boulpaep Saunders / Elsevier, 2005

- 21 -

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

5.4 Embryologie générale (cours de la Prof. L. Michalik) 1. Livres

Biologie du développement Gilbert, S. De Boeck ISBN : 2-8041-45344 2ème édition française

5.5. Embryologie humaine (cours du Prof. A. Volterra + TP) 1. Livres

Embryologie humaine Larsen, W. de Boeck Université, Bruxelles(1996) ISBN 2-8041-1959-9

2. Internet Site web du Département de biologie cellulaire et de morphologie, avec la liste exhaustive des livres de références pour l’enseignement l’embryologie pour tous les modules

www-ibcm.unil.ch/teaching/livresreference/index.html

5.6. Génétique moléculaire (cours du Prof. N. Fasel) 1. Livres Molecular Cell Biology. Lodish et al 5th edition. (2004) Freeman and Co. Human Molecular Genetics 2 Tom Strachan and Andrew Read 2nd edition (2003) John Wiley and Sons

- 22 -

Module B1.3 – 08 “Développement” 2007-08

5.7. Statistique biomédicale (cours du Prof. A. Marazzi) 1. Livres Pagano M., Gauvreau K. Principles of Biostatistics 2nd edition Duxbury Press, Boston, 2000. Rosner B. Fundamentals of Biostatistics. 5th edition Duxbury Press, Boston, 1999.

2. Internet Marazzi A. Polycopié de biostatistique http://www.iumsp.ch/Unites/us/Alfio/msp_polybiostat.htm BOMS : Basics of medical statistics www.boms.ch

- 23 -