Epidémiologie de la résistance bactérienne en 2009: les nouveaux risques

Epidmiologie de la rsistance

bactrienne en 2009: les nouveaux

risquesC.Muller-SerieysService de microbiologieHpital Bichat Cl.Bernard PARIS

Frquence des germes isols de bactrimies nosocomiales en 2006Enqute dincidence partir du laboratoire: 1/10 au 31/12/200680 Hpitaux; n=2091wwwcclinparisnord.org

Espces%E.coli19,4S.aureus17,4S.coag-14,3P.aeruginosa7,8Entrocoques4,4

en 2006www.cclinparisnord.org

E.coli: Rsistance aux aminopnicillines en 2007

N= 8068I+R: 55,8%(FQ: 17,3 %)www.earss.rivm.nl

www.earss.rivm.nl

E coli : % R C3G dans bactrimies en 2007

4,1% vs 2,5% en 2005N=7840FQ: 17,3% R vs 13,6 en 2005Aminosides: 6.8 % R vs 6,7 en 2005

www.earss.rivm.nl

N= 1161I+R 11,6%(7,4% en 2006)K.pneumoniae: % R C3G dans bactrimies en 2007

Les nouvelles BLSE

N=10 872 Enterobacteriaceae

88 hpitaux , oct 2005

169 (1,7%)BLSE

EVOLUTION DE LINCIDENCE DES BMR POUR 100 ADMISSIONS BICHAT - CLAUDE BERNARD / AP-HP 1991-2008SARM Ent III C3G-R* A. baumanniiPyo Tic RAnnes0,12 EBLSE0,440,660,550, 74

1520545535 Amox+clav

K.pneumo sauvage

K.pneumo sauvage

111111111

#REF!

#REF!

#REF!

#REF!

#REF!

#REF!

#REF!

#REF!

#REF!

Annes

Pourcentage de rsistant

Evolution de la rsistance des K. pneumoniae non BLSE

Graph1

3512.50.10.519913.61.1

4319920.45199219924.80

44.619930.71.319935.21993

35.619941.119949.46.31994

44.319950.622.49.77.81995

484612199619964

454512199774

51491419989.55

53521.43.41096

51502513118

Amoxicilline

Amoxiclav

Cefotaxime

Gentamicine

Acide nalidixique

Pfloxacine

Ciprofloxacine

Annes


Evolution de la rsistance de E. coli, GHBCB

Graph2

3512.50.10.519913.61.10.1

4319920.45199219924.800.45

44.619930.71.319935.219930.7

35.619941.119949.46.319941.1

44.319950.622.49.77.819950.62

4846121996199641

4545121997741

51491419989.551

53521.43.410961.4

515025131182

5655471815112

Amoxicilline

Amoxiclav

Cefotaxime

Gentamicine

Acide nalidixique

Pfloxacine

Ciprofloxacine

Caz

Annes



K.pneumo BLSE

AnneK. pneumoniae BLSEAmxAugTicPIPPTzCG1CG2CtxCazImpGeTobNtAmkNalPefCip

199130710082.110010010010099;3049.298.798.493.897.792.1

199223410010010010003983

19937455.494.674.397.397.390.5

19945110027.5969670969488

1995271001007.492.692.692.692.692.6

199624100100256581

1997191001005562786367

1998121001002575536450

1999

200025100100100100100100

Enterobacter cloacae

N souchesTicarcillineCfotaximeGentamicineTobramycineAmikacineAcide nalidixiquePfloxacineCiprofloxacineAmxAugPIPPTzCG1CG2CazImpNt

306199131.315.416.416.112.318.610.91001009845.514.9016.1

181199224141010.5179.510014012

238199322.513.81318.516.815.5

238199432.824.416.817.62.126.92124.40

231199528.122.514.715.11.721.61911.722.5014.3

266199631.5176223331.50

22219972522131311614220

2211998272410.592.3141024

2691999353015166202014100100353230015

2442000353213147282618100100353232014


00000000

00000000

00000000

00000000

00000000

00000000

00000000

00000000

00000000

00000000

Ticarcilline

Cfotaxime

Gentamicine

Tobramycine

Amikacine

Acide nalidixique

Pfloxacine

Ciprofloxacine

Annes


Evolution de la rsistance de E. cloacae, GHBCB

Enterobacter aerogenes

AnneN souchesAmxAugTicPIPPTzCG1CG2CtxCazImpGeTobNtAmkNalPefCip

19945853.451511.721311436.234.5

19954742.538.338.32014.914.914.923.421.717

19965628.6

19974817181800084

1998624037375862119

1999

2000691001004949494545015222220303025

S. marcescens


19911481001007810010010.1069.667.338.883.778.3

1992125100509.66.601250

19939950.518.228.328.321.252.552.5

1994753525.31222.61134.632

19958610048.825.625.6023.22927.916.344.244.240.7

1996714022.510010123636

199765302322014.5162222

1998641714148391916

199967100100282825241610282222

2000731001002929262311014585148272725

Proteus indole +


199115810010016.41001.21.20

BGN et Cphalosporinases plasmidiques

Cephalosporinases plasmidiques

C. freundii

E. aerogenes

E. cloacae

M. morgannii

P. aeruginosa

E. coli /Shigella sp.

Y. enterocolitica

P. aeruginosa

Aeromonas sp.

A. punctata

H. alvei

CMY-2-like, LAT, BIL, CFE, KEH

MIR, ACT

DHA

MOX, CMY-1-like

FOX

ACC

Les RisquesCphalosporinases plasmidiques: Pensylvanie CMY presque aussi frquentes que BLSE chez E.coli et co-rsistance aux autres classes dantibiotique +++ ( H.E Sidjabat ; CID mars 2009 vol 48). Sources: infections urinaires.

Etude prospective au Canada entre 2000 et 2003: emergence dE.coli produisant AmpC -lactamases dans infections urinaires communautaires (incidence 1,7 vs 15/100 000)(Pitout et al Emerging Inf Diseases Vol 13 Mars 2007)

Peu frquentes en France actuellement mais rapportes un peu partout en Europe.

Les CarbapnmasesNaturelles de Stenotrophomonas maltophilia, Chryseobacterium

AcquisesBactriesClasse AKPCSME, NMC/IMIClasse BMetallo-b-lactamaseIMP, VIM, SPM

Classe DEntrobactriesSerratia marcescens

P. aeruginosa, AcinetobacterEntrobactries (rare)OXAAcinetobacter spp.

Carbapnmases et entrobactries KPC : Premire carbapnmase plasmidique de classe A (transposon)resistance toutes les b-lactamines y compris C3G,C4G et carbapnmes

Apparues chez certaines EnterobactriesKlebsiella pneumoniae (bouffes pidmiques)Mais aussi sporadique chez K. oxytoca, Citrobacter freundii, Enterobacter spp., Escherichia coli, Salmonella spp., Serratia spp.,

Dcrite chez Pseudomonas aeruginosa (Colombie)

Rpartition des souches productrices de KPCFrequent OccurrenceSporadic Isolate(s)France (Nass et al. 2005. AAC 49)Singapore (report from survey)Puerto Rico (ICAAC 2007)Columbia (Villegas et al. 2006. AAC 50:2880-2882 & ICAAC 07)Brazil (ICAAC 2007)Israel (Navon-Venezia et al. 2006. AAC 50)China (Wei Z, et al. 2007. AAC 51)

New-York: 30% des K.pneumoniae sont rsistantes aux pnmesproduction de carbapnmasesmutation de porinesMme clone dans lest des USA.Risque de dissmination (voyages).

K.pneumoniae KPC 3

IMP dcrite initialement au dbut des annes 90 au Japon chez Pseudomonas aeruginosa

VIM rapporte par la suite en Europe chez Pseudomonas aeruginosa en 1997

transfert de mtallo-lactamases plasmidiques de Pseudomonas aeruginosa vers les entrobactriesMetallo-b-lactamase

The Impact of VIM-1 Metallo--Lactamase on Outcome of Patients with Klebsiella pneumoniae Bloodstream Infections. A prospective observational study

George L. Daikos1, Panayiotis Petrikkos1, Mina Psichogiou1, Chris Kosmidis16 ,Evangelos Vryonis2, Athanasios Skoutelis2, Kleoniki Georgousi37 , Leonidas S.Tzouvelekis4, Panayotis T. Tassios4, Christina Bamia5, and George Petrikkos1

AAC Accepts, published online ahead of print on 17 February 2009

IMP dcrite initialement au dbut des annes 90 au Japon chez Pseudomonas aeruginosa

VIM rapporte par la suite en Europe chez Pseudomonas aeruginosa en 1997

transfert de mtallo-lactamases plasmidiques de Pseudomonas aeruginosa vers les entrobactries

Rcemment : mergence de Klebsiella pneumoniae productrices de VIM dans le sud de l'Europe, aux USA et en Core

En grce: Klebsiella pneumoniae productrices de VIM endmiques dans diffrents hpitaux depuis dbut 2000

Rsistances des souches isoles

R similaire pour SHV-5 +



*

*

*

*

*

*

*

Rcemment : mergence de Klebsiella pneumoniae productrices de VIM dans le sud de l'Europe, aux USA et en Core

En Grce: Klebsiella pneumoniae productrices de VIM endmiques dans diffrents hpitaux depuis dbut 2000.

Rsistances des souches isoles 2004-2006R similaire pour SHV-5 + R similaire pour SHV-5 + R similaire pour SHV-5 +

Prvalence importante de Klebsiella pneumoniae responsables de septicmies nosocomiales ou lies aux soins productrices de VIM-1 dans 3 hpitaux d'AthnesSouches multirsistantes (>3 classes AB) avec une diversit des CMI des carbapnmes.Diffusion inter et intra-hospitalire de plusieurs clones sur une priode relativement courte entre 2002 et 2003

Hpital : utilisation non contrle des carbapnmes et mesures d'hygine insuffisante

Importance de P.aeruginosa et Acinetobacter baumanniiPyo: 3me rang des bactries responsables dinfections nosocomiales.

P.aeruginosa (souches invasives)Rsistance (%) dans diffrents pays europens

P.aeruginosa: % de rsistance la pipracilline dans les bactrimies en 2007Aminosides31,1% RN= 1168I+R 20,5%www.earss.rivm.nl

P.aeruginosa: rsistance aux carbapnmes en 2007I+R 18,4%Cefta: 18,7% I+RFQ: 26,3% I+RSur un collectif de 1257 1302 souches

www.earss.rivm.nl

EVOLUTION DE LA RESISTANCE DE PSEUDOMONAS AERUGINOSA AUX ANTIBIOTIQUES BICHAT - CLAUDE BERNARD 1993-2007

34 Ticarcilline

32 Ciprofloxacine

23 Imipnme

20 Ceftazidime

en 2006www.cclinparisnord.org

15 CHU; priode dtude avril mai 2004

Ra-Raisin 2007: surveillance des IN en ranimation adulte ( CCLIN Paris-Nord ). 48 services de ranimation, 82 % publics (CHU-CH)6 726 patients hospitaliss + de 2 j

A. baumannii55.6% CAZ-R (n=109; 74,3% 2006)

P. aeruginosa21.2% CAZ-R (n=989; 22,1% 2006)

S. maltophilia50,0% CAZ-R (n=89; 49,4 % 2006)

ACTIVITE DU MEROPENEME : ETUDE MYSTIC

Turner, DMID 2006

7124 souches cliniques40 centres EuropensPas de modification notable de la sensibilit pour S.aureus, SCN , les entrobactries (BLSE et AmpC) et P.aeruginosa par rapport 2002.Pour Acinetobacter augmentation de la rsistance 12,7% vs 34,9% et 15,7 vs 40,4% pour MEM et IPM respectivement (augmentation de la prvalence des Acinetobacter multi-R en Europe).

56CeftazidimeTicarcillineGentamicineAmikacineImipnmeCiprofloxacine% de souches rsistantesAnne1494807173

Graph7

77.592180767885

40.482.52.37458681992

42.9886.977.965691993

39.4944.677.565.261.480.9

34.386.10.778.864.262.21995

6787167919966182

5082155319973760

6992.5155731401998

6491224732351999

80931754473856

Ticarcilline

Cetazidime

Imipnme

Gentamicine

Tobramycine

Amikacine

Ciprofloxacine

Annes


Evolution de la rsistance de A. baumannii, GHBCB

E.coli

N souchesAmoxicillineAmoxiclavCefotaximeGentamicineAcide nalidixiquePfloxacineCiprofloxacineTicPIPPTzCG1CG2CazFEPCPOImpTobNtAmkISEPANorOflo

209019913512.50.10.53.61.1357.12.70.100.50.20.2

21741992430.454.80430.450

2294199344.60.71.35.20.701.10

2510199435.61.19.46.31.1

2424199544.30.622.49.77.80.6202.410.4

246619964846124485100

24371997454512743951020.1

293419985149149.5543.543.57.61040.4

2892199953521.43.41096454571.40.30.303.220.30.0699

28252000515025131184545820.30.5054101111

E.coli

0000000

0000000

0000000

0000000

0000000

0000000

0000000

0000000

0000000

0000000

Amoxicilline

Amoxiclav

Cefotaxime

Gentamicine

Acide nalidixique

Pfloxacine

Ciprofloxacine

Annes



P.mirabilis

N souchesAmoxicillineAmoxiclavCfotaximeGentamicineTobramycineAmikacineAcide nalidixiquePfloxacineCiprofloxacineTicPIPPTzCG1CG2CazImpNt

352199133.50.11.92.31.1151533.5301.10.102.3

338199234.33.22.5122203401

410199331.90.22.63.11.222.214.60.2

337199435.60.624.613.9

301199532.9042.40.41911.3001.6

298199635190711000

428199729200550.51210000

373199843310.36.76.20.5184353520.30

387199942370.5950.3242012363600.505

38420003834276023171135353204

P.mirabilis

000000000

000000000

000000000

000000000

000000000

000000000

000000000

000000000

000000000

000000000

Amoxicilline

Amoxiclav

Cfotaxime

Gentamicine

Tobramycine

Amikacine

Acide nalidixique

Pfloxacine

Ciprofloxacine

Annes


Evolution de la rsistance de P. mirabilis, GHBCB

K.pneumo sauvage

N souchesAmoxicillineAmoxiclavTicarcillineGentamicineTobramycineAmikacineAcide nalidixiquePfloxacineCiprofloxacinePIPPTzCG1CG2CtxCazImpNt

1991460100301005.26.14.210.56.82017;50205.7

19922991001001.62.31.6119.6002.3

19933884.75.621311.20

19943051001004.33.3015.111.40

19952911001002.72.409.36.902.4

19962521001001120

19973251001001211060

19983331001002.12.10610

1999325100101005431312610014030

20003301001010033298610090003

K.pneumo sauvage

100301005.26.14.2199110.56.8

10019921001.62.31.6119.61992

1993199319934.75.621311.21993

10019941004.33.3015.111.41994

10019951002.72.409.36.91995

1001996100119961199619962

10019971001211997106

10019981002.12.10199861

1001010054313126

10010100332986

Amoxicilline

Amoxiclav

Ticarcilline

Gentamicine

Tobramycine

Amikacine

Acide nalidixique

Pfloxacine

Ciprofloxacine

Annes


Evolution de la rsistance des K. pneumoniae non BLSE

K.pneumo BLSE

460

299

388

305

291

252

325

333

325

330

N souches

Annes

Nombre de souches

Klebsiella pneumoniae non BLSE


K. pneumoniae BLSEAmxAugTicPIPPTzCG1CG2CtxCazImpGeTobNtAmkNalPefCip

199130710082.110010010010099;3049.298.798.493.897.792.1

199223410010010010003983

19937455.494.674.397.397.390.5

19945110027.5969670969488

1995271001007.492.692.692.692.692.6

199624100100256581

1997191001005562786367

1998121001002575536450

199910

200025100100100100100100


307

234

74

51

27

24

19

12

10

25

K. pneumoniae BLSE

Annes

Nombre de souches

Klebsiella pneumoniae BLSE


N souchesTicarcillineCfotaximeGentamicineTobramycineAmikacineAcide nalidixiquePfloxacineCiprofloxacineAmxAugPIPPTzCG1CG2CazImpNt

306199131.315.416.416.112.318.610.91001009845.514.9016.1

181199224141010.5179.510014012

238199322.513.81318.516.815.5

238199432.824.416.817.62.126.92124.40

231199528.122.514.715.11.721.61911.722.5014.3

266199631.5176223331.50

22219972522131311614220

2211998272410.592.3141024

2691999353015166202014100100353230015

2442000353213147282618100100353232014


31.315.416.416.112.3199118.610.9

24141010.51719929.51992

22.5199313.813199318.516.81993

32.824.416.817.62.126.9211994

28.122.514.715.11.721.61911.7

199631.517199661996199622

25221313119971614

272410.592.319981410

353015166202014

353213147282618

Ticarcilline

Cfotaxime

Gentamicine

Tobramycine

Amikacine

Acide nalidixique

Pfloxacine

Ciprofloxacine

Annes


Evolution de la rsistance de E. cloacae, GHBCB

S. marcescens


19945853.451511.721311436.234.5

19954742.538.338.32014.914.914.923.421.717

19965628.6

19974817181800084

1998624037375862119

1999

2000691001004949494545015222220303025

Proteus indole +


19911481001007810010010.1069.667.338.883.778.3

1992125100509.66.601250

19939950.518.228.328.321.252.552.5

1994753525.31222.61134.632

19958610048.825.625.6023.22927.916.344.244.240.7

1996714022.510010123636

199765302322014.5162222

1998641714148391916

199967100100282825241610282222

2000731001002929262311014585148272725

Providencia


199115810010016.41001.21.20

A.baumannii :imipnmase


chez S.aureus

Epidmiologie de S.aureus est lieTransmission croiseDiffusion de clonesRsistance aux antibiotiques = marqueurs de ces clonesPopulations tudiesOrigine des prlvementsDiversit des rseaux de surveillance au sein de l ONERBA

LES SARM1re souche isole en France en 1962 En Europe Voss et coll 1994 :Danemark : 0.1%Suisse : 0.3%Allemagne : 5.5%Belgique : 25.1 %Espagne : 30.3%France : 33.6 %Italie : 34.4 %

Prvalence des SARM dans les bactrimies en 200725,8 %N=4250www.rivm.nl/earss

www.rivm.nl/earss

David Trystram Groupe Hospitalier Piti SalptrireService de bactriologie-hygine Pr V.Jarlier

EVOLUTION DE LA PROPORTION ANNUELLE DE SARM PARMI S. AUREUSBICHAT CLAUDE BERNARD / AP-HP 1991-200723,3Anne21,2

Rseau national REA-Raisin:IN chez ladulte en 2006 (158 units de ra).

Evolution des taux de SARMServices de ranimation

Donnes nationales : phnotypes de rsistance des S. aureus (n=877,832) isols dinfections nosocomiales en ranimation (Etude Ra-Raisin 2005-2006 www.invs.sante.fr).1 souche sur 2 est Mti-R en 2005, 40% en 2006

Etat actuel de la rsistance de S.aureus CCLIN Paris-Nord 2006-200726 et 117 laboratoires Hors AP-HP

En ranimation: 283/899 sont des SARM soit 31,5% vs 243/863 soit 28,2%Court sjour hors Ra: 1483/4460 sont des SARM soit 33,2% vs 1505/5238 soit 28,7%SSRLD: 630/1062 soit 59,3% vs 497/886 soit 56,1%www.cclinparisnord.org

SARM communautairesDistincts des SARM hospitaliers:Sur le plan clinique: sujets exposs sont les enfants et les populations dfavorises sur le plan pidmiologique: possde une cassette chromosomique particulire (SCC IV)Sur le plan de la virulence:produisent une toxine de Panton et Valentine (PVL) ou une Toxic shock syndrom toxin (TSST) :inconstantEmergence mondiale et dissmination clonale: 1 clone en France ST 80 , clones diffrents selon les continents mais tendance la diffusionEncore peu nombreux en France: Peu rsistants aux autres antibiotiques:Kana, ttra, ac.fusidique en FranceUSA et Ocanie parfois rythro (efflux).

Vandenesch et al. Emerg Infect Dis, 2003Tristan A. et al Emerg Infect Dis, 2007; Larsen AR et al, Journal of Clin Microbiology 2009

J.Robert RICAI 2008

SARM producteurs de toxines PVL et toxic shock syndrom toxine 1 (TSST-1): enqute ONERBA 2008Enqute prospective: mai octobre 2008Recherche SARM de 3 phnotypes particuliers:S-genta, S-FQ, R-FA99 laboratoires32147 S.aureus avec 6614 SARM (21%)SARM correspondant au phnotype 1) PVL : 106 (1,6% )2) TSST-1 :150 ( 2,3% )3 ) S- aminoside : 62 (0,9 %) total=318 souches

SARM communautaires aux USAMethicillin-Resistant Staphylococcus aureus Disease in three Communities.N.Engl.J.Med vol 352; 14;1436-1444 April 7-2005P Parmi les 12 553 patients porteurs de SARM qui ont t recenss entre 2001 et 2002, 17 % prsentaient une souche communautaire :BBaltimore : 8 %MMinnesota : 12 %AAtlanta : 20 %

Incidence des infections SARM communautaire :AAtlanta : 25,7 cas pour 100 000 hab.BBaltimore : 18,0 cas pour 100 000 hab.CMS DURPI 2009

SARM communautaires aux USAPriode dtude: 1996-2005MRSA prvalence: 7,2 76,3% chez homosexuels VIH+ San FranciscoSouche PVL+ passe de 33% en 2002 >90% en 2004/2005 (H.Charleton et coll Abstract C2-1142 ICAAC 2007)Populations carcrales :412/502 SARM (82,1%) PVL+ souche USA300 en 2007 souche sensible au SXT, clinda , ttra, linzolide. (P.Tattevin et al abst C2-225 ICAAC 2008)

S.aureus rsistant la vancomycine: VRSA

7 souches dcrites aux USA: 2 souches en 2002 (MI-VRSA Michigan et PI-VRSA Pensylvanie),1 en 2004 ( New-York) VRSA-4, 5 , 6 en 2005, VRSA-7 en 2006, ( Michigan).Haut niveau de rsistance la vanco (CMI=1024 mg/l)Rsistance de type inductible porte par le transposon Tn1546 co-rsistance trimetoprim, bta-lactamines, aminoglycosides et dsinfectants. transfert de gne vanA E.faecalis S.aureusContexte de forte incidence dERV et de SARMPas de souche en Europe

(Miller D; et al MMWR 2002; Sievert D et al MMWR 2002; Kacica M. et al MMWR 2004; W.Zhu et coll Abst C2-608 ICAAC 2007 Sievert et al CID 2008 46, 668-674).

CMS DURPI 2009


chez les Entrocoques

Bactrimies E.faecalis : % de souches rsistantes la vancomycine en 2007(Rseaux Azay, Ile de France, Russir)0,1%N=1216www.rivm.nl/earss

Bactrimies E.faecium: % de souches rsistantes la vancomycine en 2007(Rseaux Azay, Ile de France, Russir) CMI> 8 mg/L

1,2 %N=322www.rivm.nl/earss

Donnes nationales : rsistance dE.faecalis et E.faecium isols dinfections nosocomiales en ranimation (Etude Ra-Raisin 2005 et 2006).

VRE en Europe 2007rsistance aux glycopeptides en Europe dans les bactrimies:Allemagne: E.faecium: 15,3%, E.faecalis: 1,1%Italie: E.faecalis 1,8%, E.faecium 10,6%Belgique: E.faecalis 1% E.faecium: 0%Portugal: E.faecalis 3,6%; E.faecium 29,1%

WWW.earss.rivm.nl

Situation en France: Proportion stable jusquen 2003 (E.faecium 12% et E.faecalis 5%ONERBA donnes de surveillance 2004 des rseaux franaisBEH 2006: R.Leclercq et coll: entrocoques rsistants la vancomycine , situation en France en 2005.

Souches VRE en France 2006-2008(N.Bourdon et al BEH 2008 41-42)Souches pidmiques: 2006 ouest, centre et Paris2007: Paris, Est2008: NordE.faecium vanA, CC17 adapt au milieu hospitalierSouches Ampi, FQ rsistantes, RHN genta (59,6%), gnes de virulence.

CONTEXTERsistance aux antibiotiques en constante augmentation19402008Rsistance ATBNouveaux ATBNombre de nouveaux antibiotiques en constante diminutionFox JL. 2006. Nat Biotechnol 24:1521Age dor des antibiotiques

ConclusionsLa rsistance prsente des niveaux trs variables selon les pays mais ce problme est mondial.Adaptation efficace des bactries pour leur survie.Ncessit de connatre lpidmiologie pour le traitement empirique des infections svres. Le bon usage des ATB doit tre une proccupation permanente des prescripteurs.

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Epidémiologie de la résistance bactérienne en 2009: les nouveaux risques

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